单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-04 |
Harnessing the Transcriptional Signatures of CAR-T-Cells and Leukemia/Lymphoma Using Single-Cell Sequencing Technologies
2024-Feb-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25042416
PMID:38397092
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综述 | 本文探讨了利用单细胞测序技术分析CAR-T细胞和白血病/淋巴瘤的转录特征 | 采用现代单细胞测序技术，深入剖析白血病细胞与CAR-T细胞的转录复杂性 | 未提及文章的具体限制 | 讨论导致CAR-T免疫治疗临床失败的潜在机制 | 探讨CAR-T细胞的生物特征和影响临床反应的机制 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 322 | 2024-08-04 |
Peripheral Lymphocytes in Primary Liver Cancers: Elevated NK and CD8+ T Cells and Dysregulated Selenium Metabolism
2024-Feb-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14020222
PMID:38397459
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研究论文 | 该研究探讨了原发性肝癌对外周血淋巴细胞的影响，特别关注NK细胞和CD8+ T细胞的变化以及硒代谢的失调 | 首次揭示了原发性肝癌对外周血淋巴细胞数量和硒蛋白代谢的显著影响 | 该研究的样本可能有限，且主要数据来自特定数据库，可能存在选择偏倚 | 研究原发性肝癌对外周血淋巴细胞的影响 | 研究对象包括肝细胞癌（HCC）和肝内胆管癌（ICC）患者的外周血淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序技术 | Cox回归模型 | 细胞型数据，转录组数据，蛋白质组数据 | 研究涉及的样本数量不明确，主要来源于GEO数据库和肿瘤切除患者的外周血样本 |
| 323 | 2024-08-04 |
Microarray Gene Expression Analysis of Lesional Skin in Canine Pemphigus Foliaceus
2024-Feb-14, Veterinary sciences
IF:2.0Q2
DOI:10.3390/vetsci11020089
PMID:38393106
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研究论文 | 本研究旨在表征犬类脓疱性皮肤病患者皮肤损伤中的分子机制和生物通路变化 | 本研究发现犬类脓疱性皮肤病损伤与人类脓疱性皮肤损伤的免疫特征相似，提供了新的分子机制见解 | 研究样本量相对较小，仅包括7例病变皮肤和5例健康皮肤 | 阐明犬类脓疱性皮肤病的发病机制及其生物通路变化 | 犬类脓疱性皮肤病患者的损伤皮肤与健康皮肤样本 | 数字病理学 | 自体免疫性疾病 | RNA微阵列 | NA | 基因表达数据 | 7例犬类脓疱性皮肤病患者和5例健康犬样本 |
| 324 | 2024-08-07 |
scMGCN: A Multi-View Graph Convolutional Network for Cell Type Identification in scRNA-seq Data
2024-Feb-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25042234
PMID:38396909
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scMGCN的多视角图卷积网络模型，用于从scRNA-seq数据中识别细胞类型 | 引入了多视角学习和多图构建方法来捕捉scRNA-seq数据中的全面细胞信息，并结合图卷积网络与注意力机制提取细胞间的高阶共享信息 | NA | 开发一种稳定且可解释的方法来从大规模scRNA-seq数据中识别细胞类型 | scRNA-seq数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 图卷积网络 | 多视角图卷积网络模型 | scRNA-seq数据 | 多种数据集，包括单数据集、跨物种和跨平台实验 |
| 325 | 2024-08-07 |
Comparison of Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cells and Fibroblasts as Donor Nuclei for Handmade Cloning in Sheep Using a Single-Cell Transcriptome
2024-Feb-10, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14040589
PMID:38396557
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研究论文 | 本文比较了脐带间充质干细胞和成纤维细胞作为供体核在手工克隆绵羊中的应用，使用单细胞转录组学方法分析了八细胞胚胎的转录组特征。 | 首次探索了脐带间充质干细胞作为供体核在核转移技术中的应用，并提供了细胞重编程机制的新见解。 | 文章未明确提及研究的局限性。 | 研究旨在提高核转移技术的效率，并探索脐带间充质干细胞作为供体核的优势。 | 研究对象包括脐带间充质干细胞、成纤维细胞和八细胞胚胎。 | 干细胞研究 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 研究涉及脐带间充质干细胞和成纤维细胞作为供体核的八细胞胚胎。 |
| 326 | 2024-08-04 |
Multimodal Single-Cell Sequencing of B Cells in Primary Sjögren's Syndrome
2024-02, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42683
PMID:37610265
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研究论文 | 本研究探讨了原发性干燥综合征中B细胞的组成、基因表达和B细胞受体使用情况 | 该研究首次通过多模态单细胞测序揭示了B细胞的异质性和分子特征，提供了更深入的患者分层方法 | 样本量相对较小，可能影响结果的广泛适用性和统计力量 | 确定SSA/SSB抗体分层的原发性干燥综合征（pSS）患者中B细胞的角色 | 研究对象为6名SSA-、8名SSA+单阳性和10名SSA/SSB+双阳性的pSS患者及4名健康对照者 | 数字病理学 | 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞变异、多样性及连接（VDJ）基因测序（scVDJ-seq） | NA | 单细胞数据 | 230,000个B细胞，涉及24名参与者（6名SSA-，8名SSA+，10名SSA/SSB+及4名健康对照） |
| 327 | 2024-08-04 |
Tissue niches and immunopathology through the lens of spatial tissue profiling techniques
2024-Feb, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350484
PMID:37985207
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评论 | 本研究讨论了空间组织在生物学中的基础作用及其对免疫系统的影响 | 结合多重组织学和空间转录组学技术，提供了蛋白质和基因表达模式的空间背景 | 承认空间组织剖析技术的挑战和局限性 | 探讨如何通过空间组织剖析改善对区域免疫的理解 | 重点关注组织生态位在健康和疾病中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 多重组织学和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 328 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-Seq reveals the earliest lineage specification and X chromosome dosage compensation in bovine preimplantation embryos
2024-Feb-29, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302035RR
PMID:38363564
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研究论文 | 该研究揭示了牛胚胎早期谱系特征和X染色体剂量补偿的情况。 | 利用单细胞转录组学和基因组编辑方法探讨了牛胚胎中的谱系特征和X染色体剂量补偿的时序和调控。 | 该研究主要集中在牛胚胎模型，可能无法直接推广到其他物种。 | 旨在通过使用牛胚胎模型深入理解早期胚胎发育中的调控机制。 | 研究对象为286个牛个体细胞的转录组。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，基因组编辑 | NA | 转录组数据 | 286个牛个体细胞 |
| 329 | 2024-08-04 |
Cortical somatostatin long-range projection neurons and interneurons exhibit divergent developmental trajectories
2024-Feb-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.11.013
PMID:38086373
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研究论文 | 研究了小鼠体内表达生长抑素的细胞的多样性及其发育过程 | 首次将单细胞RNA测序和空间转录组学结合，揭示了发育过程中生长抑素表达神经元的差异化轨迹 | 仅限于小鼠模型，可能无法完全代表其他哺乳动物的发育过程 | 探讨哺乳动物皮层抑制性神经元的细胞多样性及其发育机制 | 小鼠体内的生长抑素（SST+）表达细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 330 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of submandibular gland reveals collagen type XV-positive fibroblasts as a disease-characterizing cell population of IgG4-related disease
2024-02-20, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03289-7
PMID:38378635
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了IgG4相关疾病患者下颌下腺中的非免疫细胞，发现表达胶原蛋白XV的成纤维细胞可能是该疾病的特征性细胞群 | 首次揭示了胶原蛋白XV阳性成纤维细胞在IgG4相关疾病中的作用，并提出其可能作为疾病监测的标志物 | NA | 探讨IgG4相关疾病中非免疫细胞的特征及其潜在的生物标志物 | IgG4相关疾病患者的下颌下腺非免疫细胞 | 数字病理学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | IgG4相关疾病患者的下颌下腺非免疫细胞样本 |
| 331 | 2024-08-04 |
BPTF cooperates with MYCN and MYC to link neuroblastoma cell cycle control to epigenetic cellular states
2024-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579816
PMID:38405949
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研究论文 | 这篇文章探讨了核小体重塑因子BPTF如何与MYCN和MYC合作，将神经母细胞瘤细胞周期控制与表观遗传细胞状态联系起来 | 文章提出BPTF在神经母细胞瘤中扮演双重角色，既与MYCN/MYC共定位于细胞周期相关基因的启动子，又与CRC共定位于超级增强子以调节细胞身份 | NA | 探讨BPTF在神经母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的相关性 | 神经母细胞瘤细胞及其内在转录调控机制 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | Bulk RNA-seq, 单细胞测序, 组织微阵列, 免疫沉淀/质谱 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 332 | 2024-08-07 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Data Reveals Memory-like NK Cell Subset Associated with Mycobacterium tuberculosis Latency
2024-Feb-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13040293
PMID:38391906
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，分析了外周血自然杀伤（NK）细胞的表型和分子特征，并探讨了NK细胞在结核分枝杆菌（Mtb）潜伏感染中的作用 | 本研究首次揭示了与结核分枝杆菌潜伏感染相关的记忆样NK细胞亚群，并通过流式细胞术验证了这些细胞的存在 | 研究样本量较小，需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探讨NK细胞在结核分枝杆菌潜伏感染中的作用及其分子特征 | 外周血NK细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA | 小样本量 |
| 333 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals HIF1A as a Severity-Sensitive Immunological Scar in Circulating Monocytes of Convalescent Comorbidity-Free COVID-19 Patients
2024-Feb-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13040300
PMID:38391913
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨了无并发症的COVID-19康复患者循环单核细胞中HIF1A作为敏感性免疫疤痕的作用 | 首次在单细胞水平上研究了无并发症COVID-19康复患者在不同时间点的转录组免疫细胞失调，并揭示了HIF1A在康复期的长期免疫作用 | NA | 研究无并发症COVID-19康复患者的免疫细胞转录组失调，以识别不同疾病严重程度的康复标志 | 无并发症的COVID-19康复患者的循环单核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 334 | 2024-08-07 |
HHLA2 is more significantly associated with poor prognosis in TSCC than PD-L1
2024-Feb, Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/jop.13514
PMID:38321252
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研究论文 | 本研究旨在探讨HHLA2作为免疫检查点在舌鳞状细胞癌中的潜力，并与PD-L1进行比较 | 本研究发现HHLA2在舌鳞状细胞癌中表达上调，且与不良预后显著相关，可能成为比PD-L1更有效的免疫治疗靶点 | NA | 研究HHLA2作为免疫检查点在舌鳞状细胞癌中的作用及与PD-L1的比较 | 舌鳞状细胞癌中的HHLA2和PD-L1表达及预后影响 | 数字病理学 | 舌鳞状细胞癌 | RNA测序, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | COX回归模型 | RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据 | RNA-seq数据来自TCGA，单细胞RNA测序数据来自GEO数据库 |
| 335 | 2024-08-07 |
Analytical Workflows for Single-Cell Multiomic Data Using the BD Rhapsody Platform
2024-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.963
PMID:38353375
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研究论文 | 本文描述了一个详细的分析流程，包括六个管道，用于单细胞多组学数据的高质量分析 | 提出了一个包括六个管道的详细分析流程，用于处理和分析单细胞多组学数据 | NA | 开发一个高效的分析流程，以从单细胞多组学数据中提取生物学相关信息 | 单细胞多组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达矩阵 | 数千个单个细胞 |
| 336 | 2024-08-07 |
Recommendations on single-cell RNA sequencing of skin xenografts in the study of genetic skin diseases
2024-Feb, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15036
PMID:38389155
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2024-08-07 |
Characterization of the m6A/m1A/m5C/m7G-related regulators on the prognosis and immune microenvironment of glioma by integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2024-Feb, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3666
PMID:38391150
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq）数据，分析了m6A、m1A、m5C和m7G相关调控因子在胶质瘤预后和免疫微环境中的作用 | 首次整合了四种RNA甲基化调控因子（m6A、m1A、m5C和m7G）在胶质瘤中的研究，并分析了它们与胶质瘤预后和肿瘤内异质性的关系 | NA | 探讨m6A/m1A/m5C/m7G相关调控因子在胶质瘤中的作用，并提供新的可靠的胶质瘤预后和治疗生物标志物 | 胶质瘤中的m6A/m1A/m5C/m7G相关调控因子及其与预后和免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq） | 机器学习方法和多元Cox回归分析 | RNA序列数据 | 三个自有的单细胞RNA测序数据集和公开的批量RNA测序数据集 |
| 338 | 2024-08-07 |
Identifying molecular subtypes and tumor microenvironment infiltration signatures in kidney renal clear cell carcinoma based on stemness-associated disulfidptosis genes by integrating machine learning, single-cell analyses and experimental validation
2024-Feb-29, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26094
PMID:38390172
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习、单细胞分析和实验验证，基于干细胞相关硫化物死亡基因识别肾透明细胞癌的分子亚型和肿瘤微环境浸润特征 | 首次识别出与硫化物死亡相关的两种分子亚型，并构建了包含九个基因的SADG特征，这些基因与肿瘤干细胞性和肿瘤微环境高度相关 | NA | 旨在阐明硫化物死亡在肾透明细胞癌进展中的作用 | 肾透明细胞癌患者及其分子亚型和肿瘤微环境特征 | 机器学习 | 肾癌 | 非负矩阵分解(NMF)算法、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、最小绝对收缩和选择算子(LASSO) Cox回归分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 使用了三个独立的外部验证数据集和临床样本进行验证 |
| 339 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell and spatially resolved transcriptomic strategies to survey the astrocyte response to stroke in male mice
2024-Feb-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45821-y
PMID:38383565
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研究论文 | 本研究描述了一种平台，结合空间解析单细胞转录组和蛋白质组的方法，以调查小鼠对中风的星形胶质细胞反应 | 创新点在于整合了Visium和10X Chromium的数据集，并采用tDISCO技术来确定星形胶质细胞的空间边界和分子特征 | 本研究主要集中在雄性小鼠的星形胶质细胞反应，结果可能不适用于其他性别或物种 | 本研究旨在探讨星形胶质细胞在缺血性中风中的异质性及其反应 | 研究对象为雄性小鼠中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 脑卒中 | tDISCO、Visium、10X Chromium | NA | 转录组数据、蛋白组数据 | NA |
| 340 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of anaplastic ependymoma and H3K27M-mutant diffuse midline glioma
2024-Feb-21, BMC neurology
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12883-024-03558-7
PMID:38383423
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了间变性室管膜瘤和H3K27M突变型弥漫中线胶质瘤的细胞类型差异 | 揭示了两种脑肿瘤间的细胞异质性及其可能的细胞起源差异 | NA | 分析和比较两种常见脑肿瘤亚型的细胞类型差异 | 间变性室管膜瘤和H3K27M突变型弥漫中线胶质瘤 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 11,219个细胞 |