单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7855 篇文献，本页显示第 1561 - 1580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2024-11-21 |
Protocol of a prospective multicenter study on comorbidity impact on multiple sclerosis and antibody-mediated diseases of the central nervous system (COMMIT)
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380025
PMID:39021565
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研究论文 | 本研究旨在探讨共病对多发性硬化症（MS）和中樞神經系統抗体介导疾病（如NMOSD和MOGAD）的影响 | 采用多中心前瞻性研究设计，结合多种先进技术（如无靶向蛋白质组学、超灵敏ELISA、RT-qPCR、质谱流式细胞术和单细胞RNA测序）分析炎症和神经退行性标志物 | NA | 评估共病对MS、NMOSD和MOGAD的影响，并探索可能的治疗方法以改善这些疾病的结果 | 多发性硬化症患者、NMOSD患者、MOGAD患者以及健康对照者 | NA | 多发性硬化症 | 无靶向蛋白质组学、超灵敏ELISA、RT-qPCR、质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 血液和脑脊液中的炎症和神经退行性标志物 | NA |
| 1562 | 2024-11-21 |
Unraveling the landscape of non-melanoma skin cancer through single-cell RNA sequencing technology
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1500300
PMID:39558960
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术揭示非黑色素瘤皮肤癌的肿瘤内异质性和药物耐药机制的研究进展 | 利用单细胞RNA测序技术全面分析非黑色素瘤皮肤癌的基因表达异质性，揭示肿瘤内异质性和药物耐药机制 | 文章主要为综述性质，未提供新的实验数据或模型 | 探讨非黑色素瘤皮肤癌的肿瘤内异质性和药物耐药机制，并提出未来研究方向 | 非黑色素瘤皮肤癌，包括基底细胞癌、皮肤鳞状细胞癌和默克尔细胞癌 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1563 | 2024-11-21 |
Single-cell RNA sequencing analysis identifies acute changes in the tumor microenvironment induced by interferon α gene therapy in a murine bladder cancer model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1387229
PMID:39559365
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研究论文 | 研究了在小鼠膀胱癌模型中，干扰素α基因疗法对肿瘤微环境的影响，并通过单细胞RNA测序分析了急性变化 | 首次在小鼠膀胱癌模型中使用单细胞RNA测序分析干扰素α基因疗法对肿瘤微环境的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探讨干扰素α基因疗法对膀胱癌肿瘤微环境的影响，并寻找提高患者选择和治疗效果的机制 | 小鼠膀胱癌模型中的肿瘤细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠膀胱组织中的单个细胞 |
| 1564 | 2024-11-21 |
Single-cell sequencing unveils mitophagy-related prognostic model for triple-negative breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1489444
PMID:39559367
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据构建了一个与三阴性乳腺癌相关的线粒体自噬相关基因的预后模型 | 首次构建了基于线粒体自噬相关基因的三阴性乳腺癌预后模型，并验证了其在多个独立队列中的预测准确性 | NA | 研究线粒体自噬在三阴性乳腺癌中的预后意义 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 多个独立队列的数据 |
| 1565 | 2024-11-20 |
Machine learning based analysis of single-cell data reveals evidence of subject-specific single-cell gene expression profiles in acute myeloid leukaemia patients and healthy controls
2024-Dec, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
DOI:10.1016/j.bbagrm.2024.195062
PMID:39366464
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和机器学习方法，分析了急性髓系白血病（AML）患者和健康对照者的单细胞基因表达谱 | 发现AML患者和健康对照者的基因表达谱可以在个体水平上以高准确率（>70%）进行分类，表明存在个体特异性的单细胞转录组学特征 | NA | 探索急性髓系白血病患者和健康对照者的单细胞基因表达谱的个体特异性 | 急性髓系白血病患者和健康对照者的单细胞基因表达谱 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据 |
| 1566 | 2024-11-20 |
Local Controlled Delivery of IL-4 Decreases Inflammatory Bone Loss in a Murine Model of Periodontal Disease
2024-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400332
PMID:39465979
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研究论文 | 研究通过局部控制释放IL-4来减少牙周疾病小鼠模型中的炎症性骨损失 | 使用生物可降解聚合物载体局部持续释放IL-4，以靶向口腔内的巨噬细胞，减少炎症性骨损失并促进骨再生 | 研究仅在牙周疾病小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 评估使用控制药物释放策略靶向口腔内巨噬细胞的可行性 | 牙周疾病小鼠模型中的巨噬细胞 | NA | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序技术 | NA | RNA | 小鼠样本 |
| 1567 | 2024-11-20 |
Landscape of multiple tissues' gene expression pattern associated with severe sepsis: Genetic insights from Mendelian randomization and trans-omics analysis
2024-Dec-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123181
PMID:39471899
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研究论文 | 研究了与严重脓毒症相关的多组织基因表达模式，并使用孟德尔随机化和跨组学分析方法揭示了ST7L作为泛组织风险因子的作用 | 首次揭示了ST7L作为泛组织风险因子在严重脓毒症中的作用，并通过跨组学分析验证了其在树突状细胞中的表达和功能 | 研究主要基于基因表达数据和跨组学分析，缺乏对临床治疗的直接指导 | 揭示与严重脓毒症相关的多组织基因表达模式，并识别潜在的治疗靶点 | 严重脓毒症患者的基因表达模式和跨组织风险因子 | 基因组学 | 脓毒症 | 孟德尔随机化、全基因组关联研究、表达数量性状位点分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 26个队列中的12种组织类型 |
| 1568 | 2024-11-20 |
Integrated analysis of multi-omics data for the discovery of biomarkers and therapeutic targets for juvenile idiopathic arthritis
2024-Dec, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2024.100256
PMID:39554251
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研究论文 | 本研究通过多组学数据的综合分析，发现了青少年特发性关节炎的生物标志物和治疗靶点 | 首次使用两样本孟德尔随机化分析方法，揭示了血浆蛋白与青少年特发性关节炎之间的因果关系 | 研究仅限于血浆蛋白的分析，未涉及其他可能的生物标志物 | 识别和开发青少年特发性关节炎的新药物靶点和生物标志物，以提高治疗效果 | 青少年特发性关节炎及其相关血浆蛋白 | 生物信息学 | 风湿性疾病 | 两样本孟德尔随机化分析、共定位分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 蛋白质组学、转录组学 | 未具体说明样本数量 |
| 1569 | 2024-11-20 |
All the single cells: Single-cell transcriptomics/epigenomics experimental design and analysis considerations for glial biologists
2024-Nov-19, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24633
PMID:39558887
|
review | 本文为胶质生物学家提供单细胞转录组学和表观组学实验设计与分析的入门指南 | 本文针对胶质生物学领域，介绍了单细胞'组学实验的设计和分析方法，旨在帮助生物学家更好地理解和解读这些大型数据集 | NA | 提高胶质生物学家对单细胞RNA-seq数据集的分析和解读能力，确保单细胞'组学实验在胶质生物学领域严谨且可重复地推进 | 单细胞转录组学和表观组学数据集 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1570 | 2024-11-20 |
Storm: Incorporating transient stochastic dynamics to infer the RNA velocity with metabolic labeling information
2024-Nov-18, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012606
PMID:39556617
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Storm的新方法，通过解决基因表达动力学的随机微分方程，结合代谢标记信息来推断RNA速度 | Storm方法克服了以往利用确定性动力学和稳态假设的不足，能够处理涉及瞬态过程的数据，并揭示时间依赖和细胞状态特异性的转录调控 | NA | 开发一种新的方法来推断RNA速度，并揭示基因表达动力学中的瞬态和随机特性 | RNA速度、基因表达动力学、转录调控 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机微分方程 | RNA测序数据 | NA |
| 1571 | 2024-11-20 |
Deficiency of FABP7 Triggers Premature Neural Differentiation in Idiopathic Normocephalic Autism Organoids
2024-Nov-18, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406849
PMID:39556706
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研究论文 | 研究探讨了FABP7缺乏在自闭症谱系障碍（ASD）患者脑类器官中引发的神经干细胞过早分化现象 | 揭示了FABP7/MEK通路在ASD患者神经干细胞异常分化中的作用，并提出了潜在的治疗靶点 | NA | 探究FABP7缺乏在ASD患者脑类器官中引发的神经干细胞过早分化的分子机制 | 自闭症谱系障碍（ASD）患者的脑类器官 | 数字病理学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个细胞系和时间序列样本 |
| 1572 | 2024-11-20 |
PD-L1 promotes tumor metastasis by regulating the infiltration of FGFBP2(+)Tm cells in colorectal cancer
2024-Nov-18, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03223-w
PMID:39558101
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研究论文 | 研究探讨了PD-L1在结直肠癌中通过调节FGFBP2(+)Tm细胞的浸润促进肿瘤转移的作用 | 首次揭示了PD-L1通过抑制CXCL9和CXCL10的分泌，减少记忆T细胞的浸润，从而促进结直肠癌的转移 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本，缺乏更大规模的人类临床试验验证 | 探讨PD-L1在结直肠癌中的作用及其对肿瘤转移的影响 | PD-L1、FGFBP2(+)记忆T细胞、结直肠癌及其转移 | NA | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 包括外周血、淋巴结、结肠息肉、原发肿瘤和肝转移样本 |
| 1573 | 2024-11-20 |
Novel integrated multiomics analysis reveals a key role for integrin beta-like 1 in wound scarring
2024-Nov-18, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00322-3
PMID:39558136
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研究论文 | 本文开发了一种新型的高分辨率空间多组学方法，结合空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示了整合素β样1在伤口瘢痕形成中的关键作用 | 本文创新性地开发了一种高分辨率的空间多组学方法，结合空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示了细胞间通信和信号传导在修复过程中的新特征 | NA | 研究伤口修复过程中分子和空间组织的单细胞水平关系，揭示炎症相关瘢痕形成的分子机制 | 伤口微环境中的纤维母细胞及其在炎症介导的遗传变化后的瘢痕形成作用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了PU.1小鼠模型和人类及小鼠的初级纤维母细胞 |
| 1574 | 2024-11-20 |
scCancerExplorer: a comprehensive database for interactively exploring single-cell multi-omics data of human pan-cancer
2024-Nov-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1100
PMID:39558175
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研究论文 | 开发了一个名为scCancerExplorer的综合数据库，用于交互式探索人类泛癌的单细胞多组学数据 | 填补了缺乏专门用于交互式探索人类泛癌单细胞多组学数据的数据库的空白 | NA | 开发一个用户友好的数据库，促进对单细胞基因组、表观基因组和转录组数据的探索 | 人类泛癌的单细胞基因组、表观基因组和转录组数据 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞多组学 | NA | 基因组、表观基因组和转录组数据 | 50种癌症类型 |
| 1575 | 2024-11-20 |
Single-cell expression and immune infiltration analysis of polyamine metabolism in breast cancer
2024-Nov-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01524-w
PMID:39549127
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和系统免疫学方法分析了乳腺癌中多胺代谢与免疫浸润的关系 | 首次结合单细胞RNA测序和系统免疫学方法，探讨了乳腺癌中多胺代谢与免疫微环境的相互作用 | 研究样本主要来自TCGA和GEO数据库，可能存在数据偏差 | 探讨乳腺癌中多胺代谢与免疫浸润的关系，为个性化治疗提供新思路 | 乳腺癌样本中的多胺代谢与免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 46个乳腺癌增殖相关共表达模块 |
| 1576 | 2024-11-20 |
Single-cell data revealed the regulatory mechanism of TNK cell heterogeneity in liver metastasis from gastric cancer
2024-Nov-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01528-6
PMID:39549183
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析了胃癌肝转移中TNK细胞异质性的调控机制 | 首次揭示了TNK细胞亚群在胃癌肝转移中的关键作用及其调控机制 | NA | 分类与胃癌肝转移相关的细胞亚群，并探讨其与其他免疫细胞亚群的相互作用机制 | 胃癌肝转移中的TNK细胞亚群及其调控机制 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | GSE163558数据集中的胃癌患者及其转移组样本 |
| 1577 | 2024-11-20 |
Temporal single-cell RNA sequencing dataset of gastroesophagus development from embryonic to post-natal stages
2024-Nov-16, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-04081-7
PMID:39550363
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研究论文 | 本文介绍了从胚胎到出生后阶段的小鼠胃食管发育的单细胞RNA测序数据集的技术质量 | 提供了全面的单细胞RNA测序数据集，捕捉了食管、胃和胃食管鳞柱交界处（GE-SCJ）在胚胎、新生儿和成年阶段的转录动态 | 未提及 | 研究胃食管交界处的发育和稳态失调，以阐明癌症发病机制 | 小鼠的食管、胃和胃食管鳞柱交界处（GE-SCJ） | 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多个胚胎、新生儿和成年阶段的小鼠样本 |
| 1578 | 2024-11-20 |
Single cell and spatial transcriptomics highlight the interaction of club-like cells with immunosuppressive myeloid cells in prostate cancer
2024-Nov-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54364-1
PMID:39550375
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，研究了前列腺癌微环境中俱乐部样细胞与免疫抑制性髓系细胞的相互作用 | 首次揭示了俱乐部样细胞在前列腺癌微环境中的关键作用，及其与免疫抑制性髓系细胞的关联 | 研究样本仅限于120名患者，可能无法全面代表所有前列腺癌患者的情况 | 探讨前列腺癌治疗耐药性的机制及其与肿瘤微环境的关系 | 前列腺癌中的俱乐部样细胞和免疫抑制性髓系细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 120名前列腺癌患者 |
| 1579 | 2024-11-20 |
GPRC5A promotes lung colonization of esophageal squamous cell carcinoma
2024-Nov-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54251-9
PMID:39550386
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研究论文 | 研究揭示了GPRC5A在食管鳞状细胞癌早期肺转移中的作用及其分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了食管鳞状细胞癌早期肺转移细胞的滋养层样'肿瘤植入'表型，并发现GPRC5A通过与WWP1相互作用促进LATS1的泛素化和降解，从而激活YAP1信号通路，促进肿瘤的植入和生长 | 研究样本量较小，仅涉及148例食管鳞状细胞癌患者，可能影响结果的普适性 | 探讨食管鳞状细胞癌早期肺转移的机制及潜在治疗靶点 | 食管鳞状细胞癌的早期肺转移细胞及其分子机制 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 148例食管鳞状细胞癌患者 |
| 1580 | 2024-11-19 |
Chrysalis: decoding tissue compartments in spatial transcriptomics with archetypal analysis
2024-Nov-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07165-7
PMID:39550461
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Chrysalis的计算方法，用于在空间转录组学中通过空间变异基因检测和原型分析快速揭示组织区室，无需外部参考数据 | Chrysalis方法无需外部参考数据，通过空间变异基因检测和原型分析快速揭示组织区室，并提供独特的可视化方法 | NA | 开发一种无需外部参考数据的空间转录组学组织区室解析方法 | 空间转录组学中的组织区室 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 原型分析 | 基因表达数据 | NA |