单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-07 |
IFN-γ decreases PD-1 in T lymphocytes from convalescent COVID-19 patients via the AKT/GSK3β signaling pathway
2024-02-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-55191-6
PMID:38424104
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研究论文 | 本文研究了康复期COVID-19患者中IFN-γ通过AKT/GSK3β信号通路降低T淋巴细胞PD-1表达的现象 | 首次揭示了IFN-γ通过AKT/GSK3β信号通路调控康复期COVID-19患者CD8 T细胞PD-1表达的机制 | NA | 探讨康复期COVID-19患者免疫状态异常的原因 | 康复期COVID-19患者的T淋巴细胞和免疫分子 | 免疫学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 细胞和蛋白质表达数据 | 康复期COVID-19患者的CD8 T细胞和血浆样本 |
| 282 | 2024-08-07 |
Integrated meta-omics reveals the regulatory landscape involved in lipid metabolism between pig breeds
2024-Feb-20, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-023-01743-3
PMID:38374121
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研究论文 | 本文通过综合代谢组学和宏基因组学方法，揭示了不同猪品种间脂质代谢调控的分子机制 | 首次系统地研究了不同猪品种间脂质代谢的细胞和分子机制，为改善动物生产和人类疾病提供了新的视角 | NA | 探究不同猪品种间脂质代谢的调控机制 | 猪的空肠、结肠、肝脏和背最长肌组织的细胞类型 | 代谢组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两品种猪的多个组织样本 |
| 283 | 2024-08-07 |
Mef2c regulates bone mass through Sost-dependent and -independent mechanisms
2024-02, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2023.116976
PMID:38042445
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研究论文 | 本文研究了转录因子Mef2c通过Sost依赖和非依赖机制调节骨量的作用 | 发现了Mef2c通过Sost以外的机制调节骨量，并识别了新的Mef2c转录靶点 | NA | 识别Mef2c在骨代谢中的新转录靶点 | Mef2c在骨形成中的作用及其转录靶点 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Mef2c; Dmp1-Cre和Mef2c; Bglap-Cre小鼠的股骨细胞亚群 |
| 284 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of MYD88L265P and MYD88WT Waldenström macroglobulinemia patients
2024-Feb, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.27
PMID:38435423
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了MYD88L265P和MYD88WT基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的CD19阳性细胞，揭示了肿瘤内克隆异质性及其对B细胞组成的潜在影响 | 首次在单细胞水平上分析了两种不同基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的转录组特征，揭示了患者间的转录组差异和共同特征 | 研究样本量较小，仅包括五名MYD88L265P基因型和两名MYD88WT基因型患者以及两名健康对照 | 评估瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症中的克隆异质性 | MYD88L265P和MYD88WT基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的CD19阳性细胞 | 数字病理学 | 瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五名MYD88L265P基因型患者、两名MYD88WT基因型患者和两名健康对照 |
| 285 | 2024-08-04 |
IL6-STAT3-C/EBPβ-IL6 positive feedback loop in tumor-associated macrophages promotes the EMT and metastasis of lung adenocarcinoma
2024-Feb-29, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02989-x
PMID:38424624
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）通过IL6-STAT3-C/EBPβ-IL6正反馈环路促进肺腺癌的上皮间质转化（EMT）和转移的机制 | 揭示了巨噬细胞促进肿瘤进展的新机制，IL6-STAT3-C/EBPβ-IL6信号级联可能成为肺癌治疗的新靶点 | 研究的样本主要来自单一医院，样本容量相对较小 | 研究肿瘤相关巨噬细胞在肺癌转移中的调控机制 | 研究对象包括来自公共数据库和14名肺癌患者的正常及肿瘤组织样本 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞测序，RT-qPCR，Western blotting，免疫荧光，双荧光素酶报告实验，ChIP | NA | 组织样本 | 14名手术患者的肿瘤和正常组织样本 |
| 286 | 2024-08-07 |
The Role of CD8A in the Immune Microenvironment of Breast Cancer
2024-Feb-21, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902073
PMID:38420798
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研究论文 | 研究探讨了CD8A在三阴性乳腺癌（TNBC）免疫微环境中的作用及其与预后的关系 | 通过使用单细胞RNA测序数据和临床样本评估，揭示了CD8A在转移性乳腺癌免疫微环境中的表达及其对预后的影响 | NA | 寻找新的治疗靶点和策略，改善三阴性乳腺癌的预后 | 三阴性乳腺癌及其免疫微环境中的CD8A表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE102818、GSE118389和GSE202695等多个数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 287 | 2024-08-07 |
Enabling methanol fixation of pediatric nasal wash during respiratory illness for single cell sequencing in comparison with fresh samples
2024-Feb, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-023-02780-2
PMID:37758866
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研究论文 | 本研究开发了一种协议，允许在甲醇固定的儿童鼻洗样本中进行单细胞RNA测序，并与新鲜样本进行比较 | 首次展示了甲醇固定儿童鼻洗样本进行单细胞RNA测序的可行性，并发现其与新鲜样本在定性和定量参数上无显著差异 | NA | 探索甲醇固定儿童鼻洗样本在单细胞RNA测序中的应用 | 儿童鼻洗样本 | 数字病理学 | 呼吸道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 288 | 2024-08-04 |
Endothelial downregulation of nuclear m6A reader YTHDC1 promotes pulmonary vascular remodeling in sugen hypoxia model of pulmonary hypertension
2024-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24963
PMID:38318069
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研究论文 | 本文分析了YTHDC1在苏根缺氧小鼠模型中的表达变化及其在肺动脉内皮细胞功能障碍中的作用 | 首次分析了苏根缺氧小鼠模型中m6A调节因子的表达和生物功能变化，建立了YTHDC1与PAECs功能障碍之间的因果关系 | 目前对m6A调节因子在肺动脉内皮细胞功能障碍中的具体机制尚不完全清楚 | 研究m6A调节因子在肺动脉内皮细胞功能障碍中的作用 | 鼠类模型中的肺动脉内皮细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞测序 | 苏根缺氧模型 | RNA测序数据 | 苏根缺氧小鼠模型的肺动脉内皮细胞 |
| 289 | 2024-08-07 |
Centrosome amplification-related signature correlated with immune microenvironment and treatment response predicts prognosis and improves diagnosis of hepatocellular carcinoma by integrating machine learning and single-cell analyses
2024-Feb, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-023-10538-5
PMID:37154991
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习和单细胞分析，构建了与免疫微环境和治疗反应相关的中心体扩增相关特征，用于预测肝细胞癌的预后和改善诊断 | 首次详细探讨了中心体扩增在肝细胞癌中的作用，并构建了一个具有高敏感性和特异性的预后和诊断特征 | 研究主要基于TCGA和ICGC数据集，可能需要更多临床数据验证 | 探讨中心体扩增在肝细胞癌中的分子机制及其对临床特征、肿瘤微环境和临床药物反应的影响 | 肝细胞癌患者及其中心体扩增相关基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-惩罚Cox回归算法 | 基因表达数据 | 134个中心体扩增相关预后基因，其中6个关键预后基因 |
| 290 | 2024-08-07 |
Integrating single-cell and bulk RNA sequencing reveals CK19 + cancer stem cells and their specific SPP1 + tumor-associated macrophage niche in HBV-related hepatocellular carcinoma
2024-Feb, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-023-10615-9
PMID:38159218
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序技术，揭示了HBV相关肝细胞癌中CK19阳性癌症干细胞及其特异的SPP1阳性肿瘤相关巨噬细胞微环境 | 首次全面探索了HBV相关肝细胞癌中的CK19阳性癌症干细胞及其肿瘤相关巨噬细胞，并揭示了其异质性和免疫抑制特性 | NA | 探索HBV相关肝细胞癌中CK19阳性癌症干细胞及其肿瘤相关巨噬细胞的特性，为临床治疗提供新思路 | HBV相关肝细胞癌中的CK19阳性癌症干细胞及其肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 64,581个单细胞来自人类肝细胞癌及邻近正常组织 |
| 291 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics in endocrine research
2024-Feb-28, Endocrine journal
IF:1.3Q4
DOI:10.1507/endocrj.EJ23-0457
PMID:38220200
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综述 | 本综述探讨了单细胞和空间转录组学在内分泌研究中的应用及其局限性 | 提出了单细胞和空间转录组学在研究内分泌器官及其疾病中的潜在未来应用 | 这些技术在内分泌研究中的应用仍然有限 | 揭示内分泌器官中细胞异质性及其细胞间相互作用的功能角色 | 主要研究内分泌器官的细胞类型及其互作 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 292 | 2024-08-07 |
Identification of common stria vascularis cellular alteration in sensorineural hearing loss based on ScRNA-seq
2024-Feb-27, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10122-7
PMID:38413848
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序（scRNA-seq）数据，分析了耳蜗血管纹（SV）在感音神经性听力损失（SNHL）中的细胞间通讯变化及其在病理发生中的作用。 | 发现了新的保守基因和下调通路，并预测了转录因子Nfe2l2作为多个共享细胞通路的上游调控因子。 | NA | 旨在通过分析公共可用的单细胞转录组测序数据，识别感音神经性听力损失中常见的调控信号通路。 | 耳蜗血管纹（SV）的细胞间通讯及其在感音神经性听力损失（SNHL）病理发生中的作用。 | 数字病理学 | 感音神经性听力损失 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自感音神经性听力损失小鼠和正常成年小鼠的耳蜗血管纹（SV）样本 |
| 293 | 2024-08-07 |
Metabolic Landscape of Osteosarcoma: Reprogramming of Lactic Acid Metabolism and Metabolic Communication
2024-Feb-22, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902083
PMID:38420794
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸代谢在骨肉瘤微环境中的重编程及其对肿瘤侵袭、生长和肿瘤微环境的影响 | 首次揭示了骨肉瘤中乳酸代谢的高亚群及其与其他亚群的独特代谢通信模式，并确定了与乳酸代谢相关的重要基因NDUFAF6 | NA | 探索骨肉瘤微环境中乳酸代谢的重编程及其对肿瘤侵袭、生长和肿瘤微环境的影响 | 骨肉瘤细胞的乳酸代谢及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞基因表达数据分析 | NA | 转录组数据 | 涉及骨肉瘤样本的单细胞RNA测序数据 |
| 294 | 2024-08-05 |
Immune Response Associated Gene Signatures in Aortic Dissection Compared to Aortic Aneurysm
2024-Feb-06, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902064
PMID:38420822
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研究论文 | 该文章研究了与免疫反应相关的基因在主动脉夹层和主动脉瘤中的差异 | 本研究识别了37个在主动脉夹层中显著失调的基因，这些基因之前未与此病相关联 | 样本量较小，且研究仅限于特定基因的分析，可能无法全面反映所有相关的生物过程 | 探讨主动脉夹层中免疫系统的作用及相关基因的特征 | 以主动脉夹层患者、主动脉瘤患者及对照组为对象进行基因表达分析 | 数字病理学 | 主动脉夹层 | 微阵列技术和RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 主动脉夹层4个、主动脉瘤3个及对照组的RNA样本，共37个分析数据点 |
| 295 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Identified Core Genes and Transcription Factors in Mesenchymal Cell Differentiation during Liver Cirrhosis
2024-Feb-06, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902062
PMID:38420807
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别了肝硬化过程中间质细胞分化中的核心基因和转录因子 | 首次通过单细胞转录组和批量RNA测序数据，揭示了肝纤维化过程中间质细胞分化的核心基因和转录因子 | 小鼠模型在反映人类疾病进展和结果方面可能不够准确 | 研究肝纤维化和肝硬化中间质细胞分化的机制 | 人肝硬化和健康肝脏组织以及小鼠健康和纤维化肝脏的间质细胞 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞转录组测序, RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过50,000个人类单细胞和多个小鼠肝脏样本 |
| 296 | 2024-08-04 |
Extracting, filtering and simulating cellular barcodes using CellBarcode tools
2024-Feb, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00595-7
PMID:38374363
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研究论文 | 介绍CellBarcode和CellBarcodeSim工具，以提高细胞条形码的提取和过滤效率 | 提供了一种新的工具包，支持多种条形码类型的提取和过滤，并探索影响条形码识别的因素 | 目前工具在支持的条形码类型多样性和分析策略上存在局限 | 开发更灵活有效的条形码提取与过滤工具 | 细胞条形码，从批量或单细胞测序数据中提取 | 数字病理学 | NA | PCR，测序 | NA | 生物数据 | NA |
| 297 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals immune cell heterogeneity in acute myeloid leukaemia peripheral blood mononuclear cells after chemotherapy
2024-Feb, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-023-00853-2
PMID:37615858
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组测序技术分析了急性髓系白血病（AML）患者在接受化疗后的外周血单个核细胞（PBMC）的免疫细胞异质性 | 本研究首次揭示了AML患者化疗后PBMC中T细胞、自然杀伤细胞（NK细胞）、单核细胞、树突状细胞（DCs）和造血干细胞前体（HSC-Prog）的亚群多样性及其转录因子和染色体拷贝数变异（CNV）的显著变化 | NA | 探索AML患者化疗后的免疫微环境，为精准医疗和免疫治疗提供见解 | AML患者化疗后的PBMC微环境 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 5名AML患者和6名健康捐赠者的PBMC |
| 298 | 2024-08-07 |
Normalizing need not be the norm: count-based math for analyzing single-cell data
2024-Feb, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften
DOI:10.1007/s12064-023-00408-x
PMID:37947999
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研究论文 | 本文提出了一种不进行归一化处理，而是利用基于计数的代数方法来分析单细胞数据的新方法 | 本文创新地避免了归一化和转换步骤，采用基于计数的代数方法来分析单细胞RNA测序数据，这种方法更简单直观，且避免了常见转换带来的问题 | NA | 探索不进行归一化处理的新方法来分析单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 计数数据 | NA |
| 299 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies senescence as therapeutic target in rhabdomyolysis-induced acute kidney injury
2024-Feb-28, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfad199
PMID:37697719
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在横纹肌溶解诱导的急性肾损伤模型中，识别出与细胞衰老相关的过渡性巨噬细胞亚群，并探讨了衰老抑制剂的治疗潜力。 | 首次揭示了横纹肌溶解诱导的急性肾损伤中存在与细胞衰老相关的过渡性巨噬细胞亚群，并证明了衰老抑制剂在肾保护中的作用。 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证；衰老抑制剂的具体作用机制和长期效果仍需进一步研究。 | 探索横纹肌溶解诱导的急性肾损伤中免疫细胞的变化，特别是细胞衰老在其中的作用，并评估衰老抑制剂的治疗效果。 | 横纹肌溶解诱导的急性肾损伤中的免疫细胞，特别是巨噬细胞和肾小管上皮细胞。 | 数字病理学 | 肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约17,000个单细胞 |
| 300 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals roles of unique retinal microglia types in early diabetic retinopathy
2024-Feb-26, Diabetology & metabolic syndrome
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13098-024-01282-3
PMID:38409074
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了独特的视网膜小胶质细胞类型在早期糖尿病视网膜病变中的作用 | 首次定义了三种新的小胶质细胞亚型，并构建了一个涉及小胶质细胞和其他视网膜细胞的炎症网络 | 样本量较小，仅包含五个视网膜标本，可能影响结果的普适性 | 探讨早期糖尿病视网膜病变中小胶质细胞的变化及其在炎症反应中的作用 | 采用SD大鼠捐赠的视网膜标本分析早期糖尿病视网膜病变中的细胞变化 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 五个视网膜标本 |