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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-03-05 |
Sample multiplexing for retinal single-cell RNA sequencing
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111250
PMID:39569377
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研究论文 | 本文建立了一种用于小鼠视网膜神经节细胞的单细胞RNA测序样本多重标记方法，以解决稀有细胞群体表征的挑战 | 利用胆固醇修饰的寡核苷酸进行样本多重标记，提高了数据精度，并展示了该方法在识别非标记样本中的多重细胞方面的应用 | 未明确说明样本大小或技术适用范围，可能仅限于小鼠视网膜神经节细胞研究 | 开发单细胞RNA测序样本多重标记方法，以高效表征稀有细胞群体并解析样本来源 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2026-03-05 |
Antigen specificity of clonally-enriched CD8+ T cells in multiple sclerosis
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.07.611010
PMID:39282370
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序，分析了多发性硬化症患者脑脊液和血液中的CD8+ T细胞，揭示了其克隆扩增、抗原特异性及其与EB病毒抗原的关联 | 首次结合无偏倚和靶向抗原发现方法，鉴定出多发性硬化症来源的CD8+ T细胞克隆能识别EB病毒抗原及多种新型模拟表位 | 研究样本仅来自未接受治疗的患者，且样本量相对有限，未涵盖疾病不同阶段或治疗后的变化 | 探究多发性硬化症中CD8+ T细胞的克隆特性、功能及抗原特异性 | 多发性硬化症患者及对照参与者的脑脊液和血液样本 | 单细胞组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA-seq, TCR-seq | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 一组未接受治疗的多发性硬化症患者及对照参与者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 143 | 2026-03-05 |
The cell rejuvenation atlas: leveraging network biology to identify master regulators of rejuvenation strategies
2024-09-09, Aging
DOI:10.18632/aging.206105
PMID:39264584
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SINGULAR的细胞再生图谱，通过单细胞RNA-seq和网络生物学方法，系统分析了多种再生策略在多个器官中的分子机制 | 首次构建了统一的细胞再生图谱，利用网络生物学在单细胞分辨率下比较不同再生策略，并识别了协调再生反应的主调控因子 | 未在摘要中明确提及具体限制，可能包括数据集的覆盖范围或实验验证的不足 | 旨在揭示再生策略的分子机制，以促进更全面的细胞再生干预设计 | 多种再生策略（如热量限制和部分重编程）在多个器官中的细胞 | 网络生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA-seq | 网络生物学方法 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2026-03-05 |
Protocol for flow cytometry-assisted single-nucleus RNA sequencing of human and mouse adipose tissue with sample multiplexing
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102893
PMID:38416649
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研究论文 | 本文介绍了一种用于人和小鼠脂肪组织的流式细胞术辅助单核RNA测序协议，支持样本多重分析 | 开发了一种整合流式细胞术进行质量控制、计数和精确核池化的新工作流程，以直接加载到10x Chromium控制器，有效消除批次混淆、减少低质量核、环境RNA污染和试剂浪费 | NA | 优化脂肪组织的单细胞RNA测序方法，克服脂肪细胞大小、脆弱性和商业试剂盒成本限制 | 人和小鼠的脂肪组织 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium控制器 |
| 145 | 2026-03-05 |
Niche-DE: niche-differential gene expression analysis in spatial transcriptomics data identifies context-dependent cell-cell interactions
2024-01-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03159-6
PMID:38217002
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研究论文 | 本文提出了一种名为niche-DE的新统计方法，用于分析空间转录组数据中的细胞类型特异性生态位相关基因，并开发了niche-LR方法来揭示配体-受体信号机制 | 首次专注于识别由细胞间相互作用驱动的局部基因表达变化，而非全局基因表达变异，适用于不同分辨率的空间转录组数据 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 开发统计方法以分析空间转录组数据中的细胞类型特异性生态位相关基因和配体-受体信号机制 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | niche-DE, niche-LR | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 146 | 2026-03-04 |
Protocol for isolating specific C. elegans neuron types for bulk and single-cell RNA sequencing
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103439
PMID:39514392
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研究论文 | 本文介绍了一种从秀丽隐杆线虫中分离特定神经元类型以进行批量或单细胞RNA测序的详细实验方案 | 提供了一种针对秀丽隐杆线虫特定神经元类型的标准化分离流程，适用于幼虫和成年动物，结合了荧光激活细胞分选技术 | 该方案可能依赖于特定的荧光标记或遗传工具，且未在多种神经元类型或复杂条件下进行广泛验证 | 开发一种用于分离秀丽隐杆线虫特定神经元类型以进行基因表达分析的实验方案 | 秀丽隐杆线虫的特定神经元类型 | 单细胞测序 | NA | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2026-03-04 |
Immune responses in checkpoint myocarditis across heart, blood and tumour
2024-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08105-5
PMID:39506125
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术，揭示了免疫检查点抑制剂相关心肌炎（irMyocarditis）患者心脏、血液和肿瘤组织中的免疫反应特征 | 首次在irMyocarditis患者中同时分析心脏、血液和肿瘤组织的单细胞转录组与T细胞受体谱，揭示了心脏扩增的T细胞克隆与肿瘤组织不重叠，并发现循环血液中特定CD8 T细胞群与致命性病例相关 | 样本量相对有限（28例患者），未明确心脏自身抗原，且机制性因果关系仍需进一步验证 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制及其与抗肿瘤免疫的关系 | 免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者的心脏组织、血液样本及配对肿瘤组织 | 单细胞组学与免疫学 | 心肌炎（免疫相关不良反应） | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，多重显微成像，蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据，T细胞受体序列数据，显微图像，蛋白质组数据 | 28例irMyocarditis患者，41例未受影响个体；共分析84,576个心脏细胞和366,066个血液细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 148 | 2026-03-04 |
Single-Cell Transcriptomic Dataset of RPGR-associated Retinitis Pigmentosa Patient-Derived Retinal Organoids
2024-11-26, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-04124-z
PMID:39592612
|
研究论文 | 本研究利用源自正常和RPGR突变人诱导多能干细胞（hiPSC）的视网膜类器官，通过单细胞RNA测序技术，构建了RPGR相关视网膜色素变性（XLRP）的单细胞转录组数据集，旨在探索疾病机制并为靶向治疗开发提供数据支持 | 首次在RPGR相关XLRP中，利用患者来源的视网膜类器官在四个关键发育时间点（40、90、150、200天）进行大规模单细胞转录组测序，生成了高质量、可靠的细胞类型注释数据集 | 研究主要基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内视网膜的复杂微环境；样本数量相对有限，且仅针对RPGR一种突变类型 | 探索RPGR基因突变导致光感受器功能障碍的分子机制，并为X连锁视网膜色素变性的靶向治疗开发提供数据资源和参考 | 源自正常和RPGR突变人诱导多能干细胞（hiPSC）的视网膜类器官 | 单细胞组学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 71,096个细胞（对照组33,839个，RPGR突变组37,257个），覆盖四个发育时间点（40、90、150、200天） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2026-03-04 |
Temporal single-cell RNA sequencing dataset of gastroesophagus development from embryonic to post-natal stages
2024-11-16, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-04081-7
PMID:39550363
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研究论文 | 本文提供了一个小鼠从胚胎到出生后阶段的胃食管发育时间序列单细胞RNA测序数据集，用于研究胃食管鳞柱状交界处的转录动态 | 首次提供了覆盖胃食管发育全过程的全面单细胞RNA测序数据集，整合了外部数据集并通过类器官和动物模型验证，揭示了组织微环境中的发育模式和信号网络 | 数据集仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类胃食管疾病的复杂性，且未直接应用于癌症干预策略的开发 | 研究胃食管鳞柱状交界处的发育动态和稳态失调，以阐明癌症发病机制 | 小鼠的食管、胃和胃食管鳞柱状交界处在胚胎、新生儿和成年阶段的细胞 | 单细胞组学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠从胚胎到成年多个发育阶段的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 150 | 2026-03-04 |
Biologically informed machine learning modeling of immune cells to reveal physiological and pathological aging process
2024-Oct-24, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00479-4
PMID:39449067
|
研究论文 | 本研究构建了涵盖人类从新生儿到超百岁老人生命周期的首个免疫细胞转录组图谱，通过生物信息学与机器学习方法揭示免疫细胞在生理和病理衰老过程中的变化 | 首次构建覆盖全生命周期的免疫细胞转录组图谱，开发了适用于单细胞和批量RNA-seq数据的生物年龄预测模型PHARE，并发现儿科COVID-19患者和冠状动脉疾病患者存在加速衰老现象 | 研究主要基于转录组数据，可能未完全涵盖蛋白质组或表观遗传层面的衰老变化；样本年龄分布可能存在不均匀性 | 探究衰老如何塑造免疫细胞功能，为不同生命阶段的精准治疗提供依据 | 人类免疫细胞（涵盖新生儿至超百岁老人） | 机器学习 | 老年疾病 | RNA-seq | 机器学习模型（PHARE） | 转录组数据 | 涵盖从新生儿到超百岁老人的多年龄段人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 151 | 2026-03-04 |
Sex-dependent APOE4 neutrophil-microglia interactions drive cognitive impairment in Alzheimer's disease
2024-Oct, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03122-3
PMID:38961225
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术，揭示了APOE4女性携带者中一种新型中性粒细胞亚群与认知障碍的关联，并提出了靶向IL-17F的治疗策略 | 首次在APOE4女性阿尔茨海默病患者中发现与认知障碍相关的特定中性粒细胞亚群，并阐明其通过IL-17F/IL-17RA轴抑制小胶质细胞功能的机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类队列，需要在更大规模人群中验证；治疗策略的临床转化效果尚待评估 | 探究APOE4基因型在阿尔茨海默病中的性别特异性免疫机制 | APOE4携带者的中性粒细胞与小胶质细胞 | 单细胞组学与神经免疫学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序，多重流式细胞术 | NA | 转录组数据，流式细胞数据 | 两个独立的APOE4女性AD患者队列（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 152 | 2026-03-04 |
mosna reveals different types of cellular interactions predictive of response to immunotherapies and survival in cancer
2024-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532947
PMID:36993595
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研究论文 | 本文介绍了一个名为mosna的Python包，用于分析空间组学数据，以预测癌症免疫疗法反应和生存率 | 开发了一个兼容多种空间组学方法的分析工具，能整合临床数据并识别预测性细胞交互特征 | NA | 开发一个分析空间组学数据的工具，以预测免疫疗法反应和癌症生存率 | 空间组学数据，包括转录组学和蛋白质组学数据 | 数字病理学 | 癌症 | 空间组学，包括MERFISH、seqFISH、CODEX、MIBI-TOF、免疫荧光和10x Visium | 机器学习模型 | 空间组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium |
| 153 | 2026-03-04 |
Single-cell DNA methylation analysis tool Amethyst reveals distinct noncanonical methylation patterns in human glial cells
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.13.607670
PMID:39211069
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Amethyst的综合性R软件包，用于处理和分析图谱规模的单细胞甲基化测序数据 | 开发了首个用于图谱规模单细胞甲基化测序数据分析的综合性R软件包Amethyst，并利用该工具在人类大脑数据集中发现并描述了星形胶质细胞和少突胶质细胞中存在非典型甲基化模式，挑战了该甲基化形式主要与大脑神经元相关的传统观点 | 未明确提及具体局限性 | 开发单细胞甲基化测序数据分析工具，并探索人类胶质细胞中的甲基化模式 | 人类外周血单个核细胞（PBMC）、人类大脑皮层细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞甲基化测序 | NA | 甲基化测序数据 | NA | NA | 单细胞甲基化测序 | NA | NA |
| 154 | 2026-03-04 |
Single-cell profile reveals the landscape of cardiac immunity and identifies a cardio-protective Ym-1hi neutrophil in myocardial ischemia-reperfusion injury
2024-04-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.02.003
PMID:38395651
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了心肌缺血再灌注损伤中免疫细胞的动态变化，并鉴定出一种具有心脏保护作用的Ym-1hi中性粒细胞亚型 | 首次在MIRI中通过单细胞测序系统描绘了心脏免疫细胞景观，并发现了一种新型的Ym-1hi中性粒细胞亚型，该亚型具有心脏保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证相对有限 | 探究心肌缺血再灌注损伤中免疫细胞亚型及其动态变化，并鉴定具有保护作用的细胞亚型 | 小鼠心肌组织中的CD45阳性免疫细胞，以及临床患者样本 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠心肌组织在六个时间点采集的CD45细胞，以及临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 155 | 2026-03-03 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify COL6A3 as a prognostic biomarker in undifferentiated pleomorphic sarcoma
2024-Nov-15, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02168-8
PMID:39548577
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学技术，鉴定COL6A3作为未分化多形性肉瘤的预后生物标志物 | 首次结合单细胞和空间转录组学分析未分化多形性肉瘤及其亚型，发现COL6A3和BGN基因能预测生存和转移，且COL6A3优于现有肉瘤预后基因组合 | 样本量较小（单细胞分析仅5个活检样本和1个切除样本），需在更大队列中验证 | 更好表征未分化多形性肉瘤及其亚型（如非典型纤维黄色瘤和多形性真皮肉瘤），并识别预后生物标志物 | 未分化多形性肉瘤、非典型纤维黄色瘤和多形性真皮肉瘤的肿瘤样本 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 5个活检样本（AFX和PDS）和1个切除样本（PDS），另加独立队列46个和38个UPS肿瘤 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 156 | 2026-03-03 |
Recovering single-cell expression profiles from spatial transcriptomics with scResolve
2024-Oct-21, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100864
PMID:39326411
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研究论文 | 本文开发了一种名为scResolve的方法，用于从多细胞分辨率空间转录组学数据中恢复单细胞表达谱 | scResolve能够准确恢复单个细胞在其位置上的表达谱，这是细胞类型去卷积方法无法实现的，并支持细胞类型特异性差异基因表达分析和稀有细胞群体的准确识别 | NA | 开发一种从空间转录组学测量中恢复单细胞表达谱的方法，以克服现有技术缺乏单细胞分辨率的问题 | 人类乳腺癌数据和人类肺部疾病数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学测量数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 157 | 2026-03-03 |
A single-cell RNA-seq dataset describing macrophages in NSCLC tumor and peritumor tissues
2024-10-01, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03885-x
PMID:39353975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序生成了非小细胞肺癌肿瘤及瘤周组织中巨噬细胞的转录组数据集，以探究其在肿瘤微环境中的特征差异和相关性 | 首次基于单细胞RNA测序技术，全面描述了NSCLC肿瘤与瘤周组织中巨噬细胞的转录组特征，填补了该领域在组织特异性差异方面的知识空白 | 研究仅提供了数据集，未进行深入的机制或功能验证分析，且样本来源和数量未在摘要中明确说明 | 探究非小细胞肺癌肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞的特性，以理解NSCLC的进展并识别临床治疗靶点 | 非小细胞肺癌肿瘤及瘤周组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 158 | 2026-03-03 |
A single-cell transcriptomic dataset of pluripotent stem cell-derived astrocytes via NFIB/SOX9 overexpression
2024-09-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03823-x
PMID:39256463
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序，构建了NFIB/SOX9过表达诱导人多能干细胞分化为星形胶质细胞的全面转录组图谱 | 首次利用单细胞RNA测序技术，系统描绘了NFIB/SOX9过表达诱导星形胶质细胞分化的详细路径和分子特征 | 诱导星形胶质细胞的精确分化路径和分子特征仍未完全阐明 | 解析NFIB/SOX9诱导星形胶质细胞分化的分子机制，为神经系统疾病研究提供模型 | 人多能干细胞（iPSCs）及其NFIB/SOX9过表达诱导分化的星形胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 64,736个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 159 | 2026-03-03 |
Identification of four mitochondria-related genes in sepsis based on RNA sequencing technology
2024-05-16, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00623-1
PMID:38755528
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研究论文 | 本研究通过RNA测序技术识别并分析了与脓毒症相关的线粒体基因，以阐明脓毒症免疫的潜在机制 | 结合RNA测序、生物信息学分析和单细胞测序，识别出四个与脓毒症预后显著负相关的线粒体基因（FIS1、FKBP8、GLRX5、GUK1），并验证了其诊断价值 | 样本量较小（脓毒症组20例，SIRS组12例），且为单中心研究，可能限制结果的普遍性 | 识别与脓毒症患者相关的线粒体基因，以阐明脓毒症免疫的潜在机制并提供临床治疗新思路 | 脓毒症和全身炎症反应综合征（SIRS）患者的住院病例 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序 | NA | RNA（mRNA）序列数据 | 脓毒症组20例，SIRS组12例，总计32例 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞测序用于明确核心基因的定位 |
| 160 | 2026-03-03 |
Wnt pathway inhibition with the porcupine inhibitor LGK974 decreases trabecular bone but not fibrosis in a murine model with fibrotic bone
2024-May, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziae011
PMID:38577521
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研究论文 | 本研究通过使用porcupine抑制剂LGK974抑制Wnt通路，探究其在G-GPCR信号过度激活的小鼠模型中，对骨纤维化和骨小梁形成的影响 | 首次在G-GPCR信号过度激活的骨纤维化小鼠模型中，应用单细胞RNA测序技术分析Wnt配体表达变化，并评估LGK974对骨小梁和纤维化的特异性作用 | LGK974仅部分减少骨小梁，对骨纤维化无显著改善，且在对照小鼠中引起明显骨丢失，提示其治疗潜力有限且存在副作用 | 探索Wnt通路抑制作为骨纤维化疾病（如纤维性发育不良）潜在治疗策略的效果 | 9周龄雄性ColI(2.3)/Rs1小鼠及其同窝对照小鼠的长骨基质细胞 | 数字病理学 | 骨纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型（ColI(2.3)/Rs1转基因小鼠） | RNA测序数据 | ColI(2.3)/Rs1小鼠及同窝对照小鼠的长骨基质细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |