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当前共找到 444 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-07 |
AGImpute: imputation of scRNA-seq data based on a hybrid GAN with dropouts identification
2024-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae068
PMID:38317025
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研究论文 | 本文提出了一种名为AGImpute的混合生成对抗网络，用于识别和填补单细胞RNA测序数据中的dropout事件 | AGImpute通过动态阈值估计策略估计不同细胞中的dropout事件数量，并结合自编码器和生成对抗网络进行dropout事件的填补 | NA | 解决单细胞RNA测序数据分析中dropout事件带来的挑战 | 单细胞RNA测序数据中的dropout事件 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络（GAN） | 基因表达数据 | 两个模拟数据集和七个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 322 | 2024-08-04 |
Bulk and single-cell sequencing identified a prognostic model based on the macrophage and lipid metabolism related signatures for osteosarcoma patients
2024-Feb-29, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26091
PMID:38404899
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研究论文 | 本研究利用大规模和单细胞测序技术，探讨了与巨噬细胞和脂质代谢相关的预后模型在骨肉瘤患者中的应用 | 创新地建立了一个基于巨噬细胞和脂质代谢的风险模型，为骨肉瘤患者的化疗效果提供了新的预测工具 | 未提及具体的样本量和外部验证的有效性 | 研究巨噬细胞的分化状态与骨肉瘤化疗效果间的关系 | 骨肉瘤患者及其免疫微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 大规模和单细胞测序 | 风险模型 | 基因相关数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 323 | 2024-08-07 |
Cutting-Edge Skin Ageing Research on tissue stem cell
2024-Feb-26, Journal of biochemistry
IF:2.1Q4
DOI:10.1093/jb/mvae022
PMID:38408191
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综述 | 本文综述了干细胞衰老的机制及其对健康的影响，并探讨了干细胞疗法在皮肤领域的应用潜力 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在干细胞研究中的进展 | NA | 探讨干细胞衰老的机制及其对健康的影响 | 干细胞及其在组织修复和再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 324 | 2024-08-07 |
Development of a CD8+ T cell associated signature for predicting the prognosis and immunological characteristics of gastric cancer by integrating single-cell and bulk RNA-sequencing
2024-02-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-54273-9
PMID:38402299
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，开发了一种与CD8+ T细胞相关的预测胃癌预后和免疫特征的标志物 | 本研究首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，开发了一种新的预测胃癌预后和免疫特征的标志物 | 本研究主要基于TCGA和GEO队列的数据，未来需要更多队列验证其普适性 | 开发一种能够预测胃癌预后和免疫特征的标志物 | 胃癌患者的预后和免疫特征 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | LASSO回归 | RNA测序数据 | 703个CD8+ T细胞特征基因，其中8个用于构建预测标志物 | NA | NA | NA | NA |
| 325 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics identifies the differentiation trajectory from inflammatory monocytes to pro-resolving macrophages in a mouse skin allergy model
2024-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46148-4
PMID:38396021
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了小鼠皮肤过敏模型中炎症单核细胞向促解析巨噬细胞的分化轨迹 | 本研究阐明了Ly6C经典单核细胞向Ly6C促解析巨噬细胞的逐步分化过程 | 本研究局限于小鼠模型，未验证在人类过敏反应中的适用性 | 研究炎症单核细胞在小鼠皮肤过敏中向巨噬细胞的分化过程 | 研究对象为Ly6C经典单核细胞及其向促解析巨噬细胞的分化过程 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq，流式细胞术分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 326 | 2024-08-04 |
Identifying PLAUR as a Pivotal Gene of Tumor Microenvironment and Regulating Mesenchymal Phenotype of Glioblastoma
2024-Feb-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16040840
PMID:38398231
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研究论文 | 本研究确定了PLAUR作为胶质母细胞瘤肿瘤微环境的关键基因，并调控其间质表型 | 识别PLAUR作为胶质母细胞瘤间质表型的中心基因，揭示其在肿瘤相关巨噬细胞和胶质瘤细胞之间的配体-受体相互作用 | 尚未详细探讨PLAUR在不同肿瘤微环境条件下的具体作用机制 | 识别能够通过肿瘤内在和外在机制调节胶质母细胞瘤间质表型的基因 | 胶质母细胞瘤及其相关的微环境组成部分 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞测序，功能富集分析，WGCNA | BALB/c裸鼠异种移植模型 | 基因表达数据 | 涉及细胞系、原代胶质瘤细胞及BALB/c裸鼠的实验 | NA | NA | NA | NA |
| 327 | 2024-08-04 |
Harnessing the Transcriptional Signatures of CAR-T-Cells and Leukemia/Lymphoma Using Single-Cell Sequencing Technologies
2024-Feb-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25042416
PMID:38397092
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综述 | 本文探讨了利用单细胞测序技术分析CAR-T细胞和白血病/淋巴瘤的转录特征 | 采用现代单细胞测序技术，深入剖析白血病细胞与CAR-T细胞的转录复杂性 | 未提及文章的具体限制 | 讨论导致CAR-T免疫治疗临床失败的潜在机制 | 探讨CAR-T细胞的生物特征和影响临床反应的机制 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 328 | 2024-08-04 |
Peripheral Lymphocytes in Primary Liver Cancers: Elevated NK and CD8+ T Cells and Dysregulated Selenium Metabolism
2024-Feb-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14020222
PMID:38397459
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研究论文 | 该研究探讨了原发性肝癌对外周血淋巴细胞的影响，特别关注NK细胞和CD8+ T细胞的变化以及硒代谢的失调 | 首次揭示了原发性肝癌对外周血淋巴细胞数量和硒蛋白代谢的显著影响 | 该研究的样本可能有限，且主要数据来自特定数据库，可能存在选择偏倚 | 研究原发性肝癌对外周血淋巴细胞的影响 | 研究对象包括肝细胞癌（HCC）和肝内胆管癌（ICC）患者的外周血淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序技术 | Cox回归模型 | 细胞型数据，转录组数据，蛋白质组数据 | 研究涉及的样本数量不明确，主要来源于GEO数据库和肿瘤切除患者的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 329 | 2024-08-04 |
Microarray Gene Expression Analysis of Lesional Skin in Canine Pemphigus Foliaceus
2024-Feb-14, Veterinary sciences
IF:2.0Q2
DOI:10.3390/vetsci11020089
PMID:38393106
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研究论文 | 本研究旨在表征犬类脓疱性皮肤病患者皮肤损伤中的分子机制和生物通路变化 | 本研究发现犬类脓疱性皮肤病损伤与人类脓疱性皮肤损伤的免疫特征相似，提供了新的分子机制见解 | 研究样本量相对较小，仅包括7例病变皮肤和5例健康皮肤 | 阐明犬类脓疱性皮肤病的发病机制及其生物通路变化 | 犬类脓疱性皮肤病患者的损伤皮肤与健康皮肤样本 | 数字病理学 | 自体免疫性疾病 | RNA微阵列 | NA | 基因表达数据 | 7例犬类脓疱性皮肤病患者和5例健康犬样本 | NA | NA | NA | NA |
| 330 | 2024-08-07 |
scMGCN: A Multi-View Graph Convolutional Network for Cell Type Identification in scRNA-seq Data
2024-Feb-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25042234
PMID:38396909
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scMGCN的多视角图卷积网络模型，用于从scRNA-seq数据中识别细胞类型 | 引入了多视角学习和多图构建方法来捕捉scRNA-seq数据中的全面细胞信息，并结合图卷积网络与注意力机制提取细胞间的高阶共享信息 | NA | 开发一种稳定且可解释的方法来从大规模scRNA-seq数据中识别细胞类型 | scRNA-seq数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 图卷积网络 | 多视角图卷积网络模型 | scRNA-seq数据 | 多种数据集，包括单数据集、跨物种和跨平台实验 | NA | NA | NA | NA |
| 331 | 2024-08-07 |
Comparison of Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cells and Fibroblasts as Donor Nuclei for Handmade Cloning in Sheep Using a Single-Cell Transcriptome
2024-Feb-10, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14040589
PMID:38396557
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研究论文 | 本文比较了脐带间充质干细胞和成纤维细胞作为供体核在手工克隆绵羊中的应用，使用单细胞转录组学方法分析了八细胞胚胎的转录组特征。 | 首次探索了脐带间充质干细胞作为供体核在核转移技术中的应用，并提供了细胞重编程机制的新见解。 | 文章未明确提及研究的局限性。 | 研究旨在提高核转移技术的效率，并探索脐带间充质干细胞作为供体核的优势。 | 研究对象包括脐带间充质干细胞、成纤维细胞和八细胞胚胎。 | 干细胞研究 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 研究涉及脐带间充质干细胞和成纤维细胞作为供体核的八细胞胚胎。 | NA | NA | NA | NA |
| 332 | 2024-08-04 |
Multimodal Single-Cell Sequencing of B Cells in Primary Sjögren's Syndrome
2024-02, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42683
PMID:37610265
|
研究论文 | 本研究探讨了原发性干燥综合征中B细胞的组成、基因表达和B细胞受体使用情况 | 该研究首次通过多模态单细胞测序揭示了B细胞的异质性和分子特征，提供了更深入的患者分层方法 | 样本量相对较小，可能影响结果的广泛适用性和统计力量 | 确定SSA/SSB抗体分层的原发性干燥综合征（pSS）患者中B细胞的角色 | 研究对象为6名SSA-、8名SSA+单阳性和10名SSA/SSB+双阳性的pSS患者及4名健康对照者 | 数字病理学 | 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞变异、多样性及连接（VDJ）基因测序（scVDJ-seq） | NA | 单细胞数据 | 230,000个B细胞，涉及24名参与者（6名SSA-，8名SSA+，10名SSA/SSB+及4名健康对照） | NA | NA | NA | NA |
| 333 | 2024-08-04 |
Tissue niches and immunopathology through the lens of spatial tissue profiling techniques
2024-Feb, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350484
PMID:37985207
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评论 | 本研究讨论了空间组织在生物学中的基础作用及其对免疫系统的影响 | 结合多重组织学和空间转录组学技术，提供了蛋白质和基因表达模式的空间背景 | 承认空间组织剖析技术的挑战和局限性 | 探讨如何通过空间组织剖析改善对区域免疫的理解 | 重点关注组织生态位在健康和疾病中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 多重组织学和空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 334 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-Seq reveals the earliest lineage specification and X chromosome dosage compensation in bovine preimplantation embryos
2024-Feb-29, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302035RR
PMID:38363564
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研究论文 | 该研究揭示了牛胚胎早期谱系特征和X染色体剂量补偿的情况。 | 利用单细胞转录组学和基因组编辑方法探讨了牛胚胎中的谱系特征和X染色体剂量补偿的时序和调控。 | 该研究主要集中在牛胚胎模型，可能无法直接推广到其他物种。 | 旨在通过使用牛胚胎模型深入理解早期胚胎发育中的调控机制。 | 研究对象为286个牛个体细胞的转录组。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，基因组编辑 | NA | 转录组数据 | 286个牛个体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 335 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of submandibular gland reveals collagen type XV-positive fibroblasts as a disease-characterizing cell population of IgG4-related disease
2024-02-20, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03289-7
PMID:38378635
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了IgG4相关疾病患者下颌下腺中的非免疫细胞，发现表达胶原蛋白XV的成纤维细胞可能是该疾病的特征性细胞群 | 首次揭示了胶原蛋白XV阳性成纤维细胞在IgG4相关疾病中的作用，并提出其可能作为疾病监测的标志物 | NA | 探讨IgG4相关疾病中非免疫细胞的特征及其潜在的生物标志物 | IgG4相关疾病患者的下颌下腺非免疫细胞 | 数字病理学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | IgG4相关疾病患者的下颌下腺非免疫细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 336 | 2024-08-04 |
BPTF cooperates with MYCN and MYC to link neuroblastoma cell cycle control to epigenetic cellular states
2024-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579816
PMID:38405949
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研究论文 | 这篇文章探讨了核小体重塑因子BPTF如何与MYCN和MYC合作，将神经母细胞瘤细胞周期控制与表观遗传细胞状态联系起来 | 文章提出BPTF在神经母细胞瘤中扮演双重角色，既与MYCN/MYC共定位于细胞周期相关基因的启动子，又与CRC共定位于超级增强子以调节细胞身份 | NA | 探讨BPTF在神经母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的相关性 | 神经母细胞瘤细胞及其内在转录调控机制 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | Bulk RNA-seq, 单细胞测序, 组织微阵列, 免疫沉淀/质谱 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2024-08-07 |
HHLA2 is more significantly associated with poor prognosis in TSCC than PD-L1
2024-Feb, Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/jop.13514
PMID:38321252
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研究论文 | 本研究旨在探讨HHLA2作为免疫检查点在舌鳞状细胞癌中的潜力，并与PD-L1进行比较 | 本研究发现HHLA2在舌鳞状细胞癌中表达上调，且与不良预后显著相关，可能成为比PD-L1更有效的免疫治疗靶点 | NA | 研究HHLA2作为免疫检查点在舌鳞状细胞癌中的作用及与PD-L1的比较 | 舌鳞状细胞癌中的HHLA2和PD-L1表达及预后影响 | 数字病理学 | 舌鳞状细胞癌 | RNA测序, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | COX回归模型 | RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据 | RNA-seq数据来自TCGA，单细胞RNA测序数据来自GEO数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 338 | 2024-08-07 |
Analytical Workflows for Single-Cell Multiomic Data Using the BD Rhapsody Platform
2024-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.963
PMID:38353375
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研究论文 | 本文描述了一个详细的分析流程，包括六个管道，用于单细胞多组学数据的高质量分析 | 提出了一个包括六个管道的详细分析流程，用于处理和分析单细胞多组学数据 | NA | 开发一个高效的分析流程，以从单细胞多组学数据中提取生物学相关信息 | 单细胞多组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达矩阵 | 数千个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 339 | 2024-08-07 |
Recommendations on single-cell RNA sequencing of skin xenografts in the study of genetic skin diseases
2024-Feb, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15036
PMID:38389155
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2024-08-07 |
Characterization of the m6A/m1A/m5C/m7G-related regulators on the prognosis and immune microenvironment of glioma by integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2024-Feb, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3666
PMID:38391150
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq）数据，分析了m6A、m1A、m5C和m7G相关调控因子在胶质瘤预后和免疫微环境中的作用 | 首次整合了四种RNA甲基化调控因子（m6A、m1A、m5C和m7G）在胶质瘤中的研究，并分析了它们与胶质瘤预后和肿瘤内异质性的关系 | NA | 探讨m6A/m1A/m5C/m7G相关调控因子在胶质瘤中的作用，并提供新的可靠的胶质瘤预后和治疗生物标志物 | 胶质瘤中的m6A/m1A/m5C/m7G相关调控因子及其与预后和免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq） | 机器学习方法和多元Cox回归分析 | RNA序列数据 | 三个自有的单细胞RNA测序数据集和公开的批量RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |