单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1881	2025-01-01	Functional cure and long-term survival in multiple myeloma: how to challenge the previously impossible 2024-08-01, Haematologica IF:8.2Q1 DOI:10.3324/haematol.2023.283058 PMID:38356448	综述	本文探讨了多发性骨髓瘤（MM）的功能性治愈和长期生存的可能性	提出了功能性治愈的概念，并讨论了通过新型诊断和治疗手段实现长期疾病控制的可能性	尽管功能性治愈的概念提出，但实际治愈仍难以实现，且长期疗效仍需进一步验证	探讨多发性骨髓瘤的功能性治愈和长期生存策略	多发性骨髓瘤患者	NA	多发性骨髓瘤	全基因组测序、单细胞测序	NA	NA	NA
1882	2025-01-01	The expression of immune related genes and potential regulatory mechanisms in schizophrenia 2024-05, Schizophrenia research IF:3.6Q1 DOI:10.1016/j.schres.2023.11.007 PMID:37993327	研究论文	本研究通过单细胞转录组和批量RNA数据分析，探讨了免疫功能障碍在精神分裂症发病机制中的作用	首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示了精神分裂症组织中细胞组成的显著差异及免疫相关基因的异常表达	未涉及实验验证，且样本来源和数量未明确说明	探讨免疫功能障碍在精神分裂症发病机制中的作用	精神分裂症患者的脑组织	生物信息学	精神分裂症	单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
1883	2024-12-31	Tumor-derived CCL15 regulates RNA m6A methylation in cancer-associated fibroblasts to promote hepatocellular carcinoma growth 2024-Dec-27, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217420 PMID:39734010	研究论文	本文揭示了CCL15在肝细胞癌（HCC）进展中的关键作用，通过调节癌症相关成纤维细胞（CAFs）中的RNA m6A甲基化促进HCC生长	首次发现CCL15通过STAT3通路诱导CAFs中FTO的表达，进而调控CEBPA mRNA的m6A甲基化，揭示了CCL15在HCC细胞与CAFs之间的新型调控轴	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在临床患者中进行验证	探讨CCL15在HCC生长中的具体作用和机制	肝细胞癌（HCC）细胞和癌症相关成纤维细胞（CAFs）	癌症生物学	肝细胞癌	单细胞RNA测序、免疫荧光、共培养实验、类器官模型、异种移植模型、m6A测序、RNA测序	NA	RNA测序数据、免疫荧光图像	NA
1884	2024-12-31	Targeting UBE2T suppresses breast cancer stemness through CBX6-mediated transcriptional repression of SOX2 and NANOG 2024-Dec-21, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217409 PMID:39716485	研究论文	本文揭示了UBE2T通过CBX6介导的转录抑制调控乳腺癌干细胞（BCSC）干性的机制，并提出了潜在的治疗策略	首次发现UBE2T通过TRIM25介导的CBX6泛素化降解调控SOX2和NANOG的转录，从而影响BCSC干性	研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	研究UBE2T在乳腺癌干细胞干性调控中的作用及其潜在治疗策略	乳腺癌干细胞（BCSCs）	癌症生物学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），干性指数分析	NA	基因表达数据	NA
1885	2024-12-31	Imaging spatial transcriptomics reveals molecular patterns of vulnerability to pathology in a transgenic α-synucleinopathy model 2024-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.07.31.606032 PMID:39372781	研究论文	本文利用成像空间转录组学技术，研究了转基因α-突触核蛋白病模型中分子模式对病理的脆弱性	首次结合成像空间转录组学和免疫荧光技术，在同一组织切片中识别出易受α-突触核蛋白磷酸化病理影响的神经元亚型，并揭示了其转录基础	研究仅限于转基因小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病情况	探讨帕金森病和路易体痴呆中α-突触核蛋白病理的分子机制	转基因人α-突触核蛋白过表达小鼠的皮质和海马神经元	数字病理学	帕金森病	成像空间转录组学（IST）、免疫荧光	转基因小鼠模型	图像、转录组数据	NA
1886	2024-12-31	Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus 2024-Dec-11, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-5398491/v1 PMID:39711562	研究论文	本文介绍了一种名为DBiTplus的多模态空间组学方法，结合了基于测序的空间转录组学和基于图像的空间蛋白质分析，以在同一组织切片上实现单细胞分辨率的细胞分型和基因组尺度的生物通路研究	DBiTplus方法首次在同一组织切片上整合了测序和成像技术，实现了单细胞分辨率的空间转录组和蛋白质组分析	在应用DBiTplus方法时，小鼠胚胎的蛋白质标记物有限，可能影响分析的全面性	研究目的是通过整合空间转录组学和蛋白质组学，深入理解异质性细胞过程并连接细胞类型与功能	研究对象包括小鼠胚胎、正常人类淋巴结和人类淋巴瘤FFPE组织	数字病理学	淋巴瘤	DBiT-seq, CODEX	NA	图像, 测序数据	小鼠胚胎、正常人类淋巴结和人类淋巴瘤FFPE组织
1887	2024-12-31	A specific gene expression program underlies antigen archiving by lymphatic endothelial cells in mammalian lymph nodes 2024-Dec-10, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-5493746/v1 PMID:39711554	研究论文	本文研究了淋巴结中淋巴管内皮细胞（LEC）如何实现持久抗原存档及其独特的转录程序	通过单细胞测序和空间转录组学，确定了LEC亚群和树突状细胞在免疫后多个时间点的抗原水平，并发现了一种独特的转录程序，可以预测不同疾病状态和生物体中的抗原存档能力	研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步扩展	探究LEC如何实现持久抗原存档及其独特的转录程序	淋巴结中的淋巴管内皮细胞（LEC）和树突状细胞	生物信息学	NA	单细胞测序，空间转录组学	机器学习	基因表达数据	小鼠和人类独立数据集
1888	2024-12-31	Single-cell RNA sequencing offers opportunities to explore the depth of physiology, adaptation, and biochemistry in non-model organisms exposed to pollution 2024-Dec, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics DOI:10.1016/j.cbd.2024.101339 PMID:39393164	综述	本文综述了单细胞RNA测序技术在非模式生物污染暴露研究中的应用	强调了单细胞RNA测序技术在揭示非模式生物对环境污染反应的分子机制中的潜力	主要基于已发表文献的分析，缺乏新的实验数据	探讨单细胞RNA测序技术在非模式生物污染暴露研究中的应用	非模式生物	分子生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA测序数据	NA
1889	2024-12-31	Differential Response to Cisplatin between Co-cultured Cells and Pure Cultured Cells Based on Single-cell RNA Sequencing of Three-dimensional-cultured Breast Cancer Cells 2024-Nov-29, Frontiers in bioscience (Landmark edition) DOI:10.31083/j.fbl2912406 PMID:39735986	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了三维培养的乳腺癌细胞在共培养和纯培养条件下对顺铂的不同反应	首次使用单细胞RNA测序技术分析三维共培养的乳腺癌细胞对顺铂的反应，揭示了共培养模型与纯培养模型在药物反应上的差异	研究仅针对MCF-7细胞，未涉及其他类型的乳腺癌细胞，且实验时间较短，可能无法完全反映长期药物反应	开发一种实验方法，用于直接共培养三维乳腺癌细胞，并研究其对顺铂的反应	MCF-7细胞、人乳腺成纤维细胞和人脐静脉内皮细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	三维细胞共培养模型	RNA测序数据	四组细胞培养：未处理的MCF-7细胞组、MCF-7细胞加顺铂组、未处理的共培养组、共培养加顺铂组
1890	2024-12-31	Osteostaticytes: A novel osteoclast subset couples bone resorption and bone formation 2024-Jul, Journal of orthopaedic translation IF:5.9Q1 DOI:10.1016/j.jot.2024.06.010 PMID:39027343	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了骨愈合过程中骨重塑的细胞和分子机制，并发现了一种新的破骨细胞亚群——骨稳态细胞（OSCs）	首次发现并命名了骨稳态细胞（OSCs），揭示了其在骨重塑中的关键作用，特别是在骨吸收和骨形成之间的逆转阶段	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证，且对OSCs的具体功能机制仍需进一步探索	阐明骨髓炎后骨愈合的细胞和分子机制，特别是骨重塑过程中的逆转阶段	人类皮质骨、小鼠胫骨骨折模型、骨髓炎相关胫骨骨折模型	数字病理	骨髓炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、实时PCR、免疫荧光染色、基因集富集分析（GSEA）、CellChat、transwell实验、共培养实验	NA	单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像	人类皮质骨样本、小鼠胫骨骨折模型
1891	2024-12-31	Defining predictors of responsiveness to advanced therapies in Crohn's disease and ulcerative colitis: protocol for the IBD-RESPONSE and nested CD-metaRESPONSE prospective, multicentre, observational cohort study in precision medicine 2024-04-17, BMJ open IF:2.4Q1 DOI:10.1136/bmjopen-2023-073639 PMID:38631839	研究论文	本文介绍了一项前瞻性、多中心、观察性队列研究，旨在通过多组学数据创建预测工具，以预测克罗恩病和溃疡性结肠炎患者对先进疗法的反应	该研究首次整合了肠道微生物组、代谢组、单细胞转录组、人类基因组、饮食和临床数据，以创建预测模型，并计划进行跨治疗比较和独立复制队列研究	研究的主要局限性在于其观察性设计，可能无法完全控制混杂因素，且样本量相对较小（1325名参与者）	研究目标是识别和验证预测模型，以预测克罗恩病和溃疡性结肠炎患者对先进疗法的反应	研究对象为开始接受先进疗法的克罗恩病和溃疡性结肠炎患者	精准医学	克罗恩病和溃疡性结肠炎	多组学数据分析	预测模型	多组学数据（肠道微生物组、代谢组、单细胞转录组、人类基因组、饮食和临床数据）	1325名参与者
1892	2024-12-30	scRNA + BCR-seq identifies proportions and characteristics of dual BCR B cells in the peritoneal cavity of mice and peripheral blood of healthy human donors across different ages 2024-Dec-28, Immunity & ageing : I & A IF:5.2Q1 DOI:10.1186/s12979-024-00493-6 PMID:39732722	研究论文	本研究利用scRNA-seq和scBCR-seq技术，探讨了小鼠腹膜和健康志愿者外周血中双受体B细胞的存在及其与年龄的关系	首次揭示了老年小鼠和健康志愿者中双受体B细胞的比例和特性，并发现这些细胞在老年个体中显著增加	研究样本主要来自小鼠和健康志愿者，未涉及疾病状态下的双受体B细胞	探讨双受体B细胞在不同年龄个体中的存在及其特性	小鼠腹膜和健康志愿者外周血中的B细胞	免疫学	NA	scRNA-seq, scBCR-seq	NA	单细胞RNA测序数据, B细胞受体测序数据	小鼠和不同年龄的健康志愿者
1893	2024-12-30	TIM3 on natural killer cells regulates antibody-dependent cellular cytotoxicity in HER2-positive gastric cancer 2024-Dec-24, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217412 PMID:39722406	研究论文	本研究探讨了TIM3在自然杀伤细胞（NK细胞）上对HER2阳性胃癌（GC）中抗体依赖性细胞毒性（ADCC）的调节作用	首次揭示了TIM3在NK细胞中的表达与CD16的相关性，并提出了抗TIM3抗体与曲妥珠单抗联合治疗HER2阳性胃癌的新策略	研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证其效果	研究HER2阳性胃癌中NK细胞的免疫检查点分子与曲妥珠单抗诱导的ADCC之间的关系	HER2阳性胃癌患者和HER2转染的胃癌细胞	肿瘤免疫学	胃癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和免疫组织化学	小鼠HER2阳性胃癌模型	基因表达数据和免疫组化数据	HER2阳性胃癌患者和小鼠模型
1894	2024-12-30	Single-cell transcriptome profiling identifies the activation of type I interferon signaling in ossified posterior longitudinal ligament 2024-Dec, Frontiers of medicine IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s11684-024-1075-5 PMID:39441507	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了I型干扰素信号在OPLL患者骨化韧带中的激活，并探讨了其在骨化过程中的作用	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了I型干扰素信号在OPLL骨化过程中的激活，并验证了其在体外促进成骨分化的作用	研究主要基于体外实验，尚未在体内模型中验证I型干扰素信号阻断对OPLL的预防效果	探讨OPLL的分子机制及潜在预防干预措施	OPLL患者的骨化韧带	数字病理学	脊柱疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	OPLL患者的骨化韧带样本
1895	2024-12-30	Immunological face of megakaryocytes 2024-Dec, Frontiers of medicine IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s11684-024-1087-1 PMID:39542989	综述	本文综述了巨核细胞（MKs）在免疫系统中的新兴角色及其在生理和病理环境中的功能	揭示了巨核细胞作为独特免疫细胞的多样化能力，并发现了具有免疫调节功能的‘免疫巨核细胞’亚群	需要进一步研究确定巨核细胞的免疫功能是由整个巨核细胞群体还是特定亚群执行	探讨巨核细胞在免疫系统中的功能及其在生理和病理环境中的作用	巨核细胞及其免疫功能	免疫学	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
1896	2024-12-30	The prognostic value and immunological role of calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 (CAMKK2) in pan-cancer study 2024-Oct-11, Medicine IF:1.3Q2 DOI:10.1097/MD.0000000000040072 PMID:39465821	研究论文	本文通过整合多组学和临床数据，全面评估了钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶激酶2（CAMKK2）在泛癌研究中的预后价值和免疫学作用	首次在泛癌研究中全面评估CAMKK2的分子景观，并发现其在不同癌症类型中的异常表达与生存结果相关	研究结果基于特定癌症队列，可能无法推广到所有癌症类型	评估CAMKK2在泛癌研究中的预后价值和免疫学作用	多种癌症类型中的CAMKK2基因	癌症研究	泛癌	多组学分析、单细胞转录组分析	NA	多组学数据、临床数据	多个癌症队列（如IMvigor210、GSE176307、GSE78220等）
1897	2024-12-29	Unveiling chemotherapy-induced immune landscape remodeling and metabolic reprogramming in lung adenocarcinoma by scRNA-sequencing 2024-Dec-27, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.95988 PMID:39729352	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了化疗对肺腺癌免疫景观和代谢重编程的影响	首次通过单细胞RNA测序技术全面分析化疗对肺腺癌免疫细胞和代谢的影响，并识别了两种巨噬细胞亚型	样本量较小，仅涉及9名患者，可能影响结果的普遍性	探讨化疗和免疫治疗对肺腺癌患者的影响，特别是免疫景观和代谢重编程	肺腺癌患者的肿瘤样本	数字病理学	肺癌	scRNA-seq, 流式细胞术, 免疫荧光, Seahorse检测, 肿瘤异种移植模型	NA	单细胞RNA测序数据	9名肺腺癌患者的83,622个细胞
1898	2024-12-29	Itaconate facilitates viral infection via alkylating GDI2 and retaining Rab GTPase on the membrane 2024-Dec-27, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-024-02077-8 PMID:39730330	研究论文	本文探讨了代谢物衣康酸通过烷基化GDI2并保留Rab GTPase在膜上，从而促进病毒感染的作用机制	揭示了衣康酸通过烷基化GDI2并影响Rab GTPase的分布来促进病毒感染的新机制	研究主要集中于VSV和IAV病毒，未涵盖其他病毒类型	研究衣康酸在病毒感染中的作用及其分子机制	巨噬细胞、上皮细胞、中性粒细胞	分子生物学	病毒感染	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
1899	2024-12-29	Organoids as a model system for researching human neuroendocrine tumor of the breast 2024-Dec-27, Cancer cell international IF:5.3Q1 DOI:10.1186/s12935-024-03621-w PMID:39731167	研究论文	本文首次建立了乳腺神经内分泌肿瘤（NETB）的类器官模型，并用于组织学染色、药物筛选和单细胞RNA测序	首次建立NETB的类器官模型，为临床研究提供了坚实的基础	样本量较小，仅基于一名中国女性患者的样本	研究乳腺神经内分泌肿瘤的发病机制和有效治疗方法	乳腺神经内分泌肿瘤（NETB）	数字病理学	乳腺癌	组织学染色、药物筛选、单细胞RNA测序	类器官模型	组织样本、RNA测序数据	一名中国女性患者的样本
1900	2024-12-29	Long-term in vitro expansion of a human fetal pancreas stem cell that generates all three pancreatic cell lineages 2024-Dec-26, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2024.10.044 PMID:39626658	研究论文	本文报道了从8-17周胎儿胰腺样本中衍生出18种人类胎儿胰腺类器官（hfPO）系，并发现其中4种能够在优化培养条件下长期扩展并生成胰腺的三种细胞谱系	首次报道了能够长期体外扩展并生成胰腺三种细胞谱系的人类胎儿三能干细胞/祖细胞	研究仅限于胎儿胰腺样本，未涉及成体胰腺或其他器官	研究人类胎儿胰腺干细胞的长期体外扩展及其多向分化能力	人类胎儿胰腺样本	干细胞研究	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	18种人类胎儿胰腺类器官（hfPO）系