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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1701 | 2025-10-06 |
Stratified analysis identifies HIF-2α as a therapeutic target for highly immune-infiltrated melanomas
2024-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.29.620300
PMID:39554029
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研究论文 | 本研究通过分层分析发现HIF-2α是高度免疫浸润黑色素瘤的潜在治疗靶点 | 首次通过标准化荟萃分析揭示免疫浸润程度与ICB疗效的关系,并发现HIF-2α在特定细胞类型中的特异性表达 | 样本量相对有限,且主要基于回顾性队列分析 | 探索黑色素瘤免疫治疗反应的生物标志物和联合治疗新靶点 | 转移性黑色素瘤患者和临床前模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序,荟萃分析 | NA | RNA测序数据,临床数据 | 516例患者(抗PD-1治疗290例,抗CTLA-4治疗175例,联合治疗51例) | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 1702 | 2025-10-06 |
Identification of gene and protein signatures associated with long-term effects of COVID-19 on the immune system after patient recovery by analyzing single-cell multi-omics data using a machine learning approach
2024-10-03, Vaccine
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.vaccine.2024.126253
PMID:39182316
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研究论文 | 通过机器学习方法分析单细胞多组学数据,识别与COVID-19康复患者免疫系统长期影响相关的基因和蛋白特征 | 首次结合五种特征排序算法和两种分类算法分析COVID-19康复患者的单细胞多组学数据,识别出特定的分子标志物 | 研究仅限于特定免疫细胞亚型,样本来源和规模未明确说明 | 研究COVID-19康复患者免疫系统的持久性改变和次级免疫反应 | COVID-19康复患者和健康对照组的免疫细胞 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞多组学测序 | LASSO, MCFS, RF, CATBoost, XGBoost, 决策树, K近邻 | 单细胞多组学数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Chromium | 包含scRNA-seq、HTO、CITE-seq和SCT多种检测技术 |
| 1703 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics defines injury specific microenvironments and cellular interactions in kidney regeneration and disease
2024-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51186-z
PMID:39237549
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术解析小鼠肾脏缺血再灌注损伤中特定微环境的基因表达模式和细胞相互作用 | 首次应用空间转录组学揭示肾脏损伤中空间依赖的基因表达模式,并预测Clcf1-Crfl1在持续损伤的近端小管细胞与成纤维细胞间的分子相互作用 | 研究仅针对小鼠肾脏缺血再灌注损伤模型,未涉及其他类型肾脏损伤或人类样本 | 解析肾脏损伤修复过程中的分子通路和细胞相互作用机制 | 小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1704 | 2025-10-06 |
SMARCA4 Loss and Mutated β-Catenin Induce Proliferative Lesions in the Murine Embryonic Cerebellum
2024-04-10, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1605-23.2024
PMID:38383496
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型探究SMARCA4缺失和β-连环蛋白突变在小鼠胚胎小脑中诱导增殖性病变的机制 | 首次揭示β-连环蛋白突变单独可导致严重发育表型,并与SMARCA4缺失协同诱导小脑早期祖细胞增殖性病变 | 体外培养中双突变细胞未显示致瘤潜力,提示胚胎微环境对病变发展具有重要作用 | 解析异常WNT信号和SMARCA4缺陷诱导肿瘤发生机制 | 基因工程小鼠模型(BLBP-Cre小鼠) | 癌症生物学 | 髓母细胞瘤 | DNA甲基化分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 胚胎期E13.5至E16.5的小鼠小脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1705 | 2025-10-06 |
Reversal of injury-associated retinal ganglion cell gene expression by a phosphodiesterase anchoring disruptor peptide
2024-Sep, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110017
PMID:39097072
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研究论文 | 本研究探讨了通过干扰磷酸二酯酶锚定来逆转损伤相关视网膜神经节细胞基因表达的机制 | 首次证明通过表达修饰的PDE4D3 N端肽4D3(E)能够逆转视神经损伤诱导的基因表达变化 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类细胞或临床环境中验证 | 探索PDE4D3位移促进神经保护作用的分子机制 | 视网膜神经节细胞(RGCs) | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 腺相关病毒转染 | NA | 基因表达数据 | 小鼠视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1706 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Flow Cytometry Panel for Analysis of Idiopathic Subglottic Stenosis
2024-Sep, Otolaryngology--head and neck surgery : official journal of American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery
DOI:10.1002/ohn.754
PMID:38606634
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研究论文 | 本文提出了一种用于分析特发性声门下狭窄的综合流式细胞术检测方案 | 开发了针对iSGS的全面流式细胞术检测组合,首次系统描述了iSGS瘢痕组织的细胞特征 | 样本量较小(9对样本),单中心研究 | 建立特发性声门下狭窄的流式细胞术检测平台并分析其细胞组成 | 特发性声门下狭窄患者的正常组织和瘢痕组织样本 | 数字病理学 | 特发性声门下狭窄 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据 | 9对正常和瘢痕组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1707 | 2025-10-06 |
Machine learning-based gene expression biomarkers to distinguish Zika and Dengue virus infections: implications for diagnosis
2024-Sep, Virusdisease
DOI:10.1007/s13337-024-00885-8
PMID:39464736
|
研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别能够区分寨卡病毒和登革热病毒感染的基因表达生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序数据和多种机器学习算法来识别区分寨卡和登革热病毒感染的基因生物标志物 | 仅分析了24小时时间点的数据,且需要进一步的实验验证 | 开发基于基因表达特征的寨卡和登革热病毒感染诊断方法 | 人类肝癌细胞系Huh7感染寨卡病毒和登革热病毒后的基因表达数据 | 机器学习 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 逻辑回归,支持向量机,随机森林,决策树 | 基因表达数据 | GSE110496数据集中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1708 | 2025-10-06 |
Monocyte Single-Cell Multimodal Profiling in Cardiovascular Disease Risk States
2024-Aug-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324457
PMID:39105287
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术对心血管疾病风险状态下单核细胞进行综合表征 | 首次采用CITE-seq和单细胞RNA测序相结合的多模态方法,系统揭示单核细胞的高度异质性及其在心血管疾病风险状态下的变化 | 研究主要关注特定心血管疾病风险因素,未涵盖所有可能的病理条件 | 探索单核细胞在心血管疾病风险状态下的异质性变化和功能特征 | 437,126个人类单核细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | CITE-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表位数据 | 437,126个单核细胞 | NA | 单细胞多组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1709 | 2025-10-06 |
Decoding the mosaic of inflammatory bowel disease: Illuminating insights with single-cell RNA technology
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.07.011
PMID:39421242
|
综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在炎症性肠病研究中的最新进展与应用 | 系统整合单细胞转录组、蛋白质组、T细胞受体谱和表观遗传分析,提供IBD发病机制的全面视角 | 缺乏纵向研究数据,需要整合多种单细胞和空间转录组技术 | 探索单细胞测序技术在炎症性肠病研究中的应用价值 | 炎症性肠病(包括溃疡性结肠炎和克罗恩病)患者细胞 | 数字病理 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组分析, T细胞受体谱分析, 表观遗传分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1710 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell and spatial analysis reveals MUC1-mediated cellular crosstalk in mucinous colorectal adenocarcinoma
2024-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1701
PMID:38778448
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,系统分析黏液性结直肠腺癌的肿瘤微环境,揭示MUC1介导的细胞间相互作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统解析MCA肿瘤微环境,发现MUC1+肿瘤细胞与ZEB1+内皮细胞的关键相互作用 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证发现 | 深入理解黏液性结直肠腺癌肿瘤微环境的细胞间相互作用机制 | 黏液性结直肠腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 三维生物打印, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1711 | 2025-10-06 |
Melanocyte stem cells in the skin: Origin, biological characteristics, homeostatic maintenance and therapeutic potential
2024-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1720
PMID:38778457
|
综述 | 本文全面概述皮肤黑色素细胞干细胞的起源、生物学特性、稳态维持及治疗潜力 | 重点强调单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9技术和实用模型在黑色素细胞干细胞研究中的重要意义 | NA | 探讨黑色素细胞干细胞在皮肤组织稳态维持和疾病治疗中的潜在应用价值 | 哺乳动物毛囊、表皮或汗腺中的黑色素细胞干细胞 | 再生医学 | 皮肤色素障碍疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1712 | 2025-10-06 |
Landscape of gut mucosal immune cells showed gap of follicular or memory B cells into plasma cells in immunological non-responders
2024-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1699
PMID:38783408
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析HIV感染者肠道黏膜免疫细胞,揭示免疫无应答者B细胞向浆细胞分化存在缺陷 | 首次在单细胞水平描绘HIV感染者肠道黏膜免疫细胞图谱,发现免疫无应答者滤泡/记忆B细胞向浆细胞分化存在障碍 | 样本量较小(仅17名参与者),需要更大规模研究验证 | 探究HIV感染者肠道黏膜免疫细胞在免疫恢复中的作用机制 | HIV感染者肠道黏膜免疫细胞 | 单细胞生物学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序,免疫组化,16S rRNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,微生物组数据,流式细胞数据 | 17名参与者(5名HIV阴性对照,9名免疫应答者,3名免疫无应答者),54,475个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序,16S rRNA测序 | NA | NA |
| 1713 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analysis reveals the tumour microenvironment in patients with endometrial cancer responding to anti-PD-1 treatment
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1668
PMID:38649737
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1714 | 2025-10-06 |
Regulatory T cells in skin mediate immune privilege of the hair follicle stem cell niche
2024-01-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adh0152
PMID:38181095
|
研究论文 | 本研究揭示了皮肤中调节性T细胞通过IL-2信号通路保护毛囊干细胞生态位的免疫豁免机制 | 开发了皮肤特异性Treg细胞基因重组技术,首次证明非淋巴器官中存在局部免疫耐受机制 | 研究主要依赖基因工程小鼠模型,人类疾病验证仅限于罕见脱发类型 | 探究皮肤局部调节性T细胞维持自身免疫耐受的生物学机制 | 皮肤调节性T细胞、毛囊干细胞生态位、脱发疾病模型 | 免疫学 | 脱发症 | 空间转录组学、遗传重组技术 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1715 | 2025-10-06 |
Contributions of T Cell Signaling for Wound Healing
2024-11-14, Journal of burn care & research : official publication of the American Burn Association
IF:1.5Q3
DOI:10.1093/jbcr/irae151
PMID:39110034
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光成像技术揭示了T细胞在伤口愈合过程中的信号传导特征 | 首次在伤口愈合过程中发现并验证了耗竭T细胞的存在,并揭示了不同T细胞亚群具有独特的信号传导特征 | 耗竭T细胞在伤口愈合中的分子机制和具体作用需要未来更深入的研究 | 探索T细胞在伤口愈合过程中的信号传导作用 | 伤口愈合过程中的T细胞亚群 | 免疫学 | 伤口愈合 | scRNA-seq, 免疫荧光成像 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1716 | 2025-10-06 |
The unveiled mosaic of intra-tumor heterogeneity in ovarian cancer through spatial transcriptomic technologies: A systematic review
2024-11, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.08.001
PMID:39111726
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系统综述 | 通过空间转录组技术揭示卵巢癌肿瘤内异质性的系统综述 | 系统整合空间转录组技术在卵巢癌研究中的应用,强调空间背景对理解肿瘤异质性和微环境的重要性 | 作为综述文章,不包含原始实验数据,主要基于现有文献分析 | 探讨空间转录组技术在卵巢癌肿瘤内异质性和肿瘤微环境研究中的应用价值 | 卵巢癌肿瘤组织及其微环境 | 数字病理 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1717 | 2025-10-06 |
DC-derived CXCL10 promotes CTL activation to suppress ovarian cancer
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.013
PMID:38823437
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研究论文 | 本研究探讨树突状细胞来源的CXCL10通过激活细胞毒性T淋巴细胞抑制卵巢癌的机制 | 首次揭示CXCL10在卵巢癌微环境中作为树突状细胞与细胞毒性T淋巴细胞相互作用的关键调节因子 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行临床验证 | 阐明树突状细胞及其CXCL10标记基因在卵巢癌微环境中的作用机制 | 卵巢癌微环境中的树突状细胞和细胞毒性T淋巴细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 免疫浸润分析, 体外实验 | 动物模型 | 基因表达数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1718 | 2025-10-06 |
WITHDRAWN: Single-cell RNA Sequencing Revealing that MMP12+ Macrophages are Associated with Cancer Liver Metastasis
2024-09-12, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
撤稿文章 | 该文章因作者要求已被出版商撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1719 | 2025-10-06 |
Integration of single-cell RNA sequencing of endothelial cells and proteomics to unravel the role of ICAM1-PTGS2 communication in apical periodontitis: A laboratory investigation
2024-09, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.14080
PMID:38713190
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术,揭示了内皮细胞在慢性根尖周炎中的多样性及ICAM1-PTGS2通讯在铁死亡中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析慢性根尖周炎中内皮细胞亚群多样性,并发现ICAM1通过调控PTGS2影响铁死亡的新机制 | 样本量较小(5个CAP样本),主要基于体外细胞实验验证,需要更多临床样本进一步确认 | 探究慢性根尖周炎中内皮细胞多样性及ICAM1-PTGS2通讯在疾病发生发展中的作用机制 | 慢性根尖周炎患者组织样本、人脐静脉内皮细胞(HUVECs)、THP-1来源的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 根尖周炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 实时PCR, 蛋白质印迹, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 基因表达数据 | 5个慢性根尖周炎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1720 | 2025-10-06 |
Inhalable Stem Cell Exosomes Promote Heart Repair After Myocardial Infarction
2024-Aug-27, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究开发了一种通过吸入干细胞外泌体治疗心肌梗死的无创方法 | 首次报道通过吸入方式递送干细胞外泌体的无创治疗方法,并发现内皮细胞CD36在心脏修复中的新机制 | 研究主要基于动物模型,尚未进行临床试验验证 | 开发心肌梗死后心脏修复的无创治疗方法 | C57BL/6小鼠和猪的心肌梗死模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,心脏磁共振成像,超声心动图 | NA | 基因表达数据,影像数据,组织学数据 | 小鼠和猪的心肌梗死模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |