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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 1941 - 1960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1941 | 2025-10-07 |
Bulk and single-cell transcriptome datasets of the mouse fetal and adult rete ovarii and surrounding tissues
2024-Apr-13, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03227-x
PMID:38615064
|
研究论文 | 本研究通过批量、单细胞和细胞核水平的转录组测序，揭示了小鼠胎儿和成年期卵巢网及其周围组织的转录组特征 | 首次系统性地对卵巢网三个区域进行多层次的转录组分析，并利用Pax8-rtTA; Tre-H2B-GFP转基因小鼠模型实现卵巢网特异性标记 | 研究局限于小鼠模型，卵巢网的具体功能意义仍需进一步实验验证 | 探索卵巢网在卵巢稳态和生理变化响应中的潜在功能 | 小鼠胎儿和成年期卵巢网组织及其周围组织 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠胎儿和成年期卵巢网组织样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | NA | NA |
| 1942 | 2025-10-07 |
Targeting metabolic sensing switch GPR84 on macrophages for cancer immunotherapy
2024-Feb-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03603-3
PMID:38349405
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现脂肪酸受体GPR84是调控肿瘤相关巨噬细胞抗肿瘤表型的重要代谢感应开关 | 首次发现GPR84作为代谢感应开关调控巨噬细胞抗肿瘤极化，并证明其激动剂6-OAU可增强抗PD-1疗法的疗效 | 研究主要基于小鼠肿瘤模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞代谢重编程机制以增强癌症免疫治疗效果 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及其GPR84受体 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组测序，基因敲除，药理学激活 | NA | 转录组数据 | 多个肿瘤模型的小鼠数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1943 | 2025-10-07 |
A model of human neural networks reveals NPTX2 pathology in ALS and FTLD
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07042-7
PMID:38355792
|
研究论文 | 本研究通过建立人类神经网络模型揭示了TDP-43蛋白病变中NPTX2积累的神经毒性机制 | 开发了新型均质化神经干细胞系(iCoMoNSCs)和长效功能性神经网络模型(iNets)，首次发现TDP-43通过3'UTR调控NPTX2表达并导致神经退行 | 模型虽能模拟年龄相关疾病但仍需验证其与真实人类大脑发育的一致性 | 探索TDP-43蛋白病变的发生机制及其在神经退行性疾病中的作用 | 诱导多能干细胞分化的神经网络模型及ALS/FTLD患者神经元 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症,额颞叶痴呆 | 单细胞转录组测序,干细胞分化,电生理记录 | 神经网络模型,类器官模型 | 基因表达数据,蛋白质组数据,电生理数据 | 未明确样本数量但包含患者神经元和干细胞衍生模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1944 | 2025-10-07 |
Innovative super-resolution in spatial transcriptomics: a transformer model exploiting histology images and spatial gene expression
2024-01-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae052
PMID:38436557
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研究论文 | 提出了一种基于Transformer架构的无监督模型TransformerST，用于提升空间转录组学的分辨率至单细胞水平 | 首次将Transformer架构应用于空间转录组学超分辨率分析，无需参考单细胞RNA测序数据，通过视觉Transformer编码器发掘图像-基因表达的潜在共表征 | 未提及具体的数据集验证范围和计算资源需求 | 提升空间转录组学技术的分辨率，实现单细胞级别的空间基因表达分析 | 空间转录组学数据，特别是Visium平台产生的多细胞水平数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | Transformer，视觉Transformer，图Transformer | 组织学图像，空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 1945 | 2025-10-07 |
Network-based prioritization and validation of regulators of vascular smooth muscle cell proliferation in disease
2024, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00474-4
PMID:38898928
|
研究论文 | 本研究通过构建基因调控网络识别并验证了血管平滑肌细胞增殖的关键调控因子 | 首次通过单细胞转录组和表观遗传分析重建基因调控网络，发现RUNX1和TIMP1-CD74轴等新型增殖调控因子 | 研究主要基于计算分析和体外验证，需要进一步的体内实验确认 | 阐明血管平滑肌细胞增殖的分子决定因素 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, 表观遗传分析, 计算机扰动分析 | 基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1946 | 2025-10-07 |
Interstitial macrophage phenotypes in Schistosoma-induced pulmonary hypertension
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372957
PMID:38779688
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术揭示了血吸虫诱导肺动脉高压中间质巨噬细胞亚群的表型特征和相互作用机制 | 首次在血吸虫诱导的肺动脉高压模型中鉴定出三个不同的间质巨噬细胞亚群，并阐明它们通过CCL2-CCR2轴和TSP-1/TGF-β通路的相互作用机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；观察时间点有限（仅第1、3、7天） | 探究血吸虫诱导肺动脉高压中间质巨噬细胞亚群的表型特征和功能作用 | 小鼠肺部间质巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 野生型和报告基因小鼠，在未暴露及血吸虫暴露后第1、3、7天的时间点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1947 | 2025-10-07 |
The role of SASP in ischemic stroke: a deep dive into cellular mechanisms
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1513357
PMID:39931101
|
研究论文 | 通过整合bulk和单细胞转录组分析，探究衰老相关分泌表型在缺血性脑卒中中的作用机制 | 首次结合bulk芯片和单细胞测序数据系统分析SASP在缺血性脑卒中中的作用，发现嗜碱性粒细胞中Ccl3和Lcp1基因的关键调控作用 | 研究样本量有限，主要基于动物模型数据，人类临床验证不足 | 解析SASP在缺血性脑卒中发病机制中的细胞分子作用 | 人类外周血bulk芯片数据、MCAO小鼠单细胞测序数据、MCAO和假手术大鼠血清样本 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序, bulk转录组分析, RT-qPCR, 蛋白互作网络分析, 富集分析 | MCAO动物模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量，包含人类外周血芯片数据、小鼠单细胞数据和大鼠血清样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1948 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing revealed PPARG promoted osteosarcoma progression: based on osteoclast proliferation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506225
PMID:39936154
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究PPARG在促进骨肉瘤进展中的作用机制 | 首次在单细胞水平识别出C2MKI67+破骨细胞亚群，并发现PPARG转录因子在破骨细胞增殖分化中的关键作用 | 研究样本量有限，需要进一步实验验证PPARG作为治疗靶点的临床可行性 | 探索骨肉瘤中破骨细胞的作用机制并寻找新的治疗靶点 | 骨肉瘤患者和破骨细胞 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, CCK-8检测, 伤口愈合实验, Transwell实验 | Monocle2, Cytotrace, Slingshot, CellChat, PySCENIC | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1949 | 2025-10-07 |
Leveraging Single-Cell RNA-Seq to Generate Robust Microglia Aging Clocks
2024-Nov-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.05.616811
PMID:39554035
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据开发稳健的小胶质细胞衰老时钟 | 首次在单细胞水平开发小胶质细胞衰老时钟，并证明其可应用于常规批量RNA-seq数据 | NA | 建立能够准确反映大脑衰老过程的生物标志物 | 小胶质细胞 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督频率特征化方法 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1950 | 2025-10-07 |
Influence of Vitamin D Receptor Signalling and Vitamin D on Colonic Epithelial Cell Fate Decisions in Ulcerative Colitis
2024-Oct-15, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjae074
PMID:38747639
|
研究论文 | 本研究探讨维生素D受体信号传导和维生素D对溃疡性结肠炎患者结肠上皮细胞命运决定的影响 | 首次在人类结肠类器官模型中系统研究维生素D-VDR轴对上皮细胞分化的调控机制，并利用CRISPR/Cas9技术验证VDR依赖性 | 研究主要基于体外类器官模型，需要进一步在体实验验证 | 阐明维生素D-VDR信号轴在溃疡性结肠炎发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎患者和健康个体的结肠活检样本及患者来源的结肠类器官 | 分子生物学 | 溃疡性结肠炎 | 免疫组织化学, RNA表达阵列, 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因敲除 | NA | 图像, 文本(基因表达数据) | 来自UC患者和健康个体的结肠活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1951 | 2024-08-08 |
Correction to: Machine learning applications on intratumoral heterogeneity in glioblastoma using single-cell RNA sequencing data
2024-Sep-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad022
PMID:37226813
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1952 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics of vulvar lichen sclerosus reveal multi-compartmental alterations in gene expression and signaling cross-talk
2024-Aug-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.14.607986
PMID:39211101
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析外阴硬化性苔藓病变组织，揭示多细胞区室的基因表达改变和信号通路交互作用 | 首次结合单细胞和空间转录组技术系统揭示VLS病变中角质形成细胞、成纤维细胞、免疫细胞和黑色素细胞的分子异质性与统一性变化 | 样本量有限，疾病机制验证主要依赖体外模型 | 解析外阴硬化性苔藓的分子发病机制 | VLS患者病变和非病变皮肤组织、健康对照外阴皮肤 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 单层培养模型, 器官型培养模型 | 基因表达数据, 空间定位数据 | VLS患者和健康对照的外阴皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1953 | 2025-10-07 |
Ibudilast Protects Retinal Bipolar Cells from Excitotoxic Retinal Damage and Activates the mTOR Pathway
2024-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.585556
PMID:38562805
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研究论文 | 本研究探讨了伊布地司特在兴奋性毒性视网膜损伤模型中对视网膜神经元的保护作用及其作用机制 | 首次发现伊布地司特通过激活mTOR通路保护视网膜双极细胞，并揭示双极细胞与穆勒胶质细胞之间的旁分泌信号交流在神经保护中的重要作用 | 研究仅使用鸡视网膜损伤模型，mTOR抑制剂雷帕霉素未能减少细胞死亡，机制尚未完全阐明 | 研究伊布地司特对视网膜神经元的保护作用及其分子机制 | 鸡视网膜神经元，特别是双极细胞和穆勒胶质细胞 | 神经科学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序，光谱域光学相干断层扫描，视网膜电图，TUNEL检测 | NA | 基因表达数据，影像数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1954 | 2025-10-07 |
Age-related loss of Notch3 underlies brain vascular contractility deficiencies, glymphatic dysfunction, and neurodegeneration in mice
2024-Jan-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI166134
PMID:38015629
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研究论文 | 本研究揭示年龄相关的Notch3信号丢失导致小鼠脑血管收缩功能缺陷、类淋巴系统功能障碍和神经退行性变 | 首次证明年龄相关的Notch3信号下降直接导致脑血管功能异常和神经退行性病变，并发现其与CADASIL疾病的相似病理特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究年龄如何特异性影响脑血管系统及其分子机制 | 小鼠和人类脑血管组织 | 神经科学 | 血管性痴呆 | 单细胞转录组测序，MRI | Notch3基因敲除小鼠模型 | 转录组数据，影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1955 | 2025-10-07 |
Deciphering the role of metal ion transport-related genes in T2D pathogenesis and immune cell infiltration via scRNA-seq and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1479166
PMID:39926598
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习方法研究金属离子转运相关基因在2型糖尿病发病机制和免疫细胞浸润中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和12种机器学习算法系统分析金属离子转运相关基因在T2D中的作用，并预测了12个蛋白质结构 | 研究样本量有限，主要基于生物信息学分析，需要实验验证 | 探索2型糖尿病的分子机制，特别关注免疫细胞浸润的作用 | 2型糖尿病和非糖尿病患者的胰岛细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 细胞间通讯分析 | Stepglm[backward]加GBM等12种机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据 | T2D和ND患者的胰岛细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1956 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing uncovers the mechanistic role of DAPK1 in glioma and its diagnostic and prognostic implications
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1463747
PMID:39926603
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探索DAPK1基因在胶质瘤中的作用机制及其诊断和预后价值 | 首次在胶质瘤单细胞水平上鉴定DAPK1作为终末亚群的标志基因，并建立基于DAPK1的预后预测模型 | DAPK1在胶质瘤中的具体作用机制仍需进一步深入研究 | 开发基于DAPK1的预后标志物以预测胶质瘤患者结局 | 胶质瘤患者 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序,RNA-seq,微阵列 | LASSO回归,逐步回归算法 | 单细胞RNA测序数据,RNA-seq数据,微阵列数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胶质瘤患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1957 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomes of dissecting the intra-tumoral heterogeneity of breast cancer microenvironment
2024-Dec-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06015-7
PMID:39724260
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示乳腺癌肿瘤微环境的瘤内异质性 | 首次构建包含54,055个细胞的乳腺癌单细胞转录组图谱，识别了恶性上皮细胞的六种共同表达程序和六种亚型特异性表达程序 | 样本量较小（仅4例恶性患者和4例非恶性患者），需要更大规模研究验证 | 研究乳腺癌异质性在单细胞转录组中的形成机制和作用 | 乳腺癌临床标本中的细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF) | 单细胞转录组数据 | 54,055个高质量细胞，来自4例恶性和4例非恶性患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1958 | 2025-10-07 |
Integrated analysis reveals prognostic correlation and immune characteristics of a tumor-associated macrophage-based risk signature in triple-negative breast cancer
2024-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1037
PMID:39525038
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研究论文 | 本研究通过整合分析构建了基于肿瘤相关巨噬细胞的风险特征，用于三阴性乳腺癌的预后预测和免疫特征分析 | 首次基于单细胞RNA测序数据识别TAM簇并构建8基因风险特征，开发了整合分期和TAM风险特征的新型列线图 | NA | 探索三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的特征，构建预后风险特征并验证其与免疫特征的关系 | 三阴性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，逆转录聚合酶链反应，Western blot，免疫组织化学 | LASSO回归，单变量Cox回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1959 | 2025-10-07 |
The CD8+ T cell tolerance checkpoint triggers a distinct differentiation state defined by protein translation defects
2024-06-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.026
PMID:38776918
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研究论文 | 本研究揭示了外周CD8+ T细胞耐受检查点触发了一种由蛋白质翻译缺陷定义的独特分化状态 | 首次证明外周耐受触发与耗竭、记忆和功能效应细胞完全不同的分化状态，并发现该状态由蛋白质翻译缺陷维持 | 研究主要关注早期分化阶段（60小时内），长期耐受状态的维持机制需要进一步探索 | 阐明外周CD8 T细胞耐受检查点的分子机制和细胞状态特征 | 外周CD8+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1960 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq and single-cell bisulfite-sequencing reveal insights into yak preimplantation embryogenesis
2024-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105562
PMID:38097189
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞亚硫酸氢盐测序揭示牦牛植入前胚胎发育的表观遗传调控机制 | 首次在牦牛胚胎发育中结合单细胞转录组和DNA甲基化分析，鉴定出43个候选甲基化驱动基因和关键表观遗传调控因子 | 研究聚焦特定物种（牦牛），结果在其他哺乳动物的普适性需要进一步验证 | 探究高原牦牛植入前胚胎发育过程中的DNA甲基化作用和表观遗传重编程机制 | 牦牛卵母细胞和不同发育阶段的植入前胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞亚硫酸氢盐测序 | NA | 单细胞转录组数据, DNA甲基化数据 | 卵母细胞和系列发育阶段胚胎的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞甲基化测序 | NA | NA |