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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1641 2025-10-07
Expansion effect of romiplostim on hematopoietic stem and progenitor cells versus thrombopoietin and eltrombopag
2024-Nov, International journal of hematology IF:1.7Q3
研究论文 比较罗米司亭与重组人血小板生成素和艾曲波帕对造血干细胞和祖细胞的体外扩增效果及分子机制 首次在单细胞水平揭示罗米司亭对最原始造血干细胞亚群中RHOA信号通路相关分子变化的特异性诱导作用 仅为体外研究,需要进一步体内实验验证 阐明罗米司亭与其他TPO受体激动剂的生物学效应差异 人CD34+造血干细胞和祖细胞 单细胞生物学 血液疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1642 2025-10-07
Gene expansions contributing to human brain evolution
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过分析完整的人类基因组序列,识别了与人类大脑进化相关的基因复制事件 首次利用完整端粒到端粒人类基因组序列(T2T-CHM13)系统识别人类特异性基因复制,并通过斑马鱼模型验证这些基因在大脑发育中的功能 研究主要关注基因复制事件,可能忽略了其他类型的基因组变异对大脑进化的贡献 探索人类大脑进化过程中基因复制事件的贡献 人类基因组序列、大脑转录组数据、斑马鱼模型 基因组学 NA 长读长DNA测序、单细胞RNA-seq、CRISPR基因编辑 NA 基因组序列、转录组数据、图像、行为数据 200个不同祖先背景的现代人类样本,多个斑马鱼模型 NA 单细胞RNA-seq, 长读长测序 NA NA
1643 2025-10-07
A multi-platform analysis of human gingival crevicular fluid reveals ferroptosis as a relevant regulated cell death mechanism during the clinical progression of periodontitis
2024-05-27, International journal of oral science IF:10.8Q1
研究论文 通过多平台分析揭示铁死亡在牙周炎临床进展中的重要作用 首次在牙周炎患者中发现与铁死亡相关的蛋白质和生物学过程 样本量较小(16名患者),观察时间有限(12周) 研究铁死亡在牙周炎进展中的作用机制 牙周炎患者的龈沟液和牙龈组织 生物信息学 牙周炎 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、Western blot、生物信息学分析 NA 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 16名牙周炎诊断患者,12周临床监测 NA 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 NA 使用公共单细胞RNA测序数据集GSE164241
1644 2025-10-07
Machine learning and deep learning to identifying subarachnoid haemorrhage macrophage-associated biomarkers by bulk and single-cell sequencing
2024-05, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞和批量转录组测序分析蛛网膜下腔出血大鼠模型中的巨噬细胞亚群,并开发诊断模型识别关键生物标志物 结合单细胞测序和批量RNA测序识别SAH特异性巨噬细胞亚群,并开发基于机器学习和卷积神经网络的诊断模型 需要进一步的实验和临床研究来验证研究结果并探索治疗靶点的临床意义 识别蛛网膜下腔出血巨噬细胞相关生物标志物以改进诊断和治疗策略 蛛网膜下腔出血大鼠模型的脑组织样本 机器学习, 深度学习 蛛网膜下腔出血 单细胞转录组测序, 批量RNA测序 卷积神经网络, 机器学习算法 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1645 2025-10-07
Transcriptomic and spatial dissection of human ex vivo right atrial tissue reveals proinflammatory microvascular changes in ischemic heart disease
2024-May-21, Cell reports. Medicine
研究论文 通过单核RNA测序和空间转录组学分析人类离体右心房组织,揭示缺血性心脏病中促炎性微血管变化 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术系统分析人类右心房组织在心血管疾病中的基因表达变化 研究样本为离体组织,可能无法完全反映体内真实情况;对照组为接受预防性手术的瓣膜病患者 揭示缺血性心脏病和心力衰竭中右心房组织的分子和细胞变化机制 人类离体右心房组织和心包液 空间转录组学 心血管疾病 单核RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 未明确样本数量(使用瓣膜病患者作为对照组) NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1646 2025-10-07
Single-cell analysis revealed a potential role of T-cell exhaustion in colorectal cancer with liver metastasis
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 通过单细胞分析揭示T细胞耗竭在结直肠癌肝转移中的潜在作用 首次通过单细胞测序技术系统分析结直肠癌肝转移中T细胞耗竭的作用机制,发现CEACAM5和ADGRE5-CD55在Tex与Treg-上皮细胞相互作用中的关键角色 研究基于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明 探究T细胞耗竭在结直肠癌肝转移过程中的作用机制 结直肠癌肝转移患者的单细胞测序数据 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 Seurat聚类分析,伪时间分析,ssGSEA 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1647 2025-10-07
Integrated analysis highlights the significance role of ITGAL in lung adenocarcinoma
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过整合分析揭示了ITGAL在肺腺癌中的预后价值和抑制肿瘤恶性进展的作用 首次系统阐明ITGAL在肺腺癌中的预后价值及其通过调控NK细胞因子影响肿瘤微环境的机制 研究主要基于TCGA数据库和体外实验,缺乏大规模临床样本验证 探究ITGAL在肺腺癌中的生物学功能和临床意义 肺腺癌患者和肿瘤细胞 生物信息学 肺腺癌 单细胞测序,3D Matrigel培养,BrdU ELISA,伤口愈合迁移实验,细胞粘附实验 NA 基因表达数据,临床预后数据,单细胞测序数据 TCGA数据库中的肺腺癌样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1648 2025-10-07
Detecting early-warning biomarkers associated with heart-exosome genetic-signature for acute myocardial infarction: A source-tracking study of exosome
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过溯源分析血浆外泌体,检测与心脏外泌体遗传特征相关的急性心肌梗死早期预警生物标志物 首次通过去卷积算法实现血浆外泌体溯源分析,识别出三个与心脏外泌体遗传特征相关的急性心肌梗死早期预警生物标志物 仅分析了血浆总外泌体中的心脏来源部分,未完全排除其他器官外泌体的干扰 检测与心脏外泌体遗传特征相关的急性心肌梗死早期预警生物标志物 急性心肌梗死患者的血浆外泌体 生物信息学 心血管疾病 单细胞测序, 去卷积算法, 加权基因共表达网络, 机器学习 机器学习 基因表达数据 住院患者队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1649 2025-10-07
Identification of PPAR-related differentially expressed genes liver hepatocellular carcinoma and construction of a prognostic model based on data analysis and molecular docking
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析肝细胞癌中PPAR相关基因表达,构建预后模型并筛选潜在治疗药物 首次在单细胞水平分析肝细胞癌中PPAR相关基因表达特征,构建基于8个PPAR相关基因的预后模型,并通过分子对接筛选潜在治疗药物 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 探索肝细胞癌发展的分子机制并识别潜在治疗靶点 肝细胞癌组织样本和细胞系 生物信息学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,分子对接,伤口愈合实验 LASSO-Cox回归模型,ConsensusCluster分析 基因表达数据 TCGA-LIHC、ICGC-LIRI和GSE14520数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1650 2025-10-07
Integrative analysis unveils ECM signatures and pathways driving hepatocellular carcinoma progression: A multi-omics approach and prognostic model development
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过多组学方法揭示细胞外基质在肝细胞癌进展中的特征和作用机制,并开发了基于ECM的预后模型 整合单细胞转录组分析和多组学数据,系统揭示ECM在LIHC免疫浸润和预后分层中的新作用,并构建了有效的ECM预后模型 样本量相对有限(10个LIHC样本),需要在更大队列中进一步验证 探索细胞外基质在肝细胞癌进展中的作用机制并开发预后预测模型 肝细胞癌患者样本、肝癌细胞系 生物信息学 肝癌 单细胞RNA测序, Western blotting, 侵袭实验, Transwell实验 Lasso回归 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 10个LIHC样本(单细胞数据), TCGA-LIHC队列, CheckMate研究独立队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1651 2025-10-07
Integration of single-cell and RNA-seq data to explore the role of focal adhesion-related genes in osteoporosis
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 通过整合单细胞和RNA测序数据探索黏着斑相关基因在骨质疏松症中的作用 首次通过整合单细胞RNA测序和RNA测序数据识别出与骨质疏松相关的两个关键基因FAM129A和RNF24 研究样本量有限,仅基于GSE56815和GSE56116两个队列数据 挖掘与黏着斑相关的枢纽基因并研究其在骨质疏松症中的作用 骨质疏松症患者样本、小鼠模型、人类血液样本 生物信息学 骨质疏松症 单细胞RNA测序,RNA测序 NA 基因表达数据 两个基因表达数据集(GSE56815和GSE56116) NA 单细胞RNA测序,RNA测序 NA NA
1652 2025-10-07
Histone modification-linked prognostic model for ovarian cancer reveals LBX2 as a novel growth promoter
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究构建了基于组蛋白修饰相关基因的卵巢癌预后模型,并发现LBX2作为新的生长促进因子 首次将组蛋白修饰相关基因与卵巢癌预后关联,并鉴定LBX2为新的卵巢癌增殖促进因子 研究基于回顾性数据,需要进一步实验验证 探索组蛋白修饰相关基因在卵巢癌预后预测中的作用 卵巢癌患者 生物信息学 卵巢癌 RNA-Seq, 单细胞RNA测序 Lasso回归 转录组数据 多个队列的卵巢癌患者数据 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
1653 2025-10-07
Prognostic and immunotherapeutic potential of regulatory T cell-associated signature in ovarian cancer
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序识别Treg相关生物标志物,开发了卵巢癌预后模型并评估其免疫治疗潜力 首次结合单细胞RNA测序和机器学习算法构建Treg相关特征评分,用于卵巢癌预后预测和免疫治疗反应评估 需要进一步的外部验证和临床转化研究 探索调节性T细胞相关基因在卵巢癌中的预后价值和免疫治疗潜力 卵巢癌患者 生物信息学 卵巢癌 单细胞RNA测序, 机器学习 随机生存森林(RSF), LASSO 基因表达数据 未明确指定样本数量,但识别了365个Treg相关基因 NA single-cell RNA-seq NA NA
1654 2025-10-07
Construction of a prognostic model with CAFs for predicting the prognosis and immunotherapeutic response of lung squamous cell carcinoma
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究构建了基于癌症相关成纤维细胞(CAFs)的预后模型,用于预测肺鳞状细胞癌(LUSC)的预后和免疫治疗反应 首次在LUSC中系统分类CAFs亚型并构建包含9个CAF相关基因的预后特征模型 CAFs在LUSC中的功能复杂且不确定,需要进一步验证 开发预测LUSC预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 肺鳞状细胞癌患者和癌症相关成纤维细胞 生物信息学 肺癌 单细胞RNA测序, 单变量Cox分析, 多变量Cox分析, ssGSEA, Kaplan-Meier分析 Cox比例风险模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1655 2025-10-07
Synthetic control removes spurious discoveries from double dipping in single-cell and spatial transcriptomics data analyses
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种名为ClusterDE的统计方法,用于识别单细胞和空间转录组数据分析中可靠的细胞类型和空间域标记基因 通过生成合成零数据作为阴性对照,有效控制假发现率并消除因双重检验导致的虚假发现 NA 解决单细胞和空间转录组数据分析中的双重检验问题,识别可靠的差异表达基因 单细胞转录组数据和空间转录组数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 统计方法 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1656 2025-04-10
scRNA-Seq reveals age-dependent microglial evolution as a determinant of immune response following spinal cord injury
2024-12, Brain research bulletin IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脊髓损伤后不同年龄组小胶质细胞的亚型及其功能差异 首次系统性地鉴定了脊髓损伤后年龄依赖性小胶质细胞亚型演化及其免疫功能差异 研究主要基于生物信息学分析,动物模型验证样本量有限 探究年龄因素如何通过小胶质细胞亚型影响脊髓损伤后的免疫反应 脊髓损伤后的小胶质细胞 生物信息学 脊髓损伤 scRNA-seq, 免疫荧光染色 伪时间轨迹分析, CellChat细胞通讯分析 基因表达数据 整合GEO数据库中多个数据集的小鼠模型样本 NA NA NA NA
1657 2025-04-10
Investigating the mechanisms of inflammation and immune alterations in Parkinson's disease using spatial transcriptomics techniques
2024-10-15, Brain research bulletin IF:3.5Q2
研究论文 本研究利用空间转录组学技术探究帕金森病中炎症和免疫改变的机制 首次在MPTP诱导的帕金森病小鼠模型中应用空间转录组学技术,揭示了中脑黑质区域的病理变化与铁死亡之间的关联 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证 探究帕金森病中炎症和免疫改变的分子机制 MPTP诱导的帕金森病小鼠模型 空间转录组学 帕金森病 空间转录组测序 MPTP诱导的小鼠模型 转录组数据 未明确说明样本数量 NA NA NA NA
1658 2025-04-10
Deciphering brain cellular and behavioral mechanisms: Insights from single-cell and spatial RNA sequencing
2024 Jul-Aug, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
综述 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在脑研究中的应用及其潜在问题和挑战 深入探讨了单细胞和空间RNA测序与神经科学多个方向的整合潜力,包括神经发育、新型脑微结构识别等 未具体说明数据处理中的具体技术限制或样本量限制 理解单个细胞或细胞类型在特定脑功能中的作用 脑细胞及其在脑功能中的作用 神经科学 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据 NA NA NA NA NA
1659 2025-10-07
Mucosal Single-Cell Profiling of Crohn's-Like Disease of the Pouch Reveals Unique Pathogenesis and Therapeutic Targets
2024-Dec, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 通过单细胞分析技术研究克罗恩样储袋病(CDP)的黏膜细胞特征,揭示其独特发病机制和潜在治疗靶点 首次在单细胞水平系统描绘CDP的细胞图谱,发现内质网应激在免疫和非免疫细胞中普遍增强的独特特征 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 探究克罗恩样储袋病(CDP)的病理生理机制和潜在治疗靶点 接受回肠储袋肛管吻合术患者的黏膜组织样本 数字病理学 炎症性肠病 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 50例患者 NA 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 NA NA
1660 2025-10-07
Novel Perspective on Sevoflurane-Induced Cognitive Dysfunction: Implications of Neuronal SIRPα and Microglial Synaptic Remodeling
2024-12-18, ACS chemical neuroscience IF:4.1Q2
研究论文 本研究探讨神经元SIRPα和小胶质细胞突触重塑在七氟醚诱导新生小鼠认知功能障碍中的作用 首次揭示神经元SIRPα通过调控小胶质细胞功能改善七氟醚诱导的认知障碍,并发现IRF8与SIRPα表达的相关性 研究仅针对新生小鼠,未验证其他年龄阶段;转录组分析显示皮质小胶质细胞和神经元无显著变化 阐明七氟醚诱导认知功能障碍的分子机制 新生小鼠 神经科学 认知功能障碍 单细胞转录组测序, 慢病毒过表达, SCENIC分析 NA 基因表达数据, 行为学数据 新生小鼠皮质细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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