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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 1621 - 1640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2025-10-07 |
De novo detection of somatic variants in high-quality long-read single-cell RNA sequencing data
2024-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.06.583775
PMID:38496441
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研究论文 | 开发了名为LongSom的计算工作流程，利用高质量长读长单细胞RNA测序数据检测体细胞变异 | 无需正常样本即可检测体细胞变异，能够同时检测SNV、mtSNV、CNA和基因融合，并基于细胞突变谱重新注释细胞类型 | NA | 开发检测体细胞变异的方法以重建肿瘤克隆异质性 | 人类卵巢癌样本 | 计算生物学 | 卵巢癌 | 长读长单细胞RNA测序 | 计算工作流程 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1622 | 2025-10-07 |
ApoE ε4-dependent alteration of CXCR3 + CD127 + CD4 + T cells is associated with elevated plasma neurofilament light chain in Alzheimer's disease
2024-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.28.596276
PMID:38853824
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研究论文 | 本研究通过单细胞质谱流式技术揭示了阿尔茨海默病患者外周血中CXCR3+CD127+Th1细胞与神经丝轻链蛋白的负相关性，并发现这种关联受ApoE ε4基因型调控 | 首次发现外周免疫细胞CXCR3+CD127+Th1细胞与AD神经退行标志物NfL的ApoE ε4依赖性关联，并证实脑脊液中该细胞群的促炎能力增强 | 样本量有限，机制研究不够深入，需要进一步验证因果关系 | 探究阿尔茨海默病患者外周适应性免疫细胞组成与神经炎症的关联 | 阿尔茨海默病患者和健康对照者的外周血单核细胞和脑脊液样本 | 免疫学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞质谱流式技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 血浆蛋白浓度数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1623 | 2025-10-07 |
Genome-wide Cas9-mediated screening of essential non-coding regulatory elements via libraries of paired single-guide RNAs
2024-07, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-024-01204-8
PMID:38778183
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研究论文 | 开发了一种通过配对sgRNA文库进行Cas9介导的全基因组非编码调控元件功能筛选的方法 | 首次使用配对sgRNA文库系统性地删除全基因组非编码调控元件来研究其功能 | 研究仅限于K562、293T细胞系和人胚胎干细胞，尚未在更多细胞类型中验证 | 系统研究非编码调控元件的功能及其在生物学过程中的作用 | 人类基因组中的非编码调控元件 | 基因组学 | NA | CRISPR-Cas9筛选，单细胞测序 | NA | 基因组数据，测序数据 | K562细胞系、293T细胞系和人胚胎干细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1624 | 2025-10-07 |
Transcript and protein signatures derived from shared molecular interactions across cancers are associated with mortality
2024-05-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05268-7
PMID:38734658
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研究论文 | 通过分析多种实体癌中的共享细胞间相互作用，构建多细胞肿瘤模型并识别与死亡率相关的基因特征 | 首次构建跨癌种的共享多细胞肿瘤模型，并在mRNA和蛋白质水平验证基因特征与死亡率关联 | 研究仅涵盖五种实体癌，样本来源有限 | 识别跨癌种的共享细胞间相互作用及其与癌症死亡率的关系 | 乳腺癌、结肠癌、肝癌、肺癌和卵巢癌患者 | 生物信息学 | 多癌种 | 单细胞RNA测序，NicheNet分析，Cox比例风险模型 | 共享多细胞肿瘤模型 | 单细胞RNA测序数据，蛋白质组数据 | TCGA队列：9185个肿瘤样本和727个对照；UKBB队列：10384名癌症患者和5063个对照 | NA | 单细胞RNA-seq，蛋白质组学 | NA | NA |
| 1625 | 2025-10-07 |
Choline metabolism reprogramming mediates an immunosuppressive microenvironment in non-small cell lung cancer (NSCLC) by promoting tumor-associated macrophage functional polarization and endothelial cell proliferation
2024-05-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05242-3
PMID:38730286
|
研究论文 | 本研究探讨胆碱代谢通过调控肿瘤相关巨噬细胞功能和内皮细胞增殖重塑非小细胞肺癌免疫抑制微环境的机制 | 首次发现胆碱酯酶水平与免疫治疗预后的关联，并构建了胆碱代谢相关基因特征揭示其在免疫抑制微环境中的作用机制 | 研究为单中心回顾性分析，样本量有限，需要多中心前瞻性研究验证 | 探索胆碱代谢在非小细胞肺癌免疫治疗耐药中的作用机制 | 277例接受一线免疫治疗的晚期非小细胞肺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，Cox回归分析，Kaplan-Meier生存分析，功能富集分析 | 预后模型，列线图 | 临床数据，基因表达数据，单细胞测序数据 | 277例晚期NSCLC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1626 | 2025-10-07 |
Integrative analyses of bulk and single-cell transcriptomics reveals the infiltration and crosstalk of cancer-associated fibroblasts as a novel predictor for prognosis and microenvironment remodeling in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-05-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05238-z
PMID:38702814
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研究论文 | 本研究通过整合分析和单细胞转录组学揭示了癌症相关成纤维细胞在肝内胆管癌中的浸润特征及其与肿瘤细胞的相互作用 | 首次构建了CAFs浸润评分系统并揭示了成纤维细胞与肿瘤细胞通过多种信号通路相互作用的机制 | 研究结果需要进一步实验验证，样本量相对有限 | 探索肝内胆管癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的异质性及其与肿瘤细胞的相互作用 | 肝内胆管癌组织和癌旁正常组织 | 生物信息学 | 肝内胆管癌 | 加权基因共表达网络分析,单细胞转录组学分析,SCENIC分析 | WGCNA,回归分析 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | TCGA-CHOL队列,GSE89748队列和107,943队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1627 | 2025-10-07 |
De novo antibody discovery in human blood from full-length single B cell transcriptomics and matching haplotyped-resolved germline assemblies
2024-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.26.586834
PMID:38585716
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组测序和单倍型解析的种系基因组组装，从人血液中发现了新的抗体 | 首次将单倍型解析的种系免疫球蛋白位点组装与单B细胞全长转录组测序相结合，能够完全解析母源和父源对种系V、D、J基因库的贡献 | 研究仅针对麻疹、腮腺炎和风疹疫苗接种后的B细胞反应，样本来源和免疫挑战类型有限 | 理解种系免疫球蛋白单倍型如何影响表达的抗体库 | 人类B细胞及其表达的抗体 | 免疫基因组学 | 传染病 | 单细胞全长转录组测序, 基因组测序, 单倍型组装 | NA | 基因组序列, 转录组序列 | 来自同一供体的B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组测序 | NA | NA |
| 1628 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveal distinctive patterns of fibroblast activation in heart failure with preserved ejection fraction
2024-12, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-024-01074-w
PMID:39311911
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示射血分数保留型心衰中成纤维细胞激活的独特模式 | 首次在早期HFpEF模型中系统鉴定疾病特异性成纤维细胞表型，并发现血管生成素样4（ANGPTL4）的核心调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 解析HFpEF疾病进展中成纤维细胞的分子激活机制 | 小鼠心脏间质细胞（成纤维细胞和巨噬细胞）及人类心肌组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 小鼠HFpEF模型及两种HFrEF模型，人类心肌样本和血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1629 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome unveils unique transcriptomic signatures of human organ-specific endothelial cells
2024-12, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-024-01087-5
PMID:39508863
|
研究论文 | 构建了包含超过21万个来自24个人类组织38个区域的内皮细胞图谱，揭示了不同组织内皮细胞的转录组异质性 | 首次系统性描绘了人类组织特异性内皮细胞的转录组特征，发现了毛细血管内皮细胞的高度异质性和组织特异性衰老模式 | 研究主要基于转录组数据，可能未完全捕捉蛋白质水平和功能层面的异质性 | 探索人类不同组织中内皮细胞的异质性和转录组特征 | 人类24个组织38个区域的210,000多个内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 多种疾病（与不同组织内皮细胞相关） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | >210,000个内皮细胞，来自24个人类组织的38个区域 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1630 | 2025-10-07 |
Evaluating cell type deconvolution in FFPE breast tissue: application to benign breast disease
2024-09, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae098
PMID:40162103
|
研究论文 | 评估FFPE乳腺组织中细胞类型反卷积方法的性能，并开发用于良性乳腺疾病分析的R包 | 构建了乳腺组织单细胞RNA-seq参考数据，测试了多种反卷积方法在FFPE样本中的表现，发现深度学习方法的优越性 | FFPE伪影显著影响反卷积方法的准确性，RMSE误差范围在0.04-0.17之间 | 优化从FFPE样本中定义个体细胞类型组成的策略 | 良性乳腺疾病组织 | 生物信息学 | 乳腺疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 数字病理学 | 深度学习, 细胞类型反卷积方法 | 转录组数据, 图像数据 | 62个良性乳腺疾病RNA-seq样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1631 | 2025-10-07 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomes analyses reveals heterogeneity of serine-glycine-one-carbon metabolism with distinct prognoses and therapeutic vulnerabilities in HNSCC
2024-06-17, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00310-2
PMID:38886346
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析揭示头颈鳞状细胞癌中丝氨酸-甘氨酸-一碳代谢异质性及其与预后和治疗脆弱性的关联 | 首次在HNSCC中系统揭示SGOC代谢异质性，构建4-SGOC基因预后特征，并鉴定IMPDH1作为潜在代谢治疗靶点 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步实验验证代谢通路的直接功能 | 解析HNSCC代谢异质性以推进精准肿瘤治疗 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组分析，LASSO-COX回归分析 | 预后特征模型 | RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 1632 | 2025-10-07 |
Single cell analysis unveils B cell-dominated immune subtypes in HNSCC for enhanced prognostic and therapeutic stratification
2024-04-16, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00292-1
PMID:38622125
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示头颈鳞状细胞癌中B细胞主导的免疫亚型，用于改善预后和治疗分层 | 首次通过单细胞RNA测序系统分析头颈鳞癌中肿瘤浸润B细胞的基因表达模式，并建立基于B细胞活化的新型肿瘤分类系统 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证B细胞在免疫微环境中的具体作用机制 | 探索肿瘤浸润B细胞在头颈鳞癌免疫微环境中的作用及其对免疫治疗反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者样本和肿瘤浸润B细胞 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的头颈鳞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1633 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals cell atlas and identifies cycling tumor cells responsible for recurrence in ameloblastoma
2024-02-29, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00281-4
PMID:38424060
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示成釉细胞瘤的细胞图谱，并鉴定导致肿瘤复发的循环肿瘤细胞 | 首次在单细胞分辨率下揭示成釉细胞瘤的细胞景观，鉴定出具有干细胞特性的循环肿瘤细胞亚群及其EZH2介导的调控机制 | NA | 探究成釉细胞瘤肿瘤起始和复发的分子机制 | 成釉细胞瘤肿瘤细胞 | 数字病理学 | 成釉细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1634 | 2025-10-07 |
Tim4 deficiency reduces CD301b+ macrophage and aggravates periodontitis bone loss
2024-02-28, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-023-00270-z
PMID:38418808
|
研究论文 | 本研究探讨Tim4缺陷通过减少CD301b+巨噬细胞加剧牙周炎骨丢失的机制 | 首次揭示Tim4作为CD301b+巨噬细胞的上游调控因子，通过p38 MAPK信号通路调控其在牙周炎中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Tim4在牙周炎骨丢失中对CD301b+巨噬细胞的调控机制 | 小鼠牙周炎模型中的CD301b+巨噬细胞 | 免疫学 | 牙周炎 | 高通量RNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1635 | 2025-10-07 |
PRX1-positive mesenchymal stem cells drive molar morphogenesis
2024-02-19, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00277-0
PMID:38369512
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪揭示了PRX1阳性间充质干细胞通过Wnt5a信号调控磨牙形态发生的机制 | 首次发现PRX1阳性间充质细胞在磨牙形态发生中的关键作用，并阐明Wnt5a通过WNT信号通路调控细胞增殖的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究调控牙齿形态发生的关键因素和分子机制 | 小鼠磨牙发育过程中的间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 谱系追踪 | NA | 基因表达数据, 细胞谱系数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1636 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics reveals that metabolic characteristics define the tumor immunosuppression microenvironment via iCAF transformation in oral squamous cell carcinoma
2024-01-30, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-023-00267-8
PMID:38287007
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示了口腔鳞癌中代谢特征通过iCAF转化定义肿瘤免疫抑制微环境的机制 | 首次在口腔鳞癌中通过空间转录组学揭示了代谢区域与免疫微环境的关系，并发现了上皮细胞-iCAF-Tregs的协同作用轴 | NA | 阐明口腔鳞癌中不同代谢区域与肿瘤免疫微环境的关系 | 口腔鳞癌组织 | 空间转录组学 | 口腔鳞癌 | 单细胞测序, 空间转录组测序 | SPOTlight反卷积, k-means聚类, CellPhoneDB, NicheNet | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1637 | 2025-10-07 |
O-GlcNAcylation of circadian clock protein Bmal1 impairs cognitive function in diabetic mice
2024-Nov, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00263-6
PMID:39375536
|
研究论文 | 本研究揭示了高血糖通过O-GlcNAc糖基化修饰生物钟蛋白Bmal1导致糖尿病小鼠认知功能障碍的分子机制 | 首次发现Bmal1的O-GlcNAc糖基化修饰在糖尿病认知功能障碍中的关键作用，并开发了特异性阻断该修饰的短肽治疗方法 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 阐明糖尿病相关认知功能障碍的分子机制 | 糖尿病小鼠的海马神经元 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1638 | 2025-10-07 |
Accurate and Flexible Single Cell to Spatial Transcriptome Mapping with Celloc
2024-Oct, Small science
IF:11.1Q1
DOI:10.1002/smsc.202400139
PMID:40212250
|
研究论文 | 开发了一种名为Celloc的新方法，用于实现单细胞RNA测序与空间转录组数据之间的精确映射 | 结合图注意力自编码器和综合损失函数，实现灵活的单细胞到空间位点映射，既能解析每个位点内的细胞组成，也能为scRNA-seq数据中的每个细胞分配空间位置 | NA | 解决单细胞RNA测序数据缺乏空间信息和空间转录组数据分辨率有限的问题 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | 图注意力自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 1639 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals VEGFR as a potential target for CAR-T cell therapy in chordoma
2024-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02635-5
PMID:38605247
|
研究论文 | 通过单细胞测序鉴定VEGFR作为脊索瘤CAR-T细胞治疗的潜在靶点 | 首次在脊索瘤中通过单细胞测序鉴定VEGFR作为CAR-T治疗靶点，并开发了同时靶向VEGFR和TGF-β的双功能CAR-T细胞 | 样本量较小（14例），仅进行了体外实验验证 | 寻找脊索瘤免疫治疗新靶点并开发有效CAR-T疗法 | 脊索瘤患者肿瘤样本和CAR-T细胞 | 单细胞测序 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序，CAR-T细胞技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 14例脊索瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1640 | 2025-10-07 |
Understanding the heterogeneity of natural killer cells at the maternal-fetal interface: implications for pregnancy health and disease
2024-Nov-14, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaae040
PMID:39570646
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综述 | 本文系统回顾了母胎界面自然杀伤细胞的异质性研究及其与妊娠健康的关系 | 整合了基于表面标志物、功能分子和单细胞RNA测序的NK细胞分类方法，并总结了dNK细胞分化途径 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证 | 探讨母胎界面NK细胞异质性及其在妊娠相关疾病中的作用 | 子宫NK细胞亚群和蜕膜NK细胞 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |