单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7855 篇文献，本页显示第 1601 - 1620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1601 | 2024-11-20 |
Single-cell landscape of peripheral immune response in patients with anti-melanoma differentiation-associated gene 5 dermatomyositis
2024-08-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/kead597
PMID:37941459
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析了抗黑色素瘤分化相关基因5阳性皮肌炎患者的外周免疫反应 | 首次在抗黑色素瘤分化相关基因5阳性皮肌炎样本中鉴定出高度表达IFN alpha诱导蛋白27和IFN诱导螺旋酶C域1的独特CD14+单核细胞亚群 | 样本量较小，仅包括8名患者和6名健康对照 | 探讨抗黑色素瘤分化相关基因5阳性皮肌炎的免疫景观及其潜在的病毒感染起源 | 抗黑色素瘤分化相关基因5阳性皮肌炎患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 皮肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8名抗黑色素瘤分化相关基因5阳性皮肌炎患者和6名健康对照 |
| 1602 | 2024-11-20 |
Comprehensive analysis of the endothelin system in the kidneys of mice, rats, and humans
2024-07-31, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20240768
PMID:38904098
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和免疫定位分析了人类、大鼠和小鼠肾脏中内皮素系统的表达 | 结合单细胞RNA测序数据和免疫定位技术，全面分析了人类、大鼠和小鼠肾脏中内皮素系统的表达，并发现了性别和物种间的差异 | 商业化抗体在所有物种中并不都有效，RNA表达与蛋白质水平并不总是相关，需要多种方法来确保研究的严谨性和可重复性 | 研究肾脏内皮素系统的表达及其在不同物种和性别中的差异 | 人类、大鼠和小鼠的肾脏 | NA | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类、大鼠和小鼠的肾脏样本 |
| 1603 | 2024-11-20 |
Development of a Spectral Flow Cytometry Analysis Pipeline for High-Dimensional Immune Cell Characterization
2024-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.19.599633
PMID:38948780
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研究论文 | 本文开发了一种用于高维免疫细胞表征的光谱流式细胞术分析管道 | 引入了一种新的分析管道，改进了光谱流式细胞术数据的分析，并将其应用于识别衰老中的稀有T细胞群体 | NA | 开发和验证一种用于高维免疫细胞表征的光谱流式细胞术分析方法 | 年轻和老年雌性小鼠的脾细胞中的T细胞群体 | 生物信息学 | NA | 光谱流式细胞术 | NA | 细胞数据 | 11个脾脏中的3,776,804个T细胞 |
| 1604 | 2024-11-20 |
Sex differences and immune correlates of Long COVID development, persistence, and resolution
2024-Jun-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.18.599612
PMID:38948732
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研究论文 | 研究探讨了性别差异对长新冠（Long COVID）发展和持续的影响，并分析了相关的免疫机制 | 首次系统地研究了性别特异性免疫失调在长新冠发病机制中的作用，并发现了与长新冠相关的多个免疫途径 | 样本量较小，仅包括45名患者，可能限制了结果的普适性 | 探讨性别差异对长新冠发展和持续的影响及其免疫机制 | 急性SARS-CoV-2感染和感染后3个月及12个月的血液样本 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学、单细胞蛋白质组学和血浆蛋白质组学 | NA | 血液样本 | 45名患者 |
| 1605 | 2024-11-20 |
Bidirectional epigenetic editing reveals hierarchies in gene regulation
2024-May-17, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02213-3
PMID:38760566
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研究论文 | 本研究开发了一种双向表观遗传编辑系统CRISPRai，结合CRISPRa和CRISPRi技术，用于同时激活和抑制两个基因位点，并通过Perturb-seq技术研究基因间的相互作用 | 开发了CRISPRai系统，能够同时进行激活和抑制编辑，结合单细胞RNA测序技术，揭示了基因调控的新层次 | NA | 研究基因调控的层次结构和基因间的相互作用 | 血液形成系转录因子SPI1和GATA1以及IL2基因的调控机制 | 基因编辑 | NA | CRISPRa, CRISPRi, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Jurkat T细胞、原代T细胞和嵌合抗原受体(CAR) T细胞 |
| 1606 | 2024-11-20 |
Endovascular biopsy in neurointerventional surgery: A systematic review
2024-Mar-22, Interventional neuroradiology : journal of peritherapeutic neuroradiology, surgical procedures and related neurosciences
IF:1.5Q3
DOI:10.1177/15910199241240508
PMID:38515364
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综述 | 本文系统综述了神经介入手术中血管内活检的应用 | 介绍了血管内活检在获取内皮细胞生物信息方面的潜力 | 研究样本量有限，难以识别与动脉瘤生长或破裂相关的特征基因 | 总结血管内活检在神经介入手术中的文献 | 内皮细胞及其在脑血管疾病中的分子异常 | NA | 脑血管疾病 | 荧光激活细胞分选（FACS）、单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 9项研究，使用各种血管内设备收集内皮细胞 |
| 1607 | 2024-11-20 |
Interpretable Spatial Gradient Analysis for Spatial Transcriptomics Data
2024-Mar-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.19.585725
PMID:38562886
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研究论文 | 本文介绍了一种名为LSGI的计算框架，用于从空间转录组数据中系统地识别具有显著可解释空间转录组梯度的空间位置 | LSGI通过非负矩阵分解（NMF）结合线性回归的方法，对滑动窗口进行详细分析，能够识别空间上接近但方向相反的信号通路梯度 | NA | 开发一种能够从空间转录组数据中识别和解释空间转录组梯度的计算框架 | 空间转录组数据中的空间转录组梯度 | 生物信息学 | 脑肿瘤 | 非负矩阵分解（NMF），线性回归 | NA | 空间转录组数据 | 87个肿瘤空间转录组数据集 |
| 1608 | 2024-11-20 |
Single-cell Transcriptome Analysis Identifies Senescent Osteocytes as Contributors to Bone Destruction in Breast Cancer Metastasis
2024-Mar-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4047486/v1
PMID:38558984
|
研究论文 | 研究揭示了乳腺癌骨转移中衰老的成骨细胞对骨破坏的贡献 | 首次证明乳腺癌骨转移中的成骨细胞会提前衰老并表现出衰老相关分泌表型，促进骨破坏 | NA | 探讨乳腺癌骨转移中成骨细胞的病理重编程及其对骨破坏的影响 | 乳腺癌骨转移中的成骨细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和乳腺癌患者的成骨细胞样本 |
| 1609 | 2024-11-20 |
Spatially Resolved Transcriptomic Signatures of Hippocampal Subregions and Arc-Expressing Ensembles in Active Place Avoidance Memory
2024-Feb-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.30.573225
PMID:38260257
|
研究论文 | 研究通过bulk RNA测序和空间转录组学实验，分析了海马体背侧区域在主动位置回避记忆（APA）回忆后的基因表达变化 | 首次通过空间转录组学技术，揭示了海马体不同亚区域在APA记忆回忆后的基因表达差异，并发现了与突触可塑性和记忆相关的基因富集 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小，可能影响结果的普适性 | 探讨海马体在主动位置回避记忆回忆过程中的基因表达变化及其机制 | 海马体背侧区域的CA1、CA3和齿状回（DG）亚区域 | 神经科学 | NA | bulk RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 训练和未训练的小鼠样本 |
| 1610 | 2024-11-20 |
Digital profiling of cancer transcriptomes from histology images with grouped vision attention
2024-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.28.560068
PMID:37808782
|
研究论文 | 开发了一种基于分组视觉注意力机制的Transformer模型，用于从全切片组织学图像中预测癌症转录组 | 首次将Transformer模型应用于全切片组织学图像，并展示了其在预测空间基因表达模式和开发数字基因表达特征方面的潜力 | 模型在小数据集上训练，可能导致过拟合 | 开发一种新的深度学习模型，用于从组织学图像中预测癌症转录组，以改善癌症管理和个性化治疗 | 癌症转录组和组织学图像 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习 | Transformer | 图像 | 1,802个正常组织样本和4,331个肿瘤样本，涵盖九种癌症类型 |
| 1611 | 2024-11-20 |
Spatially resolved transcriptomic signatures of hippocampal subregions and Arc-expressing ensembles in active place avoidance memory
2024, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2024.1386239
PMID:39544521
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研究论文 | 研究通过批量RNA测序和空间转录组学实验，分析了海马体背侧在主动位置回避记忆（APA）回忆后的基因表达变化 | 首次通过空间转录组学技术，研究了海马体不同亚区在APA记忆回忆后的基因表达差异，并发现了与突触可塑性和记忆相关的基因富集 | 研究仅限于海马体背侧，未涵盖整个海马体区域；样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨海马体在主动位置回避记忆回忆后的基因表达变化及其与记忆形成的关系 | 海马体背侧的CA1、CA3和齿状回（DG）亚区 | 神经科学 | NA | RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 训练和未训练的小鼠样本 |
| 1612 | 2024-11-20 |
VCAN in the extracellular matrix drives glioma recurrence by enhancing cell proliferation and migration
2024, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2024.1501906
PMID:39554845
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研究论文 | 本文研究了细胞外基质中的VCAN蛋白在胶质瘤复发中的作用，发现VCAN通过增强细胞增殖和迁移促进胶质瘤复发 | 首次揭示了VCAN在胶质瘤复发中的关键作用，并提出了通过抑制PI3K/Akt通路来治疗胶质瘤复发的新策略 | NA | 探讨VCAN在胶质瘤复发中的作用机制，并寻找潜在的治疗策略 | 胶质瘤细胞、VCAN蛋白、PI3K/Akt信号通路 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序、免疫组化染色 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1613 | 2024-11-20 |
NFIL3/Tim3 axis regulates effector Th1 inflammation in COPD mice
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1482213
PMID:39555065
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研究论文 | 研究NFIL3/Tim3轴在COPD小鼠模型中对Th1炎症的调节作用 | 首次揭示NFIL3/Tim3轴在COPD小鼠中通过抑制Th1分化来调节Th1失衡 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨COPD相关Th1细胞的调节因子及其在炎症机制中的作用 | COPD小鼠的Th1细胞及其相关基因NFIL3和Tim3 | 免疫学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞测序、流式细胞术 | NA | 细胞 | COPD小鼠模型 |
| 1614 | 2024-11-20 |
Bulk- and single cell-RNA sequencing reveal KIF20A as a key driver of hepatocellular carcinoma progression and immune evasion
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1469827
PMID:39555078
|
研究论文 | 本研究通过bulk RNA-seq和scRNA-seq数据分析，揭示了KIF20A在肝细胞癌进展和免疫逃逸中的关键作用 | 首次发现KIF20A在肝细胞癌中高表达，并证实其促进癌细胞增殖、侵袭和转移，同时影响免疫微环境 | NA | 探讨KIF20A在肝细胞癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | KIF20A在肝细胞癌中的表达及其与诊断、预后和免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1615 | 2024-11-20 |
Analysis of immunogenic cell death in periodontitis based on scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1438998
PMID:39555084
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研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，研究了牙周炎中免疫原性细胞死亡（ICD）的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出与ICD相关的细胞群和关键基因，并构建了诊断模型 | 研究仅限于牙周炎样本，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨牙周炎中免疫原性细胞死亡的机制及其在疾病发展中的作用 | 牙周炎中的免疫原性细胞死亡及相关基因 | 数字病理学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序、qPCR、酶联免疫吸附测定（ELISA）、免疫荧光（IF）染色 | 机器学习 | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1616 | 2024-11-19 |
Single-cell profiling of the peripheral blood immune landscape during mid- and late-stage pregnancy
2024-Dec-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 研究了中期和晚期妊娠妇女外周血单核细胞（PBMC）的免疫谱，揭示了妊娠不同阶段的免疫细胞亚型和分子特性的显著差异 | 首次详细描述了中期和晚期妊娠妇女外周血免疫谱的变化，发现了一种罕见的T细胞亚型“XIST+ T细胞”，并揭示了其在妊娠期间的免疫调节作用 | 样本量较小，仅包括三名中期和晚期妊娠妇女，可能影响结果的普适性 | 确定中期和晚期妊娠妇女外周血单核细胞的免疫谱，为研究妊娠相关疾病提供基础 | 中期和晚期妊娠妇女的外周血单核细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和流式细胞术 | NA | 单细胞RNA数据 | 三名中期妊娠妇女和三名晚期妊娠妇女的外周血样本 |
| 1617 | 2024-11-19 |
Atypical chemokine receptor 1-positive endothelial cells mediate leucocyte infiltration and synergize with secreted frizzled-related protein 2/asporin-positive fibroblasts to promote skin fibrosis in systemic sclerosis
2024-Nov-18, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae286
PMID:39009432
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研究论文 | 研究探讨了系统性硬化症（SSc）和局限性硬皮病（LS）中皮肤纤维化的病理机制，特别是血管内皮细胞损伤与免疫细胞浸润的关系以及不同细胞类型在纤维化皮肤生态系统中的相互作用 | 首次揭示了非典型趋化因子受体1（ACKR1）在纤维化皮肤组织中高表达促进免疫细胞浸润，并发现SFRP2/ASPN+成纤维细胞协同加剧皮肤纤维化的机制 | 研究样本量较小，且仅限于SSc和LS患者，可能影响结果的普适性 | 探索血管内皮细胞损伤与免疫细胞浸润的关系，以及不同细胞类型在纤维化皮肤生态系统中的相互作用 | 系统性硬化症（SSc）和局限性硬皮病（LS）患者的皮肤纤维化 | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共62,295个细胞，来自3名健康供体和7名SSc患者以及3名LS患者的皮肤活检样本 |
| 1618 | 2024-11-19 |
The role of FOXK2-FBXO32 in breast cancer tumorigenesis: Insights into ribosome-associated pathways
2024-Nov-18, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15482
PMID:39552461
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研究论文 | 研究FOXK2基因及其下游基因FBXO32在乳腺癌肿瘤发生中的作用，并探讨其在免疫治疗中的潜在应用 | 首次揭示了FOXK2在多种癌症中的表达与患者预后和免疫反应的关系，并发现其下游基因FBXO32在癌症免疫反应中的作用 | 需要进一步研究FOXK2及其下游基因FBXO32在癌症中的具体机制以及其在癌症治疗中的潜在优势 | 寻找新的生物标志物以预测肿瘤免疫治疗的疗效和预后 | FOXK2基因及其下游基因FBXO32在癌症中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、RNA-seq、ChIP-seq | NA | RNA | 来自TCGA数据库的泛癌bulk RNA-seq数据 |
| 1619 | 2024-11-19 |
Mouse Bladder Smooth Muscle Lack the Functional Active NMDAR
2024-Nov-18, Neurourology and urodynamics
IF:1.8Q3
DOI:10.1002/nau.25631
PMID:39552551
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研究论文 | 研究探讨了N-甲基-D-天冬氨酸受体（NMDAR）在小鼠膀胱平滑肌（BSM）功能中的作用及其作为治疗过度活跃膀胱的潜在靶点 | 发现小鼠膀胱平滑肌中缺乏功能性NMDAR，这表明NMDAR抑制在体内治疗过度活跃膀胱的疗效不太可能直接通过影响BSM本身来实现 | 研究仅限于小鼠和人类组织，未涉及其他物种；实验结果可能受到样本量和实验条件的限制 | 探讨NMDAR在膀胱平滑肌功能中的作用及其作为治疗过度活跃膀胱的潜在靶点 | 小鼠和人类的膀胱平滑肌细胞 | NA | NA | 肌动描记法、钙成像、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | RNA序列数据、图像 | 小鼠和人类组织的膀胱平滑肌细胞 |
| 1620 | 2024-11-19 |
Lung Tissue Multilayer Network Analysis Uncovers the Molecular Heterogeneity of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-Nov-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0500OC
PMID:38626356
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研究论文 | 本文通过多层网络分析方法，研究了慢性阻塞性肺疾病（COPD）的分子异质性 | 本文提出了一种新的多层网络分析方法，整合了COPD患者的mRNA、microRNA和甲基化数据，揭示了与临床特征相关的分子机制 | 本文的样本量相对较小，且仅限于前吸烟者，可能限制了研究结果的普适性 | 揭示慢性阻塞性肺疾病的分子异质性及其与临床特征的关系 | COPD患者的肺组织样本及其mRNA、microRNA和甲基化数据 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 多层网络分析 | 机器学习模型 | mRNA、microRNA、甲基化数据 | 135名前吸烟者COPD患者 |