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当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-12-03 |
Regorafenib plus nivolumab in unresectable hepatocellular carcinoma: the phase 2 RENOBATE trial
2024-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-02824-y
PMID:38374347
|
研究论文 | 本研究是一项多中心、单臂、II期临床试验，评估了瑞戈非尼联合纳武利尤单抗作为不可切除肝细胞癌一线治疗的疗效和安全性 | 首次在II期临床试验中评估瑞戈非尼联合纳武利尤单抗作为uHCC一线治疗的疗效，并通过单细胞RNA测序探索了长期应答者的免疫生物标志物 | 研究为单臂设计，缺乏对照组，样本量较小（42例患者） | 评估瑞戈非尼联合纳武利尤单抗作为不可切除肝细胞癌一线治疗的疗效和安全性，并探索免疫应答的生物标志物 | 不可切除肝细胞癌患者 | NA | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，单细胞RNA测序数据 | 42例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2025-12-03 |
Multiomic spatial landscape of innate immune cells at human central nervous system borders
2024-01, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02673-1
PMID:38123840
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、飞行时间质谱流式细胞术和单细胞空间转录组学等多种技术，全面描绘了人类中枢神经系统边界先天免疫细胞的多组学空间景观 | 首次在人类样本中系统性地揭示了中枢神经系统边界区域（如脑膜、脉络丛、血管周围间隙）先天免疫细胞（特别是CNS相关巨噬细胞，CAMs）的时空异质性和功能多样性，并比较了生理状态与疾病状态（如胶质母细胞瘤）下髓系细胞分布的差异 | 样本主要来自死后组织或手术切除样本，可能无法完全反映活体动态过程；空间转录组学分辨率虽高，但尚未达到单细胞水平；对某些罕见细胞亚群的功能验证仍需进一步实验 | 全面表征人类中枢神经系统边界区域的免疫系统组成、空间分布及在发育、健康和疾病状态下的变化 | 人类中枢神经系统边界区域的先天免疫细胞（包括小胶质细胞和CNS相关巨噬细胞），以及胶质母细胞瘤样本中的髓系细胞 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 飞行时间质谱流式细胞术, 单细胞空间转录组学, 命运图谱, 高级免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 空间转录组数据, 组织图像数据 | 来自102个个体的超过356,000个转录组；15例外周血干细胞移植患者的脑组织样本；解剖分离的胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 143 | 2025-11-30 |
Desmosome mutations impact the tumor microenvironment to promote melanoma proliferation
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.19.558457
PMID:37786690
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研究论文 | 本研究揭示了桥粒基因突变通过影响肿瘤微环境促进黑色素瘤增殖的新机制 | 首次发现桥粒基因在人类癌症中的高频突变，并阐明其通过改变角质形成细胞的微环境促进黑色素瘤增殖 | 研究主要基于原发黑色素瘤样本，未在转移性黑色素瘤中观察到相同现象 | 探究桥粒基因突变在黑色素瘤发生发展中的作用机制 | 人类黑色素瘤样本、角质形成细胞与黑色素瘤细胞共培养体系 | 肿瘤生物学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、蛋白质免疫荧光、基因敲低、细胞共培养 | 细胞共培养模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据、细胞增殖数据 | 未明确样本数量的人类黑色素瘤活检组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 144 | 2025-11-29 |
Advancing toward a unified eosinophil signature from transcriptional profiling
2024-Nov-27, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae188
PMID:39213186
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综述 | 本文总结了嗜酸性粒细胞转录谱研究的现状，探讨了技术挑战、现有研究成果和未来研究方向 | 首次系统性地总结了嗜酸性粒细胞转录谱研究的各种方法，提出了统一技术标准和跨研究比较的重要性 | 嗜酸性粒细胞存在细胞脆弱性和RNA提取困难等技术挑战，人类样本研究相对有限 | 建立统一的嗜酸性粒细胞转录特征，提高嗜酸性粒细胞相关疾病的诊断和治疗精准度 | 小鼠和人类嗜酸性粒细胞 | 单细胞组学 | 嗜酸性粒细胞相关疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 微阵列 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2025-11-29 |
Childhood-onset lupus nephritis is characterized by complex interactions between kidney stroma and infiltrating immune cells
2024-11-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adl1666
PMID:39602512
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研究论文 | 通过空间转录组学技术构建儿童狼疮性肾炎肾脏组织的单细胞分辨率图谱，揭示肾脏基质细胞与浸润免疫细胞间的复杂相互作用 | 首次在单细胞分辨率下结合空间信息分析儿童狼疮性肾炎肾脏组织，发现了免疫细胞特异性定位模式和基因表达的空间依赖性 | 样本量较小（8例患者和4例对照），组织学评分与肾小球细胞转录特征相关性较弱 | 解析儿童狼疮性肾炎的免疫发病机制和分子异质性 | 儿童狼疮性肾炎患者和对照个体的肾脏组织 | 空间转录组学 | 狼疮性肾炎 | 空间转录组学，单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | 8例儿童狼疮性肾炎患者，4例对照个体 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-11-29 |
Craters on the melanoma surface facilitate tumor-immune interactions and demonstrate pathologic response to checkpoint blockade in humans
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.18.613595
PMID:39345527
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼和人黑色素瘤模型发现表面凹陷结构促进肿瘤-免疫相互作用并预测免疫检查点阻断治疗反应 | 首次发现黑色素瘤表面凹陷结构是CD8 T细胞识别抗原和杀伤肿瘤的主要场所，并证明其预测免疫治疗反应的价值 | 研究主要基于斑马鱼模型，人类样本验证仍需扩大 | 探索免疫治疗中促进免疫应答的肿瘤微环境结构域 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 长期活体成像、高分辨率空间转录组学、多重成像 | 斑马鱼肿瘤模型 | 图像、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 147 | 2025-11-27 |
Single-Cell Multiomics Identifies Glycan Epitope LacNAc as a Potential Cell-Surface Effector Marker of Peripheral T Cells in Bladder Cancer Patients
2024-12-20, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00635
PMID:39582226
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术首次系统整合了膀胱癌患者外周血中单细胞转录组、T细胞受体谱和糖基化表位LacNAc分析 | 首次系统整合单细胞转录组、TCR谱和糖基化表位LacNAc分析，开发了不改变免疫细胞转录状态的单细胞糖组学多组学平台 | NA | 探索膀胱癌患者外周T细胞的糖基化表位标志物及其免疫功能 | 膀胱癌患者的外周血免疫细胞 | 单细胞多组学 | 膀胱癌 | 单细胞多组学，化学酶标记，DNA条形码 | NA | 单细胞转录组，T细胞受体谱，糖基化数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | 利用化学酶标记与DNA条形码的单细胞糖组学多组学平台 |
| 148 | 2025-11-26 |
Multimodal cortical neuronal cell type classification
2024-05, Pflugers Archiv : European journal of physiology
DOI:10.1007/s00424-024-02923-2
PMID:38376567
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综述 | 本文综述了大脑皮层神经元细胞类型分类方法的历史演变和当前基于单细胞转录组学的分类进展 | 整合了形态学、电生理和转录组学多模态特征，提出了皮层神经元的新型分类框架 | 承认转录组学定义的细胞类型是否对应真实功能类型仍需未来验证 | 建立可靠的大脑皮层神经元细胞类型分类系统 | 大脑皮层兴奋性和抑制性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 149 | 2025-11-25 |
PDIA3 orchestrates effector T cell program by serving as a chaperone to facilitate the non-canonical nuclear import of STAT1 and PKM2
2024-Aug-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.038
PMID:38822524
|
研究论文 | 本研究揭示了PDIA3通过促进STAT1和PKM2的非经典核输入来调控效应T细胞程序的新机制 | 首次发现PDIA3作为分子伴侣促进STAT1和PKM2的非经典核输入，调控Th1和Th17细胞分化 | PDIA3的高诱导仅发生在异常外部刺激下，这一机制可能在病理条件下特异性发生 | 探索类风湿关节炎中T细胞效应程序的调控机制 | 类风湿关节炎患者的CD4 T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 150 | 2025-11-25 |
Unveiling the NEFH+ malignant cell subtype: Insights from single-cell RNA sequencing in prostate cancer progression and tumor microenvironment interactions
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517679
PMID:39759507
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别前列腺癌中NEFH+恶性细胞亚型及其与肿瘤微环境的相互作用 | 首次发现NEFH+恶性细胞亚型位于分化末端，具有更高恶性程度，并揭示其通过PTN-NCL通路与癌症相关成纤维细胞的相互作用机制 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索前列腺癌恶性细胞亚型与肿瘤微环境相互作用的机制，为诊疗提供新见解 | 前列腺癌患者单细胞RNA测序数据及MDA PCa 2b、VCap细胞系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，基因本体分析，基因集富集分析，inferCNV分析，细胞轨迹推断，转录因子调控网络分析 | 风险评分模型，细胞通信预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2025-11-24 |
Spatial Omics Driven Crossmodal Pretraining Applied to Graph-based Deep Learning for Cancer Pathology Analysis
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160300
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研究论文 | 本研究探索利用空间转录组学数据通过对比跨模态预训练机制生成深度学习模型，以提取分子和组织学信息用于基于图的学习任务 | 首次将空间转录组学数据与组织学成像配对，通过对比跨模态预训练机制增强基于图的深度学习模型在癌症病理分析中的性能 | NA | 开发能够更好理解癌变形态学和分子基础的算法，提升基于图的深度学习在癌症病理分析中的性能 | 癌症组织病理学全切片图像和空间转录组学数据 | 数字病理学 | 癌症 | 对比跨模态预训练，基于图的深度学习 | 图神经网络 | 图像，空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 50微米分辨率定位的组织学成像与空间转录组学数据配对 |
| 152 | 2025-11-24 |
Potential to Enhance Large Scale Molecular Assessments of Skin Photoaging through Virtual Inference of Spatial Transcriptomics from Routine Staining
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160301
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研究论文 | 本研究探索从常规H&E染色组织切片推断空间转录组信息的潜力，以增强皮肤光老化的大规模分子评估 | 开发了从常规H&E染色切片推断空间转录组信息的机器学习方法，避免了昂贵空间转录组技术的限制 | 研究样本量有限（仅4名患者），且存在患者间变异性 | 增强皮肤光老化的大规模分子评估能力，为皮肤癌研究提供新方法 | 皮肤组织标本，特别是基底细胞癌和鳞状细胞癌手术切除部位邻近的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间转录组学，全玻片成像，机器学习 | 机器学习模型 | 图像，转录组数据 | 来自261个皮肤标本队列中的4名患者 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组分析，50微米分辨率，分析超过18,000个基因 |
| 153 | 2025-11-24 |
Enhancing Spatial Transcriptomics Analysis by Integrating Image-Aware Deep Learning Methods
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160299
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研究论文 | 提出一种整合空间转录组学和组织病理学图像的深度学习方法，以更好地识别癌症组织中的生物学模式 | 首次将空间转录组学数据与组织病理学图像通过深度学习模型相结合，利用ResNet提取形态学特征，实现图像感知的特征发现 | 方法主要针对胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌等特定癌症类型，在其他疾病中的适用性有待验证 | 开发能够整合空间转录组学和图像数据的分析方法，以更好地理解癌症组织的空间异质性 | 胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学，深度学习 | ResNet-50, Louvain聚类 | 空间基因表达数据，高分辨率全切片组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 154 | 2025-11-20 |
OneSC: A computational platform for recapitulating cell state transitions
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596831
PMID:38895453
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研究论文 | 介绍OneSC计算平台，用于通过随机微分方程系统模拟细胞状态转换 | 不同于现有网络推断方法，OneSC优先生成能够产生忠实细胞状态转换和稳定细胞状态的布尔网络 | NA | 开发计算平台以模拟细胞状态转换和细胞命运决策 | 小鼠骨髓祖细胞及其分化轨迹 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机微分方程系统，布尔网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 155 | 2025-11-19 |
ELLA: Modeling Subcellular Spatial Variation of Gene Expression within Cells in High-Resolution Spatial Transcriptomics
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.23.614515
PMID:39386706
|
研究论文 | 提出一种名为ELLA的计算方法，用于建模高分辨率空间转录组学中亚细胞水平的基因表达空间变异 | 创建统一细胞坐标系锚定不同细胞形态，利用非均匀泊松过程建模空间计数数据，采用表达梯度函数表征亚细胞表达模式 | NA | 开发计算工具分析高分辨率空间转录组数据中的亚细胞基因表达定位 | mRNA的亚细胞定位模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 非均匀泊松过程 | 空间基因表达数据 | 四个不同技术的空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 156 | 2025-11-19 |
Mapping single-cell developmental potential in health and disease with interpretable deep learning
2024-Mar-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.19.585637
PMID:38562882
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研究论文 | 开发了可解释的深度学习框架CytoTRACE 2，用于从单细胞RNA测序数据中表征细胞发育潜能和分化状态 | 首次在绝对尺度上量化细胞潜能，在31个数据集上优于现有方法，能够重建胚胎发育时间层次并发现与癌症预后相关的细胞表型 | 仅基于scRNA-seq数据，未整合其他组学数据验证 | 表征单细胞发育潜能和分化状态 | 人类和小鼠单细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞RNA测序数据 | 31个人类和小鼠scRNA-seq数据集，涵盖28种组织类型，62个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2025-11-18 |
Spatial transcriptomics reveals influence of microenvironment on intrinsic fates in melanoma therapy resistance
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601416
PMID:39005406
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序揭示了黑色素瘤治疗耐药性中细胞内在状态与肿瘤微环境的共同影响 | 首次在单细胞分辨率上证明耐药命运同时受细胞内在状态和肿瘤微环境共同塑造，并发现不同耐药程序在个体肿瘤中共存 | 研究主要基于异种移植模型，人类患者样本验证仍需进一步扩展 | 探索黑色素瘤治疗耐药性中细胞内在因素与微环境因素的相互作用机制 | 黑色素瘤细胞系、患者肿瘤样本和异种移植模型 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 共识非负矩阵分解 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个细胞系和患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2025-11-17 |
Lung Tissue Multilayer Network Analysis Uncovers the Molecular Heterogeneity of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-Nov-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0500OC
PMID:38626356
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研究论文 | 通过多层网络分析整合肺组织多组学数据，揭示慢性阻塞性肺疾病的分子异质性 | 首次采用多层网络方法整合mRNA、microRNA和甲基化组数据，识别出具有不同分子特征但临床表现相似的COPD患者亚群 | 研究样本仅包含135名前吸烟COPD患者，需要更大规模验证 | 揭示COPD的分子异质性及其与临床特征的关系 | 135名前吸烟COPD患者的肺组织样本 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | mRNA测序,microRNA测序,甲基化测序,空间转录组学 | 机器学习模型,多层网络分析 | 分子组学数据,临床数据 | 135名前吸烟COPD患者 | NA | 空间转录组学,单组学分析 | NA | NA |
| 159 | 2025-11-15 |
Inflammatory Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2024-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.24.630257
PMID:39763863
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研究论文 | 本研究通过分析HIV-1治疗中断后病毒反弹前后的血浆蛋白质组和单细胞转录组，发现可检测病毒血症前炎症单核细胞增加 | 首次在可检测HIV-1病毒反弹前观察到CD16单核细胞增加和独特转录特征 | 研究样本量有限，仅关注外周血单个核细胞 | 识别治疗停止后病毒反弹的早期信号，为延长HIV-1缓解期提供策略 | HIV-1感染者的外周血单个核细胞和血浆样本 | 单细胞组学 | HIV-1感染 | 单细胞转录组测序, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2025-11-15 |
Genetically Engineered Mouse Models for Alzheimer Disease and Frontotemporal Dementia: New Insights from Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2024-Dec-19, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.006
PMID:39743215
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的基因工程小鼠模型，重点总结了单细胞转录组学、多组学和空间转录组学研究的新发现 | 整合单细胞转录组学、多组学和空间转录组学技术为神经退行性疾病小鼠模型提供新见解 | 承认没有任何小鼠模型是完美的，存在模型局限性 | 研究神经退行性疾病的病因学和潜在治疗方法 | 基因工程小鼠模型，特别是阿尔茨海默病和额颞叶痴呆模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学, 多组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |