单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
201	2024-08-04	Single-cell sequencing of the retina shows that LDHA regulates pathogenesis of autoimmune uveitis 2024-02, Journal of autoimmunity IF:7.9Q1 DOI:10.1016/j.jaut.2023.103160 PMID:38160538	研究论文	本文研究了LDHA在自身免疫性葡萄膜炎中对病理发生的调节作用	研究发现LDHA的抑制可以恢复炎症下T效应细胞和T调节细胞的不平衡，并揭示了其在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制	未提及具体的临床数据或者长期观察结果	旨在揭示自身免疫性葡萄膜炎中视网膜损伤的细胞动态和致病机制	实验自身免疫性葡萄膜炎小鼠及葡萄膜炎患者外周血单核细胞	数字病理学	自身免疫性葡萄膜炎	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	实验中使用了自身免疫性葡萄膜炎小鼠和人类患者的样本
202	2024-08-05	The Characteristics of Macrophage Heterogeneity in Atherosclerotic Aortas 2024-02, Journal of cardiovascular translational research IF:2.4Q3 DOI:10.1007/s12265-023-10434-1 PMID:37713049	研究论文	本文研究了动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群的特征	通过单细胞RNA测序分析巨噬细胞亚群的不同表型和功能特性	研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏大型临床样本的验证	探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及其异质性	动脉粥样硬化中的巨噬细胞亚群	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	NA	6个亚群（基于单细胞分析）
203	2024-08-04	Distinct immune escape and microenvironment between RG-like and pri-OPC-like glioma revealed by single-cell RNA-seq analysis 2024-Feb, Frontiers of medicine IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s11684-023-1017-7 PMID:37955814	research paper	通过单细胞RNA-seq分析对26个胶质瘤进行分类，揭示了原始少突胶质细胞样（pri-OPC）和放射胶质细胞样（RG）的肿瘤之间的免疫逃逸和微环境的区别	首次揭示了pri-OPC样和RG样胶质瘤在免疫逃逸程序上的显著差异	样本数量较少，仅涉及26个胶质瘤，可能影响结果的广泛适用性	探讨胶质瘤与神经发生和胶质发生之间的关系	26个胶质瘤样本，分类为pri-OPC样和RG样肿瘤	数字病理学	胶质瘤	单细胞RNA-seq	NA	RNA-seq数据	26个胶质瘤样本
204	2024-08-07	Tumor-derived exosomes induce initial activation by exosomal CD19 antigen but impair the function of CD19-specific CAR T-cells via TGF-β signaling 2024-Feb, Frontiers of medicine IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s11684-023-1010-1 PMID:37870681	研究论文	研究肿瘤来源的外泌体（TEXs）对CD19特异性CAR T细胞功能的影响及其机制	首次揭示了淋巴瘤来源的外泌体通过TGF-β信号通路影响CAR T细胞的功能，并提出了一种新的治疗策略	研究主要集中在体外实验，需要进一步的临床试验验证	探讨肿瘤来源的外泌体对CAR T细胞功能的影响及其潜在机制	CD19特异性CAR T细胞及肿瘤来源的外泌体	免疫学	淋巴瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	来自淋巴瘤患者的血浆外泌体及CAR T细胞
205	2024-08-04	Spatial transcriptomics reveals heterogeneity of histological subtypes between lepidic and acinar lung adenocarcinoma 2024-02, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.1573 PMID:38318637	研究论文	本文探讨了早期肺腺癌不同组织学亚型之间的异质性。	提出了一种在单细胞水平上评估患者组织学亚型的新方法，揭示了肿瘤内皮细胞对免疫反应的抑制作用。	研究样本量较小，仅包含11名手术后患者，可能限制了结果的普遍适用性。	研究早期肺腺癌不同组织学亚型的临床意义以及其在单细胞层面的异质性。	研究对象为11名病理确认的早期IA期肺腺癌患者。	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和数字空间分析（DSP）	NA	组织样本	11名早期IA期肺腺癌患者的样本
206	2024-08-04	Granulocytic myeloid-derived suppressor cell activity during biofilm infection is regulated by a glycolysis/HIF1a axis 2024-Feb-29, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI174051 PMID:38421730	研究论文	这篇文章探讨了糖酵解/HIF1a轴对粒细胞来源的抑制细胞在生物膜感染中的作用	该研究揭示了糖酵解和HIF1a在促进粒细胞来源抑制细胞抗炎活性和生物膜持续性中的重要性	文章未提及特定的实验局限性	研究糖酵解和HIF1a在生物膜相关的假体关节感染中的作用	粒细胞来源的抑制细胞与金黄色葡萄球菌假体关节感染的关系	数字病理学	NA	单细胞测序	小鼠模型	基因组数据	包括PJI患者的粒细胞样本
207	2024-08-07	Advanced patient-specific microglia cell models for pre-clinical studies in Alzheimer's disease 2024-Feb-15, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-024-03037-3 PMID:38365833	研究论文	本研究开发了一种基于Matrigel的三维单层培养和与神经胶质细胞共培养的单核细胞衍生的微胶质样细胞（MDMi）模型，用于阿尔茨海默病（AD）的临床前研究	本研究首次开发了一种生理相关且具有AD患者特异性的三维微胶质细胞模型，该模型能够更好地模拟人微胶质的形态和功能	本研究仅在体外模型中进行了实验，尚未在动物模型或临床试验中验证其有效性	开发一种新型的、生理相关的AD患者特异性微胶质细胞模型，以改进AD个性化药物开发策略	单核细胞衍生的微胶质样细胞（MDMi）及其在AD中的应用	数字病理学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序（scRNAseq）	3D细胞培养模型	细胞	十六名AD患者及匹配的健康对照
208	2024-08-04	Integration of scRNA and bulk RNA-sequence to construct the 5-gene molecular prognostic model based on the heterogeneity of thyroid carcinoma endothelial cell 2024-02-25, Acta biochimica et biophysica Sinica IF:3.3Q1 DOI:10.3724/abbs.2023254 PMID:38186223	研究论文	本研究构建了基于甲状腺癌内皮细胞异质性的5基因分子预后模型	揭示内皮细胞与乳头状甲状腺癌进展的强关联，并筛选出5个关键基因	对于肿瘤微环境中的细胞关注较少，可能影响研究的全面性	探索甲状腺癌的分子预后过程及其内皮细胞的作用	甲状腺癌的内皮细胞及其相关基因	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR)	NA	基因表达数据	NA
209	2024-08-07	Proteomic profiling of aqueous humor-derived exosomes in Vogt-Koyanagi-Harada disease and Behcet's uveitis 2024-02, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2024.109895 PMID:38185270	research paper	本研究首次对来自Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体进行了无标记定量蛋白质组学分析，以确定其在疾病中的潜在作用	首次对房水来源的外泌体进行无标记定量蛋白质组学分析，并发现补体相关通路在这些疾病发病机制中的重要作用	NA	探究Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎中房水来源外泌体的蛋白质组学特征及其在疾病发病机制中的作用	Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体	NA	Vogt-Koyanagi-Harada病, Behcet氏葡萄膜炎	无标记定量蛋白质组学	NA	蛋白质	84名患者
210	2024-08-07	[Single-cell transcriptome characterization of oral mucosal fibroblasts] 2024-Feb, Shanghai kou qiang yi xue = Shanghai journal of stomatology PMID:38583017	研究论文	本研究通过整合口腔黏膜和皮肤组织的单细胞数据库，对成纤维细胞亚群进行了分类和功能分析	首次在单细胞水平上统一了口腔黏膜和皮肤组织成纤维细胞亚型的分类，并分析了它们在功能上的异同	NA	阐明正常口腔黏膜和皮肤组织中成纤维细胞亚型的组成和功能差异，为组织修复和再生领域的未来应用提供基础	口腔黏膜和皮肤组织的成纤维细胞亚群	数字病理学	NA	单细胞转录组测序	UMAP	转录组数据	四个单细胞数据库
211	2024-08-04	Molecular map of disulfidptosis-related genes in lung adenocarcinoma: the perspective toward immune microenvironment and prognosis 2024-02-11, Clinical epigenetics IF:4.8Q1 DOI:10.1186/s13148-024-01632-y PMID:38342890	研究论文	本研究系统探讨了与二硫化物相关的基因在肺腺癌中的表达及其预后意义	提出了一种新的DRG标记风险评分，可以预测肺腺癌的免疫微环境和预后	未提及具体的样本量和实验方法的局限性	阐明与二硫化物相关基因在肺腺癌中的预后重要性	研究与肺腺癌相关的二硫化物相关基因及其在肿瘤微环境中的作用	数字病理学	肺癌	qRT-PCR、单细胞测序	Cox回归模型	基因表达数据	NA
212	2024-08-04	Single-cell sequencing identifies inflammation-promoting fibroblast-neutrophil interaction in peri-implantitis 2024-02, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1 DOI:10.1111/jcpe.13912 PMID:38088448	研究论文	本文揭示了通过单细胞测序技术获得的周围种植体炎症浸润的细胞组成和分子环境	该研究首次发现了在种植体炎症中促炎症成纤维细胞与中性粒细胞的相互作用	该研究可能未涵盖所有相关的细胞类型和潜在的分子机制	解释周围种植体炎与牙周炎之间的病理差异	周围种植体炎患者的组织与牙周炎患者及健康供体的牙周组织	数字病理学	牙周炎	单细胞转录组测序	NA	组织样本	来自患有周围种植体炎和牙周炎的患者，以及健康供体的高通量样本
213	2024-08-07	Revisiting Multi-Omics Data to Unravel Galectins as Prognostic Factors in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma 2024-Feb-27, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines12030529 PMID:38540141	研究论文	本研究重新审视多组学数据，以揭示半乳糖凝集素作为头颈鳞状细胞癌的预后因子	本研究通过单细胞RNA测序分析了半乳糖凝集素在肿瘤微环境中的表达及其对预后的影响，并展示了其在预测HPV和突变状态、分层HNSCC预后和预测治疗反应中的三重功能	本研究强调需要进一步研究以评估半乳糖凝集素在HNSCC中的作用，并明确个体半乳糖凝集素在患者分层中的角色	评估半乳糖凝集素作为头颈鳞状细胞癌的预后生物标志物	头颈鳞状细胞癌中的半乳糖凝集素表达及其与HPV和突变状态的关系	数字病理学	头颈鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
214	2024-08-04	A Keratin 12 Expression-Based Analysis of Stem-Precursor Cells and Differentiation in the Limbal-Corneal Epithelium Using Single-Cell RNA-Seq Data 2024-Feb-26, Biology DOI:10.3390/biology13030145 PMID:38534415	研究论文	这篇文章分析了在单细胞RNA测序数据基础上，角膜上皮中的干前体细胞和分化过程，特别是角蛋白12（Krt12）的表达情况	本研究揭示了角膜上皮分化过程中Krt12表达变化的独特四个步骤，并提供了多种基因组群的识别	这篇文章未提及样本的多样性或外部验证的必要性	旨在探究角膜上皮中干前体细胞的特性及分化机制	研究对象为角膜上皮中的干前体细胞及其分化过程	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	基因表达数据	NA
215	2024-08-07	Comprehensive Transcriptomic Profiling of Diverse Brain Tumor Types Uncovers Complex Structures of the Brain Tumor Microenvironment 2024-Feb-23, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines12030506 PMID:38540119	研究论文	本研究分析了六种脑肿瘤类型（脑膜瘤、星形细胞瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤）的转录组结构，以揭示脑肿瘤微环境的复杂结构	通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和免疫相关基因的无监督聚类，揭示了脑肿瘤微环境中免疫细胞类型的差异分布及其对治疗的反应	NA	提供克服脑肿瘤治疗脆弱性的潜在指导方针	脑肿瘤微环境的转录组结构	数字病理学	脑肿瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	六种脑肿瘤类型的细胞群体
216	2024-08-04	SPINK1 Overexpression Correlates with Hepatocellular Carcinoma Treatment Resistance Revealed by Single Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics 2024-Feb-22, Biomolecules IF:4.8Q1 DOI:10.3390/biom14030265 PMID:38540686	研究论文	本研究揭示了SPINK1在肝细胞癌治疗抵抗中的作用	首次阐明了SPINK1在肝细胞癌化疗抵抗中的关键角色，并确定其作为潜在治疗靶点	对SPINK1影响的机制理解仍然有限，尚需进一步的研究	探究SPINK1对肝细胞癌化疗抵抗的影响	肝细胞癌患者的细胞和组织样本	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序和空间转录组学	NA	RNA数据	来自两个肝细胞癌队列的单细胞样本
217	2024-08-04	Lupus dermal fibroblasts are proinflammatory and exhibit a profibrotic phenotype in scarring skin disease 2024-Feb-15, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.173437 PMID:38358820	研究论文	该研究探讨了系统性红斑狼疮患者皮肤纤维母细胞的炎症反应与瘢痕生成之间的关系	揭示了系统性红斑狼疮纤维母细胞在炎症反应中的不同表现，为治疗皮肤损伤提供了新靶点	研究仅限于小样本量且主要集中在皮肤样本上	旨在理解红斑狼疮皮肤纤维母细胞的炎症机制及其在瘢痕疾病中的作用	对22名系统性红斑狼疮及皮肤红斑狼疮患者和34名健康对照的皮肤纤维母细胞进行分析	数字病理学	皮肤红斑狼疮	单细胞RNA测序	NA	生物样本	22名系统性红斑狼疮及皮肤红斑狼疮患者和34名健康对照
218	2024-08-04	Tertiary lymphoid structures sustain cutaneous B cell activity in hidradenitis suppurativa 2024-Feb-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.169870 PMID:38113104	研究论文	本研究调查了在脓疱性汗腺炎（HS）皮损中B细胞的动态和微环境互动	首次在HS皮损中识别了三级淋巴结构，并描述了T细胞、B细胞、抗原呈递细胞和皮肤基质之间的有组织互动	本研究主要集中在皮损区域，未能广泛评估HS的全身反应	探讨B细胞在脓疱性汗腺炎发病机制中的作用及其微环境	研究了脓疱性汗腺炎患者皮损中B细胞的活动	数字病理学	脓疱性汗腺炎	单细胞RNA测序, 空间转录组分析	NA	组织样本	涉及多个脓疱性汗腺炎皮损样本
219	2024-08-04	Ferroptosis-Related lncRNA to Predict the Clinical Outcomes and Molecular Characteristics of Kidney Renal Papillary Cell Carcinoma 2024-Feb-29, Current issues in molecular biology IF:2.8Q3 DOI:10.3390/cimb46030123 PMID:38534739	研究论文	该研究构建了一种基于铁死亡相关的长非编码RNA风险评分模型，用于预测肾脏肾小管细胞癌的临床结果和分子特征	提出了一种新的肾脏肾小管细胞癌亚型，并开发了准确的预后模型	未提及具体的限制因素	研究肾脏肾小管细胞癌的预后与分子特征	肾脏肾小管细胞癌患者	数字病理学	肾脏癌症	单细胞转录组学	风险评分模型	基因表达数据	基于TCGA-KIRP数据集
220	2024-08-04	Single-cell analyses of metastatic bone marrow in human neuroblastoma reveals microenvironmental remodeling and metastatic signature 2024-Feb-15, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.173337 PMID:38358826	研究论文	这篇文章研究了神经母细胞瘤中转移性骨髓的单细胞特征，揭示了微环境重塑和转移特征	引入单细胞RNA测序技术，分析了转移性骨髓微环境中的免疫细胞群体重塑和基因表达变化	该研究仅集中于神经母细胞瘤的转移性骨髓，未涉及其他部位的转移或不同类型的肿瘤	理解神经母细胞瘤转移微环境的细胞和分子机制，以改善临床结果	转移性和非转移性神经母细胞瘤患者的免疫细胞和肿瘤细胞变化	数字病理学	神经母细胞瘤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	3个独立的神经母细胞瘤队列