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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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401 | 2024-08-05 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize the molecular and cellular architecture of the ischemic mouse brain
2024-Feb-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg1323
PMID:38324639
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学研究小鼠缺血半球的分子和细胞结构 | 本研究首次揭示了缺血大脑中非神经元细胞的分子和空间特征,以及细胞类型间的相互作用 | 对缺血大脑中其他细胞类型的研究较为有限 | 研究缺血后小鼠大脑的分子和细胞架构 | 小鼠缺血半球及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 缺血性脑卒中 | 空间转录组学 | NA | 转录组 | 19777个点 |
402 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the impact of mechanical loading on knee tibial cartilage in osteoarthritis
2024-Feb-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111496
PMID:38224628
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了机械负荷对膝骨关节炎患者膝关节胫骨软骨中软骨细胞亚群的影响 | 首次识别出一种新的软骨细胞亚群HTC-C,并分析了其在不同机械负荷条件下的功能和细胞间相互作用 | 研究仅限于KOA患者的膝关节胫骨软骨,且样本量未具体说明 | 探究机械负荷对膝骨关节炎发展中软骨细胞亚群的影响及其分子机制 | 膝骨关节炎患者的膝关节胫骨软骨 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本量未提及 |
403 | 2024-08-07 |
Elevated enteric putrescine suppresses differentiation of intestinal germinal center B cells
2024-Feb-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111544
PMID:38266445
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研究论文 | 本研究探讨了外源性腐胺对肠道微环境中B细胞分化的影响 | 发现腐胺通过影响B细胞受体信号通路和脂肪酸氧化相关基因,抑制肠道B细胞分化,并揭示了腐胺在不同癌症中的免疫调节作用 | NA | 研究腐胺与B细胞成熟和代谢失调之间的因果关系及其机制 | 肠道微环境中的B细胞分化 | 免疫学 | NA | bulk RNA测序和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA |
404 | 2024-08-07 |
Understanding the cell fate and behavior of progenitors at the origin of the mouse cardiac mitral valve
2024-Feb-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.006
PMID:38198889
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和回顾性多色克隆分析,探讨了小鼠心脏二尖瓣起源的前体细胞的命运和行为 | 首次详细描述了二尖瓣前体细胞的代谢过程和其在阀叶形成中的特定贡献 | NA | 揭示小鼠心脏二尖瓣前体细胞的身份、命运决策及其在阀叶中的行为和分布 | 小鼠胚胎和新生儿的二尖瓣前体细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 涉及小鼠胚胎和新生儿的二尖瓣前体细胞样本 |
405 | 2024-08-07 |
Autoreactive T cells target peripheral nerves in Guillain-Barré syndrome
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06916-6
PMID:38233524
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研究论文 | 本文通过结合体外T细胞筛选、单细胞RNA测序和T细胞受体(TCR)测序,研究了Guillain-Barré综合征(GBS)中自身反应性T细胞的作用 | 首次鉴定出具有细胞毒性T辅助1(T1)样表型的自身反应性记忆CD4细胞和针对周围神经髓鞘抗原的稀有CD8 T细胞,并揭示了多克隆TCR谱系、短CDR3β长度、偏好HLA-DR限制和识别免疫优势表位 | NA | 揭示Guillain-Barré综合征中自身反应性T细胞的免疫机制 | Guillain-Barré综合征患者中的自身反应性T细胞 | NA | Guillain-Barré综合征 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | RNA | 超过1,000个自身反应性单T细胞克隆 |
406 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals the role of antigen presentation in liver metastatic breast cancer
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108896
PMID:38318373
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研究论文 | 这篇文章深入分析了11例晚期乳腺癌患者的肝转移转录组特征 | 揭示了肝转移相关的抗原呈递功能障碍与肿瘤浸润T细胞的关系 | 样本量较小,仅为11例,可能影响结果的普遍性 | 研究肝转移乳腺癌中抗原呈递的作用 | 11例患有继发性肝癌的乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 11例 |
407 | 2024-08-07 |
Compartmentalization and synergy of osteoblasts drive bone formation in the regenerating fin
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108841
PMID:38318374
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、谱系追踪、靶向成骨细胞消融和电子显微镜技术,探讨了斑马鱼再生鳍中表皮、成骨细胞和非成骨细胞的谱系关系及其在再生过程中的作用 | 研究揭示了再生鳍中成骨细胞的来源及其在再生过程中的分工和协同作用,以及再生受损时的检测和补偿机制 | NA | 探讨斑马鱼再生鳍中细胞的谱系关系及其在再生过程中的作用 | 斑马鱼再生鳍中的表皮细胞、成骨细胞和非成骨细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、谱系追踪、靶向消融、电子显微镜 | NA | RNA | NA |
408 | 2024-08-07 |
Comparative transcriptomic analysis of bovine mesenchymal stromal cells reveals tissue-source and species-specific differences
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108886
PMID:38318381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了来自脂肪组织、骨髓和外周血的牛间充质干细胞的转录组特征,并探讨了其与马和人类间充质干细胞的异同 | 首次系统比较了不同来源的牛间充质干细胞的转录组特征,并揭示了其与人类间充质干细胞的相似性,为牛作为非传统动物模型用于间充质干细胞研究提供了依据 | NA | 探讨牛间充质干细胞的转录组特征及其与人类和马间充质干细胞的异同 | 牛间充质干细胞及其与人类和马间充质干细胞的转录组特征 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自脂肪组织、骨髓和外周血的牛间充质干细胞,以及来自相同组织的马间充质干细胞和人类及小鼠的骨髓间充质干细胞 |
409 | 2024-08-07 |
Delivery of Interferon β-Encoding Plasmid via Lipid Nanoparticle Restores Interferon β Expression to Enhance Antitumor Immunity in Colon Cancer
2024-Feb-06, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c10972
PMID:38319978
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研究论文 | 本文研究通过脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒,以恢复干扰素β表达并增强结直肠癌的抗肿瘤免疫 | 利用脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒,增强肿瘤免疫原性和T细胞效应功能,抑制结直肠癌生长 | NA | 测试通过阳离子脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒至肿瘤,恢复干扰素β表达以抑制肿瘤免疫逃逸的效果 | 结直肠癌细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-Seq, scRNA-Seq | NA | RNA | 涉及人类结直肠肿瘤组织和细胞,以及小鼠模型 |
410 | 2024-08-05 |
Gut microbiota-derived LCA mediates the protective effect of PEDV infection in piglets
2024-Feb-05, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-023-01734-4
PMID:38317217
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研究论文 | 本研究探讨了肠道微生物群与仔猪对PEDV感染的抵抗力之间的关系 | 发现LCA在炎症中发挥保护作用,并通过影响肠道T细胞群体来增强抗病毒效果 | 实验主要集中在猪的模型上,缺乏对其他动物或人类的广泛适用性研究 | 调查肠道微生物群在猪仔对PEDV感染抵抗力中的作用 | 猪仔的肠道微生物群及其对猪流行性腹泻病毒(PEDV)感染的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学,16S扩增子测序,宏基因组学,非靶向代谢组学 | NA | NA | NA |
411 | 2024-08-07 |
Cellular Senescence Contributes to the Progression of Hyperoxic Bronchopulmonary Dysplasia
2024-Feb, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0038OC
PMID:37874230
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研究论文 | 本文研究了细胞衰老在超氧环境下支气管肺发育不良(BPD)进展中的作用 | 首次提出细胞衰老在BPD进展中的重要作用,并探讨了减少髓过氧化物酶毒性氧化物产生、内质网应激和减轻细胞衰老作为潜在治疗策略的可能性 | NA | 探讨细胞衰老在超氧环境下支气管肺发育不良进展中的作用及其潜在治疗策略 | 人类肺部解剖样本和Sprague-Dawley大鼠幼崽 | NA | 支气管肺发育不良 | NA | NA | 组织学、转录组学和免疫印迹数据 | 人类肺部解剖样本和大鼠幼崽 |
412 | 2024-08-05 |
Skin single-cell transcriptomics reveals a core of sebaceous gland-relevant genes shared by mice and humans
2024-Feb-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10008-8
PMID:38310227
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠和人类皮肤中与皮脂腺相关的基因的核心。 | 首次通过单细胞转录组学方法比较了小鼠和人类皮脂腺相关基因的表达差异,发现种间间存在显著差异。 | 研究中观察到在小鼠和人类样本中,皮脂腺特有转录本的重叠极少,可能限制了其跨物种的比较分析。 | 探索并比较小鼠和人类皮脂腺中特有的基因表达模式。 | 小鼠和人类的皮肤样本,通过单细胞RNA测序进行分析。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠与人类皮肤样本 |
413 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analyses reveal critical regulators of spermatogonial stem cell fate transitions
2024-Feb-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10072-0
PMID:38310206
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了精原干细胞命运转变的关键调控因子 | 本研究首次描述了静止状态的精原干细胞亚群,即Eomes+精原细胞,并提供了精原干细胞命运决定的动态转录图谱 | NA | 探索未分化精原细胞亚群的分子特征和关键调控因子 | 精原干细胞及其前体细胞的命运转变 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 从小鼠中分离的未分化精原细胞 |
414 | 2024-08-05 |
Comparison of preparation methods of rat kidney single-cell suspensions
2024-02-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53270-2
PMID:38307992
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研究论文 | 本文探讨了一种名为逐步酶消化(StE)的方法以制备大鼠整个肾脏组织的单细胞悬液。 | StE方法在收获率、单细胞率和细胞活性方面优于传统的机械研磨法和简单酶消化法。 | 文章没有提到本文方法的临床应用或长期效果的评估。 | 研究旨在提高大鼠肾脏单细胞悬液的制备效率与质量。 | 研究对象为大鼠的整个肾脏组织。 | 数字病理学 | NA | 酶消化 | NA | NA | NA |
415 | 2024-08-05 |
Analysis of brain and blood single-cell transcriptomics in acute and subacute phases after experimental stroke
2024-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01711-x
PMID:38177281
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研究论文 | 本研究探讨了缺血性中风后脑部和血液单细胞转录组学的变化 | 首次揭示了缺血性中风后微胶质细胞、单核细胞来源的巨噬细胞和中性粒细胞的时间动态和多样性 | 对外周白细胞和脑内常驻细胞的具体动态变化尚不够了解 | 研究缺血性中风后脑细胞和血细胞的转录组动态 | 小鼠在缺血性中风后2天和14天的脑和血液细胞 | 数字病理学 | 脑卒中 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本,具体数量未提供 |
416 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics analysis of cellular heterogeneity and immune mechanisms in neurodegenerative diseases
2024-Feb, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.16242
PMID:38221677
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综述 | 本文章主要分析了单细胞转录组学在神经退行性疾病中的细胞异质性和免疫机制方面的应用 | 强调了单细胞转录组技术在揭示神经退行性疾病中细胞异质性和免疫机制方面的重要性 | 未明确提及具体的实验研究或数据支持 | 探讨神经退行性疾病的发病机制及开发新的治疗方法 | 神经退行性疾病中的单细胞转录组和免疫细胞 | 数字病理 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
417 | 2024-08-07 |
Association of HBsAg levels with differential gene expression in NK, CD8 T, and memory B cells in treated patients with chronic HBV
2024-Feb, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100980
PMID:38314025
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研究论文 | 本研究探讨了在慢性HBV感染治疗过程中,循环HBsAg水平对NK、CD8 T和记忆B细胞基因表达的影响。 | 首次发现HBsAg对NK、CD8 T和记忆B细胞亚群在血液和肝脏中有特定影响。 | 研究样本量较小,且仅限于接受NUC治疗的慢性HBV感染患者。 | 旨在研究高和低循环HBsAg水平对免疫调节的影响,以增进对HBV免疫反应的理解。 | 慢性HBV感染治疗中的NK、CD8 T和记忆B细胞。 | 免疫学 | 肝炎 | 10x Genomics单细胞RNA测序 | NA | RNA | 18名接受tenofovir/entecavir治疗的慢性HBV感染患者 |
418 | 2024-08-07 |
T-cell infiltration and its regulatory mechanisms in cancers: insights at single-cell resolution
2024-Feb-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02960-w
PMID:38303018
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究肿瘤浸润T细胞及其调控机制的最新进展 | 采用单细胞RNA测序技术进行高分辨率分析,揭示了不同表型免疫细胞及其微环境因素的精确组成 | NA | 探讨影响T细胞浸润的因素,以理解肿瘤免疫并提高癌症免疫治疗的效果 | 肿瘤浸润T细胞及其调控机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
419 | 2024-08-07 |
A single cell RNAseq benchmark experiment embedding "controlled" cancer heterogeneity
2024-Feb-02, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03002-y
PMID:38307867
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研究论文 | 本文介绍了一个基于10X Genomics平台的单细胞RNA测序实验,通过使用表达七种不同驱动基因的肺癌细胞系,创建了一个受控的癌症异质性环境 | 本研究提供了一个全面的框架,用于开发和验证通过单细胞RNA测序分析癌症异质性的方法 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据分析中的挑战,特别是细胞注释和肿瘤亚群识别 | 肺癌细胞系,表达七种不同驱动基因(EGFR, ALK, MET, ERBB2, KRAS, BRAF, ROS1) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用表达七种不同驱动基因的肺癌细胞系 |
420 | 2024-08-05 |
Cellular heterogeneity in red and melanized focal muscle changes in farmed Atlantic salmon (Salmo salar) visualized by spatial transcriptomics
2024-Feb, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-023-03850-x
PMID:38087072
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研究论文 | 本文使用空间转录组学技术研究了养殖大西洋鲑鱼的红色和黑色局部肌肉变化的细胞异质性 | 研究揭示了红色和黑色肌肉变色中的相似分子机制,并展示了不同样本类型中基因的独特表达模式 | 本研究未提及具体样本量和实验条件的限制 | 研究养殖大西洋鲑鱼肌肉的病理条件和细胞异质性 | 养殖大西洋鲑鱼的红色和黑色肌肉局部变化 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |