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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 1841 - 1860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1841 | 2025-10-07 |
Unveiling inflammatory and prehypertrophic cell populations as key contributors to knee cartilage degeneration in osteoarthritis using multi-omics data integration
2024-Jun-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224420
PMID:38325908
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学整合分析揭示膝关节骨关节炎中炎症和前肥大细胞群对软骨退变的关键作用 | 发现两个新的软骨细胞群体（preInfC和InfC），揭示MIF-CD74信号通路激活，并确定preHTC和HTC为OA关键细胞群 | 样本量相对有限（8例OA供体和3例非OA对照），需要更大规模研究验证 | 解析人类膝关节软骨细胞异质性并识别骨关节炎关键细胞群体 | 人类膝关节软骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学染色, 实时定量PCR | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据, 全基因组关联研究数据 | 11名供体（8例OA，3例对照）共19个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1842 | 2025-10-07 |
Disease activity drives divergent epigenetic and transcriptomic reprogramming of monocyte subpopulations in systemic lupus erythematosus
2024-Jun-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-225433
PMID:38413168
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研究论文 | 本研究探讨系统性红斑狼疮中疾病活动度对单核细胞亚群表观遗传和转录组重编程的影响 | 首次整合DNA甲基化组、转录组和单细胞转录组学数据，揭示SLE疾病活动度驱动单核细胞亚群特异性表观遗传和转录组重编程 | 样本量相对有限，仅包含SLE患者和健康供体的单核细胞分析 | 研究系统性红斑狼疮中单核细胞亚群的表观遗传和转录组特征与疾病活动度和进展的关系 | 系统性红斑狼疮患者和健康供体的经典、中间和非经典单核细胞亚群 | 表观遗传学 | 系统性红斑狼疮 | DNA甲基化组测序,转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 表观遗传数据,转录组数据,单细胞转录组数据 | SLE患者（首次和随访访视）和健康供体的单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 1843 | 2025-10-07 |
Proinflammatory phenotype of B10 and B10pro cells elicited by TNF-α in rheumatoid arthritis
2024-Apr-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224878
PMID:38302261
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研究论文 | 本研究揭示了TNF-α通过干扰SHIP-1诱发B10和B10pro细胞促炎表型在类风湿关节炎中的机制 | 首次发现TNF-α能够改变B10和B10pro细胞的免疫表型，使其从抑炎转为促炎，并阐明了SHIP-1在这一过程中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型，在人类患者中的直接证据仍需进一步验证 | 探究TNF-α对B10和B10pro细胞表型和功能的调控机制及其在类风湿关节炎发病中的作用 | B10和B10pro细胞、类风湿关节炎患者、健康个体、基因敲除小鼠模型 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、转录组测序、基因敲除模型 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、细胞频率数据 | 健康个体和RA患者的外周血样本、TNF-α-/-和SHIP-1-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1844 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analyses reveal disturbed decidual homoeostasis in obstetric antiphospholipid syndrome
2024-Apr-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224930
PMID:38331588
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示产科抗磷脂综合征中蜕膜稳态失衡的细胞组成和分子特征 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘OAPS患者蜕膜细胞的异常微环境，发现巨噬细胞/dNK细胞比例失衡、血管内皮细胞收缩及代谢通路改变等新特征 | 样本量有限（5例患者+5例对照），需更大队列验证；主要聚焦早孕期蜕膜组织 | 揭示产科抗磷脂综合征的发病机制 | 早孕期蜕膜组织细胞 | 单细胞组学 | 产科抗磷脂综合征 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组化，免疫荧光，ELISA | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 5例OAPS患者和5例健康对照的蜕膜组织（初验证扩大队列） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1845 | 2025-10-07 |
p53 accelerates endothelial cell senescence in diabetic retinopathy by enhancing FoxO3a ubiquitylation and degradation via UBE2L6
2024-Apr, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2024.112391
PMID:38437929
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研究论文 | 本研究揭示了p53通过增强UBE2L6介导的FoxO3a泛素化降解加速糖尿病视网膜病变中内皮细胞衰老的机制 | 首次发现p53通过上调UBE2L6表达促进FoxO3a泛素化降解，从而加速内皮细胞衰老的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未在人体临床试验中验证 | 阐明糖尿病视网膜病变中内皮细胞衰老的具体分子机制 | db/db糖尿病小鼠视网膜组织和人视网膜微血管内皮细胞(HRMECs) | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | db/db小鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1846 | 2025-10-07 |
[Analysis of the types and functions of CD34+ cells in full-thickness skin defect wounds of normal mice and diabetic mice by single-cell RNA sequencing]
2024-Mar-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析正常小鼠和糖尿病小鼠全层皮肤缺损创面中CD34+细胞的类型和功能 | 首次使用CD34细胞谱系示踪小鼠结合单细胞RNA测序技术，系统比较了正常和糖尿病小鼠创面愈合过程中CD34+细胞的异质性和功能差异 | 样本量较小（对照组3只，糖尿病组2只），仅观察了伤后第4天的时间点 | 探究CD34+细胞在正常和糖尿病小鼠皮肤创面愈合过程中的细胞类型和功能差异 | CD34细胞谱系示踪小鼠（正常组和糖尿病模型组） | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选 | Seurat 4.0.2 | 单细胞RNA测序数据 | 6只CD34细胞谱系示踪小鼠（3只对照组，2只糖尿病组用于单细胞测序） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1847 | 2025-10-07 |
CD7 activation regulates cytotoxicity-driven pathology in systemic sclerosis, yielding a target for selective cell depletion
2024-Mar-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224827
PMID:38123919
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术发现CD7激活调控系统性硬化症中细胞毒性驱动的病理过程，并验证了靶向CD7的选择性细胞清除策略 | 首次揭示CD7在系统性硬化症中作为共刺激分子调控细胞毒性T细胞和NK细胞的致病作用，并证明靶向CD7的选择性细胞清除可改善疾病表现 | 样本量相对有限（165例患者），临床验证仅基于单个同情用药案例 | 探究系统性硬化症中细胞毒性细胞的调控机制及潜在治疗靶点 | 系统性硬化症患者和健康对照者的皮肤和血液样本 | 免疫学 | 系统性硬化症 | 单细胞转录组学, 流式细胞术, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据, 图像数据 | 165例系统性硬化症患者和80例健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1848 | 2025-10-07 |
CD_99 G1 neutrophils modulate osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells in the pathological process of ankylosing spondylitis
2024-Feb-15, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224107
PMID:37977819
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了强直性脊柱炎患者脊柱附着点中细胞亚群的异质性及其在骨生成过程中的相互作用机制 | 发现新型早期中性粒细胞亚群CD99_G1在AS中升高，并揭示间充质干细胞通过CAR细胞亚群向成骨分化的两条分化路径 | 样本量较小（5例患者和3例健康对照），需要在更大队列中验证发现 | 探究强直性脊柱炎脊柱附着点中细胞类型异质性及骨生成机制 | 强直性脊柱炎患者和健康个体的脊柱附着点组织 | 单细胞生物学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序，实时定量PCR，免疫荧光，流式细胞术，成骨诱导，茜素红染色，免疫组化，shRNA | 伪时间分析，配体-受体对分析 | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | 5例强直性脊柱炎患者和3例健康个体，共40,065个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1849 | 2025-10-07 |
RNA-seq analysis reveals prenatal alcohol exposure is associated with placental inflammatory cells and gene expression
2024-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147951
PMID:37918548
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现产前酒精暴露与胎盘炎症细胞比例和基因表达改变相关 | 首次利用单细胞RNA测序数据进行细胞类型反卷积分析，研究产前酒精暴露对胎盘细胞组成和炎症基因表达的影响 | 样本量相对较小（68例），需要未来研究进一步验证和功能分析 | 探究产前酒精暴露对胎盘细胞类型组成和炎症基因表达的影响 | 南非开普敦前瞻性出生队列中的35名重度饮酒孕妇和33名对照孕妇的胎盘样本 | 生物信息学 | 胎儿酒精谱系障碍 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，细胞类型反卷积分析 | 线性回归模型 | RNA测序数据 | 68例胎盘样本（35例酒精暴露，33例对照） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1850 | 2025-10-07 |
Immune responses in checkpoint myocarditis across heart, blood and tumour
2024-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08105-5
PMID:39506125
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析免疫检查点抑制剂引发的心肌炎患者心脏、肿瘤和血液中的免疫反应特征 | 首次在irMyocarditis患者中同时分析心脏、肿瘤和血液的免疫反应，发现心脏扩增的TCR克隆不识别常见心脏自身抗原，且与肿瘤TCR克隆重叠度低 | 样本量相对有限（28例患者），部分机制仍需进一步验证 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制及其与抗肿瘤免疫的关系 | 28例免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者和41例未受影响个体 | 免疫学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，显微镜检查，蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据，TCR序列数据，显微镜图像，蛋白质数据 | 28例irMyocarditis患者，41例对照个体，共分析84576个心脏细胞和366066个血液细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1851 | 2025-02-14 |
Reconstruction of gene regulatory networks from single cell transcriptomic data
2024-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii
IF:0.9Q3
DOI:10.18699/vjgb-24-104
PMID:39944798
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综述 | 本文综述了从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据重建基因调控网络（GRNs）的方法和程序 | 本文特别关注了利用其他组学数据（主要是转录因子结合位点和开放染色质图谱）来提高单细胞转录组数据重建GRN的准确性 | 单细胞组学数据的技术和生物学特性需要特定的GRN推断方法 | 理解和研究细胞在发育过程中及响应各种内外刺激时使用的机制 | 基因调控网络（GRNs） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1852 | 2025-10-07 |
Deconvolution of spatial transcriptomics data via graph contrastive learning and partial least square regression
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf052
PMID:39924717
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研究论文 | 提出一种基于图对比学习和偏最小二乘回归的空间转录组数据反卷积方法CLPLS | 首次将图对比学习与偏最小二乘回归结合用于空间转录组反卷积，并能整合单细胞多组学数据探索空间表观基因组异质性 | NA | 开发空间转录组数据反卷积方法以解析组织内细胞空间架构 | 空间转录组数据和单细胞多组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组测序，单细胞多组学测序 | 图对比学习，偏最小二乘回归 | 基因表达数据，染色质可及性数据 | 模拟数据集和来自不同平台的真实数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞多组学 | NA | NA |
| 1853 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic revealed intratumor heterogeneity and cancer stem cell enrichment in colorectal cancer metastasis
2024-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217181
PMID:39159882
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研究论文 | 本研究通过空间转录组技术揭示结直肠癌原发灶和肝转移灶的瘤内异质性及癌症干细胞富集机制 | 首次利用空间转录组技术系统揭示结直肠癌转移过程中的瘤内异质性特征，发现FOXD1作为新型转移性癌症干细胞标志物 | 仅分析两对原发灶与匹配转移灶样本，样本量有限 | 探索结直肠癌转移的细胞机制和癌症干细胞作用 | 结直肠癌患者的原发肿瘤组织及匹配的肝转移组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | 轨迹分析、伪时间分析、CellphoneDB互作分析 | 空间RNA转录组数据 | 2例原发结直肠癌组织及其匹配的肝转移组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组技术 |
| 1854 | 2025-10-07 |
Inferring pattern-driving intercellular flows from single-cell and spatial transcriptomics
2024-Oct, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02380-w
PMID:39187683
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研究论文 | 提出FlowSig方法，从单细胞和空间转录组数据推断细胞间通讯驱动的信息流 | 首次结合图形因果建模和条件独立性分析，揭示细胞间通讯与细胞内基因模块之间的耦合关系 | 方法依赖于因果推断假设，需要实验验证其生物学意义 | 开发从单细胞和空间转录组数据推断细胞间信息流的方法 | 皮质类器官、胰腺胰岛、COVID-19患者样本、小鼠胚胎 | 生物信息学 | COVID-19, 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 图形因果模型 | 基因表达数据 | 多种实验数据集和合成数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1855 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals placental response under environmental stress
2024-Aug-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50914-9
PMID:39095385
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究环境应激下胎盘的反应机制 | 首次在单细胞水平揭示砷暴露下胎盘细胞类型特异性反应，发现PRAP1基因在26种胎盘细胞类型中显著上调并具有性别偏好性 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞验证有限 | 探究环境应激下胎盘的分子响应机制 | 小鼠胎盘细胞和人类滋养层细胞 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序，体外实验，离体实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种胎盘细胞类型（包括多种滋养层细胞） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1856 | 2025-10-07 |
Hofbauer cells and fetal brain microglia share transcriptional profiles and responses to maternal diet-induced obesity
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114326
PMID:38848212
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了母体饮食诱导肥胖模型中胎儿脑小胶质细胞与胎盘霍夫bauer细胞具有共同的转录特征 | 首次证实胎儿脑小胶质细胞与胎盘霍夫bauer细胞具有共同起源和相似的转录程序，并提出霍夫bauer细胞可作为胎儿脑小胶质细胞编程的非侵入性生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型，虽然与人类数据集比较显示保守性，但需要进一步临床验证 | 探索母体肥胖对胎儿免疫细胞编程的影响及其与神经发育障碍的关联 | 小鼠模型中的胎儿脑小胶质细胞和胎盘霍夫bauer细胞 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1857 | 2025-10-07 |
Bulk and single-cell transcriptome datasets of the mouse fetal and adult rete ovarii and surrounding tissues
2024-Apr-13, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03227-x
PMID:38615064
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研究论文 | 本研究通过批量、单细胞和细胞核水平的转录组测序，揭示了小鼠胎儿和成年期卵巢网及其周围组织的转录组特征 | 首次系统性地对卵巢网三个区域进行多层次的转录组分析，并利用Pax8-rtTA; Tre-H2B-GFP转基因小鼠模型实现卵巢网特异性标记 | 研究局限于小鼠模型，卵巢网的具体功能意义仍需进一步实验验证 | 探索卵巢网在卵巢稳态和生理变化响应中的潜在功能 | 小鼠胎儿和成年期卵巢网组织及其周围组织 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠胎儿和成年期卵巢网组织样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | NA | NA |
| 1858 | 2025-10-07 |
Targeting metabolic sensing switch GPR84 on macrophages for cancer immunotherapy
2024-Feb-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03603-3
PMID:38349405
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现脂肪酸受体GPR84是调控肿瘤相关巨噬细胞抗肿瘤表型的重要代谢感应开关 | 首次发现GPR84作为代谢感应开关调控巨噬细胞抗肿瘤极化，并证明其激动剂6-OAU可增强抗PD-1疗法的疗效 | 研究主要基于小鼠肿瘤模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞代谢重编程机制以增强癌症免疫治疗效果 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及其GPR84受体 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组测序，基因敲除，药理学激活 | NA | 转录组数据 | 多个肿瘤模型的小鼠数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1859 | 2025-10-07 |
A model of human neural networks reveals NPTX2 pathology in ALS and FTLD
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07042-7
PMID:38355792
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研究论文 | 本研究通过建立人类神经网络模型揭示了TDP-43蛋白病变中NPTX2积累的神经毒性机制 | 开发了新型均质化神经干细胞系(iCoMoNSCs)和长效功能性神经网络模型(iNets)，首次发现TDP-43通过3'UTR调控NPTX2表达并导致神经退行 | 模型虽能模拟年龄相关疾病但仍需验证其与真实人类大脑发育的一致性 | 探索TDP-43蛋白病变的发生机制及其在神经退行性疾病中的作用 | 诱导多能干细胞分化的神经网络模型及ALS/FTLD患者神经元 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症,额颞叶痴呆 | 单细胞转录组测序,干细胞分化,电生理记录 | 神经网络模型,类器官模型 | 基因表达数据,蛋白质组数据,电生理数据 | 未明确样本数量但包含患者神经元和干细胞衍生模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1860 | 2025-10-07 |
Innovative super-resolution in spatial transcriptomics: a transformer model exploiting histology images and spatial gene expression
2024-01-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae052
PMID:38436557
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研究论文 | 提出了一种基于Transformer架构的无监督模型TransformerST，用于提升空间转录组学的分辨率至单细胞水平 | 首次将Transformer架构应用于空间转录组学超分辨率分析，无需参考单细胞RNA测序数据，通过视觉Transformer编码器发掘图像-基因表达的潜在共表征 | 未提及具体的数据集验证范围和计算资源需求 | 提升空间转录组学技术的分辨率，实现单细胞级别的空间基因表达分析 | 空间转录组学数据，特别是Visium平台产生的多细胞水平数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | Transformer，视觉Transformer，图Transformer | 组织学图像，空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组学平台 |