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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1781 | 2025-10-07 |
Intestinal Stromal Cells in the Turmoil of Inflammation and Defective Connective Tissue Remodeling in Inflammatory Bowel Disease
2024-09-03, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izae066
PMID:38581412
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综述 | 本文综述了肠道基质细胞在炎症性肠病中对炎症反应和细胞外基质重塑的调控作用 | 通过单细胞测序和空间转录组学揭示了基质细胞表型复杂性及空间功能分区,为靶向治疗提供新视角 | 当前IBD治疗主要针对炎症过程,对纤维狭窄或瘘管性疾病疗效有限 | 探讨肠道基质细胞在IBD发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 肠道上皮下肌成纤维细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1782 | 2025-10-07 |
West Nile Virus-Induced Expression of Senescent Gene Lgals3bp Regulates Microglial Phenotype within Cerebral Cortex
2024-Jul-08, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070808
PMID:39062523
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研究论文 | 本研究探讨西尼罗河病毒感染如何通过衰老基因Lgals3bp调控小胶质细胞表型变化 | 首次揭示LGALS3BP蛋白在病毒感染诱导的小胶质细胞衰老过程中的调控作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 阐明西尼罗河病毒感染与大脑皮层小胶质细胞衰老的分子机制 | 成年和老年小鼠的大脑皮层小胶质细胞 | 神经科学 | 神经病毒感染 | 空间转录组学,RNA测序,流式细胞术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 成年和老年小鼠群体 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1783 | 2025-10-07 |
Loss of p73 Expression Contributes to Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-01-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0503OC
PMID:37931077
|
研究论文 | 本研究探讨p73表达缺失在慢性阻塞性肺疾病发病机制中的作用 | 首次揭示p73缺失导致多纤毛细胞缺失并自发引发COPD样肺部病理改变 | 样本量有限,人类研究样本数量较少(吸烟者82例,既往吸烟者69例,COPD患者11例,对照组12例) | 确定p73缺失是否导致小鼠出现COPD样表型,并探讨吸烟或COPD对p73表达的影响 | 小鼠模型、人类气道上皮细胞、吸烟者和COPD患者 | 呼吸系统疾病研究 | 慢性阻塞性肺疾病 | 电子显微镜、流式细胞术、形态计量学、强迫振荡技术、单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、形态学数据 | 小鼠模型未明确数量,人类研究:当前吸烟者82例,既往吸烟者69例,COPD患者11例,非COPD对照12例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1784 | 2025-10-07 |
Interleukin 13 Promotes Maturation and Proliferation in Metaplastic Gastroids
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101366
PMID:38815928
|
研究论文 | 本研究建立Meta1胃类器官模型,探究IL-13通过STAT6信号通路促进SPEM细胞成熟与增殖的机制 | 首次建立可稳定传代的SPEM细胞体外类器官模型,揭示IL-13/STAT6轴在胃黏膜化生中的调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 阐明IL-13对SPEM细胞成熟和增殖的分子机制 | 小鼠胃类器官(正常和化生型)、人类化生胃类器官、ILC2细胞 | 细胞生物学 | 胃黏膜化生 | 单细胞RNA测序、细胞分选、三维共培养、气液界面培养、STAT6抑制实验 | 类器官模型 | 基因表达数据、蛋白质磷酸化数据 | Mist1-Kras转基因小鼠和IL-13-tdTomato报告基因小鼠的胃组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1785 | 2025-10-07 |
Multi-omics analyses and machine learning prediction of oviductal responses in the presence of gametes and embryos
2024-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598905
PMID:38915688
|
研究论文 | 通过多组学分析和机器学习预测输卵管对配子和胚胎存在的响应机制 | 开发了基于transformer的机器学习模型整合转录组和蛋白质组数据,首次系统揭示输卵管对配子和胚胎的时空特异性响应 | 小鼠模型与人类输卵管炎症反应存在部分差异,样本采集时间点有限 | 阐明输卵管与配子/胚胎之间的适应性相互作用机制 | 小鼠输卵管组织及输卵管液样本 | 机器学习 | 生殖系统疾病 | RNA-seq, scRNA-seq, 蛋白质组学 | transformer | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 小鼠输卵管组织在不同交配后时间点的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 1786 | 2025-10-07 |
Type I interferon signaling pathway enhances immune-checkpoint inhibition in KRAS mutant lung tumors
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2402913121
PMID:39186651
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现KRAS突变肺肿瘤中I型干扰素通路受损,恢复该通路可增强免疫检查点抑制疗效 | 首次揭示KRAS突变肺肿瘤中I型干扰素通路受损是贯穿肿瘤发展的关键特征,证明恢复该通路可使免疫冷肿瘤转化为热肿瘤 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索KRAS突变肺肿瘤早期发展阶段的功能性改变及其对免疫治疗的影响 | 表达KRAS致癌基因的小鼠肺泡II型细胞及携带p53或LKB1突变的小鼠和人类晚期肿瘤 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1787 | 2025-10-07 |
cfDiffusion: diffusion-based efficient generation of high quality scRNA-seq data with classifier-free guidance
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf071
PMID:39987461
|
研究论文 | 提出基于扩散模型的高质量单细胞RNA测序数据生成方法cfDiffusion | 结合无分类器引导和高级特征缓存机制,显著降低训练成本并提高多属性单细胞数据生成效率 | 推理时间仍长于scDiffusion方法 | 解决单细胞RNA测序数据模拟中的质量和效率问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1788 | 2025-10-07 |
Meta-atlas of Juvenile and Adult Enteric Neuron scRNA-seq for Dataset Comparisons and Consensus on Transcriptomic Definitions of Enteric Neuron Subtypes
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.31.621315
PMID:39574584
|
研究论文 | 通过整合多个小鼠肠道神经系统单细胞RNA测序数据集,构建肠道神经元的元图谱并建立神经元亚型的转录组学共识定义 | 首次系统整合多个独立scRNA-seq数据集,构建肠道神经元的元图谱,实现跨年龄段的共识分类 | 数据集间细胞分离和文库构建方法存在差异,未来需将转录组谱与历史分类系统关联 | 识别新的细胞类型、共享标记基因、数据集差异,并建立肠道神经元亚型的转录组学共识定义 | 小鼠肠道神经系统神经元 | 单细胞转录组学 | 胃肠动力障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单核RNA测序 | 数据整合分析 | 单细胞转录组数据 | 多个独立数据集整合 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1789 | 2025-10-07 |
Characterization of an orthotopic mouse transplant model reveals early changes in the tumor microenvironment of lung cancer
2024-Nov, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:39044458
|
研究论文 | 本研究通过建立原位移植小鼠模型,利用单细胞RNA测序技术揭示了肺癌早期肿瘤微环境的细胞和分子变化 | 首次在携带Kras G12C突变的Lewis肺癌原位移植模型中,通过检测突变Kras转录本识别肿瘤细胞,并系统揭示了早期肿瘤微环境中成纤维细胞、髓系细胞和T/NK细胞的表型变化 | 研究基于小鼠移植模型,可能无法完全模拟人类肺癌的自然发生过程 | 探究肺癌早期阶段的细胞和分子动态变化 | Lewis肺癌细胞系(LLC)和原位移植小鼠模型 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1790 | 2025-10-07 |
MCAM is a prognostic biomarker in patients with liver cirrhosis and HCC
2024-Oct-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000532
PMID:39992088
|
研究论文 | 本研究评估了可溶性黑色素瘤细胞粘附分子(sMCAM)作为肝硬化和肝细胞癌患者预后血液生物标志物的潜力 | 首次发现sMCAM在肝纤维化和HCC患者血液中水平升高,并证明其作为预后生物标志物的价值 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 评估sMCAM作为肝硬化和HCC患者预后血液生物标志物的临床应用价值 | 健康对照者、慢性肝病患者、肝硬化患者和肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 组织图像, 血液样本 | 健康对照8例, 慢性肝病66例, 肝硬化236例, 肝细胞癌72例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1791 | 2025-10-07 |
POSTN+ cancer-associated fibroblasts determine the efficacy of immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2024-Jul-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008721
PMID:39067872
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据、空间转录组学和多重免疫荧光技术,揭示了POSTN+癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌免疫治疗抵抗中的关键作用 | 首次系统鉴定POSTN+ CAF亚群在肝癌免疫治疗中的屏障作用,并阐明其通过IL-6/STAT3信号通路招募SPP1+巨噬细胞形成免疫抑制微空间的机制 | 研究基于六个数据集的220个样本,样本来源和数量可能存在局限性 | 探究肝细胞癌免疫治疗抵抗机制,特别关注癌症相关成纤维细胞亚群的作用 | 肝细胞癌患者肿瘤微环境中的细胞组成和相互作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 220个样本来自六个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1792 | 2025-10-07 |
The rise of single-cell transcriptomics in yeast
2024-04, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.3934
PMID:38403881
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组技术在酵母研究中的应用现状与发展前景 | 系统总结了酵母单细胞RNA测序技术面临的独特技术挑战及解决方案 | NA | 探讨单细胞转录组技术在酵母研究中的技术发展和应用潜力 | 酵母单细胞转录组学研究 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1793 | 2025-10-07 |
scMGATGRN: a multiview graph attention network-based method for inferring gene regulatory networks from single-cell transcriptomic data
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae526
PMID:39417321
|
研究论文 | 提出基于多视图图注意力网络的scMGATGRN方法,用于从单细胞转录组数据推断基因调控网络 | 首次将多视图图注意力网络应用于基因调控网络推断,能够同时利用局部特征信息和高阶邻居特征信息 | 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性 | 开发更准确的基因调控网络推断方法 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图注意力网络(GAT), 多视图注意力机制 | 单细胞转录组数据 | 7个基准单细胞RNA测序数据集,来自5个细胞系(2个人类,3个小鼠) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1794 | 2025-10-07 |
Identification of microenvironment features associated with primary resistance to anti-PD-1/PD-L1 + antiangiogenesis in gastric cancer through spatial transcriptomics and plasma proteomics
2024-Sep-13, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02092-x
PMID:39272096
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研究论文 | 通过空间转录组学和血浆蛋白质组学分析胃癌对抗PD-1/PD-L1+抗血管生成联合疗法原发性耐药的肿瘤微环境特征 | 首次结合空间转录组学和血浆蛋白质组学系统分析胃癌联合治疗耐药机制,发现M2巨噬细胞浸润和S100A10过表达的关键作用 | 研究样本仅限REGOMUNE II期临床试验的 Caucasian 患者群体,样本代表性有限 | 探究胃癌患者对抗PD-1/PD-L1+抗血管生成联合疗法原发性耐药的分子机制 | 晚期胃癌患者 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学, 血浆蛋白质组学, 生物标志物分析 | NA | 空间转录组数据, 血浆蛋白质数据, 临床数据 | REGOMUNE II期临床试验患者群体 | NA | 空间转录组学, 血浆蛋白质组学 | NA | NA |
| 1795 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas of the human brain vasculature across development, adulthood and disease
2024-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07493-y
PMID:38987604
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了人类大脑血管系统在发育期、成年期和疾病状态下的分子图谱 | 首次在单细胞水平系统描绘人类大脑血管系统的分子异质性,揭示了疾病状态下动静脉分化改变和胎儿期基因重新激活等新现象 | 样本来源和数量仍有限,未能覆盖所有脑部血管疾病类型 | 解析人类大脑血管系统的细胞和分子结构 | 人类胎儿和成年患者的大脑血管内皮细胞、周细胞及其他组织来源细胞 | 单细胞基因组学 | 脑部血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 117个样本,606,380个细胞,来自68名人类胎儿和成年患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1796 | 2025-10-07 |
SFXN1-mediated immune cell infiltration and tumorigenesis in lung adenocarcinoma: A potential therapeutic target
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111918
PMID:38537539
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研究论文 | 本研究探讨了SFXN1在肺腺癌中的功能作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示SFXN1通过调节ERK磷酸化和CCL20表达影响免疫细胞浸润的分子机制 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库,需要更多临床样本验证 | 研究SFXN1在肺腺癌进展中的功能意义并评估其治疗靶点潜力 | 肺腺癌细胞系、TCGA和GEO数据库中的RNA-seq和scRNA-seq数据 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, Western blot, IHC | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、体外实验数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1797 | 2025-10-07 |
Integrated scRNAseq analyses of mouse cochlear supporting cells reveal the involvement of Ezh2 in hair cell regeneration
2024-Jan-28, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-023-09173-y
PMID:38281217
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研究论文 | 通过整合分析小鼠耳蜗支持细胞的单细胞RNA测序数据,揭示Ezh2在毛细胞再生中的潜在作用 | 首次通过整合多个发育时间点的单细胞RNA测序数据,识别出与发育阶段相关的共表达基因,并发现Ezh2和KLF15可能是关键转录调控因子 | 研究主要基于公共数据库的测序数据,需要进一步实验验证Ezh2的具体调控机制 | 探索小鼠耳蜗毛细胞再生能力的分子基础 | 小鼠耳蜗前感觉细胞和支持细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损伤 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠耳蜗组织从胚胎期14天到出生后33天的多个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1798 | 2025-10-07 |
Ectopic expression of NKG7 enhances CAR-T function and improves the therapeutic efficacy in liquid and solid tumors
2024-Dec, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107506
PMID:39551173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现NKG7过表达可增强CAR-T细胞功能并提高对液体和实体瘤的治疗效果 | 首次利用临床样本单细胞测序数据发现NKG7可作为增强CAR-T细胞功能的靶点,并验证其在多种消化系统癌症模型中的治疗效果 | 研究样本量有限(19例单细胞测序数据),且缺乏治疗后活检样本验证 | 探索增强CAR-T细胞功能的策略并提高其抗肿瘤疗效 | 消化系统癌症患者肿瘤浸润T细胞及B7H3阳性消化系统癌细胞系 | 单细胞测序分析 | 消化系统癌症 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞模型 | 单细胞RNA测序数据 | 19例消化系统癌症临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1799 | 2025-10-07 |
Gas6-Axl signal promotes indoor VOCs exposure-induced pulmonary fibrosis via pulmonary microvascular endothelial cells-fibroblasts cross-talk
2024-08-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.134786
PMID:38824778
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研究论文 | 本研究通过建立室内VOCs暴露小鼠模型,揭示了Gas6-Axl信号通过肺微血管内皮细胞与成纤维细胞相互作用促进肺纤维化的新机制 | 首次发现室内VOCs暴露通过诱导肺微血管内皮细胞PANoptosis表型分泌Gas6,激活成纤维细胞Axl受体促进肺纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需要进一步验证 | 阐明室内挥发性有机化合物暴露诱导肺纤维化的分子机制 | 小鼠模型、肺微血管内皮细胞、肺成纤维细胞 | 单细胞组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | VOCs暴露小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1800 | 2025-10-07 |
Systemic immune profiling analysis identifying M2-TAM related genes predicted colon cancer prognosis and chemotherapy responses
2024-Dec-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000040979
PMID:39969348
|
研究论文 | 本研究通过系统免疫分析鉴定M2-TAM相关基因,用于预测结肠癌预后和化疗反应 | 开发了新的M2样巨噬细胞标记基因,建立了基于7个基因的M2-TAM风险模型,并通过孟德尔随机化验证了免疫检查点与结肠癌的因果关系 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索与M2样巨噬细胞相关的新生物标志物,用于结肠癌预后预测和治疗反应评估 | 结肠癌患者 | 生物信息学 | 结肠癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,LASSO回归,Cox回归,孟德尔随机化 | 风险预测模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结肠癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |