本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-04 |
scRNA-seq revealed high stemness epithelial malignant cell clusters and prognostic models of lung adenocarcinoma
2024-02-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-54135-4
PMID:38355636
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA-seq分析识别肿瘤干细胞相关的预后模型,以预测肺腺癌的预后、化疗药物及免疫治疗效果 | 本研究提出了一种基于干细胞相关基因的模型,以预测肺腺癌的预后和免疫微环境 | 该研究的样本量及数据来源可能限制了结论的广泛适用性 | 研究肺腺癌的预后因素及干细胞特征 | 样本包括高干细胞特征的恶性上皮细胞和肺腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CoxBoost + RSF模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-08-04 |
Biomarkers and prognostic factors of PD-1/PD-L1 inhibitor-based therapy in patients with advanced hepatocellular carcinoma
2024-Feb-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-023-00535-z
PMID:38355603
|
综述 | 本文总结了PD-1/PD-L1抑制剂在晚期肝细胞癌患者中的生物标志物和预后因素。 | 首次通过评估单细胞测序和空间转录组学的最新进展,揭示肿瘤异质性以及其生物标志物与预后的关系 | 可能缺乏关于某些预后因素和生物标志物的具体临床应用示例 | 探讨晚期肝细胞癌患者中使用PD-1/PD-L1抑制剂的生物标志物与预后因素 | 晚期肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的相关标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | NGS, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 临床数据, 生物标志物分析 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-08-07 |
Glycosylation-related genes mediated prognostic signature contribute to prognostic prediction and treatment options in ovarian cancer: based on bulk and single‑cell RNA sequencing data
2024-Feb-14, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11908-4
PMID:38355446
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据,识别与卵巢癌相关的糖基化相关基因,构建预测预后和免疫治疗的基因签名 | 首次基于单细胞和批量RNA测序数据构建糖基化相关基因签名,用于卵巢癌的预后预测和治疗策略 | NA | 识别卵巢癌中的主要糖基化相关基因,并构建有效的基因签名以预测预后和免疫治疗 | 卵巢癌患者的糖基化相关基因及其在预后和免疫治疗中的作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | COX回归, LASSO回归 | RNA测序数据 | 1187个糖基化相关基因, 16个基因签名 | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-08-07 |
Fine particulate matter 2.5 induces susceptibility to Pseudomonas aeruginosa infection via expansion of PD-L1high neutrophils in mice
2024-Feb-14, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02640-x
PMID:38355515
|
研究论文 | 本研究探讨了细颗粒物PM2.5暴露如何通过扩张表达PD-L1的高中性粒细胞导致小鼠对铜绿假单胞菌感染的易感性增加 | 首次揭示了PM2.5暴露通过扩张PD-L1高表达的中性粒细胞,影响其吞噬功能,从而增加对铜绿假单胞菌感染的易感性 | 研究主要在动物模型中进行,未来需在人体中验证相关发现 | 探讨PM2.5暴露对呼吸系统健康的影响及其分子机制 | 小鼠模型中的中性粒细胞和铜绿假单胞菌感染 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 多只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-08-04 |
Integrated transcriptomics uncovers an enhanced association between the prion protein gene expression and vesicle dynamics signatures in glioblastomas
2024-Feb-13, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11914-6
PMID:38347462
|
研究论文 | 本研究揭示了朊蛋白基因表达与胶质母细胞瘤中的囊泡动力学特征之间增强的关联。 | 本研究首次展示了PrPC作为胶质母细胞瘤中囊泡生物学调节因子的潜在角色,并且引入了一种新的研究工具GBMdiscovery。 | 本研究主要依赖于公开的RNA测序数据,可能存在数据偏倚和适用性限制。 | 研究PRNP/PrPC在胶质母细胞瘤生物学中的作用及其分子机制。 | 以患者来源的胶质母细胞瘤为研究对象,分析其RNA测序数据。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及来自四项独立研究的患者来源胶质母细胞瘤的公开RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-08-04 |
Residual ANTXR1+ myofibroblasts after chemotherapy inhibit anti-tumor immunity via YAP1 signaling pathway
2024-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45595-3
PMID:38346978
|
研究论文 | 这篇文章探讨了化疗后残留的ANTXR1+肌成纤维细胞如何通过YAP1信号通路抑制抗肿瘤免疫。 | 首次揭示了高分级浆液性卵巢癌中化疗对CAF群体的影响及其与抗肿瘤免疫的关系,特别是YAP1信号通路的作用。 | 研究主要集中在高分级浆液性卵巢癌,可能不适用于其他类型的癌症。 | 研究化疗对癌症相关成纤维细胞群体的影响,并探讨其对抗肿瘤免疫的作用。 | 针对在高分级浆液性卵巢癌中发现的不同CAF群体进行研究,特别是CAF-S1群体。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞分析、空间转录组学和免疫组化 | NA | 生物组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-08-04 |
Hypoblast from human pluripotent stem cells regulates epiblast development
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06871-2
PMID:38052228
|
研究论文 | 本文报告了利用人类多能干细胞生成真实的原始膜细胞的方法及其在胚胎发育中的作用 | 提出了利用人类多能干细胞生成的原始膜细胞在体外自组织模型中的创新应用 | 受伦理和法律限制,后植入阶段的研究受到限制 | 研究人类胚胎发育过程中的原始膜细胞及其机制 | 人类多能干细胞及其衍生的原始膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 三维双层结构模型 | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals alterations in perivascular macrophage lipid metabolism in the onset of Wooden Breast myopathy in broiler chickens
2024-02-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53904-5
PMID:38342952
|
研究论文 | 本研究旨在利用空间转录组学特征化与木胸肌病微观特征相关的细胞类型特异性表达谱 | 揭示了在木胸肌病早期阶段中周围血管巨噬细胞脂质代谢的改变 | 样本量较小,仅使用了三只鸡的肌肉样本 | 研究木胸肌病早期的细胞互作和基因表达模式 | 23天大肉鸡的右胸大肌的肌肉样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 肌肉样本 | 3只肉鸡 | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-08-07 |
CD40 is expressed in the subsets of endothelial cells undergoing partial endothelial-mesenchymal transition in tumor microenvironment
2024-Feb, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16045
PMID:38111334
|
研究论文 | 本文研究了肿瘤微环境中部分内皮-间质转化过程中表达CD40的特定内皮细胞亚群 | 建立了新的EndoMT报告细胞系统EMRECs,并鉴定了CD40作为部分EndoMT特异性标记物 | NA | 深入理解TGF-β诱导的EndoMT机制,并促进针对EndoMT驱动的癌症进展和转移的新治疗策略的开发 | 内皮细胞在部分内皮-间质转化过程中的基因表达和CD40的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类肿瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-08-07 |
A Data-Distribution and Successive Spline Points based discretization approach for evolving gene regulatory networks from scRNA-Seq time-series data using Cartesian Genetic Programming
2024-Feb, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105126
PMID:38278505
|
研究论文 | 本文提出了一种基于数据分布和连续样条点的离散化方法,用于从scRNA-Seq时间序列数据中进化基因调控网络,使用笛卡尔遗传编程 | 本文提出的分布和连续样条点离散化(DSSPD)方法考虑了数据分布和适当的预处理步骤,改进了基因调控网络的推断结果 | NA | 推断基因调控网络 | scRNA-Seq时间序列数据 | 系统生物学 | NA | scRNA-Seq | 笛卡尔遗传编程(CGP) | 时间序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-08-07 |
LINC00960 affects osteosarcoma treatment and prognosis by regulating the tumor immune microenvironment
2024-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24990
PMID:38352756
|
研究论文 | 本研究探讨了LINC00960在骨肉瘤中的表达及其对肿瘤免疫微环境的调控作用,评估了其在骨肉瘤治疗和预后中的价值 | 发现LINC00960在骨肉瘤中的高表达与转移和不良预后相关,并可能作为新的生物标志物用于预测骨肉瘤患者的总体生存 | NA | 评估LINC00960在骨肉瘤中的预后和治疗价值,并分析其作用机制 | 骨肉瘤患者的LINC00960表达及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 85例骨肉瘤样本及6例骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-08-07 |
A Novel Approach for Pancreas Transcriptomics Reveals the Cellular Landscape in Homeostasis and Acute Pancreatitis
2024-Feb-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.01.043
PMID:38325760
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FixNCut的单细胞RNA测序方法,用于研究胰腺在稳态和急性胰腺炎中的细胞景观 | FixNCut方法通过可逆固定组织,提高了对胰腺细胞,特别是腺泡细胞和免疫细胞的定义,为研究胰腺生物学和疾病提供了一个广泛适用的方法和参考图谱 | NA | 创新一种方法,克服现有单细胞RNA测序研究中腺泡细胞代表性不足的问题,加速对胰腺在健康和疾病状态下的研究 | 胰腺在稳态和急性胰腺炎中的细胞景观 | 数字病理学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 使用已建立的小鼠急性胰腺炎模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-08-07 |
Induction of lung progenitor cell-like organoids by porcine pluripotent stem cells
2024-Feb-29, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302402R
PMID:38334430
|
研究论文 | 本研究通过猪多能干细胞诱导生成肺祖细胞样类器官,并探讨了猪肺发育过程中的细胞类型和信号通路 | 首次报道了猪肺细胞的生成和发展,并确定了NKX2.1和FOXA2作为猪肺发育的关键核心转录因子 | NA | 研究猪肺发育和再生 | 猪多能干细胞诱导的肺祖细胞样类器官 | 数字病理学 | 肺部疾病 | scRNA-seq | Monocle算法 | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of aging mouse liver
2024-Feb-29, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302282R
PMID:38334462
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析研究了衰老小鼠肝脏的分子和细胞过程 | 首次全面分析了衰老过程中肝脏的单细胞转录组变化,揭示了衰老相关的细胞组成和基因表达变化 | NA | 探究衰老对小鼠肝脏的分子和细胞影响 | 衰老小鼠肝脏的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-08-07 |
Integrated Single-Cell Transcriptomic Atlas of Human Kidney Endothelial Cells
2024-Feb-14, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000320
PMID:38351505
|
研究论文 | 本文通过重新处理和整合7个关于人类肾脏控制单细胞/单核RNA测序数据集,构建了一个全面的人类肾脏内皮细胞单细胞转录组图谱 | 首次系统地描述了人类肾脏内皮细胞的异质性,并发现了7个具有不同分子特征和生理功能的内皮细胞亚群 | NA | 构建一个全面的人类肾脏内皮细胞单细胞转录组图谱,以理解这些细胞在疾病、衰老和物种间的变化 | 人类肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞/单核RNA测序 (sc/snRNAseq) | NA | 转录组数据 | 超过200,000个肾脏细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-08-04 |
vissE: a versatile tool to identify and visualise higher-order molecular phenotypes from functional enrichment analysis
2024-Feb-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05676-y
PMID:38331751
|
研究论文 | vissE是一个灵活的网络分析和可视化工具,用于从功能富集分析中识别和可视化高阶分子表型 | 本研究提出的vissE工具通过组织信息和提供多种可视化模块,克服了路径分析中结果冗余的问题 | 未提及具体的限制信息 | 旨在增强分子发现过程中的基因集富集和路径分析工作流程 | 应用vissE于三种不同技术的功能分析,包括乳腺癌的空间转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-08-07 |
UPP1 promotes lung adenocarcinoma progression through the induction of an immunosuppressive microenvironment
2024-Feb-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45340-w
PMID:38331898
|
研究论文 | 本研究通过综合单细胞RNA测序数据分析,揭示了UPP1通过诱导免疫抑制微环境促进肺腺癌进展的机制 | 首次发现UPP1肿瘤细胞与免疫抑制微环境的关联,并通过多种技术手段验证了UPP1在肺腺癌中的免疫抑制作用 | NA | 深入了解肺腺癌进展的分子机制 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据和基因表达数据 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 377,574个细胞来自117名肺腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-08-07 |
Tricarboxylic Acid Cycle Metabolite-Coordinated Biohydrogels Augment Cranial Bone Regeneration Through Neutrophil-Stimulated Mesenchymal Stem Cell Recruitment and Histone Acetylation-Mediated Osteogenesis
2024-Feb-07, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.3c15473
PMID:38284176
|
研究论文 | 本文开发了一种由柠檬酸(NaCit, Cit)协同的三羧酸(TCA)循环代谢物修饰的生物仿生水凝胶,显著促进了颅骨再生 | 首次展示了柠檬酸协同的CGG水凝胶通过调节免疫微环境和间充质干细胞命运,有效促进颅骨再生 | NA | 开发新型生物仿生水凝胶以改善颅骨再生 | 颅骨缺陷的再生 | 生物医学工程 | 颅骨疾病 | RNA测序 | NA | 生物材料 | 涉及大鼠和小鼠的颅骨缺陷模型 | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-08-04 |
KIF20B and MET, hub genes of DIAPHs, predict poor prognosis and promote pancreatic cancer progression
2024-Feb, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2023.155046
PMID:38266456
|
研究论文 | 这篇文章探讨了KIF20B和MET作为DIAPH基因的中心基因在胰腺癌中的预后和治疗价值 | 研究发现KIF20B和MET的共同下调可以抑制胰腺癌的进展,揭示了其潜在的治疗靶点 | 尚需进一步研究以验证KIF20B和MET联合预后在临床应用中的有效性 | 旨在评估KIF20B和MET在胰腺癌中的预后价值和治疗前景 | 研究对象为胰腺腺癌样本中KIF20B和MET的基因表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,质量谱,Co-IP实验 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-08-04 |
In-Depth Genomic Analysis: The New Challenge in Congenital Heart Disease
2024-Feb-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25031734
PMID:38339013
|
研究论文 | 本研究通过深度基因组分析探讨先天性心脏病的成因和机制 | 利用下一代测序技术揭示了先天性心脏病(CHD)相关的基因变异和组织发生的通路 | 未提及具体的样本大小和实验设置限制 | 研究先天性心脏病的遗传成因和机制 | 关注先天性心脏病患者及伴随外部异常的基因类群 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 下一代测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |