单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals variations in monocytes and Tregs between gout flare and remission
2024-Feb-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179067
PMID:38329132
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 222 | 2024-08-04 |
Heterogeneous osteoimmune profiles via single-cell transcriptomics in osteoporotic patients who fail bisphosphonate treatment
2024-Feb-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316871121
PMID:38346184
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研究论文 | 本文研究了在双膦酸盐治疗失败的骨质疏松患者中通过单细胞转录组学揭示异质的骨免疫特征 | 研究首次揭示了骨质疏松患者中免疫细胞的异质性及其与双膦酸盐治疗失败的相关性 | 样本量可能有限，未深入探讨其他可能影响结果的生物标志物 | 探讨骨质疏松症中的免疫细胞异质性及其在双膦酸盐治疗中的作用 | 选取不同骨质疏松症状态的绝经后女性，包括非骨质疏松、经过治疗改善的患者及治疗失败者 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞转录组数据 | 三组共涉及多名绝经后女性样本，具体样本量未详细说明 |
| 223 | 2024-08-04 |
Rabies virus-based barcoded neuroanatomy resolved by single-cell RNA and in situ sequencing
2024-Feb-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87866
PMID:38319699
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研究论文 | 本文结合条形码狂犬病毒与单细胞和原位测序，探索小鼠大脑中的逆行标记和跨突触标记 | 本研究首次将条形码狂犬病毒与高通量的单细胞RNA测序和原位测序相结合，以实现神经元类型的广泛映射 | 目前条形码狂犬病毒的应用仅限于映射非神经元细胞的相互作用和培养神经元的突触连接 | 研究各种神经元类型的连接性，从而理解神经电路的结构和功能 | 小鼠大脑中的目标神经元及其突触连接 | 数字神经解剖学 | NA | RNA条形码测序 | NA | 转录组数据 | 对96个逆行标记细胞和295个跨突触标记细胞进行了单细胞RNA测序，对4130个逆行标记细胞和2914个跨突触标记细胞进行了原位测序 |
| 224 | 2024-08-07 |
Introducing single cell stereo-sequencing technology to transform the plant transcriptome landscape
2024-02, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2023.10.002
PMID:37914553
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综述 | 本文综述了单细胞立体测序技术（Stereo-seq）在植物转录组学中的应用及其优势 | Stereo-seq技术结合了空间信息与单细胞转录组学，解决了传统单细胞RNA测序（scRNA-seq）无法提供高分辨率空间转录组信息的问题 | NA | 探讨Stereo-seq技术在植物研究中的应用，以推进我们对植物转录组学时代生物过程的理解 | 植物转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 225 | 2024-08-04 |
Adipose tissue macrophage heterogeneity in the single-cell genomics era
2024-Feb, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2024.100031
PMID:38354858
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研究论文 | 文章讨论了在单细胞基因组学时代脂肪组织巨噬细胞的异质性 | 提出了单细胞转录组技术能够揭示脂肪组织巨噬细胞的高度异质性 | 需要进一步研究以更好地理解ATMs和肥胖对其影响的复杂性 | 探讨肥胖及其引发的炎症如何影响脂肪组织巨噬细胞 | 主要研究脂肪组织巨噬细胞(ATMs)的异质性及其特征 | 数字病理 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 226 | 2024-08-07 |
A novel EIF3C-related CD8+ T-cell signature in predicting prognosis and immunotherapy response of nasopharyngeal carcinoma
2024-Feb-24, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05552-x
PMID:38400862
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研究论文 | 本研究探讨了EIF3C在鼻咽癌肿瘤免疫微环境中的作用，并构建了一个新的EIF3C相关CD8+ T细胞签名（ETS）模型，用于预测鼻咽癌的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次构建了EIF3C相关CD8+ T细胞签名模型，用于预测鼻咽癌的预后和免疫治疗反应 | NA | 探索EIF3C在鼻咽癌肿瘤免疫微环境中的作用，并开发新的生物标志物以准确预测免疫治疗效果 | EIF3C在鼻咽癌中的表达及其对CD8+ T细胞浸润的影响 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | scRNA-seq | lasso算法 | RNA序列 | NA |
| 227 | 2024-08-04 |
Development of a novel lncRNA-derived immune gene score using machine learning-based ensembles for predicting the survival of HCC
2024-Feb-09, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05608-6
PMID:38334792
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研究论文 | 本文开发了一种新型的lncRNA衍生免疫基因评分模型，用于预测肝细胞癌（HCC）患者的生存率 | 提出了一种基于机器学习的集成方法来建立lncRNA和免疫基因评分模型 | 研究中使用的单细胞测序数据可能无法完全代表患者体内的真实免疫环境 | 开发一个准确的预测模型以评估肝细胞癌患者的生存期 | 肝细胞癌患者的mRNA和lncRNA表达谱 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA和lncRNA表达数据 | 使用了来自TCGA、GEO和ICGC的数据集进行模型验证 |
| 228 | 2024-08-04 |
Identification and validation of Golgi apparatus-related signature for predicting prognosis and immunotherapy response in breast cancer
2024-Feb-01, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05612-w
PMID:38300336
|
研究论文 | 本研究旨在探讨高尔基体相关基因在乳腺癌预后和免疫治疗反应评估中的预测价值 | 识别并验证了一种由394个高尔基体相关基因组成的预后风险特征，可以有效区分乳腺癌患者的高风险和低风险组 | 未提及具体的研究局限性 | 研究乳腺癌中高尔基体相关基因的预测价值 | 乳腺癌患者的数据和样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | qPCR和单细胞测序 | Cox回归分析 | 转录组数据和临床数据 | 涉及394个与乳腺癌预后显著相关的高尔基体相关基因 |
| 229 | 2024-08-07 |
A prognostic model based on Scissor+ cancer associated fibroblasts identified from bulk and single cell RNA sequencing data in head and neck squamous cell carcinoma
2024-02, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2023.110984
PMID:38029947
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出与头颈鳞状细胞癌（HNSCC）不良预后相关的成纤维细胞亚群，并构建了一个预测HNSCC患者生存概率的风险模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据，识别出与HNSCC不良预后相关的成纤维细胞亚群，并构建了预测模型 | 需要进一步的实验验证和临床试验来验证模型的准确性和实用性 | 识别与头颈鳞状细胞癌预后相关的成纤维细胞亚群，并构建预测模型 | 头颈鳞状细胞癌患者的成纤维细胞亚群及其预后相关基因 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 风险模型 | RNA测序数据 | 使用The Cancer Genome Atlas (TCGA)和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中的数据进行验证 |
| 230 | 2024-08-04 |
Human uterine natural killer cells regulate differentiation of extravillous trophoblast early in pregnancy
2024-02-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.12.013
PMID:38237587
|
研究论文 | 本文探讨了人类子宫自然杀伤细胞如何调控早期妊娠中滋养层细胞的分化 | 通过单细胞转录组学及体外模型，识别了促进滋养层细胞分化的uNK细胞来源的细胞因子信号 | NA | 研究uNK细胞在滋养层细胞侵入子宫环境中的作用及其对妊娠结果的影响 | 人类子宫自然杀伤细胞和滋养层细胞的相互作用 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞转录组学 | 器官样本模型 | 组织样本 | 使用滋养层细胞类器官和原代组织样本 |
| 231 | 2024-08-07 |
A time- and single-cell-resolved model of murine bone marrow hematopoiesis
2024-02-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.12.001
PMID:38183977
|
研究论文 | 本文通过结合持续标记与时间序列单细胞RNA测序，构建了一个实时定量的体内组织动态模型，用于小鼠骨髓造血作用 | 本文通过结合单细胞表达模式与分化和生长速度的动态变化，揭示了不同谱系间自我更新和分化特性的广泛变化 | NA | 构建一个实时定量的体内组织动态模型，以理解小鼠骨髓造血作用 | 小鼠骨髓造血作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 232 | 2024-08-07 |
Integrative analysis of neuroblastoma by single-cell RNA sequencing identifies the NECTIN2-TIGIT axis as a target for immunotherapy
2024-02-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.12.008
PMID:38181797
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析神经母细胞瘤中的免疫调节相互作用，识别出NECTIN2-TIGIT轴作为免疫治疗的新靶点 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了神经母细胞瘤中的免疫调节网络，并确定了NECTIN2-TIGIT轴作为关键的免疫检查点 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术，识别和优化神经母细胞瘤的免疫治疗策略 | 高风险神经母细胞瘤患者及其肿瘤中的免疫细胞 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 24个肿瘤样本（包括10个化疗前和14个化疗后，其中有5对匹配样本） |
| 233 | 2024-08-07 |
Leukaemia exposure alters the transcriptional profile and function of BCR::ABL1 negative macrophages in the bone marrow niche
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45471-0
PMID:38316788
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研究论文 | 研究慢性髓系白血病（CML）对骨髓微环境中BCR::ABL1阴性巨噬细胞转录组和功能的影响 | 揭示了CML骨髓微环境中存在的独特亚群未成熟巨噬细胞，并发现CML暴露的巨噬细胞通过减少表面标记CD36的表达，显著降低了凋亡细胞的清除能力 | NA | 探讨CML对骨髓微环境中旁观巨噬细胞的影响 | CML小鼠模型和人类骨髓来源的巨噬细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 234 | 2024-08-07 |
A comprehensive database of exosome molecular biomarkers and disease-gene associations
2024-Feb-15, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03015-7
PMID:38360815
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研究论文 | 开发了一个综合数据库ExMdb，包含外泌体核酸生物标志物与疾病-基因关联信息 | 首次系统地整合了外泌体核酸生物标志物与疾病-基因关联的数据，并提供了大量的高通量数据支持 | NA | 探索复杂疾病的调控机制并促进诊断和治疗生物标志物的开发 | 外泌体核酸生物标志物及其与疾病基因的关联 | NA | NA | RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据集 | 4,586个实验支持的基因-疾病关联，13,768个诊断和治疗生物标志物，312,049个核酸亚细胞定位，164个高通量数据集 |
| 235 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell transcriptomics with cellular phenotypes: cell morphology, Ca2+ imaging and electrophysiology
2024-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-023-01174-2
PMID:38495444
|
综述 | 本文回顾了单细胞转录组学与细胞表型结合的最新技术进展 | 提出了一系列新的方法将scRNAseq与生物物理测量结合，为转录组数据与细胞功能之间的联系提供了生理学见解 | 文章中未明确提及具体的技术限制或挑战 | 旨在探讨如何通过结合单细胞转录组学和细胞表型来理解细胞状态及其功能 | 研究对象包括细胞形态、钙信号和电生理学等细胞功能指标 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | 转录组数据与生物物理测量数据 | 强调在具有可兴奋细胞类型的组织中的应用，例如大脑、胰岛和视网膜，但具体样本数未说明 |
| 236 | 2024-08-04 |
Defining the T cell transcriptional landscape in pediatric liver transplant rejection at single cell resolution
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582173
PMID:38464256
|
研究论文 | 本文探讨了小儿肝脏移植排斥反应中的T细胞转录谱，以单细胞分辨率定义其特征 | 使用单细胞测序和免疫谱系分析揭示了CD8+ T细胞的特异性和基因表达特征，以及在排斥反应中的持续活性 | 本研究的样本量较小，仅包括14名患者，可能限制了结果的广泛适用性 | 研究小儿肝脏移植在急性细胞排斥中的T细胞反应及其转录特征 | 14名小儿肝脏移植患者的肝活检样本 | 免疫学 | 肝脏移植排斥反应 | 单细胞测序和免疫谱系分析 | CD8+ T细胞克隆类型分析 | 生物样本（肝活检） | 14名患者的30个冷冻保存的肝活检样本 |
| 237 | 2024-08-07 |
Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582629
PMID:38464041
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研究论文 | 本文研究了胰岛素信号通路如何通过调节R2逆转录转座子的表达，来维持代际间核糖体DNA（rDNA）拷贝数的稳定 | 首次揭示了胰岛素受体（InR）作为R2表达的主要抑制因子，并通过单细胞RNA测序发现InR表达与rDNA拷贝数的关系 | NA | 探讨胰岛素信号通路在维持rDNA拷贝数稳定中的作用及其机制 | 胰岛素信号通路、R2逆转录转座子、核糖体DNA拷贝数 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 238 | 2024-08-04 |
PI3K/mTOR is a therapeutically targetable genetic dependency in diffuse intrinsic pontine glioma
2024-Feb-06, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170329
PMID:38319732
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研究论文 | 本文探讨了针对弥漫性内在脑干胶质瘤的治疗靶点和组合疗法的潜力 | 识别了PIK3CA和MTOR作为可靶向的分子依赖性，并提出了paxalisib与二甲双胍及标准放疗联合的临床相关治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，临床应用仍需进一步验证 | 开发有效的针对弥漫性中线胶质瘤的治疗策略 | 研究弥漫性内在脑干胶质瘤患者衍生模型及其针对性治疗效果 | 数字病理学 | NA | CRISPR/Cas9基因删除筛选，空间转录组学，ATAC-Seq | 正交肿瘤模型 | 分子数据 | 多种患者衍生和免疫相容性的异种移植模型 |
| 239 | 2024-08-07 |
Temporal transcriptomic dynamics in developing macaque neocortex
2024-Feb-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90325
PMID:38415809
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研究论文 | 研究描述了猕猴新皮质发育过程中的转录组动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术，构建了猕猴新皮质发育的转录组图谱，揭示了从干细胞到神经元的分化轨迹 | NA | 探究人类和非人灵长类新皮质神经发生中的转录调控 | 猕猴的顶叶新皮质在不同发育阶段的转录组变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 在E40、E50、E70、E80和E90五个时间点采集的猕猴顶叶样本 |
| 240 | 2024-08-04 |
The E3 ubiquitin ligase MARCH2 protects against myocardial ischemia-reperfusion injury through inhibiting pyroptosis via negative regulation of PGAM5/MAVS/NLRP3 axis
2024-Feb-27, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00622-3
PMID:38409220
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研究论文 | 本研究揭示了E3泛素连接酶MARCH2通过负调控PGAM5/MAVS/NLRP3通路抑制心肌细胞焦亡，从而保护心脏免受缺血-再灌注损伤的机制 | 发现MARCH2通过促进PGAM5的K48连接聚泛素化和蛋白酶体降解，抑制心肌细胞中的NLRP3炎症小体激活 | 本研究未涉及在临床试验中的应用及长期效应 | 研究MARCH2在心肌缺血-再灌注损伤中的保护作用及其机制 | 人心脏和小鼠心脏中的MARCH2表达水平及其对心肌细胞的影响 | 心血管疾病 | 心肌缺血 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 人心脏和小鼠心脏的样本 |