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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-06-26 |
Single-Cell Analysis Reveals a Subset of High IL-12p40-Secreting Dendritic Cells within Mouse Bone Marrow-Derived Macrophages Differentiated with M-CSF
2024-04-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300431
PMID:38416039
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现,M-CSF分化的小鼠骨髓源性巨噬细胞(BMDM)中有一小群细胞高分泌IL-12p40,并证实这群细胞具有树突状细胞(DC)特征 | 首次通过分泌分析和单细胞RNA测序揭示M-CSF分化的BMDM中存在一个高表达Il12b的DC样亚群,该亚群在LPS刺激下表现出独特的DC激活程序,不同于BMDM的随机细胞异质性 | 未能在静息状态下通过表面标志物分离该DC样亚群,且研究仅限于体外小鼠模型 | 探究M-CSF分化的骨髓源性巨噬细胞在IL-12产生中的细胞异质性及其与树突状细胞的关系 | 小鼠骨髓源性巨噬细胞及树突状细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序, 分泌分析, 流式细胞术, 报告基因小鼠 | NA | 基因表达数据, 分泌数据 | 小鼠骨髓源性巨噬细胞培养物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2026-06-26 |
IDO1 Inhibition Promotes Activation of Tumor-intrinsic STAT3 Pathway and Induces Adverse Tumor-protective Effects
2024-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300545
PMID:38391297
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示IDO1抑制剂激活肿瘤内在STAT3通路并导致不利肿瘤保护效应的机制 | 首次利用单细胞RNA测序全面分析IDO1抑制剂对肿瘤微环境的影响,发现其同时激活免疫细胞和诱导M2巨噬细胞浸润及IL-6/JAK2/STAT3通路的意外副作用 | 未明确提及,可能包括实验模型仅涉及小鼠结肠癌细胞系及单一抑制剂类型 | 探究IDO1抑制剂临床失败原因,揭示其对肿瘤微环境的整体影响 | 小鼠结肠癌CT26细胞移植的BALB/C小鼠肿瘤微环境 | 机器学习 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | BALB/C小鼠移植CT26结肠癌模型(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2026-06-26 |
Liver-restricted Type I IFN Signature Precedes Liver Damage in Chronic Hepatitis B Patients Stopping Antiviral Therapy
2024-03-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300569
PMID:38294274
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研究论文 | 本研究通过纵向采样慢性乙型肝炎患者停止抗病毒治疗后的肝脏样本,发现肝脏限制性I型干扰素信号在肝损伤之前出现,并揭示了先天免疫激活先于临床显著肝损伤的早期免疫触发机制 | 首次在停止抗病毒治疗的慢性乙肝患者中捕获肝损伤前的早期免疫事件,发现肝脏特异性I型干扰素信号和MIF因子是旁观者淋巴细胞活化的最早免疫触发因子 | 未明确说明 | 阐明慢性乙型肝炎患者停止抗病毒治疗后肝损伤发生前的早期免疫激活机制 | 慢性乙型肝炎患者停止抗病毒治疗后的肝脏和血液样本 | 数字病理学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 测序数据, 流式数据 | 纵向采样的慢性乙型肝炎患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 144 | 2026-06-26 |
Impaired innate and adaptive immune responses to BNT162b2 SARS-CoV-2 vaccination in systemic lupus erythematosus
2024-03-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176556
PMID:38456511
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研究论文 | 系统性红斑狼疮患者对BNT162b2 SARS-CoV-2疫苗的先天性和适应性免疫反应受损 | 首次全面比较系统性红斑狼疮患者与健康对照者对BNT162b2 mRNA疫苗的先天性和适应性免疫反应,发现免疫抑制治疗与未治疗患者均存在T细胞反应受损,并揭示疫苗诱导的单核细胞群体减少 | 样本量较小(19例SLE患者和56例健康对照),且未评估长期免疫持久性 | 评估系统性红斑狼疮患者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的免疫反应,优化自身免疫疾病患者的疫苗接种策略 | 系统性红斑狼疮患者和健康志愿者 | 机器学习和生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,临床样本数据 | 19例系统性红斑狼疮患者和56例健康对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析外周血单个核细胞 |
| 145 | 2026-06-26 |
A mouse model of Zhu-Tokita-Takenouchi-Kim syndrome reveals indispensable SON functions in organ development and hematopoiesis
2024-03-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.175053
PMID:38290089
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研究论文 | 通过构建Son单倍剂量不足的小鼠模型,揭示SON基因在器官发育和造血过程中的重要作用 | 首次通过小鼠模型系统研究SON单倍剂量不足导致的ZTTK综合征的临床症状,并利用单细胞转录组分析揭示造血异常机制 | 未提及具体局限性,可能缺乏对人类患者与小鼠模型差异的全面比较 | 建立ZTTK综合征的小鼠模型并探索SON基因在器官发育和造血中的功能 | Son单倍剂量不足小鼠(Son+/-)及其造血干细胞和祖细胞 | 机器学习和转录组分析 | ZTTK综合征(罕见遗传病) | RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | Son+/-小鼠及对照组,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 146 | 2026-06-26 |
Preservation of scRNA-Seq Libraries Using Existing Inactivation Protocols
2024-02-13, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens13020167
PMID:38392905
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研究论文 | 本文测试了使用现有灭活方案从高安全级别实验室移除单细胞RNA测序文库的可行性,并证明灭活不影响样本质量 | 首次验证了将现有核酸提取灭活方案用于移除单细胞测序文库,无需开发新方法即可安全操作 | 未明确说明不同灭活方案对特定病原体或极端条件下的适用性比较 | 评估现有灭活方案在处理单细胞RNA测序文库时的有效性和样本完整性 | 单细胞RNA测序文库在生物安全3级及以上实验室中的处理 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 147 | 2026-06-26 |
Residual ANTXR1+ myofibroblasts after chemotherapy inhibit anti-tumor immunity via YAP1 signaling pathway
2024-02-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45595-3
PMID:38346978
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研究论文 | 化疗后残留的ANTXR1+肌成纤维细胞通过YAP1信号通路抑制抗肿瘤免疫 | 揭示了化疗对高级别浆液性卵巢癌中CAF亚群的不同影响,并发现ECM-myCAF通过YAP1通路抑制CD8 T细胞毒性,为靶向治疗提供新方向 | 未探讨其他CAF亚群在化疗后的具体作用机制,且样本量和临床验证有限 | 研究化疗对高级别浆液性卵巢癌中CAF亚群的影响及其免疫抑制机制 | 高级别浆液性卵巢癌中的癌症相关成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞分析、空间转录组学、免疫组织化学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 用于单细胞RNA测序和空间转录组分析的10x平台 |
| 148 | 2026-06-26 |
Tertiary lymphoid structures sustain cutaneous B cell activity in hidradenitis suppurativa
2024-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169870
PMID:38113104
|
研究论文 | 该研究结合组织学分析、单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了化脓性汗腺炎(HS)皮肤病变中三级淋巴结构的存在及其在B细胞活动中的作用 | 首次在HS皮肤病变中鉴定出三级淋巴结构,并描述了其内B细胞的成熟过程,包括生发中心反应和类别转换重组 | NA | 探究HS皮肤病变中B细胞的动态变化及其微环境相互作用 | 化脓性汗腺炎患者的皮肤病变组织 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,组织学分析 | NA | 图像,文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3',10x Visium |
| 149 | 2026-06-26 |
Molecular Insights From Multiomics Studies of Physical Activity
2024-02-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi23-0004
PMID:38241506
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综述 | 基于多组学技术研究体力活动的分子效应,探讨其系统性健康效益的机制 | 系统整合多种组学技术(代谢组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、脂质组学、单细胞RNA测序及表观基因组学)全面揭示体力活动对全身器官及分子通讯的影响 | 未提及具体局限性,但作为综述可能缺乏对特定组学技术深度定量分析的验证 | 揭示多组学技术如何提升对体力活动系统性效应(器官间整合反应及组织通讯分子机制)的理解 | 体力活动相关的全身性分子变化及组织间通讯机制 | 机器学习 | NA | NA | NA | 多组学数据(代谢组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组、脂质组、单细胞转录组、表观基因组) | NA | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学, 脂质组学, 表观基因组学 | NA | NA |
| 150 | 2026-06-26 |
Non-coding genome contribution to ALS
2024, International review of neurobiology
DOI:10.1016/bs.irn.2024.04.002
PMID:38802183
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综述 | 总结非编码基因组在肌萎缩侧索硬化症(ALS)遗传风险中的作用,并强调细胞特异性功能注释的重要性 | 提出通过单细胞表观遗传图谱和空间转录组学改进细胞特异性基因组功能注释,以揭示非编码风险变异的功能,并解决编码与非编码变异之间的明显矛盾 | 未提供具体实验数据或样本分析,主要基于现有文献总结和理论推测 | 探索非编码基因组在ALS遗传病因学中的贡献,推动针对未解遗传因素的研究 | ALS疾病相关的非编码基因组变异及其在中枢神经系统细胞类型中的功能影响 | 自然语言处理 | 肌萎缩侧索硬化症 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 151 | 2026-06-26 |
Predictive biomarkers and initial analysis of maternal immune alterations in postpartum preeclampsia reveal an immune-driven pathology
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380629
PMID:38745664
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研究论文 | 本研究探讨产后子痫前期的母体免疫变化及其预测生物标志物,揭示免疫驱动的病理机制 | 首次在产后子痫前期患者诊断时进行单细胞转录组分析,发现胎盘CD163+细胞和孕早期血压作为预测生物标志物的潜力 | 样本采集时间点不一致(产后48小时至25天),且为初步研究,需要更大规模验证 | 理解产后子痫前期的免疫贡献及识别围产期预测生物标志物 | 产后子痫前期患者和正常妊娠女性的胎盘和血液样本 | 机器学习 | 妊娠期疾病 | 单细胞转录组学,流式细胞术,细胞内细胞因子染色,免疫组化 | NA | 文本,图像 | 产后子痫前期患者和正常妊娠对照组,具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 152 | 2026-06-26 |
Protocol of a prospective multicenter study on comorbidity impact on multiple sclerosis and antibody-mediated diseases of the central nervous system (COMMIT)
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380025
PMID:39021565
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研究论文 | 一项前瞻性多中心研究方案,探讨共病对多发性硬化及中枢神经系统抗体介导疾病的影响 | 首次系统研究血管共病对MS、NMOSD和MOGAD临床及旁临床参数的影响,结合多种先进技术进行标志物分析 | 未提及具体局限性 | 评估共病(尤其是血管共病)及相关风险因素对MS、NMOSD和MOGAD临床和旁临床参数的影响 | MS、NMOSD和MOGAD患者(有或无共病)以及健康对照者 | 机器学习 | 多发性硬化, 视神经脊髓炎谱系疾病, MOG抗体相关疾病 | 蛋白质组学、超敏ELISA、RT-qPCR、质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 外周血和脑脊液样本数据、OCT图像、MRI图像 | 多中心前瞻性研究,样本量未具体说明 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 153 | 2026-06-26 |
Dynamic immune status analysis of peripheral blood mononuclear cells in patients with Klebsiella pneumoniae bloodstream infection sepsis using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380211
PMID:38898888
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析肺炎克雷伯菌血流感染脓毒症患者外周血单个核细胞的动态免疫状态 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究肺炎克雷伯菌血流感染引起的脓毒症在急性期和恢复期外周血单个核细胞的免疫状态变化 | 样本量较小(共13名受试者),可能限制结果的一般性和统计效力 | 分析肺炎克雷伯菌血流感染脓毒症患者外周血单个核细胞在急性期和恢复期的免疫状态变化 | 外周血单个核细胞 | 机器学学习 | 肺炎克雷伯菌血流感染脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 13名受试者,包括3名健康对照、7名急性期患者(其中4名死亡)和3名恢复期患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2026-06-26 |
Distinct cuproptosis patterns in hepatocellular carcinoma patients correlate with unique immune microenvironment characteristics and cell-cell communication, contributing to varied overall survival outcomes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1379690
PMID:38868777
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研究论文 | 探讨肝癌患者铜死亡模式与免疫微环境特征及细胞间通讯的关联,以及对总生存期的影响 | 首次揭示铜死亡相关基因在肝细胞癌中与免疫微环境和细胞间通讯的关联,并构建了基于铜死亡相关基因的预后风险模型 | 未提及具体局限性信息 | 探索肝细胞癌中细胞铜死亡与免疫微环境的相关性,为免疫治疗提供潜在见解 | 肝细胞癌患者的铜死亡相关基因表达、免疫微环境及细胞间通讯 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, LASSO Cox分析, WGCNA, 共识聚类 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据库和GEO数据库的肝癌患者样本(具体数量未提及) | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq(推测) | TCGA和GEO数据库来源的测序数据, 平台细节未明确提供 |
| 155 | 2026-06-20 |
The advance of single cell transcriptome to study kidney immune cells in diabetic kidney disease
2024-11-16, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03853-y
PMID:39550562
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综述 | 本文讨论了单细胞转录组学在糖尿病肾病研究中的应用,重点分析了免疫细胞在疾病进展中的作用 | 通过整合单细胞RNA测序研究,提供了对糖尿病肾病中免疫细胞(包括巨噬细胞、T细胞、B细胞等)作用的新视角,为发病机制和免疫治疗策略提供了新见解 | 肾脏结构和功能复杂且异质性高,研究每个细胞类型在病理生理中的功能仍然具有挑战性 | 探讨单细胞转录组学在糖尿病肾病领域的应用,并突出免疫细胞在该疾病中的重要作用 | 糖尿病肾病患者的肾脏活检和尿液样本中的免疫细胞 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2026-06-20 |
Oxysterols contribute to immune cell recruitment in SLE skin lesions
2024-10-22, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03414-6
PMID:39438997
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研究论文 | 本研究探索了氧化甾醇在系统性红斑狼疮(SLE)皮肤病变中的作用及其对免疫细胞招募的影响 | 首次通过靶向氧化脂质代谢组学分析鉴定了SLE皮肤病变中异常氧化胆固醇代谢,并阐明了成纤维细胞通过IL-1β介导的p38 MAPK和NFκB通路表达CH25H和CYP7B1,进而通过GPR183轴促进免疫细胞招募的机制 | 研究主要基于体外实验和数据分析,缺乏体内验证;样本量可能有限,且未涉及其他免疫细胞类型或长期临床结果 | 阐明氧化甾醇代谢在SLE皮肤病变发病机制中的作用 | 系统性红斑狼疮患者的皮肤病变组织及成纤维细胞 | 自然语言处理 | 系统性红斑狼疮 | 液相色谱-质谱联用(LC-MS)靶向氧化脂质代谢组学、免疫组织化学染色、单细胞测序数据分析 | NA | 代谢组学数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 157 | 2026-06-20 |
The miR-203/ZBTB20/MAFA Axis Orchestrates Pancreatic β-Cell Maturation and Identity During Weaning and Diabetes
2024-10-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0604
PMID:39058664
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研究论文 | 本研究揭示了miR-203/ZBTB20/MAFA轴在断奶和糖尿病期间调控胰腺β细胞成熟和身份的作用机制 | 首次发现miR-203的成熟形式(miR-203)在营养转变过程中调控β细胞成熟,并通过单细胞RNA测序证明miR-203升高促进未成熟β细胞向CgBHi内分泌细胞转化 | 未在人体样本中验证该调控轴的作用 | 探究营养转变与β细胞成熟之间的分子机制,揭示调控β细胞成熟的关键信号通路 | 胰腺β细胞 | 机器学习 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠胰腺β细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 158 | 2026-06-20 |
No Evidence for Persistent Enteroviral B Infection of Pancreatic Islets in Patients With Type 1 Diabetes and Prediabetes From RNA Sequencing Data
2024-10-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db24-0076
PMID:39083653
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研究论文 | 通过RNA测序数据分析,未发现1型糖尿病及前驱糖尿病患者胰岛中存在持续性肠道病毒B感染的证据 | 首次利用人类胰腺分析计划(HPAP)的大规模RNA-seq数据(包括α、β、外分泌细胞及单细胞数据),通过Kraken2和STAR双重方法系统评估肠道病毒B的存在 | 无法排除非常低水平的持续性肠道病毒B感染存在的可能性 | 验证肠道病毒B持续性感染是否为1型糖尿病的重要病因 | 1型糖尿病、前驱糖尿病(自身抗体阳性但未发病)、2型糖尿病及非糖尿病患者的胰腺组织样本 | 自然语言处理 | 1型糖尿病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 243个批量RNA文库和79个单细胞RNA文库 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2026-06-20 |
Integrated analysis of bulk and single-cell RNA-seq data reveals cell differentiation-related subtypes and a scoring system in bladder cancer
2024-10, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70111
PMID:39400959
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研究论文 | 整合批量与单细胞RNA-seq数据,揭示膀胱癌细胞分化相关亚型并构建评分系统 | 首次识别膀胱癌细胞分化相关分子亚型并构建CDR评分系统,发现ANXA5作为潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性信息 | 探索膀胱癌细胞分化相关基因的分子亚型及其预后意义,并建立评分系统 | 膀胱癌细胞分化相关基因、膀胱癌患者样本 | 机器学习和数字病理学 | 膀胱癌 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、Lasso回归、Cox回归 | WGCNA、Lasso、Cox回归模型 | 基因表达数据(批量与单细胞RNA-seq) | 两个GEO单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2026-06-20 |
Unlocking reproducible transcriptomic signatures for acute myeloid leukaemia: Integration, classification and drug repurposing
2024-09, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70085
PMID:39267259
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研究论文 | 通过整合34个数据集(包括单细胞RNA测序数据)识别急性髓系白血病(AML)相关基因签名,结合XGBoost模型进行亚型分类和药物重定位,并构建了CSAMLdb数据库平台 | 首次整合多组公开数据集(含scRNA-seq)系统性筛选出191个低变异高一致性的AML特征基因,并开发了结合XGBoost和自定义框架的亚型分类方法,同时通过药物重定位发现solasonine对高危患者潜在疗效 | 未明确说明研究局限性 | 解决AML转录组研究的异质性问题,通过数据整合和机器学习方法实现可重复的分子分型和药物重定位 | 急性髓系白血病患者转录组数据(包含34个数据集,26个对照组、6个预后数据集和2个scRNA-seq数据集) | 机器学习 | 急性髓系白血病 | RNA-seq, scRNA-seq, 分子对接 | XGBoost | 转录组数据 | 34个数据集(含26个对照组、6个预后数据集和2个单细胞RNA测序数据集) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |