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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1961 | 2025-10-06 |
Deafness DFNB128 Associated with a Recessive Variant of Human MAP3K1 Recapitulates Hearing Loss of Map3k1-Deficient Mice
2024-Jun-27, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15070845
PMID:39062623
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研究论文 | 本研究通过发现MAP3K1基因的新型隐性变异与人类非综合征性耳聋DFNB128的关联,并利用小鼠模型验证其功能 | 首次发现MAP3K1基因隐性变异导致人类非综合征性耳聋,并通过计算模型预测其结构改变与表型的关系 | 研究仅基于一个近亲巴基斯坦家系,样本量有限 | 鉴定导致罕见形式耳聋的新致病基因 | 巴基斯坦近亲家系中的耳聋患者和小鼠耳蜗细胞 | 遗传学 | 耳聋 | 微阵列芯片, 外显子组测序, 单细胞转录组测序 | 计算结构建模 | 基因组数据, 转录组数据 | 一个巴基斯坦家系中的两个同胞群 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1962 | 2025-10-06 |
Inflammatory Alterations to Renal Lymphatic Endothelial Cell Gene Expression in Mouse Models of Hypertension
2024, Kidney & blood pressure research
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000539721
PMID:38972305
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高血压小鼠模型中肾淋巴管内皮细胞的基因表达变化 | 首次在高血压模型中系统揭示肾淋巴管内皮细胞的转录组多样性增加和炎症反应特征 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 评估高血压条件下肾淋巴管内皮细胞的具体变化 | 小鼠肾组织中的CD31+和podoplanin+细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种高血压小鼠模型(血管紧张素II诱导型和盐敏感型) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1963 | 2025-10-06 |
Impaired myofibroblast proliferation is a central feature of pathologic post-natal alveolar simplification
2024-Dec-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.94425
PMID:39660606
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多种小鼠模型揭示了肌成纤维细胞增殖受损是肺泡简化病理过程的核心特征 | 首次通过单细胞RNA测序在多种BPD模型中系统证实肌成纤维细胞增殖受损是肺泡简化的核心机制,而非传统认为的TGFβ信号增强 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究支气管肺发育不良(BPD)中肺泡简化的发病机制 | 早产儿支气管肺发育不良和多种小鼠肺泡简化模型 | 单细胞生物学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 药理学方法, 遗传学方法 | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1964 | 2025-10-06 |
Transcriptome Assembly at Single-Cell Resolution with Beaver
2024-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.04.621958
PMID:39574665
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Beaver的单细胞特异性转录本组装工具,用于短读长单细胞RNA测序数据 | 设计了转录本片段图结构,开发了高效的动态规划算法,并整合了两个基于51个精心设计特征的随机森林模型来准确估计候选转录本在单个细胞中表达的可能性 | 仅针对短读长scRNA-seq数据设计,未验证在其他单细胞测序技术上的表现 | 开发能够在单细胞分辨率下准确重建全长转录本的组装方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林, 动态规划算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq3 | Smart-seq3单细胞RNA测序技术 |
| 1965 | 2025-10-06 |
Endothelial KLF11 is a novel protector against diabetic atherosclerosis
2024-10-26, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02473-y
PMID:39462409
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研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞KLF11在糖尿病动脉粥样硬化中的保护作用机制 | 首次发现内皮KLF11通过抑制内皮-间质转化和炎症反应来保护糖尿病动脉粥样硬化 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究KLF11在糖尿病动脉粥样硬化中的保护机制 | 内皮细胞特异性KLF11转基因和敲除小鼠模型 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,功能获得和缺失实验 | NA | 基因表达数据 | 基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1966 | 2025-10-06 |
Atp13a5 Marker Reveals Pericyte Specification in the Mouse Central Nervous System
2024-Oct-23, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0727-24.2024
PMID:39261008
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学鉴定出小鼠中枢神经系统周细胞的特异性标记物Atp13a5,并建立了相应的基因工具模型 | 首次发现Atp13a5作为中枢神经系统周细胞的特异性标记物,并成功构建了兼具tdTomato报告基因和Cre重组酶的基因敲入模型 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探索中枢神经系统周细胞的功能特性和分子标记 | 小鼠中枢神经系统周细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组测序,基因敲入技术 | 基因敲入小鼠模型 | 单细胞转录组数据,成像数据 | 小鼠胚胎发育阶段(从E15开始)及成年小鼠组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1967 | 2025-10-06 |
CXCL9, CXCL10, and CCL19 synergistically recruit T lymphocytes to skin in lichen planus
2024-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179899
PMID:39190494
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现扁平苔藓中角质形成细胞和成纤维细胞特异性分泌CXCL9、CXCL10和CCL19细胞因子,并证实这些因子能协同增强CD8+ T细胞向皮肤的招募 | 首次揭示CCL19与CXCL9/CXCL10在T细胞招募中的协同作用机制,并发现CCL19可作为扁平苔藿治疗新靶点 | 样本量较小(仅7名患者),需更大规模研究验证发现 | 探究扁平苔藓的分子发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 扁平苔藓患者的配对血液和皮肤样本(病变和非病变组织) | 单细胞转录组学 | 扁平苔藓 | 单细胞RNA测序,体外迁移实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 | 7名扁平苔藓患者的配对血液和皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1968 | 2025-10-06 |
LMD: Cluster-Independent Multiscale Marker Identification in Single-cell RNA-seq Data
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.12.566780
PMID:38014159
|
研究论文 | 提出了一种名为LMD的新工具,用于在单细胞RNA测序数据中识别局部化基因标记 | 通过构建细胞-细胞亲和图并在细胞图上扩散基因表达值,基于扩散动力学为每个基因评分,实现多分辨率和细粒度的细胞多样性表征 | NA | 开发一种不依赖聚类的多尺度标记识别方法,用于单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图扩散算法 | 基因表达数据 | 9个单细胞RNA测序数据集,包括小鼠骨髓和毛囊真皮凝聚物数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1969 | 2025-10-06 |
The spatial impact of a Western diet in enriching Galectin-1-regulated Rho, ECM, and SASP signaling in a novel MASH-HCC mouse model
2024-Oct-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00660-3
PMID:39402682
|
研究论文 | 本研究通过新型MASH-HCC小鼠模型探讨西方饮食如何通过Galectin-1信号通路影响肿瘤微环境 | 开发了新型MASH-HCC小鼠模型,首次揭示西方饮食通过空间特异性方式调控Galectin-1介导的Rho信号、ECM重塑和SASP通路 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明西方饮食通过Galectin-1信号通路促进MASH向HCC发展的机制 | MASH-HCC小鼠模型和人类MASH-HCC组织 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学,多重免疫组织化学 | 小鼠疾病模型 | 空间转录组数据,免疫组织化学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学,多重免疫组织化学 | NA | NA |
| 1970 | 2025-10-06 |
Monocytes Reprogrammed by 4-PBA Potently Contribute to the Resolution of Inflammation and Atherosclerosis
2024-Sep-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325023
PMID:39224974
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用4-PBA重编程单核细胞的新方法,可有效促进炎症消退并减轻动脉粥样硬化 | 首次发现4-PBA可将单核细胞重编程为具有免疫调节功能的消退表型,并阐明其通过CD24介导抗炎活性传播的新机制 | 研究主要基于ApoE-/-小鼠模型,人体应用效果尚需验证 | 开发针对单核细胞的精准治疗方法以解决动脉粥样硬化中的慢性炎症 | 单核细胞和ApoE-/-小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫学方法, 生化遗传学方法, 共培养实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 高脂饮食喂养的ApoE-/-小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1971 | 2025-10-06 |
Fc-engineered antibodies promote neutrophil-dependent control of Mycobacterium tuberculosis
2024-Sep, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-024-01777-9
PMID:39174703
|
研究论文 | 本研究通过工程化改造识别结核分枝杆菌荚膜的抗体Fc区域,探索了抗体介导的结核病控制机制 | 构建了52种Fc变体抗体,首次发现Fc工程化抗体可通过中性粒细胞依赖性方式促进结核分枝杆菌限制 | 研究主要基于人类全血感染模型,尚未进行体内验证 | 探索抗体Fc介导的结核分枝杆菌限制机制及治疗潜力 | 结核分枝杆菌和工程化抗体 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序,Fc工程化 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1972 | 2025-10-06 |
Integration of Clinical Trial Spatial Multiomics Analysis and Virtual Clinical Trials Enables Immunotherapy Response Prediction and Biomarker Discovery
2024-Aug-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0943
PMID:38861365
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研究论文 | 本研究开发了一种计算模型,整合空间多组学分析和虚拟临床试验,用于预测肝细胞癌免疫治疗反应和发现生物标志物 | 开发了能够同时追踪器官尺度肿瘤进展和捕获肿瘤空间异质性的新型计算模型,将数学建模与高通量空间多组学数据相结合 | 模型参数主要来源于文献,需要进一步临床验证 | 促进免疫治疗方案设计和生物标志物发现 | 肝细胞癌患者 | 计算生物学 | 肝细胞癌 | 空间定量系统药理学模型,成像质谱流式技术,空间转录组学 | 空间定量系统药理学模型 | 空间多组学数据,空间蛋白质组学数据,空间转录组学数据 | 来自新辅助HCC临床试验和独立抗PD1单药治疗研究的样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组分析 |
| 1973 | 2025-10-06 |
A robust model for cell type-specific interindividual variation in single-cell RNA sequencing data
2024-Jun-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49242-9
PMID:38898015
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研究论文 | 开发了一种名为CTMM的新模型,用于检测和量化单细胞RNA测序数据中细胞类型特异性个体间变异 | 首次提出专门针对细胞类型特异性个体间变异的线性混合模型,能够识别传统方法难以发现的阶段特异性变异基因 | 单细胞RNA测序样本量相对较小,模型校准具有挑战性 | 开发统计模型来解析单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性个体间变异 | 人类诱导多能干细胞分化过程中的转录组变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1974 | 2025-10-06 |
A pathologically expanded, clonal lineage of IL-21-producing CD4+ T cells drives inflammatory neuropathy
2024-Jun-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178602
PMID:39087473
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术鉴定出驱动炎症性神经病变的IL-21产生型CD4+ T细胞克隆谱系 | 首次发现IL-21表达CD4+ T细胞在炎症性神经病变中的克隆扩增和多功能特性,揭示Tfh/Tph细胞亚群共同谱系分化途径 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明炎症性神经病变中致病性CD4+ T细胞的关键特性 | 炎症性神经病变小鼠模型中外周神经组织 | 免疫学 | 炎症性神经病变 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 1975 | 2025-10-06 |
Vascular restoration through local delivery of angiogenic factors stimulates bone regeneration in critical size defects
2024-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.07.003
PMID:39100886
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析骨缺损修复机制,并开发了搭载Spp1和Cxcl12的PCL/PLGA支架材料促进血管生成和骨再生 | 首次在单细胞水平揭示临界尺寸骨缺损中血管生成障碍的关键机制,并创新性地开发了可局部缓释Spp1和Cxcl12的双电纺支架材料 | 研究仅在小鼠模型中进行验证,尚未在大型动物或临床实验中测试 | 探索临界尺寸骨缺损的修复机制并开发促进骨再生的新型治疗方法 | 小鼠临界尺寸骨缺损模型及再生组织中的细胞群体 | 骨组织工程 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序,电纺丝技术,电喷雾技术 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织学数据,行为学数据 | 小鼠骨缺损模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1976 | 2025-10-06 |
Integrated Single-cell Multiomic Analysis of HIV Latency Reversal Reveals Novel Regulators of Viral Reactivation
2024-05-09, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae003
PMID:38902848
|
研究论文 | 通过整合单细胞多组学分析揭示HIV潜伏逆转的新调控因子 | 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq技术同时分析潜伏感染细胞的转录组和表观基因组特征,并利用机器学习预测病毒再激活 | 研究仅针对CD4+ T细胞,未涉及其他潜在HIV潜伏库细胞类型 | 揭示HIV潜伏逆转的分子机制和新型调控因子 | 约125,000个潜伏感染的原代CD4+ T细胞 | 单细胞多组学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 约125,000个原代CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1977 | 2025-10-06 |
Young glial progenitor cells competitively replace aged and diseased human glia in the adult chimeric mouse brain
2024-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01798-5
PMID:37460676
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研究论文 | 本研究通过移植年轻健康的人类胶质祖细胞成功替代成年嵌合小鼠大脑中的衰老和病变胶质细胞 | 首次发现年轻健康胶质祖细胞在成年大脑中具有竞争优势,能够通过YAP1/MYC/E2F信号通路取代衰老和病变胶质细胞 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床环境中验证 | 探究健康胶质细胞是否能在成年前脑中竞争取代病变人类胶质细胞 | 人类胶质祖细胞和亨廷顿病模型小鼠 | 神经科学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | 嵌合小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1978 | 2025-10-06 |
Marmosets contain multitudes
2024-Apr-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97866
PMID:38661001
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示狨猴携带来自其兄弟姐妹的遗传差异细胞的程度 | 利用单细胞RNA测序技术首次在狨猴中量化了来自兄弟姐妹的遗传嵌合细胞 | NA | 研究狨猴体内遗传嵌合现象 | 狨猴细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1979 | 2025-10-06 |
BuDDI: BulkDeconvolution withDomainInvariance to predict cell-type-specific perturbations from bulk
2024-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.20.549951
PMID:37503097
|
研究论文 | 提出BuDDI方法,通过域适应技术整合单细胞和批量RNA-seq数据来预测细胞类型特异性扰动效应 | 使用变分自编码器学习四个独立潜在空间,能够模拟细胞类型特异性扰动响应,无需单细胞扰动数据训练 | NA | 开发从批量数据推断细胞类型特异性扰动效应的方法 | 单细胞RNA-seq数据和批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1980 | 2025-10-06 |
Uncover spatially informed variations for single-cell spatial transcriptomics with STew
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae064
PMID:38827413
|
研究论文 | 提出一种名为STew的空间转录组多视图表示学习方法,用于联合分析空间信息和基因表达 | 开发了首个空间转录组多视图表示学习方法,能够有效利用空间信息揭示与基因表达共享的变异 | NA | 解决空间转录组数据分析中有效利用空间信息的挑战 | 人类背外侧前额叶皮层、小鼠主嗅球和银屑病皮肤组织 | 空间转录组学 | 银屑病 | 空间转录组学 | 多视图表示学习 | 空间转录组数据 | 多个数据集,包含数千个空间位置 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium, Slide-seqV2 | 10x Visium空间转录组技术、Slide-seqV2技术、10x Xenium单细胞空间转录组技术 |