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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1761 | 2025-10-07 |
Pharmacology of Hydrogen Sulfide and Its Donors in Cardiometabolic Diseases
2024-Aug-15, Pharmacological reviews
IF:19.3Q1
DOI:10.1124/pharmrev.123.000928
PMID:38866561
|
综述 | 本文综述了硫化氢及其供体在心脏代谢疾病中的生理作用和药理机制 | 重点关注硫化氢通过蛋白质硫巯基化修饰调控心脏代谢疾病的新机制,并探讨新兴技术在相关研究中的应用前景 | 主要基于现有文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 探讨硫化氢在心脏代谢疾病中的治疗潜力及其药理作用机制 | 内源性硫化氢及其供体在细胞、动物和临床研究中的作用 | 药理学 | 心脏代谢疾病 | 多组学分析、肠道菌群分析、类器官、单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1762 | 2025-10-07 |
Transfer Learning Reveals Cancer-Associated Fibroblasts Are Associated with Epithelial-Mesenchymal Transition and Inflammation in Cancer Cells in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-May-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1660
PMID:38587552
|
研究论文 | 本研究通过整合人类肿瘤单细胞数据与类器官共培养实验,揭示了胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞与上皮细胞上皮-间质转化和炎症状态的关联 | 引入从人类单细胞数据到类器官共培养分析的迁移学习方法,用于细胞间相互作用的实验验证 | NA | 识别肿瘤细胞与癌症相关成纤维细胞的相互作用机制 | 胰腺导管腺癌患者样本和类器官共培养系统 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,迁移学习,类器官共培养 | 迁移学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1763 | 2025-10-07 |
Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotype and phenotype in chronic lymphocytic leukemia
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.15.585298
PMID:38559060
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研究论文 | 本研究利用长读长单细胞RNA测序技术研究慢性淋巴细胞白血病中癌症亚克隆的基因型和表型特征 | 首次将长读长单细胞RNA测序技术应用于研究BTK抑制剂治疗中出现的突变亚克隆,能够更全面地分析转录本覆盖度 | 研究样本量较小(仅6名患者),且仅在部分患者中观察到突变亚克隆的转录组差异 | 探究BTK抑制剂治疗中突变亚克隆的扩张机制和转录组特征 | 慢性淋巴细胞白血病患者中的癌症亚克隆 | 单细胞测序 | 慢性淋巴细胞白血病 | 长读长单细胞RNA测序,bulk DNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,DNA测序数据 | 6名获得BTK抑制剂治疗期间出现突变的CLL患者 | NA | 单细胞RNA测序,长读长测序 | MAS-seq | 长读长单细胞RNA测序技术 |
| 1764 | 2025-03-20 |
Single-Cell Sequencing Technology and Its Application in the Study of Central Nervous System Diseases
2024-Jun, Cell biochemistry and biophysics
IF:1.8Q4
DOI:10.1007/s12013-023-01207-3
PMID:38133792
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术及其在中枢神经系统疾病研究中的应用 | 单细胞测序技术能够对混合细胞群体中的单个细胞进行精确分析,并从中枢神经系统的不同空间位置、时间阶段和细胞类型中收集细胞,从而发现与特定疾病相关的细胞亚群及其相关基因 | NA | 探索单细胞测序技术在中枢神经系统疾病研究中的应用 | 中枢神经系统中的细胞,包括神经元和胶质细胞(如星形胶质细胞、少突胶质细胞和小胶质细胞) | 生物信息学 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1765 | 2025-10-07 |
Altered Purinergic Signaling and CD8+ T Cell Dysregulation in STAT3 GOF Syndrome
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.12.626682
PMID:39713308
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研究论文 | 本研究揭示了STAT3功能获得性突变综合征中嘌呤信号通路异常与CD8+ T细胞功能失调的分子机制 | 首次发现STAT3 GOF综合征中CD8+ T细胞存在嘌呤信号通路失调,具体表现为CD39表达上调而CD73和A2AR表达下调 | STAT3 GOF变异驱动病理的确切分子机制尚未完全阐明 | 探究STAT3功能获得性突变导致CD8+ T细胞失调的分子机制 | STAT3 GOF综合征患者和小鼠模型的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫调节疾病 | 单细胞RNA测序, 高维免疫分析, 功能评估 | NA | 基因表达数据, 功能实验数据 | STAT3 GOF患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1766 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis reveals a unique microenvironment in peri-implantitis
2024-12, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13982
PMID:38566468
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示种植体周围炎独特的免疫微环境特征 | 首次通过单细胞分析发现种植体周围炎中CXCL13+成纤维细胞亚群特异性增加,并揭示其通过CXCL8/CXCL6-CXCR2/CXCR1轴招募中性粒细胞的机制 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 揭示种植体周围炎的独特微环境特征 | 种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体的组织活检样本 | 数字病理学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1767 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling reveals a conserved role for hypoxia-inducible factor signaling during human craniotomy infection
2024-Nov-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101790
PMID:39426374
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示人类开颅手术感染中缺氧诱导因子信号通路的保守作用 | 首次在人类开颅手术感染中鉴定出粒细胞样髓源性抑制细胞的主导作用及保守的缺氧诱导因子信号特征 | 回顾性研究设计,样本来源单一 | 探索开颅手术感染的细胞和分子特征 | 开颅手术感染患者组织样本和小鼠模型 | 单细胞组学 | 手术感染 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 超过2,500例开颅手术回顾性分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1768 | 2025-10-07 |
Single-Cell Proteomic and Transcriptomic Characterization of Drug-Resistant Prostate Cancer Cells Reveals Molecular Signatures Associated with Morphological Changes
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619905
PMID:39553982
|
研究论文 | 通过单细胞蛋白质组学和转录组学技术表征耐药前列腺癌细胞的分子特征及其与形态变化的关联 | 开发了优化的高通量DIA方法实现单细胞水平蛋白质定量,并首次整合单细胞蛋白质组和转录组数据揭示耐药细胞的分子异质性 | 研究主要基于PC3细胞系,未在更多细胞系或临床样本中验证 | 揭示前列腺癌耐药细胞的蛋白质组学特征和分子机制 | 前列腺癌PC3细胞系及其衍生的耐药细胞 | 单细胞多组学 | 前列腺癌 | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 数据非依赖性采集 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 优化高通量DIA方法(通量60样本/天) |
| 1769 | 2025-10-07 |
The SWI/SNF chromatin remodelling complex regulates pancreatic endocrine cell expansion and differentiation in mice in vivo
2024-Oct, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06211-7
PMID:38958700
|
研究论文 | 本研究探讨SWI/SNF染色质重塑复合物在小鼠胰腺内分泌细胞发育和分化中的调控作用 | 首次在体内模型中系统研究BRG1和BRM ATPase亚基对内分泌细胞发育的协同调控机制 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明SWI/SNF染色质重塑复合物在内分泌细胞发育中的分子机制 | 小鼠胰腺内分泌祖细胞和分化细胞 | 发育生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞分选, 定量PCR, 组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 代谢表型数据, 组织学图像 | 胚胎期15.5天和出生后不同发育阶段的小鼠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1770 | 2025-10-07 |
Association between biological ageing and periodontitis: Evidence from a cross-sectional survey and multi-omics Mendelian randomization analysis
2024-10, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14040
PMID:38956929
|
研究论文 | 通过横断面调查和多组学孟德尔随机化分析探讨生物衰老与牙周炎之间的关联及潜在因果关系 | 首次结合横断面调查、孟德尔随机化分析和多组学整合方法系统研究生物衰老与牙周炎的因果关系及分子机制 | 基于观察性数据和遗传数据,无法完全排除残余混杂因素的影响 | 探究生物衰老与牙周炎之间的关系及潜在因果机制 | 3189名NHANES参与者和GWAS汇总统计数据 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞测序, GWAS, 孟德尔随机化分析, 多组学整合分析 | 多元回归分析, 两步MR中介分析 | 基因组数据, 调查数据, 单细胞测序数据 | 3189名NHANES参与者 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 1771 | 2025-10-07 |
SCIPAC: quantitative estimation of cell-phenotype associations
2024-05-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03263-1
PMID:38741183
|
研究论文 | 开发了首个能够定量估计单细胞数据中每个细胞与表型关联的算法SCIPAC | 首个能够定量估计单细胞数据中细胞与表型关联的算法,并为每个关联提供p值 | 未在摘要中明确说明 | 确定单细胞RNA测序数据中细胞与表型(如癌症)之间的关联 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | SCIPAC算法 | 单细胞RNA测序数据 | 四个真实数据集(癌性和非癌性) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1772 | 2025-10-07 |
IQGAP2 regulates blood-brain barrier immune dynamics
2024-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.07.527394
PMID:38645082
|
研究论文 | 本研究揭示了IQGAP2蛋白在调控血脑屏障免疫特权和免疫细胞进入中枢神经系统中的关键作用 | 首次发现IQGAP2作为支架蛋白在调控血脑屏障免疫动态中的核心功能,并证明其在阿尔茨海默病患者海马体中表达降低 | IQGAP2调控免疫细胞浸润的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究IQGAP2蛋白如何调控血脑屏障的免疫细胞浸润 | 小鼠、斑马鱼模型以及人类组织样本 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | 小鼠和斑马鱼模型,人类阿尔茨海默病组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1773 | 2025-10-07 |
Altered ontogeny and transcriptomic signatures of tissue-resident pulmonary interstitial macrophages ameliorate allergic airway hyperresponsiveness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1371764
PMID:38983858
|
研究论文 | 本研究探讨组织驻留肺间质巨噬细胞发育轨迹改变对过敏性气道高反应性的影响 | 首次揭示LPS诱导肺损伤后巨噬细胞发育谱系改变可减轻过敏性气道反应,并通过单细胞测序鉴定出与过敏性疾病相关的间质巨噬细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证 | 阐明环境暴露引起的巨噬细胞发育轨迹改变对过敏性气道反应的影响机制 | 组织驻留肺巨噬细胞和屋尘螨诱导的过敏性气道反应 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、胚胎谱系标记 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1774 | 2024-08-07 |
Prediction of cell-cell communication patterns of dorsal root ganglion cells: single-cell RNA sequencing data analysis
2024-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.384067
PMID:37905887
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1775 | 2025-10-07 |
Androgen deprivation induces double-null prostate cancer via aberrant nuclear export and ribosomal biogenesis through HGF and Wnt activation
2024-Feb-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45489-4
PMID:38336745
|
研究论文 | 研究揭示雄激素剥夺疗法通过异常HGF和Wnt信号激活诱导双阴性前列腺癌的机制 | 首次发现当前ADT通过异常HGF/MET信号激活进一步升高Wnt/β-catenin信号,并鉴定XPO1和核糖体蛋白在DNPC中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限临床样本,需要更大规模临床验证 | 探索雄激素剥夺疗法诱导双阴性前列腺癌的分子机制 | 前列腺癌细胞、小鼠前列腺组织、人类DNPC临床样本 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类临床DNPC标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1776 | 2025-10-07 |
Gpnmb and Spp1 mark a conserved macrophage injury response masking fibrosis-specific programming in the lung
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182700
PMID:39509324
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肺损伤后巨噬细胞亚群,揭示了Gpnmb和Spp1标记的巨噬细胞是组织损伤的保守反应而非纤维化特异性程序 | 首次发现巨噬细胞亚群聚类主要由细胞起源和组织分区驱动而非损伤模型,并鉴定出Gpnmb表达巨噬细胞作为组织损伤的保守反应标志 | 研究仅基于小鼠模型和已有的人类数据集,需要进一步实验验证机制 | 探究肺损伤后不同巨噬细胞亚群在健康修复和纤维化修复中的不同作用机制 | 小鼠肺巨噬细胞和人类肺疾病数据集 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | LPS或博来霉素处理的小鼠肺巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1777 | 2025-10-07 |
Predicting lung aging using scRNA-Seq data
2024-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012632
PMID:39700255
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序数据的年龄预测回归模型PolyEN | 提出了PolyEN模型,能够学习基因表达随时间的连续表示,并整合基因信息进行年龄预测 | NA | 基于单细胞RNA测序数据预测肺衰老 | 肺上皮细胞和肺内皮细胞 | 机器学习 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | 回归模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1778 | 2025-10-07 |
Metastasis of colon cancer requires Dickkopf-2 to generate cancer cells with Paneth cell properties
2024-Nov-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97279
PMID:39535280
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研究论文 | 本研究揭示了Dickkopf-2(DKK2)通过调控HNF4A蛋白水平促进结肠癌转移过程中潘氏细胞特性癌细胞生成的新机制 | 首次发现DKK2在结肠癌转移中通过下调HNF4A蛋白水平诱导潘氏细胞特性癌细胞生成 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究结肠癌转移过程中潘氏细胞特性癌细胞生成的分子机制 | 结肠癌细胞、小鼠模型、患者转移样本 | 癌症生物学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 染色质可及性分析, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | C57BL/6小鼠模型和患者转移样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1779 | 2025-10-07 |
Single-cell, spatial, and fate-mapping analyses uncover niche dependent diversity of cochlear myeloid cells
2024-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.30.621184
PMID:39554030
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、命运图谱和联体共生实验揭示了小鼠耳蜗中五种髓系细胞亚群的多样性特征 | 首次系统揭示了耳蜗微环境中组织驻留巨噬细胞在基因表达、空间分布、发育起源和功能方面的独特异质性 | 研究主要聚焦小鼠模型,人类耳蜗巨噬细胞的特征仍需进一步验证 | 探索耳蜗髓系细胞的多样性及其与微环境的关系 | 小鼠耳蜗组织中的髓系细胞 | 单细胞生物学 | 听力相关疾病 | 单细胞转录组测序, 命运图谱分析, 联体共生实验 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | 小鼠耳蜗组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1780 | 2025-10-07 |
SDePER: a hybrid machine learning and regression method for cell-type deconvolution of spatial barcoding-based transcriptomic data
2024-Oct-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03416-2
PMID:39402626
|
研究论文 | 开发了一种结合机器学习和回归的混合方法SDePER,用于空间条形码转录组数据的细胞类型解卷积 | 提出混合机器学习和回归方法,解决ST与scRNA-seq数据间的平台效应,同时处理稀疏性和空间相关性 | NA | 开发空间转录组数据细胞类型解卷积方法 | 空间条形码转录组数据和参考单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 混合机器学习与回归模型 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 模拟数据和四个真实数据集 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |