单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7855 篇文献，本页显示第 1461 - 1480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1461 | 2024-11-24 |
Integrated analysis of single-cell, spatial and bulk RNA-sequencing identifies a cell-death signature for predicting the outcomes of head and neck cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1487966
PMID:39575251
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，识别出一种细胞死亡特征，用于预测头颈部癌症的预后 | 本文创新性地整合了单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，构建了一个细胞死亡相关特征风险评分模型（CDRscore），用于预测头颈部癌症的预后 | NA | 研究细胞死亡在头颈部癌症复发和术后预后中的作用，并开发一种预测预后的模型 | 头颈部癌症患者的单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据和空间转录组学数据 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 涉及五种主要亚型的头颈部癌症相关单细胞RNA测序数据，以及来自TCGA数据集的批量RNA测序数据和喉鳞状细胞癌的空间转录组学数据 |
| 1462 | 2024-11-23 |
Atlas of Metastatic Gastric Cancer Links Ferroptosis to Disease Progression and Immunotherapy Response
2024-Dec, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.038
PMID:39097198
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组和免疫分析，揭示了胃腺癌转移过程中铁死亡与疾病进展及免疫治疗反应的关系 | 首次大规模分析了胃腺癌转移的单细胞数据，揭示了铁死亡在疾病进展中的作用，并提出了联合CAR-T细胞疗法的新治疗策略 | 研究主要集中在治疗前患者的样本，未来需进一步验证在治疗后患者中的效果 | 深入理解胃腺癌转移的肿瘤和免疫生物学机制，开发创新有效的治疗方法 | 胃腺癌转移的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 68对治疗前原发性和转移性肿瘤样本 |
| 1463 | 2024-11-23 |
Mucosal Single-Cell Profiling of Crohn's-Like Disease of the Pouch Reveals Unique Pathogenesis and Therapeutic Targets
2024-Dec, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.025
PMID:39084267
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研究论文 | 研究了克罗恩样袋病（CDP）的黏膜单细胞分析，揭示了其独特的病理机制和治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术分析了CDP的黏膜细胞，揭示了其独特的免疫细胞特征和细胞内信号通路 | 样本量较小，且仅限于特定患者群体 | 探讨克罗恩样袋病（CDP）的病理生理机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 克罗恩样袋病（CDP）患者的黏膜细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、免疫组化 | NA | 细胞 | 50名接受回肠储袋-肛门吻合术的患者 |
| 1464 | 2024-11-23 |
CVGAE: A Self-Supervised Generative Method for Gene Regulatory Network Inference Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2024-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00633-y
PMID:38778003
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研究论文 | 提出了一种基于单细胞RNA测序数据的自我监督生成方法CVGAE用于基因调控网络推断 | 使用图神经网络进行归纳表示学习，将基因表达数据和观测拓扑结构合并到低维向量空间中，并采用多层GraphSAGE作为编码器和改进的解码器来克服网络稀疏性问题 | NA | 改进基因调控网络推断的准确性和模型泛化能力 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 多个包含四个相关真实网络的单细胞数据集 |
| 1465 | 2024-11-23 |
Luteinizing Hormone Receptor Mutation (LHRN316S) Causes Abnormal Follicular Development Revealed by Follicle Single-Cell Analysis and CRISPR/Cas9
2024-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00646-7
PMID:39150470
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和CRISPR/Cas9技术研究黄体生成素受体突变对卵泡发育的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了黄体生成素受体突变对卵泡发育的影响，并利用CRISPR/Cas9技术构建了LHR小鼠模型 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨黄体生成素受体突变对卵泡发育的影响及其在女性不孕治疗中的潜在应用 | 卵泡中的卵母细胞、卵丘颗粒细胞和壁颗粒细胞 | NA | 女性不孕 | 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9 | NA | RNA | 14只LHR雌性小鼠和ICR野生型雄性小鼠交配 |
| 1466 | 2024-11-23 |
A Study on the Inflammatory Response of the Brain in Neurosyphilis
2024-Nov-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406971
PMID:39574316
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研究论文 | 研究了神经梅毒中大脑的炎症反应机制 | 通过蛋白质组学和单细胞转录组学的整合分析，确定了Toll样/NF-κB信号通路在Tp引起的中枢神经系统损伤中的关键作用 | NA | 揭示Tp感染引起的神经梅毒中炎症介导的脑损伤机制 | 神经梅毒患者的中枢神经系统和外周血中的炎症细胞 | NA | 神经梅毒 | 蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据 | NA |
| 1467 | 2024-11-23 |
Evidence for a lipofibroblast-to- Cthrc1 + myofibroblast reversible switch during the development and resolution of lung fibrosis in young mice
2024-Nov-21, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00482-2023
PMID:39401861
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研究论文 | 研究了年轻小鼠肺纤维化发展及消退过程中脂质成纤维细胞向Cthrc1+肌成纤维细胞的可逆转换 | 揭示了肌成纤维细胞在肺纤维化消退过程中的异质性及其分化轨迹 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨肺纤维化发展及消退过程中肌成纤维细胞的来源和命运 | 年轻小鼠的肺纤维化过程 | NA | 肺纤维化 | 遗传谱系追踪和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类IPF数据集 |
| 1468 | 2024-11-23 |
Mapping of the T Cell Landscape of Biliary Tract Cancer Unravels Anatomical Subtype-Specific Heterogeneity
2024-Nov-21, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1173
PMID:39570809
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研究论文 | 研究揭示了胆道癌不同亚型中T细胞的分布和异质性 | 首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序，结合病理切片分析，揭示了胆道癌不同亚型中T细胞的多样性和空间分布特征 | 研究样本量较小，且仅限于胆道癌患者，可能影响结果的普适性 | 探讨胆道癌不同亚型中T细胞的分布特征，为个性化免疫治疗提供依据 | 胆道癌（包括肝内胆管癌、肝外胆管癌和胆囊癌）患者的T细胞 | 数字病理学 | 胆道癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | NA | 单细胞数据和病理切片图像 | 36个样本来自16名胆道癌患者 |
| 1469 | 2024-11-23 |
Chronic Inflammation Deters Natural Killer Cell Fitness and Cytotoxicity in Myeloid Leukemia
2024-Nov-21, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014592
PMID:39571169
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研究论文 | 研究慢性炎症对骨髓性白血病中自然杀伤细胞功能的影响 | 首次揭示了慢性炎症通过肿瘤坏死因子-α（TNFa）及其受体TNFR2和SOCS家族基因Cish抑制自然杀伤细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体内验证 | 探讨慢性炎症对骨髓性白血病中自然杀伤细胞功能的影响及其机制 | 自然杀伤细胞在慢性骨髓性白血病中的功能和表型变化 | 免疫学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了BCR::ABL1+ CML小鼠模型和健康供体的自然杀伤细胞 |
| 1470 | 2024-11-23 |
Deciphering single-cell gene expression variability and its role in drug response
2024-Nov-20, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddae138
PMID:39277847
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，探讨了药物反应中基因表达变异性的作用 | 本研究将药物反应与药物基因表达变异性的联系扩展到细胞层面，并提出了一种增强药物疗效预测的新方法 | NA | 探讨基因表达变异性在药物反应中的作用 | 药物基因在不同细胞类型和组织中的表达变异性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及八种不同人体组织的多种细胞类型 |
| 1471 | 2024-11-23 |
Salmonella dry surface biofilm: morphology, single-cell landscape, and sanitization
2024-Nov-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01623-24
PMID:39494899
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研究论文 | 研究了Typhimurium干表面生物膜（DSB）的形成及其与湿表面生物膜（WSB）的比较，探讨了DSB的形态、单细胞景观和消毒方法 | 首次全面研究了DSB的特征及其生存机制，并提出了morin溶解在70%异丙醇中作为有效的干消毒剂 | NA | 探讨干表面生物膜的形成及其在低水分食品加工环境中的生存机制和消毒方法 | Typhimurium干表面生物膜（DSB）和湿表面生物膜（WSB） | NA | NA | 共聚焦激光扫描显微镜分析、电子显微镜、微生物组单细胞转录组学 | NA | 图像 | 39种黄酮类化合物和70%异丙醇（IPA）的组合效果测试 |
| 1472 | 2024-11-23 |
TRAIL induces podocyte PANoptosis via death receptor 5 in diabetic kidney disease
2024-Nov-19, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.10.026
PMID:39571905
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研究论文 | 研究探讨了TRAIL通过死亡受体5诱导足细胞PANoptosis在糖尿病肾病中的作用 | 首次揭示了TRAIL/DR5在糖尿病肾病中通过激活PANoptosis导致足细胞损伤的自身分泌作用 | NA | 探讨TRAIL/DR5在糖尿病肾病中诱导足细胞PANoptosis的作用机制 | 糖尿病肾病患者的足细胞 | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三例正常人肾样本和三例糖尿病肾病肾样本 |
| 1473 | 2024-11-23 |
Construction of molecular subtype and prognostic model for gastric cancer based on nucleus-encoded mitochondrial genes
2024-11-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78729-0
PMID:39557952
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研究论文 | 本研究基于核编码线粒体基因构建胃癌的分子亚型和预后模型 | 首次揭示了核编码线粒体基因突变与胃癌患者生存结果之间的关联，并开发了一个评分系统来预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，可能存在样本偏倚和数据质量问题 | 探讨核编码线粒体基因在胃癌中的作用，并开发一个预后模型来预测患者的治疗反应 | 胃癌患者的核编码线粒体基因表达和临床信息 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃癌样本 |
| 1474 | 2024-11-23 |
Integrated analysis of single-cell RNA sequencing and bulk transcriptome data identifies a pyroptosis-associated diagnostic model for Parkinson's disease
2024-11-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80185-9
PMID:39558055
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，识别出与帕金森病相关的细胞焦亡相关诊断模型 | 首次通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，构建了基于细胞焦亡相关基因的帕金森病诊断模型 | 研究主要基于数据分析，缺乏临床验证 | 开发一种新的帕金森病诊断模型，特别是在疾病的早期阶段 | 帕金森病患者和健康个体的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | LASSO逻辑回归、支持向量机递归特征消除和随机森林 | 基因表达数据 | 帕金森病患者和健康个体的单细胞RNA测序数据 |
| 1475 | 2024-11-23 |
Airway ciliary microenvironment responses in mice with primary ciliary dyskinesia and central pair apparatus defects
2024-11-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-79877-z
PMID:39558053
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研究论文 | 研究了小鼠上呼吸道纤毛微环境中上皮细胞对纤毛运动缺陷和黏液纤毛清除功能障碍的响应 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究了上呼吸道上皮细胞对中央对装置基因突变引起的纤毛运动缺陷的响应 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类患者 | 探讨纤毛运动缺陷对上呼吸道上皮细胞微环境的影响 | 小鼠上呼吸道上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及Cfap221/Pcdp1、Cfap54和Spef2基因突变的小鼠上呼吸道上皮细胞 |
| 1476 | 2024-11-23 |
Lung Single-Cell Transcriptomics Offers Insights into the Pulmonary Interstitial Toxicity Caused by Silica Nanoparticles
2024-Nov-15, Environment & health (Washington, D.C.)
DOI:10.1021/envhealth.4c00052
PMID:39568699
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了二氧化硅纳米颗粒引起的肺间质毒性的细胞特异性反应和细胞间相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了二氧化硅纳米颗粒引起的肺间质损伤的细胞特异性反应和分子机制 | 研究仅限于Wistar大鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 阐明二氧化硅纳米颗粒暴露引起的肺损伤中不同细胞群体的相互作用和关键因素 | Wistar大鼠的肺部细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10457个肺部细胞 |
| 1477 | 2024-11-23 |
Molecular diversity and migration of GABAergic neurons in the developing ventral midbrain
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111239
PMID:39569362
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研究论文 | 研究了发育中的腹侧中脑中GABA能神经元的分子多样性和迁移机制 | 通过单细胞RNA测序和荧光激活细胞分选技术，首次全面揭示了腹侧中脑中GABA能神经元的亚型及其空间分布和发育机制 | 研究仅限于小鼠模型，可能不适用于其他物种 | 探讨腹侧中脑中GABA能神经元的多样性和发育机制 | 发育中的小鼠腹侧中脑中的GABA能神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，荧光激活细胞分选 (FACS) | NA | 转录组数据 | 多个GABA能神经元亚型 |
| 1478 | 2024-11-23 |
Single-Cell and Spatial Multi-omics Reveal Interferon Signaling in the Pathogenesis of Perianal Fistulizing Crohn's Disease
2024-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.08.620717
PMID:39574705
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研究论文 | 研究使用单细胞和空间多组学技术揭示了肛周瘘管性克罗恩病发病机制中的干扰素信号 | 首次通过单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和空间转录组学等多组学方法，全面分析了肛周瘘管性克罗恩病中的免疫和非免疫细胞群，并揭示了干扰素信号在疾病发病机制中的关键作用 | 研究样本量较小，且未涉及长期随访数据 | 探讨肛周瘘管性克罗恩病的发病机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 肛周瘘管性克罗恩病患者、无肛周疾病的克罗恩病患者和特发性肛周瘘管患者的黏膜细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 共63名患者，包括24名肛周瘘管性克罗恩病患者、10名无肛周疾病的克罗恩病患者和29名特发性肛周瘘管患者 |
| 1479 | 2024-11-23 |
Leveraging Single-Cell RNA-Seq to Generate Robust Microglia Aging Clocks
2024-Nov-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.05.616811
PMID:39554035
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据开发稳健的微胶质细胞衰老时钟 | 首次利用单细胞RNA测序数据开发微胶质细胞衰老时钟，并比较了不同的计算方法 | 仅限于微胶质细胞，未涵盖其他类型的细胞 | 开发和比较计算方法以建立稳健的微胶质细胞衰老时钟 | 微胶质细胞的衰老过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 1480 | 2024-11-23 |
De novo detection of somatic variants in high-quality long-read single-cell RNA sequencing data
2024-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.06.583775
PMID:38496441
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研究论文 | 本文介绍了一种名为LongSom的计算工作流程，利用高质量的长读单细胞RNA测序数据检测体细胞单核苷酸变异、拷贝数变异和基因融合，以重建肿瘤克隆异质性 | LongSom能够在不需要正常样本的情况下检测变异，有助于研究癌症进化、克隆异质性和治疗抗性 | NA | 开发一种新的计算方法，利用长读单细胞RNA测序数据检测体细胞变异，以研究肿瘤的克隆异质性和治疗抗性 | 人类卵巢癌样本中的体细胞单核苷酸变异、拷贝数变异和基因融合 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 长读单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类卵巢癌样本 |