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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-30 |
Cellular Senescence Contributes to the Progression of Hyperoxic Bronchopulmonary Dysplasia
2024-02, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0038OC
PMID:37874230
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研究论文 | 本研究探讨细胞衰老在支气管肺发育不良(BPD)进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序证明高氧诱导的BPD中多种细胞类型(包括2型肺泡细胞)存在细胞衰老,并验证Foxo4-p53结合增加 | 未提及具体限制 | 验证细胞衰老是否促进高氧性支气管肺发育不良的进展 | 人类尸检肺组织及暴露于95%氧气的Sprague-Dawley新生大鼠 | 数字病理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 组织学, 转录组学, 免疫印迹 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 人类尸检肺组织及新生大鼠(P1-P10) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2 | 2026-06-26 |
Preservation of scRNA-Seq Libraries Using Existing Inactivation Protocols
2024-02-13, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens13020167
PMID:38392905
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研究论文 | 本文测试了使用现有灭活方案从高安全级别实验室移除单细胞RNA测序文库的可行性,并证明灭活不影响样本质量 | 首次验证了将现有核酸提取灭活方案用于移除单细胞测序文库,无需开发新方法即可安全操作 | 未明确说明不同灭活方案对特定病原体或极端条件下的适用性比较 | 评估现有灭活方案在处理单细胞RNA测序文库时的有效性和样本完整性 | 单细胞RNA测序文库在生物安全3级及以上实验室中的处理 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-06-26 |
Residual ANTXR1+ myofibroblasts after chemotherapy inhibit anti-tumor immunity via YAP1 signaling pathway
2024-02-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45595-3
PMID:38346978
|
研究论文 | 化疗后残留的ANTXR1+肌成纤维细胞通过YAP1信号通路抑制抗肿瘤免疫 | 揭示了化疗对高级别浆液性卵巢癌中CAF亚群的不同影响,并发现ECM-myCAF通过YAP1通路抑制CD8 T细胞毒性,为靶向治疗提供新方向 | 未探讨其他CAF亚群在化疗后的具体作用机制,且样本量和临床验证有限 | 研究化疗对高级别浆液性卵巢癌中CAF亚群的影响及其免疫抑制机制 | 高级别浆液性卵巢癌中的癌症相关成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞分析、空间转录组学、免疫组织化学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 用于单细胞RNA测序和空间转录组分析的10x平台 |
| 4 | 2026-06-26 |
Tertiary lymphoid structures sustain cutaneous B cell activity in hidradenitis suppurativa
2024-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169870
PMID:38113104
|
研究论文 | 该研究结合组织学分析、单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了化脓性汗腺炎(HS)皮肤病变中三级淋巴结构的存在及其在B细胞活动中的作用 | 首次在HS皮肤病变中鉴定出三级淋巴结构,并描述了其内B细胞的成熟过程,包括生发中心反应和类别转换重组 | NA | 探究HS皮肤病变中B细胞的动态变化及其微环境相互作用 | 化脓性汗腺炎患者的皮肤病变组织 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,组织学分析 | NA | 图像,文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3',10x Visium |
| 5 | 2026-06-26 |
Molecular Insights From Multiomics Studies of Physical Activity
2024-02-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi23-0004
PMID:38241506
|
综述 | 基于多组学技术研究体力活动的分子效应,探讨其系统性健康效益的机制 | 系统整合多种组学技术(代谢组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、脂质组学、单细胞RNA测序及表观基因组学)全面揭示体力活动对全身器官及分子通讯的影响 | 未提及具体局限性,但作为综述可能缺乏对特定组学技术深度定量分析的验证 | 揭示多组学技术如何提升对体力活动系统性效应(器官间整合反应及组织通讯分子机制)的理解 | 体力活动相关的全身性分子变化及组织间通讯机制 | 机器学习 | NA | NA | NA | 多组学数据(代谢组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组、脂质组、单细胞转录组、表观基因组) | NA | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学, 脂质组学, 表观基因组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-06-19 |
Accurate single-molecule spot detection for image-based spatial transcriptomics with weakly supervised deep learning
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.03.556122
PMID:37732188
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研究论文 | 提出Polaris分析流程,利用弱监督深度学习实现图像空间转录组学中准确的单分子点检测 | 将深度学习模型用于细胞分割和点检测,结合概率基因解码器,提供统一的一键式解决方案,适用于MERSFISH、seqFISH或ISS实验 | NA | 开发准确分析图像空间转录组数据的统一流程 | 图像空间转录组数据中的单分子和单细胞基因表达 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-06-18 |
Cortical somatostatin long-range projection neurons and interneurons exhibit divergent developmental trajectories
2024-02-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.11.013
PMID:38086373
|
研究论文 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学,研究小鼠皮层中表达生长抑素的抑制性神经元的发育轨迹 | 首次揭示SST+抑制性神经元在胚胎期分化为长投射神经元和两种中间神经元,并遵循不同的发育路径 | 中间神经元多样性可能需要在出生后早期进一步细化,文中未提供出生后阶段的详细数据 | 探究皮层抑制性神经元的细胞多样性出现的时间和机制 | 小鼠皮层中表达生长抑素的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎和出生后早期样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3',空间转录组学平台 |
| 8 | 2026-06-18 |
The role of NF-κB signaling pathway in reactive astrocytes among neurodegeneration after methamphetamine exposure by integrated bioinformatics
2024-02-08, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.pnpbp.2023.110909
PMID:38061485
|
研究论文 | 通过整合生物信息学方法,探究NF-κB信号通路在甲基苯丙胺暴露后反应性星形胶质细胞导致神经退行性变中的作用 | 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,系统分析METH暴露后反应性星形胶质细胞的免疫微环境变化及其与帕金森病的共同致病机制,并利用随机森林算法建立诊断模型 | 未提及具体局限性,可能包括样本数量有限、动物模型与人类差异、以及NF-κB通路调控机制在体内外的验证不足 | 阐明METH暴露后反应性星形胶质细胞过度激活在神经退行性变中的作用及NF-κB信号通路的机制 | METH暴露后小鼠脑组织中的星形胶质细胞和神经元,以及人类GEO数据库中的转录组数据 | 机器学习 | 神经退行性疾病(帕金森病) | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 随机森林 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-06-15 |
Rapid anti-myeloma activity by T cells expressing an anti-BCMA CAR with a human heavy-chain-only antigen-binding domain
2024-02-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2023.12.018
PMID:38155568
|
研究论文 | 开发了一种全人源抗BCMA嵌合抗原受体T细胞疗法FHVH-T,并在复发多发性骨髓瘤患者中进行了首次人体临床试验,显示出快速、持久且强大的抗肿瘤活性 | 首次使用仅含重链抗原识别域的全人源抗BCMA CAR,结合4-1BB和CD3ζ结构域,设计为FHVH33-CD8BBZ,并在25例患者中验证了其高严格完全缓解率和良好的安全性 | 部分患者(4/12)产生了抗CAR抗体反应,且细胞因子释放综合征3级发生率为25%,需进一步优化降低免疫原性和毒性 | 评估全人源抗BCMA CAR T细胞疗法(FHVH-T)在复发多发性骨髓瘤中的安全性和疗效 | 25例复发多发性骨髓瘤患者 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 25例患者(其中24例可评估) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 10 | 2026-06-02 |
Tissue niches and immunopathology through the lens of spatial tissue profiling techniques
2024-02, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350484
PMID:37985207
|
综述 | 本综述通过空间组织分析技术探讨了组织微环境与免疫病理学的关系,强调了多组学组织学和空间转录组学在研究免疫反应中的重要性 | 综合讨论了空间组织分析技术相较于传统组织病理学研究的优势,并指出了其在疾病诊断和治疗中的革命性潜力 | 承认了空间组织分析技术存在挑战和局限性 | 探讨空间组织分析技术如何揭示组织微环境调控区域免疫的机制,及其在组织免疫病理学中的相关性 | 组织微环境、免疫反应、空间组织分析技术 | 计算机视觉, 机器学习 | 癌症, 自身免疫性疾病, 感染性疾病 | 空间转录组学, 多重组织学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学, 多重组织学 | NA | NA |
| 11 | 2026-06-02 |
Distinct immune escape and microenvironment between RG-like and pri-OPC-like glioma revealed by single-cell RNA-seq analysis
2024-Feb, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-1017-7
PMID:37955814
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq分析揭示RG样和pri-OPC样胶质瘤之间不同的免疫逃逸和微环境特征 | 首次将胶质瘤分为原始少突胶质前体细胞样和放射状胶质样亚型,并发现它们在免疫逃逸机制上的显著差异,尤其是pri-OPC样肿瘤中MHC-I基因下调以及肿瘤浸润淋巴细胞中特定基因表达与免疫检查点和不良预后的关联 | 样本量较小,仅基于26例胶质瘤的单细胞RNA-seq分析,且结论主要依赖公共数据库验证,可能缺乏广泛的临床代表性 | 研究神经发生和胶质发生与胶质瘤的关系,揭示不同胶质瘤亚型的免疫逃逸机制 | 26例胶质瘤样本及其肿瘤浸润淋巴细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组表达数据 | 26例胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-06-02 |
Tumor-derived exosomes induce initial activation by exosomal CD19 antigen but impair the function of CD19-specific CAR T-cells via TGF-β signaling
2024-Feb, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-1010-1
PMID:37870681
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研究论文 | 研究了肿瘤来源外泌体通过外泌体CD19抗原诱导初始激活,但通过TGF-β信号损害CD19特异性CAR-T细胞功能 | 首次揭示了B细胞淋巴瘤来源外泌体对CD19-CAR T细胞的双重作用:初始激活与后续抑制,并发现TGF-β抑制剂可逆转抑制作用 | 未明确外泌体诱导CAR-T细胞凋亡和功能损害的具体分子机制细节 | 探究淋巴瘤来源外泌体对CD19-CAR T细胞功能的影响及其机制 | B细胞淋巴瘤来源外泌体、CD19-CAR T细胞、淋巴瘤患者血浆外泌体 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究对象包括来自淋巴瘤患者的血浆外泌体及CD19-CAR T细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 13 | 2026-05-31 |
A single-cell atlas of the murine pancreatic ductal tree identifies novel cell populations with potential implications in pancreas regeneration and exocrine pathogenesis
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582044
PMID:38463969
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建小鼠胰腺导管树图谱,发现新的导管细胞群体及其在胰腺再生和外分泌病理中的潜在作用 | 首次在单细胞分辨率下全面描绘从小叶中心细胞到主导管的整个小鼠胰腺导管上皮图谱,鉴定出15个导管细胞群体及其器官形成和内分泌分化能力 | 未提供具体限制信息 | 探究胰腺导管细胞在单细胞水平上的异质性及其在胰腺再生和外分泌发病机制中的作用 | 小鼠胰腺导管上皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 健康小鼠胰腺样本、慢性胰腺炎和胰腺肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-05-30 |
Single-cell transcriptomics analysis of cellular heterogeneity and immune mechanisms in neurodegenerative diseases
2024-02, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.16242
PMID:38221677
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学分析在神经退行性疾病中细胞异质性和免疫机制研究中的应用 | 深入探讨了单细胞转录组学技术在揭示神经退行性疾病中细胞异质性和免疫调控机制方面的最新进展 | NA | 强调单细胞转录组学技术的原理及其在神经退行性疾病细胞异质性和免疫机制研究中的最新进展 | 神经退行性疾病中的单细胞转录组 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-05-29 |
MMP14high macrophages orchestrate progressive pulmonary fibrosis in SR-Ag-induced hypersensitivity pneumonitis
2024-02, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107070
PMID:38218353
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析,发现MMP14高表达的巨噬细胞在SR-Ag诱导的过敏性肺炎中驱动进行性肺纤维化 | 首次鉴定出MMP14高表达的巨噬细胞亚群在纤维化过敏性肺炎中的作用,并揭示其通过外泌体MMP14调控成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未完全阐明人类纤维化过敏性肺炎中MMP14巨噬细胞的具体作用机制及临床转化潜力 | 探究MMP14高表达巨噬细胞在SR-Ag诱导的纤维化过敏性肺炎中的作用及机制 | 纤维化过敏性肺炎小鼠模型中的肺巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | 决策树模型 | 基因表达数据 | 未明确提及样本量 | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 16 | 2026-05-24 |
Single-cell analyses of metastatic bone marrow in human neuroblastoma reveals microenvironmental remodeling and metastatic signature
2024-02-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173337
PMID:38358826
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人神经母细胞瘤转移性骨髓,揭示微环境重塑和转移特征 | 首次通过单细胞水平比较分析有和无转移患者的骨髓微环境,揭示免疫细胞群体重塑、基因表达重编程及预后标志物 | 未提及具体限制 | 阐明神经母细胞瘤骨髓转移的细胞和分子机制,为开发新疗法提供依据 | 神经母细胞瘤患者的转移性骨髓样本 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个患者样本,包括有和无转移的神经母细胞瘤患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 17 | 2026-05-23 |
Obesogenic diet disrupts tissue-specific mitochondrial gene signatures in the artery and capillary endothelium
2024-02-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 通过转录组测序研究高脂饮食对脂肪和肠系膜内皮细胞线粒体基因表达的影响及其在肥胖中表型趋同的机制 | 首次揭示肥胖通过下调PPAR-γ导致脂肪动脉和毛细血管内皮细胞氧化磷酸化基因表达减少,进而使肠系膜与脂肪内皮细胞发生表型趋同 | NA | 探究肥胖如何影响内皮细胞代谢表型,特别是线粒体基因表达 | 小鼠脂肪和肠系膜血管内皮细胞,以及人类内脏脂肪组织 | 数字病理学 | 肥胖 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | NA | 测序数据 | 小鼠(正常饮食组和高脂饮食组)及人类内脏脂肪组织样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-05-23 |
Collagen induction of immune cells in the mammary glands during pregnancy
2024-02-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据,评估了妊娠-泌乳周期中乳腺脂肪垫的胶原动力学,发现免疫细胞异位表达胶原并参与细胞间相互作用 | 首次揭示妊娠阶段免疫细胞(包括淋巴系和髓系细胞)能异位产生I型和III型胶原,并显著增强细胞间胶原相互作用,为免疫细胞参与乳腺细胞外基质调控提供新证据 | 仅基于已有scRNA-Seq数据的二次分析,缺乏体内功能验证实验 | 探究妊娠-泌乳周期中乳腺胶原动态变化及免疫细胞在其中的作用 | 妊娠-泌乳周期中的乳腺脂肪垫组织及免疫细胞(淋巴系和髓系细胞) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量,基于公开scRNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-05-18 |
Metabolic Landscape of Osteosarcoma: Reprogramming of Lactic Acid Metabolism and Metabolic Communication
2024-02-22, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902083
PMID:38420794
|
研究论文 | 解码骨肉瘤中乳酸代谢重编程及其在肿瘤微环境中的作用,并鉴定NDUFAF6为预后生物标志物 | 首次通过单细胞基因表达数据揭示骨肉瘤中乳酸代谢高亚群,并发现其与其他亚群之间的独特代谢通讯模式 | 未提及具体局限性 | 探索骨肉瘤微环境中乳酸代谢的重编程及相关分子机制 | 骨肉瘤细胞的乳酸代谢模式和细胞间信号改变 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-05-18 |
The Role of CD8A in the Immune Microenvironment of Breast Cancer
2024-02-21, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902073
PMID:38420798
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研究论文 | 本研究探讨了CD8A在三阴性乳腺癌免疫微环境中的作用,发现其在转移灶中下调与良好预后相关 | 首次利用单细胞RNA测序揭示CD8A在原发性和转移性乳腺癌病灶免疫微环境中的细胞特异性表达变化 | 未说明 | 寻找三阴性乳腺癌的新治疗靶点 | 乳腺癌患者样本及公共数据库数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及GSE102818、GSE118389和GSE202695三个公共数据集及临床三阴性乳腺癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |