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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1881 | 2025-10-07 |
ITGA5+ synovial fibroblasts orchestrate proinflammatory niche formation by remodelling the local immune microenvironment in rheumatoid arthritis
2024-Nov-01, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225778
PMID:39486872
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学鉴定了一种新型ITGA5+滑膜成纤维细胞亚群,并揭示了其在类风湿关节炎炎症微环境形成中的作用机制 | 首次鉴定出CD45-CD31-PDPN+ITGA5+滑膜成纤维细胞新亚群,发现其通过分泌TGF-β1诱导naïve CD4+ T细胞分化为CXCL13hiPD-1hi外周辅助T细胞,从而重塑促炎微环境 | 研究样本量相对有限,需要更大规模队列验证;动物模型结果向人类临床转化的有效性需进一步确认 | 研究滑膜成纤维细胞的表型异质性及其在类风湿关节炎炎症反应中的作用 | 骨关节炎、持续缓解期和活动期类风湿关节炎患者的滑膜组织和细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,免疫组织化学,多重免疫荧光,流式细胞术,细胞共培养,过继转移,RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,空间基因表达数据,流式细胞数据,免疫荧光图像 | 包含PEAC和R4RA两个队列的患者样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1882 | 2025-10-07 |
Cell and transcriptomic diversity of infrapatellar fat pad during knee osteoarthritis
2024-Oct-15, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225928
PMID:39375009
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了膝关节骨关节炎中髌下脂肪垫的细胞和转录组多样性 | 首次提供了人类髌下脂肪垫的全面细胞和转录组图谱,确定了与膝关节骨关节炎、性别和肥胖状态相关的成纤维细胞关键作用 | 样本量相对有限(21个样本),需要进一步验证 | 确定髌下脂肪垫在膝关节骨关节炎中的作用及其与性别和肥胖状态的关系 | 人类髌下脂肪垫组织 | 单细胞生物学 | 膝关节骨关节炎 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 代谢组数据 | 21个髌下脂肪垫样本(6个健康对照,15个膝关节骨关节炎供体),共82,924个细胞核 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 1883 | 2025-10-07 |
NR3C2 affects the proliferation and invasiveness of colon cancer cells through the Wnt/β-Catenin signaling pathway
2024-Sep-05, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05935-8
PMID:39237674
|
研究论文 | 本研究探讨NR3C2通过Wnt/β-Catenin信号通路调控结肠癌细胞增殖和侵袭的机制 | 首次揭示NR3C2通过调控Wnt/β-Catenin信号通路影响结肠癌细胞增殖、侵袭、自噬和凋亡的分子机制 | 研究样本量有限,主要依赖公共数据库数据,需要更多临床样本验证 | 探索NR3C2与结肠癌预后的相关性及其作用机制 | 结肠癌组织、结肠癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 结肠癌 | 生物信息学分析、慢病毒转染、CCK-8检测、Transwell实验、Western blot | 动物移植瘤模型、细胞模型 | mRNA表达数据、单细胞转录组数据、临床数据 | TCGA数据库结肠癌数据、GEO数据库单细胞数据、3对新鲜结肠癌及癌旁样本 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1884 | 2025-10-07 |
Stellate cells are in utero markers of pancreatic disease in cystic fibrosis
2024-Aug-07, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00871-2
PMID:39112965
|
研究论文 | 本研究利用绵羊囊性纤维化模型探究胰腺疾病在妊娠期的演变过程 | 首次在囊性纤维化动物模型中通过单细胞RNA测序鉴定出星状细胞在妊娠期显著过度富集 | 研究仅限于动物模型,需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究囊性纤维化胰腺疾病的发病机制和演变过程 | 囊性纤维化绵羊模型的胎儿胰腺组织 | 单细胞组学 | 囊性纤维化 | RNA-seq, scRNA-seq, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 妊娠期6个时间点的胎儿胰腺样本(从50天到足月) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1885 | 2025-10-07 |
Unravelling CD4+ T cell diversity and tissue adaptation of Tregs in abdominal aortic aneurysms through single-cell sequencing
2024-08, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13796
PMID:38637948
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示腹主动脉瘤中CD4+ T细胞的多样性及调节性T细胞的组织适应性 | 首次发现腹主动脉瘤中调节性T细胞的组织特异性表型是在主动脉中获得的,并识别了其前体细胞 | NA | 探究腹主动脉瘤中CD4+ T细胞的异质性和调节性T细胞的发育机制 | 从腹主动脉瘤主动脉和脾脏分离的CD4+ T细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1886 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling of bronchoalveolar cells reveals a Th17 signature in neutrophilic severe equine asthma
2024-04, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13745
PMID:38153159
|
研究论文 | 通过单细胞mRNA测序分析马支气管肺泡细胞,揭示中性粒细胞性重度马哮喘中存在显著的Th17免疫特征 | 首次在重度马哮喘中通过单细胞测序发现显著的Th17免疫反应特征,并鉴定出单核-淋巴细胞复合物及CXCL13在中间单核细胞中的上调 | 样本量较小(11匹马),使用冷冻保存的细胞可能影响细胞活性 | 揭示重度马哮喘的免疫驱动机制 | 温血马的支气管肺泡细胞 | 单细胞测序分析 | 哮喘 | 单细胞mRNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 11匹温血马(5匹对照,6匹SEA患者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1887 | 2025-10-07 |
Modeling primitive and definitive erythropoiesis with induced pluripotent stem cells
2024-03-26, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023011708
PMID:38290102
|
研究论文 | 利用诱导多能干细胞建模原始和终末红细胞生成过程 | 首次通过同源基因背景的iPSCs直接比较原始和终末红细胞的差异,并利用KLF1突变模型验证终末红细胞特异性表型变化 | 研究主要基于体外分化系统,可能与体内真实发育环境存在差异 | 比较原始和终末红细胞生成的功能特性和分子机制差异 | 人诱导多能干细胞分化的红细胞和胎儿肝脏来源的红细胞 | 干细胞生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1888 | 2025-10-07 |
Investigating adverse genomic and regulatory changes caused by replacement of the full-length CFTR cDNA using Cas9 and AAV
2024-Mar-12, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102134
PMID:38384445
|
研究论文 | 评估使用Cas9和AAV替换CFTR全长cDNA引起的基因组和调控变化的安全性 | 首次全面评估CFTR基因替换策略的基因组安全性,结合CAST-seq、ATAC-seq和scRNA-seq多组学分析 | 研究样本量有限,主要关注特定基因座的变化,长期安全性仍需验证 | 评估基于Cas9和AAV的CFTR基因替换治疗策略的安全性 | 囊性纤维化患者的气道基底干细胞 | 基因编辑 | 囊性纤维化 | CRISPR-Cas9基因编辑, AAV载体, CAST-seq, ATAC-seq, scRNA-seq | NA | 基因组测序数据, 表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 1889 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and AlphaFold 3 insights into cytokine signaling and its role in uveal melanoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1458041
PMID:39916959
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和AlphaFold 3技术揭示葡萄膜黑色素瘤的细胞异质性,并识别预后生物标志物 | 首次构建葡萄膜黑色素瘤特异性基因特征,结合单细胞分辨率的细胞因子反应词典和AlphaFold 3蛋白结构预测 | 样本量有限,主要基于TCGA-UVM和GSE84976队列验证 | 阐明葡萄膜黑色素瘤的细胞异质性并识别预后生物标志物 | 原发性和转移性葡萄膜黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, LASSO回归, ROC曲线分析, 伪时间轨迹映射, CRISPR-Cas9筛选, AlphaFold 3结构预测 | LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 蛋白质结构数据 | TCGA-UVM和GSE84976队列样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1890 | 2025-10-07 |
InTraSeq: A Multimodal Assay that Uncovers New Single-Cell Biology and Regulatory Mechanisms
2024-Dec-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5284652/v1
PMID:39711533
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型多模态单细胞测序技术InTraSeq,能够同时测量单个细胞中的mRNA、表面标志物、细胞质蛋白和核蛋白 | 开发了能够同时测量细胞内mRNA和多种蛋白质(包括翻译后修饰和转录因子)的多模态单细胞测序技术 | NA | 开发和应用多模态单细胞测序技术以更全面地研究细胞功能和调控机制 | Th17细胞分化过程中的细胞状态和调控机制 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,多模态单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 超过85,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,多模态单细胞分析 | InTraSeq | 基于寡核苷酸条形码抗体的多模态单细胞测序技术 |
| 1891 | 2025-10-07 |
Biophysical model for joint analysis of chromatin and RNA sequencing data
2024-Dec, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.110.064405
PMID:39916216
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研究论文 | 提出一种用于联合分析染色质和RNA测序数据的生物物理模型 | 开发了能够参数化多组学数据的染色质动力学和转录生物物理模型,并评估多组学数据相对于非配准单细胞测序的优势 | 模型主要应用于单细胞ATAC-seq数据,对其他模态数据的整合验证有限 | 开发联合分析染色质可及性和基因表达数据的计算方法 | 单细胞多组学测序数据和非配准单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学测序 | 生物物理模型 | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1892 | 2025-10-07 |
The MRAP2 accessory protein directly interacts with melanocortin-3 receptor to enhance signaling
2024-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.06.622243
PMID:39574659
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研究论文 | 本研究证实MRAP2辅助蛋白通过与MC3R直接相互作用增强其信号传导功能 | 首次使用单分子下拉技术确认MC3R与MRAP2的相互作用,揭示了它们形成1:1异源二聚体的分子机制 | 研究主要在HEK293细胞系中进行,需要在更接近生理条件的模型中验证 | 阐明MRAP2对MC3R信号传导的调控机制及其在能量稳态中的作用 | 黑皮质素3受体(MC3R)及其辅助蛋白MRAP2 | 分子生物学 | 肥胖症 | 单分子下拉(SiMPull)、荧光光漂白分析、单核RNA测序、空间转录组学、结构同源建模、丙氨酸突变筛选 | NA | 分子相互作用数据、基因表达数据、信号传导数据 | HEK293细胞系、人类下丘脑神经元 | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1893 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA transcriptomics in mice reveals embryonic origin of fibrosis due to maternal obesity
2024-Nov, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105421
PMID:39476533
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示母体肥胖通过抑制AMPK信号通路增强胚胎纤维化进程的机制 | 首次在胚胎期发现母体肥胖诱导的纤维化细胞群增加,并证实AMPK信号通路在其中的关键调控作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证 | 探究母体肥胖导致子代组织纤维化的胚胎起源和分子机制 | C57BL/6J小鼠胚胎体细胞组织(E9.5、E11.5、E13.5时期) | 单细胞组学 | 纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 对照组和母体肥胖组小鼠胚胎组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1894 | 2025-10-07 |
NME4 suppresses NFκB2-CCL5 axis, restricting CD8+ T cell tumour infiltration in oesophageal squamous cell carcinoma
2024-10, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13838
PMID:39016535
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研究论文 | 本研究揭示了NME4通过调控NFκB2-CCL5轴抑制CD8+ T细胞在食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中浸润的机制 | 首次发现NME4在肿瘤微环境中的免疫调节功能,并阐明其通过NFκB2-CCL5轴调控CD8+ T细胞浸润的新机制 | 临床样本中NME4表达与临床病理和预后的相关性有限,主要机制研究基于小鼠模型 | 探究NME4在食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中的免疫学作用及其分子机制 | 食管鳞状细胞癌患者样本、C57BL/6小鼠同源肿瘤模型、AKR小鼠ESCC细胞系 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 多重免疫组织化学、单细胞RNA测序、定量蛋白质组学、蛋白质微阵列筛选 | 同源肿瘤小鼠模型 | 组织切片图像、单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据 | 食管鳞状细胞癌患者样本和小鼠模型样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1895 | 2025-10-07 |
FANCD2 as a ferroptosis-related target for recurrent implantation failure by integrated bioinformatics and Mendelian randomization analysis
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70119
PMID:39400935
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研究论文 | 通过整合生物信息学和孟德尔随机化分析,研究铁死亡相关基因在复发性种植失败中的作用 | 首次结合生物信息学分析和孟德尔随机化方法系统研究DEFRGs在RIF中的表达和意义,发现FANCD2通过非经典铁死亡依赖途径参与RIF发病机制 | 研究样本量有限,需要进一步实验验证基因功能机制 | 探究铁死亡相关基因在复发性种植失败发病机制中的作用 | 复发性种植失败患者和健康个体的子宫内膜组织 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 生物信息学分析,孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1896 | 2025-10-07 |
Single Cell RNAseq Analysis of Cytokine-Treated Human Islets: Association of Cellular Stress with Impaired Cytokine Responsiveness
2024-Jul-11, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqae015
PMID:38985000
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析细胞因子处理的人类胰岛,揭示细胞应激与细胞因子反应性受损的关联 | 首次在单细胞水平揭示人类胰岛对细胞因子的整体反应较鼠类显著减弱,并发现核糖体蛋白高表达与细胞因子无反应性相关 | 供体死亡原因和胰岛分离方法可能影响实验结果,未评估应激相关基因表达可能限制研究结论的普适性 | 研究人类胰岛在细胞因子刺激下的基因表达变化及其与细胞应激的关系 | 人类胰岛细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 未明确样本数量的人类胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1897 | 2025-10-07 |
The dysfunction of CD8+ T cells triggered by endometriotic stromal cells promotes the immune survival of endometriosis
2024-07, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13786
PMID:38544333
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示子宫内膜异位症中CD8+ T细胞功能失调促进疾病免疫逃逸的机制 | 首次在单细胞水平系统描绘子宫内膜异位症的细胞图谱,发现子宫内膜基质细胞通过STAT1/PDCD1通路和代谢重编程诱导CD8+ T细胞功能失调的新机制 | 样本量较小(仅3例患者),需要更大规模研究验证发现 | 探究子宫内膜异位症的细胞异质性及CD8 T细胞在疾病进展中的作用 | 卵巢子宫内膜异位症患者组织样本及小鼠模型 | 单细胞组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例卵巢子宫内膜异位症患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1898 | 2025-10-07 |
Single-cell multi-omics analysis reveals cooperative transcription factors for gene regulation in oligodendrocytes
2024-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.19.599799
PMID:38948852
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研究论文 | 通过整合单细胞多组学数据识别少突胶质细胞中协同转录因子对基因表达的调控机制 | 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq数据系统识别少突胶质细胞中协同转录因子,并开发深度学习模型量化TF-TF相互作用对靶基因表达的贡献 | 研究主要基于计算预测,实验验证仅限于部分TF对的共富集分析 | 解析少突胶质细胞中转录因子协同调控基因表达的分子机制 | 少突胶质细胞及其基因调控网络 | 生物信息学 | 脑部疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq, ChIP-seq, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1899 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the altered innate immunity in immune checkpoint inhibitor-related myocarditis
2024-06, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13770
PMID:38425094
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示免疫检查点抑制剂相关心肌炎中先天免疫系统的改变 | 首次构建了ICI相关心肌炎外周血单核细胞的细胞图谱,并发现S100A蛋白家族作为潜在血清标志物 | 样本量较小,仅包含肺鳞状细胞癌患者 | 探究免疫检查点抑制剂相关心肌炎的转录组特征和发病机制 | 肺鳞状细胞癌患者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 4组患者(具体人数未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1900 | 2025-10-07 |
Early life vaccination reprograms the metabolism and function of myeloid cells in neonates
2024-06, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13772
PMID:38424694
|
研究论文 | 本研究揭示早期接种卡介苗通过mTOR/HIF1a信号通路和糖酵解重编程新生儿髓系细胞功能 | 首次发现BCG疫苗接种通过代谢重编程改变新生儿髓系细胞的免疫抑制功能 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类新生儿中验证 | 探究疫苗接种对新生儿免疫系统发育的影响机制 | 新生小鼠的髓系来源抑制细胞 | 免疫学 | 免疫相关疾病 | 单细胞转录组测序,代谢物分析,功能分析 | NA | 基因表达数据,代谢数据 | 新生小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |