单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-07 |
Dynamics of host immune responses and a potential function of Trem2hi interstitial macrophages in Pneumocystis pneumonia
2024-Feb-05, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02709-1
PMID:38317180
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研究论文 | 本研究通过时间分辨的单细胞RNA测序分析，探讨了Pneumocystis肺炎过程中宿主免疫反应的变化及Trem2hi间质巨噬细胞的潜在作用 | 首次详细描述了Pneumocystis肺炎过程中免疫细胞的动态转录变化，并揭示了PCP相关巨噬细胞（PAM）在疾病中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 阐明Pneumocystis肺炎过程中宿主免疫反应的动态变化及Trem2hi间质巨噬细胞的功能 | Pneumocystis肺炎感染的小鼠肺组织中的CD45+细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 感染Pneumocystis的小鼠肺组织中的CD45+细胞 |
| 262 | 2024-08-07 |
Neutrophils in the era of single-cell RNA sequencing: functions and targeted therapies in cancer
2024-02-05, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 263 | 2024-08-04 |
Nicotinamide riboside activates renal metabolism and protects the kidney in a model of Alport syndrome
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.580911
PMID:38464264
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研究论文 | 这篇文章展示了烟酰胺核糖在Alport综合征小鼠模型中激活肾脏代谢并保护肾脏的作用 | 首次在Alport小鼠模型中发现烟酰胺核糖补充恢复近端肾小管中的脂肪酸氧化，并揭示了性别差异 | 当前对NAD补充的保护机制及其主要负责的细胞类型理解较少 | 研究烟酰胺核糖对慢性肾病的保护作用及其机制 | 使用Alport综合征小鼠模型进行研究 | 数字病理学 | 慢性肾病 | RNA测序 | 小鼠模型 | 转录组数据 | NA |
| 264 | 2024-08-07 |
WITHDRAWN: The effect of ischemia on expression quantitative trait loci (eQTL) in human myocardium and insights into myocardial injury etiology
2024-Feb-20, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3967889/v1
PMID:38464039
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序分析了118名接受主动脉瓣置换手术患者的心肌组织样本，探讨缺血对人类心肌表达数量性状位点（eQTL）的影响及其与心肌损伤病因的关系 | 本研究首次在人类心肌组织中识别并复制了缺血条件下的局部表达数量性状位点（cis-eQTL），并结合基因组关联研究，确定了心肌损伤的因果基因 | 研究样本主要集中在接受特定心脏手术的患者，可能限制了结果的普遍性 | 旨在理解人类心肌缺血的病理过程，并探索心肌损伤的病因 | 人类心肌组织样本及心肌损伤的因果基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 118名患者的心肌组织样本及2,371名患者的独立队列 |
| 265 | 2024-08-07 |
Transcriptome network analysis of inflammation and fibrosis in keloids
2024-Feb, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.12.007
PMID:38242738
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研究论文 | 本文通过转录组测序和微小RNA测序，分析了人类瘢痕疙瘩组织与正常皮肤组织中的炎症和纤维化转录组图谱，并利用单细胞RNA测序研究了细胞间通讯网络和成纤维细胞的多样性 | 本文首次通过多组学数据揭示了瘢痕疙瘩中炎症细胞与成纤维细胞之间的细胞间对话，并发现了可能与瘢痕疙瘩发展相关的miRNA和基因 | 研究样本量较小，仅包括六个瘢痕疙瘩组织和两个正常皮肤样本，可能影响结果的普遍性 | 探究瘢痕疙瘩中炎症和纤维化的转录组图谱 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤肿瘤 | 转录组测序、微小RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、微小RNA数据、单细胞RNA数据 | 六个瘢痕疙瘩组织和两个正常皮肤样本，共24,086个细胞 |
| 266 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA profiling reveals classification and characteristics of mononuclear phagocytes in colorectal cancer
2024-Feb, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011176
PMID:38408082
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对结直肠癌中的单核吞噬细胞进行了分类和特征分析 | 本研究发现了与结直肠癌预后相关的新亚群，并揭示了调控单核吞噬细胞分化的转录因子调控网络 | NA | 深入全面地理解单核吞噬细胞的免疫功能 | 结直肠癌中的单核吞噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6种不同的单核吞噬细胞亚群 |
| 267 | 2024-08-07 |
NeuroTri2-VISDOT: An open-access tool to harness the power of second trimester human single cell data to inform models of Mendelian neurodevelopmental disorders
2024-Feb-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.01.578438
PMID:38352329
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研究论文 | 本文介绍了一个名为NeuroTri2-VISDOT的网络工具，用于探索第二孕期人类大脑的单细胞RNA测序数据，以支持孟德尔神经发育障碍的研究 | 开发了一个易于访问的网络工具，降低了使用单细胞数据分析的门槛，促进了孟德尔神经发育障碍的转化研究 | NA | 提供一个易于访问的工具，帮助研究人员利用第二孕期人类大脑的单细胞数据来构建孟德尔神经发育障碍的模型 | 第二孕期人类大脑的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 由Bhaduri等人在2021年产生的第二孕期人类大脑的单细胞RNA测序数据集 |
| 268 | 2024-08-04 |
Recent progress in hair follicle stem cell markers and their regulatory roles
2024-Feb-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v16.i2.126
PMID:38455104
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研究论文 | 本文回顾了毛囊干细胞的分子标记物及其调节作用 | 探讨了单细胞转录组技术提供的详细数据，聚焦于重要的HFSC分子标记物 | 缺乏HFSC的实验验证和比较不同标记物的实用性 | 旨在总结和分析毛囊干细胞标记物及其功能 | 主要研究毛囊干细胞及其在损伤愈合中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | NA | NA |
| 269 | 2024-08-07 |
Identification and validation of a pyroptosis-related prognostic model for colorectal cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-Feb-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i2.329
PMID:38455135
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研究论文 | 本研究基于大量和单细胞RNA测序数据，构建并验证了与结直肠癌（CRC）预后相关的细胞焦亡相关预测模型。 | 首次构建了一个基于细胞焦亡相关基因的结直肠癌预后模型，并验证了其与免疫浸润的相关性。 | NA | 评估细胞焦亡相关基因对结直肠癌预后的影响及其与免疫浸润的关联。 | 结直肠癌（CRC）患者的预后及免疫浸润情况。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | LASSO回归算法 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO的数据集，具体样本数量未在摘要中明确。 |
| 270 | 2024-08-04 |
Granzyme B+ B cells detected by single-cell sequencing are associated with prognosis in patients with intrahepatic cholangiocarcinoma following liver transplantation
2024-Feb-22, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03609-x
PMID:38386050
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞测序检测到的granzyme B+ B细胞与肝移植后肝内胆管癌患者预后的关系 | 首次揭示了肿瘤样本中granzyme B+ B细胞的显著增加及其与无病生存的正相关性 | 研究仅涉及肝内胆管癌，无法广泛适用于其他癌症类型 | 研究granzyme B+ B细胞在肝内胆管癌中的作用及其对预后的影响 | 肝移植接受者的肝内胆管癌患者 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞测序 | NA | 样本数据 | 25个样本来自基因表达综合数据库以及40名肝移植接受者 |
| 271 | 2024-08-04 |
Identification macrophage signatures in prostate cancer by single-cell sequencing and machine learning
2024-Feb-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03633-5
PMID:38349474
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和机器学习识别前列腺癌中的巨噬细胞特征。 | 提出了一种基于巨噬细胞相关基因的风险标签，用于预测前列腺癌患者的进展。 | 样本来源于公共数据库，可能缺乏来自不同临床环境的数据验证。 | 分析肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌中的作用，并建立相关的预后模型。 | 关注肿瘤微环境中巨噬细胞与前列腺癌进展之间的关系。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、机器学习 | NA | 基因数据、RNA数据 | 从多个公共数据库下载的前列腺癌单细胞测序数据 |
| 272 | 2024-08-07 |
uPAR (PLAUR) Marks Two Intra-Tumoral Subtypes of Glioblastoma: Insights from Single-Cell RNA Sequencing
2024-Feb-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25041998
PMID:38396677
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，分析了uPAR（PLAUR）在胶质母细胞瘤（GBM）中的作用及其分子合作者 | 首次全面研究uPAR在GBM内部亚型中的功能及其分子合作者，无需预设生物学途径 | NA | 探讨uPAR在胶质母细胞瘤内部亚型中的作用及其分子机制 | uPAR在胶质母细胞瘤中的作用及其分子合作者 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 37名胶质母细胞瘤患者 |
| 273 | 2024-08-04 |
ITGAM-mediated macrophages contribute to basement membrane damage in diabetic nephropathy and atherosclerosis
2024-Feb-27, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03505-1
PMID:38413872
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研究论文 | 本研究分析了ITGAM介导的巨噬细胞在糖尿病肾病和动脉粥样硬化中的作用 | 发现ITGAM作为关键基因参与了糖尿病肾病和动脉粥样硬化中的基底膜损伤 | 未提供研究中可能存在的具体局限性信息 | 研究糖尿病肾病和动脉粥样硬化中的基底膜损伤及其相关机制 | 糖尿病肾病和动脉粥样硬化患者的转录组特征 | 生物信息学 | 糖尿病相关并发症 | 转录组分析、免疫浸润分析、单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来源于基因表达综合数据库的糖尿病肾病和动脉粥样硬化患者样本 |
| 274 | 2024-08-04 |
High-throughput mapping of single-neuron projection and molecular features by retrograde barcoded labeling
2024-Feb-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85419
PMID:38390967
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研究论文 | 该文章建立了一种新型的多重追踪方法，同时表征单神经元的投射组和转录组 | 提出了rAAV2-retro条形码的多重追踪方法，能够同时分析神经元投射和转录组特征 | 该研究在复杂脑网络中可能仍面临技术挑战 | 帮助揭示神经电路的组织原则和信息处理机制 | 探究腹内侧前额叶皮层(vmPFC)神经元的投射模式及其分子特征 | 神经科学 | NA | 条形码连接组学 | NA | 转录组数据 | 大量单神经元样本 |
| 275 | 2024-08-07 |
Human archetypal pluripotent stem cells differentiate into trophoblast stem cells via endogenous BMP5/7 induction without transitioning through naive state
2024-02-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53381-w
PMID:38332235
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研究论文 | 本研究展示了人类原始多能干细胞可以通过内源性BMP5/7诱导分化为滋养层干细胞，无需经过原始状态 | 本研究首次证明了人类原始多能干细胞可以直接分化为滋养层干细胞，无需添加外源性BMP4，通过激活EGF和WNT通路以及抑制TGFβ、HDAC和ROCK信号通路 | NA | 探索人类多能干细胞向滋养层干细胞分化的机制 | 人类多能干细胞和滋养层干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个原始诱导多能干细胞和胚胎干细胞系 |
| 276 | 2024-08-07 |
Microglia sense astrocyte dysfunction and prevent disease progression in an Alexander disease model
2024-02-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awad358
PMID:37955589
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研究论文 | 本研究探讨了微胶质细胞在亚历山大疾病模型中感知星形胶质细胞功能障碍并防止疾病进展的作用 | 首次展示了微胶质细胞通过P2Y12受体感知星形胶质细胞功能障碍，并通过改变形态和钙信号传导来保护对抗亚历山大疾病病理 | NA | 探究微胶质细胞在亚历山大疾病中的作用及其机制 | 微胶质细胞和星形胶质细胞在亚历山大疾病模型中的相互作用 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 免疫组织化学研究，钙成像，单细胞RNA测序，ATP成像 | NA | 图像数据 | 60TM小鼠模型和野生型小鼠 |
| 277 | 2024-08-07 |
A novel batch-effect correction method for scRNA-seq data based on Adversarial Information Factorization
2024-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011880
PMID:38386700
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研究论文 | 本文提出了一种基于对抗信息分解的新型批次效应校正方法，用于单细胞RNA测序数据 | 该方法不依赖于细胞类型的先验知识或特定的标准化策略，适用于任何下游分析任务，并在多种情况下优于现有技术 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 白血病 | scRNA-seq | 对抗信息分解 | 基因表达数据 | NA |
| 278 | 2024-08-07 |
Lineage and ecology define liver tumor evolution in response to treatment
2024-Feb-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101394
PMID:38280378
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学方法，研究了肝癌患者肿瘤样本在治疗过程中的进化轨迹 | 提出了一种基于细胞谱系和生态学的评分系统，用于监测肿瘤在治疗干预下的进化 | NA | 研究肝癌在治疗反应中的进化机制 | 肝癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 716名肝癌患者 |
| 279 | 2024-08-04 |
Single-cell insights into immune dysregulation in rheumatoid arthritis flare versus drug-free remission
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45213-2
PMID:38316770
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研究论文 | 本文探讨类风湿性关节炎（RA）在药物撤除后的免疫失调及其发作过程 | 提出了一种模型来理解RA的免疫失调，为治疗和预防提供了新的研究方向 | 研究主要集中在药物撤除后的短期效果，可能未能全面覆盖所有RA患者的情况 | 探讨类风湿性关节炎发作时的免疫机制 | 分析类风湿性关节炎患者在发作与药物撤除缓解状态下的免疫细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞测序和质谱细胞术 | NA | 细胞数据 | 研究涉及类风湿性关节炎患者的循环细胞亚群 |
| 280 | 2024-08-07 |
Baf-mediated transcriptional regulation of teashirt is essential for the development of neural progenitor cell lineages
2024-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01169-3
PMID:38374207
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研究论文 | 研究通过遗传学方法破坏果蝇神经系统中的进化保守屏障自整合因子（Baf），利用单细胞RNA测序技术揭示了Baf敲降引起的转录组变化，特别是I型神经母细胞中的变化，并发现Baf与转录因子teashirt（tsh）共同作用于异染色质锚定至内核膜的过程，从而调控神经前体细胞谱系的发育 | 首次揭示了Baf介导的teashirt转录调控是一种新的分子机制，用于调节神经前体细胞谱系的发育 | NA | 探索异染色质锚定至内核膜的细胞类型特异性或上下文依赖性程序化调控对神经细胞发育的影响 | 果蝇神经系统中的Baf因子及其对神经前体细胞谱系发育的影响 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 果蝇神经系统中的I型神经母细胞 |