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当前共找到 444 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-04 |
Adipose tissue macrophage heterogeneity in the single-cell genomics era
2024-Feb, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2024.100031
PMID:38354858
|
研究论文 | 文章讨论了在单细胞基因组学时代脂肪组织巨噬细胞的异质性 | 提出了单细胞转录组技术能够揭示脂肪组织巨噬细胞的高度异质性 | 需要进一步研究以更好地理解ATMs和肥胖对其影响的复杂性 | 探讨肥胖及其引发的炎症如何影响脂肪组织巨噬细胞 | 主要研究脂肪组织巨噬细胞(ATMs)的异质性及其特征 | 数字病理 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组技术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 262 | 2024-08-04 |
Development of a novel lncRNA-derived immune gene score using machine learning-based ensembles for predicting the survival of HCC
2024-Feb-09, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05608-6
PMID:38334792
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研究论文 | 本文开发了一种新型的lncRNA衍生免疫基因评分模型，用于预测肝细胞癌（HCC）患者的生存率 | 提出了一种基于机器学习的集成方法来建立lncRNA和免疫基因评分模型 | 研究中使用的单细胞测序数据可能无法完全代表患者体内的真实免疫环境 | 开发一个准确的预测模型以评估肝细胞癌患者的生存期 | 肝细胞癌患者的mRNA和lncRNA表达谱 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA和lncRNA表达数据 | 使用了来自TCGA、GEO和ICGC的数据集进行模型验证 | NA | NA | NA | NA |
| 263 | 2024-08-04 |
Identification and validation of Golgi apparatus-related signature for predicting prognosis and immunotherapy response in breast cancer
2024-Feb-01, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05612-w
PMID:38300336
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研究论文 | 本研究旨在探讨高尔基体相关基因在乳腺癌预后和免疫治疗反应评估中的预测价值 | 识别并验证了一种由394个高尔基体相关基因组成的预后风险特征，可以有效区分乳腺癌患者的高风险和低风险组 | 未提及具体的研究局限性 | 研究乳腺癌中高尔基体相关基因的预测价值 | 乳腺癌患者的数据和样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | qPCR和单细胞测序 | Cox回归分析 | 转录组数据和临床数据 | 涉及394个与乳腺癌预后显著相关的高尔基体相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 264 | 2024-08-07 |
A prognostic model based on Scissor+ cancer associated fibroblasts identified from bulk and single cell RNA sequencing data in head and neck squamous cell carcinoma
2024-02, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2023.110984
PMID:38029947
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出与头颈鳞状细胞癌（HNSCC）不良预后相关的成纤维细胞亚群，并构建了一个预测HNSCC患者生存概率的风险模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据，识别出与HNSCC不良预后相关的成纤维细胞亚群，并构建了预测模型 | 需要进一步的实验验证和临床试验来验证模型的准确性和实用性 | 识别与头颈鳞状细胞癌预后相关的成纤维细胞亚群，并构建预测模型 | 头颈鳞状细胞癌患者的成纤维细胞亚群及其预后相关基因 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 风险模型 | RNA测序数据 | 使用The Cancer Genome Atlas (TCGA)和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中的数据进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 265 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell transcriptomics with cellular phenotypes: cell morphology, Ca2+ imaging and electrophysiology
2024-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-023-01174-2
PMID:38495444
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综述 | 本文回顾了单细胞转录组学与细胞表型结合的最新技术进展 | 提出了一系列新的方法将scRNAseq与生物物理测量结合，为转录组数据与细胞功能之间的联系提供了生理学见解 | 文章中未明确提及具体的技术限制或挑战 | 旨在探讨如何通过结合单细胞转录组学和细胞表型来理解细胞状态及其功能 | 研究对象包括细胞形态、钙信号和电生理学等细胞功能指标 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | 转录组数据与生物物理测量数据 | 强调在具有可兴奋细胞类型的组织中的应用，例如大脑、胰岛和视网膜，但具体样本数未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 266 | 2024-08-04 |
PI3K/mTOR is a therapeutically targetable genetic dependency in diffuse intrinsic pontine glioma
2024-Feb-06, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170329
PMID:38319732
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研究论文 | 本文探讨了针对弥漫性内在脑干胶质瘤的治疗靶点和组合疗法的潜力 | 识别了PIK3CA和MTOR作为可靶向的分子依赖性，并提出了paxalisib与二甲双胍及标准放疗联合的临床相关治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，临床应用仍需进一步验证 | 开发有效的针对弥漫性中线胶质瘤的治疗策略 | 研究弥漫性内在脑干胶质瘤患者衍生模型及其针对性治疗效果 | 数字病理学 | NA | CRISPR/Cas9基因删除筛选，空间转录组学，ATAC-Seq | 正交肿瘤模型 | 分子数据 | 多种患者衍生和免疫相容性的异种移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 267 | 2024-08-07 |
Temporal transcriptomic dynamics in developing macaque neocortex
2024-Feb-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90325
PMID:38415809
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研究论文 | 研究描述了猕猴新皮质发育过程中的转录组动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术，构建了猕猴新皮质发育的转录组图谱，揭示了从干细胞到神经元的分化轨迹 | NA | 探究人类和非人灵长类新皮质神经发生中的转录调控 | 猕猴的顶叶新皮质在不同发育阶段的转录组变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 在E40、E50、E70、E80和E90五个时间点采集的猕猴顶叶样本 | NA | NA | NA | NA |
| 268 | 2024-08-04 |
The E3 ubiquitin ligase MARCH2 protects against myocardial ischemia-reperfusion injury through inhibiting pyroptosis via negative regulation of PGAM5/MAVS/NLRP3 axis
2024-Feb-27, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00622-3
PMID:38409220
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研究论文 | 本研究揭示了E3泛素连接酶MARCH2通过负调控PGAM5/MAVS/NLRP3通路抑制心肌细胞焦亡，从而保护心脏免受缺血-再灌注损伤的机制 | 发现MARCH2通过促进PGAM5的K48连接聚泛素化和蛋白酶体降解，抑制心肌细胞中的NLRP3炎症小体激活 | 本研究未涉及在临床试验中的应用及长期效应 | 研究MARCH2在心肌缺血-再灌注损伤中的保护作用及其机制 | 人心脏和小鼠心脏中的MARCH2表达水平及其对心肌细胞的影响 | 心血管疾病 | 心肌缺血 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 人心脏和小鼠心脏的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 269 | 2024-08-04 |
Molecular classification and tumor microenvironment characteristics in pheochromocytomas
2024-Feb-26, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87586
PMID:38407266
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研究论文 | 本研究对嗜铬细胞瘤的分子特征和肿瘤微环境进行了单细胞转录组分析 | 提出了一种基于单细胞转录组的分子分类和微环境特征分析，为嗜铬细胞瘤的潜在治疗策略提供线索 | CD8 T细胞浸润缺乏的情况限制了对免疫治疗效果的评估 | 探讨嗜铬细胞瘤的细胞分子特征及其免疫微环境 | 对4名散发性未分类嗜铬细胞瘤患者和1名具有冯·希佩尔-林道综合征的遗传性患者的组织进行研究 | 数字病理学 | 嗜铬细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 16个组织样本，来自5名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2024-08-04 |
Molecular, Metabolic, and Subcellular Mapping of the Tumor Immune Microenvironment via 3D Targeted and Non-Targeted Multiplex Multi-Omics Analyses
2024-Feb-20, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16050846
PMID:38473208
|
研究论文 | 本研究开发了一种整合多重空间分辨的多组学平台，研究肿瘤免疫微环境的三维映射 | 提出了一种新颖的方法，通过多重组学分析实现了对肿瘤免疫微环境的空间和单细胞分辨率的研究 | 在研究中仅使用了两种妇科肿瘤样本，可能不足以普遍适用于所有类型的肿瘤 | 研究肿瘤免疫微环境中细胞间及细胞与细胞外基质的相互作用 | 两种福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）妇科肿瘤样本 | 数字病理学 | NA | 非靶向质谱成像、空间转录组学、靶向seqIF | NA | 图像 | 两种福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本 | NA | NA | NA | NA |
| 271 | 2024-08-04 |
Identification of robust cellular programs using reproducible LDA that impact sex-specific disease progression in different genotypes of a mouse model of AD
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582178
PMID:38464087
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研究论文 | 本文开发了一个可重复的LDA（rLDA）包，以识别影响老年痴呆症小鼠不同基因型的性别特异性疾病进展的细胞程序 | 提出了Topyfic，一个可重复的LDA包，能够更准确地推断单细胞数据中细胞程序的身份和活性 | LDA的可解释性受制于超参数选择及随机初始化导致的主题定义变异性 | 识别在单细胞RNA-seq数据分析中活跃的细胞程序 | 研究老年痴呆症小鼠模型中不同基因型的细胞类型及其状态 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | LDA | 基因表达数据 | 使用了两种5xFAD小鼠模型的脑单细胞和单核数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 272 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of the effects of the cuprotosis-associated gene SLC31A1 on patient prognosis and tumor microenvironment in human cancer
2024-Feb-29, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-1308
PMID:38482443
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研究论文 | 本研究分析了SLC31A1基因在多种癌症中的表达与预后及肿瘤微环境的关系 | 提出SLC31A1作为癌症能量代谢相关的潜在靶点，提供新的治疗方向 | 未详细探讨不同癌症中SLC31A1的具体功能机制 | 探索SLC31A1在癌症中的生物功能及其预后价值 | 分析SLC31A1在多种癌症中的表达、突变、甲基化及免疫细胞浸润等 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、RT-qPCR、WB | NA | 基因表达数据 | 涉及多种癌症组织的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 273 | 2024-08-04 |
The integration of bulk and single-cell sequencing data revealed the function of FKBP10 in the gastric cancer microenvironment
2024-Feb-29, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-1484
PMID:38482445
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研究论文 | 本研究揭示了FKBP10在胃癌微环境中的功能 | 整合了散装和单细胞测序数据，提供了FKBP10及其共表达基因在肿瘤微环境中的影响 | 未提及具体限制 | 研究FKBP10在胃癌微环境中的表达和功能 | 胃癌细胞及其微环境中的相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | qRT-PCR、单细胞和散装测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 274 | 2024-08-07 |
Identification of fatty acid oxidation-related subtypes by integrated analysis of bulk- and single-cell transcriptome profiling in colorectal cancer
2024-Feb-29, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-23-833
PMID:38482228
|
研究论文 | 本研究通过综合分析大量和单细胞转录组数据，识别了结直肠癌中与脂肪酸氧化（FAO）相关的亚型。 | 本研究首次揭示了结直肠癌患者中FAO水平的基因组模式，并构建了FAO相关基因评分（GFAO_Score），有助于精准筛选患者并优化临床策略。 | NA | 研究结直肠癌中脂肪酸氧化的分子生物化学特征及其相互作用机制。 | 结直肠癌患者的脂肪酸氧化水平及其相关基因。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数据来自TCGA和GEO数据库中的结直肠癌患者。 | NA | NA | NA | NA |
| 275 | 2024-08-07 |
Disulfidptosis-related genes of prognostic signature and immune infiltration features in hepatocellular carcinoma supported by bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-Feb-29, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-23-949
PMID:38482234
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌的癌症基因组图谱-肝细胞癌和基因表达综合数据库数据，识别与硫化物应激相关的关键基因，并探讨其在肝细胞癌预后和免疫浸润中的作用 | 首次探讨了硫化物应激相关基因在肝细胞癌中的预后价值和免疫治疗潜力 | NA | 研究硫化物应激相关基因在肝细胞癌中的预后和免疫治疗作用 | 肝细胞癌患者的基因表达数据和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | Cox回归分析 | 基因表达数据 | 使用了来自癌症基因组图谱-肝细胞癌和基因表达综合数据库的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 276 | 2024-08-07 |
Tumoral C2 Regulates the Tumor Microenvironment by Increasing the Ratio of M1/M2 Macrophages and Tertiary Lymphoid Structures to Improve Prognosis in Melanoma
2024-Feb-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16050908
PMID:38473271
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研究论文 | 本研究通过多维分析转录组数据，探讨了C2在黑色素瘤中的作用及其对肿瘤微环境的调节机制 | 首次发现C2水平的上调与黑色素瘤的良好预后相关，并能增强M1巨噬细胞的招募和极化 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，需要进一步的人体临床试验验证 | 探究C2在黑色素瘤中的作用及其对免疫治疗效果的影响 | C2在黑色素瘤中的表达及其对肿瘤微环境和免疫细胞的影响 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 转录组分析、免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了C57BL/6小鼠构建的皮下肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 277 | 2024-08-07 |
Identification of bZIP Transcription Factors That Regulate the Development of Leaf Epidermal Cells in Arabidopsis thaliana by Single-Cell RNA Sequencing
2024-Feb-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25052553
PMID:38473801
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究了拟南芥叶片表皮细胞的转录组特征，并鉴定了两个bZIP转录因子基因在调控表皮细胞发育中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了拟南芥叶片表皮细胞中bZIP转录因子的表达模式及其在细胞发育中的调控作用 | 研究仅限于3天龄的拟南芥真叶，未涵盖其他发育阶段的叶片 | 探究拟南芥叶片表皮细胞发育的转录调控机制 | 拟南芥叶片表皮细胞中的bZIP转录因子 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3天龄的拟南芥真叶中的表皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 278 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Expression of Immune-Related Genes in Macrophages of Diabetic Kidney Disease
2024-Feb, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-023-01906-2
PMID:37777674
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研究论文 | 本研究旨在识别糖尿病肾病中巨噬细胞的免疫相关基因 | 该研究首次揭示了糖尿病肾病巨噬细胞中免疫相关基因的表达，并确定了相关的标记基因 | 样本量相对较小，仅分析了三只糖尿病小鼠和三只对照小鼠 | 识别糖尿病肾病中的免疫相关基因，以探索其作为治疗靶点的潜力 | 糖尿病小鼠的肾小管细胞和对照小鼠的肾小管细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 总共分析了59个正常肾小管和66个糖尿病肾病样本 | NA | NA | NA | NA |
| 279 | 2024-08-07 |
NMI Functions as Immuno-regulatory Molecule in Sepsis by Regulating Multiple Signaling Pathways
2024-Feb, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-023-01893-4
PMID:37679586
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研究论文 | 本文探讨了NMI作为免疫调节分子在脓毒症中的作用，通过调节多种信号通路来影响炎症反应 | 首次揭示了NMI通过多种受体和信号通路在脓毒症中的作用机制 | NA | 研究NMI在脓毒症中的功能机制及其对炎症反应的影响 | NMI在脓毒症中的表达及其对免疫和炎症反应的调节作用 | NA | 脓毒症 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 来自GEO数据库的脓毒症患者的中性粒细胞和单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 280 | 2024-08-04 |
Stromal Signals Dominate Gene Expression Signature Scores That Aim to Describe Cancer Cell-intrinsic Stemness or Mesenchymality Characteristics
2024-02-23, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0383
PMID:38349551
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤微环境对EMT相关基因表达特征分数的影响 | 揭示了肿瘤样本中细胞成分主导EMT特征分数的现象 | 未能深入探讨非癌细胞的具体影响机制 | 验证非癌细胞在肿瘤特征评分中的主导作用 | 已发表的11个与EMT相关的基因表达特征 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序(RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 分析了多个肿瘤类型的样本 | NA | NA | NA | NA |