单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-07 |
Author Correction: Deciphering driver regulators of cell fate decisions from single-cell transcriptomics data with CEFCON
2024-Feb-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45929-1
PMID:38351163
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals alterations in perivascular macrophage lipid metabolism in the onset of Wooden Breast myopathy in broiler chickens
2024-02-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53904-5
PMID:38342952
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研究论文 | 本研究旨在利用空间转录组学特征化与木胸肌病微观特征相关的细胞类型特异性表达谱 | 揭示了在木胸肌病早期阶段中周围血管巨噬细胞脂质代谢的改变 | 样本量较小，仅使用了三只鸡的肌肉样本 | 研究木胸肌病早期的细胞互作和基因表达模式 | 23天大肉鸡的右胸大肌的肌肉样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 肌肉样本 | 3只肉鸡 |
| 363 | 2024-08-04 |
A call for a unified and multimodal definition of cellular identity in the enteric nervous system
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.15.575794
PMID:38293133
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研究论文 | 本研究呼吁在肠神经系统中建立统一和多模态的细胞身份定义 | 强调了技术和数据整合的重要性，并提出了使用多种先进技术以推动对肠神经元身份的全面理解 | 主要依赖转录组学数据，缺乏对组织的充分验证，导致在功能注释方面存在显著差异 | 旨在通过实施各种先进的技术和方法，以更全面地理解肠神经系统中的细胞身份 | 比较和分析小鼠与人类的肠神经系统数据集以及不同的研究结果 | 神经科学 | 肠道神经病 | 单细胞转录组技术，复合成像，电生理学，空间转录组学 | 人类多能干细胞（hPSC）模型 | 基因表达数据，组织样本数据 | NA |
| 364 | 2024-08-07 |
CD40 is expressed in the subsets of endothelial cells undergoing partial endothelial-mesenchymal transition in tumor microenvironment
2024-Feb, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16045
PMID:38111334
|
研究论文 | 本文研究了肿瘤微环境中部分内皮-间质转化过程中表达CD40的特定内皮细胞亚群 | 建立了新的EndoMT报告细胞系统EMRECs，并鉴定了CD40作为部分EndoMT特异性标记物 | NA | 深入理解TGF-β诱导的EndoMT机制，并促进针对EndoMT驱动的癌症进展和转移的新治疗策略的开发 | 内皮细胞在部分内皮-间质转化过程中的基因表达和CD40的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类肿瘤细胞 |
| 365 | 2024-08-07 |
A Data-Distribution and Successive Spline Points based discretization approach for evolving gene regulatory networks from scRNA-Seq time-series data using Cartesian Genetic Programming
2024-Feb, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105126
PMID:38278505
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研究论文 | 本文提出了一种基于数据分布和连续样条点的离散化方法，用于从scRNA-Seq时间序列数据中进化基因调控网络，使用笛卡尔遗传编程 | 本文提出的分布和连续样条点离散化（DSSPD）方法考虑了数据分布和适当的预处理步骤，改进了基因调控网络的推断结果 | NA | 推断基因调控网络 | scRNA-Seq时间序列数据 | 系统生物学 | NA | scRNA-Seq | 笛卡尔遗传编程（CGP） | 时间序列数据 | NA |
| 366 | 2024-08-07 |
LINC00960 affects osteosarcoma treatment and prognosis by regulating the tumor immune microenvironment
2024-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24990
PMID:38352756
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研究论文 | 本研究探讨了LINC00960在骨肉瘤中的表达及其对肿瘤免疫微环境的调控作用，评估了其在骨肉瘤治疗和预后中的价值 | 发现LINC00960在骨肉瘤中的高表达与转移和不良预后相关，并可能作为新的生物标志物用于预测骨肉瘤患者的总体生存 | NA | 评估LINC00960在骨肉瘤中的预后和治疗价值，并分析其作用机制 | 骨肉瘤患者的LINC00960表达及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 85例骨肉瘤样本及6例骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据 |
| 367 | 2024-08-07 |
A Novel Approach for Pancreas Transcriptomics Reveals the Cellular Landscape in Homeostasis and Acute Pancreatitis
2024-Feb-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.01.043
PMID:38325760
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FixNCut的单细胞RNA测序方法，用于研究胰腺在稳态和急性胰腺炎中的细胞景观 | FixNCut方法通过可逆固定组织，提高了对胰腺细胞，特别是腺泡细胞和免疫细胞的定义，为研究胰腺生物学和疾病提供了一个广泛适用的方法和参考图谱 | NA | 创新一种方法，克服现有单细胞RNA测序研究中腺泡细胞代表性不足的问题，加速对胰腺在健康和疾病状态下的研究 | 胰腺在稳态和急性胰腺炎中的细胞景观 | 数字病理学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用已建立的小鼠急性胰腺炎模型进行研究 |
| 368 | 2024-08-07 |
Induction of lung progenitor cell-like organoids by porcine pluripotent stem cells
2024-Feb-29, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302402R
PMID:38334430
|
研究论文 | 本研究通过猪多能干细胞诱导生成肺祖细胞样类器官，并探讨了猪肺发育过程中的细胞类型和信号通路 | 首次报道了猪肺细胞的生成和发展，并确定了NKX2.1和FOXA2作为猪肺发育的关键核心转录因子 | NA | 研究猪肺发育和再生 | 猪多能干细胞诱导的肺祖细胞样类器官 | 数字病理学 | 肺部疾病 | scRNA-seq | Monocle算法 | 细胞 | NA |
| 369 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of aging mouse liver
2024-Feb-29, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302282R
PMID:38334462
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析研究了衰老小鼠肝脏的分子和细胞过程 | 首次全面分析了衰老过程中肝脏的单细胞转录组变化，揭示了衰老相关的细胞组成和基因表达变化 | NA | 探究衰老对小鼠肝脏的分子和细胞影响 | 衰老小鼠肝脏的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 370 | 2024-08-07 |
Integrated Single-Cell Transcriptomic Atlas of Human Kidney Endothelial Cells
2024-Feb-14, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000320
PMID:38351505
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研究论文 | 本文通过重新处理和整合7个关于人类肾脏控制单细胞/单核RNA测序数据集，构建了一个全面的人类肾脏内皮细胞单细胞转录组图谱 | 首次系统地描述了人类肾脏内皮细胞的异质性，并发现了7个具有不同分子特征和生理功能的内皮细胞亚群 | NA | 构建一个全面的人类肾脏内皮细胞单细胞转录组图谱，以理解这些细胞在疾病、衰老和物种间的变化 | 人类肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞/单核RNA测序 (sc/snRNAseq) | NA | 转录组数据 | 超过200,000个肾脏细胞 |
| 371 | 2024-08-04 |
vissE: a versatile tool to identify and visualise higher-order molecular phenotypes from functional enrichment analysis
2024-Feb-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05676-y
PMID:38331751
|
研究论文 | vissE是一个灵活的网络分析和可视化工具，用于从功能富集分析中识别和可视化高阶分子表型 | 本研究提出的vissE工具通过组织信息和提供多种可视化模块，克服了路径分析中结果冗余的问题 | 未提及具体的限制信息 | 旨在增强分子发现过程中的基因集富集和路径分析工作流程 | 应用vissE于三种不同技术的功能分析，包括乳腺癌的空间转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 372 | 2024-08-07 |
UPP1 promotes lung adenocarcinoma progression through the induction of an immunosuppressive microenvironment
2024-Feb-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45340-w
PMID:38331898
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研究论文 | 本研究通过综合单细胞RNA测序数据分析，揭示了UPP1通过诱导免疫抑制微环境促进肺腺癌进展的机制 | 首次发现UPP1肿瘤细胞与免疫抑制微环境的关联，并通过多种技术手段验证了UPP1在肺腺癌中的免疫抑制作用 | NA | 深入了解肺腺癌进展的分子机制 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据和基因表达数据 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 377,574个细胞来自117名肺腺癌患者样本 |
| 373 | 2024-08-07 |
Tricarboxylic Acid Cycle Metabolite-Coordinated Biohydrogels Augment Cranial Bone Regeneration Through Neutrophil-Stimulated Mesenchymal Stem Cell Recruitment and Histone Acetylation-Mediated Osteogenesis
2024-Feb-07, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.3c15473
PMID:38284176
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研究论文 | 本文开发了一种由柠檬酸（NaCit, Cit）协同的三羧酸（TCA）循环代谢物修饰的生物仿生水凝胶，显著促进了颅骨再生 | 首次展示了柠檬酸协同的CGG水凝胶通过调节免疫微环境和间充质干细胞命运，有效促进颅骨再生 | NA | 开发新型生物仿生水凝胶以改善颅骨再生 | 颅骨缺陷的再生 | 生物医学工程 | 颅骨疾病 | RNA测序 | NA | 生物材料 | 涉及大鼠和小鼠的颅骨缺陷模型 |
| 374 | 2024-08-04 |
KIF20B and MET, hub genes of DIAPHs, predict poor prognosis and promote pancreatic cancer progression
2024-Feb, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2023.155046
PMID:38266456
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研究论文 | 这篇文章探讨了KIF20B和MET作为DIAPH基因的中心基因在胰腺癌中的预后和治疗价值 | 研究发现KIF20B和MET的共同下调可以抑制胰腺癌的进展，揭示了其潜在的治疗靶点 | 尚需进一步研究以验证KIF20B和MET联合预后在临床应用中的有效性 | 旨在评估KIF20B和MET在胰腺癌中的预后价值和治疗前景 | 研究对象为胰腺腺癌样本中KIF20B和MET的基因表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，质量谱，Co-IP实验 | NA | 基因组数据 | NA |
| 375 | 2024-08-04 |
In-Depth Genomic Analysis: The New Challenge in Congenital Heart Disease
2024-Feb-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25031734
PMID:38339013
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研究论文 | 本研究通过深度基因组分析探讨先天性心脏病的成因和机制 | 利用下一代测序技术揭示了先天性心脏病（CHD）相关的基因变异和组织发生的通路 | 未提及具体的样本大小和实验设置限制 | 研究先天性心脏病的遗传成因和机制 | 关注先天性心脏病患者及伴随外部异常的基因类群 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 下一代测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 376 | 2024-08-07 |
Establishment of ganglioside GD2-expressing extranodal NK/T-cell lymphoma cell line with scRNA-seq analysis
2024-Feb, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2023.11.006
PMID:38029851
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研究论文 | 本文建立了一种表达神经节苷脂GD2的结外NK/T细胞淋巴瘤细胞系ENKL-J1，并进行了单细胞RNA测序分析 | 首次建立了表达GD2的ENKL细胞系，并通过单细胞RNA测序揭示了其分子和基因组特征 | NA | 研究结外NK/T细胞淋巴瘤的分子和基因组特征，探索新的治疗方案 | 结外NK/T细胞淋巴瘤细胞系ENKL-J1 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自ENKL患者的骨髓细胞建立的细胞系ENKL-J1 |
| 377 | 2024-08-07 |
Environmental and molecular regulation of diapause formation in a scyphozoan jellyfish
2024-Feb, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17249
PMID:38133544
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research paper | 本研究旨在揭示温度和食物供应对水母Aurelia coerulea滞育囊形成的关键作用，并利用单细胞RNA测序探索滞育形成的细胞和分子基础 | 研究揭示了细胞类型特异性的转录景观，并发现热休克蛋白编码基因HSC70和HSP90a可能作为调控滞育囊形成的枢纽基因 | NA | 理解滞育形成机制，以深入了解各种物种的适应性生存策略 | 水母Aurelia coerulea的滞育囊形成 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 378 | 2024-08-07 |
MMP14high macrophages orchestrate progressive pulmonary fibrosis in SR-Ag-induced hypersensitivity pneumonitis
2024-Feb, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107070
PMID:38218353
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研究论文 | 本研究探讨了MMP14高表达的巨噬细胞在SR-Ag诱导的过敏性肺炎中促进肺纤维化的机制 | 通过单细胞RNA测序分析，首次鉴定出MMP14高表达的巨噬细胞亚群，并揭示了其在促进纤维母细胞向肌纤维母细胞转化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探究MMP14高表达的巨噬细胞在过敏性肺炎中的作用及其潜在的治疗靶点 | MMP14高表达的巨噬细胞及其在肺纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | 决策树模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 379 | 2024-08-07 |
All-potassium channel CRISPR screening reveals a lysine-specific pathway of insulin secretion
2024-Feb, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101885
PMID:38246588
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研究论文 | 本研究使用CRISPR-Cas9介导的钾通道敲除和单细胞RNA测序技术，在胰腺β细胞系中识别与胰岛素分泌相关的基因 | 首次揭示了赖氨酸特异性的胰岛素分泌途径，并确定了Kcnh6作为关键的钾通道 | 研究仅在特定的胰腺β细胞系中进行，可能需要进一步的体内研究以验证结果 | 识别与胰岛素分泌相关的基因，特别是影响钾通道功能的基因 | 胰腺β细胞中的钾通道及其对胰岛素分泌的影响 | NA | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 83个钾通道基因被敲除，使用了胰腺β细胞系 |
| 380 | 2024-08-07 |
ADAR1 Inhibits Macrophage Apoptosis and Alleviates Sepsis-induced Liver Injury Through miR-122/BCL2A1 Signaling
2024-Feb-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2023.00171
PMID:38343614
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研究论文 | 研究探讨了ADAR1通过miR-122/BCL2A1信号通路抑制巨噬细胞凋亡并减轻脓毒症引起的肝损伤的作用机制 | 首次揭示了ADAR1通过miR-122/BCL2A1信号通路减轻脓毒症引起的肝损伤 | NA | 研究ADAR1在脓毒症引起肝损伤中的作用及其机制 | ADAR1在脓毒症中的作用及通过miR-122/BCL2A1信号通路的影响 | NA | 脓毒症 | 转录组和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括来自脓毒症患者的PBMCs和CLP诱导的脓毒症小鼠模型 |