单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202402-202402] [清除筛选条件]
当前共找到 444 篇文献,本页显示第 221 - 240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
221 2024-08-04
From patient tissue correlates to molecular mechanisms of cancer immune evasion: the emerging role of CD58 and PD-L1 co-regulation via CMTM6
2024-02, Genes and immunity IF:5.0Q2
研究论文 本文探讨了CD58和PD-L1的共同调节在癌症免疫逃逸中的作用 揭示了CD58损失导致免疫逃逸的机制,并发现CMTM6在CD58和PD-L1的双重调节中的关键作用 仅在黑色素瘤患者样本中进行研究,可能不适用于所有类型癌症 研究癌细胞内在的免疫逃逸机制 黑色素瘤患者的组织样本和衍生的共同培养模型 数字病理学 黑色素瘤 单细胞转录组分析 共同培养模型 组织样本 患者样本与肿瘤浸润性淋巴细胞的联合样本 NA NA NA NA
222 2024-08-05
Cross-Omic Transcription Factor Analysis: An Insight on Transcription Factor Accessibility and Expression Correlation
2024-02-21, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本文探讨了不同功能基因组区域内转录因子的表达与模体信息之间的相关性 提出了对基因活动矩阵(GAM)和基因组注释基因活动矩阵(GAGAM)贡献的元分析,并探讨了转录因子的动态 对可及区域如何影响基因表达的概念缺乏明确的定义 研究转录因子表达与转录因子在不同细胞类型中的动态如何相关 不同功能基因组区域内的转录因子 数字病理学 NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 NA 基因组数据 NA NA NA NA NA
223 2024-08-05
An integrated single-cell RNA-seq atlas of the mouse hypothalamic paraventricular nucleus links transcriptomic and functional types
2024-02, Journal of neuroendocrinology IF:3.3Q2
研究论文 本研究构建了小鼠下丘脑旁核的转录组细胞类型详细图谱 整合了多个PVN单细胞数据集,并进行功能性表征,首次提供了不同神经内分泌亚型的详细分类 目前的分子分类仍不够充分,未来需要更多的数据来完善分类 旨在详细描述小鼠下丘脑旁核的转录组细胞类型及其功能 研究对象为小鼠下丘脑旁核的神经细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 整合多个小鼠下丘脑旁核单细胞数据集,具体样本数量未明 NA NA NA NA
224 2024-08-04
Resolving cellular dynamics using single-cell temporal transcriptomics
2024-02, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1
综述 本文讨论了通过单细胞时间转录组学解决细胞动态的方法 介绍了非破坏性活细胞转录组学方法,并探讨了其与计算模型的互补性质 未具体提及研究的限制 加深对细胞动态及其在发育过程和疾病进展中作用的理解 单细胞转录组学及其在细胞状态动态重建中的应用 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 计算模型 转录组数据 NA NA NA NA NA
225 2024-08-05
Computing Minimal Boolean Models of Gene Regulatory Networks
2024-02, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology IF:1.4Q2
研究论文 文章提出了一种算法,用于优化基因调控网络的数据拟合和噪声消除。 提出了一种新的方法,将实验数据整合并通过优化线性目标函数在约束下寻找最佳一致结构。 对于基因调控的复杂性和实验技术的局限性,所需的逻辑规则未经预先确认。 开发一种算法,以最佳方式找到适合数据的基因调控网络。 对基因调控网络模型的构建与优化进行研究。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) 布尔网络 模拟数据和公开的scRNA-Seq数据集 NA NA NA NA NA
226 2024-08-04
Accurate single-molecule spot detection for image-based spatial transcriptomics with weakly supervised deep learning
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出Polaris,一个用于图像基础空间转录组分析的分析管道 结合深度学习模型进行细胞分割和点检测,以及概率基因解码器以准确量化单细胞基因表达 NA 开发一个无缝的解决方案用于分析空间转录组数据 图像基础空间转录组数据 数字病理学 NA 深度学习 NA 图像 NA NA NA NA NA
227 2024-08-05
Immunoregulatory and neutrophil-like monocyte subsets with distinct single-cell transcriptomic signatures emerge following brain injury
2024-Feb-03, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究揭示了脑损伤后单核细胞亚群的免疫调节特性及其单细胞转录组特征 首次表明创伤导致特定CD115/Ly6C单核细胞群体的释放,并与神经保护相关 研究主要在小鼠模型中进行,临床应用需要进一步验证 探索脑损伤后单核细胞的免疫反应和潜在的神经保护机制 小鼠模型中观察到的单核细胞亚群及其转录组特征 数字病理 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型中观察的单核细胞数目未具体说明 NA NA NA NA
228 2024-08-04
Preparation of High-Viability Single-Cell Suspensions from African Turquoise Killifish Brain Tissue
2024-02-01, Cold Spring Harbor protocols
research paper 本研究描述了如何从非洲蓝色杀鱼的脑组织中准备高活性的单细胞悬液 本研究创新性地提供了一种从新兴模型生物制备高活性单细胞悬液的协议 未提及该方法在其他物种或组织中的适用性 本研究的目的是为单细胞测序准备高活性的单细胞悬液 非洲蓝色杀鱼的脑组织 NA NA 酶解与机械解离 NA NA 研究成功用于非洲蓝色杀鱼的10× Genomics单细胞测序实验 NA NA NA NA
229 2024-08-04
Sfrp1 inhibits lung fibroblast invasion during transition to injury-induced myofibroblasts
2024-Feb, The European respiratory journal
研究论文 本文研究了Sfrp1在肺纤维母细胞转变为损伤诱导的肌成纤维细胞过程中的抑制作用 首次揭示了Sfrp1在调节人类肺纤维母细胞对TGFβ1响应中的作用 研究主要基于小鼠模型和特定患者组织样本,可能限制结果的普遍适用性 探讨肺纤维母细胞在损伤和修复过程中的命运变化 小鼠肺再生过程中的纤维母细胞及其转变 数字病理学 肺纤维化 空间转录组学、单细胞RNA测序、免疫染色 NA 组织样本 小鼠模型和特定的特发性肺纤维化患者组织样本 NA NA NA NA
230 2024-08-04
Single-cell sequencing of the retina shows that LDHA regulates pathogenesis of autoimmune uveitis
2024-02, Journal of autoimmunity IF:7.9Q1
研究论文 本文研究了LDHA在自身免疫性葡萄膜炎中对病理发生的调节作用 研究发现LDHA的抑制可以恢复炎症下T效应细胞和T调节细胞的不平衡,并揭示了其在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 未提及具体的临床数据或者长期观察结果 旨在揭示自身免疫性葡萄膜炎中视网膜损伤的细胞动态和致病机制 实验自身免疫性葡萄膜炎小鼠及葡萄膜炎患者外周血单核细胞 数字病理学 自身免疫性葡萄膜炎 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 实验中使用了自身免疫性葡萄膜炎小鼠和人类患者的样本 NA NA NA NA
231 2024-08-05
The Characteristics of Macrophage Heterogeneity in Atherosclerotic Aortas
2024-02, Journal of cardiovascular translational research IF:2.4Q3
研究论文 本文研究了动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群的特征 通过单细胞RNA测序分析巨噬细胞亚群的不同表型和功能特性 研究主要基于单细胞RNA测序数据,缺乏大型临床样本的验证 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及其异质性 动脉粥样硬化中的巨噬细胞亚群 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA NA 6个亚群(基于单细胞分析) NA NA NA NA
232 2024-08-04
Distinct immune escape and microenvironment between RG-like and pri-OPC-like glioma revealed by single-cell RNA-seq analysis
2024-Feb, Frontiers of medicine IF:3.9Q2
research paper 通过单细胞RNA-seq分析对26个胶质瘤进行分类,揭示了原始少突胶质细胞样(pri-OPC)和放射胶质细胞样(RG)的肿瘤之间的免疫逃逸和微环境的区别 首次揭示了pri-OPC样和RG样胶质瘤在免疫逃逸程序上的显著差异 样本数量较少,仅涉及26个胶质瘤,可能影响结果的广泛适用性 探讨胶质瘤与神经发生和胶质发生之间的关系 26个胶质瘤样本,分类为pri-OPC样和RG样肿瘤 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA-seq NA RNA-seq数据 26个胶质瘤样本 NA NA NA NA
233 2024-08-07
Tumor-derived exosomes induce initial activation by exosomal CD19 antigen but impair the function of CD19-specific CAR T-cells via TGF-β signaling
2024-Feb, Frontiers of medicine IF:3.9Q2
研究论文 研究肿瘤来源的外泌体(TEXs)对CD19特异性CAR T细胞功能的影响及其机制 首次揭示了淋巴瘤来源的外泌体通过TGF-β信号通路影响CAR T细胞的功能,并提出了一种新的治疗策略 研究主要集中在体外实验,需要进一步的临床试验验证 探讨肿瘤来源的外泌体对CAR T细胞功能的影响及其潜在机制 CD19特异性CAR T细胞及肿瘤来源的外泌体 免疫学 淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 来自淋巴瘤患者的血浆外泌体及CAR T细胞 NA NA NA NA
234 2024-08-04
Spatial transcriptomics reveals heterogeneity of histological subtypes between lepidic and acinar lung adenocarcinoma
2024-02, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本文探讨了早期肺腺癌不同组织学亚型之间的异质性。 提出了一种在单细胞水平上评估患者组织学亚型的新方法,揭示了肿瘤内皮细胞对免疫反应的抑制作用。 研究样本量较小,仅包含11名手术后患者,可能限制了结果的普遍适用性。 研究早期肺腺癌不同组织学亚型的临床意义以及其在单细胞层面的异质性。 研究对象为11名病理确认的早期IA期肺腺癌患者。 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和数字空间分析(DSP) NA 组织样本 11名早期IA期肺腺癌患者的样本 NA NA NA NA
235 2024-08-07
Advanced patient-specific microglia cell models for pre-clinical studies in Alzheimer's disease
2024-Feb-15, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究开发了一种基于Matrigel的三维单层培养和与神经胶质细胞共培养的单核细胞衍生的微胶质样细胞(MDMi)模型,用于阿尔茨海默病(AD)的临床前研究 本研究首次开发了一种生理相关且具有AD患者特异性的三维微胶质细胞模型,该模型能够更好地模拟人微胶质的形态和功能 本研究仅在体外模型中进行了实验,尚未在动物模型或临床试验中验证其有效性 开发一种新型的、生理相关的AD患者特异性微胶质细胞模型,以改进AD个性化药物开发策略 单核细胞衍生的微胶质样细胞(MDMi)及其在AD中的应用 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序(scRNAseq) 3D细胞培养模型 细胞 十六名AD患者及匹配的健康对照 NA NA NA NA
236 2024-08-04
Integration of scRNA and bulk RNA-sequence to construct the 5-gene molecular prognostic model based on the heterogeneity of thyroid carcinoma endothelial cell
2024-02-25, Acta biochimica et biophysica Sinica IF:3.3Q1
研究论文 本研究构建了基于甲状腺癌内皮细胞异质性的5基因分子预后模型 揭示内皮细胞与乳头状甲状腺癌进展的强关联,并筛选出5个关键基因 对于肿瘤微环境中的细胞关注较少,可能影响研究的全面性 探索甲状腺癌的分子预后过程及其内皮细胞的作用 甲状腺癌的内皮细胞及其相关基因 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
237 2024-08-07
Proteomic profiling of aqueous humor-derived exosomes in Vogt-Koyanagi-Harada disease and Behcet's uveitis
2024-02, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
research paper 本研究首次对来自Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体进行了无标记定量蛋白质组学分析,以确定其在疾病中的潜在作用 首次对房水来源的外泌体进行无标记定量蛋白质组学分析,并发现补体相关通路在这些疾病发病机制中的重要作用 NA 探究Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎中房水来源外泌体的蛋白质组学特征及其在疾病发病机制中的作用 Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体 NA Vogt-Koyanagi-Harada病, Behcet氏葡萄膜炎 无标记定量蛋白质组学 NA 蛋白质 84名患者 NA NA NA NA
238 2024-08-07
[Single-cell transcriptome characterization of oral mucosal fibroblasts]
2024-Feb, Shanghai kou qiang yi xue = Shanghai journal of stomatology
PMID:38583017
研究论文 本研究通过整合口腔黏膜和皮肤组织的单细胞数据库,对成纤维细胞亚群进行了分类和功能分析 首次在单细胞水平上统一了口腔黏膜和皮肤组织成纤维细胞亚型的分类,并分析了它们在功能上的异同 NA 阐明正常口腔黏膜和皮肤组织中成纤维细胞亚型的组成和功能差异,为组织修复和再生领域的未来应用提供基础 口腔黏膜和皮肤组织的成纤维细胞亚群 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 UMAP 转录组数据 四个单细胞数据库 NA NA NA NA
239 2024-08-04
Molecular map of disulfidptosis-related genes in lung adenocarcinoma: the perspective toward immune microenvironment and prognosis
2024-02-11, Clinical epigenetics IF:4.8Q1
研究论文 本研究系统探讨了与二硫化物相关的基因在肺腺癌中的表达及其预后意义 提出了一种新的DRG标记风险评分,可以预测肺腺癌的免疫微环境和预后 未提及具体的样本量和实验方法的局限性 阐明与二硫化物相关基因在肺腺癌中的预后重要性 研究与肺腺癌相关的二硫化物相关基因及其在肿瘤微环境中的作用 数字病理学 肺癌 qRT-PCR、单细胞测序 Cox回归模型 基因表达数据 NA NA NA NA NA
240 2024-08-04
Single-cell sequencing identifies inflammation-promoting fibroblast-neutrophil interaction in peri-implantitis
2024-02, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1
研究论文 本文揭示了通过单细胞测序技术获得的周围种植体炎症浸润的细胞组成和分子环境 该研究首次发现了在种植体炎症中促炎症成纤维细胞与中性粒细胞的相互作用 该研究可能未涵盖所有相关的细胞类型和潜在的分子机制 解释周围种植体炎与牙周炎之间的病理差异 周围种植体炎患者的组织与牙周炎患者及健康供体的牙周组织 数字病理学 牙周炎 单细胞转录组测序 NA 组织样本 来自患有周围种植体炎和牙周炎的患者,以及健康供体的高通量样本 NA NA NA NA
回到顶部