单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 1561 - 1580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2025-10-07 |
Prognostic and immunotherapeutic potential of regulatory T cell-associated signature in ovarian cancer
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18248
PMID:38520220
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别Treg相关生物标志物，开发了卵巢癌预后模型并评估其免疫治疗潜力 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习算法构建Treg相关特征评分，用于卵巢癌预后预测和免疫治疗反应评估 | 需要进一步的外部验证和临床转化研究 | 探索调节性T细胞相关基因在卵巢癌中的预后价值和免疫治疗潜力 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习 | 随机生存森林(RSF), LASSO | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量，但识别了365个Treg相关基因 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1562 | 2025-10-07 |
Construction of a prognostic model with CAFs for predicting the prognosis and immunotherapeutic response of lung squamous cell carcinoma
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18262
PMID:38520221
|
研究论文 | 本研究构建了基于癌症相关成纤维细胞(CAFs)的预后模型，用于预测肺鳞状细胞癌(LUSC)的预后和免疫治疗反应 | 首次在LUSC中系统分类CAFs亚型并构建包含9个CAF相关基因的预后特征模型 | CAFs在LUSC中的功能复杂且不确定，需要进一步验证 | 开发预测LUSC预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 | 肺鳞状细胞癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单变量Cox分析, 多变量Cox分析, ssGSEA, Kaplan-Meier分析 | Cox比例风险模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1563 | 2025-10-07 |
Synthetic control removes spurious discoveries from double dipping in single-cell and spatial transcriptomics data analyses
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.21.550107
PMID:37546812
|
研究论文 | 提出一种名为ClusterDE的统计方法，用于识别单细胞和空间转录组数据分析中可靠的细胞类型和空间域标记基因 | 通过生成合成零数据作为阴性对照，有效控制假发现率并消除因双重检验导致的虚假发现 | NA | 解决单细胞和空间转录组数据分析中的双重检验问题，识别可靠的差异表达基因 | 单细胞转录组数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 统计方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1564 | 2025-04-10 |
scRNA-Seq reveals age-dependent microglial evolution as a determinant of immune response following spinal cord injury
2024-12, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脊髓损伤后不同年龄组小胶质细胞的亚型及其功能差异 | 首次系统性地鉴定了脊髓损伤后年龄依赖性小胶质细胞亚型演化及其免疫功能差异 | 研究主要基于生物信息学分析，动物模型验证样本量有限 | 探究年龄因素如何通过小胶质细胞亚型影响脊髓损伤后的免疫反应 | 脊髓损伤后的小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, 免疫荧光染色 | 伪时间轨迹分析, CellChat细胞通讯分析 | 基因表达数据 | 整合GEO数据库中多个数据集的小鼠模型样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1565 | 2025-04-10 |
Investigating the mechanisms of inflammation and immune alterations in Parkinson's disease using spatial transcriptomics techniques
2024-10-15, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探究帕金森病中炎症和免疫改变的机制 | 首次在MPTP诱导的帕金森病小鼠模型中应用空间转录组学技术，揭示了中脑黑质区域的病理变化与铁死亡之间的关联 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究帕金森病中炎症和免疫改变的分子机制 | MPTP诱导的帕金森病小鼠模型 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 空间转录组测序 | MPTP诱导的小鼠模型 | 转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1566 | 2025-04-10 |
Deciphering brain cellular and behavioral mechanisms: Insights from single-cell and spatial RNA sequencing
2024 Jul-Aug, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
DOI:10.1002/wrna.1865
PMID:38972934
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在脑研究中的应用及其潜在问题和挑战 | 深入探讨了单细胞和空间RNA测序与神经科学多个方向的整合潜力，包括神经发育、新型脑微结构识别等 | 未具体说明数据处理中的具体技术限制或样本量限制 | 理解单个细胞或细胞类型在特定脑功能中的作用 | 脑细胞及其在脑功能中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1567 | 2025-10-07 |
Transcriptomic Analysis of Air-Liquid Interface Culture in Human Lung Organoids Reveals Regulators of Epithelial Differentiation
2024-12-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13231991
PMID:39682739
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析气液界面培养对人肺类器官上皮分化的影响 | 首次使用单细胞RNA测序全面分析ALI培养对肺上皮细胞分化的调控机制 | NA | 识别影响上皮细胞分化的关键因素 | 人肺类器官上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1568 | 2025-10-07 |
Mucosal Single-Cell Profiling of Crohn's-Like Disease of the Pouch Reveals Unique Pathogenesis and Therapeutic Targets
2024-Dec, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.025
PMID:39084267
|
研究论文 | 通过单细胞分析技术研究克罗恩样储袋病(CDP)的黏膜细胞特征，揭示其独特发病机制和潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平系统描绘CDP的细胞图谱，发现内质网应激在免疫和非免疫细胞中普遍增强的独特特征 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 探究克罗恩样储袋病(CDP)的病理生理机制和潜在治疗靶点 | 接受回肠储袋肛管吻合术患者的黏膜组织样本 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 50例患者 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 1569 | 2025-10-07 |
Novel Perspective on Sevoflurane-Induced Cognitive Dysfunction: Implications of Neuronal SIRPα and Microglial Synaptic Remodeling
2024-12-18, ACS chemical neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.1021/acschemneuro.4c00485
PMID:39644326
|
研究论文 | 本研究探讨神经元SIRPα和小胶质细胞突触重塑在七氟醚诱导新生小鼠认知功能障碍中的作用 | 首次揭示神经元SIRPα通过调控小胶质细胞功能改善七氟醚诱导的认知障碍，并发现IRF8与SIRPα表达的相关性 | 研究仅针对新生小鼠，未验证其他年龄阶段；转录组分析显示皮质小胶质细胞和神经元无显著变化 | 阐明七氟醚诱导认知功能障碍的分子机制 | 新生小鼠 | 神经科学 | 认知功能障碍 | 单细胞转录组测序, 慢病毒过表达, SCENIC分析 | NA | 基因表达数据, 行为学数据 | 新生小鼠皮质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1570 | 2025-10-07 |
Gene interactions analysis of brain spatial transcriptome for Alzheimer's disease
2024-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101337
PMID:39281834
|
研究论文 | 本研究通过分析阿尔茨海默病脑空间转录组数据，揭示了淀粉样蛋白-β积累过程中基因相互作用的动态变化 | 首次基于空间转录组学识别淀粉样蛋白-β积累过程中的多种基因关联，从时空依赖的基因相互作用角度为AD病因研究提供新视角 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限 | 揭示阿尔茨海默病中基因相互作用的时空动态特征 | 小鼠和人类大脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组测序,单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单核RNA-seq数据 | 敲除AD和野生型小鼠模型，不同AD小鼠模型，人类单核RNA-seq数据 | NA | 空间转录组学,单核RNA-seq | NA | NA |
| 1571 | 2025-10-07 |
Esophageal epithelial Ikkβ deletion promotes eosinophilic esophagitis in experimental allergy mouse model
2024-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.05.602313
PMID:39026724
|
研究论文 | 本研究通过构建食管上皮细胞Ikkβ条件性敲除小鼠模型，揭示了上皮IKKβ/NFκB信号通路在嗜酸性食管炎发病机制中的关键保护作用 | 首次在实验性过敏小鼠模型中证明食管上皮细胞特异性Ikkβ缺失会加剧嗜酸性食管炎病理特征，并利用单细胞RNA测序技术深入解析了上皮分化和屏障完整性的破坏机制 | 研究基于小鼠模型，其病理特征与人类疾病的完全对应性仍需进一步验证 | 探究上皮IKKβ/NFκB信号通路在嗜酸性食管炎发病机制中的作用 | 食管上皮细胞条件性Ikkβ敲除小鼠 | 单细胞测序分析 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序，RNA测序，组织学分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织学图像数据 | Ikkβ EEC-KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1572 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies PLK1 as a driver of immunosuppressive tumor microenvironment in LUAD
2024-Jun, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011309
PMID:38885192
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现PLK1是肺腺癌免疫抑制肿瘤微环境的关键驱动因子 | 首次揭示PLK1通过调控CXCL2细胞因子分泌促进肿瘤相关巨噬细胞M2极化和抑制抗原呈递过程的新机制 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，人类临床样本验证尚不充分 | 探究PLK1在肺腺癌免疫抑制肿瘤微环境形成中的作用机制 | 肺腺癌小鼠模型和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1573 | 2025-10-07 |
Automatically Detecting Anchor Cells and Clustering for scRNA-Seq Data Using scTSNN
2024-11, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3460761
PMID:39283774
|
研究论文 | 提出了一种名为scTSNN的张量共享最近邻锚点聚类方法，用于自动检测单细胞RNA测序数据中的锚点细胞并进行聚类 | 首次利用张量亲和力学习模块挖掘细胞间的局部-全局平衡拓扑结构，并设计基于密度的共享最近邻测量方法自动检测锚点细胞 | 在无监督场景下发现真实细胞类型仍然具有挑战性 | 开发自动检测锚点细胞和确定聚类数量的单细胞RNA测序数据分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 张量共享最近邻聚类模型 | 单细胞RNA测序数据 | 合成数据集和真实scRNA-seq数据集，包括哺乳动物细胞和宫颈癌肿瘤细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1574 | 2025-10-07 |
Inferring Characteristics of the Tumor Immune Microenvironment of Patients with HNSCC from Single-Cell Transcriptomics of Peripheral Blood
2024-09-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0092
PMID:39113621
|
研究论文 | 本研究探索从头颈鳞状细胞癌患者外周血单细胞转录组数据推断肿瘤免疫微环境特征的可能性 | 首次证明可从外周血单细胞RNA测序数据推断肿瘤免疫微环境中的免疫细胞比例和基因表达谱，并开发了TIMEP预测工具 | 研究样本量有限，需要在更大规模研究中验证 | 探索从外周血推断肿瘤免疫微环境特征的方法及其在癌症免疫治疗中的应用价值 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个头颈鳞状细胞癌患者数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 外周血单个核细胞和肿瘤组织的单细胞RNA测序 |
| 1575 | 2025-10-07 |
STFormer: Learning to Explore Spot Relationships for Spatial Transcriptomics Prediction from Histology of Colorectal Cancer
2024-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC53108.2024.10782295
PMID:40031511
|
研究论文 | 提出STFormer深度学习模型，通过组织学图像预测结直肠癌空间转录组数据 | 引入Style-Aug模块增强特征泛化能力，采用Cross-WSI Transformer模块有效捕获跨WSI的spot关系 | 在有限WSI数据场景下的性能表现未充分验证 | 开发从组织学图像预测空间转录组数据的成本效益方法 | 结直肠癌组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学，深度学习 | Transformer | 图像，基因表达数据 | 内部和外部数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1576 | 2025-10-07 |
Autofluorescence is a biomarker of neural stem cell activation state
2024-Apr-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.02.011
PMID:38521057
|
研究论文 | 本研究利用自发荧光成像技术识别神经干细胞静息和激活状态的生物标志物 | 首次发现静息神经干细胞在特定溶酶体亚群中富集自发荧光，可作为单细胞水平预测干细胞行为的梯度标志物 | 研究仅限于小鼠神经干细胞，技术应用范围需进一步验证 | 开发非破坏性活细胞成像方法追踪神经干细胞激活状态 | 小鼠神经干细胞 | 细胞生物学 | NA | 荧光寿命成像(FLIM), 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1577 | 2025-10-07 |
Unraveling the immunomodulatory impact of hydroxychloroquine on peripheral T cells using single-cell RNA sequencing
2024-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103324
PMID:39405653
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示羟氯喹对外周T细胞的免疫调节作用机制 | 首次在单细胞水平系统阐明羟氯喹对T细胞亚群的差异化调控作用，特别是发现其对CD8+T细胞细胞毒性的增强作用 | 研究主要基于体外实验，需要更多体内实验验证；样本量有限 | 探究羟氯喹对T细胞的免疫调节机制 | 外周T细胞（CD4+T细胞和CD8+T细胞） | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 狼疮患者样本（含羟氯喹治疗组和未治疗组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1578 | 2025-10-07 |
Cellular communication network factor 3 contributes to the pathological process of rheumatoid arthritis through promoting cell senescence and osteoclastogenesis in the joint
2024-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103334
PMID:39549484
|
研究论文 | 本研究探讨细胞通讯网络因子3在类风湿关节炎病理过程中的作用机制及治疗潜力 | 首次揭示CCN3通过促进细胞衰老和破骨细胞分化参与类风湿关节炎病理过程，并验证其抗体治疗的潜在价值 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究CCN3在类风湿关节炎中的分子功能及治疗靶点潜力 | 类风湿关节炎患者的关节组织、滑膜细胞、单核细胞及实验小鼠模型 | 病理学研究 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、体外细胞培养、动物模型实验 | 实验性关节炎动物模型 | 基因表达数据、细胞表型数据、组织病理数据 | 公共单细胞RNA测序数据集及实验动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1579 | 2025-10-07 |
EZH2 promotes B-cell autoimmunity in primary Sjogren's syndrome via METTL3-mediated m6A modification
2024-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103341
PMID:39577129
|
研究论文 | 本研究揭示了EZH2通过METTL3介导的m6A修饰促进原发性干燥综合征中B细胞自身免疫反应的机制 | 首次阐明METTL3通过m6A修饰调控EZH2表达，进而影响B细胞功能的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，需要进一步临床验证 | 探索EZH2在原发性干燥综合征B细胞自身免疫反应中的作用及治疗潜力 | 原发性干燥综合征患者外周血B细胞、唾液腺组织及三种干燥综合征小鼠模型 | 生物医学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,ChIP测序,ChIP-qPCR,流式细胞术,CFSE检测,RIP实验,放线菌素D实验,m6A-RIP-qPCR | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,临床数据 | 原发性干燥综合征患者样本和三种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序,染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 1580 | 2025-10-07 |
PAGE-based transfer learning from single-cell to bulk sequencing enhances model generalization for sepsis diagnosis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae661
PMID:39710434
|
研究论文 | 提出基于单细胞转录组的迁移学习方法scPAGE2，通过整合单细胞和批量转录组数据构建脓毒症诊断模型 | 开发了改进的差异表达基因对分析方法，实现了从单细胞到批量转录组数据的知识迁移 | 模型在更广泛疾病类型和临床场景中的适用性需要进一步验证 | 提高脓毒症诊断模型的泛化能力 | 脓毒症患者和急性髓系白血病患者的转录组数据 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序，荧光激活细胞分选 | 迁移学习 | 转录组数据 | 来自三个转录组平台和FACS的七个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |