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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2025-10-07 |
iIMPACT: integrating image and molecular profiles for spatial transcriptomics analysis
2024-06-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03289-5
PMID:38844966
|
研究论文 | 开发了一种整合组织图像和分子谱的多阶段统计方法iIMPACT,用于空间转录组学数据分析 | 首次将AI重建的组织图像与基因表达空间背景相结合定义空间区域,克服了现有方法仅依赖分子信息的局限 | NA | 提高空间转录组学数据聚类分析的准确性和可解释性 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | 多阶段统计方法 | 组织图像、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1622 | 2025-10-07 |
Clearance of VWF by hepatic macrophages is critical for the protective effect of ADAMTS13 in sickle cell anemia mice
2024-03-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021583
PMID:38142410
|
研究论文 | 本研究揭示了肝巨噬细胞通过清除ADAMTS13切割的VWF在镰状细胞贫血中的保护作用机制 | 首次发现Clec4f+Marcohigh巨噬细胞亚群以去唾液酸化依赖方式清除VWF,并证明巨噬细胞介导的VWF清除对ADAMTS13保护效应至关重要 | 研究仅在镰状细胞贫血小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证 | 阐明肝巨噬细胞在镰状细胞贫血病理机制中的作用及ADAMTS13的保护机制 | 镰状细胞贫血小鼠模型及其肝巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 镰状细胞贫血 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重错误鲁棒荧光原位杂交 | NA | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | 镰状细胞贫血小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1623 | 2025-10-07 |
IKKε-deficient macrophages impede cardiac repair after myocardial infarction by enhancing the macrophage-myofibroblast transition
2024-Sep, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01304-0
PMID:39261656
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和磷酸化蛋白阵列技术,揭示了IKKε缺失通过增强巨噬细胞-肌成纤维细胞转化导致心肌梗死后心脏修复障碍的机制 | 首次发现IKKε-p38轴通过调控巨噬细胞-肌成纤维细胞转化影响心肌梗死后的心脏修复过程 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究IKKε在心肌梗死后炎症反应和心脏修复中的调控作用 | 心肌梗死小鼠模型中的心脏巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白阵列 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | IKKε敲除小鼠和野生型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1624 | 2025-10-07 |
FGF receptors mediate cellular senescence in the cystic fibrosis airway epithelium
2024-Jun-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174888
PMID:38916962
|
研究论文 | 本研究揭示了FGF受体通过MAPK p38信号通路介导囊性纤维化气道上皮细胞衰老的机制 | 首次发现FGFR4和FGFR1在CF气道上皮细胞衰老中的关键作用,并证明抑制FGFR可改善黏液纤毛清除功能 | 研究主要基于体外和动物模型,需要进一步临床验证 | 探究囊性纤维化气道上皮细胞衰老的分子机制及潜在治疗策略 | 非CF和CF供体的人原代支气管上皮细胞、CF支气管上皮细胞系、Cftr基因敲除大鼠 | 单细胞测序 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 非CF和CF供体的人原代支气管上皮细胞、CF细胞系、Cftr-/-大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1625 | 2025-10-07 |
B-cell depletion limits HTLV-1-infected T-cell expansion and ameliorate HTLV-1-associated myelopathy
2024-Oct, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.52190
PMID:39186315
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和临床试验证明B细胞耗竭可限制HTLV-1感染T细胞的扩增并改善HTLV-1相关脊髓病 | 首次提出通过靶向B细胞治疗HAM的创新策略,揭示了HTLV-1感染B细胞并促进T细胞增殖的新机制 | 样本量有限(14例临床试验患者),需要更大规模研究验证疗效 | 探索HAM的发病机制并评估利妥昔单抗治疗HAM患者的疗效 | HTLV-1相关脊髓病患者的外周血单个核细胞和临床病例 | 单细胞测序分析 | HTLV-1相关脊髓病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 14例HAM患者参与临床试验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1626 | 2025-10-07 |
An initial game-theoretic assessment of enhanced tissue preparation and imaging protocols for improved deep learning inference of spatial transcriptomics from tissue morphology
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae476
PMID:39367648
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研究论文 | 本研究通过改进组织制备和成像方案,评估其对基于深度学习的空间转录组学形态学推断性能的影响 | 首次从博弈论角度评估组织处理标准化对空间转录组学深度学习模型性能的边际效益 | 研究样本量有限(仅13例结直肠癌患者),需要更大规模验证 | 探索优化组织制备和成像方案对空间转录组学形态学推断模型性能的提升效果 | 13例病理T分期III期结直肠癌患者组织样本 | 数字病理 | 结直肠癌 | 空间转录组学,深度学习 | Inceptionv3 | 全切片图像 | 13例结直肠癌患者 | 10x Genomics, Leica | 空间转录组学 | Visium CytAssist, Leica Bond | Visium CytAssist检测,自动化苏木精-伊红染色,40×分辨率成像 |
| 1627 | 2025-10-07 |
An integrated single-cell reference atlas of the human endometrium
2024-Sep, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01873-w
PMID:39198675
|
研究论文 | 构建了一个高分辨率的人类子宫内膜单细胞参考图谱,整合了63位女性的单细胞转录组数据 | 首次创建了人类子宫内膜细胞图谱(HECA),识别了先前未报告的细胞类型,并通过空间转录组学进行原位定位验证 | 样本数量相对有限(63位女性),需要进一步扩大样本规模验证发现 | 建立人类子宫内膜的高分辨率单细胞参考图谱,研究子宫内膜生理和疾病机制 | 人类子宫内膜组织,包括患有和未患有子宫内膜异位症的女性 | 单细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 313,527个细胞(单细胞数据集),312,246个细胞核(单核数据集),来自63位捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,单核RNA-seq | NA | NA |
| 1628 | 2025-10-07 |
scDAPP: a comprehensive single-cell transcriptomics analysis pipeline optimized for cross-group comparison
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae134
PMID:39345754
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研究论文 | 开发了一个针对跨组比较优化的单细胞转录组学综合分析流程scDAPP | 首个专门针对跨组比较设计的自动化单细胞转录组分析流程,采用数据学习参数进行预处理并使用经过基准测试的软件 | NA | 开发标准化、自动化的单细胞转录组数据分析流程以解决跨组比较的复杂需求 | 单细胞或单核转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1629 | 2025-10-07 |
Molecular and network disruptions in neurodevelopment uncovered by single cell transcriptomics analysis of CHD8 heterozygous cerebral organoids
2024-Jul-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34862
PMID:39149047
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析CHD8杂合脑类器官,揭示神经发育过程中的分子和网络紊乱 | 首次在脑类器官模型中系统研究CHD8单倍体不足对早期神经发育的影响,发现细胞组成变化和细胞间通讯紊乱 | 研究基于体外脑类器官模型,可能与体内真实神经发育存在差异 | 研究CHD8基因在神经和大脑发育中的分子和细胞功能,并探索其与自闭症谱系障碍临床表现的关联 | CHD8杂合敲除的脑类器官及其同基因对照 | 单细胞转录组学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑 | 脑类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1630 | 2025-10-07 |
Bacterial phenotypic heterogeneity through the lens of single-cell RNA sequencing
2024 Feb-Apr, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2024.2334110
PMID:38532542
|
综述 | 探讨单细胞RNA测序在细菌表型异质性研究中的应用与前景 | 首次系统阐述单细胞转录组学在微生物群体表型异质性研究中的创新应用 | 作为综述文章未涉及原始实验数据 | 解析细菌转录异质性及其生态学意义 | 微生物群体和细菌细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1631 | 2025-10-07 |
Arctiin alleviates knee osteoarthritis by suppressing chondrocyte oxidative stress induced by accumulated iron via AKT/NRF2/HO-1 signaling pathway
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83383-7
PMID:39738432
|
研究论文 | 本研究探讨牛蒡苷通过AKT/NRF2/HO-1信号通路减轻铁过载诱导的软骨细胞氧化应激,从而缓解膝骨关节炎 | 首次揭示牛蒡苷通过调节铁代谢和激活AKT/NRF2/HO-1通路同时抑制软骨细胞凋亡和铁死亡的双重保护机制 | 未明确牛蒡苷的具体分子靶点及其在人体中的安全有效性 | 探究牛蒡苷对铁过载所致膝骨关节炎的治疗作用及分子机制 | 膝骨关节炎患者的软骨细胞及疾病模型 | 分子生物学 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序, CCK-8检测, 流式细胞术, 荧光检测, Q-RTPCR, Western Blotting, 显微CT, 组织染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白表达数据, 影像数据, 组织学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1632 | 2025-10-07 |
Integrated analyses of Mendelian randomization, eQTL, and single-cell transcriptome identify CCN3 as a potential biomarker in aortic dissection
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83611-0
PMID:39738466
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化、eQTL和单细胞转录组分析,鉴定CCN3作为主动脉夹层的潜在生物标志物 | 首次结合多种分析方法系统筛选主动脉夹层相关血浆分泌蛋白,发现CCN3在mRNA和血浆水平均下调并可能具有保护作用 | 当前AD与血浆蛋白水平相关性研究稀缺且缺乏特异性,样本量有限 | 探索血浆分泌蛋白作为主动脉夹层的潜在生物标志物 | 主动脉夹层患者与正常个体的基因表达和血浆蛋白水平 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究,eQTL分析,单细胞转录组测序,qPCR,酶联免疫吸附试验 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据,蛋白质数据 | 三个GEO数据集的患者样本和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1633 | 2025-10-07 |
Claudin 7 suppresses invasion and metastasis through repression of a smooth muscle actin program
2024-Dec-02, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202311002
PMID:39320351
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研究论文 | 本研究揭示了紧密连接蛋白Claudin 7通过抑制平滑肌肌动蛋白相关基因表达来抑制乳腺癌侵袭和转移的机制 | 首次通过功能遗传学方法在鼠源乳腺癌类器官模型中证实Cldn7对侵袭转移的抑制作用,并发现其通过调控SMA相关基因和间充质表型实现这一功能 | 研究主要基于动物模型和细胞系,人类临床样本验证相对有限 | 探究Claudin 7在乳腺癌转移过程中的作用机制 | 鼠源乳腺癌类器官、人类乳腺癌细胞系、新鲜人类肿瘤组织 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 功能遗传学、转录组分析、RNA-seq | NA | 基因表达数据、RNA-seq数据 | 鼠源乳腺癌类器官模型、人类细胞系、人类肿瘤组织样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1634 | 2025-10-07 |
Different gene expression patterns between mouse and human brain pericytes revealed by single-cell/nucleus RNA sequencing
2024-12, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2024.107434
PMID:39423955
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研究论文 | 通过单细胞/核RNA测序比较小鼠和人类大脑周细胞基因表达模式的异同 | 首次系统比较小鼠和人类大脑周细胞的转录组差异,识别物种特异性基因表达模式 | 仅分析成年大脑周细胞,未涵盖发育阶段或其他脑区 | 研究小鼠和人类大脑周细胞基因表达的相似性和差异性 | 小鼠和人类成年大脑周细胞 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四个小鼠和人类大脑周细胞单细胞/核RNA测序数据集 | 10x Genomics,其他 | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium,Smart-seq | 10x单细胞RNA测序平台和Smart-seq单细胞RNA测序平台 |
| 1635 | 2025-10-07 |
Base editing screens define the genetic landscape of cancer drug resistance mechanisms
2024-Nov, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01948-8
PMID:39424923
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研究论文 | 通过CRISPR碱基编辑筛选系统鉴定癌症药物耐药机制的遗传基础 | 前瞻性利用CRISPR碱基编辑技术构建包含32,476种变异的筛选文库,系统绘制癌症药物耐药性变异功能图谱 | 研究仅在四种癌细胞系中进行,未涵盖所有癌症类型和体内微环境 | 系统鉴定癌症药物耐药性的遗传机制并探索克服策略 | 四种癌细胞系中的11个癌症基因变异 | 功能基因组学 | 肺癌 | CRISPR碱基编辑, 单细胞转录组测序 | CRISPR筛选 | 基因组编辑数据, 单细胞RNA测序数据 | 四种癌症细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1636 | 2025-10-07 |
Characterization of a novel mitophagy-related 5-genes signature for diagnosis of acute myocardial infarction
2024-09, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2024.107417
PMID:39159737
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研究论文 | 本研究开发了一个基于5个线粒体自噬相关基因的诊断标志物,用于急性心肌梗死的诊断 | 首次基于线粒体自噬相关基因表达将心肌梗死患者分为三个亚群,并建立了5基因诊断标志物 | 研究样本量未明确说明,需要进一步验证 | 开发心肌梗死的诊断标志物 | 心肌梗死患者的心脏组织和外周血样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,支持向量机-递归特征消除,随机森林 | SVM-RFE,随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1637 | 2025-10-07 |
BAG6 restricts pancreatic cancer progression by suppressing the release of IL33-presenting extracellular vesicles and the activation of mast cells
2024-Aug, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01195-1
PMID:38942797
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研究论文 | 本研究揭示BAG6通过抑制携带IL33的细胞外囊泡释放和肥大细胞激活来限制胰腺癌进展的新机制 | 首次发现BAG6在胰腺癌中的肿瘤抑制作用,阐明其通过调控EVs释放和肥大细胞激活影响肿瘤微环境的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究BAG6在胰腺癌进展中的作用机制及其对肿瘤微环境的调控 | 胰腺导管腺癌(PDAC)小鼠模型、人类类器官和患者样本 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、Cre/loxP报告系统、类器官培养 | NA | 基因表达数据、蛋白质水平数据、单细胞转录组数据 | 小鼠PDAC模型、人类类器官和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1638 | 2025-10-07 |
Conditional deletion of miR-204 and miR-211 in murine retinal pigment epithelium results in retinal degeneration
2024-Jun, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107344
PMID:38705389
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研究论文 | 通过条件性敲除小鼠视网膜色素上皮中的miR-204和miR-211,研究其对视网膜结构和功能的影响 | 首次在成年小鼠中实现视网膜色素上皮特异性条件性敲除miR-204/211家族,并揭示其在维持视网膜功能中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 评估miR-204和miR-211在成熟小鼠眼睛中的功能作用 | 条件性敲除miR-204/211的小鼠视网膜色素上皮和视网膜组织 | 分子生物学 | 视网膜变性 | 条件性基因敲除,单细胞RNA测序,光学相干断层扫描,免疫染色 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,成像数据,组织学数据 | 两组条件性KO小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1639 | 2025-10-07 |
A revised conceptual framework for mouse vomeronasal pumping and stimulus sampling
2024-03-25, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2024.01.036
PMID:38320553
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研究论文 | 本研究通过多学科方法重新探讨小鼠犁鼻器刺激采样机制,提出修正的泵送概念框架 | 发现小鼠犁鼻器侧部主要由平滑肌组成,识别出两种具有不同特性和功能的平滑肌纤维亚型,揭示了新的刺激采样机制 | 研究主要聚焦于小鼠模型,结果向其他物种的普适性需要进一步验证 | 阐明犁鼻器的物理机械功能和刺激采样基本原理 | 小鼠犁鼻器组织 | 神经生物学 | NA | 单细胞转录组学、药理学分析、2D/3D断层扫描 | NA | 解剖学数据、组织学数据、生理学数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1640 | 2025-10-07 |
Development of a prognostic gene signature and exploration of P4HA1 in the modulation of cuproptosis in colorectal cancer
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82625-y
PMID:39738206
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研究论文 | 本研究开发了一个基于铜死亡相关基因的预后模型,并探索了P4HA1在结直肠癌铜死亡调控中的作用 | 首次构建了结直肠癌铜死亡相关基因的预后模型,并发现P4HA1作为关键基因调控铜死亡过程 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索铜死亡在结直肠癌中的作用并开发预后预测模型 | 结直肠癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组分析,WGCNA,LASSO回归,随机森林,单细胞测序,体外实验 | 预后预测模型 | 转录组数据,临床数据 | TCGA数据库结直肠癌患者数据及两个独立外部验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |