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当前共找到 444 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-12 |
The HSP90-MYC-CDK9 network drives therapeutic resistance in mantle cell lymphoma
2024-Feb-07, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00484-9
PMID:38326887
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了套细胞淋巴瘤中HSP90-MYC-CDK9网络是治疗耐药性的主要驱动力 | 首次在套细胞淋巴瘤中通过单细胞RNA测序分析揭示了HSP90-MYC-CDK9网络在BTKi和CAR-T疗法序贯耐药中的关键作用 | 样本量相对较小（25名患者的66个样本），且为观察性研究，需要进一步实验验证 | 探究套细胞淋巴瘤对BTKi和CAR-T疗法序贯耐药的分子机制 | 25名接受BTKi和/或CAR-T治疗的套细胞淋巴瘤患者的66个样本 | 数字病理学 | 套细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 25名患者的66个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-02-08 |
scGIST: gene panel design for spatial transcriptomics with prioritized gene sets
2024-02-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03185-y
PMID:38408997
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研究论文 | 本文提出了一种名为scGIST的约束特征选择工具，用于设计单细胞空间转录组学（sc-ST）的基因面板，优先考虑用户指定的基因，同时不损害细胞类型检测的准确性 | scGIST是一种创新的约束特征选择工具，能够在有限的面板大小下优先纳入用户指定的基因（如配体-受体复合物或特定通路基因），同时保持细胞类型检测的准确性，解决了sc-ST技术中面板大小的关键挑战 | NA | 开发一种工具以优化单细胞空间转录组学（sc-ST）的基因面板设计，在有限的面板大小内平衡用户指定基因的优先纳入和细胞类型检测的准确性 | 单细胞空间转录组学（sc-ST）技术中的基因面板设计 | 空间转录组学 | NA | 单细胞空间转录组学（sc-ST），荧光原位杂交（FISH） | 约束特征选择工具 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-02-08 |
Kidney double positive T cells have distinct characteristics in normal and diseased kidneys
2024-02-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-54956-3
PMID:38396136
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研究论文 | 本研究探讨了正常和疾病状态下肾脏中TCR+CD4+CD8+（双阳性；DP）T细胞的存在、特征及功能 | 首次系统描述了肾脏DP T细胞在正常和损伤条件下的独特炎症与代谢特征，并利用单细胞RNA-seq揭示了其基因表达变化 | DP T细胞在肾脏中为少数群体，其具体病理生理作用仍需进一步验证；人类样本仅来源于肾细胞癌患者，可能限制结果的普适性 | 探究正常和疾病状态下肾脏DP T细胞的特性与功能 | 小鼠肾脏（正常、缺血再灌注损伤、顺铂损伤、病毒感染模型）及人类肾细胞癌患者的肾脏组织 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型及人类肾细胞癌患者肾脏样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-02-08 |
Circulating cancer-specific CD8 T cell frequency is associated with response to PD-1 blockade in Merkel cell carcinoma
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101412
PMID:38340723
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研究论文 | 本研究探讨了Merkel细胞癌中循环MCPyV特异性CD8 T细胞频率与PD-1阻断治疗反应之间的关联 | 首次利用MCPyV肽-HLA-I多聚体结合多色流式细胞术、单细胞转录组学和TCR测序，系统分析了病毒驱动癌症中特异性T细胞的特征，并发现循环中而非肿瘤内的这些细胞频率与治疗反应显著相关 | 样本量较小（27例患者），且研究仅针对病毒驱动的Merkel细胞癌，可能不适用于非病毒性癌症 | 探究癌症特异性T细胞在PD-1免疫治疗中的作用机制 | Merkel细胞癌患者中的MCPyV特异性CD8 T细胞 | 免疫肿瘤学 | Merkel细胞癌 | MCPyV肽-HLA-I多聚体检测、26色流式细胞术、单细胞转录组学、T细胞受体测序 | NA | 流式细胞数据、单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 27例Merkel细胞癌患者 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-02-08 |
Lineage and ecology define liver tumor evolution in response to treatment
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101394
PMID:38280378
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞转录组的策略，通过测量细胞谱系和生态来追踪肝癌患者纵向肿瘤活检的进化，并构建了一个谱系与生态评分系统来预测临床结果 | 开发了一种结合细胞谱系和微环境生态的联合动态评分系统，用于分类肿瘤状态并追踪其在治疗响应中的进化轨迹 | NA | 监测肝癌在治疗干预下的肿瘤进化，并预测临床结果 | 肝癌患者的纵向肿瘤活检样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包括纵向活检样本和额外716名肝癌患者的批量转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-02-03 |
Exercise mitigates flow recirculation and activates metabolic transducer SCD1 to catalyze vascular protective metabolites
2024-02-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7481
PMID:38354249
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研究论文 | 本研究探讨了运动如何通过减少血流再循环并激活内皮SCD1酶来催化保护性脂质代谢物，从而改善血管健康 | 首次揭示了运动通过调节血流动力学（如减少主动脉弓小弯处的血流再循环）并激活内皮SCD1酶，催化产生抗炎脂质代谢物（油酸和棕榈油酸），为血管保护提供新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；且SCD1的具体信号通路和长期效应需进一步探索 | 探究运动如何通过代谢转换器SCD1介导血管保护作用，并阐明其与血流动力学变化的关联 | 野生型小鼠、内皮特异性SCD1敲除小鼠、高脂饮食小鼠以及主动脉内皮细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 非靶向代谢组学分析、单细胞转录组学、计算机模拟分析、腺病毒转染 | NA | 代谢组数据、转录组数据、血流动力学模拟数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-01-24 |
Single-cell transcriptome analysis reveals keratinocyte subpopulations contributing to psoriasis in corneum and granular layer
2024-Feb, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI)
IF:2.0Q3
DOI:10.1111/srt.13572
PMID:38279596
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了与银屑病相关的角质形成细胞亚群及其分子机制 | 首次在单细胞水平上系统鉴定了银屑病皮肤角质层和颗粒层中特定的角质形成细胞功能亚群，并阐明了它们参与的关键信号通路 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证；样本量相对有限；未进行体内功能实验验证 | 探究银屑病发病机制中角质形成细胞的具体功能亚群及其分子特征 | 正常和银屑病皮肤组织 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-01-23 |
Bacterial phenotypic heterogeneity through the lens of single-cell RNA sequencing
2024 Feb-Apr, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2024.2334110
PMID:38532542
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在研究细菌表型异质性方面的应用与前景 | 将单细胞转录组学技术应用于微生物群体，为研究细胞分化和细菌生态学提供了新的视角 | 作为一篇综述文章，未涉及具体实验数据或方法验证 | 探讨细菌转录异质性及其在微生物系统中的作用 | 细菌群体及其转录异质性 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-01-13 |
A comprehensive database of exosome molecular biomarkers and disease-gene associations
2024-02-15, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03015-7
PMID:38360815
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研究论文 | 本研究开发了一个全面的外泌体核酸生物标志物和疾病-基因关联数据库ExMdb，整合了已发表文献和高通量数据集 | 首次构建了系统整合外泌体核酸生物标志物、疾病-基因关联和高通量测序数据的综合数据库，并进行了全面的生物信息学分析 | 数据库主要基于已发表数据，缺乏实验验证；癌症相关外泌体核酸的系统研究仍面临挑战 | 建立外泌体生物标志物数据库，研究复杂疾病的调控机制并促进诊断和治疗生物标志物的开发 | 外泌体核酸生物标志物、疾病-基因关联、高通量测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 文本数据、测序数据 | 4586个实验支持的基因-疾病关联、13768个诊断和治疗生物标志物、312049个核酸亚细胞定位、164个高通量数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-01-13 |
A single cell RNAseq benchmark experiment embedding "controlled" cancer heterogeneity
2024-02-02, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03002-y
PMID:38307867
|
研究论文 | 本文介绍了一个基于10X Genomics scRNA-seq的实验，通过使用表达七种不同驱动基因的肺癌细胞系，创建了一个受控的异质性环境，旨在为分析癌症异质性的方法提供基准数据集 | 利用表达特定驱动基因的肺癌细胞系构建了一个受控的异质性scRNA-seq基准数据集，为癌症异质性分析方法提供了验证框架 | NA | 为癌症异质性分析方法的开发和验证提供基准数据集 | 肺癌细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 11 | 2025-11-06 |
Integrating single-cell RNA-seq datasets with substantial batch effects
2024-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.03.565463
PMID:37961672
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研究论文 | 本文提出一种改进的条件变分自编码器方法，用于整合具有显著批次效应的单细胞RNA测序数据集 | 引入并比较多种正则化约束策略，提出结合VampPrior和循环一致性损失的新模型sysVI | 方法主要针对cVAE框架，对其他整合方法的适用性需要进一步验证 | 开发能够有效处理显著批次效应同时保留生物学变异的单细胞数据整合方法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器(cVAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-17 |
A call for a unified and multimodal definition of cellular identity in the enteric nervous system
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.15.575794
PMID:38293133
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评论 | 本文呼吁建立统一的多模态细胞身份定义方法以研究肠神经系统 | 强调整合多组学数据和创新技术来重新定义肠神经系统细胞身份 | 当前研究过度依赖转录组数据且缺乏组织验证 | 建立肠神经系统细胞身份的统一定义标准 | 小鼠和人类肠神经系统数据集 | 单细胞生物学 | 肠神经病变 | 单细胞转录组测序, 多重成像, 电生理学, 空间转录组学, 表观基因组分析, 蛋白质组学, 代谢组学 | 差异基因表达分析, 模块评分, 共表达分析, 层次聚类, 数据整合, 标签转移 | 单细胞转录组数据, 多组学数据 | 多个独立报告的ENS数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-16 |
Cortical somatostatin long-range projection neurons and interneurons exhibit divergent developmental trajectories
2024-Feb-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.11.013
PMID:38086373
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了小鼠大脑皮层中表达生长抑素的抑制性神经元在发育过程中的分化轨迹 | 首次发现SST+抑制性神经元在胚胎阶段就分为长程投射神经元和两种中间神经元类型，并遵循不同的发育轨迹 | 研究仅针对小鼠模型，且中间神经元的多样性可能在出生后早期继续完善 | 探究大脑皮层抑制性神经元的发育多样性和分化机制 | 小鼠大脑皮层中表达生长抑素(SST+)的抑制性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-05 |
Lupus dermal fibroblasts are proinflammatory and exhibit a profibrotic phenotype in scarring skin disease
2024-02-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173437
PMID:38358820
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研究论文 | 本研究探讨狼疮皮肤成纤维细胞的炎症反应特征及其在瘢痕形成中的作用机制 | 首次揭示系统性红斑狼疮成纤维细胞对炎症的过度反应特性，并发现瘢痕与非瘢痕患者存在差异性的TGF-β反应通路 | 样本量有限（56例），仅针对皮肤成纤维细胞进行研究 | 探究皮肤狼疮患者瘢痕形成的细胞机制 | 系统性红斑狼疮和皮肤狼疮患者的真皮成纤维细胞 | 细胞生物学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序，细胞因子刺激实验 | NA | 基因表达数据 | 22例狼疮患者和34例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-05 |
Single-cell analyses of metastatic bone marrow in human neuroblastoma reveals microenvironmental remodeling and metastatic signature
2024-02-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173337
PMID:38358826
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析神经母细胞瘤骨转移骨髓微环境，揭示免疫细胞重塑和转移特征 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘神经母细胞瘤骨转移微环境的细胞组成和转录重编程特征 | 样本量相对有限，需要更大队列验证发现 | 探究神经母细胞瘤骨转移的微环境机制和开发新治疗策略 | 神经母细胞瘤患者的骨髓样本 | 单细胞组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含转移和非转移患者的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-05 |
Obesogenic diet disrupts tissue-specific mitochondrial gene signatures in the artery and capillary endothelium
2024-Feb-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 本研究通过RNA测序技术探究肥胖饮食对动脉和毛细血管内皮细胞线粒体基因表达的影响 | 首次揭示肥胖饮食导致脂肪和肠系膜内皮细胞表型趋同的机制，发现PPAR-γ在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限 | 探究肥胖对内皮细胞代谢表型，特别是线粒体基因表达的影响 | 小鼠和人类脂肪组织及肠系膜的内皮细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖相关代谢疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠脂肪和肠系膜血管内皮细胞，人类内脏脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-05 |
A human stomach cell type transcriptome atlas
2024-02-14, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01812-5
PMID:38355543
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研究论文 | 通过整合相关性分析方法构建人类胃部细胞类型转录组图谱 | 首次利用未分级的胃部RNAseq数据预测胃部细胞类型转录组特征，填补了主要单细胞测序图谱中胃部细胞类型基因富集谱的空白 | 基于相关性分析的预测方法而非直接单细胞测序，可能无法完全捕获细胞异质性 | 建立人类胃部细胞类型特异性基因表达图谱 | 人类胃部细胞（壁细胞、主细胞、胃黏液细胞、胃肠内分泌细胞等11种细胞类型） | 单细胞生物学 | 胃癌 | RNA-seq，整合相关性分析 | 相关性分析模型 | RNA测序数据 | 359名个体的未分级胃部RNAseq数据 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-10-05 |
Defining the T cell transcriptional landscape in pediatric liver transplant rejection at single cell resolution
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582173
PMID:38464256
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了儿童肝移植排斥反应中T细胞的转录组特征 | 首次在单细胞分辨率下定义了儿童肝移植排斥中CD8+ T细胞的克隆扩增和基因表达特征，并发现这些克隆在组织学排斥缓解后仍持续存在 | 样本量相对较小（14名患者），且为回顾性研究 | 探究儿童肝移植急性细胞排斥反应中T细胞的转录组特征和免疫应答机制 | 儿童肝移植患者的肝脏活检组织 | 单细胞生物学 | 肝移植排斥反应 | 单细胞测序，免疫受体谱分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 14名患者的30份冷冻肝脏活检组织（5份移植前或无排斥，9份有排斥） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞免疫受体谱分析 |
| 19 | 2025-10-05 |
Model-based dimensionality reduction for single-cell RNA-seq using generalized bilinear models
2024-Feb-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.21.537881
PMID:37162914
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研究论文 | 开发了一种基于广义双线性模型的单细胞RNA测序数据降维新方法scGBM | 提出使用泊松双线性模型直接建模计数数据，引入快速估计算法可扩展到数百万细胞的数据集，并能量化细胞潜在位置的不确定性 | 未明确说明方法在其他单细胞数据类型上的适用性 | 解决单细胞RNA测序数据降维中标准方法可能诱导虚假异质性和掩盖真实生物学变异的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义双线性模型,泊松双线性模型 | 基因表达计数数据 | 可扩展到数百万细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Molecular Signatures of Glomerular Neovascularization in a Patient with Diabetic Kidney Disease
2024-Feb-01, Clinical journal of the American Society of Nephrology : CJASN
IF:8.5Q1
DOI:10.2215/CJN.0000000000000276
PMID:37533147
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研究论文 | 通过空间转录组学技术分析糖尿病肾病患者肾活检样本中肾小球新生血管的分子特征 | 首次使用三维免疫荧光成像和空间转录组学揭示糖尿病肾病中肾小球周围新生血管的分子特征，突破了传统病理学评估的局限 | 仅基于单个病例分析，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索糖尿病肾病中肾小球新生血管的分子机制 | 66岁女性糖尿病肾病患者 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学，三维免疫荧光成像 | NA | 基因表达数据，影像数据 | 1例患者肾活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |