单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 1601 - 1620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1601 | 2025-10-07 |
TNFR1-mediated senescence and lack of TNFR2-signaling limit human intervertebral disc cell repair in back pain conditions
2024-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.22.581620
PMID:38948728
|
研究论文 | 本研究揭示了TNFα受体在椎间盘退变疼痛中限制修复的不同作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现促炎细胞因子主要由小群巨噬细胞表达，并阐明TNFR1介导的衰老和TNFR2信号缺失共同限制椎间盘细胞修复 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步体内验证 | 探究椎间盘退变疼痛中修复受限的分子机制 | 人类椎间盘退变组织及人纤维环细胞 | 单细胞生物学 | 椎间盘退变疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类椎间盘退变组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1602 | 2025-10-07 |
Hierarchically Assembled Nanofiber Scaffold Guides Long Bone Regeneration by Promoting Osteogenic/Chondrogenic Differentiation of Endogenous Mesenchymal Stem Cells
2024-06, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202309868
PMID:38259052
|
研究论文 | 开发三维垂直排列纳米纤维支架促进内源性间充质干细胞成骨/成软骨分化以引导长骨再生 | 首创具有长通道和大孔径的三维垂直排列纳米纤维支架，能够从骨髓腔招募BMSCs并促进其向软骨细胞和成骨细胞分化 | 未明确说明样本数量和研究持续时间，缺乏与其他先进支架材料的直接对比 | 开发新型纳米纤维支架促进临界尺寸节段性长骨缺损的再生修复 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)和长骨缺损模型 | 组织工程 | 骨缺损 | 单细胞测序，免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据，组织染色图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1603 | 2025-10-07 |
Air Pollutants and Mortality Risk in Patients with Aortic Dissection: Evidence from a Clinical Cohort, Single-Cell Sequencing, and Proteomics
2024-Apr-16, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.4c00534
PMID:38561599
|
研究论文 | 本研究通过临床队列、单细胞测序和蛋白质组学探讨空气污染物与主动脉夹层患者死亡风险的关联及机制 | 首次结合临床队列、单细胞测序和蛋白质组学多维度揭示PM2.5通过肥大细胞激活和脱颗粒影响主动脉夹层预后的机制 | 研究为观察性设计，不能确定因果关系；空气污染物数据来自监测站而非个人暴露水平 | 评估空气污染物与急性主动脉夹层患者死亡风险的关联并探索潜在机制 | 1,267例急性主动脉夹层患者及主动脉组织样本 | 临床医学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 蛋白质组学, 多变量Cox回归模型 | Cox回归模型 | 临床数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 1,267例患者 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 1604 | 2025-10-07 |
An ultra high-throughput, massively multiplexable, single-cell RNA-seq platform in yeasts
2024-04, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.3927
PMID:38282330
|
研究论文 | 本研究优化了适用于酵母的超高通量单细胞RNA测序平台SPLiT-seq，实现了大规模并行转录组分析 | 开发了基于组合条形码策略的酵母单细胞RNA测序方法，无需物理隔离细胞即可同时处理数百种基因型或生长条件 | 方法主要针对酵母物种开发，在其他生物系统中的适用性需要进一步验证 | 开发高效、低成本的酵母单细胞转录组测序技术 | 多种物种和倍性的酵母细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序( scRNAseq)，SPLiT-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 43,388个酵母细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | SPLiT-seq | 基于分裂池连接转录组测序的单细胞RNA测序平台 |
| 1605 | 2025-10-07 |
Profibrotic VEGFR3-Dependent Lymphatic Vessel Growth in Autoimmune Valvular Carditis
2024-04, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320326
PMID:38269589
|
研究论文 | 本研究揭示了自身免疫性瓣膜炎中VEGFR3依赖性淋巴管生长的新机制及其与心脏纤维化的关联 | 首次发现瓣膜表面内皮细胞在疾病进展中形成新生毛细淋巴管，并鉴定出具有促纤维化转录特征的新型淋巴瓣膜内皮细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究内皮细胞在风湿性心脏病发病机制中的作用 | K/B.g7自身免疫性瓣膜炎小鼠模型和人类风湿性心脏病患者的二尖瓣组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫染色，组织学分析，超声心动图 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 小鼠模型和人类二尖瓣置换术患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1606 | 2025-10-07 |
Characterizing the T Cell Repertoire in the Proximal Airway in Health and Disease
2024-04, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.31088
PMID:37787469
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较声门下狭窄患者与健康对照组近端气道T细胞受体库的多样性和特征 | 首次在单细胞水平上系统比较声门下狭窄疾病与健康状态下近端气道T细胞受体库的多样性和克隆性特征 | 高频克隆型的目标抗原仍未解析，样本量相对有限（iSGS n=24, iLTS n=8, 对照组 n=7） | 验证声门下狭窄病例是否具有较低多样性（高度克隆性）的适应性免疫反应假说 | 声门下狭窄患者（iSGS和iLTS）与健康对照组的近端气道黏膜组织 | 免疫学 | 声门下狭窄 | 单细胞RNA测序，T细胞受体序列分析 | Immunarch生物信息学流程 | 单细胞RNA测序数据，T细胞受体序列数据 | iSGS患者24例，iLTS患者8例，健康对照组7例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1607 | 2025-10-07 |
Silencing XIST on the future active X: Searching human and bovine preimplantation embryos for the repressor
2024-Apr, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-022-01115-9
PMID:35585273
|
研究论文 | 本研究通过分析人类和牛早期胚胎的单细胞RNA测序数据，探索X染色体上XIST基因在活性X染色体上的抑制机制 | 首次在人类和牛早期胚胎中同时研究XIST在活性X染色体上的抑制机制，并确定了与XIST抑制相关的候选基因 | 研究主要基于转录组数据分析，需要进一步的实验验证候选基因的具体功能机制 | 探索活性X染色体如何避免被自身XIST基因沉默的分子机制 | 人类和牛的早期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 人类和牛早期胚胎（4-8细胞期、桑椹胚期、早期囊胚期） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1608 | 2025-10-07 |
Potential Therapeutic Targets for Hypotension in Duchenne Muscular Dystrophy
2024-Apr, Medical hypotheses
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.mehy.2024.111318
PMID:38585412
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现KCNQ5和RyR2基因可能是导致杜氏肌营养不良患者低血压的潜在治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出KCNQ5和RyR2基因在DMD突变小鼠血管平滑肌细胞中的显著上调表达 | 研究机制尚不明确，且主要基于小鼠模型数据 | 探索杜氏肌营养不良患者低血压的分子机制和潜在治疗靶点 | 杜氏肌营养不良突变小鼠的血管平滑肌细胞 | 单细胞测序分析 | 杜氏肌营养不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1609 | 2025-10-07 |
Gene panel selection for targeted spatial transcriptomics
2024-01-25, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03174-1
PMID:38273415
|
研究论文 | 开发了一种名为gpsFISH的计算方法，用于优化靶向空间转录组学中的基因面板选择 | 通过建模和调整平台效应，克服了现有方法依赖scRNA-seq数据而忽略技术间平台效应的局限性 | NA | 优化靶向空间转录组学中的基因选择方法 | 复杂组织中的细胞类型 | 空间转录组学 | NA | 靶向空间转录组学，单细胞RNA测序 | 计算模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1610 | 2025-10-07 |
A pancreatic cancer organoid platform identifies an inhibitor specific to mutant KRAS
2024-01-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.11.011
PMID:38151022
|
研究论文 | 开发胰腺癌类器官平台筛选出特异性靶向KRAS突变的抑制剂 | 建立高通量药物筛选平台，利用等基因小鼠胰腺类器官鉴定出可特异性抑制KRAS突变型胰腺癌的化合物 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需扩展 | 发现靶向PDAC相关KRAS突变的新型抑制剂 | 胰腺导管腺癌(PDAC)类器官模型 | 癌症研究 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 高通量药物筛选 | 类器官模型 | 基因表达数据, 药物反应数据 | 超过6000种化合物筛选 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1611 | 2025-10-07 |
Cytokine expression and cytokine-mediated cell-cell communication during skeletal muscle regeneration revealed by integrative analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-Dec, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.12055
PMID:39691872
|
研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序数据揭示骨骼肌再生过程中的细胞因子表达和细胞间通讯机制 | 首次整合15个公共单细胞RNA测序数据集，系统分析393种小鼠细胞因子在骨骼肌再生中的动态表达谱和细胞间通讯网络 | 仅分析早期再生时间点（0、2、5、7天），未涵盖完整再生过程；基于转录组数据推断细胞通讯，需实验验证 | 解析骨骼肌再生过程中细胞因子介导的细胞间通讯机制 | 小鼠骨骼肌再生过程中的各种细胞类型 | 单细胞生物学 | 肌肉损伤修复 | 单细胞RNA测序 | CellChat | 单细胞转录组数据 | 整合15个公共scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1612 | 2025-10-07 |
Single-cell multi-ome regression models identify functional and disease-associated enhancers and enable chromatin potential analysis
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01689-8
PMID:38514783
|
研究论文 | 开发了一种名为SCARlink的单细胞多组学回归模型，用于预测基因表达并将增强子与靶基因关联 | 使用正则化泊松回归对瓦片水平可及性数据进行建模，避免了传统基因-峰相关性分析和峰值调用的限制 | NA | 建立基因水平调控模型，识别功能性增强子并分析染色质潜能 | 单细胞多组学测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学测序 | 正则化泊松回归 | 基因组可及性数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1613 | 2025-10-07 |
EBF1 Limits the Numbers of Cochlear Hair and Supporting Cells and Forms the Scala Tympani and Spiral Limbus during Inner Ear Development
2024-02-14, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1060-23.2023
PMID:38176908
|
研究论文 | 本研究探讨了早期B细胞因子1（EBF1）在小鼠内耳发育过程中对毛细胞和支持细胞数量的调控作用 | 首次发现EBF1通过抑制前感觉域和Kölliker器细胞的增殖来调控内耳细胞数量，并参与螺旋缘和鼓阶的形成 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 阐明EBF1在内耳发育过程中的功能机制 | 小鼠内耳组织 | 发育生物学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织形态学数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1614 | 2025-10-07 |
Combining Cre-LoxP and single-cell sequencing technologies: insights into the extracellular vesicle cargo transfer
2024, Extracellular vesicles and circulating nucleic acids
DOI:10.20517/evcna.2024.58
PMID:39811732
|
研究论文 | 本研究首次将Cre-LoxP重组系统与单细胞测序技术结合，用于追踪胰腺导管腺癌模型中肿瘤来源细胞外囊泡的摄取和功能 | 首次将Cre-LoxP重组系统与单细胞测序技术相结合，能够在不干扰EV生物发生或表型的情况下特异性识别单个EV受体细胞 | NA | 研究肿瘤来源细胞外囊泡在受体非恶性细胞中的摄取和功能 | 胰腺导管腺癌小鼠模型中的巨噬细胞、中性粒细胞和肥大细胞 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | Cre-LoxP重组系统，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1615 | 2025-10-07 |
Neurodegeneration: 2024 update
2024-Jan, Free neuropathology
|
综述 | 本文回顾了过去一年神经退行性疾病神经病理学领域的重要研究进展 | 综合展示了从传统病理学到单细胞RNA测序、人工智能等前沿技术在神经退行性疾病研究中的应用 | 仅代表作者个人选择的文献，可能无法涵盖该领域所有重要研究 | 总结神经退行性疾病神经病理学领域的最新研究进展 | 人类组织样本和神经退行性疾病相关研究 | 神经病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,人工智能,人诱导多能干细胞模型,临床病理解剖相关研究 | NA | 组织病理学数据,基因组数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1616 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomes and chromatin accessibility of endothelial cells unravel transcription factors associated with dysregulated angiogenesis in systemic sclerosis
2024-Sep-30, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-225415
PMID:38754983
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了系统性硬化症中内皮细胞的转录组和染色质可及性变化，发现ETS转录因子家族在血管异常调控中的关键作用 | 首次在系统性硬化症中整合单细胞转录组和染色质可及性分析，识别出ELK4、ERF和ETS1作为调控血管异常的新靶点 | 样本量相对有限，主要聚焦皮肤组织，需要进一步验证这些发现在其他血管床的普适性 | 阐明系统性硬化症中内皮细胞功能障碍的分子机制 | 系统性硬化症患者和对照的内皮细胞 | 单细胞组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 单核转座酶可及染色质测序, 免疫荧光染色, 蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 蛋白质组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1617 | 2025-10-07 |
Multimodal contrastive learning for spatial gene expression prediction using histology images
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae551
PMID:39471412
|
研究论文 | 提出一种基于多模态对比学习的空间基因表达预测方法mclSTExp，使用组织学图像预测空间转录组数据 | 将每个斑点视为'单词'，通过Transformer自注意力机制整合内在特征与空间上下文，并利用对比学习融合图像特征 | 仅在乳腺癌和皮肤鳞状细胞癌数据集上进行了评估，未验证在其他癌症类型上的泛化能力 | 开发成本效益高的空间基因表达预测方法 | 乳腺癌和皮肤鳞状细胞癌组织样本 | 计算机视觉 | 乳腺癌,皮肤鳞状细胞癌 | 多模态对比学习,Transformer,自注意力机制 | Transformer,Densenet-121 | 图像,空间基因表达数据 | 两个乳腺癌数据集和一个皮肤鳞状细胞癌数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1618 | 2025-10-07 |
Scaling deep identifiable models enables zero-shot characterization of single-cell biological states
2024-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.11.566161
PMID:38014345
|
研究论文 | 开发了scShift深度学习框架，用于消除单细胞RNA测序数据中的批次效应并识别真实生物差异 | 通过扩展深度可识别模型实现了零样本表征能力，能够外推至未见过的生物状态如COVID-19后纤维化 | 需要大规模单细胞图谱数据进行训练，存在数据多样性过渡阈值 | 解决单细胞RNA测序数据分析中跨数据集批次效应的挑战 | 单细胞RNA测序数据，特别是肺纤维化状态 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 深度变分推断框架 | 单细胞RNA测序数据 | 超过200个训练模型，基于大规模单细胞图谱汇编 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1619 | 2025-10-07 |
STMGraph: spatial-context-aware of transcriptomes via a dual-remasked dynamic graph attention model
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae685
PMID:39764614
|
研究论文 | 开发了一种名为STMGraph的空间上下文感知双视图动态深度学习框架，用于空间转录组数据分析 | 提出双重掩码机制与动态图注意力模型相结合的方法，通过建立双解码视图共享特征，并利用自监督从两个不同视角更新图连接关系 | NA | 提高空间转录组数据分析的准确性和鲁棒性，实现微环境异质性检测、空间域聚类和批次效应校正 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 动态图注意力模型(DGAT), 深度学习 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1620 | 2025-10-07 |
Comprehensive Characterization of a Subfamily of Ca2+-Binding Proteins in Mouse and Human Retinal Neurons at Single-Cell Resolution
2024-Sep, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0145-24.2024
PMID:39260891
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术全面分析小鼠和人类视网膜神经元中钙结合蛋白亚家族的表达谱 | 首次在单细胞分辨率下系统比较小鼠和人类视网膜神经元中CaBP1-5的表达模式，发现双极细胞共表达多种CaBP而非单一蛋白 | 研究主要基于转录组数据，蛋白质水平验证不足；功能机制研究有待深入 | 阐明CaBP1、CaBP2和CaBP5在视网膜神经元中的表达模式和潜在功能 | 小鼠和人类视网膜神经元（包括无长突细胞、神经节细胞、水平细胞和双极细胞） | 单细胞转录组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞逆转录聚合酶链反应 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类视网膜神经元单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |