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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
A time- and single-cell-resolved model of murine bone marrow hematopoiesis
2024-02-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.12.001
PMID:38183977
|
研究论文 | 本研究通过结合持续标记和时间序列单细胞RNA测序,构建了小鼠骨髓造血过程的实时定量模型 | 将级联单细胞表达模式与分化和生长速度的动态变化相结合,建立了首个实时、定量的体内组织动力学模型 | 基于快照测量重建动态行为可能存在推断偏差,模型在小鼠骨髓中验证但需在其他系统中进一步测试 | 构建高分辨率的组织尺度动力学模型以理解造血过程 | 小鼠骨髓造血系统 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 动力学模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
Tracking early mammalian organogenesis - prediction and validation of differentiation trajectories at whole organism scale
2024-Feb-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201867
PMID:37982461
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序追踪小鼠早期器官发生的细胞分化轨迹 | 建立了从原肠胚形成到器官发生的高密度采样时间序列数据集,结合计算谱系重建和实验验证揭示了血液和内皮发育的新程序 | 研究时间窗口仅限于E6.5-E9.5阶段,未覆盖更晚期的发育过程 | 解析早期哺乳动物器官发生过程中的细胞分化轨迹和命运决定机制 | 小鼠胚胎(E6.5-E9.5阶段) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算谱系重建 | 单细胞转录组数据 | 超过400,000个细胞(包含新采集的300,000个细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
Endothelial cells drive organ fibrosis in mice by inducing expression of the transcription factor SOX9
2024-02-28, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abq4581
PMID:38416842
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研究论文 | 本研究揭示内皮细胞通过转录因子SOX9驱动多器官纤维化的机制 | 首次证实内皮细胞(而非仅成纤维细胞)通过SOX9表达直接促进器官纤维化,并发现CCN2是介导此过程的关键因子 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚不充分 | 探究内皮细胞在器官纤维化中的作用机制 | 小鼠模型及人类心力衰竭患者心脏组织 | 分子生物学 | 器官纤维化/心力衰竭 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因编辑 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 组织病理数据 | 多种小鼠纤维化模型(心脏、肺、肝)及人类心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
Lipocalin-2 expression identifies an intestinal regulatory neutrophil population during acute graft-versus-host disease
2024-02-21, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi1501
PMID:38381845
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现表达脂质运载蛋白-2的肠道中性粒细胞群体,可减轻急性移植物抗宿主病的严重程度 | 首次发现LCN2表达的中性粒细胞群体通过调控巨噬细胞功能缓解aGVHD,并揭示LCN2/IGF-1R信号通路机制 | 未明确LCN2治疗对移植物抗白血病效应的影响,人类样本验证仍需扩大 | 探索急性移植物抗宿主病的肠道组织耐受机制和潜在治疗策略 | 小鼠模型和人类aGVHD患者肠道活检样本 | 单细胞生物学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个患者队列的肠道活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize the molecular and cellular architecture of the ischemic mouse brain
2024-02-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg1323
PMID:38324639
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞转录组学技术,系统描绘了缺血性小鼠大脑的分子和细胞结构特征 | 首次整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了缺血大脑中LGALS9-CD44信号通路的关键作用,并发现细胞外囊泡介导的Lgals9递送可改善功能恢复 | 研究仅基于小鼠模型,需要在其他物种中进一步验证;Lgals9的具体作用机制仍需深入探索 | 表征缺血性大脑的分子和细胞结构特征,探索神经炎症在脑缺血后的病理机制 | 缺血性中风小鼠模型中的脑组织细胞 | 空间转录组学 | 脑血管疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 19,777个转录组位点 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
CD23+IgG1+ memory B cells are poised to switch to pathogenic IgE production in food allergy
2024-02-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi0673
PMID:38324641
|
研究论文 | 本研究在儿童花生过敏中发现了一类CD23+IgG1+记忆B细胞,这些细胞在2型免疫反应中产生,含有高亲和力花生特异性克隆,并能被激活分化为产生IgE的细胞 | 首次描述了CD23+IgG1+记忆B细胞作为致病性IgE产生细胞前体在食物过敏中的关键作用,揭示了长期过敏持续性的潜在机制 | 研究主要聚焦于儿童花生过敏,样本来源相对局限,需要进一步验证在其他食物过敏中的普适性 | 探究食物过敏中持续性IgE反应的B细胞记忆机制 | 人类儿童花生过敏患者 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞RNA测序,B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据,血清学数据 | 儿童花生过敏患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
Understanding the cell fate and behavior of progenitors at the origin of the mouse cardiac mitral valve
2024-02-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.006
PMID:38198889
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和克隆分析揭示了小鼠心脏二尖瓣发育过程中内皮祖细胞的命运决定机制 | 首次定义了二尖瓣祖细胞的代谢过程特征,并揭示了内皮细胞衍生克隆在瓣叶形成中的特异性生长模式 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类或其他物种中验证 | 探究心脏二尖瓣发育过程中内皮祖细胞的命运决定和行为机制 | 小鼠胚胎和出生后二尖瓣的内皮细胞和瓣膜细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 回顾性多色克隆分析 | NA | 基因表达数据, 细胞谱系数据 | 基因标记的内皮细胞和显微解剖的小鼠胚胎及出生后二尖瓣样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
Characterization of the human fetal gonad and reproductive tract by single-cell transcriptomics
2024-02-26, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.006
PMID:38295793
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析人类胎儿性腺及生殖道的细胞组成和分子特征 | 首次对妊娠早期和中期人类胎儿性腺及相邻生殖道进行单细胞转录组分析,揭示了性别分化过程中的形态和分子变化 | NA | 研究人类胎儿性别特异性性腺发生和生殖道发育过程 | 人类胎儿性腺及相邻发育中的生殖道组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 妊娠早期和中期男女性胎儿样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
The soil emergence-related transcription factor PIF3 controls root penetration by interacting with the receptor kinase FER
2024-02-26, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.001
PMID:38295794
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子PIF3通过与受体激酶FER相互作用调控植物根系穿透土壤的机制 | 首次发现FER-PIF3信号通路在根系土壤穿透中的关键作用,并阐明其通过调控机械敏感离子通道PIEZO和外根冠细胞脱落的分子机制 | 研究主要基于拟南芥和少量大豆突变体,在其他作物中的普适性需要进一步验证 | 探究植物根系穿透土壤的分子调控机制 | 拟南芥和大豆的根系组织 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 生化实验, 成像技术, 遗传学实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 细胞成像数据 | 拟南芥和大豆突变体根系样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2025-10-06 |
Spatial Pathomics Toolkit for Quantitative Analysis of Podocyte Nuclei with Histology and Spatial Transcriptomics Data in Renal Pathology
2024-Feb, Proceedings of SPIE--the International Society for Optical Engineering
DOI:10.1117/12.3006318
PMID:40375953
|
研究论文 | 开发并应用空间病理组学工具包(SPT)对肾病理中的足细胞核进行定量分析 | 提出首个整合组织学和空间转录组学数据的足细胞空间病理组学分析工具包 | 未提及具体样本量限制或验证范围 | 开发定量分析工具以促进肾病理中细胞空间病理组学研究 | 肾小球足细胞核 | 数字病理 | 肾脏疾病 | 空间转录组学, 病理图像分析 | 实例对象分割模型 | 全切片图像(WSI), 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 71 | 2025-10-07 |
Bitter taste receptors in the reproductive system: Function and therapeutic implications
2024-02, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31179
PMID:38219077
|
综述 | 本文综述了苦味受体在生殖系统中的功能及其治疗潜力 | 系统总结了苦味受体在生殖系统各组织中的非味觉功能,并提出了其在生殖疾病治疗中的新策略 | 缺乏遗传学和功能学研究证据 | 探讨苦味受体在生殖系统中的功能及治疗应用前景 | 人类和小鼠生殖系统组织及细胞 | 生殖医学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2025-10-07 |
Single-Cell Mapping of Large and Small Arteries During Hypertensive Aging
2024-02-01, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glad188
PMID:37531301
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了高血压衰老过程中大、小动脉的细胞图谱,系统解析了血管壁细胞多样性和动态通讯变化 | 首次从血管衰老、高血压和血管类型三个维度整合12个数据集,系统描绘高血压衰老过程中血管细胞组成变化和细胞间通讯网络 | 研究仅使用雄性Wistar Kyoto大鼠和自发性高血压大鼠,未涉及雌性模型;样本量相对有限 | 解析高血压与衰老在血管系统中的相互作用机制 | 雄性Wistar Kyoto大鼠和自发性高血压大鼠的主动脉、股动脉和肠系膜动脉 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自16周和72周龄大鼠的12个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2025-10-07 |
Meta-analyses of mouse and human prostate single-cell transcriptomes reveal widespread epithelial plasticity in tissue regression, regeneration, and cancer
2024-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.30.578066
PMID:38352515
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研究论文 | 通过对小鼠和人类前列腺单细胞转录组进行荟萃分析,揭示组织退化、再生和癌症中广泛存在的上皮细胞可塑性 | 首次通过跨物种单细胞转录组荟萃分析系统揭示前列腺上皮细胞在正常状态、雄激素剥夺后退化及癌症中的广泛可塑性 | 基于已有数据集的分析,可能受原始实验设计和技术差异的影响 | 研究前列腺组织中细胞状态可塑性在组织维持和癌症中的作用 | 小鼠和人类前列腺组织样本 | 单细胞转录组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个已发表和新的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-07 |
Cellular Senescence Contributes to the Progression of Hyperoxic Bronchopulmonary Dysplasia
2024-Feb, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0038OC
PMID:37874230
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研究论文 | 本研究探讨细胞衰老在高氧诱导的支气管肺发育不良进展中的作用机制 | 首次系统证实细胞衰老在BPD发病机制中的关键作用,并验证通过抑制髓过氧化物酶氧化产物、内质网应激和细胞衰老可改善BPD表型 | 研究主要基于动物模型,人类样本有限;治疗干预时间点和长期效果需进一步验证 | 阐明细胞衰老在支气管肺发育不良疾病进展中的作用机制 | 人类尸检肺组织、Sprague-Dawley大鼠幼崽(P1-P10) | 病理生理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 转录组学, 免疫印迹, 组织学分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 组织图像 | 人类尸检肺样本和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2025-10-07 |
Decoding functional hematopoietic progenitor cells in the adult human lung
2024-Feb-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3576483/v2
PMID:38077002
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研究论文 | 本研究揭示了成人肺脏中存在功能性造血祖细胞及其在血管丰富的肺泡间质生态位中的分布 | 首次在人类肺脏中发现具有增殖和移植潜能的造血前体细胞,其频率与骨髓相当,并揭示了肺源性祖细胞特有的免疫和造血通路激活特征 | NA | 探索肺脏作为髓外造血器官的功能潜力 | 成人肺组织中的CD34+造血祖细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 76 | 2024-08-07 |
Author Correction: Deciphering driver regulators of cell fate decisions from single-cell transcriptomics data with CEFCON
2024-Feb-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45929-1
PMID:38351163
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2025-10-07 |
Resident Synovial Macrophages in Synovial Fluid: Implications for Immunoregulation in Infectious and Inflammatory Arthritis
2024-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.29.560183
PMID:37873090
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研究论文 | 本研究通过鉴定滑膜液中定居滑膜巨噬细胞的特征,揭示其在感染性和炎症性关节炎中的免疫调节作用 | 首次在滑膜液中鉴定出CD14dim/OPG+/ZO-1+的定居滑膜巨噬细胞群体,并证明其迁移能力和M2极化特征 | 样本量有限,主要针对未分化关节炎患者,需要更大规模研究验证 | 探究定居滑膜巨噬细胞在关节炎发病机制中的免疫调节功能 | 人类关节炎患者的滑膜液和外周血样本 | 免疫学 | 关节炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, ELISA, 迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 多名未分化关节炎患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-07 |
Advances in the Immunology of the Host-Parasite Interactions in African Trypanosomosis, including Single-Cell Transcriptomics
2024-Feb-20, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens13030188
PMID:38535532
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综述 | 本文综述了非洲锥虫病宿主-寄生虫相互作用的免疫学进展,重点介绍了单细胞转录组学技术的应用 | 整合了最新的单细胞和空间测序技术研究锥虫生命周期阶段和宿主细胞的转录组特征 | NA | 深入理解寄生虫生物学和宿主免疫机制,为开发新的疫苗和治疗策略提供基础 | 锥虫寄生虫、哺乳动物宿主细胞、组织微环境 | 单细胞生物学 | 寄生虫病 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 79 | 2025-10-07 |
Multiplex generation and single cell analysis of structural variants in a mammalian genome
2024-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.22.576756
PMID:38405830
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研究论文 | 开发了一种在哺乳动物基因组中多重生成和定位结构变异的方法,并实现单细胞水平的分析 | 创建了基于shuffle cassette整合和Cre-loxP重组的SV生成系统,首次实现在单次实验中诱导数千个基因组SV,并能在单细胞RNA测序数据中鉴定SV基因型 | 诱导的SV会随时间从细胞群体中快速耗竭,可能由于Cre介导的毒性和/或重排本身的负向选择 | 系统探索结构变异对基因表达、染色质景观和3D核结构的功能影响 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, Cre-loxP位点特异性重组, T7介导的体外转录 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 概念验证实验中诱导了数千个基因组SV | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals cell atlas and identifies cycling tumor cells responsible for recurrence in ameloblastoma
2024-02-29, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00281-4
PMID:38424060
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示成釉细胞瘤的细胞图谱,并鉴定导致肿瘤复发的循环肿瘤细胞 | 首次在单细胞分辨率下揭示成釉细胞瘤的细胞景观,鉴定出具有干细胞特性的循环肿瘤细胞亚群及其EZH2介导的调控机制 | NA | 探究成釉细胞瘤肿瘤起始和复发的分子机制 | 成釉细胞瘤肿瘤细胞 | 数字病理学 | 成釉细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |