单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1501	2025-02-03	Single-cell resolution of human airway epithelial cells exposed to bronchiolitis obliterans-associated chemicals 2024-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology DOI:10.1152/ajplung.00304.2023 PMID:38084407	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术，识别了暴露于与闭塞性细支气管炎（BO）相关化学物质后的人气道上皮细胞的转录组特征，以帮助解释BO的诱导机制	首次在单细胞分辨率下揭示了BO相关化学物质暴露后人气道上皮细胞的转录组变化，并识别了不同化学物质暴露下的功能通路差异	研究仅关注了两种化学物质（二乙酰和氮芥）的暴露，未涵盖其他可能的BO相关化学物质	揭示BO相关化学物质暴露后人气道上皮细胞的转录组特征，以解释BO的诱导机制	人气道上皮细胞	数字病理学	肺纤维化疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	75,663个单细胞
1502	2025-02-03	Obesogenic diet disrupts tissue-specific mitochondrial gene signatures in the artery and capillary endothelium 2024-Feb-01, Physiological genomics IF:2.5Q2 DOI:10.1152/physiolgenomics.00109.2023 PMID:37982169	研究论文	本研究探讨了肥胖如何影响内皮细胞的代谢表型，特别是线粒体基因表达	通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，揭示了肥胖饮食导致脂肪内皮细胞氧化磷酸化基因表达减少，进而导致肠系膜和脂肪内皮细胞的表型趋同	研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步扩展	理解肥胖对内皮细胞代谢表型的影响，特别是线粒体基因表达的变化	小鼠和人类的脂肪和肠系膜内皮细胞	分子生物学	肥胖	RNA测序（bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq）	NA	RNA测序数据	小鼠脂肪和肠系膜内皮细胞，以及人类内脏脂肪的单核RNA测序数据
1503	2025-02-03	Distribution of P2Y and P2X purinergic receptor expression within the intestine 2024-02-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology DOI:10.1152/ajpgi.00108.2023 PMID:37987757	研究论文	本文研究了P2Y和P2X嘌呤能受体在肠道中的分布及其在细胞外核苷酸信号传导中的作用	通过单细胞RNA测序数据分析了P2嘌呤能受体在肠道中的表达，并使用人类肠道类器官验证了这些受体的功能	研究主要依赖于体外模型（如肠道类器官和细胞系），可能无法完全反映体内情况	探索嘌呤能受体在肠道上皮细胞中的表达及其在细胞外核苷酸信号传导中的作用	人类肠道上皮细胞、肠道类器官和肠道细胞系（T84、Caco2、HT29）	分子生物学	肠道炎症和感染性疾病	单细胞RNA测序（RNAseq）	NA	RNA测序数据	人类肠道类器官和三种肠道细胞系
1504	2024-08-05	A review of computational methods for predicting cancer drug response at the single-cell level through integration with bulk RNAseq data 2024-02, Current opinion in structural biology IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.sbi.2023.102745 PMID:38109840	review	本综述探讨了通过整合大规模 RNAseq 数据预测单细胞级别癌症药物反应的计算方法	综述了利用大规模药物筛选生成特定癌细胞组药物敏感性的创新方法	缺乏将单细胞 RNA 测序知识转化为治疗策略的具体探讨	旨在通过整合数据来提升癌症药物的精准治疗策略	研究对象包括各种癌症药物对不同癌细胞群的反应	数字病理学	癌症	RNAseq	NA	NA	NA
1505	2025-02-03	Single-cell RNA sequencing of human prostate basal epithelial cells reveals zone-specific cellular populations and gene expression signatures 2024-02, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6227 PMID:37984408	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了人类前列腺基底上皮细胞在不同腺区中的细胞群体和基因表达特征	首次在前列腺基底细胞中识别出多个细胞群体和细胞类型特异性基因签名，这些签名可能在驱动前列腺疾病中起关键作用	研究主要基于体外培养的前列腺上皮细胞，可能无法完全反映体内情况	探讨前列腺基底细胞在不同腺区中的基因表达差异及其在前列腺疾病中的作用	人类前列腺基底上皮细胞	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	人类前列腺和精囊的原代前列腺上皮细胞培养物
1506	2025-02-03	Dissociation of murine oral mucosal tissues for single cell applications 2024-02, Journal of immunological methods IF:1.6Q4 DOI:10.1016/j.jim.2023.113605 PMID:38142927	研究论文	本文介绍了优化小鼠口腔黏膜组织解离方法的研究，提供了三种不同的协议，用于分离口腔黏膜中的主要细胞群	提出了三种不同的酶解方法，分别优先回收免疫细胞、基质细胞和上皮细胞，适用于健康和炎症状态下的研究	每种解离方法都有其局限性，可能因优先回收特定细胞类型而产生偏差	优化小鼠口腔黏膜组织的解离方法，以便更好地进行单细胞RNA测序和流式细胞术研究	小鼠口腔黏膜组织	单细胞技术	牙周炎	单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	单细胞数据	NA
1507	2025-02-03	Bitter taste receptors in the reproductive system: Function and therapeutic implications 2024-Feb, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1 DOI:10.1002/jcp.31179 PMID:38219077	综述	本文综述了2型味觉受体（TAS2Rs）在生殖系统中的功能及其治疗潜力	探讨了TAS2Rs在生殖健康中的新角色，特别是在男性和女性生殖过程中的潜在功能及其在癌症治疗中的应用	缺乏遗传和功能研究，需要更多技术如单细胞RNA测序和CRISPR/Cas9基因编辑来深入理解TAS2Rs在生殖中的作用	探索TAS2Rs在生殖系统中的功能及其作为治疗靶点的潜力	男性和女性生殖系统中的TAS2Rs	生殖医学	生殖系统疾病	单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑	NA	NA	NA
1508	2025-02-03	Interleukin-10 signaling in somatosensory neurons controls CCL2 release and inflammatory response 2024-02, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2023.12.013 PMID:38081433	研究论文	本文研究了IL-10信号在感觉神经元中的作用，特别是其在调节CCL2释放和炎症反应中的功能	首次证明抗炎细胞因子通过直接结合感觉神经元上的受体来限制炎症	研究主要基于小鼠模型，未涉及人类样本	探讨IL-10信号在感觉神经元中的免疫调节作用	小鼠的背根神经节（DRG）感觉神经元	免疫学	炎症相关疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	小鼠模型
1509	2025-02-03	Method for Collecting Single Epithelial Cells from the Mouse Larynx 2024-02, The Laryngoscope DOI:10.1002/lary.30970 PMID:37602769	研究论文	本文开发了一种从小鼠喉部收集单个上皮细胞的方法，以研究喉部上皮细胞的分子变化	开发了一种新的方法，能够从小鼠喉部可靠地收集单个上皮细胞，并最小化非喉部和非上皮细胞的污染	方法尚未在人类样本中验证，且收集的细胞数量有限	开发一种可靠的方法，从小鼠喉部收集单个上皮细胞，用于下游细胞和分子分析	小鼠喉部的上皮细胞	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	细胞样本	单个喉部收集6000-8000个细胞，三个组织合并收集35000-40000个细胞
1510	2025-02-02	Reduced TRIM expression correlates with anomalous CD4 T cell activation in systemic lupus Erythematosus and its clinical diagnostic potential 2024-12, Immunology letters IF:3.3Q3 DOI:10.1016/j.imlet.2024.106913 PMID:39233252	研究论文	本研究探讨了系统性红斑狼疮（SLE）患者循环CD4+T细胞亚群中T细胞受体相互作用分子（TRIM）的表达、功能及其临床相关性	首次在SLE患者中系统性地研究了TRIM在CD4+T细胞亚群中的表达及其与疾病活动的相关性，并探讨了其在临床诊断中的潜在应用	研究主要基于单细胞RNA测序数据和流式细胞术分析，未涉及TRIM在SLE中的具体分子机制	阐明TRIM在SLE患者CD4+T细胞亚群中的表达、功能及其临床意义	系统性红斑狼疮（SLE）患者、健康对照者（HCs）和类风湿性关节炎（RA）患者的外周血单核细胞（PBMCs）及小鼠的CD4+T细胞亚群	免疫学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	RNA测序数据、流式细胞术数据	SLE患者、健康对照者（HCs）和类风湿性关节炎（RA）患者的外周血单核细胞（PBMCs）及小鼠的CD4+T细胞亚群
1511	2025-02-02	Beyond the Heartbeat: Single-Cell Omics Redefining Cardiovascular Research 2024-Nov, Current cardiology reports IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s11886-024-02117-3 PMID:39158785	综述	本文探讨了单细胞组学技术在人类心脏不同区域的应用，揭示了细胞多样性、调控网络和疾病机制	强调了单细胞组学技术在心脏研究中的革命性应用，特别是在心脏再生、疾病建模和精准医学方面的潜力	NA	探索单细胞组学技术在心血管研究中的应用，以揭示心脏的细胞组成和分子动态	人类心脏的不同区域	生物信息学	心血管疾病	单细胞转录组学、基因组学、蛋白质组学、表观基因组学、空间转录组学	NA	单细胞组学数据	NA
1512	2025-02-02	Single-cell sequencing has revealed a more complex array of thymic epithelial cells 2024-10, Immunology letters IF:3.3Q3 DOI:10.1016/j.imlet.2024.106904 PMID:39117004	综述	本文综述了单细胞测序在揭示胸腺上皮细胞分类中的最新见解，包括正常和肿瘤胸腺中的细胞类型	利用单细胞测序技术揭示了胸腺上皮细胞的更复杂分类，特别是在正常和肿瘤胸腺中的细胞类型	NA	探讨单细胞测序在胸腺上皮细胞分类中的应用	胸腺上皮细胞	单细胞测序	NA	单细胞测序	NA	单细胞数据	NA
1513	2025-02-02	Molecular Organization of Autonomic, Respiratory, and Spinally-Projecting Neurons in the Mouse Ventrolateral Medulla 2024-Jul-31, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience DOI:10.1523/JNEUROSCI.2211-23.2024 PMID:38918066	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，创建了小鼠腹外侧延髓（VLM）细胞的全面数据集，揭示了VLM中神经元和星形胶质细胞的分子和细胞组织	首次通过单细胞RNA测序技术，系统地识别了VLM中23种神经元亚型和5种星形胶质细胞亚型，并验证了脊髓投射神经元的丰富性	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他动物模型	揭示腹外侧延髓（VLM）中神经元和星形胶质细胞的分子和细胞组织，以更好地理解VLM在重要功能和运动控制中的作用	小鼠腹外侧延髓（VLM）中的神经元和星形胶质细胞	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	114,805个VLM细胞
1514	2025-02-01	TNFα has differential effects on the transcriptome profile of selected populations in murine cartilage 2024-Dec, Osteoarthritis and cartilage open DOI:10.1016/j.ocarto.2024.100528 PMID:39494399	研究论文	本文研究了肿瘤坏死因子α（TNFα）对小鼠软骨细胞转录组的影响，特别是在总RNA和单细胞分辨率下的差异	通过单细胞RNA测序技术，揭示了TNFα对不同细胞群体的转录组影响，特别是对炎症反应和基质生物合成的抑制作用	研究仅限于新生C57BL/6小鼠的软骨细胞，可能不适用于其他物种或年龄段的细胞	探讨TNFα在软骨细胞炎症反应中的作用	新生C57BL/6小鼠的软骨细胞	生物信息学	骨关节炎	RNA-Seq, 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA测序数据	14,239个细胞和24,320个基因
1515	2025-02-01	Spatial resolution of the head and neck cancer tumor microenvironment to identify tumor and stromal features associated with therapy response 2024-10, Immunology and cell biology IF:3.2Q3 DOI:10.1111/imcb.12811 PMID:39048134	研究论文	本研究通过空间转录组学和蛋白质组学技术，解析头颈癌肿瘤微环境中的特征，以识别与治疗反应相关的肿瘤和基质特征	首次结合NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler和Akoya PhenoCycler-Fusion技术，对头颈癌肿瘤微环境进行高精度空间转录组和蛋白质组分析，揭示了与免疫治疗反应相关的生物标志物	样本量较小，仅包含12名患者的25个肿瘤核心，可能限制结果的普适性	识别头颈癌肿瘤微环境中与免疫治疗反应相关的生物标志物	头颈癌患者的肿瘤微环境	数字病理学	头颈癌	NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler, Akoya PhenoCycler-Fusion	NA	转录组数据, 蛋白质组数据	12名患者的25个肿瘤核心
1516	2025-02-01	Computational estimation of clonal diversity in autoimmunity 2024-09, Immunology and cell biology IF:3.2Q3 DOI:10.1111/imcb.12801 PMID:39010261	综述	本文综述了当前用于从单细胞T细胞受体和B细胞受体测序中测量多样性的方法，并讨论了单细胞测序和多样性估计在自身免疫性疾病发现和治疗创新中的突破	讨论了单细胞测序和多样性估计在自身免疫性疾病研究中的应用及其重要性	NA	探讨适应性免疫系统中多样性的测量和解释方法，及其在自身免疫性疾病中的作用	单细胞T细胞受体和B细胞受体测序数据	生物信息学	自身免疫性疾病	单细胞测序	NA	测序数据	NA
1517	2025-02-01	Discovery of a monoclonal, high-affinity CD8+ T-cell clone following natural hepatitis C virus infection 2024-08, Immunology and cell biology IF:3.2Q3 DOI:10.1111/imcb.12791 PMID:38855806	研究论文	本文报道了在自然感染丙型肝炎病毒（HCV）后，发现了一种单克隆、高亲和力的CD8+ T细胞克隆	首次在急性HCV感染后直接从体内分离出特异性针对HCV衍生HLA I类表位的单克隆CD8 T细胞群体，并发现其具有异常长的抗原解离时间	研究仅基于两个个体的样本，样本量较小，可能限制了结果的普遍性	研究HCV感染后CD8 T细胞的特异性反应及其TCR-pMHC相互作用的特性	HCV感染后的CD8 T细胞	免疫学	丙型肝炎	单细胞测序，HLA-多聚体染色	NA	细胞数据	两个个体的样本
1518	2025-02-01	Single-cell transcriptomics reveal differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and trophoblast stem cells 2024-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.07.12.603155 PMID:39071344	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了早期妊娠人胎盘细胞滋养层（CTB）与滋养层干细胞（TSC）之间的转录多样性差异	首次在单细胞水平上比较了早期妊娠胎盘细胞滋养层与滋养层干细胞的转录组差异，并揭示了不同胎盘区域CTB的异质性	样本量相对较小（6个正常胎盘和3个TSC系），且仅关注了早期妊娠阶段	探究早期妊娠胎盘细胞滋养层的转录多样性，并比较其与滋养层干细胞的异同	早期妊娠人胎盘细胞滋养层（CTB）和滋养层干细胞（TSC）	单细胞组学	NA	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	6个正常胎盘（4个6-8周，2个12-14周）和3个TSC系
1519	2025-02-01	Characterization of NOD-like receptor-based molecular heterogeneity in glioma and its association with immune micro-environment and metabolism reprogramming 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1498583 PMID:39882240	研究论文	本研究揭示了NOD样受体（NLR）信号通路在高级别胶质瘤中的特征及其与胶质母细胞瘤（GBM）患者临床异质性的关联，并探讨了NLR通路核心基因在GBM发生和发展中的作用	首次基于NLR基因表达谱将GBM患者分为具有不同临床结果的两个亚型，并开发了基于NLR表达谱的GBM预后标志物	研究主要依赖于转录组数据，缺乏对NLR信号通路在GBM中具体机制的深入实验验证	揭示NLR信号通路在GBM中的特征及其与临床异质性的关联，并探索NLR通路核心基因在GBM发生和发展中的作用	496名具有完整预后信息的GBM患者	数字病理学	胶质母细胞瘤	转录组数据分析，单细胞测序	NMF聚类算法，LASSO和COX回归分析，随机森林算法	转录组数据	496名GBM患者
1520	2025-01-31	Transcriptional Profiling of Testis Development in Pre-Sexually-Mature Hezuo Pig 2024-Dec-29, Current issues in molecular biology IF:2.8Q3 DOI:10.3390/cimb47010010 PMID:39852125	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术对合作猪（HZP）青春期前一个月龄的睾丸进行了转录组分析，揭示了不同细胞类型在精子发生过程中的转录变化	首次在合作猪中应用单细胞RNA测序技术，揭示了睾丸发育过程中不同细胞类型的转录变化，为理解精子发生和睾丸细胞生物学提供了新的见解	研究仅针对一个月龄的合作猪睾丸，未涵盖更广泛的发育阶段或不同品种的猪	探索合作猪青春期前睾丸发育过程中的细胞类型和转录变化	合作猪（HZP）一个月龄的睾丸	生物信息学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	14,276个细胞