单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 447 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA-seq reveals transcriptomic modulation of Alzheimer's disease by activated protein C
2024-02-21, Aging
DOI:10.18632/aging.205624
PMID:38385967
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研究论文 | 单细胞RNA测序揭示了激活蛋白C对阿尔茨海默病的转录组调节 | 研究发现激活蛋白C能够通过下调炎症过程和恢复神经系统功能来改善阿尔茨海默病模型的小鼠的认知功能 | 未提及研究的局限性 | 探讨激活蛋白C在阿尔茨海默病进展中的潜在影响 | 使用5xFAD阿尔茨海默病小鼠模型与野生型小鼠进行比较研究 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用5xFAD小鼠和野生型小鼠进行比较 |
| 182 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics identifies senescence-associated secretory phenotype (SASP) features of testicular aging in human
2024-02-12, Aging
DOI:10.18632/aging.205538
PMID:38349859
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了人类睾丸老化的细胞衰老相关分泌表型特征 | 首次使用单细胞RNA测序分析睾丸老化的细胞间通讯网络，并识别了衰老睾丸中主要表达于莱迪格细胞的SASP相关基因 | 尚无法提前预测睾丸老化的发生 | 探讨睾丸老化的分子机制及其细胞衰老相关分泌表型特征 | 主要研究对象为不同年龄组的人类睾丸样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用GEO数据库中的数据，涉及年轻组与老年组的样本 |
| 183 | 2024-08-04 |
Machine learning constructs a T cell-related signature for predicting prognosis and drug sensitivity in ovarian cancer
2024-02-09, Aging
DOI:10.18632/aging.205536
PMID:38345575
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研究论文 | 本文构建了一个T细胞相关的预后标志以预测卵巢癌的预后和药物敏感性 | 使用10种不同的机器学习算法构建了TRS预测卵巢癌患者的临床结果和免疫治疗反应 | 本文的限制未详细说明 | 研究卵巢癌中T细胞相关标志物与预后及药物敏感性之间的关系 | 卵巢癌患者 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因组数据 | 多个数据集，包括TCGA和其他GSE数据集 |
| 184 | 2024-08-05 |
Anoikis-related gene signature is associated with immune infiltration and predicts the prognosis of non-small cell lung cancer
2024-02-07, Aging
DOI:10.18632/aging.205522
PMID:38329444
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研究论文 | 本文探讨了与anoikis相关的基因签名与非小细胞肺癌的免疫浸润相关，并预测其预后 | 提出了一个基于与anoikis相关的基因的预后模型，并分析了其与免疫特征的相关性 | 未详细讨论其他可能影响免疫浸润的因素 | 探讨anoikis在非小细胞肺癌患者中的预后价值和治疗指导 | 研究对象为非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用了来自RNA测序的数据集，样本量未具体说明 |
| 185 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data revealed disulfidptosis genes-based molecular subtypes and a prognostic signature in lung adenocarcinoma
2024-02-05, Aging
DOI:10.18632/aging.205509
PMID:38319721
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研究论文 | 本文进行了一项单细胞和bulk RNA测序数据的综合分析，揭示了基于二硫化物凋亡基因的分子亚型和预后特征 | 本文首次提出并验证了基于二硫化物凋亡基因的预后风险模型DRG评分，推动了肺腺癌的免疫治疗和化疗研究 | 研究中可能存在样本量限制和数据来源的偏倚 | 探索二硫化物凋亡基因在肺腺癌中的作用及其预后价值 | 本研究主要针对肺腺癌患者样本，通过单细胞RNA测序和bulk RNA测序分析 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | Cox回归和LASSO回归 | 基因表达数据 | TCGA样本和GSE131907数据集中的单细胞样本 |
| 186 | 2024-08-04 |
scGIST: gene panel design for spatial transcriptomics with prioritized gene sets
2024-02-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03185-y
PMID:38408997
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研究论文 | 本文提出了一个名为scGIST的工具，用于设计优先考虑特定基因的单细胞空间转录组面板 | scGIST是一个受限特征选择工具，能够在不影响细胞类型检测精度的情况下设计面板 | 该工具面板大小受限于基因数，且依赖于荧光原位杂交技术 | 研究旨在改善单细胞空间转录组技术中的基因面板设计 | 研究对象包括不同细胞类型的标记基因及其他感兴趣基因 | 数字病理学 | NA | 荧光原位杂交 | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-08-04 |
Characterizing hub biomarkers for post-transplant renal fibrosis and unveiling their immunological functions through RNA sequencing and advanced machine learning techniques
2024-02-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04971-9
PMID:38378674
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研究论文 | 本文探讨了肾移植后肾纤维化的中心生物标志物及其免疫功能 | 识别了与肾纤维化相关的四个核心基因及其潜在的有效小分子，提出了新的研究思路 | 缺乏临床数据验证所识别生物标志物的实用性 | 研究肾移植后肾纤维化的生物标志物及其机制 | 聚焦于肾纤维化患者的基因组数据和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA测序、单细胞测序、加权基因共表达网络分析 (WGCNA) | NA | 转录组数据 | 从NCBI基因表达综合体 (GEO) 获取的多名患者的数据和小鼠模型 |
| 188 | 2024-08-04 |
Senescent fibroblast facilitates re-epithelization and collagen deposition in radiation-induced skin injury through IL-33-mediated macrophage polarization
2024-02-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04972-8
PMID:38369466
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研究论文 | 这篇文章探讨了衰老成纤维细胞在辐射诱导的皮肤损伤中的作用 | 本研究揭示了p16表达的衰老成纤维细胞通过分泌IL-33促进辐射诱导的皮肤愈合的机制 | 本研究的限制在于未完全阐明所有潜在的细胞机制和其他因素 | 研究衰老细胞在辐射诱导的皮肤损伤中的作用及其机制 | 辐射诱导的皮肤损伤中的衰老成纤维细胞及其对愈合过程的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | 单细胞数据, 组学数据 | NA |
| 189 | 2024-08-05 |
Diffuse large B-cell lymphoma: the significance of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes exhaustion mediated by TIM3/Galectin-9 pathway
2024-02-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05002-3
PMID:38369502
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研究论文 | 本研究探讨了TIM3/Galectin-9通路在弥漫大B细胞淋巴瘤中对CD8+肿瘤浸润淋巴细胞疲惫的意义 | 首次揭示了TIM3/Galectin-9通路在CD8+肿瘤浸润淋巴细胞疲惫及免疫逃逸中的关键作用 | 对TIM3介导的CD8+TILs疲惫机制的理解仍然较为有限 | 明确TIM3介导的CD8+TILs疲惫的潜在通路及其在弥漫大B细胞淋巴瘤中的重要性 | 研究对象为弥漫大B细胞淋巴瘤中的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | RNA，免疫组化 | NA |
| 190 | 2024-08-05 |
Potential crosstalk between SPP1 + TAMs and CD8 + exhausted T cells promotes an immunosuppressive environment in gastric metastatic cancer
2024-02-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04688-1
PMID:38365757
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研究论文 | 本文研究了SPP1+ TAM与CD8+衰竭T细胞在胃癌转移中的相互作用及其免疫抑制环境的影响 | 首次揭示了SPP1+ TAMs与CD8+衰竭T细胞之间的相互作用及其在胃癌转移中的免疫抑制作用 | 研究主要依赖于动物模型，可能存在物种间差异 | 探讨SPP1+ TAM在胃癌转移中的作用 | SPP1+ TAM和CD8+衰竭T细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组分析和动物模型 | NA | 转录组数据 | NA |
| 191 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals immunosuppressive landscape in overweight and obese colorectal cancer
2024-02-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04921-5
PMID:38311726
|
研究论文 | 本研究探讨了超重和肥胖结直肠癌（CRC）的免疫抑制环境和代谢特征 | 首次在单细胞层面揭示了超重和肥胖CRC的免疫抑制微环境和特定代谢重编程 | 样本量相对较小，仅包括15名超重/肥胖及15名正常体重CRC患者 | 深入理解超重和肥胖CRC的肿瘤特征以推动更有效的治疗方案 | 超重/肥胖及正常体重的结直肠癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 192,785个细胞，来自30名CRC患者的样本 |
| 192 | 2024-08-05 |
A fast, scalable and versatile tool for analysis of single-cell omics data
2024-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02139-9
PMID:38191932
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研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞组学数据分析的非线性降维算法SnapATAC2 | 该算法在提高单细胞组学数据异质性捕捉精度的同时，确保了运行时和内存使用的高效性 | 传统降维技术在计算效率和生物多样性描述上仍面临挑战 | 研究单细胞组学数据的降维与细胞异质性分析 | 多种单细胞组学数据集，包括单细胞RNA测序等 | 数字病理 | NA | 单细胞组学技术 | 非线性降维算法 | 组学数据 | 多个单细胞组学数据集 |
| 193 | 2024-08-04 |
Immunotherapy-resistant acute lymphoblastic leukemia cells exhibit reduced CD19 and CD22 expression and BTK pathway dependency
2024-Feb-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175199
PMID:38376944
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研究论文 | 本文探讨了对CD19免疫疗法产生耐药性的急性淋巴细胞白血病细胞的特征，发现其CD19和CD22的表达减少，并依赖于BTK通路 | 本研究首次揭示了CD19免疫耐药细胞中CD19和CD22表达的联合丧失以及对BTK通路的依赖性 | 研究主要基于体外模型，临床样本数量相对较少 | 探讨CD19免疫疗法耐药性机制及其对细胞信号通路的影响 | 急性淋巴细胞白血病细胞及其耐药性相关特征 | 数字病理 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq), 转座酶可及染色质测序 (ATAC-Seq), 大质量细胞术 | NA | 细胞 | 来自多名（儿科和年轻成人）复发B细胞急性淋巴细胞白血病患者的样本 |
| 194 | 2024-08-04 |
Insight into Tetrabromobisphenol A-Associated Liver Transcriptional Landscape via Single Cell RNA Sequencing
2024-02, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300477
PMID:37867281
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术描述了四溴双酚A引起的小鼠肝脏转录组特征 | 揭示了四溴双酚A（TBBPA）对肝细胞和内皮细胞的功能障碍及其对免疫细胞招募的影响 | 研究仅在小鼠模型中进行，需在其他模型和人类样本中验证 | 探讨环境毒素四溴双酚A引发的肝脏损伤机制 | 小鼠肝脏中的主要细胞类型 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 195 | 2024-08-05 |
Identification and Validation of Glomeruli Cellular Senescence-Related Genes in Diabetic Nephropathy by Multiomics
2024-02, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300453
PMID:37957539
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研究论文 | 本研究旨在识别和验证与糖尿病肾病相关的肾小球细胞衰老相关基因 | 研究首次揭示FOS和ZFP36可能在糖尿病肾病中发挥抗衰老作用 | 研究中只是验证了部分核心基因的表达，仍需更大规模的验证 | 提供新的线索以基于抗衰老策略治疗糖尿病肾病 | 研究对象包括糖尿病肾小球和对照肾小球样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 微阵列分析, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 41个糖尿病肾小球和20个对照肾小球样本 |
| 196 | 2024-08-04 |
From patient tissue correlates to molecular mechanisms of cancer immune evasion: the emerging role of CD58 and PD-L1 co-regulation via CMTM6
2024-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-023-00224-9
PMID:38082156
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研究论文 | 本文探讨了CD58和PD-L1的共同调节在癌症免疫逃逸中的作用 | 揭示了CD58损失导致免疫逃逸的机制，并发现CMTM6在CD58和PD-L1的双重调节中的关键作用 | 仅在黑色素瘤患者样本中进行研究，可能不适用于所有类型癌症 | 研究癌细胞内在的免疫逃逸机制 | 黑色素瘤患者的组织样本和衍生的共同培养模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | 共同培养模型 | 组织样本 | 患者样本与肿瘤浸润性淋巴细胞的联合样本 |
| 197 | 2024-08-05 |
A conserved transcriptional program for MAIT cells across mammalian evolution
2024-Feb-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231487
PMID:38117256
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研究论文 | 本文研究了MAIT细胞在跨越110百万年进化的六个物种中的转录组特征 | 揭示了不同物种中MAIT细胞成熟的保守转录事件，以及其在不同物种中的共享转录程序 | 主要集中在六个特定物种，可能无法全面代表所有哺乳动物的MAIT细胞功能 | 探索MAIT细胞在哺乳动物进化中的功能和转录程序 | 涉及六种跨越110百万年进化的物种中的MAIT细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 六种物种的MAIT细胞样本 |
| 198 | 2024-08-05 |
Cross-Omic Transcription Factor Analysis: An Insight on Transcription Factor Accessibility and Expression Correlation
2024-02-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15030268
PMID:38540327
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研究论文 | 本文探讨了不同功能基因组区域内转录因子的表达与模体信息之间的相关性 | 提出了对基因活动矩阵（GAM）和基因组注释基因活动矩阵（GAGAM）贡献的元分析，并探讨了转录因子的动态 | 对可及区域如何影响基因表达的概念缺乏明确的定义 | 研究转录因子表达与转录因子在不同细胞类型中的动态如何相关 | 不同功能基因组区域内的转录因子 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 199 | 2024-08-05 |
An integrated single-cell RNA-seq atlas of the mouse hypothalamic paraventricular nucleus links transcriptomic and functional types
2024-02, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.13367
PMID:38281730
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研究论文 | 本研究构建了小鼠下丘脑旁核的转录组细胞类型详细图谱 | 整合了多个PVN单细胞数据集，并进行功能性表征，首次提供了不同神经内分泌亚型的详细分类 | 目前的分子分类仍不够充分，未来需要更多的数据来完善分类 | 旨在详细描述小鼠下丘脑旁核的转录组细胞类型及其功能 | 研究对象为小鼠下丘脑旁核的神经细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 整合多个小鼠下丘脑旁核单细胞数据集，具体样本数量未明 |
| 200 | 2024-08-04 |
Resolving cellular dynamics using single-cell temporal transcriptomics
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103060
PMID:38194753
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综述 | 本文讨论了通过单细胞时间转录组学解决细胞动态的方法 | 介绍了非破坏性活细胞转录组学方法，并探讨了其与计算模型的互补性质 | 未具体提及研究的限制 | 加深对细胞动态及其在发育过程和疾病进展中作用的理解 | 单细胞转录组学及其在细胞状态动态重建中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 转录组数据 | NA |