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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2025-10-07 |
Identification of a pancreatic stellate cell gene signature and lncRNA interactions associated with type 2 diabetes progression
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1532609
PMID:39872314
|
研究论文 | 本研究通过识别胰腺星状细胞基因特征和lncRNA相互作用,揭示了2型糖尿病进展的新机制 | 首次发现COL1A2hi/VCANhi/SULF1hi胰腺星状细胞特异性特征及其在2型糖尿病中的独特作用,并构建了相关的lncRNA-mRNA调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证 | 探索2型糖尿病中胰腺星状细胞的基因表达特征及其通过lncRNA-mRNA相互作用在疾病进展中的调控机制 | 2型糖尿病患者的胰岛细胞、胰腺星状细胞和外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个2型糖尿病和1型糖尿病数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1502 | 2025-10-07 |
Identification and validation of BATF as a prognostic biomarker and regulator of immune cell infiltration in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1429855
PMID:39872530
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,发现BATF是急性髓系白血病中免疫细胞浸润的调节因子和预后生物标志物 | 首次系统揭示BATF在AML中的预后价值及其通过调节CD8+T细胞和NK细胞比例影响免疫细胞浸润的新机制 | 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,需要更多临床样本验证BATF的临床应用价值 | 探索BATF在急性髓系白血病中的预后价值和免疫调节作用 | 急性髓系白血病患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, 流式细胞术, 单细胞测序 | C1498小鼠AML模型 | 基因组数据, 临床数据, 实验数据 | TCGA-LAML和GEO(GSE37642)数据库样本 | NA | 单细胞测序, RNA-seq | NA | NA |
| 1503 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq reveals immune cell heterogeneity and increased Th17 cells in human fibrotic skin diseases
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522076
PMID:39872534
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示纤维化皮肤疾病中免疫细胞的异质性及Th17细胞增加现象 | 首次通过CD45+免疫细胞富集构建纤维化皮肤疾病的单细胞图谱,发现Th17细胞通过IL-17A促进瘢痕疙瘩成纤维细胞功能 | 研究样本量有限,仅针对瘢痕疙瘩等特定纤维化皮肤疾病 | 探究纤维化皮肤疾病中免疫细胞的细胞景观和Th17细胞的作用机制 | 瘢痕疙瘩和正常瘢痕组织中的CD45+免疫细胞及成纤维细胞 | 单细胞测序分析 | 纤维化皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 荧光激活细胞分选, Ki-67染色, 划痕实验, 实时PCR, Western blotting | NA | 单细胞基因表达数据 | 瘢痕疙瘩和正常瘢痕组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1504 | 2025-10-07 |
Upregulation of interferon-γ response genes in monocytes and T cells identified by single-cell transcriptomics in patients with anti-citrullinated peptide antibody-positive early rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1439082
PMID:39877346
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析比较了ACPA阳性和阴性早期类风湿关节炎患者的免疫系统差异 | 首次在单细胞水平揭示了ACPA+早期RA患者中干扰素-γ反应基因在单核细胞和T细胞中的普遍上调 | 样本量相对有限,仅分析了37,318个细胞 | 探究ACPA阳性和阴性早期类风湿关节炎患者的免疫系统差异 | 抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性的早期类风湿关节炎患者 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序,多重细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,血清细胞因子数据 | 37,318个CD45+细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1505 | 2025-10-07 |
Immunometabolic alterations in type 2 diabetes mellitus revealed by single-cell RNA sequencing: insights into subtypes and therapeutic targets
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1537909
PMID:39877357
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示2型糖尿病中的免疫代谢改变,识别疾病亚型和潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平系统分析T2DM患者PBMCs的免疫代谢特征,基于代谢异质性定义三种疾病亚型,并识别关键转录因子和潜在治疗药物 | 样本量相对有限(37例患者和11例对照),仅分析外周血单个核细胞,未涉及组织特异性免疫代谢改变 | 阐明2型糖尿病的免疫代谢机制并识别治疗靶点 | 2型糖尿病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,基因集变异分析,机器学习 | 机器学习分类模型 | 单细胞转录组数据 | 37例2型糖尿病患者和11例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1506 | 2025-10-07 |
Characterization of NOD-like receptor-based molecular heterogeneity in glioma and its association with immune micro-environment and metabolism reprogramming
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1498583
PMID:39882240
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研究论文 | 本研究通过分析胶质母细胞瘤患者的转录组数据,揭示了NOD样受体信号通路在肿瘤免疫微环境和代谢重编程中的关键作用 | 首次基于NLR基因表达谱将GBM患者分为具有不同临床预后的亚型,并鉴定TRIP6基因为NLR通路中的关键枢纽基因 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索NOD样受体信号通路在胶质母细胞瘤临床异质性中的作用机制 | 496例具有完整预后信息的胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序,单细胞测序,LASSO回归,COX回归,随机森林算法 | NMF聚类,LASSO,COX,随机森林 | 基因表达数据 | 496例GBM患者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1507 | 2025-10-07 |
TCR transgenic clone selection guided by immune receptor analysis and single-cell RNA expression of polyclonal responders
2024-Dec-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98344
PMID:39854619
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞测序和TCR谱分析快速筛选抗原特异性TCR序列并生成TCR转基因小鼠的新方法 | 利用单细胞测序和TCR谱分析技术替代传统的杂交瘤筛选方法,快速选择最佳TCR克隆 | NA | 开发快速生成抗原特异性TCR转基因小鼠的方法 | SARS-CoV-2刺突蛋白特异性CD8 T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, TCR谱分析, PCR克隆 | NA | 单细胞RNA表达数据, TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1508 | 2025-10-07 |
NK cell exhaustion in Wilson's disease revealed by single-cell RNA sequencing predicts the prognosis of cholecystitis
2024-Dec-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98867
PMID:39854622
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示威尔逊病中NK细胞耗竭及其与胆囊炎预后的关联 | 首次在威尔逊病模型中揭示代谢异常导致NK细胞耗竭,并证实其与胆囊炎预后的直接关联 | 回顾性临床研究,样本来源单一,机制验证不够充分 | 探究肝脏疾病代谢异常影响胆囊炎风险的免疫机制 | 威尔逊病患者及胆囊炎患者 | 单细胞组学 | 肝胆疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据,临床数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1509 | 2025-10-07 |
scMMAE: masked cross-attention network for single-cell multimodal omics fusion to enhance unimodal omics
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf010
PMID:39851073
|
研究论文 | 提出一种基于掩码自编码器和交叉注意力机制的单细胞多组学融合框架scMMAE,用于增强单组学分析 | 首次将掩码自编码器与交叉注意力机制结合用于单细胞多组学融合,同时捕获共享特征和独特信息,并能将知识迁移到单组学分析 | NA | 开发单细胞多组学融合方法以增强单组学数据分析 | 单细胞转录组学和蛋白质组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 掩码自编码器, 交叉注意力网络 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1510 | 2025-10-07 |
Complex hierarchical structures analysis in single-cell data with Poincaré deep manifold transformation
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae687
PMID:39851075
|
研究论文 | 提出一种名为PoincaréDMT的新方法,用于分析单细胞RNA测序数据中的复杂层次结构 | 通过双曲庞加莱圆盘映射保留全局结构,结合数据增强实现局部结构校正,并整合批次图减轻批次效应 | NA | 解决单细胞数据分析中结构保留不完整和嵌入高失真问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度流形变换 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1511 | 2025-10-07 |
Immunotherapy drives mesenchymal tumor cell state shift and TME immune response in glioblastoma patients
2024-08-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae085
PMID:38695342
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了免疫检查点抑制剂治疗胶质母细胞瘤时肿瘤细胞向间充质状态转变的耐药机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示了免疫治疗驱动的胶质母细胞瘤肿瘤细胞向间充质干细胞样状态转变的耐药机制 | 样本量相对有限,需要在更大队列中验证研究结果 | 探索胶质母细胞瘤对免疫检查点抑制剂治疗的耐药机制 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 76个肿瘤样本(主要研究)+ 298个外部验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1512 | 2025-10-07 |
Integrated cancer cell-specific single-cell RNA-seq datasets of immune checkpoint blockade-treated patients
2024-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.17.576110
PMID:38328153
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研究论文 | 整合了免疫检查点阻断治疗患者的癌细胞特异性单细胞RNA-seq数据集 | 整合了来自9种癌症类型、174名患者的8个scRNA-seq数据集,创建了专门用于研究癌细胞对ICB治疗反应的独特资源 | 样本量相对有限,数据来源于已有的研究数据集 | 研究不同癌症类型中癌细胞对免疫检查点阻断治疗的反应机制 | 癌细胞 | 单细胞组学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 174名患者,90,270个癌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1513 | 2025-10-07 |
Heterogeneity and synaptic plasticity analysis of hippocampus based on db-/- mice induced diabetic encephalopathy
2024-01, Psychoneuroendocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.psyneuen.2023.106412
PMID:37898037
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析db/db糖尿病小鼠海马体细胞异质性和突触可塑性,探索糖尿病脑病的发病机制 | 首次在糖尿病认知障碍模型中构建海马体单细胞转录组图谱,发现少突胶质前体细胞的五个新亚群及其与神经可塑性调控的关联 | 研究仅限于db/db小鼠模型,样本量相对有限,需要进一步验证Sstr2基因在神经可塑性中的具体作用机制 | 探索长期高血糖状态下海马体细胞异质性及其对突触可塑性的影响 | db/db糖尿病小鼠海马体细胞 | 数字病理学 | 糖尿病脑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | CI组21,379个细胞,对照组20,045个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1514 | 2025-10-07 |
Single-cell mitophagy patterns within the tumor microenvironment modulate intercellular communication, impacting the progression and prognosis of hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1448878
PMID:39835122
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝细胞癌肿瘤微环境中的线粒体自噬模式及其对细胞间通讯和疾病预后的影响 | 首次在肝细胞癌肿瘤微环境中系统鉴定不同细胞类型的线粒体自噬模式,并揭示其通过调控细胞间通讯影响肿瘤进展的机制 | 线粒体自噬似乎不影响免疫治疗效果,研究样本量相对有限 | 探究肝细胞癌肿瘤微环境中线粒体自噬模式对细胞通讯和疾病进展的影响 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境细胞,包括癌症相关成纤维细胞、T细胞、B细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NMF聚类,CellChat,Monocle,SCENIC | 单细胞RNA测序数据 | 25,189个细胞,来自两个肝细胞癌患者数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1515 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing analysis reveals cancer-associated pericyte subgroup in esophageal squamous cell carcinoma to predict prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1474673
PMID:39835116
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研究论文 | 通过单细胞测序分析发现食管鳞状细胞癌中与预后相关的癌症相关周细胞亚群 | 首次在食管鳞状细胞癌中鉴定出6个周细胞亚型,并发现其中c4_SOD2与预后负相关、c5_TYMS与预后正相关 | 未明确说明样本量的具体数值,周细胞异质性机制仍需进一步验证 | 探究食管鳞状细胞癌中癌症相关周细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 食管鳞状细胞癌患者组织样本中的周细胞 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序, 多重免疫荧光, 分子对接 | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA-seq数据, 免疫荧光图像 | 大样本单细胞测序数据(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间分布分析 | NA | NA |
| 1516 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome atlas of peripheral immune features to Omicron breakthrough infection under booster vaccination strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460442
PMID:39835127
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析加强疫苗接种策略下奥密克戎突破性感染的免疫特征 | 首次在加强疫苗接种背景下对奥密克戎突破性感染进行单细胞转录组与TCR/BCR联合测序分析,揭示了第四剂雾化Ad5-nCoV可能诱导的'训练免疫'现象 | 样本量有限(15例PBMC样本),需更大规模研究验证 | 探究加强疫苗接种策略下奥密克戎突破性感染的免疫特征 | 外周血单个核细胞(PBMC)样本,包括奥密克戎感染者和未感染疫苗接种者 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序,T细胞/B细胞受体(TCR/BCR)测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫受体序列数据 | 15例PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1517 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and immune microenvironment analysis reveal PLOD2-driven malignant transformation in cervical cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522655
PMID:39840054
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫微环境分析揭示PLOD2驱动宫颈癌恶性转化的机制 | 识别了宫颈癌中8种细胞类型和5个恶性上皮细胞亚群,建立了NNMT CAEPCs风险评分模型,并验证了PLOD2基因的预后价值 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索宫颈癌肿瘤微环境特征并识别潜在治疗靶点 | 宫颈癌恶性上皮细胞及其微环境 | 数字病理 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 生物信息学分析 | Cox回归模型, 风险评分模型 | 基因表达数据 | 来自UCSC和ArrayExpress数据库的测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1518 | 2025-10-07 |
Targeting immune cellular populations and transcription factors: unraveling the therapeutic potential of JQF for NAFLD
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1445924
PMID:39840059
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了降糖清热方(JQF)通过调节免疫细胞亚群和转录因子治疗非酒精性脂肪肝病(NAFLD)的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统解析JQF治疗NAFLD的免疫调节机制,识别出关键免疫细胞亚群和调控转录因子 | 研究基于小鼠模型,需要进一步临床试验验证 | 探究降糖清热方治疗非酒精性脂肪肝病的作用机制 | 高脂饮食诱导的NAFLD小鼠模型 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, SCENIC分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 高脂饮食诱导的NAFLD小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1519 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the heterogeneity and function of mast cells in human ccRCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494025
PMID:39840068
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示人类透明细胞肾癌中肥大细胞的异质性和功能 | 首次在ccRCC中系统研究肥大细胞的异质性,发现VEGFA+肥大细胞亚群与IL1B+巨噬细胞共定位的新现象 | 样本量较小(仅4例患者),需要更大规模研究验证 | 探究肥大细胞在透明细胞肾癌中的异质性和功能作用 | 透明细胞肾癌患者组织样本中的肥大细胞 | 单细胞转录组学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 组织图像数据 | 4例ccRCC患者样本,整合TCGA数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量组织测序 | NA | NA |
| 1520 | 2025-10-07 |
Comprehensive bioinformatics analysis identifies metabolic and immune-related diagnostic biomarkers shared between diabetes and COPD using multi-omics and machine learning
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1475958
PMID:39845878
|
研究论文 | 通过多组学和机器学习方法识别糖尿病与COPD共享的代谢和免疫相关诊断生物标志物 | 首次通过跨疾病交叉分析识别糖尿病与COPD共享的分子机制和诊断标志物 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证分子机制 | 探索糖尿病与慢性阻塞性肺疾病之间的共同分子机制 | 糖尿病和COPD患者的多中心队列数据 | 生物信息学 | 糖尿病,慢性阻塞性肺疾病 | 多组学分析,机器学习,单细胞测序 | WGCNA,多种机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 多中心患者队列 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |