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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Surface CD52, CD84, and PTGER2 mark mature PMN-MDSCs from cancer patients and G-CSF-treated donors
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101380
PMID:38242120
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研究论文 | 本研究通过RNA测序技术识别了成熟PMN-MDSCs的特异性基因标记,并发现CD52、CD84和PTGER2可作为其潜在表面标志物 | 首次聚焦于成熟PMN-MDSCs的分子特征,发现了跨癌症类型和G-CSF处理供体的共享基因标记,并识别出三个新型表面标志物 | 研究样本来源包括癌症患者和G-CSF处理供体,但未明确样本规模及癌症类型的全面覆盖程度 | 精确分子表征循环多形核髓源性抑制细胞(PMN-MDSCs),特别是成熟亚群的特异性标志物 | 癌症患者和G-CSF处理的健康供体的成熟PMN-MDSCs及肿瘤相关中性粒细胞 | 免疫学 | 癌症 | RNA测序(RNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Lineage and ecology define liver tumor evolution in response to treatment
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101394
PMID:38280378
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析构建了肝细胞癌在治疗过程中的谱系与生态演化模型 | 提出基于谱系与生态评分的联合动态分析框架,首次在单细胞水平揭示肝癌治疗响应的演化轨迹 | 研究样本量有限,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 建立监测肿瘤治疗响应演化的分析框架 | 肝细胞癌患者肿瘤样本 | 单细胞组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 谱系-生态评分系统 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 纵向肿瘤活检样本+716例肝癌患者验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
vSPACE: Exploring Virtual Spatial Representation of Articular Chondrocytes at the Single-Cell Level
2024-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.577817
PMID:38370845
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研究论文 | 开发了一种名为vSPACE的新方法,通过虚拟空间表示展示人类关节软骨细胞的单细胞RNA测序数据 | 提出了一种将单细胞RNA测序数据在二维空间中虚拟空间表示的新方法,模拟空间转录组学技术概念但以虚拟方式实现 | 方法目前仅限于二维空间表示,且仅在人关节软骨细胞数据上验证 | 探索单细胞水平上关节软骨细胞的虚拟空间表示方法 | 人类关节软骨细胞 | 单细胞分析 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | vSPACE | 单细胞RNA测序数据 | 6名健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals endoplasmic reticulum stress-related CAF subpopulations associated with chordoma progression
2024-02-02, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad173
PMID:37772937
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了脊索瘤中与内质网应激相关的癌症相关成纤维细胞亚群及其与肿瘤进展的关系 | 首次在脊索瘤中鉴定出表达缺氧基因且功能富集于内质网应激的CAF亚群,并证明其与肿瘤细胞的空间邻近关系和临床预后价值 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证 | 解析脊索瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性、空间分布和临床意义 | 脊索瘤组织和髓核组织样本 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 多重定量免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据, 免疫荧光图像 | 单细胞测序: 6个肿瘤样本(3原发+3复发)+3个对照样本, 共72,097个细胞; 批量RNA测序: 126例患者; QIF验证: 105例患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 多重定量免疫荧光 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Characterization of mismatch-repair/microsatellite instability-discordant endometrial cancers
2024-02-01, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.35030
PMID:37751191
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研究论文 | 本研究评估了子宫内膜癌中错配修复/微卫星不稳定性检测结果不一致的情况及其临床意义 | 首次系统描述了MMR/MSI检测结果不一致的子宫内膜癌特征,发现亚克隆/异质性MMR表达与高复发率和肿瘤侵袭性相关 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 评估子宫内膜癌中MMR/MSI检测一致性及相关因素 | 666例子宫内膜癌患者样本 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 免疫组织化学, 微卫星不稳定性检测, MLH1甲基化分析, 全转录组分析, 二代测序 | NA | 组织样本, 基因表达数据, 甲基化数据 | 666例子宫内膜癌样本 | NA | 数字空间转录组学, 二代测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Exercise mitigates flow recirculation and activates metabolic transducer SCD1 to catalyze vascular protective metabolites
2024-02-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7481
PMID:38354249
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研究论文 | 本研究探讨运动如何通过激活代谢转导因子SCD1产生保护性代谢物来改善血管功能 | 首次揭示运动通过减轻血流再循环激活内皮SCD1催化油酸和棕榈油酸发挥血管保护作用的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明运动介导的血管保护代谢机制 | 野生型小鼠和内皮特异性SCD1敲除小鼠 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 非靶向代谢组学分析,单细胞转录组测序,计算机模拟分析 | 基因敲除小鼠模型,腺病毒转染过表达模型 | 代谢组数据,转录组数据,血流动力学数据 | 小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq,代谢组学 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals Hippo signaling as a driver of fibrosis in hidradenitis suppurativa
2024-Feb-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169225
PMID:38051587
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示Hippo信号通路在化脓性汗腺炎纤维化中的驱动作用 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫染色技术,系统揭示了慢性HS的发病机制和细胞相互作用网络 | NA | 阐明化脓性汗腺炎的发病机制和纤维化形成过程 | 化脓性汗腺炎患者组织样本 | 数字病理学 | 皮肤炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫染色 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
A novel EIF3C-related CD8+ T-cell signature in predicting prognosis and immunotherapy response of nasopharyngeal carcinoma
2024-Feb-24, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05552-x
PMID:38400862
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研究论文 | 本研究开发了一种基于EIF3C相关CD8+ T细胞特征的预测模型,用于评估鼻咽癌预后和免疫治疗反应 | 首次构建了EIF3C相关的CD8+ T细胞特征(ETS)预测模型,能够同时预测鼻咽癌预后和免疫治疗反应 | NA | 开发可靠的生物标志物以准确预测鼻咽癌免疫治疗效果 | 鼻咽癌肿瘤免疫微环境中的CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫浸润评估算法 | LASSO算法, Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Indoximod-based chemo-immunotherapy for pediatric brain tumors: A first-in-children phase I trial
2024-02-02, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad174
PMID:37715730
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研究论文 | 评估吲哚莫德联合化疗和放疗治疗儿童复发性脑肿瘤或新诊断弥漫性内生性脑桥胶质瘤的首次儿童I期临床试验 | 首次在儿童中评估IDO通路抑制剂吲哚莫德联合治疗的临床试验,通过单细胞测序证实了新循环CD8 T细胞克隆型的出现 | I期试验主要关注安全性和剂量确定,样本量有限,需要进一步II/III期试验验证疗效 | 评估吲哚莫德联合化疗或放疗治疗儿童脑肿瘤的安全性、耐受性和初步疗效 | 儿童复发性脑肿瘤或新诊断弥漫性内生性脑桥胶质瘤患者 | 临床试验 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体测序 | NA | 临床数据,血液样本测序数据 | 81名患者 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
Dictionary learning for integrative, multimodal and scalable single-cell analysis
2024-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01767-y
PMID:37231261
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研究论文 | 提出了一种名为'桥接整合'的新方法,通过多组学数据集作为分子桥梁整合跨模态的单细胞数据 | 首次使用多组学数据集作为字典来重建单模态数据集并将其转换到共享空间,实现了跨模态的单细胞数据整合 | 需要多组学数据集作为桥梁,可能受到多组学数据质量和可用性的限制 | 开发能够整合不同分子模态的单细胞数据分析方法 | 人类免疫细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序,染色质可及性分析,组蛋白修饰分析,DNA甲基化分析,蛋白质水平检测 | 字典学习 | 单细胞多组学数据 | 860万个人类免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Therapeutic application of human type 2 innate lymphoid cells via induction of granzyme B-mediated tumor cell death
2024-02-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.12.015
PMID:38211590
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研究论文 | 本研究揭示了人类2型先天淋巴细胞通过分泌颗粒酶B诱导肿瘤细胞死亡的新机制 | 首次发现人类ILC2细胞具有分泌颗粒酶B并直接裂解肿瘤细胞的能力,建立了可扩展2000倍的人类ILC2细胞培养平台 | 未在小鼠ILC2细胞中观察到相同现象,研究主要基于体外和动物模型 | 探索人类2型先天淋巴细胞的抗肿瘤治疗潜力 | 人类2型先天淋巴细胞和肿瘤细胞 | 免疫学 | 白血病和实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
CCDC66 mutations are associated with high myopia through affected cell mitosis
2024-02-21, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2023-109434
PMID:37852749
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研究论文 | 本研究通过外显子测序发现CCDC66基因突变与高度近视相关,并探讨了其通过影响细胞有丝分裂导致高度近视的机制 | 首次发现CCDC66基因无义突变(c.C172T, p.Q58X)与高度近视表型共分离,并证明CCDC66缺陷会通过影响微管聚合和细胞有丝分裂过程导致视网膜发育异常 | 样本量相对有限(一个家系和200例散发病例),功能研究主要在HEK293和Hela细胞系中进行,未在视网膜原代细胞中验证 | 鉴定高度近视的致病基因并探索其致病机制 | 高度近视患者家系和散发病例,人类和小鼠胚胎视网膜,HEK293和Hela细胞系 | 遗传学 | 高度近视 | 外显子测序,Sanger测序,单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因敲除,免疫荧光染色,免疫印迹 | NA | 基因组数据,转录组数据,细胞图像数据 | 1个高度近视家系和200例散发性高度近视患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Thrombopoietin mimetic stimulates bone marrow vascular and stromal niches to mitigate acute radiation syndrome
2024-Feb-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3946910/v1
PMID:38463959
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研究论文 | 本研究探讨了血小板生成素模拟物通过调节骨髓血管和基质微环境促进造血系统恢复以缓解急性放射综合征的机制 | 首次阐明TPOm通过调控骨髓血管和基质微环境支持造血干细胞再生的作用机制,并发现其能提升VEGF-C水平和增强间充质干细胞胶原蛋白表达 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 研究血小板生成素模拟物在急性放射综合征治疗中对骨髓微环境的调节作用 | C57BL/6J小鼠的骨髓造血干细胞、血管内皮细胞和间充质基质细胞 | 放射医学 | 急性放射综合征 | 流式细胞术、全组织块共聚焦显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞计数数据、生存数据 | 9-14周龄C57BL/6J小鼠,在多个时间点(第4、7、10、14、18、21天)采集骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
ACC1-mediated fatty acid biosynthesis intrinsically controls thymic iNKT cell development
2024-02-21, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad049
PMID:38041796
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研究论文 | 本研究揭示了乙酰辅酶A羧化酶1通过调控细胞存活在胸腺恒定自然杀伤T细胞发育中的关键作用 | 首次发现ACC1介导的脂肪酸生物合成通路对胸腺iNKT细胞发育具有内在调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类iNKT细胞发育的代谢调控机制尚需验证 | 探究代谢通路在iNKT细胞发育过程中的调控机制 | 小鼠胸腺iNKT细胞 | 免疫代谢学 | NA | 单细胞RNA测序,骨髓嵌合体实验 | NA | 基因表达数据 | T细胞特异性ACC1敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Techniques for Rapidly Sampling Six Crucial Organs in Adult Xenopus
2024-02-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66489
PMID:38436453
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研究论文 | 本文介绍了成年非洲爪蟾六个关键器官的快速采样技术 | 首次系统性地建立了成年非洲爪蟾器官识别和解剖的标准化方法,满足现代定量蛋白质组学和单细胞转录组学的研究需求 | 仅针对六种特定器官,未涵盖所有器官系统;方法主要适用于成年阶段 | 建立标准化的器官识别和解剖技术,促进多实验室对成年器官系统的研究 | 成年非洲爪蟾的心脏心室、肝脏、脂肪体、胰腺、成对肾脏和皮肤 | 发育生物学 | NA | 器官解剖、组织采样、定量蛋白质组学、单细胞转录组学、原位杂交、免疫组织化学、组织学 | NA | 组织样本 | NA | NA | 单细胞转录组学, 定量蛋白质组学 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Defining and targeting macrophage heterogeneity in the mammary gland and breast cancer
2024-02, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.7053
PMID:38426622
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综述 | 探讨乳腺和乳腺癌中巨噬细胞异质性及其靶向治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序技术揭示巨噬细胞亚群的空间分布与功能特异性 | 基于文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 解析巨噬细胞异质性在乳腺发育与乳腺癌中的作用机制 | 乳腺组织驻留巨噬细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Hybrid Oncocytic Tumors (HOTs) in Birt-Hogg-Dubé Syndrome Patients-A Tale of Two Cities: Sequencing Analysis Reveals Dual Lineage Markers Capturing the 2 Cellular Populations of HOT
2024-Feb-01, The American journal of surgical pathology
DOI:10.1097/PAS.0000000000002152
PMID:37994665
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研究论文 | 本研究通过整合分析和单细胞RNA测序鉴定出Birt-Hogg-Dubé综合征相关混合性嗜酸细胞肿瘤的双重谱系标记物 | 首次发现L1CAM和LINC01187在HOT中呈独特的棋盘格状互斥表达模式,能够捕获肿瘤中两种不同的上皮细胞群体 | 研究样本量有限,主要关注BHD综合征相关肿瘤 | 开发混合性嗜酸细胞肿瘤的诊断生物标志物 | Birt-Hogg-Dubé综合征患者的肾肿瘤和正常肾组织 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson Syndrome and Toxic epidermal necrolysis
2024-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.26.568771
PMID:38405793
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞测序技术分析Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症的组织特异性免疫反应 | 首次在SJS/TEN中同时进行单细胞转录组、表面蛋白质组和TCR测序,建立了多组学数据库 | 样本量相对有限(17例患者),为罕见疾病研究 | 阐明SJS/TEN的细胞免疫发病机制 | SJS/TEN患者的未受累皮肤、受累皮肤和水疱液 | 单细胞多组学 | Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症 | 单细胞转录组测序、表面蛋白质组测序、TCR测序 | NA | 单细胞多组学数据 | 17例SJS/TEN患者,共119,784个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Spatial analyses: Focusing on immune-stromal interactions to understand immunity in the tissue context
2024-02, Seminars in arthritis and rheumatism
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.semarthrit.2023.152319
PMID:38040516
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研究论文 | 通过空间分析技术研究免疫细胞与基质微环境的相互作用及其在组织免疫中的功能 | 结合多重免疫荧光和组织学与空间转录组学,首次发现先天淋巴样细胞在纤维血管巢中的定位特征及其在COVID-19诱导肺纤维化中的关键作用 | 尚未验证类似机制是否适用于其他纤维化相关疾病如自身免疫性疾病 | 理解组织环境中免疫细胞与微环境的相互作用机制 | 人类多种组织中的免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | COVID-19肺纤维化 | 多重免疫荧光组织学、空间转录组学 | 基于机器学习的细胞分割和注释 | 图像、转录组数据 | 多种人体组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Sequencing of Physically Interacting Cells in Human Kidney Allograft Rejection to Infer Contact-dependent Immune Cell Transcription
2024-02-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004762
PMID:37638864
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术推断人类肾脏移植排斥反应中物理相互作用细胞的转录程序 | 开发了结合CD45阳性富集策略和CITE-seq的测序物理相互作用细胞计算方法,能够从单细胞RNA测序数据中推断细胞间物理接触的转录特征 | 样本量相对较小(11例活检样本),空间信息在单细胞测序过程中丢失 | 研究人类肾脏移植排斥反应中免疫细胞间物理接触依赖的转录调控机制 | 人类肾脏移植活检样本中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肾脏移植排斥反应 | 单细胞RNA测序,CITE-seq(转录组和表位细胞索引测序) | 测序物理相互作用细胞计算方法 | 单细胞转录组数据,表面蛋白表达数据 | 11例人类肾脏移植活检样本,产生31,203个高质量单细胞文库 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10X Genomics平台 | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |