单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 444 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-07 |
Deconvolution at the single-cell level reveals ovarian cell-type-specific transcriptomic changes in PCOS
2024-Feb-19, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01195-w
PMID:38373962
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据对多囊卵巢综合征（PCOS）中的卵巢细胞类型特异性转录组变化进行了解卷积分析 | 首次使用单细胞RNA测序数据对PCOS中的卵巢细胞类型进行解卷积分析，揭示了细胞类型特异性的转录组变化 | 研究仅基于30个样本（15个对照 vs 15个PCOS），样本量相对较小 | 探究PCOS中卵巢组织的分子改变和细胞组成 | 多囊卵巢综合征（PCOS）中的卵巢细胞类型 | 数字病理学 | 生殖内分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 30个样本（15个对照 vs 15个PCOS） | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-08-04 |
The cycling and aging mouse female reproductive tract at single-cell resolution
2024-Feb-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.01.021
PMID:38325365
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研究论文 | 本研究系统性地表征了小鼠女性生殖道在生殖周期、妊娠和衰老过程中的形态学和基因表达变化 | 通过单细胞和空间转录组学分析，首次揭示了成纤维细胞在生殖道重塑中的中心和器官特异性角色 | 未提及具体的样本量和实验限制 | 探究生殖周期和衰老如何影响女性生殖道的重塑 | 小鼠的卵巢、输卵管、子宫、宫颈和阴道 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing to understand host-virus interactions
2024-Feb, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2023.11.009
PMID:38008383
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析宿主与病毒相互作用中的应用及其优缺点 | scRNA-seq技术能够以单细胞分辨率分析宿主和病毒转录本及宿主-病毒相互作用 | NA | 深入探讨scRNA-seq在病毒学研究中的应用，以更好地理解致病机制并发现更有效的治疗策略 | 宿主与病毒的相互作用及免疫图谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-08-07 |
Genome-wide DNA methylation of lesional and peri-lesional skin in vitiligo: a comparative and integrated analysis of multi-omics in Chinese population
2024-Feb, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-023-02630-5
PMID:38182908
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研究论文 | 本研究通过比较和整合分析中国人群中白癜风病变和周围皮肤的全基因组DNA甲基化情况 | 首次报道了临床白癜风及其周围皮肤的综合DNA甲基化图谱 | NA | 研究白癜风病变和周围皮肤的DNA甲基化特征，并整合转录组数据以识别差异甲基化和表达基因 | 白癜风患者的病变皮肤、周围皮肤和健康皮肤样本 | 数字病理学 | 白癜风 | Illumina 850K甲基化芯片 | NA | DNA甲基化数据和转录组数据 | 6个病变皮肤样本，6个周围皮肤样本，8个健康皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis dissects lncRNA-associated gene networks in Arabidopsis
2024-Feb-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100717
PMID:37715446
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了拟南芥中长非编码RNA（lncRNA）相关的基因调控网络 | 首次在单细胞分辨率下绘制了lncRNA及其相关基因调控网络的转录异质性图谱 | NA | 探索植物lncRNA生物学中的单细胞数据整合分析能力，并深入了解lncRNA表达特异性和相关基因调控 | 拟南芥中的lncRNA及其相关基因调控网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 28个已发表的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-08-07 |
Systems Analysis of Immune Changes after B-cell Depletion in Autoimmune Multiple Sclerosis
2024-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.576204
PMID:38370778
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了B细胞耗竭后在多发性硬化症患者中免疫景观的变化 | 首次全面揭示了B细胞耗竭治疗多发性硬化症后免疫细胞类型特异性变化及其功能影响 | NA | 探索B细胞耗竭疗法对多发性硬化症患者免疫系统的影响 | 多发性硬化症患者的免疫细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-08-04 |
Breaks for Precision Medicine in Cancer: Development and Prospects of Spatiotemporal Transcriptomics
2024-Feb, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2023.0116
PMID:38181185
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综述 | 本文回顾了时空转录组学在癌症研究中的整合策略及其最新进展 | 提出时空转录组学与单细胞RNA测序的数据整合，为癌症精确治疗提供新思路 | 对时空转录组学的整体应用仍处于初步探索阶段 | 揭示癌症的基因表达空间模式和细胞群体的空间异质性 | 癌症患者与细胞群体的基因表达及微环境相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing in melanoma: what have we learned so far?
2024-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.104969
PMID:38241976
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序在黑色素瘤中的应用及其带来的见解 | 探讨了单细胞测序技术如何促进对黑色素瘤异质性的理解 | 未明确列出局限性 | 分析黑色素瘤中的肿瘤内异质性及其对治疗反应的影响 | 黑色素瘤细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-08-07 |
Genomic profiling and associated B cell lineages delineate the efficacy of neoadjuvant anti-PD-1-based therapy in oesophageal squamous cell carcinoma
2024-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.104971
PMID:38244291
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研究论文 | 本研究通过整合全外显子测序、单细胞RNA测序和免疫荧光数据，分析了24名接受新辅助PD-1抑制剂联合紫杉醇和铂类化疗的食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的样本，以确定与治疗反应的相关性 | 研究发现DNA错配修复（MMR）途径的改变在最佳反应患者中频繁出现，并与肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）相关。此外，识别了B细胞在ESCC中的二分发展轨迹，其中LMO2+生发中心B细胞在响应肿瘤中富集，而CD55+记忆B细胞与组合治疗的较差反应相关 | NA | 旨在通过全面的肿瘤MMR途径改变和肿瘤内B细胞特征评估，改进接受新辅助化疗免疫治疗的ESCC患者的筛选和管理 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 全外显子测序、单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 基因组数据、转录组数据、免疫数据 | 24名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-08-07 |
High-dimensional profiling of regulatory T cells in psoriasis reveals an impaired skin-trafficking property
2024-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.104985
PMID:38306895
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研究论文 | 本研究通过高维39标记质谱流式细胞术(CyTOF)面板，深入分析了31名银屑病患者和32名健康对照者的皮肤归巢调节性T细胞(Tregs)的免疫景观，并结合体外趋化因子介导的Treg迁移实验、免疫荧光成像以及公共单细胞RNA测序数据，揭示了银屑病患者Tregs的皮肤归巢特性受损。 | 首次深入探索了银屑病患者皮肤归巢Tregs的分子特性，发现CLAhi Tregs和CLAhiCCR5+ Tregs在银屑病患者中的总体减少，以及功能标记物CD39和FoxP3的升高，CCR7表达增加而CCR4和CLA表达减少，这些变化与疾病严重程度相关。 | NA | 探究银屑病患者皮肤归巢调节性T细胞的分子特性和功能状态。 | 银屑病患者的皮肤归巢调节性T细胞。 | 免疫学 | 银屑病 | 质谱流式细胞术(CyTOF) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 31名银屑病患者和32名健康对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-08-04 |
scRNA-seq revealed high stemness epithelial malignant cell clusters and prognostic models of lung adenocarcinoma
2024-02-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-54135-4
PMID:38355636
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA-seq分析识别肿瘤干细胞相关的预后模型，以预测肺腺癌的预后、化疗药物及免疫治疗效果 | 本研究提出了一种基于干细胞相关基因的模型，以预测肺腺癌的预后和免疫微环境 | 该研究的样本量及数据来源可能限制了结论的广泛适用性 | 研究肺腺癌的预后因素及干细胞特征 | 样本包括高干细胞特征的恶性上皮细胞和肺腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CoxBoost + RSF模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-08-04 |
Biomarkers and prognostic factors of PD-1/PD-L1 inhibitor-based therapy in patients with advanced hepatocellular carcinoma
2024-Feb-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-023-00535-z
PMID:38355603
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综述 | 本文总结了PD-1/PD-L1抑制剂在晚期肝细胞癌患者中的生物标志物和预后因素。 | 首次通过评估单细胞测序和空间转录组学的最新进展，揭示肿瘤异质性以及其生物标志物与预后的关系 | 可能缺乏关于某些预后因素和生物标志物的具体临床应用示例 | 探讨晚期肝细胞癌患者中使用PD-1/PD-L1抑制剂的生物标志物与预后因素 | 晚期肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的相关标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | NGS, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 临床数据, 生物标志物分析 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-08-07 |
Glycosylation-related genes mediated prognostic signature contribute to prognostic prediction and treatment options in ovarian cancer: based on bulk and single‑cell RNA sequencing data
2024-Feb-14, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11908-4
PMID:38355446
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据，识别与卵巢癌相关的糖基化相关基因，构建预测预后和免疫治疗的基因签名 | 首次基于单细胞和批量RNA测序数据构建糖基化相关基因签名，用于卵巢癌的预后预测和治疗策略 | NA | 识别卵巢癌中的主要糖基化相关基因，并构建有效的基因签名以预测预后和免疫治疗 | 卵巢癌患者的糖基化相关基因及其在预后和免疫治疗中的作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | COX回归, LASSO回归 | RNA测序数据 | 1187个糖基化相关基因, 16个基因签名 | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-08-07 |
Fine particulate matter 2.5 induces susceptibility to Pseudomonas aeruginosa infection via expansion of PD-L1high neutrophils in mice
2024-Feb-14, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02640-x
PMID:38355515
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研究论文 | 本研究探讨了细颗粒物PM2.5暴露如何通过扩张表达PD-L1的高中性粒细胞导致小鼠对铜绿假单胞菌感染的易感性增加 | 首次揭示了PM2.5暴露通过扩张PD-L1高表达的中性粒细胞，影响其吞噬功能，从而增加对铜绿假单胞菌感染的易感性 | 研究主要在动物模型中进行，未来需在人体中验证相关发现 | 探讨PM2.5暴露对呼吸系统健康的影响及其分子机制 | 小鼠模型中的中性粒细胞和铜绿假单胞菌感染 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 多只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-08-04 |
Integrated transcriptomics uncovers an enhanced association between the prion protein gene expression and vesicle dynamics signatures in glioblastomas
2024-Feb-13, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11914-6
PMID:38347462
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研究论文 | 本研究揭示了朊蛋白基因表达与胶质母细胞瘤中的囊泡动力学特征之间增强的关联。 | 本研究首次展示了PrPC作为胶质母细胞瘤中囊泡生物学调节因子的潜在角色，并且引入了一种新的研究工具GBMdiscovery。 | 本研究主要依赖于公开的RNA测序数据，可能存在数据偏倚和适用性限制。 | 研究PRNP/PrPC在胶质母细胞瘤生物学中的作用及其分子机制。 | 以患者来源的胶质母细胞瘤为研究对象，分析其RNA测序数据。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及来自四项独立研究的患者来源胶质母细胞瘤的公开RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals alterations in perivascular macrophage lipid metabolism in the onset of Wooden Breast myopathy in broiler chickens
2024-02-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53904-5
PMID:38342952
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研究论文 | 本研究旨在利用空间转录组学特征化与木胸肌病微观特征相关的细胞类型特异性表达谱 | 揭示了在木胸肌病早期阶段中周围血管巨噬细胞脂质代谢的改变 | 样本量较小，仅使用了三只鸡的肌肉样本 | 研究木胸肌病早期的细胞互作和基因表达模式 | 23天大肉鸡的右胸大肌的肌肉样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 肌肉样本 | 3只肉鸡 | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-08-07 |
CD40 is expressed in the subsets of endothelial cells undergoing partial endothelial-mesenchymal transition in tumor microenvironment
2024-Feb, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16045
PMID:38111334
|
研究论文 | 本文研究了肿瘤微环境中部分内皮-间质转化过程中表达CD40的特定内皮细胞亚群 | 建立了新的EndoMT报告细胞系统EMRECs，并鉴定了CD40作为部分EndoMT特异性标记物 | NA | 深入理解TGF-β诱导的EndoMT机制，并促进针对EndoMT驱动的癌症进展和转移的新治疗策略的开发 | 内皮细胞在部分内皮-间质转化过程中的基因表达和CD40的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类肿瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-08-07 |
A Data-Distribution and Successive Spline Points based discretization approach for evolving gene regulatory networks from scRNA-Seq time-series data using Cartesian Genetic Programming
2024-Feb, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105126
PMID:38278505
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研究论文 | 本文提出了一种基于数据分布和连续样条点的离散化方法，用于从scRNA-Seq时间序列数据中进化基因调控网络，使用笛卡尔遗传编程 | 本文提出的分布和连续样条点离散化（DSSPD）方法考虑了数据分布和适当的预处理步骤，改进了基因调控网络的推断结果 | NA | 推断基因调控网络 | scRNA-Seq时间序列数据 | 系统生物学 | NA | scRNA-Seq | 笛卡尔遗传编程（CGP） | 时间序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-08-07 |
LINC00960 affects osteosarcoma treatment and prognosis by regulating the tumor immune microenvironment
2024-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24990
PMID:38352756
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研究论文 | 本研究探讨了LINC00960在骨肉瘤中的表达及其对肿瘤免疫微环境的调控作用，评估了其在骨肉瘤治疗和预后中的价值 | 发现LINC00960在骨肉瘤中的高表达与转移和不良预后相关，并可能作为新的生物标志物用于预测骨肉瘤患者的总体生存 | NA | 评估LINC00960在骨肉瘤中的预后和治疗价值，并分析其作用机制 | 骨肉瘤患者的LINC00960表达及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 85例骨肉瘤样本及6例骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-08-07 |
A Novel Approach for Pancreas Transcriptomics Reveals the Cellular Landscape in Homeostasis and Acute Pancreatitis
2024-Feb-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.01.043
PMID:38325760
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FixNCut的单细胞RNA测序方法，用于研究胰腺在稳态和急性胰腺炎中的细胞景观 | FixNCut方法通过可逆固定组织，提高了对胰腺细胞，特别是腺泡细胞和免疫细胞的定义，为研究胰腺生物学和疾病提供了一个广泛适用的方法和参考图谱 | NA | 创新一种方法，克服现有单细胞RNA测序研究中腺泡细胞代表性不足的问题，加速对胰腺在健康和疾病状态下的研究 | 胰腺在稳态和急性胰腺炎中的细胞景观 | 数字病理学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用已建立的小鼠急性胰腺炎模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |