单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7507 篇文献，本页显示第 1721 - 1740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1721 | 2025-01-25 |
Markers of Dermal Fibroblast Subpopulations for Viable Cell Isolation via Cell Sorting: A Comprehensive Review
2024-07-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13141206
PMID:39056788
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综述 | 本文综述了用于通过细胞分选分离活体细胞的皮肤成纤维细胞亚群的标记物 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和荧光激活细胞分选（FACS）技术，详细分析了成纤维细胞表面标记物，识别了多种独特的成纤维细胞亚群 | NA | 研究成纤维细胞表面标记物，以便进行细胞分选和后续功能研究 | 成纤维细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 细胞表面标记物数据 | 超过三千篇研究文章 |
| 1722 | 2025-01-25 |
DNA replication in early mammalian embryos is patterned, predisposing lamina-associated regions to fragility
2024-Jun-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49565-7
PMID:38898078
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术揭示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式，表明晚期复制区域在受精后的第一个细胞周期中与B区室和核纤层相关联 | 首次展示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式，并揭示了晚期复制区域与染色体断裂的关联 | 研究主要基于牛和小鼠胚胎，可能不适用于所有哺乳动物 | 探讨哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式及其对基因组组织的影响 | 牛和小鼠的早期胚胎 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 牛和小鼠的早期胚胎样本 |
| 1723 | 2025-01-25 |
LMNA -Related Dilated Cardiomyopathy: Single-Cell Transcriptomics during Patient-derived iPSC Differentiation Support Cell type and Lineage-specific Dysregulation of Gene Expression and Development for Cardiomyocytes and Epicardium-Derived Cells with Lamin A/C Haploinsufficiency
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.12.598335
PMID:38915555
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研究论文 | 本文研究了与LMNA相关的扩张型心肌病（DCM），通过患者来源的诱导多能干细胞（iPSC）分化过程中的单细胞转录组学，支持了心肌细胞和心外膜来源细胞在Lamin A/C单倍体不足情况下的基因表达和发育的细胞类型和谱系特异性失调 | 使用患者来源的iPSC模型，结合单细胞RNA测序技术，揭示了Lamin A/C单倍体不足对心肌细胞和心外膜来源细胞的基因表达和发育的影响 | 研究中识别的影响表观遗传和分化的其他因素需要进一步改进方法来深入研究 | 探讨LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 患者来源的诱导多能干细胞（iPSC）及其分化过程中的心肌细胞和心外膜来源细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | iPSC模型 | RNA测序数据 | 12个样本（4个患者样本和8个对照样本） |
| 1724 | 2025-01-25 |
Hyperoxia impairs induced pluripotent stem cell-derived endothelial cells and drives an atherosclerosis-like transcriptional phenotype
2024, JVS-vascular science
DOI:10.1016/j.jvssci.2024.100193
PMID:38770110
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研究论文 | 本文研究了高氧条件对诱导多能干细胞衍生的内皮细胞（iPSC-ECs）的影响，并探讨了其在血管疾病再生医学中的应用潜力 | 揭示了高氧条件下iPSC-ECs会发展出内皮-间质表型，并与动脉粥样硬化内皮细胞的转录表型有重叠 | 生理性4%氧浓度培养条件虽能改善高传代细胞的线粒体功能，但不足以保持其血管生成能力 | 探讨不同氧浓度对iPSC-ECs的生物能量学、细胞标志物表达、增殖和血管生成能力的影响 | 诱导多能干细胞衍生的内皮细胞（iPSC-ECs） | 再生医学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1725 | 2025-01-25 |
SGSM2 in Uveal Melanoma: Implications for Survival, Immune Infiltration, and Drug Sensitivity
2024, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
|
研究论文 | 本研究探讨了SGSM2在葡萄膜黑色素瘤（UVM）中的表达及其与生存率、免疫浸润和药物敏感性的关系 | 首次揭示了SGSM2在UVM中的高表达及其与不良预后的关联，并探讨了其与免疫浸润、免疫检查点基因和药物敏感性的关系 | 研究主要基于生物信息学分析和实验验证，需要进一步的大样本临床研究来验证这些发现 | 阐明SGSM2在UVM中的作用及其临床意义 | 葡萄膜黑色素瘤（UVM）细胞系和患者数据 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 定量实时PCR（qRT-PCR）、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | UVM细胞系和TCGA数据库中的UVM患者数据 |
| 1726 | 2025-01-25 |
Integration of single-cell transcriptomics and bulk transcriptomics to explore prognostic and immunotherapeutic characteristics of nucleotide metabolism in lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1466249
PMID:39845190
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和批量转录组学数据，探索了核苷酸代谢在肺腺癌中的预后和免疫治疗特性 | 首次构建了基于核苷酸代谢相关基因的预后风险模型，并验证了其在肺腺癌预后预测和免疫治疗响应中的准确性 | 研究主要依赖于公共数据库的转录组和临床数据，缺乏多中心验证和更大样本量的独立验证 | 探索核苷酸代谢在肺腺癌中的预后价值和免疫治疗特性 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组测序 | Lasso + Stepcox | 转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者数据 |
| 1727 | 2024-12-11 |
Improved tool for scRNA-seq analysis
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02040-x
PMID:39653731
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1728 | 2025-01-24 |
Comparative analysis of rhesus macaque and human placental organoids highlights evolutionary differences in placentation
2024-Oct-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.11.617873
PMID:39416122
|
研究论文 | 本研究通过比较恒河猴和人类胎盘类器官，揭示了胎盘在进化过程中的差异 | 开发了恒河猴胎盘类器官模型，并首次进行了恒河猴与人类胎盘类器官的单细胞RNA测序比较分析 | 研究主要关注恒河猴和人类，未涉及其他灵长类动物，可能限制了进化差异的全面理解 | 探索恒河猴与人类胎盘在基因表达和细胞分化轨迹上的异同 | 恒河猴和人类的胎盘类器官 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | RNA测序数据 | 恒河猴和人类胎盘类器官样本 |
| 1729 | 2025-01-24 |
Unveiling contact-mediated cellular crosstalk
2024-Oct, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.05.010
PMID:38906738
|
综述 | 本文探讨了细胞间相互作用在复杂生物功能中的作用及其在疾病状态中的影响，并介绍了单细胞测序、空间转录组学等新技术在理解细胞间通讯中的应用 | 结合单细胞测序、空间转录组学和生物工程技术，提供了对细胞间通讯影响的深入理解，并开发了计算方法来解析细胞接触如何调控细胞反应 | NA | 探索细胞间相互作用在生物过程中的调控机制及其在疾病中的作用 | 细胞间相互作用及其对基因表达和细胞反应的影响 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1730 | 2025-01-24 |
Unraveling the phenotypic states of human innate-like T cells: Comparative insights with conventional T cells and mouse models
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114705
PMID:39264810
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术，比较了人类胸腺和血液中先天样T细胞与传统T细胞的转录组特征，揭示了它们在效应程序和发展路径上的差异 | 揭示了人类先天样T细胞与传统T细胞在转录组特征上的差异，并发现了跨物种间的特异性区别，如人类缺乏类型2 T细胞 | 研究主要基于人类和小鼠模型，可能不适用于其他物种 | 探索先天样T细胞与传统T细胞的转录组特征及其发展路径 | 人类胸腺和血液中的先天样T细胞与传统T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术 | NA | RNA测序数据，流式细胞数据 | 人类胸腺和血液样本 |
| 1731 | 2025-01-24 |
Molecular and spatial signatures of human and rat corpus cavernosum physiopathological processes at single-cell resolution
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114760
PMID:39299236
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组测序，全面描绘了人类和大鼠海绵体在正常和疾病状态下的空间细胞景观 | 首次在分子水平上揭示了人类和大鼠海绵体的空间异质性，并发现了不同区域机械力信号富集分数的差异及其与成纤维细胞亚型空间分布的相关性 | 研究主要基于体外实验，可能无法完全反映体内复杂的生理和病理过程 | 理解海绵体的分子解剖和勃起调控机制 | 人类和大鼠的海绵体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组测序 | NA | RNA测序数据 | 人类和大鼠的海绵体样本 |
| 1732 | 2025-01-24 |
Bioinformatics and machine learning approaches reveal key genes and underlying molecular mechanisms of atherosclerosis: A review
2024-Aug-02, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000038744
PMID:39093811
|
综述 | 本研究结合生物信息学工具和机器学习方法，探索了动脉粥样硬化的关键基因及其分子网络机制，并进行了药物预测 | 通过整合多种数据集，利用Lasso回归和随机森林算法筛选出5个关键基因，并首次将这些基因与铁死亡相关基因的表达差异联系起来 | 研究依赖于公开数据集，可能受到数据质量和样本量的限制 | 探索动脉粥样硬化的关键基因及其分子机制，并进行药物预测 | 动脉粥样硬化相关基因和分子网络 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序技术 | Lasso回归, 随机森林 | 基因表达数据 | GSE20129和GSE90074数据集 |
| 1733 | 2025-01-24 |
Cell-cell communication and initial population composition shape the structure of potato spindle tuber viroid quasispecies
2024-Mar-29, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koae012
PMID:38252648
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研究论文 | 本文研究了细胞间通讯和初始种群组成如何影响马铃薯纺锤块茎类病毒准种的结构 | 通过比较缺乏胞间连丝连接的成熟保卫细胞和体外培养的叶肉细胞原生质体中的类病毒变异体积累，揭示了细胞间通讯和初始种群组成对准种结构的影响 | 研究仅针对马铃薯纺锤块茎类病毒中间株系，未涵盖其他类病毒或病毒 | 探讨细胞间通讯和初始种群组成对类病毒准种结构的影响 | 马铃薯纺锤块茎类病毒中间株系（PSTVd-I）及其变异体 | 病毒学 | NA | 测序技术 | NA | RNA序列数据 | 成熟保卫细胞和体外培养的叶肉细胞原生质体 |
| 1734 | 2025-01-24 |
Magnetically functionalized hydrogels for high-throughput genomic applications
2024-Jan-22, Advanced materials technologies
IF:6.4Q1
DOI:10.1002/admt.202301155
PMID:38645306
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研究论文 | 本文介绍了一种磁化水凝胶珠的简单方法，以提高单细胞基因组学中的分池方法的自动化程度 | 开发了磁化水凝胶珠的方法，提高了纯化过程的产量和洗涤效率，并实现了分池方法的自动化 | 未提及具体的技术局限或实验中的挑战 | 提高单细胞基因组学中分池方法的自动化程度 | 水凝胶珠 | 基因组学 | NA | BAG-Seq工作流程 | NA | 基因组数据 | NA |
| 1735 | 2025-01-24 |
The lysosome-related characteristics affects the prognosis and tumor microenvironment of lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1497312
PMID:39839650
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研究论文 | 本研究探讨了溶酶体相关基因（LAGs）在肺腺癌（LUAD）中的预后和肿瘤微环境影响 | 构建了一个包含七个关键LAGs的风险特征，用于预测LUAD患者的预后状态，并通过单细胞测序和体外实验验证了CTSH在LUAD中的功能 | 研究主要依赖于公开的RNA-seq数据，可能受到数据质量和样本选择的限制 | 研究溶酶体相关基因在肺腺癌中的预后和肿瘤微环境影响 | 肺腺癌（LUAD）患者 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞测序（scRNA-seq） | LASSO Cox回归分析 | RNA-seq数据 | 来自TCGA和GEO的肺腺癌RNA-seq数据 |
| 1736 | 2025-01-24 |
Comparative evaluation of ACetic - MEthanol high salt dissociation approach for single-cell transcriptomics of frozen human tissues
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1469955
PMID:39839668
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研究论文 | 本文介绍了一种用于冷冻人体组织单细胞转录组学研究的醋酸-甲醇高盐解离方法（ACME HS），并与其他方法进行了比较 | 首次将醋酸-甲醇解离方法优化应用于人类内分泌组织样本，并引入高盐洗涤缓冲液以稳定RNA并防止RNase再激活 | NA | 开发一种适用于冷冻人体组织单细胞转录组学研究的解离方法，以保留细胞形态和RNA完整性 | 冷冻人体组织样本 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA转录组数据 | 41个组织样本 |
| 1737 | 2025-01-24 |
Exploring the shared gene signatures and mechanism among three autoimmune diseases by bulk RNA sequencing integrated with single-cell RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1520050
PMID:39840076
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，探索了三种自身免疫性疾病（多发性硬化症、系统性红斑狼疮和类风湿性关节炎）之间的共享基因特征和机制 | 结合单细胞RNA测序技术，识别了三种自身免疫性疾病之间的共享基因，并提出了潜在的早期诊断生物标志物 | 研究主要依赖于公共数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制 | 研究三种自身免疫性疾病之间的共享基因特征，寻找早期诊断的生物标志物 | 多发性硬化症（MS）、系统性红斑狼疮（SLE）和类风湿性关节炎（RA）患者 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 公共数据库中的MS、SLE和RA患者数据，以及小鼠模型和临床样本 |
| 1738 | 2025-01-23 |
Construction of a neutrophil extracellular trap formation-related gene model for predicting the survival of lung adenocarcinoma patients and their response to immunotherapy
2024-Dec-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-463
PMID:39830760
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研究论文 | 本研究构建了一个基于中性粒细胞胞外陷阱形成相关基因（NFRGs）的预后模型，用于预测肺腺癌（LUAD）患者的生存和免疫治疗反应 | 首次使用NFRGs构建预测LUAD患者生存和免疫治疗反应的预后模型，并验证了其有效性 | 研究依赖于TCGA和GEO数据集，需要进一步的外部验证和临床实验来确认模型的普适性 | 构建一个基于NFRGs的预后签名，用于分层LUAD患者并指导个体化管理策略 | 肺腺癌（LUAD）患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，RT-qPCR | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据集中的LUAD患者样本 |
| 1739 | 2025-01-22 |
An Integrative Approach to Precision Pre-implantation Genetic Diagnosis by Investigating Single-cell Sequencing, Polygenic Risk Assessment, Artificial Intelligence-guided Embryo Selection and Genome Editing in Embryos with COL4A1 c.1537G>A Mutation
2024 Oct-Dec, Journal of human reproductive sciences
DOI:10.4103/jhrs.jhrs_145_24
PMID:39831092
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1740 | 2025-01-23 |
Spatial transcriptomics elucidates medulla niche supporting germinal center response in myasthenia gravis-associated thymoma
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114677
PMID:39180749
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研究论文 | 本研究通过空间转录组分析胸腺瘤和胸腺增生样本，揭示了与重症肌无力（MG）相关的胸腺髓质微环境特征 | 首次使用空间转录组技术详细描述了MG相关胸腺瘤中髓质区域的特定化学因子模式和免疫细胞组成，并发现MG特异性生发中心结构 | 研究样本量未明确提及，可能限制了结果的普遍性 | 探讨重症肌无力（MG）与胸腺异常之间的病理联系 | 胸腺瘤和胸腺增生样本 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | NA |