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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2025-10-06 |
Unveiling impaired vascular function and cellular heterogeneity in diabetic donor-derived vascular organoids
2024-09-10, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae043
PMID:39049437
|
研究论文 | 本研究通过糖尿病供体来源的血管类器官揭示了糖尿病血管功能障碍和细胞异质性 | 首次在糖尿病供体来源的血管类器官中发现特异性内皮细胞亚群,揭示其ROS通路过度表达和血管生成特征表达不足 | 类器官可能需要额外的器官特异性分化因子来促进器官特异性身份的形成 | 研究糖尿病血管病变的体外模型和药物筛选平台 | 糖尿病和非糖尿病供体来源的诱导多能干细胞生成的血管类器官 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 糖尿病和非糖尿病供体来源的血管类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1662 | 2025-10-06 |
Dual-specificity phosphatases 13 and 27 as key switches in muscle stem cell transition from proliferation to differentiation
2024-09-10, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae045
PMID:38975693
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研究论文 | 本研究揭示了双特异性磷酸酶DUSP13和DUSP27在肌肉干细胞从增殖向分化转变过程中的关键调控作用 | 首次发现MyoD直接靶向调控Dusp13和Dusp27,并证明这两个磷酸酶在肌肉干细胞命运转变中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人类肌肉干细胞中的功能需要进一步验证 | 探究肌肉干细胞从增殖向分化转变的分子调控机制 | 肌肉干细胞(MuSCs) | 发育生物学 | 肌肉再生障碍 | 单细胞RNA测序,基因敲除,基因过表达 | NA | 基因表达数据 | MyoD敲入小鼠和Dusp13:Dusp27双敲除小鼠的肌肉干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1663 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of long isoform sequencing and functional data identifies distinct cortical layer neuronal subtypes derived from human iPSCs
2024-09-01, Journal of neurophysiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1152/jn.00045.2024
PMID:38988287
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研究论文 | 比较两种培养基中人类iPSCs分化为神经元的效果,发现E8M培养基能更高效生成功能性皮层神经元 | 首次结合长读长单细胞RNA测序和功能验证,鉴定出人类iPSCs来源的特定皮层神经元亚型 | 研究仅观察了35天内的分化效果,未评估长期稳定性 | 优化人类iPSCs向神经元分化的方法,提高分化效率 | 人类诱导多能干细胞(iPSCs) | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 长读长单细胞RNA测序, 免疫细胞化学, 全细胞膜片钳记录 | NA | 单细胞RNA测序数据, 电生理记录数据, 免疫荧光图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1664 | 2025-10-06 |
Re-analysis of single-cell RNA-seq data reveals the origin and roles of cycling myeloid cells
2024-07-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae030
PMID:38655770
|
研究论文 | 通过重新分析单细胞RNA测序数据揭示了循环髓系细胞的起源、分化和功能 | 首次系统揭示循环髓系细胞的起源、分化过程及其在生理和病理条件下的功能 | NA | 研究循环髓系细胞的起源、分化和功能 | 循环髓系细胞,特别是aCMCs亚群 | 单细胞生物学 | 创伤损伤、癌症、病原体感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1665 | 2025-10-06 |
Candida albicans-myeloid cells-T lymphocytes axis in the tumor microenvironment of oral tumor-bearing mice
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216814
PMID:38499264
|
研究论文 | 本研究揭示白色念珠菌感染通过调节髓系细胞-T淋巴细胞轴改变口腔肿瘤微环境并促进肿瘤进展 | 首次发现白色念珠菌感染通过髓系细胞-T淋巴细胞轴调控口腔肿瘤微环境,揭示了IL-17A和γδ T细胞在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究白色念珠菌感染对口腔肿瘤微环境的影响机制 | 口腔肿瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1666 | 2025-10-06 |
An effective two-stage NMBzA-induced rat esophageal tumor model revealing that the FAT-Hippo-YAP1 axis drives the progression of ESCC
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216813
PMID:38499266
|
研究论文 | 本研究建立了一种高效的两阶段NMBzA诱导大鼠食管癌模型,并发现FAT-Hippo-YAP1轴驱动食管鳞癌进展 | 使用索拉非尼作为肿瘤促进剂建立高效两阶段致癌模型,首次揭示大鼠ESCC中FAT-Hippo-YAP1轴的渐进性超活化 | 研究仅基于大鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 建立高效的食管鳞癌动物模型并研究其致癌机制 | NMBzA诱导的大鼠食管鳞癌模型及衍生细胞系 | 癌症研究 | 食管鳞状细胞癌 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 多组学分析, 3D类器官培养 | 动物模型, 细胞系模型, 类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据, 细胞表型数据 | NMBzA诱导的大鼠食管肿瘤样本及衍生细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 1667 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Technology Landscape in 2023
2024-01-13, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad077
PMID:37934608
|
综述 | 本文综述了2023年单细胞RNA测序技术发展现状及其在干细胞研究中的应用 | 系统梳理了单细胞RNA测序技术分类、比较优势及最新技术发展格局 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于技术现状描述 | 概述单细胞RNA测序技术发展现状与技术挑战 | 单细胞RNA测序技术方法 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基于液滴、平板、水凝胶和空间转录组学等多种技术平台 |
| 1668 | 2025-10-06 |
Involvement of S100A6/S100A11 in T-Cell Immune Regulatory in HCC Revealed by Single Cell RNA-seq
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241252610
PMID:38766816
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示S100A6/S100A11在肝细胞癌T细胞免疫调控中的作用机制 | 首次发现S100A6/S100A11在肿瘤T细胞中差异表达并通过NF-κB通路影响肿瘤微环境 | 未明确说明样本数量和研究队列的具体特征 | 探究S100蛋白家族在肝细胞癌免疫细胞中的作用机制 | 肝细胞癌和乙型肝炎病毒相关肝细胞癌的免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 时序细胞轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1669 | 2025-10-06 |
Antigen/HLA-agnostic strategies for Characterizing Tumor-responsive T cell receptors in PDAC patients via single-cell sequencing and autologous organoid application
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216741
PMID:38395378
|
研究论文 | 本研究通过超深度单细胞TCR/RNA测序和自体类器官技术,在PDAC患者中鉴定和验证肿瘤反应性T细胞受体 | 开发了不依赖抗原/HLA的肿瘤反应性TCR表征策略,结合单细胞测序和自体类器官技术 | 仅为概念验证研究,样本量有限(仅2例PDAC患者) | 开发个性化TCR-T细胞疗法的肿瘤反应性TCR表征方法 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者 | 单细胞测序 | 胰腺癌 | 单细胞TCR/RNA测序,类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据,TCR序列数据 | 2例PDAC患者,超过82,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 1670 | 2025-10-06 |
Characterization of the distinct immune microenvironments between hepatocellular carcinoma and intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216799
PMID:38479553
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统比较了肝细胞癌和肝内胆管癌的肿瘤免疫微环境差异 | 首次通过整合41个单细胞RNA测序样本系统比较两种主要原发性肝癌的免疫微环境,并发现HCC中EGR1巨噬细胞的特异性富集 | 样本数量相对有限,仅包含41个样本 | 系统评估肝细胞癌和肝内胆管癌肿瘤免疫微环境的异同 | 肝细胞癌和肝内胆管癌的肿瘤组织样本 | 单细胞基因组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 41个单细胞RNA测序样本,涵盖两种恶性肿瘤的四种不同组织类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1671 | 2025-10-06 |
Association of preoperative aspartate aminotransferase to platelet ratio index with outcomes and tumour microenvironment among colorectal cancer with liver metastases
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216778
PMID:38458593
|
研究论文 | 探讨术前APRI指标对结直肠癌肝转移患者预后及肿瘤微环境的预测价值 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫组化揭示APRI与肿瘤微环境的关联机制 | 回顾性多中心研究,需前瞻性研究进一步验证 | 寻找改善结直肠癌肝转移患者预后预测的可靠生物标志物 | 1323例接受同步切除的结直肠癌肝转移患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化/免疫荧光 | Cox风险回归模型 | 血液检测数据, 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | 1323例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 多重免疫组化 | NA | NA |
| 1672 | 2025-10-06 |
CD63+ cancer-associated fibroblasts confer CDK4/6 inhibitor resistance to breast cancer cells by exosomal miR-20
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216747
PMID:38403110
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研究论文 | 本研究揭示CD63+癌症相关成纤维细胞通过外泌体miR-20介导乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂产生耐药性 | 首次发现CD63+癌症相关成纤维细胞亚群在CDK4/6抑制剂耐药肿瘤组织中富集,并阐明其通过外泌体miR-20靶向RB1 mRNA的耐药机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序和肿瘤异种移植模型,临床验证尚需进一步研究 | 探究乳腺癌对CDK4/6抑制剂产生耐药性的机制及潜在治疗策略 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞、肿瘤异种移植模型 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 外泌体分析, 纳米颗粒合成 | 肿瘤异种移植模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1673 | 2025-10-06 |
Comparable CD8+ T-cell responses to SARS-CoV-2 vaccination in single-cell transcriptomics of recently allogeneic transplanted patients and healthy individuals
2024-03, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29539
PMID:38516755
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学比较了异基因造血干细胞移植患者与健康个体对SARS-CoV-2疫苗的CD8+ T细胞应答 | 首次在ASCT患者中结合单细胞RNA测序与TCR/BCR谱分析,揭示疫苗诱导的CD8 T细胞应答特征 | 样本量有限,仅40%患者产生保护性抗体滴度 | 评估ASCT患者对SARS-CoV-2疫苗的免疫应答特征 | 异基因造血干细胞移植患者和健康疫苗接种者 | 单细胞转录组学 | 免疫缺陷状态 | 单细胞RNA测序,TCR/BCR谱分析 | NA | 单细胞转录组数据,血清学数据 | ASCT患者队列与公开健康疫苗接种者数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1674 | 2025-10-06 |
CCDC66 mutations are associated with high myopia through affected cell mitosis
2024-02-21, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2023-109434
PMID:37852749
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研究论文 | 本研究通过外显子测序发现CCDC66基因突变与高度近视相关,并探讨了其通过影响细胞有丝分裂导致高度近视的机制 | 首次发现CCDC66基因无义突变(c.C172T, p.Q58X)与高度近视表型共分离,并证明CCDC66缺陷会通过影响微管聚合和细胞有丝分裂过程导致视网膜发育异常 | 样本量相对有限(一个家系和200例散发病例),功能研究主要在HEK293和Hela细胞系中进行,未在视网膜原代细胞中验证 | 鉴定高度近视的致病基因并探索其致病机制 | 高度近视患者家系和散发病例,人类和小鼠胚胎视网膜,HEK293和Hela细胞系 | 遗传学 | 高度近视 | 外显子测序,Sanger测序,单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因敲除,免疫荧光染色,免疫印迹 | NA | 基因组数据,转录组数据,细胞图像数据 | 1个高度近视家系和200例散发性高度近视患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1675 | 2025-10-06 |
CRISPR-Cas9 Genome Editing Allows Generation of the Mouse Lung in a Rat
2024-07-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202306-0964OC
PMID:38507610
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9基因编辑和囊胚互补技术,首次在大鼠体内成功生成了小鼠肺组织 | 首次实现跨物种(小鼠-大鼠)肺组织生成,胚胎干细胞对肺组织贡献率达到近99% | 研究仅限于小鼠和大鼠模型,尚未在大型动物或人类中验证 | 探索利用大型动物作为生物反应器生成人类肺器官的可能性 | 小鼠胚胎干细胞和大鼠胚胎 | 发育生物学 | 肺发育不全 | CRISPR-Cas9基因编辑,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,免疫染色图像,流式细胞术数据 | 基因编辑大鼠胚胎和鼠-大鼠嵌合体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1676 | 2025-10-06 |
Immune Response following FLASH and Conventional Radiation in Diffuse Midline Glioma
2024-Jul-15, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2024.01.219
PMID:38364947
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术比较了FLASH和常规放疗对弥漫中线胶质瘤肿瘤免疫微环境的影响 | 首次以单细胞分辨率绘制了常规和FLASH放疗对DMG肿瘤免疫微环境的免疫改变图谱 | 研究样本量有限,仅使用小鼠模型,时间点观察有限(仅第4天和第10天) | 探索FLASH和常规放疗对弥漫中线胶质瘤肿瘤免疫微环境的影响差异 | 原位同系小鼠脑干弥漫中线胶质瘤模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 弥漫中线胶质瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠脑干DMG模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1677 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the landscape of epithelial-mesenchymal transition molecular heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2024-04-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216723
PMID:38342234
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示食管鳞状细胞癌上皮间质转化的分子异质性景观 | 首次在单细胞水平系统描绘ESCC中EMT的分子异质性,发现SERPINH1作为新的EMT标志物,并验证靶向EMT的潜在药物 | 样本量相对有限,需要更大规模验证 | 探究食管鳞状细胞癌中上皮间质转化的分子异质性及其临床意义 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,RNA-seq数据,TCGA数据 | 44名患者的39个肿瘤样本和16个癌旁样本,共209,231个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1678 | 2025-10-06 |
Up-regulation of RAN by MYBL2 maintains osteosarcoma cancer stem-like cells population during heterogeneous tumor generation
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216708
PMID:38336287
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示骨肉瘤癌症干细胞通过MYBL2-RAN通路维持异质性肿瘤的分子机制 | 首次发现MYBL2转录上调RAN并通过增强MYC蛋白核积累促进癌症干细胞自我更新的正反馈机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探索骨肉瘤癌症干细胞维持肿瘤异质性的调控机制 | 骨肉瘤癌症干细胞及其分化的异质性细胞群体 | 单细胞转录组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 临床骨肉瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1679 | 2025-10-06 |
Inhibition of ATM promotes PD-L1 expression by activating JNK/c-Jun/TNF-α signaling axis in triple-negative breast cancer
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216642
PMID:38278470
|
研究论文 | 本研究揭示ATM通过抑制JNK/c-Jun/TNF-α信号轴负向调控PD-L1表达的新机制 | 首次发现ATM通过JNK/c-Jun/TNF-α信号通路负向调控PD-L1表达的分子机制 | 样本量有限(4例scRNA-seq,86例免疫组化),需更大规模研究验证 | 探索ATM调控PD-L1表达的分子机制及其在TNBC免疫治疗中的意义 | 三阴性乳腺癌细胞系、动物模型和临床标本 | 癌症生物学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组化染色,细胞因子阵列分析,Western blot,荧光素酶报告基因检测 | 基因敲低稳定细胞系,动物模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,临床病理数据 | 4例scRNA-seq临床标本,86例免疫组化TNBC标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1680 | 2025-10-06 |
Single-cell characterization of infiltrating T cells identifies novel targets for gallbladder cancer immunotherapy
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216675
PMID:38280478
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建胆囊癌浸润T细胞图谱并建立分子分型标准 | 首次基于T细胞特征建立胆囊癌分子分型标准,识别了12种T细胞亚型及其与肿瘤微环境的关系 | 未提及样本量大小和研究队列的局限性 | 探索胆囊癌中T细胞的异质性并开发免疫治疗新靶点 | 胆囊癌患者的浸润T细胞 | 单细胞生物学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |