单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7858 篇文献，本页显示第 1821 - 1840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1821 | 2024-11-15 |
Single-cell transcriptomics reveals writers of RNA modification-mediated immune microenvironment and cardiac resident Macro-MYL2 macrophages in heart failure
2024-08-16, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-024-04080-x
PMID:39152369
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研究论文 | 研究揭示了RNA修饰编写者在心力衰竭免疫微环境中的作用及心脏驻留Macro-MYL2巨噬细胞 | 发现了RNA修饰编写者在心力衰竭免疫微环境中的新作用，并鉴定了一种与肌生成相关的心脏驻留巨噬细胞Macro-MYL2 | 需要进一步实验验证RNA修饰编写者和Macro-MYL2巨噬细胞亚型在心脏免疫微环境中的调控作用 | 探讨RNA修饰编写者在心力衰竭免疫微环境中的作用及心脏驻留巨噬细胞的新亚型 | 心力衰竭患者的免疫细胞和RNA修饰编写者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了GSE145154和GSE141910数据集中的样本 |
| 1822 | 2024-11-15 |
IGF1 and CXCR4 Respectively Related With Inhibited M1 Macrophage Polarization in Keloids
2024-Aug-15, The Journal of craniofacial surgery
IF:1.0Q3
DOI:10.1097/SCS.0000000000010479
PMID:39145631
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研究论文 | 研究探讨了瘢痕疙瘩中M1巨噬细胞极化的抑制机制，并发现了IGF1和CXCR4作为潜在的生物标志物 | 首次发现IGF1和CXCR4与瘢痕疙瘩中M1巨噬细胞极化的抑制有关，并提出了潜在的病理机制 | 研究样本量较小，仅包括3名患者的瘢痕疙瘩组织和邻近正常组织 | 探索瘢痕疙瘩的免疫异质性和新的生物标志物，以设计新的治疗和预防策略 | 瘢痕疙瘩组织及其邻近正常组织中的M1和M2巨噬细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序分析、批量数据差异基因表达分析、基因本体论（GO）分析、基因集富集分析（GSEA）、免疫浸润分析 | NA | RNA | 3名患者的瘢痕疙瘩组织和邻近正常组织 |
| 1823 | 2024-11-15 |
Coronavirus disease 2019-related myocarditis genes contribute to ECMO prognosis
2024-07-19, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-024-04032-5
PMID:39026189
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研究论文 | 研究COVID-19相关心肌炎基因对ECMO预后的影响 | 通过分析GSE150392和GSE93101数据集，识别出与心肌炎和ECMO预后相关的差异表达基因，并验证了这些基因在不同细胞类型中的表达 | 研究主要基于已有的基因表达数据集，缺乏临床样本的直接验证 | 探讨COVID-19相关心肌炎基因对ECMO治疗预后的影响 | COVID-19相关心肌炎患者和ECMO治疗预后 | NA | 心血管疾病 | 差异表达基因分析、富集通路分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE150392、GSE93101和GSE167028数据集以及单细胞测序数据 |
| 1824 | 2024-11-15 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling and modeling of mouse brain at single-cell resolution reveals cell proximity effects of aging and rejuvenation
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.16.603809
PMID:39071282
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研究论文 | 研究通过单细胞分辨率的时空转录组学分析和建模，揭示了小鼠大脑衰老和再生过程中细胞邻近效应 | 首次开发基于空间转录组学的机器学习模型（空间衰老时钟），揭示了大脑衰老和再生过程中的细胞邻近效应 | 研究主要集中在小鼠大脑，尚未在人类中验证这些发现 | 研究大脑衰老和再生过程中细胞邻近效应，开发新的计算工具来识别这些效应的介质 | 小鼠大脑的单细胞时空转录组数据，以及两种再生干预措施（运动和部分重编程） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习模型 | 转录组数据 | 420万个细胞，来自20个不同年龄段和两种再生干预措施 |
| 1825 | 2024-11-15 |
Computational cell-cell interaction technologies drive mechanistic and biomarker discovery in the tumor microenvironment
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103048
PMID:38142648
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术研究肿瘤微环境中细胞间相互作用的最新进展 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示肿瘤微环境中的细胞间相互作用，促进肿瘤-免疫界面关键细胞间相互作用的发现 | 对肿瘤微环境中细胞异质性和相互作用伙伴的了解仍不完整，阻碍了完全的药物反应 | 探讨肿瘤微环境中细胞间相互作用的研究进展，促进药物靶点和肿瘤生物标志物的发现 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1826 | 2024-11-15 |
Exploring biomarkers of Alzheimer's disease based on multi-omics and Mendelian randomisation analysis
2024-Feb, Annals of human biology
IF:1.2Q4
DOI:10.1080/03014460.2024.2415035
PMID:39508514
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研究论文 | 本研究通过结合多组学和孟德尔随机化分析，探索阿尔茨海默病的生物标志物 | 本研究创新性地整合了PET、SNP和基因表达数据，并使用AdaSMCCA、rAdaSMCCA和unAdaSMCCA算法进行高级相关性分析，以识别与阿尔茨海默病相关的关键区域、风险SNP位点和风险基因 | NA | 识别有效的阿尔茨海默病诊断和治疗生物标志物 | 阿尔茨海默病患者的多组学数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化分析、单细胞转录组测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA |
| 1827 | 2024-11-15 |
A distinct immune landscape in anti-synthetase syndrome profiled by a single-cell genomic study
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1436114
PMID:39512337
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因组学方法分析了抗合成酶综合征患者外周血单个核细胞的转录组特征及其免疫谱系 | 首次在单细胞水平上揭示了抗合成酶综合征患者免疫系统的独特特征，并发现了与健康对照和MDA5+ DM患者相比的显著差异 | 样本量较小，仅包括3名抗合成酶综合征患者和3名MDA5+ DM患者 | 研究抗合成酶综合征患者外周血单个核细胞的转录组特征及其免疫谱系 | 抗合成酶综合征患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3名抗合成酶综合征患者、3名MDA5+ DM患者和4名健康对照 |
| 1828 | 2024-11-15 |
Deciphering the role of CCL4-CCR5 in coronary artery disease pathogenesis: insights from Mendelian randomization, bulk RNA sequencing, single-cell RNA, and clinical validation
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.99518
PMID:39512689
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析、批量RNA测序、单细胞RNA测序和临床验证，探讨了CCL4-CCR5在冠状动脉疾病发病机制中的作用 | 首次通过多种技术手段综合分析CCL4及其受体CCR5在冠状动脉疾病中的因果关系和潜在机制 | 研究主要基于现有数据集和临床样本，未来需更多实验验证 | 分析CCL4及其受体CCR5在冠状动脉疾病中的作用机制 | CCL4、CCR5及其在冠状动脉疾病中的表达和功能 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化分析、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 91种循环炎症蛋白、人类动脉粥样硬化斑块样本、CAD患者血清样本 |
| 1829 | 2024-11-15 |
CDKN1A as a target of senescence in heart failure: insights from a multiomics study
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1446300
PMID:39512814
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研究论文 | 本研究通过多组学数据整合，探讨了心肌细胞衰老与心力衰竭之间的关系，并确定了CDKN1A作为潜在的治疗靶点 | 首次通过多组学数据揭示了CDKN1A在心肌细胞衰老和心力衰竭中的因果关系 | 研究主要基于现有数据库和数据集，缺乏体内实验验证 | 通过多组学数据确定心肌细胞衰老相关基因与心力衰竭的遗传关联 | 心肌细胞衰老相关基因及其在心力衰竭中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)、孟德尔随机化 (MR)、贝叶斯共定位分析 | NA | 基因表达数据、DNA甲基化数据、蛋白质表达数据 | 39个衰老相关基因 (SRGs) 在心肌细胞中的表达数据 |
| 1830 | 2024-11-15 |
Integrative analysis of single-cell and bulk multi-omics data to reveal subtype-specific characteristics and therapeutic strategies in clear cell renal cell carcinoma patients
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.101451
PMID:39513109
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量多组学数据，揭示了透明细胞肾细胞癌患者的亚型特异性特征和治疗策略 | 本研究创新性地结合了单细胞RNA测序和批量数据，识别出两种异质性亚型，并分析了其分子特征、免疫治疗反应和药物敏感性差异 | 本研究主要基于已有的数据集进行分析，未来需要更多的临床验证和实验数据来进一步验证和优化结果 | 揭示透明细胞肾细胞癌患者的亚型特异性特征和治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤亚型及其分子特征、免疫治疗反应和药物敏感性 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达、DNA甲基化和基因突变数据 | NA |
| 1831 | 2024-11-15 |
Immunofluorescence-Verified Sphingolipid Signatures Indicate Improved Prognosis in Liver Cancer Patients
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.101330
PMID:39513103
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研究论文 | 本文通过多组学整合和免疫荧光验证，开发了一种基于鞘脂代谢的肝癌预后模型，并探讨了其在免疫治疗反应中的应用 | 首次通过多组学整合和免疫荧光验证，开发了一种基于鞘脂代谢的肝癌预后模型，并揭示了其在免疫治疗反应中的潜在应用 | 需要进一步的实验验证和临床试验来验证模型的临床应用 | 开发一种基于鞘脂代谢的肝癌预后模型，并探讨其在免疫治疗反应中的应用 | 肝细胞癌患者及其预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq, AUCell算法, Cox比例风险模型, Lasso回归, 免疫荧光 | Cox比例风险模型, Lasso回归 | 基因表达数据 | 独立验证队列来自国际癌症基因组联盟（ICGC） |
| 1832 | 2024-11-14 |
Single cell RNA-seq reveals cellular and transcriptional heterogeneity in the splenic CD11b+Ly6Chigh monocyte population expanded in sepsis-surviving mice
2024-Nov-06, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00970-0
PMID:39506629
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研究论文 | 研究分析了在脓毒症幸存小鼠中扩增的脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体的细胞和转录异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症幸存小鼠脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体的细胞和转录异质性 | 研究仅限于C57BL/6J和BALB/c小鼠模型，结果可能不适用于其他物种或人类 | 探讨脓毒症幸存者免疫失调的分子基础 | 脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | C57BL/6J和BALB/c小鼠的脾脏CD11b+Ly6Chigh细胞 |
| 1833 | 2024-11-14 |
Cellular heterogeneity and dynamics of the human uterus in healthy premenopausal women
2024-Nov-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404775121
PMID:39471215
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研究论文 | 研究应用单细胞RNA测序技术分析了来自五名健康育龄女性的子宫内膜和子宫肌层的细胞异质性和动态变化 | 构建了一个包含超过167,000个细胞的正常子宫细胞图谱，并提出了一个包含39个子类型的共识注释系统 | 研究仅限于健康育龄女性，未涵盖其他年龄段或疾病状态 | 揭示人类子宫在健康育龄女性的细胞异质性和动态变化 | 子宫内膜和子宫肌层的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5名健康育龄女性，共50,000多个子宫细胞 |
| 1834 | 2024-11-14 |
Correct stimulation of CD28H arms NK cells against tumor cells
2024-Nov, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350901
PMID:39101623
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研究论文 | 研究通过靶向CD28H激活NK细胞，增强其对肿瘤细胞的杀伤作用 | 首次研究了靶向CD28H的单克隆抗体对NK细胞的激活作用及其对肿瘤细胞的杀伤效果 | NA | 探讨CD28H在NK细胞激活和肿瘤免疫逃逸中的作用 | CD28H、NK细胞、肿瘤细胞 | 免疫学 | 肾癌 | 单克隆抗体、scRNA-seq | NA | 细胞 | 涉及多种血液细胞系和透明细胞肾癌细胞 |
| 1835 | 2024-11-14 |
Computational methods for allele-specific expression in single cells
2024-Nov, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.07.003
PMID:39127549
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综述 | 本文综述了单细胞等位基因特异性表达（ASE）数据的计算方法 | 本文讨论了处理和分析单细胞ASE数据的计算方法，并强调了未来需要整合和优化的生物信息学流程以及统计方法的发展 | NA | 探讨单细胞等位基因特异性表达数据的计算方法 | 单细胞等位基因特异性表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1836 | 2024-11-14 |
Adding Highly Variable Genes to Spatially Variable Genes Can Improve Cell Type Clustering Performance in Spatial Transcriptomics Data
2024-Oct-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5315913/v1
PMID:39502778
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研究论文 | 研究探讨了在空间转录组数据中，将高变异基因与空间变异基因结合是否能提高细胞类型聚类性能 | 首次研究了将高变异基因与空间变异基因结合对细胞类型聚类性能的影响 | 仅在50个真实空间转录组数据集上进行了测试，可能需要更多数据集验证 | 探讨在空间转录组数据中，结合高变异基因与空间变异基因对细胞类型聚类性能的影响 | 空间转录组数据中的高变异基因和空间变异基因 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 50个真实空间转录组数据集 |
| 1837 | 2024-11-14 |
Single-cell sequencing technology to characterize stem T-cell subpopulations in acute T-lymphoblastic leukemia and the role of stem T-cells in the disease process
2024-Oct-17, Aging
DOI:10.18632/aging.206123
PMID:39422621
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研究论文 | 研究使用单细胞测序技术分析急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病过程中的作用 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病发展中的作用 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 探讨急性T淋巴母细胞白血病中干细胞T细胞亚群的特征及其在疾病过程中的作用 | 急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 来自公共数据库的单细胞测序数据 |
| 1838 | 2024-11-14 |
Antibody-Fab and -Fc features promote Mycobacterium tuberculosis restriction
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.617070
PMID:39416184
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研究论文 | 研究了抗体Fab和Fc特征在限制结核分枝杆菌中的作用 | 通过Fc交换优化了保护性脂阿拉伯甘露聚糖特异性单克隆抗体，并揭示了Fc效应功能在限制中的关键作用 | NA | 探讨抗体在控制结核分枝杆菌中的机制 | 结核分枝杆菌、单克隆抗体、Fc变体 | NA | 结核病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1839 | 2024-11-14 |
Unraveling the phenotypic states of human innate-like T cells: Comparative insights with conventional T cells and mouse models
2024-Sep-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114705
PMID:39264810
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术，比较了人类先天样T细胞与常规T细胞在胸腺和血液中的转录组特征 | 揭示了人类先天样T细胞与常规T细胞在转录组水平上的差异，并发现了人类与小鼠在T细胞分化上的物种特异性差异 | NA | 探索人类先天样T细胞的表型状态及其与常规T细胞和小鼠模型的比较 | 人类先天样T细胞和常规T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和流式细胞术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1840 | 2024-11-14 |
IKKα-STAT3-S727 axis: a novel mechanism in DOX-induced cardiomyopathy
2024-Sep-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05439-1
PMID:39287798
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研究论文 | 研究探讨了IKKα在DOX诱导的心肌病中的作用及其机制 | 发现了IKKα-STAT3-S727信号通路在DOX诱导的心肌病中的关键作用 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 研究IKKα如何调节巨噬细胞激活并导致DOX诱导的心肌病 | 巨噬细胞IKKα在小鼠模型中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 使用巨噬细胞特异性IKKα敲除小鼠进行研究 |