单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 1481 - 1500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1481 | 2025-10-07 |
Interleukin-1β modulates lymphoid differentiation of Flt3-positive multipotent progenitors after transplantation
2024-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114890
PMID:39425929
|
研究论文 | 本研究揭示了IL-1β在移植后通过调节Flt3阳性多能祖细胞命运促进B淋巴细胞生成的新机制 | 首次发现IL-1β能够诱导Flt3 MPPs从髓系偏向向淋巴系偏向的细胞命运转换，并促进B淋巴细胞生成 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类系统中验证 | 探究应激环境中调控造血干细胞和祖细胞行为的因子及其机制 | 表达Flt3的小鼠多能祖细胞(MPPs) | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序,谱系追踪,克隆分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1482 | 2025-10-07 |
Spatial, transcriptomic, and epigenomic analyses link dorsal horn neurons to chronic pain genetic predisposition
2024-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114876
PMID:39453813
|
研究论文 | 本研究通过多物种方法整合猕猴、人类和小鼠数据，构建了背角神经元亚型的统一图谱，并揭示了慢性疼痛遗传易感性与神经元亚型特异性染色质区域的关联 | 首次构建了跨物种保守的背角神经元亚型图谱，结合空间转录组学精确定位神经元层状分布，并建立了慢性疼痛GWAS变异与神经元特异性调控元件的直接联系 | 研究主要依赖动物模型数据，人类样本验证相对有限，调控机制的功能验证需要进一步实验 | 确定慢性疼痛遗传变异是否影响背角神经元的调控基因组学 | 背角神经元 | 空间转录组学 | 慢性疼痛 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 开放染色质分析 | 跨物种整合分析 | 转录组数据, 表观基因组数据, 空间定位数据 | 猕猴单核RNA测序图谱整合人类和小鼠数据集 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学, 单核开放染色质分析 | NA | NA |
| 1483 | 2025-10-07 |
IL-2-inducible T cell kinase deficiency sustains chimeric antigen receptor T cell therapy against tumor cells
2024-Nov-26, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178558
PMID:39589809
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9技术敲除CAR-T细胞中的ITK基因，显著改善了CAR-T细胞的抗肿瘤效果和持久性 | 首次揭示ITK缺失可通过降低CAR-T细胞耗竭、增强记忆特征来提升抗肿瘤疗效 | 研究主要聚焦CD19-CAR-T细胞，尚未验证其他CAR靶点的普适性 | 探索改善CAR-T细胞治疗持久性和抗肿瘤效果的新策略 | CD19-CAR-T细胞 | 免疫治疗 | 白血病 | CRISPR-Cas9基因编辑，RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1484 | 2025-10-07 |
The peripheral Atf3 + neuronal population is responsible for nerve regeneration at the early stage of nerve injury revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Nov-13, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2024169
PMID:39539109
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示外周神经损伤早期Atf3+神经元群体在神经再生中的作用机制 | 发现CCI诱导的新型神经元群体(CIP)高表达Atf3和再生相关基因，并揭示其与卫星胶质细胞间的信号通讯网络 | 研究仅关注损伤后第3天的早期阶段，未涵盖完整再生过程的时间动态变化 | 探究外周神经损伤后背根神经节细胞的转录组变化与神经再生机制 | 小鼠背根神经节细胞 | 单细胞基因组学 | 外周神经损伤 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 小鼠慢性压迫损伤模型DRG细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1485 | 2025-10-07 |
Arabidopsis uses a molecular grounding mechanism and a biophysical circuit breaker to limit floral abscission signaling
2024-Oct-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405806121
PMID:39453742
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了拟南芥花器官脱落信号通路的分子调控机制 | 发现MKP1作为负调控因子建立脱落信号阈值，并鉴定IDA肽家族形成生物物理断路器机制 | 研究仅限于拟南芥模型，未验证其他植物物种的普适性 | 解析植物花器官脱落信号通路的调控机制 | 拟南芥花器官脱落区细胞 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1486 | 2025-10-07 |
Aberrant activation of wound healing programs within the metastatic niche facilitates lung colonization by osteosarcoma cells
2024-Sep-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.10.575008
PMID:38260361
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了骨肉瘤细胞通过诱导肺纤维化形成转移前微环境的机制，并验证了抗纤维化药物尼达尼布的治疗潜力 | 首次发现骨肉瘤细胞通过诱导肺泡上皮损伤和慢性伤口愈合表型来创建肺转移前微环境，并证明抗纤维化药物可阻断此过程 | 研究主要基于小鼠模型和异种移植模型，人类样本验证有限 | 阐明骨肉瘤肺转移前微环境形成的细胞和分子机制，并寻找转移特异性治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、肺组织微环境、免疫活性小鼠模型、免疫缺陷人源异种移植模型 | 单细胞生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 多参数免疫荧光 | NA | 转录组数据, 蛋白质表达数据, 空间定位数据 | 免疫活性小鼠模型和免疫缺陷人源异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1487 | 2025-10-07 |
Exploring the causal role of immune cells in cerebral aneurysm through single-cell transcriptomics and Mendelian randomization analysis
2024-Jul-12, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxae042
PMID:38661482
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和孟德尔随机化分析探索免疫细胞在脑动脉瘤中的因果作用 | 首次整合单细胞转录组学与孟德尔随机化分析，揭示脑动脉瘤与免疫细胞之间的双向因果关系 | 研究仅基于未破裂脑动脉瘤样本，缺乏破裂动脉瘤数据 | 探索免疫细胞与脑动脉瘤形成的复杂相互作用机制 | 脑动脉瘤患者和对照组的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 脑动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据 | GSE193533数据集中的未破裂脑动脉瘤和对照组样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1488 | 2025-10-07 |
Advances in the Immunology of the Host-Parasite Interactions in African Trypanosomosis, including Single-Cell Transcriptomics
2024-Feb-20, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens13030188
PMID:38535532
|
综述 | 本文综述了非洲锥虫病宿主-寄生虫相互作用的免疫学进展，重点介绍了单细胞转录组学技术的应用 | 整合了最新的单细胞和空间测序技术研究锥虫生命周期阶段和宿主细胞的转录组特征 | NA | 深入理解寄生虫生物学和宿主免疫机制，为开发新的疫苗和治疗策略提供基础 | 锥虫寄生虫、哺乳动物宿主细胞、组织微环境 | 单细胞生物学 | 寄生虫病 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1489 | 2025-10-07 |
Identification of RNA-binding protein RBMS3 as a potential biomarker for immunotherapy in bladder cancer
2024-Dec, Cancer biomarkers : section A of Disease markers
IF:2.2Q3
DOI:10.3233/CBM-230489
PMID:39392600
|
研究论文 | 本研究识别RNA结合蛋白RBMS3作为膀胱癌免疫治疗的潜在生物标志物 | 首次将RBMS3鉴定为膀胱癌中具有肿瘤微环境重塑功能的关键预后RNA结合蛋白 | 研究主要基于生物信息学分析，需要实验验证 | 开发基于RNA结合蛋白的预后特征并识别膀胱癌中的关键枢纽RBP | 膀胱癌组织和细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 风险模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 多个生物信息学数据库的数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1490 | 2025-10-07 |
Defective ribosome assembly impairs leukemia progression in a murine model of acute myeloid leukemia
2024-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114864
PMID:39412990
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型和单细胞分析揭示核糖体组装缺陷可延缓急性髓系白血病进展 | 首次证明核糖体组装缺陷可通过改变转录因子景观和增加核糖体生物合成来抑制白血病进展 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用效果尚需验证 | 探究核糖体组装在白血病细胞功能中的作用及其治疗潜力 | 急性髓系白血病（AML）细胞和小鼠模型 | 癌症生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | 小鼠白血病模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 患者数据集和多个小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1491 | 2025-10-07 |
Polyclonal regeneration of mouse bone marrow endothelial cells after irradiative conditioning
2024-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114779
PMID:39489938
|
研究论文 | 本研究探讨了小鼠骨髓内皮细胞在辐照预处理后的多克隆再生机制 | 首次结合单细胞RNA测序、体外克隆形成实验和机器学习模型，系统揭示了骨髓内皮细胞再生的多克隆特性 | 研究仅限于小鼠模型，人类骨髓内皮细胞的再生机制可能有所不同 | 阐明辐照预处理后骨髓内皮细胞的再生机制 | 小鼠骨髓内皮细胞 | 单细胞生物学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 成像技术, 体外克隆形成实验 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1492 | 2025-10-07 |
Scm6A: A Fast and Low-cost Method for Quantifying m6A Modifications at the Single-cell Level
2024-Oct-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae039
PMID:39436235
|
研究论文 | 开发了一种基于机器学习的单细胞m6A定量方法Scm6A，用于快速低成本检测单细胞水平的m6A修饰 | 首次提出基于机器学习的方法实现单细胞水平m6A定量，解决了现有方法难以检测m6A细胞间异质性的问题 | NA | 开发可靠的单细胞m6A定量方法并验证其在不同疾病研究中的应用 | 外周血单个核细胞、CD4+和CD8+T细胞、肺癌组织、COVID-19患者血液样本 | 机器学习 | 肺癌, COVID-19 | 单细胞RNA测序, m6A测序, 磁激活细胞分选 | 机器学习 | 基因表达数据, 序列特征数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, m6A-seq | NA | NA |
| 1493 | 2025-10-07 |
MSIsensor-RNA: Microsatellite Instability Detection for Bulk and Single-cell Gene Expression Data
2024-Sep-13, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae004
PMID:39341794
|
研究论文 | 开发了一种基于基因表达数据检测微卫星不稳定性的软件工具MSIsensor-RNA | 首个能够同时处理批量和单细胞基因表达数据的MSI检测方法 | 未在摘要中明确说明 | 开发微卫星不稳定性检测工具 | 批量和单细胞基因表达数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序, 微阵列, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 1494 | 2025-10-07 |
SCancerRNA: Expression at the Single-cell Level and Interaction Resource of Non-coding RNA Biomarkers for Cancers
2024-Sep-13, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae023
PMID:39341795
|
研究论文 | 开发了一个名为SCancerRNA的综合性数据库，用于汇总非编码RNA生物标志物在单细胞水平的表达数据和相互作用网络 | 首个系统整理单细胞水平非编码RNA生物标志物表达数据的在线资源，整合了多种ncRNA类型及其相互作用网络 | 数据库内容依赖于已有的实验支持数据，可能无法覆盖所有相关研究 | 构建一个全面的非编码RNA生物标志物数据库，支持癌症诊断和治疗监测 | 长链非编码RNA、microRNA、PIWI互作RNA、小核仁RNA和环状RNA等非编码RNA生物标志物 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、相互作用网络数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1495 | 2025-10-07 |
DVsc: An Automated Framework for Efficiently Detecting Viral Infection from Single-cell Transcriptomics Data
2024-Jul-03, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzad007
PMID:39215426
|
研究论文 | 开发了一个名为DVsc的开源框架，用于从单细胞转录组数据中高效检测病毒感染 | 首个专门基于单细胞RNA测序数据高效检测病毒读段的计算框架 | NA | 开发精确定量分析单细胞转录组数据中病毒感染的计算工具 | 临床样本中的病毒感染检测 | 生物信息学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约200个不同的临床样本，感染超过10种不同病毒 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 兼容多种单细胞测序平台 |
| 1496 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatially resolved interactomics of tooth-associated keratinocytes in periodontitis
2024-Jun-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49037-y
PMID:38876998
|
研究论文 | 通过单细胞和空间分辨率互作组学研究牙周炎中牙齿相关角质形成细胞的作用 | 构建了人类牙周组织的综合单细胞RNA测序图谱，揭示了牙周炎中沟内和结合上皮角质形成细胞的差异化状态及与细菌的细胞特异性趋向性 | 需要进一步研究以支持慢性炎症状态下的精准牙周干预 | 研究牙周炎中牙周微环境细胞类型与微生物的关系 | 人类牙周组织中的沟内和结合上皮角质形成细胞(SK/JKs) | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 单细胞宏基因组学, 荧光原位杂交, 多重免疫荧光 | 细胞-细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 34个样本, 105,918个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1497 | 2025-10-07 |
Multimodal Learning for Mapping the Genotype-Phenotype Dynamics
2024-May-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4355413/v1
PMID:38798675
|
研究论文 | 开发了一个多模态基础模型来探索人类转录组学在细胞水平的基因型-表型关系流形 | 提出了计算整合遗传学框架，同时分析基因型和表型的高维景观，通过多模态基础模型揭示传统基因表达分析无法检测的跨组织生物标志物 | NA | 解析基因表达与表型表现之间的动态相互作用关系 | 人类转录组学数据，特别是内皮细胞中的VWF基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，语言模型 | 多模态基础模型，语言模型 | 基因表达数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1498 | 2025-10-07 |
Spinster homolog 2 reduces malignancies of glioblastoma via PTEN/PI3K/AKT pathway
2024-03, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.2785
PMID:37728571
|
研究论文 | 本研究探讨SPNS2通过PTEN/PI3K/AKT通路抑制胶质母细胞瘤恶性进展的分子机制 | 首次揭示SPNS2在胶质母细胞瘤中的抑癌功能及其通过PTEN/PI3K/AKT通路调控肿瘤恶性进展和免疫浸润的新机制 | 未明确SPNS2调控PTEN/PI3K/AKT通路的具体分子机制，缺乏临床样本验证 | 探究SPNS2在胶质母细胞瘤中的生物学功能和分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系和体内移植瘤模型 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序, 单细胞测序, 基因富集分析, 细胞功能实验, 体内移植瘤实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 利用TCGA和CGGA数据库的胶质瘤样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1499 | 2025-10-07 |
Metabolic reprogramming by mutant GNAS creates an actionable dependency in intraductal papillary mucinous neoplasms of the pancreas
2024-Dec-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332412
PMID:39277181
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤中KRAS和GNAS突变共同表达导致代谢重编程的机制 | 首次证明GNAS R201C突变与KRAS G12D协同作用诱导胃幽门型化生基因特征和糖酵解依赖性 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，需要进一步在人类样本中验证 | 探究GNAS R201C突变对胰腺肿瘤表型、转录组特征和基因组依赖性的影响 | 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMNs)和肿瘤来源细胞系 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | CRISPR/Cas9筛选, 实时代谢分析, 磷酸化分析 | 小鼠遗传模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | p48Cre; KrasLSL-G12D; Rosa26LSL-rtTA; Tg (TetO-GnasR201C)小鼠模型和肿瘤来源细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1500 | 2025-04-25 |
Transcriptional profiles of murine oligodendrocyte precursor cells across the lifespan
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.27.620502
PMID:39554158
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术，探究了小鼠少突胶质前体细胞（OPCs）在整个生命周期中的转录组变化 | 创建了一种新型转基因小鼠系，用于高分辨率解析OPCs从静止到增殖和分化的关键转变过程中的转录变化 | 研究仅针对小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究衰老如何影响少突胶质前体细胞（OPCs）的转录组特征及其功能 | 小鼠少突胶质前体细胞（OPCs） | 生物医学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | RNA-seq数据 | 30至720天龄的小鼠OPCs | NA | NA | NA | NA |