单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1661	2025-01-21	TRIM24 Cooperates with Ras Mutation to Drive Glioma Progression through snoRNA Recruitment of PHAX and DNA-PKcs 2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202400023 PMID:38828688	研究论文	本文揭示了表观遗传调节因子TRIM24在胶质瘤进展中的作用，特别是其与HRas突变共同驱动胶质瘤向类上皮性胶质母细胞瘤（Ep-GBM）转变的机制	首次发现TRIM24通过与HRas突变协同作用，通过snoRNA招募PHAX和DNA-PKcs，促进胶质瘤向Ep-GBM样肿瘤的转变	研究主要基于体外实验和动物模型，临床样本验证仍需进一步扩展	探讨TRIM24在胶质瘤进展中的分子机制及其潜在治疗策略	胶质瘤细胞、人类神经干细胞（hNSCs）、临床Ep-GBM样本	分子生物学	胶质瘤	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA测序数据	临床Ep-GBM样本及体外实验模型
1662	2025-01-21	ARID1B maintains mesenchymal stem cell quiescence via inhibition of BCL11B-mediated non-canonical Activin signaling 2024-May-30, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-48285-2 PMID:38816354	研究论文	本文探讨了ARID1B在间充质干细胞（MSCs）静息状态维持中的作用及其机制	揭示了ARID1B通过抑制BCL11B介导的非经典Activin信号通路来维持MSCs静息状态的新机制	研究主要基于小鼠切牙模型，尚未在人类细胞中验证	研究ARID1B在间充质干细胞静息状态维持中的作用及其分子机制	小鼠切牙模型中的GLI1+间充质干细胞	细胞生物学	NA	scRNA-seq, scATAC-seq	NA	单细胞RNA测序数据, 单细胞ATAC测序数据	小鼠切牙模型中的间充质干细胞
1663	2025-01-21	Triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (TREM2) regulates phagocytosis in glioblastoma 2024-05-03, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noad257 PMID:38237157	研究论文	本文研究了髓系细胞表达的触发受体2（TREM2）在胶质母细胞瘤中的吞噬作用调控机制	揭示了TREM2在胶质母细胞瘤中的吞噬作用而非免疫抑制功能，并提出了其作为脑肿瘤潜在治疗策略的可能性	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证	探讨TREM2在胶质母细胞瘤免疫病理和进展中的作用	胶质母细胞瘤中的髓系细胞	肿瘤免疫学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序、流式细胞术	小鼠胶质瘤模型	RNA测序数据、流式细胞数据	未明确提及具体样本数量
1664	2025-01-20	Single-cell RNA sequencing reveals the diversity of the immunological landscape response to genital herpes 2024-Dec, Virologica Sinica IF:4.3Q2 DOI:10.1016/j.virs.2024.10.003 PMID:39426602	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了生殖器疱疹（GH）患者免疫景观的多样性及其对HSV-2感染的反应	首次使用单细胞RNA测序技术详细描绘了GH患者的免疫细胞多样性及其在HSV-2感染和复发中的反应	研究主要依赖于外周血样本，可能无法完全代表局部感染部位的免疫反应	探讨HSV-2感染和复发的机制，特别是免疫细胞在其中的作用	健康个体和复发性GH患者的免疫细胞	生物信息学	生殖器疱疹	单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR），ELISA	NA	RNA序列数据	健康个体和复发性GH患者的外周血样本
1665	2025-01-20	Single-cell RNA-sequencing reveals a profound immune cell response in human cytomegalovirus-infected humanized mice 2024-Oct, Virologica Sinica IF:4.3Q2 DOI:10.1016/j.virs.2024.08.006 PMID:39153545	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了人巨细胞病毒（HCMV）感染的人源化小鼠中免疫细胞的深刻反应	利用单细胞RNA测序技术，首次在单细胞水平上研究了HCMV感染的人源化小鼠中PBMCs的基因表达变化	研究依赖于人源化小鼠模型，可能无法完全模拟人类体内的复杂环境	研究HCMV感染与宿主免疫反应之间的相互作用	人源化小鼠中的PBMCs	生物信息学	病毒感染	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
1666	2025-01-20	The bone marrow is the primary site of thrombopoiesis 2024-01-18, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2023020895 PMID:37879046	研究论文	本文研究了成年小鼠骨髓、脾脏和肺中巨核细胞的相对丰度及其对血小板生成的贡献	通过多种成像技术和单细胞RNA测序数据分析，揭示了骨髓是血小板生成的主要场所，而非脾脏或肺	研究主要基于小鼠模型，人类数据的直接适用性尚需进一步验证	探讨不同器官中巨核细胞的丰度及其对血小板生成的贡献	成年小鼠的骨髓、脾脏和肺	生物医学	NA	全组织光片成像、定量组织学成像、流式细胞术、活体成像、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	图像、RNA测序数据	成年小鼠的骨髓、脾脏和肺样本
1667	2025-01-19	Over Activation of IL-6/STAT3 Signaling Pathway in Juvenile Dermatomyositis 2024-Oct, Rheumatology and therapy IF:2.9Q2 DOI:10.1007/s40744-024-00699-6 PMID:39073510	研究论文	本研究探讨了IL-6/JAK/STAT3信号通路在青少年皮肌炎（JDM）中的异常激活及其在肌肉损伤中的作用	首次通过单细胞RNA测序和免疫组化技术揭示了JDM患者中IL-6/JAK/STAT3信号通路的异常激活，并发现IL-6通过触发钙超载和活性氧（ROS）产生参与肌肉损伤的发病机制	样本量较小，仅包括72名新诊断的JDM患者和两名患者的肌肉活检样本	阐明IL-6激活JAK/STAT3信号通路的机制及其在JDM发病中的作用	青少年皮肌炎（JDM）患者	生物医学	皮肌炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化、逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）	NA	血清样本、肌肉活检样本	72名新诊断的JDM患者和两名患者的肌肉活检样本
1668	2025-01-19	The architecture of silk-secreting organs during the final larval stage of silkworms revealed by single-nucleus and spatial transcriptomics 2024-07-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114460 PMID:38996068	研究论文	本文通过单核和空间转录组学技术，系统地绘制了桑蚕幼虫发育后期丝腺的细胞和空间组成	首次结合单核和空间转录组学技术，揭示了桑蚕丝腺的细胞类型和细胞状态动态，并识别了与高效丝蛋白合成相关的调控网络和细胞间通讯	研究主要集中在桑蚕幼虫发育后期的丝腺，未涉及其他发育阶段或其他物种	阐明丝腺的细胞和空间组织，以揭示高效丝蛋白合成的机制	桑蚕幼虫发育后期的丝腺	转录组学	NA	单核转录组学, 空间转录组学	NA	转录组数据	桑蚕幼虫发育后期的丝腺样本
1669	2025-01-19	The mechano-chemical circuit in fibroblasts and dendritic cells drives basal cell proliferation in psoriasis 2024-07-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114513 PMID:39003736	研究论文	本文研究了树突状细胞（DCs）与成纤维细胞之间的机械化学信号通路如何促进银屑病皮肤中基底细胞的增殖	揭示了DCs通过增加细胞外基质（ECM）表达来增强真皮硬度，进而促进基底表皮细胞过度增殖的新机制	研究主要依赖于小鼠银屑病模型和皮肤类器官模型，可能无法完全反映人类银屑病的复杂性	探讨DCs和成纤维细胞在银屑病进展中的作用	DCs、成纤维细胞和基底表皮细胞	生物医学	银屑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学、免疫染色和硬度测量	小鼠银屑病模型和皮肤类器官模型	基因表达数据、空间转录组数据、免疫染色图像和硬度测量数据	未明确提及具体样本数量
1670	2025-01-19	Identification and characterization of TM4SF1+ tumor self-seeded cells 2024-07-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114512 PMID:39003738	研究论文	本文通过光转换标记技术建立了一个精确的动物模型，以重现肿瘤自我播种的自发过程，并识别出具有增强侵袭性和生存能力的肿瘤自我播种细胞（TSCs）亚群	首次使用光转换标记技术精确识别和表征肿瘤自我播种细胞（TSCs），并确定TM4SF1作为TSCs的标志物	研究依赖于动物模型，尚未在人类患者中进行大规模验证	研究肿瘤自我播种细胞（TSCs）的详细性质和功能，以发现潜在的诊断、预后或治疗靶点	肿瘤自我播种细胞（TSCs）	肿瘤学	癌症	光转换标记技术、单细胞RNA测序	动物模型	单细胞RNA测序数据	NA
1671	2025-01-19	An atlas of GPCRs in dopamine neurons: Identification of the free fatty acid receptor 4 as a regulator of food and water intake 2024-07-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114509 PMID:39003735	研究论文	本文通过无偏qPCR阵列表达分析，绘制了多巴胺神经元中G蛋白偶联受体（GPCR）的图谱，并鉴定了自由脂肪酸受体4（FFAR4）作为食物和水摄入的调节因子	首次绘制了多巴胺神经元中GPCR的全面图谱，并鉴定了FFAR4在调节食物和水摄入中的功能	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	研究多巴胺神经元中GPCR的表达及其在代谢调节中的作用	多巴胺神经元	神经科学	NA	qPCR阵列表达分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据挖掘、离体钙成像	NA	基因表达数据、钙成像数据	Dat-eGFP小鼠的多巴胺神经元
1672	2025-01-19	Patterns of Unwanted Biological and Technical Expression Variation Among 49 Human Tissues 2024-06, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology DOI:10.1016/j.labinv.2024.102069 PMID:38670317	研究论文	本研究利用来自49种人体组织的17,282个样本，探讨了基因表达变异的原因和模式，旨在提高去除不想要的变异同时保留与生物学问题相关的变异的能力	这是对组织表达变异潜在来源的最大规模探索之一，揭示了基因表达变异的预期和意外原因，并展示了匹配的组织学标本的实用性	14%的变异原因尚不明确，且部分解释为低置信度	提高去除不想要的基因表达变异同时保留与生物学问题相关的变异的能力	49种人体组织的17,282个样本	生物信息学	NA	RNA-seq	NA	基因表达数据	17,282个样本
1673	2025-01-19	Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Heterogeneity and Transcriptional Dynamics in Porcine Circulating CD8+ T Cells 2024-04-16, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13080692 PMID:38667307	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了猪外周血循环CD8+ T细胞的异质性和转录动态	首次全面描述了猪CD8+ T细胞亚型的异质性和分化轨迹，并鉴定了潜在的转录调控因子	研究主要集中于猪的外周血样本，未涉及其他组织或疾病状态下的CD8+ T细胞	研究猪免疫系统中CD8+ T细胞的异质性和功能	猪外周血中的CD8+ T细胞	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	猪外周血样本
1674	2025-01-19	Single-Cell DNA Sequencing Reveals an Evolutionary Pattern of CHIP in Transplant Eligible Multiple Myeloma Patients 2024-04-09, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13080657 PMID:38667272	研究论文	本文通过单细胞DNA测序技术研究了多发性骨髓瘤患者中克隆性造血现象（CHIP）的进化模式	首次在多发性骨髓瘤患者中使用高吞吐量单细胞DNA测序技术，揭示了CHIP的进化模式和与治疗反应的关系	样本量较小，仅包括12名患者，且仅对部分患者进行了纵向样本分析	研究多发性骨髓瘤患者中克隆性造血现象（CHIP）的进化模式及其与治疗反应的关系	多发性骨髓瘤患者	基因组学	多发性骨髓瘤	单细胞DNA测序	NA	DNA序列数据	12名多发性骨髓瘤患者，其中4名患者有纵向样本
1675	2025-01-19	Potential Roles of Specific Subclasses of Premotor Interneurons in Spinal Cord Function Recovery after Traumatic Spinal Cord Injury in Adults 2024-04-09, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13080652 PMID:38667267	综述	本文回顾了在成人创伤性脊髓损伤后，前运动中间神经元在形成新的脊髓内回路中的作用，并强调了研究人员在分类这些细胞群体时遇到的困难	本文强调了单细胞RNA测序和转录组实验在成人脊髓中间神经元分类中的重要性，指出了传统基于胚胎发育转录因子差异表达的方法在成人中的局限性	目前的研究在明确参与运动功能恢复的特定中间神经元群体身份方面仍存在困难	探讨成人创伤性脊髓损伤后，特定亚类前运动中间神经元在脊髓功能恢复中的潜在作用	成人创伤性脊髓损伤后的前运动中间神经元	神经科学	脊髓损伤	单细胞RNA测序, 转录组实验	NA	RNA测序数据, 转录组数据	NA
1676	2025-01-19	Brooklyn plots to identify co-expression dysregulation in single cell sequencing 2024-Mar, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1 DOI:10.1093/nargab/lqad112 PMID:38213836	研究论文	本文介绍了一种通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据检测基因组相关相邻基因共表达全局变化的方法，并开发了一个软件包来生成和测试非随机性	创新点在于使用'Brooklyn plots'来识别同一染色体上显著共表达的基因百分比，并发现扩张型心肌病心肌细胞中开放染色质模式的改变	局限性在于该方法主要适用于单细胞数据，可能不适用于批量数据集	研究目的是检测单细胞RNA测序数据中基因组相关相邻基因共表达的全局变化	研究对象是单细胞RNA测序数据中的基因共表达模式	生物信息学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	NA
1677	2025-01-18	Macrophages preserve endothelial cell specialization in the adrenal gland to modulate aldosterone secretion and blood pressure 2024-07-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114395 PMID:38941187	研究论文	本文探讨了巨噬细胞在肾上腺中如何通过维持毛细血管的特殊化来调节醛固酮分泌和血压	揭示了巨噬细胞通过VEGF-A信号维持肾上腺毛细血管的特殊化，进而调节醛固酮分泌和血压的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证有限	研究巨噬细胞在肾上腺功能和血压调节中的作用	肾上腺中的巨噬细胞和毛细血管	生物医学	高血压	单细胞转录组学、功能表型分析	小鼠模型	基因表达数据、生理数据	小鼠模型和人类醛固酮产生腺瘤样本
1678	2025-01-18	Insulin and leptin oscillations license food-entrained browning and metabolic flexibility 2024-07-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114390 PMID:38900636	研究论文	本文探讨了定时喂食如何通过胰岛素和瘦素的振荡促进皮下白色脂肪组织（sWAT）的褐变和代谢灵活性	揭示了定时喂食通过胰岛素和瘦素的振荡调控sWAT褐变和能量消耗的机制，并发现神经支配在此过程中的必要性	研究主要基于动物模型，尚未在人类中进行验证	探究定时喂食如何通过激素振荡调控脂肪组织褐变和代谢灵活性	皮下白色脂肪组织（sWAT）和棕色脂肪组织（BAT）	代谢研究	代谢疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和流式细胞术	NA	基因表达数据和细胞表型数据	NA
1679	2025-01-16	Pancreatic Neuroendocrine Tumor: The Case Report of a Patient with Germline FANCD2 Mutation and Tumor Analysis Using Single-Cell RNA Sequencing 2024-Dec-14, Journal of clinical medicine IF:3.0Q1 DOI:10.3390/jcm13247621 PMID:39768544	研究论文	本文报告了一例携带FANCD2基因种系突变的胰腺神经内分泌肿瘤患者，并利用单细胞RNA测序技术对肿瘤进行了分析	首次在胰腺神经内分泌肿瘤患者中报告了FANCD2基因种系突变，并应用单细胞RNA测序技术进行肿瘤分析	样本量较小，仅为单一病例报告	探讨胰腺神经内分泌肿瘤的分子特征和预后标志物	胰腺神经内分泌肿瘤患者	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	1例患者
1680	2025-01-16	Harnessing Single-Cell and Spatial Transcriptomics for Crop Improvement 2024-Dec-11, Plants (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/plants13243476 PMID:39771174	综述	本文综述了单细胞和空间转录组技术在作物改良中的应用及其最新进展	结合单细胞和空间转录组技术，揭示了作物组织中细胞群体的异质性及其对环境刺激的响应，为作物遗传改良和育种策略提供了新的视角	未提及具体的技术局限或挑战	探讨单细胞和空间转录组技术在作物改良中的应用及其潜力	作物生物学中的细胞群体及其基因表达	作物科学	NA	单细胞转录组技术、空间转录组技术	NA	转录组数据	NA