单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 1701 - 1720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1701 | 2025-10-07 |
Bone-marrow macrophage-derived GPNMB protein binds to orphan receptor GPR39 and plays a critical role in cardiac repair
2024-Nov, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00555-4
PMID:39455836
|
研究论文 | 本研究揭示了骨髓巨噬细胞来源的GPNMB蛋白通过结合孤儿受体GPR39在心肌梗死后心脏修复中的关键作用 | 首次发现GPNMB通过GPR39受体介导心脏修复作用，并阐明其通过增强心肌细胞收缩和抑制成纤维细胞活化的双重机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究GPNMB在心脏损伤修复中的功能和机制 | 心肌梗死小鼠模型和人类心力衰竭样本 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序、谱系追踪、骨髓移植、基因功能缺失模型 | 基因敲除模型 | 基因表达数据、功能实验数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1702 | 2025-10-07 |
Loss of cell junctional components and matrix alterations drive cell desquamation and fibrotic changes in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.17.599411
PMID:38948715
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学分析，揭示了特发性肺纤维化中上皮细胞脱落与细胞连接成分丢失及基底膜基质失调的关联机制 | 首次在IPF中发现上皮细胞脱落现象，并通过空间多组学技术揭示了细胞连接成分下调与基质失调导致上皮脱落的分子机制 | 研究样本量有限，主要关注远端细支气管，未全面评估其他肺区域的变化 | 探究特发性肺纤维化中远端细支气管上皮细胞脱落的分子机制 | 特发性肺纤维化患者和无肺病史患者的远端细支气管上皮细胞及基底膜 | 空间生物学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 功能实验 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据 | IPF患者和无肺病史患者（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1703 | 2025-10-07 |
Molecular Profiling Defines Three Subtypes of Synovial Sarcoma
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404510
PMID:39257029
|
研究论文 | 通过分子特征分析将滑膜肉瘤分为三种亚型 | 首次通过转录组分析将滑膜肉瘤分为三个分子亚型，并发现高风险亚型患者比例高于既往认知 | 样本量相对有限（91个肿瘤来自55例患者） | 阐明驱动滑膜肉瘤表型多样性的基因组事件 | 滑膜肉瘤患者肿瘤组织 | 癌症基因组学 | 滑膜肉瘤 | RNA测序,靶向DNA测序,蛋白质组分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | 91个肿瘤样本来自55例患者 | NA | RNA测序,靶向DNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1704 | 2025-10-07 |
Characterization of HPV6/11-reactive T-cell subsets in papillomas of patients with juvenile-onset recurrent respiratory papillomatosis and identification of HPV11 E7-specific candidate TCR clonotypes
2024-Oct-22, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00677-24
PMID:39258910
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和RNA微阵列技术，表征了青少年发病型复发性呼吸道乳头状瘤病(JORRP)患者乳头状瘤中HPV6/11反应性T细胞亚群，并鉴定了HPV11 E7特异性候选TCR克隆型 | 首次发现IFN-γ+ CD8+组织驻留记忆T细胞在JORRP乳头状瘤中扩增并与疾病严重程度负相关，并成功鉴定出HPV11 E7特异性候选TCR克隆型 | 研究样本量有限，主要聚焦于HPV11 E7抗原，未涵盖所有HPV6/11抗原表位 | 阐明JORRP患者乳头状瘤中HPV特异性T细胞免疫应答机制 | 青少年发病型复发性呼吸道乳头状瘤病(JORRP)患者的乳头状瘤组织 | 免疫学 | 呼吸道乳头状瘤病 | 单细胞RNA测序, RNA微阵列, T细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | JORRP患者乳头状瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 基因表达谱分析 | NA | NA |
| 1705 | 2025-10-07 |
Machine learning identifies activation of RUNX/AP-1 as drivers of mesenchymal and fibrotic regulatory programs in gastric cancer
2024-06-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278565.123
PMID:38777607
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别了胃癌中驱动间质和纤维化调控程序的关键转录因子 | 开发了基于ATAC-seq数据的机器学习方法，首次系统识别了胃癌中间质表型和上皮表型的核心转录调控因子，并揭示了拷贝数变异对表观基因组调控程序的影响 | 研究主要基于细胞系和部分原发肿瘤数据，需要更多临床样本验证 | 探索胃癌异质性的转录调控机制，特别是上皮-间质转化过程的调控网络 | 胃癌细胞系和原发肿瘤样本 | 机器学习 | 胃癌 | ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习 | 基因组测序数据，基因表达数据 | 胃癌细胞系和原发肿瘤样本组合 | NA | ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1706 | 2025-10-07 |
Human inherited PD-L1 deficiency is clinically and immunologically less severe than PD-1 deficiency
2024-Jun-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231704
PMID:38634869
|
研究论文 | 比较遗传性PD-L1缺陷与PD-1缺陷在临床和免疫学表现上的差异 | 首次发现人类遗传性PD-L1缺陷的临床表现比PD-1缺陷更轻微 | 仅研究两个家系病例，样本量有限 | 探究PD-1/PD-L1通路在自身免疫疾病中的作用机制 | 遗传性PD-L1缺陷的兄弟姐妹患者 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫表型分析 | NA | 基因测序数据, 转录组数据, 免疫表型数据 | 2例PD-L1缺陷患者，与先前报道的2例PD-1缺陷患者对比 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1707 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of the human parasite Schistosoma mansoni first intra-molluscan stage reveals tentative tegumental and stem-cell regulators
2024-03-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-55790-3
PMID:38472267
|
研究论文 | 通过单细胞转录组技术研究曼氏血吸虫在螺蛳宿主内发育早期的细胞类型和分子调控机制 | 首次对曼氏血吸虫母胞蚴阶段进行单细胞转录组分析，识别了六个细胞簇并预测了关键转录因子 | 研究聚焦于早期发育阶段，对后续发育阶段的分子机制了解仍然有限 | 阐明曼氏血吸虫在中间宿主螺蛳体内发育的细胞和分子机制 | 曼氏血吸虫母胞蚴阶段的单细胞 | 单细胞生物学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序，原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 曼氏血吸虫母胞蚴单细胞悬液 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的10x Genomics Chromium平台 |
| 1708 | 2025-10-07 |
From local to global gene co-expression estimation using single-cell RNA-seq data
2024-Jan-29, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujae001
PMID:38465983
|
研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞RNA-seq数据的基因共表达估计方法，从局部到全局分析基因关系 | 提出细胞特异性基因网络概念和平均局部密度差(aLDG)这一新的单变量依赖度量，能够检测非线性、非单调关系 | NA | 开发能够捕捉局部基因依赖关系的统计方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非参数估计器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1709 | 2025-10-07 |
Aryl hydrocarbon receptor and IL-13 signaling crosstalk in human keratinocytes and atopic dermatitis
2024, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2024.1323405
PMID:38344408
|
研究论文 | 本研究探讨芳香烃受体与IL-13信号通路在人类角质形成细胞和特应性皮炎中的相互作用机制 | 首次揭示AHR通过全基因组转录调控作用调节IL-13下游信号通路，而不影响STAT6核转位 | 研究主要基于体外HaCaT细胞模型，需要更多体内实验验证 | 阐明AHR在特应性皮炎中部分改善病情的分子机制 | 人类皮肤活检组织和人角质形成细胞系HaCaT | 分子生物学 | 特应性皮炎 | RNA测序, 单细胞RNA测序, Western blot, ELISA, qRT-PCR | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 人类皮肤活检组织（患者与健康对照）和HaCaT细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 1710 | 2025-10-07 |
Extracellular vesicles from human-induced pluripotent stem cell-derived neural stem cells alleviate proinflammatory cascades within disease-associated microglia in Alzheimer's disease
2024-Nov, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12519
PMID:39499013
|
研究论文 | 本研究探讨人诱导多能干细胞来源神经干细胞胞外囊泡对阿尔茨海默病模型小鼠神经炎症的调节作用 | 首次证明hiPSC-NSC-EVs通过调节小胶质细胞和星形胶质细胞的转录组变化来抑制AD神经炎症信号通路 | 研究仅使用5xFAD小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 开发阿尔茨海默病的疾病修饰疗法 | 3月龄5xFAD转基因小鼠和培养的人类小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，免疫染色 | 动物模型 | 基因表达数据，蛋白质数据，行为数据 | 5xFAD小鼠模型和人类小胶质细胞培养物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1711 | 2025-10-07 |
CD4+ T cells exhibit distinct transcriptional phenotypes in the lymph nodes and blood following mRNA vaccination in humans
2024-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01888-9
PMID:39164479
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析mRNA疫苗接种后人类血液和引流淋巴结中SARS-CoV-2刺突蛋白特异性CD4 T细胞的转录表型差异 | 首次使用深度学习反向表位定位方法Trex定义抗原特异性，并比较疫苗接种与自然感染后CD4 T细胞在淋巴器官和外周血中的表型差异 | 样本时间点仅限于接种后3个月和6个月，未涵盖更长期的免疫反应动态 | 解析mRNA疫苗接种后CD4 T细胞在淋巴组织与血液中的转录表型特征 | 接种BNT162b2 mRNA疫苗的个体和SARS-CoV-2感染者的CD4 T细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞转录组测序，深度学习反向表位定位 | 深度学习 | 单细胞RNA测序数据 | 分析1,277个刺突蛋白特异性CD4 T细胞（含238个通过Trex方法定义） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1712 | 2025-10-07 |
Scupa: Single-cell unified polarization assessment of immune cells using the single-cell foundation model
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.15.608093
PMID:39229048
|
研究论文 | 开发了首个用于全面分析免疫细胞极化的计算方法Scupa | 首个利用单细胞基础模型系统评估免疫细胞极化的计算方法 | NA | 解决缺乏系统检测细胞因子效应和免疫细胞极化方法的问题 | 免疫细胞极化状态 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | Universal Cell Embeddings基础模型 | 单细胞转录组数据 | 基于免疫词典中14种免疫细胞类型的66种细胞因子驱动极化状态 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1713 | 2025-10-07 |
Enhanced Complement Expression in the Tumor Microenvironment Following Neoadjuvant Therapy: Implications for Immunomodulation and Survival in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-May-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4104258/v1
PMID:38798691
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析新辅助治疗对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响，发现补体基因表达上调与患者生存改善相关 | 首次揭示新辅助治疗通过上调肿瘤微环境中补体基因表达重塑免疫微环境，并发现补体表达水平与患者预后相关 | 样本量有限（36例患者），需要更大规模研究验证 | 探究新辅助治疗对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的特异性影响 | 23例接受新辅助治疗和13例未接受新辅助治疗的胰腺导管腺癌患者 | 空间转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 36例胰腺导管腺癌患者（23例治疗组，13例对照组） | NA | 空间转录组学,snRNA-seq | NA | NA |
| 1714 | 2025-10-07 |
Molecular differences between neonatal and adult stria vascularis from organotypic explants and transcriptomics
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.24.590986
PMID:38712156
|
研究论文 | 本研究通过建立新生和成年小鼠血管纹器官型外植体模型并结合单细胞RNA测序，揭示了血管纹发育和维持的关键分子差异 | 首次建立了保留血-迷路屏障完整性的新生和成年血管纹器官型外植体模型，并结合单细胞RNA测序揭示了发育特异性基因表达谱 | 研究主要基于小鼠模型，人类血管纹可能存在物种特异性差异 | 研究血管纹在发育和成熟过程中的分子差异，为听力损失治疗提供新见解 | 新生和成年小鼠的血管纹组织 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序，器官型外植体培养，药理学干预 | 小鼠器官型外植体模型 | 单细胞转录组数据，组织学数据 | 新生和成年小鼠血管纹组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1715 | 2025-10-07 |
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588538
PMID:38645090
|
研究论文 | 本研究构建了首个小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱，揭示了该组织的细胞组成和功能特征 | 首次创建小鼠精囊的单细胞转录组图谱，系统定义了分泌细胞和免疫细胞群体 | NA | 研究精囊组织的细胞组成和功能，探索其在生殖过程中的作用 | 小鼠精囊组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 23只不同年龄和饮食条件的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1716 | 2025-10-07 |
Seq-Scope Protocol: Repurposing Illumina Sequencing Flow Cells for High-Resolution Spatial Transcriptomics
2024-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.29.587285
PMID:38617262
|
研究论文 | 介绍Seq-Scope协议，将Illumina测序流动池重新用于高分辨率空间转录组学分析 | 开发了将Illumina测序平台重新用于高分辨率、高通量空间转录组分析的新方法 | 需要Illumina NovaSeq 6000等专业设备，方法复杂度较高 | 建立高分辨率空间转录组学分析协议 | 多种生物组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 无分割分析方法 | 图像, 转录组数据 | NA | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina测序流动池，支持7 mm × 7 mm或更大区域的多组织切片分析 |
| 1717 | 2025-10-07 |
Multi-omics analyses reveal bacteria and catalase associated with keloid disease
2024-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104904
PMID:38061241
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示细菌和过氧化氢酶与瘢痕疙瘩疾病的关联 | 首次综合运用微生物组、宏蛋白质组、代谢组、单细胞转录组和CDX小鼠模型研究细菌在瘢痕疙瘩中的作用机制 | 研究样本量有限，未明确说明具体样本数量 | 探索细菌在瘢痕疙瘩疾病发生发展中的作用机制 | 瘢痕疙瘩组织、健康皮肤组织、瘢痕疙瘩成纤维细胞、BALB/c雌性裸鼠 | 多组学分析 | 瘢痕疙瘩 | 16S rRNA测序, 宏蛋白质组学, 代谢组学, 单细胞RNA测序, 细胞源性异种移植模型 | CDX小鼠模型 | 微生物组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1718 | 2025-10-07 |
A longitudinal molecular and cellular lung atlas of lethal SARS-CoV-2 infection in K18-hACE2 transgenic mice
2024-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104932
PMID:38118400
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建K18-hACE2转基因小鼠在SARS-CoV-2致死感染过程中的肺部分子和细胞图谱 | 首次在K18-hACE2转基因小鼠模型中利用单细胞RNA测序技术系统揭示SARS-CoV-2感染过程中肺部细胞动态变化和分子机制 | 研究基于转基因小鼠模型，与人类疾病存在物种差异 | 探究SARS-CoV-2在肺部组织中的致病机制和细胞响应 | K18-hACE2转基因小鼠的肺组织 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | K18-hACE2转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1719 | 2025-10-07 |
ScRNA-seq reveals trained immunity-engaged Th17 cell activation against Edwardsiella piscicida-induced intestinal inflammation in teleost
2024-Dec, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127912
PMID:39326350
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了β-葡聚糖训练通过激活Th17细胞缓解鲆鱼肠道炎症的机制 | 首次在硬骨鱼中发现训练免疫通过调节肠道Th17细胞功能对抗细菌感染的机制 | 研究仅限于鲆鱼模型，尚未在其他物种验证 | 探究硬骨鱼肠道免疫细胞在细菌感染中维持肠道稳态的细胞机制 | 鲆鱼(Scophthalmus maximus)肠道免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肠道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1720 | 2025-10-07 |
Reciprocal regulation of SIRT1 and AMPK by Ginsenoside compound K impedes the conversion from plasma cells to mitigate for podocyte injury in MRL/lpr mice in a B cell-specific manner
2024-Mar, Journal of ginseng research
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.jgr.2023.11.006
PMID:38465215
|
研究论文 | 本研究揭示人参皂苷化合物K通过SIRT1和AMPK的相互调节机制，以B细胞特异性方式缓解狼疮肾炎小鼠的足细胞损伤 | 首次发现人参皂苷CK通过调节B细胞亚群中SIRT1和AMPK的协同作用，抑制浆细胞转化，从而减轻免疫复合物沉积 | 研究仅限于MRL/lpr小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探讨人参皂苷CK在狼疮肾炎中对B细胞亚群和足细胞保护的作用机制 | 雌性MRL/lpr狼疮易感小鼠 | 分子生物学 | 狼疮肾炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、代谢组学分析、免疫印迹、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、蛋白质数据 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |