本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Development and experimental validation of a machine learning-based disulfidptosis-related ferroptosis score for hepatocellular carcinoma
2024-02, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01900-x
PMID:37875647
|
研究论文 | 开发并实验验证了一种基于机器学习的双硫死亡相关铁死亡评分系统,用于肝细胞癌研究 | 首次构建双硫死亡相关铁死亡(DRF)评分系统,并通过单细胞水平分析和体外实验验证KIF20A功能 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证 | 探索双硫死亡相关铁死亡基因在肝细胞癌中的作用机制 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 体外实验 | Pearson分析, 差异分析, uniCox回归, lasso, ranger, 多变量Cox回归 | 基因表达数据 | 肝细胞癌患者队列 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Myeloid-specific ablation of Basp1 ameliorates diet-induced NASH in mice by attenuating pro-inflammatory signaling
2024-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000537
PMID:37505219
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现Basp1是NASH中髓系细胞炎症信号的关键调控因子 | 首次发现Basp1在NASH肝脏中特异性高表达,并通过髓系特异性敲除证实其在NASH发病机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床意义需要进一步验证 | 探究髓系细胞在NASH发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 小鼠髓系细胞(巨噬细胞和树突状细胞)及人类NASH肝脏样本 | 生物医学研究 | 非酒精性脂肪性肝炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据 | 小鼠模型及人类肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
AMPK signaling inhibits the differentiation of myofibroblasts: impact on age-related tissue fibrosis and degeneration
2024-02, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-023-10072-9
PMID:37917219
|
研究论文 | 本文探讨AMPK信号通路通过抑制肌成纤维细胞分化对年龄相关组织纤维化和退化的影响 | 揭示了AMPK信号通路作为肌成纤维细胞分化的有效抑制剂,并阐明其通过抑制TGF-β、NF-κB、STAT3和YAP/TAZ等信号通路发挥作用 | NA | 研究AMPK信号通路在年龄相关组织纤维化和退化中的作用机制 | 组织成纤维细胞、肌成纤维细胞及间充质细胞和髓系细胞 | 细胞生物学 | 年龄相关疾病 | 单细胞转录组研究 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582629
PMID:38464041
|
研究论文 | 本研究揭示了胰岛素信号通过调控R2逆转座子表达来维持跨代核糖体DNA拷贝数稳定的机制 | 首次发现胰岛素受体作为R2逆转座子的主要抑制因子,并阐明其通过整合rDNA拷贝数监测与环境感知来调控生殖系基因组稳定性 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物中的保守性尚需验证 | 探究生殖系rDNA拷贝数维持的调控机制 | 果蝇雄性生殖干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
A New Method for Constructing Macrophage-Associated Predictors of Treatment Efficacy Based on Single-Cell Sequencing Analysis
2024 Feb-Mar 01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000497
PMID:37982646
|
研究论文 | 基于单细胞测序分析构建巨噬细胞相关治疗疗效预测因子的新方法 | 开发了基于单细胞测序的巨噬细胞相关风险评分(TRS)模型,能够预测结直肠癌患者的预后和治疗反应 | NA | 构建结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的预后预测模型并评估其治疗预测价值 | 结直肠癌患者和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序分析 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结直肠癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Tertiary lymphoid structures sustain cutaneous B cell activity in hidradenitis suppurativa
2024-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169870
PMID:38113104
|
研究论文 | 本研究通过组织学分析、单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了化脓性汗腺炎皮损中三级淋巴结构的存在及其对B细胞活性的维持作用 | 首次在化脓性汗腺炎皮损中发现三级淋巴结构,并证明这些结构支持B细胞的持续活化和成熟过程 | 研究样本数量有限,且主要关注皮损局部微环境,未涉及全身免疫反应 | 探究化脓性汗腺炎皮损中B细胞的动态变化和微环境相互作用 | 化脓性汗腺炎患者的皮肤病变组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 组织学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 组织图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals variations in monocytes and Tregs between gout flare and remission
2024-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179067
PMID:38329132
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Granulocytic myeloid-derived suppressor cell activity during biofilm infection is regulated by a glycolysis/HIF1a axis
2024-Feb-29, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174051
PMID:38421730
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和代谢分析揭示了糖酵解/HIF1α轴在金黄色葡萄球菌生物膜感染中调控粒细胞性髓源抑制细胞免疫抑制功能的作用机制 | 首次发现糖酵解/HIF1α信号轴通过调控G-MDSCs代谢状态影响生物膜感染的慢性化进程 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证仍需扩大 | 探究G-MDSCs代谢特征与金黄色葡萄球菌假体关节感染慢性化的关联机制 | 粒细胞性髓源抑制细胞(G-MDSCs)和金黄色葡萄球菌生物膜感染模型 | 免疫代谢学 | 假体关节感染 | 单细胞RNA测序, 生物信息学代谢算法, 条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | PJI患者粒细胞样本和小鼠感染模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
An alternative splicing signature defines the basal-like phenotype and predicts worse clinical outcome in pancreatic cancer
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101411
PMID:38325381
|
研究论文 | 本研究发现了胰腺癌基底样亚型的特异性剪接特征及其与预后的关联 | 首次鉴定出QKI剪接因子作为基底样亚型决定因子,揭示了剪接调控在胰腺癌亚型分化中的新机制 | 未明确说明样本量大小和研究人群特征 | 探索剪接失调在胰腺癌亚型分化中的作用机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的分子亚型 | 分子生物学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
Surface CD52, CD84, and PTGER2 mark mature PMN-MDSCs from cancer patients and G-CSF-treated donors
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101380
PMID:38242120
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序技术识别了成熟PMN-MDSCs的特异性基因标记,并发现CD52、CD84和PTGER2可作为其潜在表面标志物 | 首次聚焦于成熟PMN-MDSCs的分子特征,发现了跨癌症类型和G-CSF处理供体的共享基因标记,并识别出三个新型表面标志物 | 研究样本来源包括癌症患者和G-CSF处理供体,但未明确样本规模及癌症类型的全面覆盖程度 | 精确分子表征循环多形核髓源性抑制细胞(PMN-MDSCs),特别是成熟亚群的特异性标志物 | 癌症患者和G-CSF处理的健康供体的成熟PMN-MDSCs及肿瘤相关中性粒细胞 | 免疫学 | 癌症 | RNA测序(RNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
vSPACE: Exploring Virtual Spatial Representation of Articular Chondrocytes at the Single-Cell Level
2024-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.577817
PMID:38370845
|
研究论文 | 开发了一种名为vSPACE的新方法,通过虚拟空间表示展示人类关节软骨细胞的单细胞RNA测序数据 | 提出了一种将单细胞RNA测序数据在二维空间中虚拟空间表示的新方法,模拟空间转录组学技术概念但以虚拟方式实现 | 方法目前仅限于二维空间表示,且仅在人关节软骨细胞数据上验证 | 探索单细胞水平上关节软骨细胞的虚拟空间表示方法 | 人类关节软骨细胞 | 单细胞分析 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | vSPACE | 单细胞RNA测序数据 | 6名健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals endoplasmic reticulum stress-related CAF subpopulations associated with chordoma progression
2024-02-02, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad173
PMID:37772937
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了脊索瘤中与内质网应激相关的癌症相关成纤维细胞亚群及其与肿瘤进展的关系 | 首次在脊索瘤中鉴定出表达缺氧基因且功能富集于内质网应激的CAF亚群,并证明其与肿瘤细胞的空间邻近关系和临床预后价值 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证 | 解析脊索瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性、空间分布和临床意义 | 脊索瘤组织和髓核组织样本 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 多重定量免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据, 免疫荧光图像 | 单细胞测序: 6个肿瘤样本(3原发+3复发)+3个对照样本, 共72,097个细胞; 批量RNA测序: 126例患者; QIF验证: 105例患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 多重定量免疫荧光 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Characterization of mismatch-repair/microsatellite instability-discordant endometrial cancers
2024-02-01, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.35030
PMID:37751191
|
研究论文 | 本研究评估了子宫内膜癌中错配修复/微卫星不稳定性检测结果不一致的情况及其临床意义 | 首次系统描述了MMR/MSI检测结果不一致的子宫内膜癌特征,发现亚克隆/异质性MMR表达与高复发率和肿瘤侵袭性相关 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 评估子宫内膜癌中MMR/MSI检测一致性及相关因素 | 666例子宫内膜癌患者样本 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 免疫组织化学, 微卫星不稳定性检测, MLH1甲基化分析, 全转录组分析, 二代测序 | NA | 组织样本, 基因表达数据, 甲基化数据 | 666例子宫内膜癌样本 | NA | 数字空间转录组学, 二代测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals Hippo signaling as a driver of fibrosis in hidradenitis suppurativa
2024-Feb-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169225
PMID:38051587
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示Hippo信号通路在化脓性汗腺炎纤维化中的驱动作用 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫染色技术,系统揭示了慢性HS的发病机制和细胞相互作用网络 | NA | 阐明化脓性汗腺炎的发病机制和纤维化形成过程 | 化脓性汗腺炎患者组织样本 | 数字病理学 | 皮肤炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫染色 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
A novel EIF3C-related CD8+ T-cell signature in predicting prognosis and immunotherapy response of nasopharyngeal carcinoma
2024-Feb-24, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05552-x
PMID:38400862
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于EIF3C相关CD8+ T细胞特征的预测模型,用于评估鼻咽癌预后和免疫治疗反应 | 首次构建了EIF3C相关的CD8+ T细胞特征(ETS)预测模型,能够同时预测鼻咽癌预后和免疫治疗反应 | NA | 开发可靠的生物标志物以准确预测鼻咽癌免疫治疗效果 | 鼻咽癌肿瘤免疫微环境中的CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫浸润评估算法 | LASSO算法, Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Indoximod-based chemo-immunotherapy for pediatric brain tumors: A first-in-children phase I trial
2024-02-02, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad174
PMID:37715730
|
研究论文 | 评估吲哚莫德联合化疗和放疗治疗儿童复发性脑肿瘤或新诊断弥漫性内生性脑桥胶质瘤的首次儿童I期临床试验 | 首次在儿童中评估IDO通路抑制剂吲哚莫德联合治疗的临床试验,通过单细胞测序证实了新循环CD8 T细胞克隆型的出现 | I期试验主要关注安全性和剂量确定,样本量有限,需要进一步II/III期试验验证疗效 | 评估吲哚莫德联合化疗或放疗治疗儿童脑肿瘤的安全性、耐受性和初步疗效 | 儿童复发性脑肿瘤或新诊断弥漫性内生性脑桥胶质瘤患者 | 临床试验 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体测序 | NA | 临床数据,血液样本测序数据 | 81名患者 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Dictionary learning for integrative, multimodal and scalable single-cell analysis
2024-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01767-y
PMID:37231261
|
研究论文 | 提出了一种名为'桥接整合'的新方法,通过多组学数据集作为分子桥梁整合跨模态的单细胞数据 | 首次使用多组学数据集作为字典来重建单模态数据集并将其转换到共享空间,实现了跨模态的单细胞数据整合 | 需要多组学数据集作为桥梁,可能受到多组学数据质量和可用性的限制 | 开发能够整合不同分子模态的单细胞数据分析方法 | 人类免疫细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序,染色质可及性分析,组蛋白修饰分析,DNA甲基化分析,蛋白质水平检测 | 字典学习 | 单细胞多组学数据 | 860万个人类免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Therapeutic application of human type 2 innate lymphoid cells via induction of granzyme B-mediated tumor cell death
2024-02-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.12.015
PMID:38211590
|
研究论文 | 本研究揭示了人类2型先天淋巴细胞通过分泌颗粒酶B诱导肿瘤细胞死亡的新机制 | 首次发现人类ILC2细胞具有分泌颗粒酶B并直接裂解肿瘤细胞的能力,建立了可扩展2000倍的人类ILC2细胞培养平台 | 未在小鼠ILC2细胞中观察到相同现象,研究主要基于体外和动物模型 | 探索人类2型先天淋巴细胞的抗肿瘤治疗潜力 | 人类2型先天淋巴细胞和肿瘤细胞 | 免疫学 | 白血病和实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
CCDC66 mutations are associated with high myopia through affected cell mitosis
2024-02-21, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2023-109434
PMID:37852749
|
研究论文 | 本研究通过外显子测序发现CCDC66基因突变与高度近视相关,并探讨了其通过影响细胞有丝分裂导致高度近视的机制 | 首次发现CCDC66基因无义突变(c.C172T, p.Q58X)与高度近视表型共分离,并证明CCDC66缺陷会通过影响微管聚合和细胞有丝分裂过程导致视网膜发育异常 | 样本量相对有限(一个家系和200例散发病例),功能研究主要在HEK293和Hela细胞系中进行,未在视网膜原代细胞中验证 | 鉴定高度近视的致病基因并探索其致病机制 | 高度近视患者家系和散发病例,人类和小鼠胚胎视网膜,HEK293和Hela细胞系 | 遗传学 | 高度近视 | 外显子测序,Sanger测序,单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因敲除,免疫荧光染色,免疫印迹 | NA | 基因组数据,转录组数据,细胞图像数据 | 1个高度近视家系和200例散发性高度近视患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Thrombopoietin mimetic stimulates bone marrow vascular and stromal niches to mitigate acute radiation syndrome
2024-Feb-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3946910/v1
PMID:38463959
|
研究论文 | 本研究探讨了血小板生成素模拟物通过调节骨髓血管和基质微环境促进造血系统恢复以缓解急性放射综合征的机制 | 首次阐明TPOm通过调控骨髓血管和基质微环境支持造血干细胞再生的作用机制,并发现其能提升VEGF-C水平和增强间充质干细胞胶原蛋白表达 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 研究血小板生成素模拟物在急性放射综合征治疗中对骨髓微环境的调节作用 | C57BL/6J小鼠的骨髓造血干细胞、血管内皮细胞和间充质基质细胞 | 放射医学 | 急性放射综合征 | 流式细胞术、全组织块共聚焦显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞计数数据、生存数据 | 9-14周龄C57BL/6J小鼠,在多个时间点(第4、7、10、14、18、21天)采集骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |