单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 444 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-04 |
Preparation of High-Viability Single-Cell Suspensions from African Turquoise Killifish Brain Tissue
2024-02-01, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot107829
PMID:36931736
|
research paper | 本研究描述了如何从非洲蓝色杀鱼的脑组织中准备高活性的单细胞悬液 | 本研究创新性地提供了一种从新兴模型生物制备高活性单细胞悬液的协议 | 未提及该方法在其他物种或组织中的适用性 | 本研究的目的是为单细胞测序准备高活性的单细胞悬液 | 非洲蓝色杀鱼的脑组织 | NA | NA | 酶解与机械解离 | NA | NA | 研究成功用于非洲蓝色杀鱼的10× Genomics单细胞测序实验 | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-08-04 |
Sfrp1 inhibits lung fibroblast invasion during transition to injury-induced myofibroblasts
2024-Feb, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01326-2023
PMID:38212077
|
研究论文 | 本文研究了Sfrp1在肺纤维母细胞转变为损伤诱导的肌成纤维细胞过程中的抑制作用 | 首次揭示了Sfrp1在调节人类肺纤维母细胞对TGFβ1响应中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和特定患者组织样本，可能限制结果的普遍适用性 | 探讨肺纤维母细胞在损伤和修复过程中的命运变化 | 小鼠肺再生过程中的纤维母细胞及其转变 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、免疫染色 | NA | 组织样本 | 小鼠模型和特定的特发性肺纤维化患者组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of the retina shows that LDHA regulates pathogenesis of autoimmune uveitis
2024-02, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103160
PMID:38160538
|
研究论文 | 本文研究了LDHA在自身免疫性葡萄膜炎中对病理发生的调节作用 | 研究发现LDHA的抑制可以恢复炎症下T效应细胞和T调节细胞的不平衡，并揭示了其在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 | 未提及具体的临床数据或者长期观察结果 | 旨在揭示自身免疫性葡萄膜炎中视网膜损伤的细胞动态和致病机制 | 实验自身免疫性葡萄膜炎小鼠及葡萄膜炎患者外周血单核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 实验中使用了自身免疫性葡萄膜炎小鼠和人类患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 244 | 2024-08-05 |
The Characteristics of Macrophage Heterogeneity in Atherosclerotic Aortas
2024-02, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-023-10434-1
PMID:37713049
|
研究论文 | 本文研究了动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群的特征 | 通过单细胞RNA测序分析巨噬细胞亚群的不同表型和功能特性 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏大型临床样本的验证 | 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及其异质性 | 动脉粥样硬化中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 6个亚群（基于单细胞分析） | NA | NA | NA | NA |
| 245 | 2024-08-04 |
Distinct immune escape and microenvironment between RG-like and pri-OPC-like glioma revealed by single-cell RNA-seq analysis
2024-Feb, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-1017-7
PMID:37955814
|
research paper | 通过单细胞RNA-seq分析对26个胶质瘤进行分类，揭示了原始少突胶质细胞样（pri-OPC）和放射胶质细胞样（RG）的肿瘤之间的免疫逃逸和微环境的区别 | 首次揭示了pri-OPC样和RG样胶质瘤在免疫逃逸程序上的显著差异 | 样本数量较少，仅涉及26个胶质瘤，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨胶质瘤与神经发生和胶质发生之间的关系 | 26个胶质瘤样本，分类为pri-OPC样和RG样肿瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 26个胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2024-08-07 |
Tumor-derived exosomes induce initial activation by exosomal CD19 antigen but impair the function of CD19-specific CAR T-cells via TGF-β signaling
2024-Feb, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-1010-1
PMID:37870681
|
研究论文 | 研究肿瘤来源的外泌体（TEXs）对CD19特异性CAR T细胞功能的影响及其机制 | 首次揭示了淋巴瘤来源的外泌体通过TGF-β信号通路影响CAR T细胞的功能，并提出了一种新的治疗策略 | 研究主要集中在体外实验，需要进一步的临床试验验证 | 探讨肿瘤来源的外泌体对CAR T细胞功能的影响及其潜在机制 | CD19特异性CAR T细胞及肿瘤来源的外泌体 | 免疫学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自淋巴瘤患者的血浆外泌体及CAR T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals heterogeneity of histological subtypes between lepidic and acinar lung adenocarcinoma
2024-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1573
PMID:38318637
|
研究论文 | 本文探讨了早期肺腺癌不同组织学亚型之间的异质性。 | 提出了一种在单细胞水平上评估患者组织学亚型的新方法，揭示了肿瘤内皮细胞对免疫反应的抑制作用。 | 研究样本量较小，仅包含11名手术后患者，可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究早期肺腺癌不同组织学亚型的临床意义以及其在单细胞层面的异质性。 | 研究对象为11名病理确认的早期IA期肺腺癌患者。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和数字空间分析（DSP） | NA | 组织样本 | 11名早期IA期肺腺癌患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2024-08-07 |
Advanced patient-specific microglia cell models for pre-clinical studies in Alzheimer's disease
2024-Feb-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03037-3
PMID:38365833
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于Matrigel的三维单层培养和与神经胶质细胞共培养的单核细胞衍生的微胶质样细胞（MDMi）模型，用于阿尔茨海默病（AD）的临床前研究 | 本研究首次开发了一种生理相关且具有AD患者特异性的三维微胶质细胞模型，该模型能够更好地模拟人微胶质的形态和功能 | 本研究仅在体外模型中进行了实验，尚未在动物模型或临床试验中验证其有效性 | 开发一种新型的、生理相关的AD患者特异性微胶质细胞模型，以改进AD个性化药物开发策略 | 单核细胞衍生的微胶质样细胞（MDMi）及其在AD中的应用 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 3D细胞培养模型 | 细胞 | 十六名AD患者及匹配的健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 249 | 2024-08-04 |
Integration of scRNA and bulk RNA-sequence to construct the 5-gene molecular prognostic model based on the heterogeneity of thyroid carcinoma endothelial cell
2024-02-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2023254
PMID:38186223
|
研究论文 | 本研究构建了基于甲状腺癌内皮细胞异质性的5基因分子预后模型 | 揭示内皮细胞与乳头状甲状腺癌进展的强关联，并筛选出5个关键基因 | 对于肿瘤微环境中的细胞关注较少，可能影响研究的全面性 | 探索甲状腺癌的分子预后过程及其内皮细胞的作用 | 甲状腺癌的内皮细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2024-08-07 |
Proteomic profiling of aqueous humor-derived exosomes in Vogt-Koyanagi-Harada disease and Behcet's uveitis
2024-02, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.109895
PMID:38185270
|
research paper | 本研究首次对来自Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体进行了无标记定量蛋白质组学分析，以确定其在疾病中的潜在作用 | 首次对房水来源的外泌体进行无标记定量蛋白质组学分析，并发现补体相关通路在这些疾病发病机制中的重要作用 | NA | 探究Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎中房水来源外泌体的蛋白质组学特征及其在疾病发病机制中的作用 | Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体 | NA | Vogt-Koyanagi-Harada病, Behcet氏葡萄膜炎 | 无标记定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | 84名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 251 | 2024-08-07 |
[Single-cell transcriptome characterization of oral mucosal fibroblasts]
2024-Feb, Shanghai kou qiang yi xue = Shanghai journal of stomatology
PMID:38583017
|
研究论文 | 本研究通过整合口腔黏膜和皮肤组织的单细胞数据库，对成纤维细胞亚群进行了分类和功能分析 | 首次在单细胞水平上统一了口腔黏膜和皮肤组织成纤维细胞亚型的分类，并分析了它们在功能上的异同 | NA | 阐明正常口腔黏膜和皮肤组织中成纤维细胞亚型的组成和功能差异，为组织修复和再生领域的未来应用提供基础 | 口腔黏膜和皮肤组织的成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | UMAP | 转录组数据 | 四个单细胞数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2024-08-04 |
Molecular map of disulfidptosis-related genes in lung adenocarcinoma: the perspective toward immune microenvironment and prognosis
2024-02-11, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-024-01632-y
PMID:38342890
|
研究论文 | 本研究系统探讨了与二硫化物相关的基因在肺腺癌中的表达及其预后意义 | 提出了一种新的DRG标记风险评分，可以预测肺腺癌的免疫微环境和预后 | 未提及具体的样本量和实验方法的局限性 | 阐明与二硫化物相关基因在肺腺癌中的预后重要性 | 研究与肺腺癌相关的二硫化物相关基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | qRT-PCR、单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing identifies inflammation-promoting fibroblast-neutrophil interaction in peri-implantitis
2024-02, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13912
PMID:38088448
|
研究论文 | 本文揭示了通过单细胞测序技术获得的周围种植体炎症浸润的细胞组成和分子环境 | 该研究首次发现了在种植体炎症中促炎症成纤维细胞与中性粒细胞的相互作用 | 该研究可能未涵盖所有相关的细胞类型和潜在的分子机制 | 解释周围种植体炎与牙周炎之间的病理差异 | 周围种植体炎患者的组织与牙周炎患者及健康供体的牙周组织 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 组织样本 | 来自患有周围种植体炎和牙周炎的患者，以及健康供体的高通量样本 | NA | NA | NA | NA |
| 254 | 2024-08-07 |
Revisiting Multi-Omics Data to Unravel Galectins as Prognostic Factors in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2024-Feb-27, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12030529
PMID:38540141
|
研究论文 | 本研究重新审视多组学数据，以揭示半乳糖凝集素作为头颈鳞状细胞癌的预后因子 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了半乳糖凝集素在肿瘤微环境中的表达及其对预后的影响，并展示了其在预测HPV和突变状态、分层HNSCC预后和预测治疗反应中的三重功能 | 本研究强调需要进一步研究以评估半乳糖凝集素在HNSCC中的作用，并明确个体半乳糖凝集素在患者分层中的角色 | 评估半乳糖凝集素作为头颈鳞状细胞癌的预后生物标志物 | 头颈鳞状细胞癌中的半乳糖凝集素表达及其与HPV和突变状态的关系 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2024-08-04 |
A Keratin 12 Expression-Based Analysis of Stem-Precursor Cells and Differentiation in the Limbal-Corneal Epithelium Using Single-Cell RNA-Seq Data
2024-Feb-26, Biology
DOI:10.3390/biology13030145
PMID:38534415
|
研究论文 | 这篇文章分析了在单细胞RNA测序数据基础上，角膜上皮中的干前体细胞和分化过程，特别是角蛋白12（Krt12）的表达情况 | 本研究揭示了角膜上皮分化过程中Krt12表达变化的独特四个步骤，并提供了多种基因组群的识别 | 这篇文章未提及样本的多样性或外部验证的必要性 | 旨在探究角膜上皮中干前体细胞的特性及分化机制 | 研究对象为角膜上皮中的干前体细胞及其分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2024-08-07 |
Comprehensive Transcriptomic Profiling of Diverse Brain Tumor Types Uncovers Complex Structures of the Brain Tumor Microenvironment
2024-Feb-23, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12030506
PMID:38540119
|
研究论文 | 本研究分析了六种脑肿瘤类型（脑膜瘤、星形细胞瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤）的转录组结构，以揭示脑肿瘤微环境的复杂结构 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和免疫相关基因的无监督聚类，揭示了脑肿瘤微环境中免疫细胞类型的差异分布及其对治疗的反应 | NA | 提供克服脑肿瘤治疗脆弱性的潜在指导方针 | 脑肿瘤微环境的转录组结构 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 六种脑肿瘤类型的细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 257 | 2024-08-04 |
Ferroptosis-Related lncRNA to Predict the Clinical Outcomes and Molecular Characteristics of Kidney Renal Papillary Cell Carcinoma
2024-Feb-29, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46030123
PMID:38534739
|
研究论文 | 该研究构建了一种基于铁死亡相关的长非编码RNA风险评分模型，用于预测肾脏肾小管细胞癌的临床结果和分子特征 | 提出了一种新的肾脏肾小管细胞癌亚型，并开发了准确的预后模型 | 未提及具体的限制因素 | 研究肾脏肾小管细胞癌的预后与分子特征 | 肾脏肾小管细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾脏癌症 | 单细胞转录组学 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 基于TCGA-KIRP数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 258 | 2024-08-04 |
Heterogeneous osteoimmune profiles via single-cell transcriptomics in osteoporotic patients who fail bisphosphonate treatment
2024-Feb-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316871121
PMID:38346184
|
研究论文 | 本文研究了在双膦酸盐治疗失败的骨质疏松患者中通过单细胞转录组学揭示异质的骨免疫特征 | 研究首次揭示了骨质疏松患者中免疫细胞的异质性及其与双膦酸盐治疗失败的相关性 | 样本量可能有限，未深入探讨其他可能影响结果的生物标志物 | 探讨骨质疏松症中的免疫细胞异质性及其在双膦酸盐治疗中的作用 | 选取不同骨质疏松症状态的绝经后女性，包括非骨质疏松、经过治疗改善的患者及治疗失败者 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞转录组数据 | 三组共涉及多名绝经后女性样本，具体样本量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2024-08-04 |
Rabies virus-based barcoded neuroanatomy resolved by single-cell RNA and in situ sequencing
2024-Feb-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87866
PMID:38319699
|
研究论文 | 本文结合条形码狂犬病毒与单细胞和原位测序，探索小鼠大脑中的逆行标记和跨突触标记 | 本研究首次将条形码狂犬病毒与高通量的单细胞RNA测序和原位测序相结合，以实现神经元类型的广泛映射 | 目前条形码狂犬病毒的应用仅限于映射非神经元细胞的相互作用和培养神经元的突触连接 | 研究各种神经元类型的连接性，从而理解神经电路的结构和功能 | 小鼠大脑中的目标神经元及其突触连接 | 数字神经解剖学 | NA | RNA条形码测序 | NA | 转录组数据 | 对96个逆行标记细胞和295个跨突触标记细胞进行了单细胞RNA测序，对4130个逆行标记细胞和2914个跨突触标记细胞进行了原位测序 | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-08-07 |
Introducing single cell stereo-sequencing technology to transform the plant transcriptome landscape
2024-02, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2023.10.002
PMID:37914553
|
综述 | 本文综述了单细胞立体测序技术（Stereo-seq）在植物转录组学中的应用及其优势 | Stereo-seq技术结合了空间信息与单细胞转录组学，解决了传统单细胞RNA测序（scRNA-seq）无法提供高分辨率空间转录组信息的问题 | NA | 探讨Stereo-seq技术在植物研究中的应用，以推进我们对植物转录组学时代生物过程的理解 | 植物转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |