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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1801 2025-10-07
Molecular differences between neonatal and adult stria vascularis from organotypic explants and transcriptomics
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过建立新生和成年小鼠血管纹器官型外植体模型并结合单细胞RNA测序,揭示了血管纹发育和维持的关键分子差异 首次建立了保留血-迷路屏障完整性的新生和成年血管纹器官型外植体模型,并结合单细胞RNA测序揭示了发育特异性基因表达谱 研究主要基于小鼠模型,人类血管纹可能存在物种特异性差异 研究血管纹在发育和成熟过程中的分子差异,为听力损失治疗提供新见解 新生和成年小鼠的血管纹组织 单细胞转录组学 听力损失 单细胞RNA测序,器官型外植体培养,药理学干预 小鼠器官型外植体模型 单细胞转录组数据,组织学数据 新生和成年小鼠血管纹组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1802 2025-10-07
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究构建了首个小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱,揭示了该组织的细胞组成和功能特征 首次创建小鼠精囊的单细胞转录组图谱,系统定义了分泌细胞和免疫细胞群体 NA 研究精囊组织的细胞组成和功能,探索其在生殖过程中的作用 小鼠精囊组织 单细胞生物学 生殖系统疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 23只不同年龄和饮食条件的小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1803 2025-10-07
Seq-Scope Protocol: Repurposing Illumina Sequencing Flow Cells for High-Resolution Spatial Transcriptomics
2024-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍Seq-Scope协议,将Illumina测序流动池重新用于高分辨率空间转录组学分析 开发了将Illumina测序平台重新用于高分辨率、高通量空间转录组分析的新方法 需要Illumina NovaSeq 6000等专业设备,方法复杂度较高 建立高分辨率空间转录组学分析协议 多种生物组织样本 空间转录组学 NA 空间转录组测序 无分割分析方法 图像, 转录组数据 NA Illumina 空间转录组学 Illumina NovaSeq 6000 Illumina测序流动池,支持7 mm × 7 mm或更大区域的多组织切片分析
1804 2025-10-07
Multi-omics analyses reveal bacteria and catalase associated with keloid disease
2024-Jan, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 通过多组学分析揭示细菌和过氧化氢酶与瘢痕疙瘩疾病的关联 首次综合运用微生物组、宏蛋白质组、代谢组、单细胞转录组和CDX小鼠模型研究细菌在瘢痕疙瘩中的作用机制 研究样本量有限,未明确说明具体样本数量 探索细菌在瘢痕疙瘩疾病发生发展中的作用机制 瘢痕疙瘩组织、健康皮肤组织、瘢痕疙瘩成纤维细胞、BALB/c雌性裸鼠 多组学分析 瘢痕疙瘩 16S rRNA测序, 宏蛋白质组学, 代谢组学, 单细胞RNA测序, 细胞源性异种移植模型 CDX小鼠模型 微生物组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1805 2025-10-07
A longitudinal molecular and cellular lung atlas of lethal SARS-CoV-2 infection in K18-hACE2 transgenic mice
2024-Jan, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序构建K18-hACE2转基因小鼠在SARS-CoV-2致死感染过程中的肺部分子和细胞图谱 首次在K18-hACE2转基因小鼠模型中利用单细胞RNA测序技术系统揭示SARS-CoV-2感染过程中肺部细胞动态变化和分子机制 研究基于转基因小鼠模型,与人类疾病存在物种差异 探究SARS-CoV-2在肺部组织中的致病机制和细胞响应 K18-hACE2转基因小鼠的肺组织 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA测序 K18-hACE2转基因小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1806 2025-10-07
ScRNA-seq reveals trained immunity-engaged Th17 cell activation against Edwardsiella piscicida-induced intestinal inflammation in teleost
2024-Dec, Microbiological research IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了β-葡聚糖训练通过激活Th17细胞缓解鲆鱼肠道炎症的机制 首次在硬骨鱼中发现训练免疫通过调节肠道Th17细胞功能对抗细菌感染的机制 研究仅限于鲆鱼模型,尚未在其他物种验证 探究硬骨鱼肠道免疫细胞在细菌感染中维持肠道稳态的细胞机制 鲆鱼(Scophthalmus maximus)肠道免疫细胞 单细胞转录组学 肠道炎症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1807 2025-10-07
Reciprocal regulation of SIRT1 and AMPK by Ginsenoside compound K impedes the conversion from plasma cells to mitigate for podocyte injury in MRL/lpr mice in a B cell-specific manner
2024-Mar, Journal of ginseng research IF:6.8Q1
研究论文 本研究揭示人参皂苷化合物K通过SIRT1和AMPK的相互调节机制,以B细胞特异性方式缓解狼疮肾炎小鼠的足细胞损伤 首次发现人参皂苷CK通过调节B细胞亚群中SIRT1和AMPK的协同作用,抑制浆细胞转化,从而减轻免疫复合物沉积 研究仅限于MRL/lpr小鼠模型,尚未在人类样本中验证 探讨人参皂苷CK在狼疮肾炎中对B细胞亚群和足细胞保护的作用机制 雌性MRL/lpr狼疮易感小鼠 分子生物学 狼疮肾炎 单细胞RNA测序、流式细胞术、代谢组学分析、免疫印迹、免疫荧光 NA 基因表达数据、代谢物数据、蛋白质数据 未明确样本数量的小鼠实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1808 2025-10-07
[Explorations about the correlation between biological changes of meninges in periodontitis mice and cognitive impairment via single-cell RNA sequencing]
2024-Jun-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
研究论文 通过单细胞RNA测序分析牙周炎小鼠脑膜的生物学变化,探讨其与认知障碍的潜在关联 首次应用单细胞RNA测序技术系统分析牙周炎小鼠脑膜的细胞组成和基因表达变化,揭示脑膜免疫与屏障功能在牙周炎相关认知障碍中的作用 样本量有限(30只小鼠),仅使用C57BL/6小鼠品系,未涉及其他动物模型或人类样本验证 阐明牙周炎小鼠脑膜生物学变化与认知障碍之间的相关性 C57BL/6小鼠(实验组15只,对照组15只) 单细胞组学 牙周炎 单细胞RNA测序,实时荧光定量PCR,免疫组织化学,基因本体富集分析,KEGG通路分析 NA 单细胞RNA测序数据,行为学数据,分子生物学数据 30只C57BL/6小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1809 2025-10-07
Single Cell Analysis of Human Colonoids Exposed to Uranium-Bearing Dust
2024-May, Environmental health perspectives IF:10.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析人类结肠类器官暴露于含铀粉尘后的分子和细胞变化 首次在人类结肠类器官模型中揭示含铀粉尘暴露对肠道上皮细胞谱系分化的特异性影响,特别是对分泌谱系细胞(肠内分泌细胞)的异常分化 仅使用三个生物学上不同的供体样本,样本量有限;仅研究急性暴露效应,未评估长期暴露影响 确定结肠在响应含铀粉尘暴露时发生的分子和细胞变化 人类结肠类器官 单细胞组学 环境暴露相关肠道疾病 单细胞RNA测序, 形态学分析, 成像技术 NA 单细胞转录组数据, 图像数据 来自三个不同生物学供体的人类结肠类器官 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1810 2025-10-07
Comprehensive multi-omics integration uncovers mitochondrial gene signatures for prognosis and personalized therapy in lung adenocarcinoma
2024-Oct-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过整合多组学数据开发基于线粒体相关基因的预后模型,用于肺腺癌的预后评估和个性化治疗 首次将单细胞RNA测序与转录组数据结合,聚焦线粒体相关基因,开发AI驱动的预后特征模型 基于公开数据库的回顾性分析,需要前瞻性研究验证 阐明线粒体相关基因在肺腺癌中的预后价值并开发个性化治疗策略 肺腺癌患者 生物信息学 肺腺癌 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 集成机器学习算法 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 TCGA-LUAD数据集及多个独立验证数据集 NA 单细胞RNA-seq, 转录组测序 NA NA
1811 2025-10-07
The effects of age and dysfunction on meibomian gland population dynamics
2024-Oct, The ocular surface
研究论文 本研究利用单细胞和空间转录组学探索小鼠睑板腺功能障碍中细胞组成、分化和基因表达的变化 首次结合单细胞和空间转录组学揭示睑板腺细胞分化过程中脂质生成基因的层次表达模式,以及年龄和Awat2基因缺失对腺体功能的影响 研究仅限于小鼠模型,结果向人类转化的适用性需要进一步验证 探究年龄和功能障碍对睑板腺群体动态的影响机制 野生型C57Bl/6小鼠和Awat2基因敲除小鼠的睑板腺组织 空间转录组学 睑板腺功能障碍 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 年轻(6月)和老年(22月)野生型小鼠,年轻(3月)和老年(13月)Awat2 KO小鼠 Resolve Biosciences 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Molecular Cartography 100基因睑板腺特异性Molecular Cartography面板
1812 2025-10-07
CRISPRi-based screens in iAssembloids to elucidate neuron-glia interactions
2024-Nov-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种名为iAssembloids的3D共培养系统,结合CRISPRi筛选技术研究神经元-胶质细胞相互作用机制 首次将iAssembloids系统与大规模CRISPRi筛选相结合,在3D模型中发现了GSK3β抑制NRF2介导的氧化应激反应的新机制,这在2D单一培养神经元筛选中未被发现 研究主要基于体外3D培养模型,可能需要进一步在体实验验证 阐明神经元与胶质细胞相互作用的分子机制,特别是在神经元死亡和存活过程中的作用 神经元和胶质细胞 神经科学 阿尔茨海默病 CRISPRi筛选, 单细胞转录组学, 免疫组织化学 3D共培养系统(iAssembloids) 基因表达数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1813 2025-10-07
Investigating gene functions and single-cell expression profiles of de novo variants in orofacial clefts
2024-Jul-18, HGG advances
研究论文 本研究通过分析唇腭裂中的新生变异基因功能及其单细胞表达谱,探索了非OMIM数据库基因在颅面发育中的作用 首次将新生变异基因与OMIM已知基因进行系统性比较,并利用单细胞RNA测序技术揭示这些基因在鼠唇发育过程中的细胞类型特异性表达模式 CPO基因集分析因DNV基因数量有限而未获得显著发现 探索唇腭裂中新生变异基因的功能及其在颅面发育中的表达特征 853个含新生变异基因(其中230个与CL/P相关,23个与CPO相关)及OMIM数据库中的455个已知基因(178个CL/P基因,277个CPO基因) 基因组学 唇腭裂 单细胞RNA测序 NA 基因组数据,单细胞表达数据 960个新生变异 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1814 2025-10-07
Inflammatory recruitment of healthy hematopoietic stem and progenitor cells in the acute myeloid leukemia niche
2024-04, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究揭示了健康造血干细胞和祖细胞在急性髓系白血病微环境中通过炎症反应主动参与疾病进程 首次发现HSPCs是白血病细胞介导骨髓炎症适应的未知组成部分,并证明AML来源的细胞外囊泡足以触发这种炎症反应 研究基于两种同源AML模型,结果在人类AML中的适用性需要进一步验证 探究健康造血干细胞和祖细胞在AML骨髓微环境炎症反应中的作用机制 造血干细胞和祖细胞(HSPCs)、急性髓系白血病细胞 血液肿瘤学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序、骨髓血浆分泌组分析、细胞外囊泡研究 NA 基因表达数据、蛋白质分泌数据 两种同源AML模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1815 2025-10-07
Tetrahedral DNA loaded siCCR2 restrains M1 macrophage polarization to ameliorate pulmonary fibrosis in chemoradiation-induced murine model
2024-Mar-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本研究开发了一种新型小鼠肺纤维化模型,并验证了通过四面体DNA递送siCCR2抑制M1巨噬细胞极化治疗肺纤维化的新策略 整合博来霉素气管给药和胸部照射建立持续性肺泡炎介导的纤维化小鼠模型;首次揭示CCL2/CCR2轴驱动M1巨噬细胞极化的关键作用;开发了多粘性末端四面体框架核酸结合四联ccr2-siRNA的新型治疗平台 动物模型仍需进一步验证与人类IPF的相似性;治疗策略的长期安全性和有效性需要更多研究 探索肺纤维化发病机制并开发新型治疗策略 小鼠模型和人类IPF患者 分子生物学 肺纤维化 单细胞RNA测序,基因沉默技术 动物疾病模型 基因表达数据,病理数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1816 2025-10-07
Identification of AgRP cells in the murine hindbrain that drive feeding
2024-Feb, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 本研究在小鼠后脑中发现并表征了先前未知的AgRP细胞群,这些细胞能够独立于下丘脑AgRP神经元驱动摄食行为 首次在小鼠后脑区域(包括最后区、亚后区及孤束核连合部)鉴定出AgRP表达细胞群,证明这些细胞具有独立于下丘脑的促食欲功能 研究主要聚焦于小鼠模型,尚未在其它物种中验证;对AgRPHind细胞的具体神经环路机制仍需进一步探索 探究后脑中AgRP细胞的存在及其在摄食调控中的作用 小鼠后脑AgRP表达细胞 神经科学 代谢疾病 基因表达分析、单细胞RNA测序、免疫荧光分析、DREADD化学遗传学、SOUL光遗传学 转基因小鼠模型 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像、行为学数据 多种转基因小鼠品系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1817 2025-10-07
Single Cell Sequencing Technology and Its Application in Alzheimer's Disease
2024, Journal of Alzheimer's disease : JAD
综述 概述单细胞测序技术及其在阿尔茨海默病研究中的应用 系统总结单细胞测序技术在解析阿尔茨海默病中枢神经系统细胞异质性方面的独特优势 NA 探讨单细胞测序技术在阿尔茨海默病研究中的应用价值 中枢神经系统细胞 单细胞测序 阿尔茨海默病 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞转录组学, 单细胞表观基因组学, 单细胞基因组学, 单细胞蛋白质组学 NA NA
1818 2025-10-07
Characterization of CD8+ virtual memory T cells in IL-4 knockout mice using single-cell RNA sequencing
2024-12-17, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析IL-4敲除小鼠中CD8+虚拟记忆T细胞的特性 首次在IL-4缺陷条件下系统表征外周CD8+虚拟记忆T细胞的分子特征和亚群变化 研究仅使用C57BL/6小鼠品系,样本量有限 探究IL-4缺失对外周CD8+虚拟记忆T细胞发育和维持的影响机制 野生型和IL-4敲除C57BL/6小鼠的脾脏CD8+ T细胞 单细胞基因组学 免疫系统疾病 单细胞RNA测序 Seurat 单细胞转录组数据 野生型和IL-4敲除C57BL/6小鼠脾脏CD8+ T细胞 10x Genomics single-cell RNA-seq 10x Chromium 10x Genomics单细胞RNA测序平台
1819 2025-10-07
Identification of LRP1+CD13+ human periosteal stem cells that require LRP1 for bone repair
2024-Nov-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞测序鉴定人类骨膜干细胞特异性标志物LRP1+CD13+及其在骨修复中的调控机制 首次发现LRP1和CD13作为人类骨膜干细胞的特异性标志物,并证实LRP1对骨修复的关键调控作用 研究主要基于小鼠模型,人类直接证据有限 鉴定人类骨膜干细胞的特异性标志物并研究其在骨修复中的功能 人类和小鼠骨膜组织 干细胞生物学 骨骼疾病 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1820 2025-10-07
scMitoMut for calling mitochondrial lineage-related mutations in single cells
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 开发了一个名为scMitoMut的R软件包,用于在单细胞水平准确识别线粒体谱系相关突变 基于β-二项分布为每个细胞中每个位点的突变分配质量q值,提高了谱系相关突变检测的灵敏度和精确度 NA 开发用于单细胞水平线粒体DNA谱系相关突变检测的统计工具 单细胞DNA测序数据、单细胞ATAC测序数据和10× Genomics多组学数据 生物信息学 结直肠癌 单细胞DNA测序、单细胞ATAC测序、单细胞多组学测序 β-二项分布统计模型 基因组测序数据、表观基因组数据 细胞系混合群体、人类结直肠癌样本、血液和脑组织细胞 10x Genomics single-cell multi-omics, single-cell ATAC-seq, single-cell DNA sequencing 10× Genomics multiome 10× Genomics单细胞多组学平台
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