单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 1721 - 1740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1721 | 2025-10-06 |
Maximum Likelihood Inference of Time-scaled Cell Lineage Trees with Mixed-type Missing Data
2024-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.05.583638
PMID:38496496
|
研究论文 | 提出一种用于动态谱系追踪数据的最大似然推断方法，能够从CRISPR诱导的突变中准确推断细胞谱系树 | 开发了概率混合型缺失(PMM)模型和LAML算法，专门处理CRISPR谱系追踪数据的三个独特特征：基因组位置的单次编辑、突变率随时间衰减、高比例的可遗传和非可遗传缺失数据 | 在存在可遗传缺失数据的情况下需要采用块坐标上升方法，计算效率可能受限 | 解决动态谱系追踪中的细胞谱系树推断问题 | 细胞谱系树、CRISPR诱导的突变数据 | 计算生物学 | 肺腺癌 | CRISPR基因组编辑、单细胞测序 | 概率混合型缺失(PMM)模型、期望最大化(EM)算法 | 基因突变数据、基因表达数据 | 小鼠肺腺癌模型数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1722 | 2025-10-06 |
Molecular assessment of intratumoral immune cell subsets and potential mechanisms of resistance to odronextamab, a CD20×CD3 bispecific antibody, in patients with relapsed/refractory B-cell non-Hodgkin lymphoma
2024-03-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008338
PMID:38519055
|
研究论文 | 评估肿瘤内免疫细胞亚群特征及odronextamab耐药机制的研究 | 首次系统分析CD20×CD3双特异性抗体odronextamab在B细胞非霍奇金淋巴瘤中的分子作用机制和耐药性 | 样本量有限，主要基于观察性数据 | 探索odronextamab在复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的生物标志物和耐药机制 | 复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者 | 肿瘤免疫学 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 免疫组织化学，流式细胞术，单细胞RNA测序，全基因组测序 | NA | 分子生物学数据，临床数据 | ELM-1研究中的患者队列 | NA | 单细胞RNA测序，全基因组测序 | NA | NA |
| 1723 | 2025-10-06 |
Mefloquine enhances the efficacy of anti-PD-1 immunotherapy via IFN-γ-STAT1-IRF1-LPCAT3-induced ferroptosis in tumors
2024-03-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008554
PMID:38471712
|
研究论文 | 本研究揭示甲氟喹通过IFN-γ-STAT1-IRF1-LPCAT3信号通路诱导铁死亡，增强抗PD-1免疫疗法对黑色素瘤和肺癌的疗效 | 首次发现甲氟喹通过激活IFN-γ-STAT1-IRF1信号通路上调LPCAT3表达诱导铁死亡，并证实LPCAT3表达与抗PD-1免疫疗法疗效正相关 | 研究主要聚焦于黑色素瘤和肺癌，未涉及其他肿瘤类型；机制研究主要在细胞和动物模型中进行 | 探究甲氟喹增强抗PD-1免疫疗法疗效的分子机制 | 黑色素瘤和肺癌细胞系及动物模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤,肺癌 | RNA测序,实时定量PCR,蛋白质印迹,染色质免疫沉淀,流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞测序数据 | 细胞系实验和动物模型，包含临床患者转录组和单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 1724 | 2025-10-06 |
Endocrine islet β-cell subtypes with differential function are derived from biochemically distinct embryonic endocrine islet progenitors that are regulated by maternal nutrients
2024-Mar-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3946483/v1
PMID:38496675
|
研究论文 | 本研究通过细胞谱系追踪和单细胞分析揭示了胚胎内分泌胰岛前体细胞如何产生功能不同的β细胞亚型 | 首次发现胚胎胰岛前体细胞具有不同的基因表达和DNA甲基化特征，这些特征决定了成年后β细胞的功能差异和稳定性 | 研究主要在小鼠模型中进行，人类样本验证相对有限 | 探索胰岛β细胞异质性形成机制及其与糖尿病发生的关系 | 小鼠胚胎胰岛前体细胞和成年β细胞，以及人类胰岛细胞 | 发育生物学 | 糖尿病 | 组合细胞谱系追踪，单细胞RNA测序，DNA甲基化分析 | NA | 单细胞转录组数据，DNA甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1725 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing of facial adipose tissue unveils FKBP5 as a therapeutic target for facial infiltrating lipomatosis
2024-07-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03835-9
PMID:39020442
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示面部浸润性脂肪增多症中FKBP5作为治疗靶点的作用机制 | 首次在单细胞水平解析面部脂肪组织的细胞图谱，发现FIL患者FAP细胞中FKBP5特异性高表达并证实其通过PI3K-AKT通路调控脂肪生成 | 样本量有限，具体PIK3CA变异与FKBP5表达关联的分子机制仍需深入探索 | 探究面部浸润性脂肪增多症的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 面部脂肪组织中的基质血管组分（SVF）和纤维脂肪生成前体细胞（FAPs） | 单细胞生物学 | 面部浸润性脂肪增多症 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | FIL患者和非FIL个体的面部脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1726 | 2025-10-06 |
Decoding cellular plasticity and niche regulation of limbal stem cells during corneal wound healing
2024-07-06, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03816-y
PMID:38971839
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了角膜缘干细胞在角膜伤口愈合过程中的分子特征和细胞命运 | 首次在单细胞水平定义了LSCs的分子特征，发现了转录因子Creb5在损伤反应中的关键作用，并鉴定出Arg1+巨噬细胞通过分泌OSM促进伤口愈合的新机制 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类组织中验证 | 探索角膜缘干细胞及其微环境细胞在角膜损伤修复中的分子和功能响应机制 | 正常小鼠和角膜上皮缺损模型小鼠的角膜组织 | 单细胞生物学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，基因敲低实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠角膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1727 | 2025-10-06 |
DPSCs regulate epithelial-T cell interactions in oral submucous fibrosis
2024-04-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03720-5
PMID:38650025
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示口腔黏膜下纤维化中上皮细胞与T细胞的相互作用机制，并探索牙髓干细胞治疗潜力 | 发现具有促炎促纤维化功能的独特上皮细胞亚群Epi1.2，揭示MIF-CD74和CXCR4介导的上皮-T细胞相互作用机制，首次系统评估DPSCs治疗OSF的效果 | OSF致病机制尚未完全阐明，DPSCs临床应用效果需进一步验证 | 探索口腔黏膜下纤维化的致病机制并开发新的治疗策略 | 口腔黏膜组织、牙髓干细胞、动物模型 | 单细胞生物学 | 口腔黏膜下纤维化 | 单细胞RNA测序、组织染色、免疫组化、扫描电镜、原子力显微镜 | 动物模型 | 单细胞转录组数据、组织图像数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1728 | 2025-10-06 |
An integrated toolkit for human microglia functional genomics
2024-04-10, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03700-9
PMID:38600587
|
研究论文 | 开发用于人类小胶质细胞功能基因组学的集成工具包，包括优化的iPSC分化方案和多组学分析平台 | 建立简化的两步20天分化流程，整合CRISPR-ON/OFF时序控制系统，并提供在线多组学数据比较平台 | 未提及与现有方法的直接比较数据，长期功能稳定性需要进一步验证 | 开发高效的人类小胶质细胞功能基因组学研究工具 | 人类iPSC衍生的小胶质细胞(iMG) | 功能基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, ATAC-Seq, 蛋白质组学, CRISPR-Cas9 | CRISPR-ON/OFF系统 | 转录组, 表观基因组, 蛋白质组, 功能测试数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 多组学分析 | NA | 在线可搜索平台(https://sherlab.shinyapps.io/IPSC-derived-Microglia/) |
| 1729 | 2025-10-06 |
Improved therapeutic consistency and efficacy of CD317+ MSCs through stabilizing TSG6 by PTX3
2024-03-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03706-3
PMID:38539221
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现CD317+ MSC亚群具有增强的免疫抑制活性，其比例与MSC治疗效果一致性密切相关 | 首次揭示CD317+ MSC亚群通过PTX3稳定TSG6蛋白的机制改善治疗一致性 | 未明确PTX3稳定TSG6的具体分子机制 | 研究MSC异质性和治疗不一致性的原因及解决方案 | 人间充质干细胞(MSCs)及其CD317+亚群 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同批次培养基扩增的MSCs | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1730 | 2025-10-06 |
Short cell cycle duration is a phenotype of human epidermal stem cells
2024-03-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03670-y
PMID:38475896
|
研究论文 | 本研究通过活细胞成像和单细胞RNA测序发现人类表皮干细胞具有较短的细胞周期持续时间 | 挑战了干细胞分裂缓慢的传统观点，发现表皮干细胞比更分化的祖细胞具有更短的细胞周期 | 研究仅限于体外培养的人类角质形成细胞，未涉及体内环境验证 | 探究人类表皮干细胞的细胞周期特征和增殖行为 | 人类角质形成细胞，包括干细胞和祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 活细胞成像，单细胞RNA测序 | NA | 图像数据，基因表达数据 | 原代培养的人类角质形成细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1731 | 2025-10-06 |
Thrombopoietin mimetic stimulates bone marrow vascular and stromal niches to mitigate acute radiation syndrome
2024-Feb-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3946910/v1
PMID:38463959
|
研究论文 | 本研究探讨了血小板生成素模拟物通过调节骨髓血管和基质微环境促进造血系统恢复以缓解急性放射综合征的机制 | 首次阐明TPOm通过调控骨髓血管和基质微环境支持造血干细胞再生的作用机制，并发现其能提升VEGF-C水平和增强间充质干细胞胶原蛋白表达 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 研究血小板生成素模拟物在急性放射综合征治疗中对骨髓微环境的调节作用 | C57BL/6J小鼠的骨髓造血干细胞、血管内皮细胞和间充质基质细胞 | 放射医学 | 急性放射综合征 | 流式细胞术、全组织块共聚焦显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞计数数据、生存数据 | 9-14周龄C57BL/6J小鼠，在多个时间点（第4、7、10、14、18、21天）采集骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1732 | 2025-10-06 |
B-cell-directed CAR T-cell therapy activates CD8+ cytotoxic CARneg bystander T cells in patients and nonhuman primates
2024-07-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023022717
PMID:38558106
|
研究论文 | 本研究首次全面鉴定并分析了B细胞靶向CAR T细胞治疗后CD8+ CARneg旁观者T细胞的激活机制及其抗白血病作用 | 首次发现CAR T细胞治疗可激活CD8+ CARneg旁观者T细胞，并揭示其通过T细胞受体非依赖性机制杀伤白血病细胞 | 样本量有限，机制研究仍需进一步验证 | 探究B细胞靶向CAR T细胞治疗中旁观者T细胞的激活机制及其在抗肿瘤反应中的作用 | 非人灵长类动物和患者来源的T细胞 | 免疫治疗 | B细胞恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 非人灵长类模型和临床试验NCT03369353患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1733 | 2025-10-06 |
Identification of a novel de novo mutation in SOX4 for syndromic tooth agenesis
2024-04-30, Clinical oral investigations
IF:3.1Q1
DOI:10.1007/s00784-024-05659-6
PMID:38684576
|
研究论文 | 本研究通过全外显子测序在Coffin-Siris综合征患者中发现了一个新的SOX4基因从头突变，并探索了其在综合征性牙齿缺失中的作用机制 | 首次报道SOX4错义突变导致综合征性牙齿缺失，通过单细胞RNA测序和WGCNA分析验证了SOX4在牙齿发育中的关键作用 | 研究仅基于单个患者病例，样本量有限，需要更多病例验证 | 识别导致综合征性牙齿缺失的致病突变并探索其调控机制 | Coffin-Siris综合征患者和小鼠牙齿发育模型 | 遗传学 | Coffin-Siris综合征 | 全外显子测序, Sanger测序, 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, WGCNA分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | 1名中国CSS患者和小鼠牙齿发育样本 | NA | 全外显子测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1734 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics link gene expression signatures to clinicopathological features of gonadotroph and lactotroph PitNET
2024-Nov-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05821-4
PMID:39548496
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析揭示促性腺激素细胞和泌乳素细胞垂体神经内分泌肿瘤的基因表达特征与临床病理特征的关联 | 首次在单细胞水平系统比较促性腺激素细胞和泌乳素细胞PitNET的肿瘤微环境差异，发现SPP1+巨噬细胞和增殖性淋巴细胞等新型细胞亚群与肿瘤侵袭性的关联 | 样本量相对有限（7例促性腺激素细胞和3例泌乳素细胞肿瘤），需更大规模验证 | 探究垂体神经内分泌肿瘤微环境细胞组成与肿瘤侵袭行为的关系 | 促性腺激素细胞和泌乳素细胞垂体神经内分泌肿瘤患者 | 单细胞转录组学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，免疫组织化学染色 | 差异表达分析，基因表达程序识别 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据，组织切片图像 | 10例单细胞测序样本（7例促性腺激素细胞+3例泌乳素细胞），134例批量RNA-seq验证队列 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 1735 | 2025-10-06 |
The novel potential therapeutic target PSMP/MSMP promotes acute kidney injury via CCR2
2024-Jul-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.028
PMID:38796708
|
研究论文 | 研究发现PSMP/MSMP通过CCR2促进急性肾损伤，可能成为治疗新靶点 | 首次揭示PSMP在急性肾损伤中的关键作用机制，证明其通过CCR2介导巨噬细胞浸润和M1极化 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究PSMP在急性肾损伤中的作用机制及治疗潜力 | 急性肾损伤患者样本和AKI小鼠模型 | 生物医学研究 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者肾组织、尿液和血浆样本，多种AKI小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1736 | 2025-10-06 |
S100A8/A9hi neutrophils induce mitochondrial dysfunction and PANoptosis in endothelial cells via mitochondrial complex I deficiency during sepsis
2024-06-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06849-6
PMID:38942784
|
研究论文 | 本研究揭示了S100A8/A9高表达中性粒细胞通过线粒体复合物I缺陷诱导内皮细胞线粒体功能障碍和PANoptosis的机制 | 首次阐明S100A8/A9通过下调Nrf1抑制线粒体复合物I组分Ndufa3表达，进而导致线粒体功能障碍并激活ZBP1介导的PANoptosis | 机制研究主要在细胞水平进行，需要更多体内实验验证 | 探讨S100A8/A9在脓毒症中诱导内皮功能障碍的分子机制 | 中性粒细胞和内皮细胞 | 细胞生物学 | 脓毒症 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1737 | 2025-10-06 |
Multiomics integration-based immunological characterizations of adamantinomatous craniopharyngioma in relation to keratinization
2024-06-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06840-1
PMID:38906852
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学对牙釉质型颅咽管瘤进行多组学整合分析，揭示其免疫微环境特征 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术系统解析ACP免疫微环境，发现GPNMB高表达的非小胶质细胞来源TAM与RHCG上皮细胞的共定位关系 | 样本数量有限，需要更大队列验证研究结果 | 阐明牙釉质型颅咽管瘤的免疫微环境特征及其与角质化的关系 | 牙釉质型颅咽管瘤标本 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学, asmFISH | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 58,081个细胞核 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1738 | 2025-10-06 |
CSTF3 contributes to platinum resistance in ovarian cancer through alternative polyadenylation of lncRNA NEAT1 and generating the short isoform NEAT1_1
2024-06-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06816-1
PMID:38898019
|
研究论文 | 本研究揭示了CSTF3通过调控lncRNA NEAT1的可变多聚腺苷酸化促进卵巢癌铂类耐药的新机制 | 首次发现CSTF3通过调控NEAT1的可变多聚腺苷化生成短异构体NEAT1_1，从而促进卵巢癌铂类耐药 | 研究主要基于公共数据库的单细胞RNA测序数据和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证 | 探索卵巢癌铂类耐药的分子机制，寻找潜在生物标志物和治疗策略 | 卵巢癌患者的铂类耐药和敏感组织，卵巢癌细胞系 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，基因敲低，基因过表达 | 细胞系模型 | 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库中的卵巢癌患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1739 | 2025-10-06 |
CXCR7 activation evokes the anti-PD-L1 antibody against glioblastoma by remodeling CXCL12-mediated immunity
2024-06-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06784-6
PMID:38898023
|
研究论文 | 本研究通过激活CXCR7受体重塑CXCL12介导的免疫反应，增强抗PD-L1抗体对胶质母细胞瘤的疗效 | 首次发现CXCR7作为CXCL12的非典型受体可负调控CXCL12表达，并证实选择性CXCR7激动剂VUF11207能逆转GAMs诱导的免疫抑制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证 | 探索通过靶向肿瘤-巨噬细胞相互作用来增强胶质母细胞瘤免疫治疗效果的机制 | 胶质母细胞瘤细胞、胶质母细胞瘤相关巨噬细胞(GAMs)、CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序、转录组分析、体外共培养系统 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 转录组数据、单细胞测序数据 | 未明确样本数量，包括复发胶质母细胞瘤标本、公共数据库数据集和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1740 | 2025-10-06 |
Chemerin attracts neutrophil reverse migration by interacting with C-C motif chemokine receptor-like 2
2024-06-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06820-5
PMID:38890311
|
研究论文 | 本研究揭示了趋化因子chemerin通过与其受体CCRL2相互作用吸引中性粒细胞反向迁移的机制 | 首次发现中性粒细胞反向迁移过程中CCRL2表达上调，并证实chemerin-CCRL2轴在此过程中的关键作用 | 研究主要基于动物模型，人类临床相关性有待验证；反向迁移的生理病理意义需进一步探索 | 探索中性粒细胞反向迁移的分子机制 | 中性粒细胞及其反向迁移现象 | 免疫学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序，体内细胞追踪 | NA | 基因表达数据，细胞追踪数据 | 急性肺损伤模型和气囊模型中的白细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |