单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7855 篇文献，本页显示第 1541 - 1560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1541 | 2024-11-21 |
Overcoming Low mRNA Expression in White Matter: A Protocol for RNA Extraction From the Optic Nerve in Large Animals for Transcriptomic Analysis
2024-Nov-04, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.13.25
PMID:39540862
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研究论文 | 本文开发了一种从大型动物视神经中提取高质量RNA的协议，用于转录组分析 | 首次发现白质中的mRNA表达水平显著低于灰质，并开发了一种专门用于大型动物视神经的RNA提取协议 | NA | 研究白质异常与中枢神经系统疾病的关系，并开发适用于大型动物视神经的RNA提取方法 | 大型动物视神经中的RNA提取 | 数字病理学 | NA | 原位杂交和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1542 | 2024-11-21 |
Annexin A1: a key regulator of T cell function and bone marrow adiposity in aplastic anaemia
2024-Nov, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP286148
PMID:39373986
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研究论文 | 研究探讨了Annexin A1在调节T细胞功能及其在再生障碍性贫血（AA）中骨髓脂肪生成中的作用 | 发现Annexin A1在AA中的显著下调，并揭示了其在疾病进展中的关键作用，为AA治疗提供了新的分子靶点 | NA | 研究Annexin A1在再生障碍性贫血中的作用及其对T细胞功能和骨髓脂肪生成的影响 | 再生障碍性贫血患者的骨髓组织和健康个体的骨髓组织 | NA | 再生障碍性贫血 | 单细胞测序分析 | NA | 组织 | 再生障碍性贫血患者和健康个体的骨髓组织样本 |
| 1543 | 2024-11-21 |
Construction and Validation of a Novel T/NK-Cell Prognostic Signature for Pancreatic Cancer Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-Nov, Cancer investigation
IF:1.8Q3
DOI:10.1080/07357907.2024.2424328
PMID:39523741
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研究论文 | 本文基于单细胞RNA测序构建并验证了一种新的胰腺癌T/NK细胞预后标志物 | 首次基于单细胞RNA测序数据构建了胰腺癌T/NK细胞的预后模型，并在外部队列中验证了其稳定性 | 研究样本量较小，仅包括3名患者的配对原发和转移肿瘤组织 | 构建并验证一种新的胰腺癌T/NK细胞预后标志物 | 胰腺癌患者的原发和转移肿瘤组织中的T/NK细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型 | 基因表达数据 | 3名胰腺癌患者的配对原发和转移肿瘤组织 |
| 1544 | 2024-11-21 |
Cell type-specific weighting-factors to solve solid organs-specific limitations of single cell RNA-sequencing
2024-Nov, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011436
PMID:39556600
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研究论文 | 本文提出了一种计算方法，通过引入细胞类型特异性权重因子（cWF）来解决单细胞RNA测序（scRNA-seq）在分析复杂实体器官时的问题 | 本文的创新点在于提出了细胞类型特异性权重因子（cWF），并通过计算方法解决了scRNA-seq在分析实体器官时的局限性 | 本文的局限性在于仅针对10种实体器官的76种细胞类型进行了验证，可能不适用于所有器官和细胞类型 | 本文的研究目的是解决单细胞RNA测序在分析复杂实体器官时的局限性 | 本文的研究对象是10种实体器官中的76种细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 10种实体器官中的76种细胞类型 |
| 1545 | 2024-11-21 |
Sex-Based Differences in Thyroid Plasma B Cell Infiltration: Implications for Autoimmune Disease Susceptibility
2024-Oct-30, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqae148
PMID:39487734
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研究论文 | 研究探讨了甲状腺中浆细胞浸润的性别差异及其对自身免疫疾病易感性的影响 | 首次研究了女性甲状腺中浆细胞的浸润情况，并揭示了CXCL13-CXCR5信号轴在浆细胞招募和组织中的关键作用 | 研究仅限于女性甲状腺，未涉及男性甲状腺的对比分析 | 探讨甲状腺中浆细胞浸润的性别差异及其对自身免疫疾病易感性的影响 | 女性甲状腺中的浆细胞浸润情况 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 1546 | 2024-11-21 |
New insight into the development of synpolydactyly caused by expansion of HOXD13 polyalanine based on weighted gene co-expression network analysis
2024-10-29, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01974-9
PMID:39472920
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）探讨了HOXD13多聚丙氨酸扩展引起的并指多指畸形（SPD）的分子机制 | 首次通过WGCNA分析揭示了HOXD13多聚丙氨酸扩展对免疫反应、破骨细胞分化和DNA复制的调控作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探讨HOXD13多聚丙氨酸扩展引起的并指多指畸形的分子机制 | HOXD13多聚丙氨酸扩展小鼠模型的肢芽细胞 | NA | 先天性畸形 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 单细胞RNA测序数据 | HOXD13+7A杂合子并指多指畸形小鼠模型的肢芽细胞 |
| 1547 | 2024-11-21 |
PD-L1 restrains PD-1+Nrp1lo Treg cells to suppress inflammation-driven colorectal tumorigenesis
2024-Oct-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114819
PMID:39368087
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研究论文 | 研究报告了PD-L1在抑制炎症驱动的结直肠癌中的作用，通过单细胞RNA测序分析揭示了PD-L1抑制PD-1Nrp1调节性T细胞和IL-6中性粒细胞的机制 | 首次揭示了PD-L1在结直肠癌中通过抑制PD-1Nrp1调节性T细胞和IL-6中性粒细胞来抑制炎症驱动的肿瘤发生 | 研究仅在老鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨PD-L1在结直肠癌中的免疫调节作用 | PD-L1、PD-1Nrp1调节性T细胞、IL-6中性粒细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老鼠模型 |
| 1548 | 2024-11-21 |
Synergic activity of FGFR2 and MEK inhibitors in the treatment of FGFR2-amplified cancers of unknown primary
2024-Oct-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.07.011
PMID:39033323
|
研究论文 | 研究探讨了FGFR2和MEK抑制剂在治疗FGFR2扩增的未知原发癌中的协同作用 | 首次在未知原发癌模型中验证了FGFR2和MEK抑制剂的协同治疗效果 | 研究仅限于两个CUP细胞系和相应的患者来源的异种移植模型 | 探索FGFR2和MEK抑制剂在治疗FGFR2扩增的未知原发癌中的潜在疗效 | 未知原发癌的细胞系和患者来源的异种移植模型 | 癌症研究 | 未知原发癌 | 荧光原位杂交分析 | NA | 基因表达数据 | 两个CUP细胞系和相应的患者来源的异种移植模型 |
| 1549 | 2024-11-21 |
Stiff Hydrogel Encapsulation Retains Mesenchymal Stem Cell Stemness for Regenerative Medicine
2024-Oct-02, Matter
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.matt.2024.05.041
PMID:39553898
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研究论文 | 研究通过微流控技术制备薄壳海藻酸盐水凝胶微胶囊，探讨其对间充质干细胞（MSC）增殖和干性的影响 | 首次通过调整海藻酸分子量控制水凝胶壳的机械性能，发现较硬的水凝胶壳能促进MSC的增殖和干性维持 | 未详细探讨不同机械性能水凝胶对MSC亚群的具体影响机制 | 探讨水凝胶封装对MSC在再生医学中应用的潜力 | 间充质干细胞（MSC）和水凝胶封装技术 | 再生医学 | NA | 微流控技术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1550 | 2024-11-21 |
Non-genetic differences underlie variability in proliferation among esophageal epithelial clones
2024-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012360
PMID:39466790
|
研究论文 | 研究了食管上皮细胞克隆在体外培养中的增殖变异性，发现非遗传因素在不同克隆的增殖能力中起重要作用 | 通过成像和细胞条形码技术追踪克隆，结合单细胞RNA测序，揭示了与高增殖克隆相关的细胞状态和基因通路 | 研究仅限于体外模型，未涉及体内环境的影响 | 探讨食管上皮细胞克隆在体外培养中的增殖变异性和相关细胞状态 | 食管上皮细胞（EPC2-hTERT）的克隆增殖行为 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 数学模型 | 图像数据和基因表达数据 | 涉及约10%的指数增长克隆和其余的非增殖克隆 |
| 1551 | 2024-11-21 |
BFAST: joint dimension reduction and spatial clustering with Bayesian factor analysis for zero-inflated spatial transcriptomics data
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae594
PMID:39552067
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研究论文 | 本文提出了一种名为BFAST的新方法，结合贝叶斯因子分析进行零膨胀空间转录组数据的降维和空间聚类 | BFAST方法在降维和空间聚类方面展示了卓越的性能，能够提取更多生物学上有意义的低维特征，从而提高聚类的准确性和精确度 | NA | 开发一种有效的方法来处理高噪声和缺失事件的空间转录组数据聚类问题 | 零膨胀空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 贝叶斯因子分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1552 | 2024-11-21 |
FixNCut: A Practical Guide to Sample Preservation by Reversible Fixation for Single Cell Assays
2024-Sep-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5063
PMID:39315321
|
研究论文 | 本文介绍了FixNCut协议的优化和实用指南，用于通过可逆固定保存单细胞样本 | FixNCut协议通过可逆固定策略，实现了样本采集与下游应用的分离，避免了应激或坏死相关的人工痕迹 | NA | 提供FixNCut协议的优化指南，以促进该方法的全面应用 | 单细胞样本的保存和分析 | NA | NA | 可逆固定 | NA | NA | NA |
| 1553 | 2024-11-21 |
Revealing novel genomic insights and therapeutic targets for juvenile idiopathic arthritis through omics
2024-09-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae078
PMID:38317060
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了幼年特发性关节炎（JIA）的新基因组见解和治疗靶点 | 发现了四个与JIA相关的新基因（CD247、RHOH、COLEC10和IRF8），并揭示了COLEC10与TNFRSF11B之间的新遗传联系，以及RHOH在正向胸腺细胞选择中的作用 | NA | 揭示幼年特发性关节炎的遗传基础和潜在治疗靶点 | 幼年特发性关节炎（JIA）的基因组和治疗靶点 | 基因组学 | 幼年特发性关节炎 | 全基因组关联研究（GWAS）、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 4550例JIA病例和18446例对照 |
| 1554 | 2024-11-21 |
Critical role of Slc22a8 in maintaining blood-brain barrier integrity after experimental cerebral ischemia-reperfusion
2024-Jul-28, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X241264401
PMID:39068534
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，识别了在脑缺血再灌注过程中调节血脑屏障破坏的关键因子Slc22a8 | 首次揭示了Slc22a8在维持血脑屏障完整性中的关键作用，并通过实验验证了其在脑缺血再灌注后的表达下调 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证Slc22a8的作用 | 探讨脑缺血再灌注后血脑屏障破坏的机制 | Slc22a8基因在小鼠脑缺血再灌注模型中的表达及功能 | NA | 脑血管疾病 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠MCAO/R模型中的多个样本 |
| 1555 | 2024-11-21 |
Revealing the molecular landscape of human placenta: a systematic review and meta-analysis of single-cell RNA sequencing studies
2024-07-01, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmae006
PMID:38478759
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综述 | 本文通过系统综述和荟萃分析单细胞RNA测序研究，揭示了人类胎盘的分子景观 | 本文通过整合多个单细胞RNA测序数据集，识别了主要胎盘细胞类型的标记基因，并强调了建立单细胞RNA测序数据注释共识的必要性 | 不同研究在采样部位、妊娠年龄、胎儿性别和后续测序及分析方法上存在差异，导致标记基因的识别存在不一致性 | 旨在通过单细胞RNA测序技术，系统综述和比较不同胎盘细胞类型的基因表达，识别共识标记基因，并探讨其在妊娠相关疾病研究中的应用 | 人类胎盘及其特异性细胞类型，包括细胞滋养层、合体滋养层和绒毛外滋养层 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了35,461个早期妊娠胎盘细胞和23,378个足月胎盘细胞 |
| 1556 | 2024-11-21 |
RNA splicing analysis deciphers developmental hierarchies and reveals therapeutic targets in adult glioma
2024-Apr-25, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173789
PMID:38662454
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研究论文 | 本文通过计算方法分析了成人胶质瘤中的RNA可变剪接（AS），揭示了与神经发育层次相关的预后AS特征，并探讨了其治疗潜力 | 本文首次揭示了AS特征与神经发育层次的关联，并验证了PTBP1作为AS特征的关键调控因子，为胶质瘤治疗提供了新的靶点 | 本文主要依赖于计算分析和体外模型验证，尚未在临床样本中进行全面验证 | 探讨成人胶质瘤中RNA可变剪接的调控机制及其在治疗中的潜在应用 | 成人胶质瘤中的RNA可变剪接及其调控因子 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及大量和单细胞RNA测序数据，具体样本数量未明确提及 |
| 1557 | 2024-11-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular and molecular landscape of fetal cystic hygroma
2024-04-22, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01859-x
PMID:38650036
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组测序技术揭示了胎儿囊性水囊瘤的细胞和分子景观 | 首次报道了胎儿囊性水囊瘤中单细胞的转录组变化，并揭示了淋巴内皮细胞在其中的富集以及VEGF信号通路的激活 | 本研究仅限于CH患者的淋巴组织，未涵盖其他可能的相关组织或细胞类型 | 探讨胎儿囊性水囊瘤的分子机制，特别是细胞亚群的转录组特征和VEGF信号通路的作用 | 胎儿囊性水囊瘤患者的淋巴组织 | 数字病理学 | 胎儿疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | CH患者和对照捐赠者的淋巴组织样本 |
| 1558 | 2024-11-21 |
Revealing Prdx4 as a potential diagnostic and therapeutic target for acute pancreatitis based on machine learning analysis
2024-04-19, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01854-2
PMID:38641608
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研究论文 | 本研究通过机器学习分析揭示了Prdx4作为急性胰腺炎的潜在诊断和治疗靶点 | 首次使用LASSO和SVM-RFE机器学习方法筛选出Prdx4作为急性胰腺炎的潜在生物标志物，并通过免疫组织化学和重组Prdx4治疗验证了其治疗潜力 | 研究样本量较小，且仅限于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探索急性胰腺炎的关键基因，以实现有效的诊断和治疗 | 急性胰腺炎及其相关基因Prdx4 | 机器学习 | 急性胰腺炎 | LASSO, SVM-RFE, ssGSEA, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 1357个差异表达基因, 小鼠胰腺组织样本 |
| 1559 | 2024-08-07 |
2024-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.534
PMID:38585235
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研究论文 | 本研究通过诱导实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）模型，探讨了视网膜小胶质细胞在疾病发展中的动态变化及其在调节免疫反应中的作用 | 首次在EAU模型中识别出一种新的炎症亚型视网膜小胶质细胞，并揭示了CD74和CCL5在调节其炎症表型中的作用 | NA | 探讨自身免疫性葡萄膜炎发病机制及寻找潜在治疗策略 | 视网膜免疫细胞及小胶质细胞的动态变化 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 在EAU小鼠模型中，对四个时间点的视网膜免疫细胞进行了单细胞RNA测序 |
| 1560 | 2024-11-21 |
Roles of bone morphogenetic proteins in endometrial remodeling during the human menstrual cycle and pregnancy
2024-03-01, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmad031
PMID:38037193
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综述 | 本文综述了骨形态发生蛋白（BMPs）在人类月经周期和妊娠期间子宫内膜重塑中的作用及其分子机制 | 本文总结了BMPs在调节人类子宫内膜增殖和蜕膜化中的已知病理生理作用及其分子机制，旨在促进诊断、治疗和预防与子宫内膜重塑失调相关的生育障碍和不良妊娠并发症的创新策略的发展 | 需要进一步的临床试验来验证BMPs作为诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 | 探讨BMPs在人类月经周期和妊娠期间子宫内膜重塑中的作用，并评估其作为诊断和治疗靶点的潜力 | BMPs在子宫内膜重塑中的作用及其分子机制 | NA | 生育障碍 | NA | NA | NA | NA |