单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 444 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-07 |
Vitamin D3 reverses immune tolerance and enhances the cytotoxicity of effector T cells in coal pneumoconiosis
2024-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.115972
PMID:38218105
|
研究论文 | 本研究探讨了维生素D3在煤工尘肺病中调节淋巴细胞功能的作用机制 | 首次揭示了维生素D3通过调节CD4+ T细胞分化和减少调节性T细胞数量，增强CD8+效应T细胞的细胞毒性，从而减轻肺纤维化和症状 | NA | 阐明维生素D3在煤工尘肺病中调节免疫状态的机制 | 煤工尘肺病中的淋巴细胞 | NA | 职业病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 422 | 2024-08-07 |
Thrombospondin 2 is a key determinant of fibrogenesis in non-alcoholic fatty liver disease
2024-Feb, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15792
PMID:38010940
|
研究论文 | 本研究旨在确定非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中表达血栓调节蛋白2（THBS2/TSP2）的特定细胞，并探讨THBS2/TSP2上调的潜在机制 | 首次揭示了THBS2/TSP2在NAFLD患者肝星状细胞（HSCs）中的高表达，并发现其与纤维化进程的相关性 | NA | 研究THBS2/TSP2在NAFLD中的表达及其对纤维化的影响 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）患者的肝细胞和肝星状细胞（HSCs） | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量聚合酶链反应（qPCR） | NA | 基因数据 | 分析了包含1433个可变基因的遗传数据集，使用了来自NAFLD患者的肝脏组织和LX-2细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 423 | 2024-08-07 |
[Single-cell RNA sequencing combined experimental verifies the core genes of dendritic cells in chronic obstructive pulmonary disease]
2024-Feb, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:38284250
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）结合实验验证，识别慢性阻塞性肺疾病（COPD）中树突状细胞的核心基因 | 首次通过scRNA-Seq技术结合实验验证，识别出COPD中树突状细胞的核心基因IL1RN、S100A8和S100A9，并分析了它们在COPD发病机制中的作用 | 研究仅限于识别和验证特定基因，未涉及这些基因在临床治疗中的具体应用 | 识别和验证COPD中树突状细胞的核心基因，为后续的COPD免疫治疗提供靶点和理论基础 | COPD中的树突状细胞及其核心基因 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | GSE173896数据集包含18个树突状细胞差异表达基因（DC-DEGs），GSE38974数据集包含646个差异表达基因（DEGs），最终识别出3个共同DC-DEGs | NA | NA | NA | NA |
| 424 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals keratinocyte subpopulations contributing to psoriasis in corneum and granular layer
2024-Feb, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI)
IF:2.0Q3
DOI:10.1111/srt.13572
PMID:38279596
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了角质形成细胞亚群在银屑病发病中的作用及其分子机制 | 首次详细描述了角质形成细胞在银屑病中的特定亚群及其相关的信号通路 | NA | 揭示与银屑病相关的角质形成细胞亚群及其分子机制 | 正常和银屑病皮肤组织中的角质形成细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 正常和银屑病皮肤组织的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 425 | 2024-08-05 |
A novel protein encoded by circKANSL1L regulates skeletal myogenesis via the Akt-FoxO3 signaling axis
2024-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2023.128609
PMID:38056741
|
研究论文 | 该文章报道了一种新型蛋白质circKANSL1L在骨骼肌生成中的作用 | 发现了由circKANSL1L编码的新型蛋白质及其在肌生成中的潜在功能 | 研究主要集中在猪的肌肉，可能不适用于其他物种 | 探究circKANSL1L如何通过Akt-FoxO3信号通路调控骨骼肌生成 | Lantang和Landrace猪的长背肌肉样本 | 数字病理学 | NA | circRNAome-seq和Ribo-seq | NA | 代谢组学和单细胞转录组学数据 | 来自Lantang和Landrace小猪的长背肌肉样本 | NA | NA | NA | NA |
| 426 | 2024-08-05 |
Exosomal lncCRLA is predictive for the evolvement and development of lung adenocarcinoma
2024-02-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216588
PMID:38097132
|
研究论文 | 本研究揭示了lncCRLA在肺腺癌发展中的预测作用 | 发现plasmatic lncCRLA作为一种新型循环生物标志物，能够预测肺腺癌的发生和演变 | 研究主要集中在lncCRLA的作用机制，缺乏对其长期临床应用的验证 | 探讨lncCRLA在肺腺癌进展中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 主要研究对象为肺腺癌细胞及其相关lncRNA | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序、RNA-Mutect技术和空间转录组学 | 转基因小鼠模型 | 细胞和组织样本 | 使用了少量的肺腺癌细胞和转基因小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 427 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling of primary tumors and paired organoids of pancreatobiliary cancer
2024-02-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216586
PMID:38081505
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了原发性胰胆道癌及其配对的类器官的转录组特征 | 揭示了原发肿瘤和其配对类器官在转录组水平上的异同，并确认了类器官模型在胰胆道癌研究中的应用前景 | 尚不清楚类器官是否能忠实反映原发胰胆道癌的异质性 | 探讨类器官模型在胰胆道癌的适用性 | 来自一例胆道癌和两例胰腺导管腺癌患者的原发肿瘤及其配对类器官 | 数字病理学 | 胰胆道癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 类器官模型 | 转录组数据 | 3个患者（1个胆管癌和2个胰腺导管腺癌） | NA | NA | NA | NA |
| 428 | 2024-08-07 |
Deciphering the immune modulation through deep transcriptomic profiling and therapeutic implications of DNA damage repair pattern in hepatocellular carcinoma
2024-02-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216594
PMID:38135208
|
研究论文 | 本研究通过深度转录组分析和机器学习框架，探讨了DNA损伤修复（DDR）在肝细胞癌（HCC）中的免疫调节作用及其治疗意义 | 引入了一种创新的深度机器学习框架，用于精确评估DDR，并利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA-seq数据 | NA | 深入理解DDR在HCC中的作用及其对肿瘤微环境的影响，探索免疫调节机制 | 肝细胞癌（HCC）中的DNA损伤修复（DDR）及其对免疫细胞和免疫调节途径的影响 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA-seq，反相蛋白阵列（RPPA） | 机器学习模型 | RNA-seq数据 | 总共分析了85,628个细胞，包括1027名患者的数据和22个肝癌细胞系的RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 429 | 2024-08-05 |
The gut microbiota and its biogeography
2024-Feb, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-023-00969-0
PMID:37740073
|
综述 | 本文探讨了肠道微生物群的生物地理学及其在生态系统中的重要性 | 文章介绍了更高分辨率的测序和单细胞数据在理解肠道微生物多样性方面的重要性 | 缺乏针对微观交互的系统长期研究 | 研究肠道微生物群的分布和多样性以及与宿主的关系 | 肠道微生物群落及其空间异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 430 | 2024-08-05 |
Multi-omics data integration shines a light on the renal medulla
2024-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.11.014
PMID:38245213
|
研究论文 | 该文章研究了肾髓质在肾功能中的作用，并构建了肾髓质标记基因的参考集 | 创新点在于利用多组学数据整合来定义肾髓质的分子程序 | 获取高质量组织的挑战限制了对调控髓质的分子程序的表征 | 研究肾髓质在维持盐和水平衡中的作用 | 研究标记基因以定义肾髓质在肾功能中的角色 | 数字病理学 | NA | 基因表达、染色质可及性、长程染色体相互作用和空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 431 | 2024-08-07 |
Specialized Retinal Endothelial Cells Modulate Blood-Retina Barrier in Diabetic Retinopathy
2024-Feb-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0368
PMID:37976214
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了视网膜内皮细胞的异质性和功能多样性，特别是在糖尿病视网膜病变中的作用 | 发现了一种新的糖尿病特异性视网膜内皮细胞群，并通过上调ACER2表达来减少神经酰胺含量和内皮细胞功能障碍的负反馈调节途径 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示视网膜内皮细胞的异质性和功能多样性，特别是在糖尿病视网膜病变中的作用 | 视网膜内皮细胞及其在糖尿病视网膜病变中的作用 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括非增生性糖尿病视网膜病变（NPDR）伴有或不伴有糖尿病黄斑水肿（DME/NDME）和活动性增生性DR（PDR）患者的血浆样本，以及糖尿病小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 432 | 2024-08-07 |
Changes in cuproptosis-related gene expression in periodontitis: An integrated bioinformatic analysis
2024-Feb-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122388
PMID:38181851
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了牙周炎中铜死亡相关基因（CRGs）的表达变化及其生物学功能 | 首次全面分析了不同表达的CRGs（DE-CRGs）在牙周炎中的综合效应，并探讨了其与免疫浸润、免疫因子、线粒体功能障碍、诊断效能及预测药物的相关性 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分有限 | 探讨牙周炎中铜死亡相关基因的表达变化及其在疾病发生和治疗中的作用 | 牙周炎中的铜死亡相关基因及其生物学功能 | NA | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了正常和牙周炎牙龈样本，具体数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 433 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of liver immune microenvironment changes induced by microplastics in mice with non-alcoholic fatty liver
2024-Feb-20, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2023.168308
PMID:37977403
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了微塑料暴露下非酒精性脂肪肝小鼠肝脏免疫微环境的改变 | 首次揭示了微塑料暴露对非酒精性脂肪肝小鼠肝脏免疫细胞亚群的影响及其分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人体中验证相关发现 | 探究微塑料暴露对非酒精性脂肪肝小鼠肝脏免疫微环境的影响 | 非酒精性脂肪肝小鼠肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 43,480个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 434 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomic interrogation of the tumour-stroma boundary in a 3D engineered model of ameloblastoma
2024-Feb, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2023.100923
PMID:38226014
|
研究论文 | 本文研究了在3D设计的肿瘤-基质模型中，肿瘤-基质边界的空间转录组学特征 | 首次展示了肿瘤细胞基因表达如何受到不同基质细胞存在的影响 | 研究可能限制在特定类型的基质细胞与肿瘤细胞之间的相互作用 | 研究肿瘤微环境中基质细胞对肿瘤行为的影响 | 使用工程化的多腔肿瘤体进行研究，以探讨不同基质对肿瘤细胞的影响 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 多腔肿瘤体 | 基因表达数据 | 多个工程化肿瘤模型样本 | NA | NA | NA | NA |
| 435 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA Sequencing (scRNA-seq): Advances and Challenges for Cardiovascular Diseases (CVDs)
2024-Feb, Current problems in cardiology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.cpcardiol.2023.102202
PMID:37967800
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在心血管疾病（CVDs）研究中的应用及其带来的挑战 | scRNA-seq技术揭示了心脏和血管系统中先前未知的细胞类型及其在不同疾病病理中的相关性 | NA | 深入理解心血管疾病的基本机制，改进治疗策略和患者风险评估 | 心血管疾病及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 436 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell sequencing and weighted co-expression network identifies a novel signature based on cellular senescence-related genes to predict prognosis in glioblastoma
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23921
PMID:37565732
|
研究论文 | 该文章探讨了细胞衰老相关基因在预后预测中的应用，特别是在胶质母细胞瘤中 | 本研究通过整合单细胞测序和加权共同表达网络分析，识别出一种新的与细胞衰老相关的基因签名，用于预测胶质母细胞瘤的预后 | 研究限制在于样本可能存在的偏倚及未完全考虑的潜在影响因素 | 本研究旨在揭示细胞衰老对胶质母细胞瘤患者预后的影响 | 研究对象为胶质母细胞瘤患者的基因表达和临床数据 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 总计选取了150个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 437 | 2024-08-05 |
Multidimensional progressive single-cell sequencing reveals cell microenvironment composition and cancer heterogeneity in lung cancer
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24018
PMID:37956258
|
研究论文 | 该文章通过多维逐渐单细胞测序揭示了肺癌的细胞微环境成分和肿瘤异质性。 | 通过单细胞RNA测序区分了八种不同的细胞类型，揭示了肿瘤微环境的显著肿瘤内异质性，并发现了潜在的预测生物标志物。 | 文章中未提及具体的研究限制。 | 研究肺癌细胞微环境的组成和肿瘤异质性。 | 研究对象为19个不同的肺癌肿瘤样本，分析其细胞类型和基因表达模式。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 19个肺癌肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 438 | 2024-08-07 |
Single-cell combined with bulk-RNA data reveal a pattern related to angiogenesis in breast cancer patients: Individualized medicine
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23947
PMID:37647361
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据，揭示了与乳腺癌患者血管生成相关的模式，并构建了个性化治疗模型。 | 本研究首次综合单细胞和批量RNA测序数据，通过随机森林生存分析构建了预测模型，并在外部验证集中进行了验证。 | 研究主要集中在三阴性乳腺癌患者，可能不适用于所有乳腺癌亚型。 | 揭示乳腺癌患者血管生成的相关模式，并构建个性化治疗模型。 | 乳腺癌患者的RNA测序数据和生存数据。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | 随机森林 | RNA测序数据 | 1082名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 439 | 2024-08-07 |
Transcriptome characteristics of epithelial cells from advanced non-small cell lung cancer were revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23960
PMID:37676967
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了晚期非小细胞肺癌上皮细胞的转录组特征 | 首次发现TPI1作为LUAD的新型生物标志物，并揭示了MXD3和GATA4作为潜在的调控转录因子 | NA | 探索与LUAD患者免疫浸润和生存时间相关的差异表达基因，并预测转录因子以揭示LUAD的分子机制和个体化治疗 | 晚期非小细胞肺癌的上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 16种上皮细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 440 | 2024-08-07 |
The single-cell evolution trajectory presented different hypoxia heterogeneity to reveal the carcinogenesis of genes in clear cell renal cell carcinoma: Based on multiple omics and real experimental verification
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24009
PMID:37886854
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中基因的癌变机制及其与缺氧异质性的关系 | 本研究首次识别了ccRCC中多个与缺氧相关的肿瘤微环境（TME）亚群，并揭示了ANGPTL4在调控ccRCC增殖中的作用 | NA | 探讨透明细胞肾细胞癌中基因的癌变机制及其与缺氧异质性的关系 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及其相关基因和细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | scRNA-seq | UMAP, NMF | 单细胞RNA测序数据 | 使用了来自GSE159115数据集的scRNA-seq数据，以及ccRCC细胞系的786-O和Caki细胞 | NA | NA | NA | NA |