单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 444 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-07 |
NeuroTri2-VISDOT: An open-access tool to harness the power of second trimester human single cell data to inform models of Mendelian neurodevelopmental disorders
2024-Feb-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.01.578438
PMID:38352329
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研究论文 | 本文介绍了一个名为NeuroTri2-VISDOT的网络工具，用于探索第二孕期人类大脑的单细胞RNA测序数据，以支持孟德尔神经发育障碍的研究 | 开发了一个易于访问的网络工具，降低了使用单细胞数据分析的门槛，促进了孟德尔神经发育障碍的转化研究 | NA | 提供一个易于访问的工具，帮助研究人员利用第二孕期人类大脑的单细胞数据来构建孟德尔神经发育障碍的模型 | 第二孕期人类大脑的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 由Bhaduri等人在2021年产生的第二孕期人类大脑的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 282 | 2024-08-04 |
Recent progress in hair follicle stem cell markers and their regulatory roles
2024-Feb-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v16.i2.126
PMID:38455104
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研究论文 | 本文回顾了毛囊干细胞的分子标记物及其调节作用 | 探讨了单细胞转录组技术提供的详细数据，聚焦于重要的HFSC分子标记物 | 缺乏HFSC的实验验证和比较不同标记物的实用性 | 旨在总结和分析毛囊干细胞标记物及其功能 | 主要研究毛囊干细胞及其在损伤愈合中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 283 | 2024-08-07 |
Identification and validation of a pyroptosis-related prognostic model for colorectal cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-Feb-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i2.329
PMID:38455135
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研究论文 | 本研究基于大量和单细胞RNA测序数据，构建并验证了与结直肠癌（CRC）预后相关的细胞焦亡相关预测模型。 | 首次构建了一个基于细胞焦亡相关基因的结直肠癌预后模型，并验证了其与免疫浸润的相关性。 | NA | 评估细胞焦亡相关基因对结直肠癌预后的影响及其与免疫浸润的关联。 | 结直肠癌（CRC）患者的预后及免疫浸润情况。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | LASSO回归算法 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO的数据集，具体样本数量未在摘要中明确。 | NA | NA | NA | NA |
| 284 | 2024-08-04 |
Granzyme B+ B cells detected by single-cell sequencing are associated with prognosis in patients with intrahepatic cholangiocarcinoma following liver transplantation
2024-Feb-22, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03609-x
PMID:38386050
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞测序检测到的granzyme B+ B细胞与肝移植后肝内胆管癌患者预后的关系 | 首次揭示了肿瘤样本中granzyme B+ B细胞的显著增加及其与无病生存的正相关性 | 研究仅涉及肝内胆管癌，无法广泛适用于其他癌症类型 | 研究granzyme B+ B细胞在肝内胆管癌中的作用及其对预后的影响 | 肝移植接受者的肝内胆管癌患者 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞测序 | NA | 样本数据 | 25个样本来自基因表达综合数据库以及40名肝移植接受者 | NA | NA | NA | NA |
| 285 | 2024-08-04 |
Identification macrophage signatures in prostate cancer by single-cell sequencing and machine learning
2024-Feb-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03633-5
PMID:38349474
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和机器学习识别前列腺癌中的巨噬细胞特征。 | 提出了一种基于巨噬细胞相关基因的风险标签，用于预测前列腺癌患者的进展。 | 样本来源于公共数据库，可能缺乏来自不同临床环境的数据验证。 | 分析肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌中的作用，并建立相关的预后模型。 | 关注肿瘤微环境中巨噬细胞与前列腺癌进展之间的关系。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、机器学习 | NA | 基因数据、RNA数据 | 从多个公共数据库下载的前列腺癌单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 286 | 2024-08-07 |
uPAR (PLAUR) Marks Two Intra-Tumoral Subtypes of Glioblastoma: Insights from Single-Cell RNA Sequencing
2024-Feb-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25041998
PMID:38396677
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，分析了uPAR（PLAUR）在胶质母细胞瘤（GBM）中的作用及其分子合作者 | 首次全面研究uPAR在GBM内部亚型中的功能及其分子合作者，无需预设生物学途径 | NA | 探讨uPAR在胶质母细胞瘤内部亚型中的作用及其分子机制 | uPAR在胶质母细胞瘤中的作用及其分子合作者 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 37名胶质母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 287 | 2024-08-04 |
ITGAM-mediated macrophages contribute to basement membrane damage in diabetic nephropathy and atherosclerosis
2024-Feb-27, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03505-1
PMID:38413872
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研究论文 | 本研究分析了ITGAM介导的巨噬细胞在糖尿病肾病和动脉粥样硬化中的作用 | 发现ITGAM作为关键基因参与了糖尿病肾病和动脉粥样硬化中的基底膜损伤 | 未提供研究中可能存在的具体局限性信息 | 研究糖尿病肾病和动脉粥样硬化中的基底膜损伤及其相关机制 | 糖尿病肾病和动脉粥样硬化患者的转录组特征 | 生物信息学 | 糖尿病相关并发症 | 转录组分析、免疫浸润分析、单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来源于基因表达综合数据库的糖尿病肾病和动脉粥样硬化患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 288 | 2024-08-04 |
High-throughput mapping of single-neuron projection and molecular features by retrograde barcoded labeling
2024-Feb-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85419
PMID:38390967
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研究论文 | 该文章建立了一种新型的多重追踪方法，同时表征单神经元的投射组和转录组 | 提出了rAAV2-retro条形码的多重追踪方法，能够同时分析神经元投射和转录组特征 | 该研究在复杂脑网络中可能仍面临技术挑战 | 帮助揭示神经电路的组织原则和信息处理机制 | 探究腹内侧前额叶皮层(vmPFC)神经元的投射模式及其分子特征 | 神经科学 | NA | 条形码连接组学 | NA | 转录组数据 | 大量单神经元样本 | NA | NA | NA | NA |
| 289 | 2024-08-07 |
Human archetypal pluripotent stem cells differentiate into trophoblast stem cells via endogenous BMP5/7 induction without transitioning through naive state
2024-02-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53381-w
PMID:38332235
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研究论文 | 本研究展示了人类原始多能干细胞可以通过内源性BMP5/7诱导分化为滋养层干细胞，无需经过原始状态 | 本研究首次证明了人类原始多能干细胞可以直接分化为滋养层干细胞，无需添加外源性BMP4，通过激活EGF和WNT通路以及抑制TGFβ、HDAC和ROCK信号通路 | NA | 探索人类多能干细胞向滋养层干细胞分化的机制 | 人类多能干细胞和滋养层干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个原始诱导多能干细胞和胚胎干细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 290 | 2024-08-07 |
Microglia sense astrocyte dysfunction and prevent disease progression in an Alexander disease model
2024-02-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awad358
PMID:37955589
|
研究论文 | 本研究探讨了微胶质细胞在亚历山大疾病模型中感知星形胶质细胞功能障碍并防止疾病进展的作用 | 首次展示了微胶质细胞通过P2Y12受体感知星形胶质细胞功能障碍，并通过改变形态和钙信号传导来保护对抗亚历山大疾病病理 | NA | 探究微胶质细胞在亚历山大疾病中的作用及其机制 | 微胶质细胞和星形胶质细胞在亚历山大疾病模型中的相互作用 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 免疫组织化学研究，钙成像，单细胞RNA测序，ATP成像 | NA | 图像数据 | 60TM小鼠模型和野生型小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 291 | 2024-08-07 |
A novel batch-effect correction method for scRNA-seq data based on Adversarial Information Factorization
2024-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011880
PMID:38386700
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研究论文 | 本文提出了一种基于对抗信息分解的新型批次效应校正方法，用于单细胞RNA测序数据 | 该方法不依赖于细胞类型的先验知识或特定的标准化策略，适用于任何下游分析任务，并在多种情况下优于现有技术 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 白血病 | scRNA-seq | 对抗信息分解 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 292 | 2024-08-07 |
Baf-mediated transcriptional regulation of teashirt is essential for the development of neural progenitor cell lineages
2024-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01169-3
PMID:38374207
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研究论文 | 研究通过遗传学方法破坏果蝇神经系统中的进化保守屏障自整合因子（Baf），利用单细胞RNA测序技术揭示了Baf敲降引起的转录组变化，特别是I型神经母细胞中的变化，并发现Baf与转录因子teashirt（tsh）共同作用于异染色质锚定至内核膜的过程，从而调控神经前体细胞谱系的发育 | 首次揭示了Baf介导的teashirt转录调控是一种新的分子机制，用于调节神经前体细胞谱系的发育 | NA | 探索异染色质锚定至内核膜的细胞类型特异性或上下文依赖性程序化调控对神经细胞发育的影响 | 果蝇神经系统中的Baf因子及其对神经前体细胞谱系发育的影响 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 果蝇神经系统中的I型神经母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 293 | 2024-08-07 |
IFN-γ decreases PD-1 in T lymphocytes from convalescent COVID-19 patients via the AKT/GSK3β signaling pathway
2024-02-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-55191-6
PMID:38424104
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研究论文 | 本文研究了康复期COVID-19患者中IFN-γ通过AKT/GSK3β信号通路降低T淋巴细胞PD-1表达的现象 | 首次揭示了IFN-γ通过AKT/GSK3β信号通路调控康复期COVID-19患者CD8 T细胞PD-1表达的机制 | NA | 探讨康复期COVID-19患者免疫状态异常的原因 | 康复期COVID-19患者的T淋巴细胞和免疫分子 | 免疫学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 细胞和蛋白质表达数据 | 康复期COVID-19患者的CD8 T细胞和血浆样本 | NA | NA | NA | NA |
| 294 | 2024-08-07 |
Integrated meta-omics reveals the regulatory landscape involved in lipid metabolism between pig breeds
2024-Feb-20, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-023-01743-3
PMID:38374121
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研究论文 | 本文通过综合代谢组学和宏基因组学方法，揭示了不同猪品种间脂质代谢调控的分子机制 | 首次系统地研究了不同猪品种间脂质代谢的细胞和分子机制，为改善动物生产和人类疾病提供了新的视角 | NA | 探究不同猪品种间脂质代谢的调控机制 | 猪的空肠、结肠、肝脏和背最长肌组织的细胞类型 | 代谢组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两品种猪的多个组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 295 | 2024-08-07 |
Mef2c regulates bone mass through Sost-dependent and -independent mechanisms
2024-02, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2023.116976
PMID:38042445
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研究论文 | 本文研究了转录因子Mef2c通过Sost依赖和非依赖机制调节骨量的作用 | 发现了Mef2c通过Sost以外的机制调节骨量，并识别了新的Mef2c转录靶点 | NA | 识别Mef2c在骨代谢中的新转录靶点 | Mef2c在骨形成中的作用及其转录靶点 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Mef2c; Dmp1-Cre和Mef2c; Bglap-Cre小鼠的股骨细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 296 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of MYD88L265P and MYD88WT Waldenström macroglobulinemia patients
2024-Feb, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.27
PMID:38435423
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了MYD88L265P和MYD88WT基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的CD19阳性细胞，揭示了肿瘤内克隆异质性及其对B细胞组成的潜在影响 | 首次在单细胞水平上分析了两种不同基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的转录组特征，揭示了患者间的转录组差异和共同特征 | 研究样本量较小，仅包括五名MYD88L265P基因型和两名MYD88WT基因型患者以及两名健康对照 | 评估瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症中的克隆异质性 | MYD88L265P和MYD88WT基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的CD19阳性细胞 | 数字病理学 | 瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五名MYD88L265P基因型患者、两名MYD88WT基因型患者和两名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 297 | 2024-08-04 |
IL6-STAT3-C/EBPβ-IL6 positive feedback loop in tumor-associated macrophages promotes the EMT and metastasis of lung adenocarcinoma
2024-Feb-29, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02989-x
PMID:38424624
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）通过IL6-STAT3-C/EBPβ-IL6正反馈环路促进肺腺癌的上皮间质转化（EMT）和转移的机制 | 揭示了巨噬细胞促进肿瘤进展的新机制，IL6-STAT3-C/EBPβ-IL6信号级联可能成为肺癌治疗的新靶点 | 研究的样本主要来自单一医院，样本容量相对较小 | 研究肿瘤相关巨噬细胞在肺癌转移中的调控机制 | 研究对象包括来自公共数据库和14名肺癌患者的正常及肿瘤组织样本 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞测序，RT-qPCR，Western blotting，免疫荧光，双荧光素酶报告实验，ChIP | NA | 组织样本 | 14名手术患者的肿瘤和正常组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 298 | 2024-08-07 |
The Role of CD8A in the Immune Microenvironment of Breast Cancer
2024-Feb-21, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902073
PMID:38420798
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研究论文 | 研究探讨了CD8A在三阴性乳腺癌（TNBC）免疫微环境中的作用及其与预后的关系 | 通过使用单细胞RNA测序数据和临床样本评估，揭示了CD8A在转移性乳腺癌免疫微环境中的表达及其对预后的影响 | NA | 寻找新的治疗靶点和策略，改善三阴性乳腺癌的预后 | 三阴性乳腺癌及其免疫微环境中的CD8A表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE102818、GSE118389和GSE202695等多个数据集，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 299 | 2024-08-07 |
Enabling methanol fixation of pediatric nasal wash during respiratory illness for single cell sequencing in comparison with fresh samples
2024-Feb, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-023-02780-2
PMID:37758866
|
研究论文 | 本研究开发了一种协议，允许在甲醇固定的儿童鼻洗样本中进行单细胞RNA测序，并与新鲜样本进行比较 | 首次展示了甲醇固定儿童鼻洗样本进行单细胞RNA测序的可行性，并发现其与新鲜样本在定性和定量参数上无显著差异 | NA | 探索甲醇固定儿童鼻洗样本在单细胞RNA测序中的应用 | 儿童鼻洗样本 | 数字病理学 | 呼吸道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 300 | 2024-08-04 |
Endothelial downregulation of nuclear m6A reader YTHDC1 promotes pulmonary vascular remodeling in sugen hypoxia model of pulmonary hypertension
2024-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24963
PMID:38318069
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研究论文 | 本文分析了YTHDC1在苏根缺氧小鼠模型中的表达变化及其在肺动脉内皮细胞功能障碍中的作用 | 首次分析了苏根缺氧小鼠模型中m6A调节因子的表达和生物功能变化，建立了YTHDC1与PAECs功能障碍之间的因果关系 | 目前对m6A调节因子在肺动脉内皮细胞功能障碍中的具体机制尚不完全清楚 | 研究m6A调节因子在肺动脉内皮细胞功能障碍中的作用 | 鼠类模型中的肺动脉内皮细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞测序 | 苏根缺氧模型 | RNA测序数据 | 苏根缺氧小鼠模型的肺动脉内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |