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当前共找到 7466 篇文献,本页显示第 161 - 180 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
161 2026-09-01
ZEB1-mediated fibroblast polarization controls inflammation and sensitivity to immunotherapy in colorectal cancer
2024-08, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究揭示ZEB1在结直肠癌相关成纤维细胞中的极化作用,调控炎症、免疫微环境及免疫治疗敏感性 首次阐明ZEB1在CAF中的特定角色,通过单细胞转录组学揭示其调控CAF极化,影响CD8+ T细胞浸润和免疫检查点抑制效果,提出靶向CAF中ZEB1作为免疫治疗增敏策略 研究主要基于小鼠模型,人类CRC中的ZEB1功能需进一步验证 探究ZEB1在结直肠癌相关成纤维细胞中对肿瘤炎症、免疫微环境和免疫治疗反应的影响 结直肠癌小鼠模型及肿瘤相关成纤维细胞 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序、组织学分析、体外建模 NA 基因表达数据、组织图像 小鼠模型及体外细胞培养样本,具体数量未提供 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
162 2026-09-01
Bioengineered human colon organoids with in vivo-like cellular complexity and function
2024-08-01, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究开发了名为“迷你结肠”的高级人类结肠类器官模型,该模型结合了类器官和器官芯片技术,以实现在体外模拟体内肠道组织的复杂性、细胞多样性和功能成熟度 通过不对称生长因子刺激,显著提高了组织长期存活能力,并复制了体内样增殖和分化细胞类型的多样性,实现了类器官成熟,包含丰富的黏液分泌杯状细胞和功能性结肠细胞 摘要中未明确提及局限性 开发一种能更接近真实体内环境的人类结肠类器官模型,用于研究肠道生理和病理,并作为药物安全性评估的临床前模型 人类结肠和小肠组织来源的类器官 组织工程和类器官技术 NA 类器官培养, 单细胞RNA测序 类器官模型 生物组织样本, 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
163 2026-09-01
ezSingleCell: an integrated one-stop single-cell and spatial omics analysis platform for bench scientists
2024-07-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 ezSingleCell是一个集成的单细胞和空间组学一站式分析平台,面向无编程经验的实验科学家,提供交互式数据分析、整合和可视化功能 该平台将多种单细胞和空间组学数据分析方法整合到一个用户友好的界面中,无需编程知识,且支持模块间交互,提供快速分析(3000细胞少于5分钟)和多种数据格式输入 未明确提及,但平台可能依赖于公开方法的性能,且目前主要针对单细胞和空间组学数据,对于其他数据类型可能适用性有限 为实验科学家提供一个无需编程背景即可使用的单细胞和空间组学数据分析平台,简化分析流程并提高可访问性 各类单细胞和空间组学数据类型,包括scRNA-seq等 生物信息学 NA 单细胞测序、空间组学 NA 单细胞和空间组学数据 标准scRNA-seq数据集,3000个细胞,用于性能评估 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
164 2026-09-01
A unified model-based framework for doublet or multiplet detection in single-cell multiomics data
2024-07-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一个基于复合泊松模型的框架,用于检测单细胞多组学数据中的双细胞或多细胞事件 首次利用实验细胞哈希结果作为多重态真实标签,在单细胞多组学数据中集成跨模态多重态信号,消除多重态聚类 摘要中未提及局限性 开发有效的多重态检测方法,提高单细胞多组学数据分析中细胞类型注释的准确性 单细胞多组学数据中的细胞多重态(双细胞或多细胞) 机器学习 NA 单细胞多组学测序(DOGMA-seq) 复合泊松模型 单细胞多组学数据(基因表达、染色质可及性、免疫组库等) 280123个微滴,来自两种组织,17个基准数据集 10x Genomics 单细胞多组学 10x Chromium 10x Chromium平台进行DOGMA-seq实验,结合细胞哈希技术
165 2026-09-01
Identification of unique cell type responses in pancreatic islets to stress
2024-07-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过多重单细胞RNA测序分析原发性人类胰岛细胞对内质网和炎症应激的细胞类型特异性转录反应,并利用干细胞衍生胰岛验证候选基因CIB1在胰岛健康中的作用 首次系统性地对多种人类胰岛内分泌和外分泌细胞类型在糖尿病相关应激下的转录反应进行全面的配对比较,识别出β细胞、α细胞和导管细胞具有最强的转录响应,并利用干细胞衍生胰岛作为模型验证候选基因CIB1的功能 未明确提及研究的局限性,可能包括样本数量有限、体外应激条件与体内环境的差异,以及干细胞衍生胰岛与原代胰岛的生物学差异 表征人类胰岛细胞在糖尿病相关应激下的细胞类型特异性转录反应,并建立资源以识别糖尿病治疗靶点 原发性人类胰岛细胞(包括内分泌和外分泌细胞类型)以及干细胞衍生的胰岛 单细胞转录组学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 未明确提及具体样本数量,但涉及原发性人类胰岛细胞和干细胞衍生胰岛 NA 单细胞RNA-seq NA 多重单细胞RNA测序
166 2026-09-01
A single-cell atlas of Drosophila trachea reveals glycosylation-mediated Notch signaling in cell fate specification
2024-03-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序技术构建了果蝇气管的全面细胞图谱,揭示了糖基化介导的Notch信号在细胞命运决定中的作用 首次提供了果蝇气管的单细胞转录组图谱,并发现糖基化反应性Notch信号在气管细胞命运决定中的新机制 未提及 研究果蝇气管发育和再生过程中的细胞类型及其调控机制,特别是Notch信号在细胞命运决定中的作用 果蝇气管细胞,特别是气管成体干细胞(气管母细胞) 单细胞转录组学 不适用 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 不适用 单细胞转录组数据 未提及具体样本数量,但涵盖果蝇气管的9个主要细胞亚型 未提及 单细胞RNA-seq 未提及 未提及
167 2026-09-01
HMGB2 drives tumor progression and shapes the immunosuppressive microenvironment in hepatocellular carcinoma: insights from multi-omics analysis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,发现HMGB2在肝细胞癌的转移亚群中显著上调,并与免疫抑制微环境和不良预后相关,提示其作为治疗靶点和预后标志物的潜力 采用多组学整合方法,包括单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学和多重免疫组化,首次揭示HMGB2在肝癌转移和免疫抑制中的关键作用 研究主要基于转录组数据,未深入探讨HMGB2的上下游调控机制,且临床样本验证规模有限 探究肝细胞癌中影响肿瘤进展和免疫抑制微环境的关键因子,特别是HMGB2的作用 肝细胞癌患者的肿瘤组织样本及临床数据 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化 NA 基因表达数据、空间转录组数据、免疫组化图像 多个肝癌患者队列的临床样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE
168 2026-09-01
Platinum-based chemotherapy promotes antigen presenting potential in monocytes of patients with high-grade serous ovarian carcinoma
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析高级别浆液性卵巢癌患者外周血单核细胞,发现铂类化疗可促进单核细胞的抗原呈递潜力 首次揭示铂类化疗通过转录上调MHC II类分子而非表观遗传改变来诱导单核细胞抗原呈递,且该效应在三个单核细胞亚群中均存在 未提供具体局限性信息 揭示高级别浆液性卵巢癌患者外周血单核细胞的肿瘤特异性转录和表观遗传变化,以及化疗如何重编程单核细胞及其与其他免疫亚群的关系 高级别浆液性卵巢癌患者的外周血单核细胞 单细胞转录组学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
169 2026-09-01
Single-cell and bulk transcriptomic datasets enable the development of prognostic models based on dynamic changes in the tumor immune microenvironment in patients with hepatocellular carcinoma and portal vein tumor thrombus
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究整合单细胞和批量转录组数据,开发基于肝细胞癌伴门静脉癌栓患者肿瘤免疫微环境动态变化的预后模型 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,系统分析原发肿瘤与门静脉癌栓细胞的异质性,并建立能预测免疫治疗和预后结局的风险模型 体外实验仅部分验证了生物学预测结果,且研究基于公共数据库,可能存在样本选择偏倚 开发基于肿瘤免疫微环境动态变化的预后模型,以预测肝细胞癌伴门静脉癌栓患者的免疫治疗和预后结局 肝细胞癌伴门静脉癌栓患者 机器学习 肝细胞癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 聚类模型、风险模型 转录组数据 未明确说明(基于公共数据库) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
170 2026-08-31
Biallelic Loss-of-Function Variants in UBAP1L and Nonsyndromic Retinal Dystrophies
2024-11-01, JAMA ophthalmology IF:7.8Q1
研究论文 本研究描述6名携带UBAP1L基因双等位基因致病性变体的非综合征性视网膜营养不良患者,并提供了临床和分子特征。 首次将UBAP1L确定为非综合征性视网膜营养不良的新型候选致病基因,并通过小鼠模型和微小基因检测提供了功能证据。 小鼠模型在15个月时未表现出视网膜退化,可能无法完全反映人类疾病表型。 提供携带UBAP1L双等位基因致病性变体的IRD患者的临床和分子特征。 6名来自不同家族的IRD患者。 遗传学, 基因组学, 分子生物学 视网膜营养不良, 视网膜色素变性 外显子组测序, 基因组测序, 单细胞RNA测序, 微小基因测定, 基因敲除小鼠 敲除小鼠模型 基因组数据, 单细胞转录组数据, 临床影像数据 6名患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
171 2026-08-29
Protocol for isolating specific C. elegans neuron types for bulk and single-cell RNA sequencing
2024-12-20, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 描述了一种从秀丽隐杆线虫中分离特定神经元类型以进行批量或单细胞RNA测序的协议 提供了详细的步骤,用于从幼虫和成年动物中分离特定细胞类型,适用于批量或单细胞RNA测序 未明确提及 提供一种分离特定神经元类型进行基因表达谱分析的方法 秀丽隐杆线虫的特定神经元类型 分子生物学 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确提及 NA 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
172 2026-08-29
Attenuated kidney oxidative metabolism in young adults with type 1 diabetes
2024-10-22, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 研究年轻1型糖尿病患者的肾脏氧化代谢减弱及其与胰岛素敏感性的关联 结合高胰岛素-正葡萄糖钳夹、MRI、11C-乙酸PET、肾活检、单细胞RNA测序和空间代谢组学,首次揭示T1D早期肾脏氧化代谢异常与近端小管细胞亚型分布的关系 样本量较小且仅纳入年轻成人,研究为横断面设计,无法确定因果关系 评估T1D患者肾脏氧化代谢改变及其与胰岛素敏感性和早期肾脏结构变化的关系 年轻T1D患者和健康对照者的肾脏组织及临床数据 数字病理学、机器学习 糖尿病肾病 单细胞RNA测序、空间代谢组学、PET、MRI Slingshot算法(轨迹分析) 影像、基因表达、代谢物、临床数据 30名T1D患者和20名健康对照者 NA 单细胞RNA测序、空间代谢组学 NA NA
173 2026-08-29
A wound-induced differentiation trajectory for neurons
2024-07-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 该研究以高再生能力的无肠目蠕虫为对象,探究损伤诱导的转录调控事件如何导致神经元生成及功能性大脑再生 首次揭示NFY转录因子复合物在截肢后一小时内于尾部碎片中动态结合,启动神经分化轨迹,并识别出颈干细胞作为多种神经亚型的祖细胞群 具体机制尚未完全阐明,且研究限于单一生物模型,未在哺乳动物中验证 阐明损伤诱导神经元分化的转录调控机制,以理解大脑再生过程 高再生能力的无肠目蠕虫(acoel worm)及其尾部再生组织 分子生物学、再生医学 NA 染色质可及性分析(如ATAC-seq)、单细胞转录组分析 NA 染色质可及性数据、单细胞转录组数据 尾片段组织样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序、染色质可及性测序 NA NA
174 2026-08-29
Developing an advanced diagnostic model for hepatocellular carcinoma through multi-omics integration leveraging diverse cell-death patterns
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合多组学数据,利用多种细胞死亡模式构建了肝细胞癌(HCC)的七基因诊断模型,并验证了其诊断效能及潜在机制。 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组测序及血液外泌体RNA测序,基于六类细胞死亡相关基因构建了一个七基因诊断模型,并探索了关键基因与免疫检查点阻断治疗的相关性。 未明确提及局限性,但可能受限于样本量较小、数据库来源的异质性以及临床验证的广度。 阐明程序性细胞死亡相关基因在肝细胞癌中的作用,并构建高效的诊断模型以改善HCC的诊断方法。 肝细胞癌患者的肿瘤组织和血液来源外泌体样本,以及相应的单细胞和空间转录组数据。 数字病理学、机器学习 肝细胞癌 单细胞RNA测序、空间转录组测序、RNA测序、定量聚合酶链反应、免疫组织化学 机器学习模型(具体未指定) 基因表达数据、影像数据(空间转录组)、文本(临床信息) 50个样本和104,288个单细胞 NA 单细胞RNA测序、空间转录组测序、批量RNA测序 NA NA
175 2026-08-29
Mitotic catastrophe heterogeneity: implications for prognosis and immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究基于有丝分裂灾难(MC)相关基因,通过多组学数据分析揭示肝细胞癌中MC异质性对预后和免疫治疗的影响,并构建预后风险模型 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组分析,揭示MC异质性与免疫逃逸及治疗抵抗的关联,并构建结合MC风险评分和传统指标的预后列线图 主要依赖公共数据库数据,缺乏实验验证;MC基因列表基于既往研究,可能存在选择偏倚 探究肝细胞癌中有丝分裂灾难异质性与免疫逃逸及治疗反应的关系,并开发预后预测模型 肝细胞癌患者样本及其肿瘤微环境中的免疫特征和空间表达数据 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、空间转录组分析 风险评分模型 转录组数据、空间转录组数据、临床数据 基于TCGA、GEO、ICLC等公共数据库的肝细胞癌患者数据,具体样本量未提及 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
176 2026-08-29
Identification of novel biomarkers related to neutrophilic inflammation in COPD
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过生物信息学预测和实验验证,识别出与慢性阻塞性肺疾病中性粒细胞炎症相关的新型枢纽基因 结合单细胞RNA测序、批量RNA测序、孟德尔随机化和蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,识别出9个与COPD中性粒细胞炎症相关的新型枢纽基因,并验证了其中两个作为COPD风险因素的潜在生物标志物 研究主要依赖公开数据集和有限的临床样本验证,可能限制发现的普遍性;qRT-PCR验证在白细胞中进行,未在肺组织中直接验证 识别与COPD中性粒细胞炎症相关的新型枢纽基因,并探索其作为临床严重程度生物标志物的潜力 COPD患者和对照组的肺组织和外周血白细胞 生物信息学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序、RNA测序、加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、蛋白质-蛋白质相互作用网络、实时定量PCR Seurat, irGSEA, Monocle2, CIBERSORT, WGCNA 基因表达数据(scRNA-seq和RNA-seq)、临床标本数据 GSE173896(scRNA-seq)和GSE57148(RNA-seq)数据集,临床标本中的外周血白细胞(具体数量未在摘要中提供) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
177 2026-08-28
The prognostic marker KRT81 is involved in suppressing CD8 + T cells and predicts immunotherapy response for triple-negative breast cancer
2024-12-31, Cancer biology & therapy IF:4.4Q2
研究论文 本研究探讨了角蛋白81(KRT81)在三阴性乳腺癌中的预后价值及其对免疫治疗反应的预测作用,发现KRT81通过抑制CD8+ T细胞促进肿瘤进展 首次揭示KRT81在三阴性乳腺癌中作为独立预后因子,并通过单细胞RNA测序和共培养实验阐明其通过CD276抑制CD8+ T细胞的新机制,同时开发了基于KRT81的生存概率列线图 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内验证和临床前瞻性研究,且样本量可能有限,需进一步验证KRT81的临床应用价值 评估KRT81作为三阴性乳腺癌预后标志物和免疫治疗反应预测因子的潜力,并探索其免疫调节机制 三阴性乳腺癌肿瘤组织样本及细胞系,包括KRT81基因表达数据、单细胞RNA测序数据及免疫细胞共培养系统 数字病理学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序 Cox回归模型 基因表达数据、单细胞测序数据、图像数据 未明确给出具体样本数量,涉及TCGA等公共数据库及细胞系实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
178 2026-08-28
Peripheral Blood-Derived PD-1/CD28-CD19 CAR-Modified PD-1+ T-Cell Therapy in Patients with Solid Tumors
2024-12-03, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 该研究开发了基于外周血PD-1+ T细胞的PD-1/CD28-CD19 CAR-T细胞疗法,并在实体瘤患者中验证了其安全性和初步疗效 首次利用外周血PD-1+ T细胞,通过引入PD-1/CD28融合受体和CD19嵌合抗原受体增强其抗肿瘤活性,并成功应用于临床患者 仅纳入4例患者,样本量小,疗效评估有限,长期效果和安全性需进一步验证 评估修饰后外周血PD-1+ T细胞疗法在实体瘤中的安全性和有效性,并探索其作为治疗策略的潜力 实体瘤患者的外周血PD-1+ T细胞及纳入的4例癌症患者 细胞治疗、免疫肿瘤学 实体瘤(包括黑色素瘤) 单细胞RNA测序、嵌合抗原受体T细胞技术 CAR-T细胞模型 单细胞转录组数据、临床疗效数据 4例癌症患者及相应外周血样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
179 2026-08-28
A Single-Cell Analysis of the NK-Cell Landscape Reveals That Dietary Restriction Boosts NK-Cell Antitumor Immunity via Eomesodermin
2024-11-04, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示,饮食限制通过激活转录因子Eomesodermin增强NK细胞的抗肿瘤免疫,抑制黑色素瘤肺转移 首次发现饮食限制通过优化mTORC1信号促进Eomes表达,从而恢复功能性的CD27+CD11b+ NK细胞亚群,增强NK细胞的肿瘤免疫监视和活化 未提及 探究饮食限制是否以及如何通过调节NK细胞增强抗肿瘤免疫 NK细胞(特别是CD27+CD11b+亚群)以及黑色素瘤细胞 免疫学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 未提及 单细胞转录组数据 未提及 未提及 单细胞RNA测序 未提及 未提及
180 2026-08-28
The dynamic behavior of chromatophores marks the transition from bands to spots in leopard geckos
2024-07-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过组织学、遗传学及单细胞转录组分析,探讨了豹纹守宫从幼体条纹到成体黑斑的皮肤颜色模式转变机制 首次揭示了黑色素细胞在缺乏其他色素细胞时能自主形成黑斑,并鉴定出转录因子中的13核苷酸缺失突变,该突变影响虹膜细胞和黄素细胞的分化 研究主要基于豹纹守宫,可能不适用于其他爬行动物;且未详细阐明黑色素细胞-虹膜细胞相互作用的分子机制 阐明豹纹守宫皮肤条纹向黑斑转变的发育过程和分子调控机制 豹纹守宫(包括野生型和Mack Super Snow突变体)的皮肤及胚胎 发育生物学 不适用 组织学分析、遗传分析、单细胞转录组分析、原位杂交 不适用 组织学图像、转录组数据、基因序列数据 涉及豹纹守宫胚胎及幼体/成体皮肤样本,具体数量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞转录组分析
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