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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1541 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals cell atlas and identifies cycling tumor cells responsible for recurrence in ameloblastoma
2024-02-29, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00281-4
PMID:38424060
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示成釉细胞瘤的细胞图谱,并鉴定导致肿瘤复发的循环肿瘤细胞 | 首次在单细胞分辨率下揭示成釉细胞瘤的细胞景观,鉴定出具有干细胞特性的循环肿瘤细胞亚群及其EZH2介导的调控机制 | NA | 探究成釉细胞瘤肿瘤起始和复发的分子机制 | 成釉细胞瘤肿瘤细胞 | 数字病理学 | 成釉细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1542 | 2025-10-07 |
Tim4 deficiency reduces CD301b+ macrophage and aggravates periodontitis bone loss
2024-02-28, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-023-00270-z
PMID:38418808
|
研究论文 | 本研究探讨Tim4缺陷通过减少CD301b+巨噬细胞加剧牙周炎骨丢失的机制 | 首次揭示Tim4作为CD301b+巨噬细胞的上游调控因子,通过p38 MAPK信号通路调控其在牙周炎中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Tim4在牙周炎骨丢失中对CD301b+巨噬细胞的调控机制 | 小鼠牙周炎模型中的CD301b+巨噬细胞 | 免疫学 | 牙周炎 | 高通量RNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1543 | 2025-10-07 |
PRX1-positive mesenchymal stem cells drive molar morphogenesis
2024-02-19, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00277-0
PMID:38369512
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪揭示了PRX1阳性间充质干细胞通过Wnt5a信号调控磨牙形态发生的机制 | 首次发现PRX1阳性间充质细胞在磨牙形态发生中的关键作用,并阐明Wnt5a通过WNT信号通路调控细胞增殖的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探究调控牙齿形态发生的关键因素和分子机制 | 小鼠磨牙发育过程中的间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 谱系追踪 | NA | 基因表达数据, 细胞谱系数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1544 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics reveals that metabolic characteristics define the tumor immunosuppression microenvironment via iCAF transformation in oral squamous cell carcinoma
2024-01-30, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-023-00267-8
PMID:38287007
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示了口腔鳞癌中代谢特征通过iCAF转化定义肿瘤免疫抑制微环境的机制 | 首次在口腔鳞癌中通过空间转录组学揭示了代谢区域与免疫微环境的关系,并发现了上皮细胞-iCAF-Tregs的协同作用轴 | NA | 阐明口腔鳞癌中不同代谢区域与肿瘤免疫微环境的关系 | 口腔鳞癌组织 | 空间转录组学 | 口腔鳞癌 | 单细胞测序, 空间转录组测序 | SPOTlight反卷积, k-means聚类, CellPhoneDB, NicheNet | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1545 | 2025-10-07 |
O-GlcNAcylation of circadian clock protein Bmal1 impairs cognitive function in diabetic mice
2024-Nov, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00263-6
PMID:39375536
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研究论文 | 本研究揭示了高血糖通过O-GlcNAc糖基化修饰生物钟蛋白Bmal1导致糖尿病小鼠认知功能障碍的分子机制 | 首次发现Bmal1的O-GlcNAc糖基化修饰在糖尿病认知功能障碍中的关键作用,并开发了特异性阻断该修饰的短肽治疗方法 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 阐明糖尿病相关认知功能障碍的分子机制 | 糖尿病小鼠的海马神经元 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1546 | 2025-10-07 |
Accurate and Flexible Single Cell to Spatial Transcriptome Mapping with Celloc
2024-Oct, Small science
IF:11.1Q1
DOI:10.1002/smsc.202400139
PMID:40212250
|
研究论文 | 开发了一种名为Celloc的新方法,用于实现单细胞RNA测序与空间转录组数据之间的精确映射 | 结合图注意力自编码器和综合损失函数,实现灵活的单细胞到空间位点映射,既能解析每个位点内的细胞组成,也能为scRNA-seq数据中的每个细胞分配空间位置 | NA | 解决单细胞RNA测序数据缺乏空间信息和空间转录组数据分辨率有限的问题 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | 图注意力自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 1547 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals VEGFR as a potential target for CAR-T cell therapy in chordoma
2024-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02635-5
PMID:38605247
|
研究论文 | 通过单细胞测序鉴定VEGFR作为脊索瘤CAR-T细胞治疗的潜在靶点 | 首次在脊索瘤中通过单细胞测序鉴定VEGFR作为CAR-T治疗靶点,并开发了同时靶向VEGFR和TGF-β的双功能CAR-T细胞 | 样本量较小(14例),仅进行了体外实验验证 | 寻找脊索瘤免疫治疗新靶点并开发有效CAR-T疗法 | 脊索瘤患者肿瘤样本和CAR-T细胞 | 单细胞测序 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序,CAR-T细胞技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 14例脊索瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1548 | 2025-10-07 |
Understanding the heterogeneity of natural killer cells at the maternal-fetal interface: implications for pregnancy health and disease
2024-Nov-14, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaae040
PMID:39570646
|
综述 | 本文系统回顾了母胎界面自然杀伤细胞的异质性研究及其与妊娠健康的关系 | 整合了基于表面标志物、功能分子和单细胞RNA测序的NK细胞分类方法,并总结了dNK细胞分化途径 | 作为综述文章,未提供原始实验数据验证 | 探讨母胎界面NK细胞异质性及其在妊娠相关疾病中的作用 | 子宫NK细胞亚群和蜕膜NK细胞 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1549 | 2025-10-07 |
Expansion effect of romiplostim on hematopoietic stem and progenitor cells versus thrombopoietin and eltrombopag
2024-Nov, International journal of hematology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s12185-024-03853-6
PMID:39302624
|
研究论文 | 比较罗米司亭与重组人血小板生成素和艾曲波帕对造血干细胞和祖细胞的体外扩增效果及分子机制 | 首次在单细胞水平揭示罗米司亭对最原始造血干细胞亚群中RHOA信号通路相关分子变化的特异性诱导作用 | 仅为体外研究,需要进一步体内实验验证 | 阐明罗米司亭与其他TPO受体激动剂的生物学效应差异 | 人CD34+造血干细胞和祖细胞 | 单细胞生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1550 | 2025-10-07 |
Gene expansions contributing to human brain evolution
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.26.615256
PMID:39386494
|
研究论文 | 本研究通过分析完整的人类基因组序列,识别了与人类大脑进化相关的基因复制事件 | 首次利用完整端粒到端粒人类基因组序列(T2T-CHM13)系统识别人类特异性基因复制,并通过斑马鱼模型验证这些基因在大脑发育中的功能 | 研究主要关注基因复制事件,可能忽略了其他类型的基因组变异对大脑进化的贡献 | 探索人类大脑进化过程中基因复制事件的贡献 | 人类基因组序列、大脑转录组数据、斑马鱼模型 | 基因组学 | NA | 长读长DNA测序、单细胞RNA-seq、CRISPR基因编辑 | NA | 基因组序列、转录组数据、图像、行为数据 | 200个不同祖先背景的现代人类样本,多个斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 长读长测序 | NA | NA |
| 1551 | 2025-10-07 |
A multi-platform analysis of human gingival crevicular fluid reveals ferroptosis as a relevant regulated cell death mechanism during the clinical progression of periodontitis
2024-05-27, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00306-y
PMID:38802345
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研究论文 | 通过多平台分析揭示铁死亡在牙周炎临床进展中的重要作用 | 首次在牙周炎患者中发现与铁死亡相关的蛋白质和生物学过程 | 样本量较小(16名患者),观察时间有限(12周) | 研究铁死亡在牙周炎进展中的作用机制 | 牙周炎患者的龈沟液和牙龈组织 | 生物信息学 | 牙周炎 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、Western blot、生物信息学分析 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 16名牙周炎诊断患者,12周临床监测 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 使用公共单细胞RNA测序数据集GSE164241 |
| 1552 | 2025-10-07 |
Machine learning and deep learning to identifying subarachnoid haemorrhage macrophage-associated biomarkers by bulk and single-cell sequencing
2024-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18296
PMID:38702954
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组测序分析蛛网膜下腔出血大鼠模型中的巨噬细胞亚群,并开发诊断模型识别关键生物标志物 | 结合单细胞测序和批量RNA测序识别SAH特异性巨噬细胞亚群,并开发基于机器学习和卷积神经网络的诊断模型 | 需要进一步的实验和临床研究来验证研究结果并探索治疗靶点的临床意义 | 识别蛛网膜下腔出血巨噬细胞相关生物标志物以改进诊断和治疗策略 | 蛛网膜下腔出血大鼠模型的脑组织样本 | 机器学习, 深度学习 | 蛛网膜下腔出血 | 单细胞转录组测序, 批量RNA测序 | 卷积神经网络, 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1553 | 2025-10-07 |
Transcriptomic and spatial dissection of human ex vivo right atrial tissue reveals proinflammatory microvascular changes in ischemic heart disease
2024-May-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101556
PMID:38776872
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析人类离体右心房组织,揭示缺血性心脏病中促炎性微血管变化 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术系统分析人类右心房组织在心血管疾病中的基因表达变化 | 研究样本为离体组织,可能无法完全反映体内真实情况;对照组为接受预防性手术的瓣膜病患者 | 揭示缺血性心脏病和心力衰竭中右心房组织的分子和细胞变化机制 | 人类离体右心房组织和心包液 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 未明确样本数量(使用瓣膜病患者作为对照组) | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1554 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis revealed a potential role of T-cell exhaustion in colorectal cancer with liver metastasis
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18341
PMID:38647235
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示T细胞耗竭在结直肠癌肝转移中的潜在作用 | 首次通过单细胞测序技术系统分析结直肠癌肝转移中T细胞耗竭的作用机制,发现CEACAM5和ADGRE5-CD55在Tex与Treg-上皮细胞相互作用中的关键角色 | 研究基于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明 | 探究T细胞耗竭在结直肠癌肝转移过程中的作用机制 | 结直肠癌肝转移患者的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析,伪时间分析,ssGSEA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1555 | 2025-10-07 |
Integrated analysis highlights the significance role of ITGAL in lung adenocarcinoma
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18289
PMID:38613346
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研究论文 | 本研究通过整合分析揭示了ITGAL在肺腺癌中的预后价值和抑制肿瘤恶性进展的作用 | 首次系统阐明ITGAL在肺腺癌中的预后价值及其通过调控NK细胞因子影响肿瘤微环境的机制 | 研究主要基于TCGA数据库和体外实验,缺乏大规模临床样本验证 | 探究ITGAL在肺腺癌中的生物学功能和临床意义 | 肺腺癌患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞测序,3D Matrigel培养,BrdU ELISA,伤口愈合迁移实验,细胞粘附实验 | NA | 基因表达数据,临床预后数据,单细胞测序数据 | TCGA数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1556 | 2025-10-07 |
Detecting early-warning biomarkers associated with heart-exosome genetic-signature for acute myocardial infarction: A source-tracking study of exosome
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18334
PMID:38661439
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研究论文 | 本研究通过溯源分析血浆外泌体,检测与心脏外泌体遗传特征相关的急性心肌梗死早期预警生物标志物 | 首次通过去卷积算法实现血浆外泌体溯源分析,识别出三个与心脏外泌体遗传特征相关的急性心肌梗死早期预警生物标志物 | 仅分析了血浆总外泌体中的心脏来源部分,未完全排除其他器官外泌体的干扰 | 检测与心脏外泌体遗传特征相关的急性心肌梗死早期预警生物标志物 | 急性心肌梗死患者的血浆外泌体 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 去卷积算法, 加权基因共表达网络, 机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据 | 住院患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1557 | 2025-10-07 |
Identification of PPAR-related differentially expressed genes liver hepatocellular carcinoma and construction of a prognostic model based on data analysis and molecular docking
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18304
PMID:38652093
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝细胞癌中PPAR相关基因表达,构建预后模型并筛选潜在治疗药物 | 首次在单细胞水平分析肝细胞癌中PPAR相关基因表达特征,构建基于8个PPAR相关基因的预后模型,并通过分子对接筛选潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索肝细胞癌发展的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 肝细胞癌组织样本和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,伤口愈合实验 | LASSO-Cox回归模型,ConsensusCluster分析 | 基因表达数据 | TCGA-LIHC、ICGC-LIRI和GSE14520数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1558 | 2025-10-07 |
Integrative analysis unveils ECM signatures and pathways driving hepatocellular carcinoma progression: A multi-omics approach and prognostic model development
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18230
PMID:38568083
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示细胞外基质在肝细胞癌进展中的特征和作用机制,并开发了基于ECM的预后模型 | 整合单细胞转录组分析和多组学数据,系统揭示ECM在LIHC免疫浸润和预后分层中的新作用,并构建了有效的ECM预后模型 | 样本量相对有限(10个LIHC样本),需要在更大队列中进一步验证 | 探索细胞外基质在肝细胞癌进展中的作用机制并开发预后预测模型 | 肝细胞癌患者样本、肝癌细胞系 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 侵袭实验, Transwell实验 | Lasso回归 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 10个LIHC样本(单细胞数据), TCGA-LIHC队列, CheckMate研究独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1559 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and RNA-seq data to explore the role of focal adhesion-related genes in osteoporosis
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18271
PMID:38534087
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研究论文 | 通过整合单细胞和RNA测序数据探索黏着斑相关基因在骨质疏松症中的作用 | 首次通过整合单细胞RNA测序和RNA测序数据识别出与骨质疏松相关的两个关键基因FAM129A和RNF24 | 研究样本量有限,仅基于GSE56815和GSE56116两个队列数据 | 挖掘与黏着斑相关的枢纽基因并研究其在骨质疏松症中的作用 | 骨质疏松症患者样本、小鼠模型、人类血液样本 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个基因表达数据集(GSE56815和GSE56116) | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 1560 | 2025-10-07 |
Histone modification-linked prognostic model for ovarian cancer reveals LBX2 as a novel growth promoter
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18260
PMID:38520216
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研究论文 | 本研究构建了基于组蛋白修饰相关基因的卵巢癌预后模型,并发现LBX2作为新的生长促进因子 | 首次将组蛋白修饰相关基因与卵巢癌预后关联,并鉴定LBX2为新的卵巢癌增殖促进因子 | 研究基于回顾性数据,需要进一步实验验证 | 探索组蛋白修饰相关基因在卵巢癌预后预测中的作用 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | RNA-Seq, 单细胞RNA测序 | Lasso回归 | 转录组数据 | 多个队列的卵巢癌患者数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |