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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
Defining and targeting macrophage heterogeneity in the mammary gland and breast cancer
2024-02, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.7053
PMID:38426622
|
综述 | 探讨乳腺和乳腺癌中巨噬细胞异质性及其靶向治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序技术揭示巨噬细胞亚群的空间分布与功能特异性 | 基于文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 解析巨噬细胞异质性在乳腺发育与乳腺癌中的作用机制 | 乳腺组织驻留巨噬细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
Hybrid Oncocytic Tumors (HOTs) in Birt-Hogg-Dubé Syndrome Patients-A Tale of Two Cities: Sequencing Analysis Reveals Dual Lineage Markers Capturing the 2 Cellular Populations of HOT
2024-Feb-01, The American journal of surgical pathology
DOI:10.1097/PAS.0000000000002152
PMID:37994665
|
研究论文 | 本研究通过整合分析和单细胞RNA测序鉴定出Birt-Hogg-Dubé综合征相关混合性嗜酸细胞肿瘤的双重谱系标记物 | 首次发现L1CAM和LINC01187在HOT中呈独特的棋盘格状互斥表达模式,能够捕获肿瘤中两种不同的上皮细胞群体 | 研究样本量有限,主要关注BHD综合征相关肿瘤 | 开发混合性嗜酸细胞肿瘤的诊断生物标志物 | Birt-Hogg-Dubé综合征患者的肾肿瘤和正常肾组织 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson Syndrome and Toxic epidermal necrolysis
2024-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.26.568771
PMID:38405793
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞测序技术分析Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症的组织特异性免疫反应 | 首次在SJS/TEN中同时进行单细胞转录组、表面蛋白质组和TCR测序,建立了多组学数据库 | 样本量相对有限(17例患者),为罕见疾病研究 | 阐明SJS/TEN的细胞免疫发病机制 | SJS/TEN患者的未受累皮肤、受累皮肤和水疱液 | 单细胞多组学 | Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症 | 单细胞转录组测序、表面蛋白质组测序、TCR测序 | NA | 单细胞多组学数据 | 17例SJS/TEN患者,共119,784个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
Spatial analyses: Focusing on immune-stromal interactions to understand immunity in the tissue context
2024-02, Seminars in arthritis and rheumatism
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.semarthrit.2023.152319
PMID:38040516
|
研究论文 | 通过空间分析技术研究免疫细胞与基质微环境的相互作用及其在组织免疫中的功能 | 结合多重免疫荧光和组织学与空间转录组学,首次发现先天淋巴样细胞在纤维血管巢中的定位特征及其在COVID-19诱导肺纤维化中的关键作用 | 尚未验证类似机制是否适用于其他纤维化相关疾病如自身免疫性疾病 | 理解组织环境中免疫细胞与微环境的相互作用机制 | 人类多种组织中的免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | COVID-19肺纤维化 | 多重免疫荧光组织学、空间转录组学 | 基于机器学习的细胞分割和注释 | 图像、转录组数据 | 多种人体组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
Sequencing of Physically Interacting Cells in Human Kidney Allograft Rejection to Infer Contact-dependent Immune Cell Transcription
2024-02-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004762
PMID:37638864
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术推断人类肾脏移植排斥反应中物理相互作用细胞的转录程序 | 开发了结合CD45阳性富集策略和CITE-seq的测序物理相互作用细胞计算方法,能够从单细胞RNA测序数据中推断细胞间物理接触的转录特征 | 样本量相对较小(11例活检样本),空间信息在单细胞测序过程中丢失 | 研究人类肾脏移植排斥反应中免疫细胞间物理接触依赖的转录调控机制 | 人类肾脏移植活检样本中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肾脏移植排斥反应 | 单细胞RNA测序,CITE-seq(转录组和表位细胞索引测序) | 测序物理相互作用细胞计算方法 | 单细胞转录组数据,表面蛋白表达数据 | 11例人类肾脏移植活检样本,产生31,203个高质量单细胞文库 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10X Genomics平台 | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 66 | 2025-10-06 |
Multiomics Data Reveal the Important Role of ANXA2R in T Cell-mediated Rejection After Renal Transplantation
2024-02-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004754
PMID:37677931
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了ANXA2R在肾移植后T细胞介导排斥反应中的关键作用 | 首次发现ANXA2R作为新型TCR相关基因在TCMR中发挥重要作用,并证实ANXA2R+CD8+T细胞在排斥反应中显著增加 | 样本量相对有限(12个多组学数据集,23个病理切片),需要更大规模研究验证 | 阐明肾移植后T细胞介导排斥反应的TCR受体库特征并识别新的治疗靶点 | 肾移植患者的移植肾组织 | 生物信息学 | 肾移植排斥反应 | 多组学分析,单细胞转录组测序,免疫荧光染色,基因集富集分析 | TRUST4算法,多种免疫细胞浸润算法 | 多组学数据,转录组数据,单细胞数据,病理图像 | 12个多组学数据集,23个临床病理切片 | NA | 单细胞转录组测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
SinCMat: A single-cell-based method for predicting functional maturation transcription factors
2024-02-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.12.006
PMID:38215756
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序的计算方法SinCMat,用于预测功能成熟转录因子 | 首个专门考虑功能细胞成熟过程的计算方法,通过识别身份转录因子和信号依赖转录因子的配对来驱动功能成熟 | NA | 预测驱动细胞功能成熟的转录因子 | 小鼠细胞图谱和Tabula Sapiens数据库中的细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大规模数据集(Mouse Cell Atlas和Tabula Sapiens) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
Characterizing Neutrophil Subtypes in Cancer Using scRNA Sequencing Demonstrates the Importance of IL1β/CXCR2 Axis in Generation of Metastasis-specific Neutrophils
2024-02-29, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0319
PMID:38358352
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序表征癌症中的中性粒细胞亚型,发现IL1β/CXCR2轴在生成转移特异性中性粒细胞中的重要作用 | 首次系统比较健康和恶性肿瘤中中性粒细胞的转录状态,发现转移性结直肠癌中中性粒细胞具有更高异质性,并证实IL1β/CXCL8/CXCR2轴在中性粒细胞从健康状态向癌症和转移进展中的关键作用 | 研究主要基于转录组数据分析,需要更多功能实验验证 | 研究中性粒细胞在健康和恶性肿瘤中的转录亚型及其发育谱系 | 人类和小鼠的中性粒细胞,重点关注肺癌、乳腺癌和结直肠癌 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 伪时序分析 | 单细胞转录组数据 | 整合公开和独立生成的人类和小鼠数据集,涵盖肺癌、乳腺癌和结直肠癌 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
Immunosuppressive CD29+ Treg accumulation in the liver in mice on checkpoint inhibitor therapy
2024-02-23, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330024
PMID:37770128
|
研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序揭示了小鼠肝脏中CD29+调节性T细胞在免疫检查点抑制剂治疗中的独特反应机制 | 首次发现肝脏特异性CD29+Treg亚群在免疫检查点抑制剂治疗后显著扩增并介导治疗抵抗 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性尚待验证 | 探究肝脏调节性T细胞在免疫检查点抑制剂治疗抵抗中的作用机制 | 小鼠肝脏调节性T细胞 | 免疫学 | 肝癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2025-10-06 |
Immunotherapy-resistant acute lymphoblastic leukemia cells exhibit reduced CD19 and CD22 expression and BTK pathway dependency
2024-Feb-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175199
PMID:38376944
|
研究论文 | 本研究通过体外模型揭示了急性淋巴细胞白血病对CD19免疫疗法产生耐药性的机制 | 首次发现CD19免疫疗法耐药细胞同时出现CD19和CD22表达降低,并表现出对BTK通路的依赖性 | 研究主要基于体外模型,需要更多临床样本验证 | 探究B细胞恶性肿瘤对CD19免疫疗法产生耐药性的分子机制 | 急性淋巴细胞白血病细胞系和患者样本 | 肿瘤免疫学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 质谱流式细胞术 | 体外耐药模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 蛋白质表达数据 | 白血病细胞系和儿科及年轻成人B-ALL患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
Diverse macrophage populations contribute to distinct manifestations of human cutaneous graft-versus-host disease
2024-02-16, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad402
PMID:38010706
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重组织免疫荧光技术,揭示了不同巨噬细胞群体在人类皮肤移植物抗宿主病不同临床表现中的重要作用 | 首次在性别不匹配移植病例中利用X连锁基因表达追踪供体来源MNPs的组织适应性,并发现急性和慢性皮肤GvHD中巨噬细胞极化状态的显著差异 | 样本量相对有限(36例患者),且主要关注皮肤病变,未涉及其他器官的GvHD表现 | 表征急性皮肤移植物抗宿主病患者中单核吞噬细胞的特性、来源和功能 | 36例急性皮肤移植物抗宿主病患者的皮肤和血液样本 | 单细胞生物学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序,多重组织免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,组织影像数据 | 36例急性皮肤GvHD患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2025-10-06 |
Recruitment and Maintenance of CX3CR1+CD4+ T Cells during Helminth Infection
2024-02-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300451
PMID:38180236
|
研究论文 | 本研究通过命运示踪小鼠模型和单细胞RNA测序技术,揭示了蠕虫感染期间CX3CR1+CD4+ T细胞的招募、维持机制及其异质性 | 首次系统表征蠕虫感染中CX3CR1+CD4+ T细胞的行为特征,发现BCL6对其维持的关键作用,并鉴定出脾脏中独特的BCL6+TCF-1+PD1+CD4+ T细胞亚群 | 研究局限于小鼠模型,未涉及人类样本验证 | 探究2型炎症反应中CX3CR1+CD4+ T细胞的生物学特性和维持机制 | 巴西日圆线虫和曼氏血吸虫感染的小鼠模型 | 免疫学 | 蠕虫感染 | 单细胞RNA测序,命运示踪模型,条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-10-06 |
Multi-organ single-cell RNA sequencing in mice reveals early hyperglycemia responses that converge on fibroblast dysregulation
2024-02-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302003R
PMID:38305779
|
研究论文 | 通过小鼠多器官单细胞RNA测序揭示高血糖早期反应中成纤维细胞失调的共性机制 | 首次在单细胞水平对1型糖尿病早期高血糖进行多器官分析,发现成纤维细胞跨器官的一致性反应模式 | 研究仅使用雄性小鼠模型,时间点局限于8周,未涵盖糖尿病后期并发症 | 解析高血糖在多器官中的早期转录反应机制 | 链脲佐菌素诱导的1型糖尿病雄性小鼠 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 67,611个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
Preservation of scRNA-Seq Libraries Using Existing Inactivation Protocols
2024-Feb-13, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens13020167
PMID:38392905
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研究论文 | 本研究验证了在生物安全高级别实验室中使用现有核酸提取灭活方案处理单细胞RNA测序文库的可行性 | 首次系统评估了现有核酸提取灭活方案对单细胞RNA测序文库质量的影响 | 仅测试了三种灭活方案,未涵盖所有可能的灭活方法 | 解决在生物安全高级别实验室中进行单细胞RNA测序分析的技术挑战 | 单细胞RNA测序文库 | 单细胞测序 | 病毒性疾病(埃博拉病毒、马尔堡病毒、拉沙病毒等) | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
Lack of affinity signature for germinal center cells that have initiated plasma cell differentiation
2024-02-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.12.010
PMID:38228150
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序追踪疟疾免疫后生发中心B细胞发育,发现浆细胞分化的启动是一个亲和力非依赖过程 | 首次证明生发中心内启动浆细胞分化的前体细胞与留在生发中心的细胞具有相同的估计亲和力,挑战了高亲和力细胞优先分化为浆细胞的传统观点 | 研究聚焦于特定抗原(PfCSP)的免疫反应,结果在其他抗原系统中的普适性需要进一步验证 | 探究生发中心B细胞分化为浆细胞过程中亲和力选择的作用机制 | 特异性识别疟疾环子孢子蛋白(PfCSP)的Igh B细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2025-10-06 |
Ultrahigh frequencies of peripherally matured LGI1- and CASPR2-reactive B cells characterize the cerebrospinal fluid in autoimmune encephalitis
2024-Feb-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311049121
PMID:38319973
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析自身免疫性脑炎患者脑脊液中LGI1和CASPR2反应性B细胞的特征 | 首次在LGI1和CASPR2抗体脑炎患者脑脊液中鉴定出极高频率的克隆扩增自身抗原反应性抗体分泌细胞 | 样本量较小(仅3例患者),需要更大规模研究验证 | 探究自身免疫性脑炎患者脑脊液中B细胞受体特征及其在疾病中的作用 | LGI1和CASPR2抗体阳性的自身免疫性脑炎患者 | 免疫学 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞RNA测序,细胞分选,单克隆抗体表达 | NA | 单细胞RNA测序数据,B细胞受体序列数据 | 3例患者,381个配对IgG B细胞受体,166个单克隆抗体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of neuroblastoma by single-cell RNA sequencing identifies the NECTIN2-TIGIT axis as a target for immunotherapy
2024-02-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.12.008
PMID:38181797
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析神经母细胞瘤,发现NECTIN2-TIGIT轴可作为免疫治疗靶点 | 首次在神经母细胞瘤中通过单细胞RNA测序鉴定NECTIN2-TIGIT作为关键免疫检查点,并证明其与PD-L1联合阻断的疗效 | 样本量相对有限(24个肿瘤),且主要在临床前模型中进行验证 | 优化神经母细胞瘤免疫治疗策略 | 高风险神经母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞测序分析 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 24个肿瘤样本(10个化疗前,14个化疗后,含5对配对样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
Molecularly stratified hypothalamic astrocytes are cellular foci for obesity
2024-Feb-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3748581/v1
PMID:38405925
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法分析星形胶质细胞分子特征,揭示其在肥胖发生中的关键作用 | 开发基于机器学习的特征识别算法,利用已发表单细胞RNA-seq数据构建参考图谱,逐步消除多效性和诱导性细胞特征 | 研究主要聚焦于健康下丘脑区域,其他脑区星形胶质细胞异质性仍需进一步验证 | 探索星形胶质细胞分子分层及其在代谢调控中的作用机制 | 下丘脑星形胶质细胞及其与神经元的相互作用 | 机器学习 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | 特征识别算法 | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2025-10-06 |
Rapid anti-myeloma activity by T cells expressing an anti-BCMA CAR with a human heavy-chain-only antigen-binding domain
2024-Feb-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2023.12.018
PMID:38155568
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研究论文 | 本研究开发了一种全人源抗BCMA嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法,并在复发多发性骨髓瘤患者中进行了首次人体临床试验 | 首次使用具有重链-only抗原结合域的全人源抗BCMA CAR-T细胞进行临床治疗 | 样本量较小(25例患者),抗CAR抗体反应评估不完全 | 评估新型CAR-T细胞疗法在复发多发性骨髓瘤中的安全性和有效性 | 25例复发多发性骨髓瘤患者 | 免疫治疗 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,CAR-T细胞治疗 | NA | 临床数据,实验室检测数据,单细胞RNA测序数据 | 25例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
Single-cell insights into immune dysregulation in rheumatoid arthritis flare versus drug-free remission
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45213-2
PMID:38316770
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研究论文 | 通过单细胞技术研究类风湿关节炎复发期与药物缓解期免疫失调的细胞机制 | 利用药物撤除实验同步关节炎复发过程,首次系统识别预示关节炎复发的循环免疫细胞亚群及其克隆扩增特征 | 样本规模有限,研究主要关注循环免疫细胞而未涉及关节局部免疫环境 | 解析类风湿关节炎复发过程中的免疫失调机制 | 类风湿关节炎患者的免疫细胞 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 质谱流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |