单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-02-03	Single-cell RNA sequencing of human prostate basal epithelial cells reveals zone-specific cellular populations and gene expression signatures 2024-02, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6227 PMID:37984408	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了人类前列腺基底上皮细胞在不同腺区中的细胞群体和基因表达特征	首次在前列腺基底细胞中识别出多个细胞群体和细胞类型特异性基因签名，这些签名可能在驱动前列腺疾病中起关键作用	研究主要基于体外培养的前列腺上皮细胞，可能无法完全反映体内情况	探讨前列腺基底细胞在不同腺区中的基因表达差异及其在前列腺疾病中的作用	人类前列腺基底上皮细胞	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	人类前列腺和精囊的原代前列腺上皮细胞培养物
62	2025-02-03	Dissociation of murine oral mucosal tissues for single cell applications 2024-02, Journal of immunological methods IF:1.6Q4 DOI:10.1016/j.jim.2023.113605 PMID:38142927	研究论文	本文介绍了优化小鼠口腔黏膜组织解离方法的研究，提供了三种不同的协议，用于分离口腔黏膜中的主要细胞群	提出了三种不同的酶解方法，分别优先回收免疫细胞、基质细胞和上皮细胞，适用于健康和炎症状态下的研究	每种解离方法都有其局限性，可能因优先回收特定细胞类型而产生偏差	优化小鼠口腔黏膜组织的解离方法，以便更好地进行单细胞RNA测序和流式细胞术研究	小鼠口腔黏膜组织	单细胞技术	牙周炎	单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	单细胞数据	NA
63	2025-02-03	Bitter taste receptors in the reproductive system: Function and therapeutic implications 2024-Feb, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1 DOI:10.1002/jcp.31179 PMID:38219077	综述	本文综述了2型味觉受体（TAS2Rs）在生殖系统中的功能及其治疗潜力	探讨了TAS2Rs在生殖健康中的新角色，特别是在男性和女性生殖过程中的潜在功能及其在癌症治疗中的应用	缺乏遗传和功能研究，需要更多技术如单细胞RNA测序和CRISPR/Cas9基因编辑来深入理解TAS2Rs在生殖中的作用	探索TAS2Rs在生殖系统中的功能及其作为治疗靶点的潜力	男性和女性生殖系统中的TAS2Rs	生殖医学	生殖系统疾病	单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑	NA	NA	NA
64	2025-02-03	Interleukin-10 signaling in somatosensory neurons controls CCL2 release and inflammatory response 2024-02, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2023.12.013 PMID:38081433	研究论文	本文研究了IL-10信号在感觉神经元中的作用，特别是其在调节CCL2释放和炎症反应中的功能	首次证明抗炎细胞因子通过直接结合感觉神经元上的受体来限制炎症	研究主要基于小鼠模型，未涉及人类样本	探讨IL-10信号在感觉神经元中的免疫调节作用	小鼠的背根神经节（DRG）感觉神经元	免疫学	炎症相关疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	小鼠模型
65	2025-02-03	Method for Collecting Single Epithelial Cells from the Mouse Larynx 2024-02, The Laryngoscope DOI:10.1002/lary.30970 PMID:37602769	研究论文	本文开发了一种从小鼠喉部收集单个上皮细胞的方法，以研究喉部上皮细胞的分子变化	开发了一种新的方法，能够从小鼠喉部可靠地收集单个上皮细胞，并最小化非喉部和非上皮细胞的污染	方法尚未在人类样本中验证，且收集的细胞数量有限	开发一种可靠的方法，从小鼠喉部收集单个上皮细胞，用于下游细胞和分子分析	小鼠喉部的上皮细胞	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	细胞样本	单个喉部收集6000-8000个细胞，三个组织合并收集35000-40000个细胞
66	2025-01-28	Resident Synovial Macrophages in Synovial Fluid: Implications for Immunoregulation in Infectious and Inflammatory Arthritis 2024-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.09.29.560183 PMID:37873090	研究论文	本研究旨在识别滑液中的常驻滑膜巨噬细胞（RSM），并展示其迁移能力及可能引发慢性炎症反应的功能变化	首次在滑液中识别出RSM，并通过单细胞RNA测序揭示了这些细胞与CD56+细胞毒性树突状细胞和IDO+ M2巨噬细胞的转录相关性	研究样本量有限，且主要依赖于体外实验验证	探讨RSM在感染性和炎症性关节炎中的免疫调节作用	人类患者，特别是表现为未分化关节炎的患者	免疫学	关节炎	流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、ELISA	NA	细胞数据、RNA测序数据	未明确说明具体样本数量，涉及多临床环境下的患者
67	2025-01-23	Circulating myeloid-derived MMP8 in stress susceptibility and depression 2024-Feb, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-07015-2 PMID:38326622	研究论文	本文探讨了循环髓系细胞特异性蛋白酶MMP8在应激易感性和抑郁症中的作用	揭示了MMP8在应激易感性和抑郁症中的新机制，并提出了针对外周免疫细胞来源的基质金属蛋白酶作为治疗应激相关神经精神疾病的新靶点	研究主要基于小鼠模型，人类样本的研究仍需进一步验证	研究应激相关疾病如重度抑郁症的潜在机制	人类和应激易感小鼠	神经科学	抑郁症	质谱流式细胞术和单细胞RNA测序	NA	血清样本和脑组织样本	人类和应激易感小鼠
68	2025-01-22	Preclinical Evidence for the Glucocorticoid-Sparing Potential of a Dual Toll-Like Receptor 7/8 Inhibitor in Autoimmune Diseases 2024-02-15, The Journal of pharmacology and experimental therapeutics IF:3.1Q2 DOI:10.1124/jpet.123.001744 PMID:37673681	研究论文	本文探讨了双Toll样受体7/8抑制剂（TLR7/8i）在自身免疫疾病中减少糖皮质激素（GC）用量的潜力	研究发现TLR7/8抑制剂与糖皮质激素联合使用可增强GC的抗炎效果，特别是在髓系细胞中表现出协同效应	研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探索TLR7/8抑制剂在自身免疫疾病治疗中的潜力，以减少糖皮质激素的用量及其副作用	人类外周血单核细胞和小鼠狼疮模型	免疫学	系统性红斑狼疮	NanoString基因表达分析和单细胞RNA测序	小鼠狼疮模型	基因表达数据	人类外周血单核细胞和小鼠模型
69	2025-01-22	CD_99 G1 neutrophils modulate osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells in the pathological process of ankylosing spondylitis 2024-Feb-15, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1136/ard-2023-224107 PMID:37977819	研究论文	本研究旨在识别脊柱附着点内的细胞类型及其异质性，并探讨骨生成的潜在机制	发现了一种新的早期中性粒细胞亚群CD99_G1，在强直性脊柱炎中升高，并揭示了Adipo-CAR细胞与CD99_G1中性粒细胞之间的相互作用	样本量较小，仅包括5名强直性脊柱炎患者和3名健康个体	探讨强直性脊柱炎病理过程中的骨生成机制	脊柱附着点内的细胞群体	数字病理学	强直性脊柱炎	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	5名强直性脊柱炎患者和3名健康个体的40,065个单细胞
70	2025-01-22	Lack of affinity signature for germinal center cells that have initiated plasma cell differentiation 2024-02-13, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2023.12.010 PMID:38228150	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术追踪了针对疟原虫环子孢子蛋白的Igh B细胞在生发中心的发展，发现启动浆细胞分化的细胞群体在亲和力上与留在生发中心的细胞无显著差异	研究发现浆细胞分化的启动过程与亲和力无关，这一发现挑战了高亲和力细胞优先选择进入浆细胞库的传统观点	研究仅针对特定抗原（疟原虫环子孢子蛋白）的B细胞，可能不适用于其他抗原或免疫反应	探讨生发中心细胞启动浆细胞分化过程中亲和力的作用	针对疟原虫环子孢子蛋白的Igh B细胞	免疫学	疟疾	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	NA
71	2025-01-22	An atlas of cells in the human tonsil 2024-02-13, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2024.01.006 PMID:38301653	研究论文	本文生成了人类扁桃体的细胞图谱，涵盖了超过556,000个细胞，使用了五种不同的数据模式进行分析	首次综合使用单细胞转录组、表观基因组、蛋白质组、免疫组库测序以及空间转录组学技术，全面解析人类扁桃体的细胞类型和状态	研究结果需要进一步验证，特别是在不同年龄段和病理条件下的适用性	解析人类扁桃体的细胞组成和功能，为免疫防御机制提供新的见解	人类扁桃体细胞	生物信息学	NA	单细胞转录组测序、表观基因组测序、蛋白质组测序、免疫组库测序、空间转录组学	NA	单细胞数据	超过556,000个细胞
72	2025-01-16	Stem-like progenitor and terminally differentiated TFH-like CD4+ T cell exhaustion in the tumor microenvironment 2024-02-27, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.113797 PMID:38363680	研究论文	本文通过单细胞测序和小鼠模型，研究了肿瘤微环境中CD4滤泡辅助T细胞（TFH-like）的耗竭状态及其在抗肿瘤免疫中的作用	揭示了CXCL13在肿瘤浸润的耗竭CD8 T细胞中高表达，诱导CD4滤泡辅助T细胞浸润，并发现部分T细胞具有细胞毒性，直接攻击表达主要组织相容性复合体-II的肿瘤	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类肿瘤中进行验证	探讨肿瘤微环境中CD4 T细胞的耗竭状态及其在抗肿瘤免疫中的作用	肿瘤微环境中的CD4 T细胞	免疫学	癌症	单细胞测序	小鼠模型	单细胞测序数据	NA
73	2025-01-15	Endocardium gives rise to blood cells in zebrafish embryos 2024-02-27, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.113736 PMID:38308842	研究论文	本研究利用斑马鱼胚胎模型，证明了心内膜在造血过程中的作用，特别是髓系细胞和中性粒细胞的主要来源	首次在斑马鱼胚胎中明确证明心内膜是髓系细胞和中性粒细胞的主要来源，并揭示了Hedgehog信号通路在此过程中的作用	研究结果主要基于斑马鱼胚胎模型，尚未在哺乳动物胚胎中得到验证	探究心内膜在造血过程中的作用及其调控机制	斑马鱼胚胎	发育生物学	NA	单细胞RNA测序、时间推移成像、谱系追踪	NA	基因表达数据、成像数据	斑马鱼胚胎
74	2025-01-15	Spatiotemporal role of SETD2-H3K36me3 in murine pancreatic organogenesis 2024-02-27, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.113703 PMID:38265933	研究论文	本文通过多种测序技术研究了SETD2-H3K36me3在小鼠胰腺器官发生中的时空作用	揭示了SETD2在胰腺发育中的关键作用，特别是其在胰腺外分泌和内分泌谱系中的调控机制	研究主要基于小鼠模型，人类胰腺发育的相似性尚需进一步验证	探讨组蛋白修饰在胰腺发育中的协调作用	小鼠胰腺	表观遗传学	胰腺疾病	CUT&Tag, ATAC-seq, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序	NA	基因组数据, 转录组数据	NA
75	2025-01-15	The single-cell transcriptome program of nodule development cellular lineages in Medicago truncatula 2024-02-27, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.113747 PMID:38329875	研究论文	本文描述了Medicago truncatula根在早期根瘤发育过程中对根瘤菌的细胞类型特异性转录组反应	通过单细胞转录组分析，揭示了根瘤发育过程中细胞谱系的转录重编程，并鉴定了新的根瘤调控因子	研究主要集中于早期根瘤发育阶段，未涵盖整个根瘤发育过程	研究Medicago truncatula根在根瘤发育过程中对根瘤菌的细胞类型特异性转录组反应	Medicago truncatula根细胞	植物生物学	NA	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	野生型Jemalong A17和超结瘤突变体sunn-4的根细胞
76	2025-01-15	Single-cell RNA sequencing of cervical exfoliated cells reveals potential biomarkers and cellular pathogenesis in cervical carcinogenesis 2024-02-12, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06522-y PMID:38346944	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了宫颈脱落细胞，揭示了宫颈癌发生过程中的潜在生物标志物和细胞病理机制	首次在单细胞分辨率下描绘了宫颈病变进展过程中免疫细胞和上皮细胞的变化，并识别出一组脂质相关巨噬细胞作为预测低级别鳞状上皮内病变向高级别病变进展的生物标志物	样本量相对较小，仅包括15个样本，且未明确说明这些样本是否来自不同患者	探索宫颈癌发生过程中的细胞异质性和潜在生物标志物，以改进宫颈癌的早期筛查方法	宫颈脱落细胞	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	56,173个宫颈脱落细胞，来自15个样本（包括正常宫颈、低级别鳞状上皮内病变、高级别鳞状上皮内病变和恶性肿瘤）
77	2025-01-12	Circulating cancer-specific CD8 T cell frequency is associated with response to PD-1 blockade in Merkel cell carcinoma 2024-Feb-20, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101412 PMID:38340723	研究论文	本文研究了Merkel细胞癌（MCC）患者中MCPyV特异性CD8 T细胞的频率与抗PD-1治疗反应之间的关系	通过使用MCPyV肽-HLA-I多聚体、26色流式细胞术、单细胞转录组学和T细胞受体（TCR）测序，首次在MCC患者中详细分析了MCPyV特异性T细胞的特征及其与抗PD-1治疗反应的关系	样本量较小（27名患者），且仅针对病毒驱动的MCC，可能不适用于其他类型的癌症	探讨MCPyV特异性CD8 T细胞在抗PD-1治疗中的作用及其与治疗反应的关系	Merkel细胞癌（MCC）患者	癌症免疫学	Merkel细胞癌	MCPyV肽-HLA-I多聚体、26色流式细胞术、单细胞转录组学、T细胞受体（TCR）测序	NA	流式细胞数据、单细胞转录组数据、TCR测序数据	27名MCC患者
78	2025-01-12	Pro-inflammatory feedback loops define immune responses to pathogenic Lentivirus infection 2024-02-05, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-024-01290-y PMID:38317183	研究论文	本文通过研究不同致病性的慢病毒感染模型，揭示了促炎性反馈回路在免疫反应中的作用	利用单细胞转录组学和细胞间通讯技术，揭示了高致病性慢病毒感染导致炎症通路延迟、广泛且持续激活的机制	研究主要基于猪尾猕猴模型，可能无法完全反映人类HIV感染的情况	探讨慢病毒致病性的免疫机制	猪尾猕猴和不同致病性的SIV病毒变体	免疫学	艾滋病	单细胞转录组学、单细胞分辨率细胞间通讯技术	NA	单细胞转录组数据	猪尾猕猴感染不同致病性SIV病毒变体的队列
79	2025-01-04	Deciphering the heterogeneity of neutrophil cells within circulation and the lung cancer microenvironment pre- and post-operation 2024-02-06, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s10565-024-09850-z PMID:38319415	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，研究了非小细胞肺癌患者手术前后血液和肿瘤组织中的中性粒细胞亚群的分布，并开发了一种过表达率（OER）计算方法来评估中性粒细胞亚群的特异性	开发了过表达率（OER）计算方法，用于评估中性粒细胞亚群的特异性，并识别出具有潜在临床应用价值的基因组合	研究样本量有限，且仅针对非小细胞肺癌患者，未涵盖其他类型的癌症	评估非小细胞肺癌患者手术前后中性粒细胞亚群的分布及其特异性，以帮助诊断和预后评估	非小细胞肺癌患者手术前后的血液和肿瘤组织	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	非小细胞肺癌患者的肿瘤和癌旁组织、手术前后血液样本
80	2025-01-04	Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals endoplasmic reticulum stress-related CAF subpopulations associated with chordoma progression 2024-02-02, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noad173 PMID:37772937	研究论文	本研究通过整合单细胞和空间转录组学，揭示了与脊索瘤进展相关的内质网应激相关CAF亚群	首次在脊索瘤中识别出高表达缺氧基因且功能富集于内质网应激的CAF亚群，并揭示了其与肿瘤细胞的空间分布关系	样本量相对较小，且仅针对脊索瘤进行研究，可能限制了结果的普适性	探讨脊索瘤中CAF的异质性、空间分布及其临床意义	脊索瘤组织中的癌症相关成纤维细胞（CAF）	数字病理学	脊索瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、多重定量免疫荧光（QIF）	NA	单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、批量RNA测序数据、免疫荧光图像	72,097个单细胞（来自3个原发性和3个复发性肿瘤样本，以及3个髓核样本作为对照），126名患者的批量RNA测序数据，105名患者的QIF验证数据