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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-11 |
Deciphering the heterogeneity of neutrophil cells within circulation and the lung cancer microenvironment pre- and post-operation
2024-02-06, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09850-z
PMID:38319415
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析非小细胞肺癌患者循环血和肿瘤微环境中中性粒细胞亚群的异质性 | 开发了过表达率(OER)计算方法来评估中性粒细胞亚群的特异性,并识别了具有潜在临床价值的基因面板 | 缺乏对中性粒细胞亚群识别标准的明确结论 | 评估中性粒细胞亚群分布特征以帮助非小细胞肺癌的诊断和预后 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织、癌旁组织及术前术后血液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-05-01 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals immune cell heterogeneity in acute myeloid leukaemia peripheral blood mononuclear cells after chemotherapy
2024-Feb, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00853-2
PMID:37615858
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研究论文 | 利用单细胞转录组测序揭示化疗后急性髓系白血病外周血单个核细胞中的免疫细胞异质性 | 首次在单细胞水平上描绘化疗后AML患者PBMC的免疫细胞图谱,发现NK细胞和单核-树突状细胞在转录因子表达和染色体拷贝数变异方面存在显著变化,并观察到造血干细胞祖细胞的拷贝数变异和细胞间相互作用网络高度异质 | 样本量较小(仅5位AML患者和6位健康供者),化疗方案不同可能引入混杂因素,未进行功能验证实验 | 探索化疗后急性髓系白血病患者的免疫微环境,为精准医学和免疫治疗提供见解 | 5名接受不同化疗方案的AML患者和6名健康供者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 91,772个高质量细胞(来自5名AML患者的44,950个PBMC和6名健康供者的46,822个PBMC) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'解决方案 |
| 3 | 2026-04-28 |
A model of human neural networks reveals NPTX2 pathology in ALS and FTLD
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07042-7
PMID:38355792
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研究论文 | 通过人类神经网络模型揭示ALS和FTLD中NPTX2的病理作用 | 首次利用iCoMoNSCs衍生的长寿命功能性神经网络iNets模拟TDP-43蛋白病,并鉴定出NTPX2作为TDP-43关键调控靶点,阐明其在神经毒性中的直接作用 | 未提及明确的局限性 | 研究TDP-43病理在神经退行性疾病中的出现机制及后果 | 诱导多能干细胞衍生的神经干细胞及其分化形成的神经网络 | 自然语言处理 | 肌萎缩侧索硬化症、额颞叶变性 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 患者样本(肌萎缩侧索硬化症和额颞叶变性患者) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 4 | 2026-04-28 |
Circulating myeloid-derived MMP8 in stress susceptibility and depression
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07015-2
PMID:38326622
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研究论文 | 循环髓系来源的MMP8在应激易感性和抑郁症中的作用 | 首次揭示外周髓系细胞特异性蛋白酶MMP8在应激易感性和抑郁症中通过直接浸润脑区影响细胞外空间和神经生理的机制 | 未明确MMP8从外周进入脑实质的具体分子途径,且研究主要基于小鼠模型,人类数据仅涉及血清水平检测 | 探究外周免疫系统改变如何通过特定分子影响中枢神经系统功能和压力相关行为 | 人类重度抑郁症患者血清样本及慢性社交挫败应激小鼠模型 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据、蛋白质组学数据 | 人类患者血清样本与小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统用于免疫细胞高维表型分析 |
| 5 | 2026-04-15 |
Thrombospondin 2 is a key determinant of fibrogenesis in non-alcoholic fatty liver disease
2024-02, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15792
PMID:38010940
|
研究论文 | 本研究通过分析NAFLD患者的单细胞RNA测序数据、肝组织样本和LX-2细胞,揭示了THBS2/TSP2在肝星状细胞中的高表达及其通过TGFβ通路调控纤维化的机制 | 首次在NAFLD中通过单细胞RNA测序和原位杂交技术,明确了THBS2/TSP2在肝星状细胞中的特异性高表达,并发现其通过非经典TGFβ-SMAD2/3通路调控胶原生成 | 研究主要基于体外细胞模型(LX-2细胞)和基因数据集分析,缺乏体内实验验证;样本量未明确说明,可能影响结果的普适性 | 识别NAFLD中表达THBS2/TSP2的特定细胞,并探究其上调的分子机制 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)患者肝组织、肝星状细胞(HSCs)及LX-2细胞系 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、定量聚合酶链反应(qPCR)、原位杂交、计算生物学、遗传学、免疫学和药理学方法 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、肝组织样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-04-14 |
SPINK1 Overexpression Correlates with Hepatocellular Carcinoma Treatment Resistance Revealed by Single Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics
2024-02-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14030265
PMID:38540686
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了SPINK1过表达与肝细胞癌治疗耐药性之间的关联 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统阐明了SPINK1在肝细胞癌治疗耐药中的作用机制,并发现其通过上调药物代谢调节因子(如CYP3A4和ABCB1)来促进耐药性 | 研究主要基于相关性分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证SPINK1作为治疗靶点的直接疗效 | 探究SPINK1对肝细胞癌治疗耐药性的影响及其分子机制 | 肝细胞癌(HCC)细胞及患者样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 两个肝细胞癌队列的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-04-14 |
Peripheral Lymphocytes in Primary Liver Cancers: Elevated NK and CD8+ T Cells and Dysregulated Selenium Metabolism
2024-02-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14020222
PMID:38397459
|
研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞测序技术,探讨了原发性肝癌(HCC和ICC)对外周血淋巴细胞(PBLs)的影响,发现NK细胞和CD8+ T细胞数量升高且与复发风险相关,并揭示了硒代谢异常 | 首次系统评估原发性肝癌对外周血淋巴细胞的影响,结合单细胞测序发现CD8+ T细胞中TGFβ信号下调及硒代谢通路异常,并通过蛋白质组学验证SELENBP1和SEPP1的表达变化 | 样本来源可能有限,未详细说明具体样本量或患者队列特征,且依赖公共数据库(GEO)数据,可能影响结果普适性 | 探究原发性肝癌(HCC和ICC)对外周血淋巴细胞组成和功能的影响,并分析其与临床预后的关联 | 原发性肝癌患者(包括肝细胞癌和肝内胆管癌)及良性肝病患者的外周血淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,生物信息学分析,蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞术数据,蛋白质组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序技术 |
| 8 | 2026-04-12 |
Therapeutic application of human type 2 innate lymphoid cells via induction of granzyme B-mediated tumor cell death
2024-02-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.12.015
PMID:38211590
|
研究论文 | 本文探讨了人类2型先天淋巴样细胞(ILC2s)通过诱导颗粒酶B介导的肿瘤细胞死亡在肿瘤治疗中的潜在应用 | 首次发现人类ILC2s分泌颗粒酶B并直接裂解肿瘤细胞,通过DNAM-1-CD112/CD155相互作用调控,揭示了其在抗肿瘤免疫中的新角色 | 未明确长期安全性或临床转化中的具体挑战 | 研究人类ILC2s的抗肿瘤机制及其治疗潜力 | 人类2型先天淋巴样细胞、急性髓系白血病细胞及实体瘤模型 | 免疫学 | 白血病、实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-04-10 |
Exercise mitigates flow recirculation and activates metabolic transducer SCD1 to catalyze vascular protective metabolites
2024-02-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7481
PMID:38354249
|
研究论文 | 本研究探讨了运动如何通过减少血流再循环并激活代谢转导酶SCD1来催化保护性脂质代谢物,从而改善血管内皮功能 | 首次揭示了运动通过调节血流动力学(如减少再循环和振荡剪切指数)并激活内皮SCD1酶,催化油酸和棕榈油酸等抗炎脂质代谢物,为血管保护提供新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证;SCD1的具体信号通路和长期效应需进一步探索 | 探究运动如何通过代谢转导酶SCD1介导血管保护作用,以改善心脏代谢疾病 | 野生型小鼠、内皮特异性SCD1敲除小鼠、高脂饮食诱导的小鼠模型以及小鼠主动脉组织 | NA | 心血管疾病 | 非靶向代谢组学分析、单细胞转录组学、计算机模拟分析、腺病毒转染 | NA | 代谢组数据、转录组数据、计算机模拟数据 | 未明确指定样本数量,涉及多种基因型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-04-10 |
Hypoblast from human pluripotent stem cells regulates epiblast development
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06871-2
PMID:38052228
|
研究论文 | 本研究通过遗传和非遗传方法从人类多能干细胞生成真正的下胚层细胞,并构建了模拟胚胎发育的三维双层结构 | 首次从人类多能干细胞生成真实的下胚层细胞,并成功构建了能模拟胚胎前后轴模式和前原肠胚阶段细胞形成的三维双层结构 | 研究受限于体外模型,可能无法完全复制体内胚胎发育的复杂性 | 研究人类胚胎发育过程中下胚层和滋养外胚层对胚胎发育的调控机制 | 人类多能干细胞、下胚层细胞、滋养外胚层细胞、三维双层结构 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-04-05 |
Autoreactive T cells target peripheral nerves in Guillain-Barré syndrome
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06916-6
PMID:38233524
|
研究论文 | 本研究通过体外T细胞筛选、单细胞RNA测序和T细胞受体测序,揭示了吉兰-巴雷综合征患者中靶向周围神经髓鞘抗原的自反应性T细胞的存在及其特征 | 首次在吉兰-巴雷综合征患者中鉴定出具有细胞毒性T辅助1样表型的自反应性记忆CD4 T细胞和罕见CD8 T细胞,并证明这些细胞在血液和脑脊液中共享,且直接参与疾病病理生理 | 研究样本量有限,仅从一名患者的神经活检中鉴定出自反应性T细胞,且疾病亚型聚焦于脱髓鞘变异型 | 探究吉兰-巴雷综合征的自免疫机制,特别是自反应性T细胞在疾病中的作用 | 吉兰-巴雷综合征患者(尤其是脱髓鞘变异型)的血液、脑脊液和神经活检样本 | 免疫学 | 吉兰-巴雷综合征 | 体外T细胞筛选、单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 | 超过1,000个自反应性单T细胞克隆,来自多名患者和对照个体的血液、脑脊液及一名患者的神经活检 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-03-30 |
Extracting, filtering and simulating cellular barcodes using CellBarcode tools
2024-02, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00595-7
PMID:38374363
|
研究论文 | 本文介绍了CellBarcode工具包及其条形码模拟套件CellBarcodeSim,用于从批量或单细胞测序数据中高效、灵活地提取和过滤多种条形码类型 | 开发了支持多种条形码类型和分析策略的通用工具,并提供了条形码模拟功能以优化识别过程 | 未明确提及具体的技术限制或性能边界 | 提高DNA细胞条形码识别的准确性和可重复性 | DNA细胞条形码 | 生物信息学 | NA | PCR和测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞测序, 批量测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-03-21 |
Characterization of the m6A/m1A/m5C/m7G-related regulators on the prognosis and immune microenvironment of glioma by integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2024-02, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3666
PMID:38391150
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,分析了m6A/m1A/m5C/m7G相关调节因子在胶质瘤预后和免疫微环境中的作用 | 首次整合了m6A、m1A、m5C和m7G四种RNA甲基化调节因子,在胶质瘤中分析其与预后和肿瘤内异质性的关系 | NA | 研究RNA甲基化调节因子对胶质瘤预后和免疫微环境的影响 | 胶质瘤患者样本 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 机器学习方法, 多元Cox回归分析 | RNA测序数据 | 三个内部单细胞RNA测序数据集和一个公开批量RNA测序数据队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-03-13 |
A Cell Cycle-aware Network for Data Integration and Label Transferring of Single-cell RNA-seq and ATAC-seq
2024-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.31.578213
PMID:38352302
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研究论文 | 本文开发了一种细胞周期感知网络(CCAN),用于在整合单细胞多组学数据时去除细胞周期效应,同时保留细胞类型特异性变异 | 这是首个研究单细胞多组学数据整合中细胞周期效应的计算模型 | NA | 研究单细胞多组学数据整合中的细胞周期效应,并开发去除该效应的方法 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞ATAC测序(scATAC-seq)数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 细胞周期感知网络(CCAN) | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-03-13 |
Tracking early mammalian organogenesis - prediction and validation of differentiation trajectories at whole organism scale
2024-02-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201867
PMID:37982461
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序追踪小鼠早期器官发生过程,结合计算预测和实验验证,揭示了细胞分化轨迹 | 整合了高密度时间点单细胞数据(从E6.5到E9.5),首次在整体生物尺度上预测并验证了分化轨迹,发现了新的体节来源内皮程序 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于其他物种;时间范围限于早期器官发生阶段 | 追踪早期哺乳动物器官发生过程,建立细胞状态与命运关系的高分辨率图谱 | 小鼠胚胎(E6.5至E9.5阶段) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 计算谱系重建模型 | 单细胞转录组数据 | 超过400,000个细胞(包括300,000个新采样细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-03-10 |
Comprehensive Integration of Multiple Single-Cell Transcriptomic Data Sets Defines Distinct Cell Populations and Their Phenotypic Changes in Murine Atherosclerosis
2024-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320030
PMID:38152886
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研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞转录组数据集,定义了小鼠动脉粥样硬化中不同的细胞群体及其表型变化 | 开发了基于报告基因表达的算法来量化平滑肌细胞向巨噬细胞表型的转分化,并整合多个数据集进行元分析以解决现有研究中的不一致发现 | 研究受限于现有数据集的实验条件,且转分化事件在检测范围内极为罕见 | 解决动脉粥样硬化单细胞RNA测序研究中的不一致结果,并深入理解驻留血管细胞在疾病中的作用 | 小鼠动脉粥样硬化模型中的血管细胞,包括平滑肌细胞、内皮细胞和主动脉瓣细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,原位杂交 | 分类算法 | 单细胞转录组数据,图像数据 | 多个已发表数据集的整合,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-03-06 |
Technical optimization of spatially resolved single-cell transcriptomic datasets to study clinical liver disease
2024-02-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53993-2
PMID:38351241
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单核RNA测序技术,优化了临床肝病样本的处理和分析流程,生成了空间分辨的单细胞数据集 | 首次结合空间转录组学和单核RNA测序,在肝纤维化样本中建立了组织处理、数据分析和细胞互作评估的优化框架 | 样本量有限,空间转录组学尚未达到单细胞分辨率,且组织保存技术对数据有影响 | 优化空间分辨单细胞转录组数据集的技术流程,以研究临床肝病 | 来自组织学正常或晚期纤维化患者的匹配肝样本 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 匹配的肝样本(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-03-02 |
Obesogenic diet disrupts tissue-specific mitochondrial gene signatures in the artery and capillary endothelium
2024-Feb-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨了肥胖如何通过影响动脉和毛细血管内皮细胞中的线粒体基因表达,导致内皮功能障碍 | 揭示了肥胖饮食下调PPAR-γ,导致脂肪和肠系膜内皮细胞表型趋同的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证有限,且未深入探究PPAR-γ下游的具体分子通路 | 理解肥胖对内皮细胞代谢表型,特别是线粒体基因表达的影响 | 小鼠和人类的内皮细胞,重点关注脂肪和肠系膜血管床 | 生物信息学 | 肥胖相关代谢疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-nuclei RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 小鼠脂肪和肠系膜血管内皮细胞,以及人类内脏脂肪单核RNA-seq数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-nuclei RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-03-02 |
Enabling methanol fixation of pediatric nasal wash during respiratory illness for single cell sequencing in comparison with fresh samples
2024-Feb, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-023-02780-2
PMID:37758866
|
研究论文 | 本研究开发了一种用于儿童下呼吸道感染患者鼻腔冲洗样本的甲醇固定方案,并验证了其用于单细胞RNA测序的可行性 | 首次提出并验证了甲醇固定法可用于保存儿童鼻腔冲洗样本以进行单细胞RNA测序,解决了临床样本处理灵活性和多中心合作的难题 | 本研究为初步研究,样本量有限,且仅针对儿童下呼吸道感染患者 | 开发并验证一种适用于儿童呼吸道感染临床样本的单细胞测序样本保存方法 | 因下呼吸道感染住院儿童的鼻腔冲洗样本 | 单细胞测序 | 下呼吸道感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 初步研究,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-02-17 |
Molecular portraits of patients with intrahepatic cholangiocarcinoma who diverge as rapid progressors or long survivors on chemotherapy
2024-02-23, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330748
PMID:37758326
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研究论文 | 本研究通过分析肝内胆管癌患者化疗前的分子特征,预测其对化疗的反应差异,并揭示了肿瘤-髓系细胞相互作用在先天化疗耐药中的关键作用 | 首次基于化疗前诊断活检的转录组特征,区分出化疗快速进展者与长期生存者,并发现该特征源于肿瘤-髓系细胞动态失衡,与肝微环境密切相关 | 研究样本量有限,且为回顾性分析,需要在前瞻性队列中进一步验证和开发该转录组特征 | 预测晚期肝内胆管癌患者对化疗的获益差异,并阐明先天化疗耐药的分子基础 | 晚期肝内胆管癌患者的诊断活检组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全转录组测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、转录组数据 | 一组基线特征可比的晚期肝内胆管癌患者(包括快速进展者和长期生存者) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | GeoMx | 靶向数字空间分析平台 |