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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 1461 - 1480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1461 | 2025-10-07 |
Interpretable single-cell factor decomposition using sciRED
2024-Aug-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4819117/v1
PMID:39149508
|
研究论文 | 开发了一种名为sciRED的可解释单细胞因子分解方法，用于改进scRNA-seq数据的因子分析 | 通过消除已知混杂效应、使用旋转提高因子可解释性、将因子映射到已知协变量、识别可能捕获隐藏生物现象的非解释因子 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的因子分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子分解模型 | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1462 | 2025-10-07 |
Endogenous FGFs drive ERK-dependent cell fate patterning in 2D human gastruloids
2024-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.08.602611
PMID:39026750
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研究论文 | 本研究揭示了FGF依赖性ERK信号在2D人类胃泌样体中驱动细胞命运模式化的新机制 | 发现了FGF4和FGF17通过基底定位的FGFR1信号诱导原始条纹样细胞的新机制，与人类和猴胚胎相似但与小鼠不同 | 研究基于体外2D胃泌样体模型，与真实胚胎环境存在差异 | 探究FGF在人类胃泌样体模型中的功能和作用机制 | 2D人类胃泌样体模型 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, 原位杂交 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1463 | 2025-10-07 |
Transcriptional control of the Cryptosporidium life cycle
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07466-1
PMID:38811723
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示隐孢子虫完整生命周期的基因表达程序 | 推翻现有模型，仅识别出三种细胞内阶段；发现Myb-M转录因子是雄性命运的最早决定因素 | 研究主要基于体外培养和感染动物模型，人类直接应用需进一步验证 | 解析隐孢子虫生命周期分子机制以推动疫苗和治疗开发 | 微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum) | 单细胞生物学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 体外培养和感染动物样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1464 | 2025-10-07 |
Spatial co-transcriptomics reveals discrete stages of the arbuscular mycorrhizal symbiosis
2024-04, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01666-3
PMID:38589485
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组技术揭示了植物与丛枝菌根真菌共生关系的细胞和空间动态过程 | 首次在细胞和空间分辨率水平整合分析植物和真菌转录组，揭示了皮层细胞在不同定殖阶段的动态转录组特征 | 研究仅限于两种模式生物，且技术方法可能无法完全捕获所有细胞类型的转录信息 | 探索植物与丛枝菌根真菌共生关系的分子机制 | 蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)和根内球囊霉(Rhizophagus irregularis) | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1465 | 2025-05-08 |
Induced B-Cell Receptor Diversity Predicts PD-1 Blockade Immunotherapy Response
2024-Dec-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.03.626669
PMID:39677742
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research paper | 研究通过单细胞RNA测序和高清空间转录组学分析，揭示了B细胞受体多样性在预测PD-1阻断免疫治疗反应中的作用 | 发现PD-1抑制成功反应的特征是治疗后B细胞受体克隆多样性的诱导，并验证了其作为跨多种癌症治疗反应预测因子的普遍性 | 研究样本主要集中在特定类型的癌症患者，可能限制了结果的广泛适用性 | 探索PD-1阻断免疫治疗反应的机制，并寻找预测治疗反应的生物标志物 | 局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者 | digital pathology | basal cell carcinoma, glioblastoma, melanoma, head and neck squamous cell carcinoma | single-cell RNA sequencing, high-definition spatial transcriptomics, spatial immunoreceptor profiling | machine learning | RNA sequencing data | 一组局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及更大的胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 1466 | 2025-05-08 |
Senescence of human pancreatic beta cells enhances functional maturation through chromatin reorganization and promotes interferon responsiveness
2024-Jun-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae313
PMID:38682582
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研究论文 | 研究人类胰腺β细胞的衰老如何通过染色质重组增强功能成熟并促进干扰素反应性 | 揭示了p16阳性β细胞的衰老状态如何通过染色质重组激活功能成熟基因的增强子，从而增强胰岛素分泌能力，并首次发现这些细胞中干扰素刺激基因的升高 | 研究主要基于体外培养的β样细胞和单细胞转录组数据，未在体内模型中验证这些发现 | 探究人类胰腺β细胞衰老对其功能成熟和干扰素反应性的影响 | 人类胰腺β细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 成人人类胰腺β细胞的单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1467 | 2025-05-08 |
Cabergoline targets multiple pathways to inhibit PRL secretion and increases stromal fibrosis
2024-Jun-05, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/ejendo/lvae055
PMID:38781434
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析卡麦角林治疗和未治疗的泌乳素瘤的细胞组成和转录景观，揭示卡麦角林抑制PRL分泌及增加间质纤维化的多途径机制 | 首次描述了卡麦角林治疗后CD8+ T细胞的未知激活，这可能在其抗肿瘤作用中发挥作用 | 样本量较小（仅5例手术切除的泌乳素瘤） | 揭示多巴胺激动剂治疗在人类泌乳素瘤肿瘤及邻近间质和免疫细胞中的潜在机制 | 3例卡麦角林治疗患者和2例未治疗患者的5例手术切除泌乳素瘤 | 单细胞转录组学 | 泌乳素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | 5例手术切除的泌乳素瘤（3例治疗，2例未治疗） | NA | NA | NA | NA |
| 1468 | 2025-05-08 |
Single-cell Transcriptome Analysis Identifies Senescent Osteocytes as Contributors to Bone Destruction in Breast Cancer Metastasis
2024-Mar-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4047486/v1
PMID:38558984
|
research paper | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了衰老骨细胞在乳腺癌骨转移中促进骨破坏的作用 | 首次发现乳腺癌骨转移中的骨细胞会提前衰老并表现出独特的衰老相关分泌表型(SASP)，促进骨破坏 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究乳腺癌骨转移中骨微环境重编程对骨细胞的影响 | 乳腺癌骨转移中的骨细胞 | digital pathology | breast cancer | single-cell RNA sequencing, multiplex hybridization, AI-assisted analysis | NA | RNA-seq数据 | 小鼠模型和乳腺癌骨转移患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1469 | 2025-05-08 |
A review of single-cell transcriptomics and epigenomics studies in maternal and child health
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2343276
PMID:38709139
|
review | 本文综述了单细胞转录组学和表观基因组学在母婴健康领域的研究 | 总结了16个人类和哺乳动物胎盘的单细胞图谱以及31项关于母体暴露和并发症的单细胞研究 | NA | 综述单细胞测序技术在母婴健康领域的应用 | 人类和哺乳动物胎盘以及母体暴露和并发症 | 单细胞测序 | 母婴健康相关疾病 | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | 单细胞测序数据 | 16个单细胞图谱和31项单细胞研究 | NA | NA | NA | NA |
| 1470 | 2025-05-07 |
Cell-type deconvolution for bulk RNA-seq data using single-cell reference: a comparative analysis and recommendation guideline
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf031
PMID:39899596
|
研究论文 | 本文通过系统评估九种基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法，提出了在不同场景下选择合适方法的推荐指南 | 首次系统比较了多种基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法，并提出了实用推荐指南 | 研究仅评估了九种方法，可能未涵盖所有现有方法 | 评估和比较基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法在组织细胞类型比例估计中的准确性和鲁棒性 | 九种反卷积方法和五组单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | 五组单细胞RNA测序数据集和真实批量数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1471 | 2025-05-07 |
Characterizing tumor biology and immune microenvironment in high-grade serous ovarian cancer via single-cell RNA sequencing: insights for targeted and personalized immunotherapy strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1500153
PMID:39896800
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究高级别浆液性卵巢癌的肿瘤生物学特性及免疫微环境，为靶向和个性化免疫治疗策略提供见解 | 利用单细胞RNA测序技术系统研究HGSOC的肿瘤异质性和免疫微环境，发现与不良预后相关的C2 IGF2+肿瘤细胞亚型及其与肿瘤进展的关联 | 研究依赖于公开数据库的scRNA-seq数据，可能受限于样本量和数据质量 | 揭示HGSOC进展和治疗抵抗的分子机制，开发更有效的个性化治疗策略 | 高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）的肿瘤细胞亚型及其免疫微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 预后模型 | RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1472 | 2025-05-07 |
Elucidating the causal associations and mechanisms between circulating immune cells and idiopathic pulmonary fibrosis: new insights from Mendelian randomization and transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1437984
PMID:39896814
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和转录组学分析，探讨循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及潜在生物标志物 | 结合孟德尔随机化和转录组学数据，首次系统性地研究了免疫细胞表型与IPF的因果关系，并鉴定了三个新的生物标志物 | 研究依赖于公开数据库的GWAS数据，可能存在样本选择偏倚 | 阐明循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及机制 | 循环免疫细胞表型和特发性肺纤维化患者 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 孟德尔随机化分析、转录组学分析、单细胞RNA测序 | IVW等五种孟德尔随机化方法 | 基因组关联研究数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自公开数据库的GWAS数据和IPF患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1473 | 2025-05-07 |
Novel pyroptosis-immune-related lncRNA signature exhibits a distinct immune cell infiltration landscape in breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522327
PMID:39906743
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研究论文 | 本研究通过分析焦亡和免疫相关的长链非编码RNA（lncRNA），构建了一个六-lncRNA特征，用于预测乳腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次构建了一个结合焦亡和免疫相关lncRNA的特征，用于预测乳腺癌预后和免疫治疗反应，并揭示了不同的免疫细胞浸润模式 | 研究依赖于TCGA数据集，需要进一步的外部验证 | 识别乳腺癌的潜在治疗靶点，并预测患者的预后和免疫治疗反应 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | Pearson相关系数、单变量Cox回归分析、LASSO方法、单细胞测序 | 六-lncRNA特征模型 | RNA-seq数据、单细胞测序数据 | TCGA数据集中的乳腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1474 | 2025-10-07 |
Application of Spatial Transcriptomics in Digestive System Tumors
2024-Dec-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15010021
PMID:39858416
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综述 | 介绍空间转录组学技术在消化系统肿瘤研究中的应用进展与前景 | 整合空间转录组学与单细胞RNA测序、人工智能和机器学习技术的研究策略 | 未提及具体研究数据和方法细节 | 探讨空间转录组学在消化系统肿瘤研究中的应用价值 | 消化系统肿瘤 | 空间转录组学 | 消化系统肿瘤 | 空间转录组学, scRNA-seq | 机器学习, 人工智能 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1475 | 2025-10-07 |
S100A11 is a potential prognostic biomarker and correlated with tumor immunosuppressive microenvironment in glioma
2024-Dec-20, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000040701
PMID:39705426
|
研究论文 | 本研究探讨S100A11作为胶质瘤相关巨噬细胞潜在生物标志物的作用及其与胶质母细胞瘤免疫抑制微环境的关系 | 首次发现S100A11在胶质瘤相关巨噬细胞中高表达，并证实其与巨噬细胞浸润存在强相关性 | NA | 更好理解胶质瘤免疫微环境，探索S100A11作为生物标志物的潜力 | 胶质瘤相关巨噬细胞(GAMs)和胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | Western blot, 免疫组织化学, 免疫荧光分析, 单细胞测序, 免疫浸润分析 | NA | 蛋白质表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1476 | 2025-10-07 |
Deciphering cell states and the cellular ecosystem to improve risk stratification in acute myeloid leukemia
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf028
PMID:39865982
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研究论文 | 通过构建急性髓系白血病单细胞转录组图谱和开发sciNMF工作流程，系统解析细胞异质性并建立ACE特征以改善预后预测 | 提出了sciNMF工作流程识别26种白血病和免疫细胞状态，首次定义了AML细胞生态系统(ACE)概念并开发了12基因特征(ACEsig) | 研究基于单细胞转录组数据，需要进一步验证其在更广泛临床场景中的应用效果 | 改善急性髓系白血病的风险分层策略 | 急性髓系白血病患者的白血病细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF) | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量，但包含公共RNA-seq队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1477 | 2025-10-07 |
Salmonella dry surface biofilm: morphology, single-cell landscape, and sanitization
2024-Nov-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01623-24
PMID:39494899
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研究论文 | 本研究比较了鼠伤寒沙门氏菌干表面生物膜和湿表面生物膜的形成特征，并通过单细胞转录组学分析其功能异质性，最后评估了黄酮类化合物与异丙醇联合使用的消毒效果 | 首次全面研究干表面生物膜的特性并探索其潜在生存机制，提出溶解于70%异丙醇的桑色素作为高效干式消毒剂 | 研究仅针对鼠伤寒沙门氏菌，未涉及其他食源性病原体 | 探究干表面生物膜的形成特征、功能异质性及消毒方法 | 鼠伤寒沙门氏菌干表面生物膜和湿表面生物膜 | 微生物学 | 食源性疾病 | 共聚焦激光扫描显微镜,电子显微镜,单细胞转录组学 | NA | 显微镜图像,转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1478 | 2025-10-07 |
Inhibition of SUMOylation Induces Adaptive Antitumor Immunity against Pancreatic Cancer through Multiple Effects on the Tumor Microenvironment
2024-Nov-04, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-23-0572
PMID:39150446
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研究论文 | 本研究通过抑制SUMOylation探索了胰腺癌治疗的新机制，发现该过程通过调节肿瘤微环境诱导适应性抗肿瘤免疫 | 首次揭示SUMOylation抑制在体内通过T细胞依赖性机制诱导适应性抗肿瘤免疫，而非直接抑制肿瘤细胞增殖 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探究SUMOylation抑制对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响及其治疗机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)小鼠模型及肿瘤微环境中的各类细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序，流式细胞术，免疫荧光，免疫组化，Western blot，qPCR | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据，基因表达数据 | 临床相关原位PDAC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1479 | 2025-10-07 |
CRISPR Screening of Transcribed Super-Enhancers Identifies Drivers of Triple-Negative Breast Cancer Progression
2024-Nov-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3995
PMID:39186674
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研究论文 | 通过CRISPR筛选技术鉴定三阴性乳腺癌进展的关键调控元件 | 首次系统分析三阴性乳腺癌特异性超级增强子及其eRNA转录本，结合CRISPR干扰和染色质互作图谱揭示调控机制 | 研究聚焦于前30个eRNA产生的超级增强子，可能未覆盖所有相关调控元件 | 揭示三阴性乳腺癌中超级增强子驱动的基因调控网络 | 三阴性乳腺癌细胞系和动物模型 | 功能基因组学 | 三阴性乳腺癌 | CRISPR干扰筛选,RNA测序,Hi-C染色质构象捕获,单细胞RNA测序,ATAC-seq | NA | 基因组学数据,转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,染色质可及性测序 | NA | NA |
| 1480 | 2025-10-07 |
Pharmacological targets and validation of remdesivir for the treatment of COVID-19-associated pulmonary fibrosis: A network-based pharmacology and bioinformatics study
2024-Sep-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039062
PMID:39331891
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研究论文 | 通过生物信息学和网络药理学方法研究瑞德西韦治疗COVID-19相关肺纤维化的靶点和分子机制 | 首次系统整合网络药理学、分子对接和单细胞测序数据验证瑞德西韦对COVID-19相关肺纤维化的多靶点作用机制 | 研究主要基于公开数据库的预测分析，需要后续实验验证 | 探究瑞德西韦治疗COVID-19相关肺纤维化的药理靶点和作用机制 | 瑞德西韦、COVID-19和肺纤维化的共同靶点 | 生物信息学 | COVID-19相关肺纤维化 | 网络药理学、生物信息学分析、分子对接、单细胞测序 | 蛋白互作网络分析、转录因子调控网络分析 | 组学数据、测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |