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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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441 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell sequencing and weighted co-expression network identifies a novel signature based on cellular senescence-related genes to predict prognosis in glioblastoma
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23921
PMID:37565732
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研究论文 | 该文章探讨了细胞衰老相关基因在预后预测中的应用,特别是在胶质母细胞瘤中 | 本研究通过整合单细胞测序和加权共同表达网络分析,识别出一种新的与细胞衰老相关的基因签名,用于预测胶质母细胞瘤的预后 | 研究限制在于样本可能存在的偏倚及未完全考虑的潜在影响因素 | 本研究旨在揭示细胞衰老对胶质母细胞瘤患者预后的影响 | 研究对象为胶质母细胞瘤患者的基因表达和临床数据 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 总计选取了150个差异表达基因 |
442 | 2024-08-05 |
Multidimensional progressive single-cell sequencing reveals cell microenvironment composition and cancer heterogeneity in lung cancer
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24018
PMID:37956258
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研究论文 | 该文章通过多维逐渐单细胞测序揭示了肺癌的细胞微环境成分和肿瘤异质性。 | 通过单细胞RNA测序区分了八种不同的细胞类型,揭示了肿瘤微环境的显著肿瘤内异质性,并发现了潜在的预测生物标志物。 | 文章中未提及具体的研究限制。 | 研究肺癌细胞微环境的组成和肿瘤异质性。 | 研究对象为19个不同的肺癌肿瘤样本,分析其细胞类型和基因表达模式。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 19个肺癌肿瘤样本 |
443 | 2024-08-07 |
Single-cell combined with bulk-RNA data reveal a pattern related to angiogenesis in breast cancer patients: Individualized medicine
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23947
PMID:37647361
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据,揭示了与乳腺癌患者血管生成相关的模式,并构建了个性化治疗模型。 | 本研究首次综合单细胞和批量RNA测序数据,通过随机森林生存分析构建了预测模型,并在外部验证集中进行了验证。 | 研究主要集中在三阴性乳腺癌患者,可能不适用于所有乳腺癌亚型。 | 揭示乳腺癌患者血管生成的相关模式,并构建个性化治疗模型。 | 乳腺癌患者的RNA测序数据和生存数据。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | 随机森林 | RNA测序数据 | 1082名乳腺癌患者 |
444 | 2024-08-07 |
Transcriptome characteristics of epithelial cells from advanced non-small cell lung cancer were revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23960
PMID:37676967
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了晚期非小细胞肺癌上皮细胞的转录组特征 | 首次发现TPI1作为LUAD的新型生物标志物,并揭示了MXD3和GATA4作为潜在的调控转录因子 | NA | 探索与LUAD患者免疫浸润和生存时间相关的差异表达基因,并预测转录因子以揭示LUAD的分子机制和个体化治疗 | 晚期非小细胞肺癌的上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 16种上皮细胞类型 |
445 | 2024-08-07 |
The single-cell evolution trajectory presented different hypoxia heterogeneity to reveal the carcinogenesis of genes in clear cell renal cell carcinoma: Based on multiple omics and real experimental verification
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24009
PMID:37886854
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析,揭示了透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中基因的癌变机制及其与缺氧异质性的关系 | 本研究首次识别了ccRCC中多个与缺氧相关的肿瘤微环境(TME)亚群,并揭示了ANGPTL4在调控ccRCC增殖中的作用 | NA | 探讨透明细胞肾细胞癌中基因的癌变机制及其与缺氧异质性的关系 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)及其相关基因和细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | scRNA-seq | UMAP, NMF | 单细胞RNA测序数据 | 使用了来自GSE159115数据集的scRNA-seq数据,以及ccRCC细胞系的786-O和Caki细胞 |
446 | 2024-08-05 |
PLZF protein forms a complex with protein TET1 to target TCF7L2 in undifferentiated spermatogonia
2024-Feb, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 本文探讨了PLZF蛋白作为表观遗传调节因子在不分化精原细胞中的作用 | 本研究建立了新的PLZF&TET1-H3K4me3-TCF7L2轴以及PLZF和EZH2之间的新关联 | NA | 研究PLZF在精原细胞自我更新及维持中的功能 | 不分化精原细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
447 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals the pulmonary inflammation induced by inhalation of subway fine particles
2024-02-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2023.132896
PMID:37951166
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研究论文 | 本研究揭示了地铁细颗粒物如何引起肺部炎症。 | 首次实验研究地铁PM引起的肺部炎症损伤 | 研究主要在小鼠模型中进行,可能不完全适用于人类 | 探索地铁细颗粒物对肺部炎症的影响及其机制 | 小鼠及其免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和生物液体 | 小鼠样本,具体数量未提及 |
448 | 2024-08-07 |
The role of NF-κB signaling pathway in reactive astrocytes among neurodegeneration after methamphetamine exposure by integrated bioinformatics
2024-Feb-08, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.pnpbp.2023.110909
PMID:38061485
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研究论文 | 本研究探讨了甲基苯丙胺暴露后神经退行性疾病中反应性星形胶质细胞的作用,通过综合生物信息学方法分析了RNA测序数据和免疫浸润情况。 | 本研究首次通过综合生物信息学方法探讨了甲基苯丙胺暴露后反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的作用及其与神经元间的交叉对话。 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏直接的细胞和动物实验验证。 | 探讨甲基苯丙胺暴露后反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的作用及其与神经元间的交叉对话。 | 甲基苯丙胺暴露后的反应性星形胶质细胞及其在神经退行性疾病中的作用。 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | RNA测序 | 随机森林算法 | RNA测序数据 | 使用了来自GEO数据库的METH批量RNA测序数据(GSE107015和GSE98793)和单细胞RNA测序数据(GSE119861),以及PD芯片数据(GSE99039和GSE72267)。 |
449 | 2024-08-05 |
Glycolysis regulation in tumor-associated macrophages: Its role in tumor development and cancer treatment
2024-Feb-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34711
PMID:37688376
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研究论文 | 本文回顾了肿瘤相关巨噬细胞中糖代谢的现状,并总结了不同亚型的代谢特征 | 从单细胞组学的角度对肿瘤相关巨噬细胞的代谢特征进行了综合总结,探讨了糖酵解在肿瘤发展及治疗中的作用 | 对肿瘤相关巨噬细胞代谢特征的总结还不够全面,尚未深入探讨糖流对肿瘤进展的具体影响 | 研究肿瘤相关巨噬细胞中的糖代谢对肿瘤发展及癌症治疗的影响 | 肿瘤相关巨噬细胞及其不同亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |