单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 444 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-07 |
Proteomic profiling of aqueous humor-derived exosomes in Vogt-Koyanagi-Harada disease and Behcet's uveitis
2024-02, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.109895
PMID:38185270
|
research paper | 本研究首次对来自Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体进行了无标记定量蛋白质组学分析，以确定其在疾病中的潜在作用 | 首次对房水来源的外泌体进行无标记定量蛋白质组学分析，并发现补体相关通路在这些疾病发病机制中的重要作用 | NA | 探究Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎中房水来源外泌体的蛋白质组学特征及其在疾病发病机制中的作用 | Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体 | NA | Vogt-Koyanagi-Harada病, Behcet氏葡萄膜炎 | 无标记定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | 84名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-08-07 |
[Single-cell transcriptome characterization of oral mucosal fibroblasts]
2024-Feb, Shanghai kou qiang yi xue = Shanghai journal of stomatology
PMID:38583017
|
研究论文 | 本研究通过整合口腔黏膜和皮肤组织的单细胞数据库，对成纤维细胞亚群进行了分类和功能分析 | 首次在单细胞水平上统一了口腔黏膜和皮肤组织成纤维细胞亚型的分类，并分析了它们在功能上的异同 | NA | 阐明正常口腔黏膜和皮肤组织中成纤维细胞亚型的组成和功能差异，为组织修复和再生领域的未来应用提供基础 | 口腔黏膜和皮肤组织的成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | UMAP | 转录组数据 | 四个单细胞数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2024-08-04 |
Molecular map of disulfidptosis-related genes in lung adenocarcinoma: the perspective toward immune microenvironment and prognosis
2024-02-11, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-024-01632-y
PMID:38342890
|
研究论文 | 本研究系统探讨了与二硫化物相关的基因在肺腺癌中的表达及其预后意义 | 提出了一种新的DRG标记风险评分，可以预测肺腺癌的免疫微环境和预后 | 未提及具体的样本量和实验方法的局限性 | 阐明与二硫化物相关基因在肺腺癌中的预后重要性 | 研究与肺腺癌相关的二硫化物相关基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | qRT-PCR、单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 244 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing identifies inflammation-promoting fibroblast-neutrophil interaction in peri-implantitis
2024-02, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13912
PMID:38088448
|
研究论文 | 本文揭示了通过单细胞测序技术获得的周围种植体炎症浸润的细胞组成和分子环境 | 该研究首次发现了在种植体炎症中促炎症成纤维细胞与中性粒细胞的相互作用 | 该研究可能未涵盖所有相关的细胞类型和潜在的分子机制 | 解释周围种植体炎与牙周炎之间的病理差异 | 周围种植体炎患者的组织与牙周炎患者及健康供体的牙周组织 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 组织样本 | 来自患有周围种植体炎和牙周炎的患者，以及健康供体的高通量样本 | NA | NA | NA | NA |
| 245 | 2024-08-07 |
Revisiting Multi-Omics Data to Unravel Galectins as Prognostic Factors in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2024-Feb-27, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12030529
PMID:38540141
|
研究论文 | 本研究重新审视多组学数据，以揭示半乳糖凝集素作为头颈鳞状细胞癌的预后因子 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了半乳糖凝集素在肿瘤微环境中的表达及其对预后的影响，并展示了其在预测HPV和突变状态、分层HNSCC预后和预测治疗反应中的三重功能 | 本研究强调需要进一步研究以评估半乳糖凝集素在HNSCC中的作用，并明确个体半乳糖凝集素在患者分层中的角色 | 评估半乳糖凝集素作为头颈鳞状细胞癌的预后生物标志物 | 头颈鳞状细胞癌中的半乳糖凝集素表达及其与HPV和突变状态的关系 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2024-08-04 |
A Keratin 12 Expression-Based Analysis of Stem-Precursor Cells and Differentiation in the Limbal-Corneal Epithelium Using Single-Cell RNA-Seq Data
2024-Feb-26, Biology
DOI:10.3390/biology13030145
PMID:38534415
|
研究论文 | 这篇文章分析了在单细胞RNA测序数据基础上，角膜上皮中的干前体细胞和分化过程，特别是角蛋白12（Krt12）的表达情况 | 本研究揭示了角膜上皮分化过程中Krt12表达变化的独特四个步骤，并提供了多种基因组群的识别 | 这篇文章未提及样本的多样性或外部验证的必要性 | 旨在探究角膜上皮中干前体细胞的特性及分化机制 | 研究对象为角膜上皮中的干前体细胞及其分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2024-08-07 |
Comprehensive Transcriptomic Profiling of Diverse Brain Tumor Types Uncovers Complex Structures of the Brain Tumor Microenvironment
2024-Feb-23, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12030506
PMID:38540119
|
研究论文 | 本研究分析了六种脑肿瘤类型（脑膜瘤、星形细胞瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤）的转录组结构，以揭示脑肿瘤微环境的复杂结构 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和免疫相关基因的无监督聚类，揭示了脑肿瘤微环境中免疫细胞类型的差异分布及其对治疗的反应 | NA | 提供克服脑肿瘤治疗脆弱性的潜在指导方针 | 脑肿瘤微环境的转录组结构 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 六种脑肿瘤类型的细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2024-08-04 |
SPINK1 Overexpression Correlates with Hepatocellular Carcinoma Treatment Resistance Revealed by Single Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics
2024-Feb-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14030265
PMID:38540686
|
研究论文 | 本研究揭示了SPINK1在肝细胞癌治疗抵抗中的作用 | 首次阐明了SPINK1在肝细胞癌化疗抵抗中的关键角色，并确定其作为潜在治疗靶点 | 对SPINK1影响的机制理解仍然有限，尚需进一步的研究 | 探究SPINK1对肝细胞癌化疗抵抗的影响 | 肝细胞癌患者的细胞和组织样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 来自两个肝细胞癌队列的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 249 | 2024-08-04 |
Ferroptosis-Related lncRNA to Predict the Clinical Outcomes and Molecular Characteristics of Kidney Renal Papillary Cell Carcinoma
2024-Feb-29, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46030123
PMID:38534739
|
研究论文 | 该研究构建了一种基于铁死亡相关的长非编码RNA风险评分模型，用于预测肾脏肾小管细胞癌的临床结果和分子特征 | 提出了一种新的肾脏肾小管细胞癌亚型，并开发了准确的预后模型 | 未提及具体的限制因素 | 研究肾脏肾小管细胞癌的预后与分子特征 | 肾脏肾小管细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾脏癌症 | 单细胞转录组学 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 基于TCGA-KIRP数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2024-08-04 |
Heterogeneous osteoimmune profiles via single-cell transcriptomics in osteoporotic patients who fail bisphosphonate treatment
2024-Feb-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316871121
PMID:38346184
|
研究论文 | 本文研究了在双膦酸盐治疗失败的骨质疏松患者中通过单细胞转录组学揭示异质的骨免疫特征 | 研究首次揭示了骨质疏松患者中免疫细胞的异质性及其与双膦酸盐治疗失败的相关性 | 样本量可能有限，未深入探讨其他可能影响结果的生物标志物 | 探讨骨质疏松症中的免疫细胞异质性及其在双膦酸盐治疗中的作用 | 选取不同骨质疏松症状态的绝经后女性，包括非骨质疏松、经过治疗改善的患者及治疗失败者 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞转录组数据 | 三组共涉及多名绝经后女性样本，具体样本量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 251 | 2024-08-04 |
Rabies virus-based barcoded neuroanatomy resolved by single-cell RNA and in situ sequencing
2024-Feb-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87866
PMID:38319699
|
研究论文 | 本文结合条形码狂犬病毒与单细胞和原位测序，探索小鼠大脑中的逆行标记和跨突触标记 | 本研究首次将条形码狂犬病毒与高通量的单细胞RNA测序和原位测序相结合，以实现神经元类型的广泛映射 | 目前条形码狂犬病毒的应用仅限于映射非神经元细胞的相互作用和培养神经元的突触连接 | 研究各种神经元类型的连接性，从而理解神经电路的结构和功能 | 小鼠大脑中的目标神经元及其突触连接 | 数字神经解剖学 | NA | RNA条形码测序 | NA | 转录组数据 | 对96个逆行标记细胞和295个跨突触标记细胞进行了单细胞RNA测序，对4130个逆行标记细胞和2914个跨突触标记细胞进行了原位测序 | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2024-08-07 |
Introducing single cell stereo-sequencing technology to transform the plant transcriptome landscape
2024-02, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2023.10.002
PMID:37914553
|
综述 | 本文综述了单细胞立体测序技术（Stereo-seq）在植物转录组学中的应用及其优势 | Stereo-seq技术结合了空间信息与单细胞转录组学，解决了传统单细胞RNA测序（scRNA-seq）无法提供高分辨率空间转录组信息的问题 | NA | 探讨Stereo-seq技术在植物研究中的应用，以推进我们对植物转录组学时代生物过程的理解 | 植物转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2024-08-04 |
Adipose tissue macrophage heterogeneity in the single-cell genomics era
2024-Feb, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2024.100031
PMID:38354858
|
研究论文 | 文章讨论了在单细胞基因组学时代脂肪组织巨噬细胞的异质性 | 提出了单细胞转录组技术能够揭示脂肪组织巨噬细胞的高度异质性 | 需要进一步研究以更好地理解ATMs和肥胖对其影响的复杂性 | 探讨肥胖及其引发的炎症如何影响脂肪组织巨噬细胞 | 主要研究脂肪组织巨噬细胞(ATMs)的异质性及其特征 | 数字病理 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组技术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 254 | 2024-08-04 |
Development of a novel lncRNA-derived immune gene score using machine learning-based ensembles for predicting the survival of HCC
2024-Feb-09, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05608-6
PMID:38334792
|
研究论文 | 本文开发了一种新型的lncRNA衍生免疫基因评分模型，用于预测肝细胞癌（HCC）患者的生存率 | 提出了一种基于机器学习的集成方法来建立lncRNA和免疫基因评分模型 | 研究中使用的单细胞测序数据可能无法完全代表患者体内的真实免疫环境 | 开发一个准确的预测模型以评估肝细胞癌患者的生存期 | 肝细胞癌患者的mRNA和lncRNA表达谱 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA和lncRNA表达数据 | 使用了来自TCGA、GEO和ICGC的数据集进行模型验证 | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2024-08-04 |
Identification and validation of Golgi apparatus-related signature for predicting prognosis and immunotherapy response in breast cancer
2024-Feb-01, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05612-w
PMID:38300336
|
研究论文 | 本研究旨在探讨高尔基体相关基因在乳腺癌预后和免疫治疗反应评估中的预测价值 | 识别并验证了一种由394个高尔基体相关基因组成的预后风险特征，可以有效区分乳腺癌患者的高风险和低风险组 | 未提及具体的研究局限性 | 研究乳腺癌中高尔基体相关基因的预测价值 | 乳腺癌患者的数据和样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | qPCR和单细胞测序 | Cox回归分析 | 转录组数据和临床数据 | 涉及394个与乳腺癌预后显著相关的高尔基体相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2024-08-07 |
A prognostic model based on Scissor+ cancer associated fibroblasts identified from bulk and single cell RNA sequencing data in head and neck squamous cell carcinoma
2024-02, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2023.110984
PMID:38029947
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出与头颈鳞状细胞癌（HNSCC）不良预后相关的成纤维细胞亚群，并构建了一个预测HNSCC患者生存概率的风险模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据，识别出与HNSCC不良预后相关的成纤维细胞亚群，并构建了预测模型 | 需要进一步的实验验证和临床试验来验证模型的准确性和实用性 | 识别与头颈鳞状细胞癌预后相关的成纤维细胞亚群，并构建预测模型 | 头颈鳞状细胞癌患者的成纤维细胞亚群及其预后相关基因 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 风险模型 | RNA测序数据 | 使用The Cancer Genome Atlas (TCGA)和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中的数据进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 257 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell transcriptomics with cellular phenotypes: cell morphology, Ca2+ imaging and electrophysiology
2024-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-023-01174-2
PMID:38495444
|
综述 | 本文回顾了单细胞转录组学与细胞表型结合的最新技术进展 | 提出了一系列新的方法将scRNAseq与生物物理测量结合，为转录组数据与细胞功能之间的联系提供了生理学见解 | 文章中未明确提及具体的技术限制或挑战 | 旨在探讨如何通过结合单细胞转录组学和细胞表型来理解细胞状态及其功能 | 研究对象包括细胞形态、钙信号和电生理学等细胞功能指标 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | 转录组数据与生物物理测量数据 | 强调在具有可兴奋细胞类型的组织中的应用，例如大脑、胰岛和视网膜，但具体样本数未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 258 | 2024-08-04 |
PI3K/mTOR is a therapeutically targetable genetic dependency in diffuse intrinsic pontine glioma
2024-Feb-06, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170329
PMID:38319732
|
研究论文 | 本文探讨了针对弥漫性内在脑干胶质瘤的治疗靶点和组合疗法的潜力 | 识别了PIK3CA和MTOR作为可靶向的分子依赖性，并提出了paxalisib与二甲双胍及标准放疗联合的临床相关治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，临床应用仍需进一步验证 | 开发有效的针对弥漫性中线胶质瘤的治疗策略 | 研究弥漫性内在脑干胶质瘤患者衍生模型及其针对性治疗效果 | 数字病理学 | NA | CRISPR/Cas9基因删除筛选，空间转录组学，ATAC-Seq | 正交肿瘤模型 | 分子数据 | 多种患者衍生和免疫相容性的异种移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2024-08-07 |
Temporal transcriptomic dynamics in developing macaque neocortex
2024-Feb-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90325
PMID:38415809
|
研究论文 | 研究描述了猕猴新皮质发育过程中的转录组动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术，构建了猕猴新皮质发育的转录组图谱，揭示了从干细胞到神经元的分化轨迹 | NA | 探究人类和非人灵长类新皮质神经发生中的转录调控 | 猕猴的顶叶新皮质在不同发育阶段的转录组变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 在E40、E50、E70、E80和E90五个时间点采集的猕猴顶叶样本 | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-08-04 |
The E3 ubiquitin ligase MARCH2 protects against myocardial ischemia-reperfusion injury through inhibiting pyroptosis via negative regulation of PGAM5/MAVS/NLRP3 axis
2024-Feb-27, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00622-3
PMID:38409220
|
研究论文 | 本研究揭示了E3泛素连接酶MARCH2通过负调控PGAM5/MAVS/NLRP3通路抑制心肌细胞焦亡，从而保护心脏免受缺血-再灌注损伤的机制 | 发现MARCH2通过促进PGAM5的K48连接聚泛素化和蛋白酶体降解，抑制心肌细胞中的NLRP3炎症小体激活 | 本研究未涉及在临床试验中的应用及长期效应 | 研究MARCH2在心肌缺血-再灌注损伤中的保护作用及其机制 | 人心脏和小鼠心脏中的MARCH2表达水平及其对心肌细胞的影响 | 心血管疾病 | 心肌缺血 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 人心脏和小鼠心脏的样本 | NA | NA | NA | NA |