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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1681 | 2025-10-06 |
Neoadjuvant chemotherapy-induced remodeling of human hormonal receptor-positive breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2024-03-31, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216656
PMID:38266804
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示新辅助化疗对人类激素受体阳性乳腺癌的免疫微环境重塑作用 | 首次在单细胞水平系统揭示HR乳腺癌化疗前后免疫细胞组成变化,发现新的免疫细胞亚群与化疗敏感性相关 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探索激素受体阳性乳腺癌化疗耐药机制及化疗对肿瘤微环境的重塑作用 | 激素受体阳性乳腺癌患者配对的化疗前后肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 | 配对的化疗前后HR乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1682 | 2025-10-06 |
scRNA-seq of colorectal cancer shows regional immune atlas with the function of CD20+ B cells
2024-03-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216664
PMID:38253219
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结直肠癌不同区域的免疫图谱,揭示CD20+ B细胞的功能 | 首次系统描绘结直肠癌不同解剖区域的免疫特征,发现CD20+ B细胞在右半和左半结直肠癌中具有不同的发育轨迹并与预后相关 | 样本量相对有限(19个样本),需要在更大队列中验证 | 表征结直肠癌不同区域的免疫景观并寻找潜在治疗靶点 | 结直肠癌患者肿瘤组织和配对正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19个样本(来自4个区域),共39,484个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1683 | 2025-10-06 |
Updates in Skin Cancer in Transplant Recipients and Immunosuppressed Patients: Review of the 2022-2023 Scientific Symposium of the International Immunosuppression and Transplant Skin Cancer Collaborative
2024, Transplant international : official journal of the European Society for Organ Transplantation
IF:2.7Q2
DOI:10.3389/ti.2024.12387
PMID:38562207
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综述 | 总结2022年国际免疫抑制与移植皮肤癌协作组科学研讨会关于移植受者和免疫抑制患者皮肤癌的最新研究进展 | 汇集了皮肤癌在免疫抑制人群中的最新研究成果,包括化学预防、免疫抑制方案、免疫治疗和空间转录组学等前沿领域 | NA | 回顾和总结移植受者和长期免疫抑制患者皮肤癌研究领域的最新科学进展 | 实体器官移植受者和其他形式长期免疫抑制患者 | NA | 皮肤癌 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1684 | 2025-10-06 |
Airway epithelial cell response to RSV is mostly impaired in goblet and multiciliated cells in asthma
2024-08-19, Thorax
IF:9.0Q1
DOI:10.1136/thorax-2023-220230
PMID:38373824
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了哮喘患者和健康捐赠者支气管上皮细胞对呼吸道合胞病毒(RSV)感染的转录反应 | 首次在单细胞分辨率下揭示了哮喘患者杯状细胞和多纤毛细胞对RSV感染的应答受损 | 样本量较小(哮喘患者n=8,健康捐赠者n=8),需要更大规模研究验证 | 探究哮喘患者支气管上皮细胞对RSV感染的分子应答机制 | 原代支气管上皮细胞(pBECs) | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16例(8例哮喘患者,8例健康捐赠者) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1685 | 2025-10-06 |
scGPT: toward building a foundation model for single-cell multi-omics using generative AI
2024-Aug, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02201-0
PMID:38409223
|
研究论文 | 开发基于生成式预训练变换器的单细胞多组学基础模型scGPT | 首次将生成式预训练模型应用于单细胞生物学领域,构建了包含3300多万个细胞的跨组学基础模型 | NA | 探索基础模型在细胞生物学和遗传研究中的适用性 | 单细胞测序数据中的基因和细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 生成式预训练变换器 | 单细胞多组学数据 | 超过3300万个细胞 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1686 | 2025-10-06 |
Genomic and single-cell characterization of patient-derived tumor organoid models of head and neck squamous cell carcinoma
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601068
PMID:39005427
|
研究论文 | 本研究通过建立头颈部鳞状细胞癌患者来源肿瘤类器官模型,揭示了肿瘤异质性特征及其与顺铂治疗反应的关系 | 首次在头颈部鳞癌类器官模型中系统表征基因组特征和单细胞异质性,发现混合上皮-间质转化状态与顺铂耐药的相关性 | 样本量相对有限(31例患者),需要更大规模验证研究结果 | 建立头颈部鳞癌患者来源肿瘤类器官模型,研究肿瘤异质性与治疗反应机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者来源肿瘤类器官 | 数字病理 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 患者来源肿瘤类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 31例头颈部鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1687 | 2025-10-06 |
Early Developmental Origins of Cortical Disorders Modeled in Human Neural Stem Cells
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.598925
PMID:38915580
|
研究论文 | 通过人类神经干细胞研究早期端脑发育阶段与皮质障碍病因的关联 | 首次在人类神经干细胞中模拟皮质障碍的早期发育起源,揭示了疾病特异性关键阶段和跨疾病的汇聚信号通路 | 研究主要基于体外模型,需要进一步验证在完整生物系统中的适用性 | 探索人类端脑早期发育阶段在皮质障碍病因中的作用机制 | 人类神经干细胞、自闭症患者来源的神经干细胞 | 发育神经生物学 | 皮质障碍、自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1688 | 2025-10-06 |
Prognostic gene landscapes and therapeutic insights in sepsis-induced coagulopathy
2024-05, Thrombosis research
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.thromres.2024.03.011
PMID:38513536
|
研究论文 | 本研究通过分析脓毒症患者的转录组数据,识别了与凝血相关的关键基因,并开发了预后模型和列线图来预测患者生存 | 首次通过单细胞测序揭示脓毒症中血小板与免疫细胞间的通讯改变,并发现FYN基因在凝血功能障碍中的核心作用 | 研究样本量有限,机制研究主要在动物模型中进行,需要进一步临床验证 | 探索脓毒症诱导凝血病(SIC)的预后基因标志物和治疗靶点 | 脓毒症患者和脓毒症大鼠模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞测序, 实时定量PCR | 预后模型, 列线图, 共识聚类 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 脓毒症患者全血转录组数据,脓毒症大鼠模型 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 1689 | 2025-10-06 |
PIP4K2C inhibition reverses autophagic flux impairment induced by SARS-CoV-2
2024-Apr-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.15.589676
PMID:38659941
|
研究论文 | 研究发现小分子抑制剂RMC-113通过双重抑制PIP4K2C和PIKfyve脂质激酶,逆转SARS-CoV-2诱导的自噬流损伤,发挥广谱抗病毒作用 | 首次揭示PIP4K2C在SARS-CoV-2进入、RNA复制和组装/释放过程中的作用,并发现其与病毒非结构蛋白6结合调控自噬流 | NA | 开发广谱抗病毒药物并阐明其作用机制 | 人类肺类器官和多种RNA病毒包括SARS-CoV-2 | 病毒学 | COVID-19 | 脂质组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、功能测定 | NA | 分子数据、转录组数据、功能测定数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1690 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing highlights epithelial and microenvironmental heterogeneity in malignant progression of pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-03-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216607
PMID:38246225
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析胰腺导管腺癌恶性进展过程中的上皮细胞和微环境异质性 | 首次在单细胞水平揭示IPMN向PDAC进展过程中上皮细胞和肿瘤微环境的异质性变化,发现SPP1-CD44通路在PDAC中显著增强 | 样本量相对有限(仅5个手术切除样本),需要更大队列验证发现 | 解析胰腺导管腺癌恶性进展的细胞分子机制 | 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)和胰腺导管腺癌(PDAC)患者手术样本 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 35,693个细胞,来自3个高级别IPMN和2个IPMN来源的PDAC | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞测序技术 |
| 1691 | 2025-10-06 |
Advanced insights on tumor-associated macrophages revealed by single-cell RNA sequencing: The intratumor heterogeneity, functional phenotypes, and cellular interactions
2024-03-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216610
PMID:38244910
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示肿瘤相关巨噬细胞异质性、功能表型和细胞相互作用方面的最新研究进展 | 从发育角度系统总结TAM表型和功能变化,深入理解TAM在肿瘤微环境中的意义 | NA | 探讨单细胞RNA测序在肿瘤相关巨噬细胞研究中的应用和意义 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 单细胞组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1692 | 2024-09-25 |
Unveiling Molecular Diversity in Cerebral Thrombi via Spatial Transcriptomics
2024-10, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.124.047907
PMID:39206540
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1693 | 2025-10-06 |
COPD basal cells are primed towards secretory to multiciliated cell imbalance driving increased resilience to environmental stressors
2024-05-20, Thorax
IF:9.0Q1
DOI:10.1136/thorax-2022-219958
PMID:38286613
|
研究论文 | 本研究揭示了COPD患者基底细胞向分泌型细胞分化失衡的分子机制及其对环境应激的增强耐受性 | 首次发现COPD-IV期基底细胞存在独特的分子特征,包括KRT5和LAMB3表达上调及Wnt/Notch信号通路激活,驱动分泌型与多纤毛细胞失衡 | 样本量较小(COPD-IV n=4,COPD-II n=3,健康对照n=4),且仅针对特定环境纳米颗粒进行研究 | 阐明环境污染物作用下COPD患者支气管上皮细胞的耐受机制 | 原发性人支气管上皮细胞(pHBECs) | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞转录组测序,功能分析,蛋白质分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 11例人支气管上皮细胞样本(4例COPD-IV期,3例COPD-II期,4例健康对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1694 | 2025-10-06 |
Identifying ADGRG1 as a specific marker for tumor-reactive T cells in acute myeloid leukemia
2024-Sep-06, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00560-0
PMID:39243082
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术鉴定ADGRG1作为急性髓系白血病中肿瘤反应性T细胞的特异性标志物 | 首次发现ADGRG1可作为CD8+肿瘤反应性T细胞的特定标志物,并通过小鼠模型和CAR-T系统验证其功能 | 研究样本仅限于RUNX1::RUNX1T1融合基因的AML患者,需要更广泛的患者群体验证 | 探索急性髓系白血病中肿瘤反应性T细胞的特征和特异性标志物 | 新诊断AML患者的骨髓T细胞和Runx1; Mx1-Cre小鼠模型 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 单细胞V(D)J测序 | STARTRAC-like算法 | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 新诊断RUNX1::RUNX1T1融合基因AML患者的骨髓T细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞V(D)J测序 | NA | NA |
| 1695 | 2025-10-06 |
Recent developments and new directions in the use of natural products for the treatment of inflammatory bowel disease
2024-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155812
PMID:38905845
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综述 | 系统回顾天然产物治疗炎症性肠病的最新研究进展 | 整合现代技术(如宏基因组学、单细胞测序、靶点识别和药物递送系统)推动天然产物在IBD治疗中的应用 | 天然产物在临床转化和药物开发方面仍面临挑战 | 探索天然产物治疗炎症性肠病的新方向 | 多酚、生物碱、萜类、醌类等天然产物 | NA | 炎症性肠病 | 宏基因组学, 单细胞测序, 靶点识别技术, 药物递送系统 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1696 | 2025-10-06 |
RAS/RAF landscape in monoclonal plasma cell conditions
2024-07-11, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023022295
PMID:38643494
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研究论文 | 通过分析10,000多名浆细胞疾病患者的RAS/RAF基因突变情况,揭示了该通路在多发性骨髓瘤等疾病中的突变特征 | 首次在如此大规模浆细胞疾病队列中系统描述RAS/RAF突变谱,并通过单细胞测序证实突变发生在不同亚克隆中 | 研究基于常规测序面板,可能未覆盖所有相关突变 | 描述浆细胞疾病中RAS/RAF通路的突变特征和临床意义 | 10,000多名不同浆细胞疾病患者 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 二代测序,单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | >10,000名患者,其中29名患者进行了单细胞测序 | NA | 单细胞测序,二代测序 | NA | NA |
| 1697 | 2025-10-06 |
MatriCom: a scRNA-Seq data mining tool to infer ECM-ECM and cell-ECM communication systems
2024-Dec-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627834
PMID:39763937
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研究论文 | 开发了一个名为MatriCom的scRNA-Seq数据挖掘工具,用于推断ECM-ECM和细胞-ECM通讯系统 | 基于独特的MatriComDB数据库(包含25,000多个经过整理的相互作用),专门针对基质组蛋白相互作用设计,能考虑ECM蛋白相互作用的特定规则 | NA | 开发工具以挖掘scRNA-Seq数据并推断ECM组分之间以及不同细胞群体与ECM之间的通讯 | 哺乳动物基质组基因(约1,000个基因中的80%)及其相互作用 | 生物信息学 | 癌症或纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 整合了46个scRNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1698 | 2025-10-06 |
Evaluating the role of IER3+ macrophages in the prognosis of liver fibrosis by bulk and single-cell transcriptional analyses
2024-Dec, ILIVER..
DOI:10.1016/j.iliver.2024.100132
PMID:40635861
|
研究论文 | 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析,建立肝纤维化预后模型并研究IER3+巨噬细胞在肝纤维化中的作用 | 首次建立包含IER3、AKR1B10、ADCY1和PGM1四个基因的肝纤维化巨噬细胞相关预后特征模型,并通过单细胞分析发现IER3在髓系细胞中的特异性表达 | 研究依赖于公共数据库数据,样本量有限,需要进一步实验验证 | 探索肝纤维化的复杂发病机制并识别能够预测肝纤维化预后的关键遗传标志物 | 肝纤维化患者样本和健康对照 | 生物信息学 | 肝纤维化 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学染色 | 预后预测模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的三个数据集(GSE84044、GSE130970、GSE15654) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1699 | 2025-10-06 |
The generation of stable microvessels in ischemia is mediated by endothelial cell derived TRAIL
2024-10-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn8760
PMID:39365855
|
研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞来源的TRAIL在介导缺血条件下稳定微血管生成中的关键作用 | 首次发现内皮细胞来源的TRAIL在促进新生血管形成和血管稳定中的新功能,并证明TRAIL-R2激动剂在治疗缺血中的潜力 | 研究主要基于动物模型和体外实验,临床转化仍需进一步验证 | 探究TRAIL在缺血条件下介导新生血管形成和血管稳定的分子机制 | 内皮细胞、周细胞、小鼠模型、患者动脉样本 | 血管生物学 | 外周动脉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1700 | 2025-10-06 |
Loss of synovial tissue macrophage homeostasis precedes rheumatoid arthritis clinical onset
2024-09-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj1252
PMID:39321281
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研究论文 | 本研究深入探讨了类风湿关节炎患者、风险人群和健康对照者滑膜组织的髓系细胞景观 | 首次在RA临床发病前发现CD40表达巨噬细胞群的富集,识别了早期致病性髓系特征 | 样本量相对有限,需要进一步验证这些发现 | 研究类风湿关节炎发病前的滑膜组织巨噬细胞稳态变化 | 类风湿关节炎患者、风险人群和健康对照者的滑膜组织细胞 | 单细胞生物学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术,RNA测序,代谢分析,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | 67,908个RA和HC滑膜组织细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |