单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7855 篇文献，本页显示第 1441 - 1460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1441 | 2024-11-24 |
EfficientNet-resDDSC: A Hybrid Deep Learning Model Integrating Residual Blocks and Dilated Convolutions for Inferring Gene Causality in Single-Cell Data
2024-Nov-22, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00667-2
PMID:39578307
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研究论文 | 提出了一种名为EfficientNet-resDDSC的混合深度学习模型，用于推断单细胞数据中的基因因果关系 | 模型结合了残差块和扩张卷积，能够在不增加计算负担的情况下扩展模型的感受野，从而更全面地揭示高维高噪声单细胞数据中不同基因之间的潜在关系 | NA | 推断基因因果关系，构建基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据中的基因 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | EfficientNet-resDDSC | 基因数据 | 涉及四个数据集和乳腺癌患者的基因调控网络构建 |
| 1442 | 2024-11-24 |
Macrophage depletion in inflamed rat knees prevents the activation of synovial mesenchymal stem cells by weakening Nampt and Spp1 signaling
2024-Nov-20, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00361-2
PMID:39563425
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研究论文 | 研究探讨了在炎症状态下，通过清除巨噬细胞来抑制滑膜间充质干细胞的激活 | 首次揭示了巨噬细胞通过Nampt和Spp1信号通路调控滑膜间充质干细胞的激活 | 研究仅在急性炎症模型中进行，未探讨慢性炎症情况下的效果 | 探究巨噬细胞在炎症和组织再生中的作用及其与滑膜间充质干细胞的相互作用 | 滑膜间充质干细胞和巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及大鼠膝关节样本，具体数量未明确提及 |
| 1443 | 2024-11-24 |
Divergent WNT signaling and drug sensitivity profiles within hepatoblastoma tumors and organoids
2024-Nov-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52757-w
PMID:39567475
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研究论文 | 研究分析了肝母细胞瘤及其肿瘤衍生类器官的分子异质性和药物敏感性 | 通过单细胞RNA测序/ATAC测序、空间转录组学和高通量药物筛选，揭示了肝母细胞瘤中两种不同的肿瘤上皮特征及其药物敏感性 | NA | 研究肝母细胞瘤的分子异质性和药物敏感性，以开发靶向疗法 | 肝母细胞瘤及其肿瘤衍生类器官 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序/ATAC测序、空间转录组学、高通量药物筛选 | NA | 基因表达数据 | 肝母细胞瘤及其肿瘤衍生类器官 |
| 1444 | 2024-11-24 |
A developmental biliary lineage program cooperates with Wnt activation to promote cell proliferation in hepatoblastoma
2024-Nov-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53802-4
PMID:39567523
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研究论文 | 研究使用组织学引导和空间转录组学技术，分析了肝母细胞瘤中胚胎胆道谱系程序与Wnt激活的相互作用，揭示了非遗传机制对肿瘤进化的影响 | 揭示了胚胎胆道谱系程序与Wnt/β-catenin信号通路的合作，通过FGF19作为旁分泌生长信号促进肿瘤细胞增殖的机制 | NA | 探讨肝母细胞瘤中胚胎胆道谱系程序与Wnt激活的相互作用及其对肿瘤细胞增殖的影响 | 肝母细胞瘤 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 患者来源的肿瘤细胞 |
| 1445 | 2024-11-24 |
Pulrodemstat, a selective inhibitor of KDM1A, suppresses head and neck squamous cell carcinoma growth by triggering apoptosis
2024-Nov-20, BMC pharmacology & toxicology
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40360-024-00807-w
PMID:39567962
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研究论文 | 研究了一种名为Pulrodemstat的选择性KDM1A抑制剂，通过触发凋亡来抑制头颈鳞状细胞癌的生长 | Pulrodemstat在临床试验中显示出比传统化疗药物5-Fu更强的抗肿瘤活性，并且对正常细胞无毒性 | NA | 寻找更精确和有效的头颈鳞状细胞癌治疗方案 | 头颈鳞状细胞癌 | NA | 头颈鳞状细胞癌 | 高通量筛选、单细胞测序、CCK-8检测、流式细胞术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 1446 | 2024-11-24 |
KanCell: dissecting cellular heterogeneity in biological tissues through integrated single-cell and spatial transcriptomics
2024-Nov-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.11.009
PMID:39577768
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研究论文 | KanCell模型通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，增强细胞异质性分析 | KanCell模型基于Kolmogorov-Arnold网络，能够有效捕捉非线性关系并优化计算效率，提供了一种准确且高效的空间转录组学分析工具 | NA | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，增强细胞异质性分析 | 人类淋巴结、心脏、黑色素瘤、乳腺癌、前额叶皮层和鼠胚脑等组织 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST） | Kolmogorov-Arnold网络（KAN） | 基因表达数据 | 涉及多种技术和组织的模拟和真实数据集 |
| 1447 | 2024-11-24 |
TNFR2 blockade promotes antitumoral immune response in PDAC by targeting activated Treg and reducing T cell exhaustion
2024-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008898
PMID:39562007
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研究论文 | 研究通过阻断TNFR2受体来增强胰腺导管腺癌（PDAC）的抗肿瘤免疫反应 | 提出了一种新的治疗策略，即结合CD40激动剂和TNFR2拮抗剂来治疗PDAC | 单独使用TNFR2阻断剂对CD8+ T细胞的激活效果有限，肿瘤生长抑制效果不显著 | 探讨TNFR2阻断剂在PDAC中的抗肿瘤免疫反应机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者和免疫活性小鼠模型 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞分析数据 | 24名PDAC患者和免疫活性小鼠模型 |
| 1448 | 2024-11-24 |
Prediction of single-cell RNA expression profiles in live cells by Raman microscopy with Raman2RNA
2024-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-02082-2
PMID:38200118
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Raman2RNA的方法，通过拉曼显微镜图像预测活细胞中的单细胞RNA表达谱 | Raman2RNA方法通过无标记的超光谱拉曼显微镜图像和领域翻译技术，实现了对活细胞中单细胞RNA表达谱的非破坏性预测 | NA | 开发一种非破坏性的方法来预测活细胞中的单细胞RNA表达谱 | 活细胞中的单细胞RNA表达谱 | 数字病理学 | NA | 拉曼显微镜 | 对抗自编码器 | 图像 | 涉及小鼠成纤维细胞和胚胎干细胞的活细胞追踪 |
| 1449 | 2024-11-24 |
A computational approach to assessing the prognostic implications of BRAF and RAS mutations in patients with papillary thyroid carcinoma
2024-Nov, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-024-03911-3
PMID:38886331
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后价值 | 揭示了BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌进展中的重要作用，特别是BRAF V600E突变与侵袭性特征的关联 | NA | 探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后意义 | 甲状腺乳头状癌患者中的BRAF和RAS突变 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 甲状腺乳头状癌和正常样本 |
| 1450 | 2024-11-24 |
Transcriptomics of Human Brain Tissue in Parkinson's Disease: a Comparison of Bulk and Single-cell RNA Sequencing
2024-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04124-5
PMID:38578357
|
综述 | 本文综述了利用RNA测序技术研究帕金森病（PD）的文献，特别是比较了批量RNA测序和单细胞RNA测序的结果 | 本文通过整合批量和单细胞RNA测序的结果，展示了这两种技术在揭示神经退行性疾病转录变化方面的互补性 | 本文主要基于文献综述，未提供新的实验数据 | 评估批量和单细胞RNA测序技术在研究帕金森病中的兼容性和互补性 | 帕金森病患者的人脑组织 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1451 | 2024-11-24 |
Advancements in Single-Cell RNA Sequencing Research for Neurological Diseases
2024-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04126-3
PMID:38564138
|
综述 | 本文详细介绍了单细胞RNA测序技术，并总结了其在神经系统疾病研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术不仅识别了多种细胞类型和反应状态，还揭示了细胞特异性基因表达变化、基因调控网络、细胞间通讯和细胞运动轨迹等 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在神经系统疾病研究中的应用，揭示疾病的具体机制，并为新的治疗策略提供依据 | 神经系统疾病及其相关细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1452 | 2024-11-24 |
Targeting METTL3 as a checkpoint to enhance T cells for tumour immunotherapy
2024-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70089
PMID:39568154
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研究论文 | 本文研究了通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 | 首次探讨了m6A在调节T细胞功能和增强抗肿瘤免疫中的作用，并发现靶向METTL3可以增强肿瘤细胞的免疫原性和T细胞功能 | NA | 探索通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 | METTL3抑制剂STM2457对肿瘤细胞和T细胞功能的影响 | 肿瘤学 | NA | RNA测序 (RNA-seq)，单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，CRISPR Cas9 | NA | RNA | 多种癌细胞系，小鼠黑色素瘤 (B16) 和小鼠结直肠腺癌 (MC38) 模型，人黑色素瘤模型 (A375) 和人T细胞 |
| 1453 | 2024-11-24 |
p53 mutation biases squamocolumnar junction progenitor cells towards dysplasia rather than metaplasia in Barrett's oesophagus
2024-Oct-01, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332095
PMID:39353725
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研究论文 | 研究p53突变在Barrett食管向食管腺癌进展中对胃贲门祖细胞命运和功能的影响 | 首次揭示p53突变在慢性损伤条件下抑制祖细胞向化生分化，促进向异型增生转变 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证 | 探讨p53突变在Barrett食管向食管腺癌进展中的作用 | Barrett食管中的胃贲门祖细胞 | NA | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | L2-IL1β小鼠模型中的Cck2r+贲门祖细胞 |
| 1454 | 2024-11-24 |
Targeting IL-33 reprograms the tumor microenvironment and potentiates antitumor response to anti-PD-L1 immunotherapy
2024-09-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009236
PMID:39231544
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研究论文 | 研究探讨了IL-33/ST2信号在PD-L1免疫治疗中的作用，并开发了sST2-Fc融合蛋白和双功能融合蛋白anti-PD-L1-sST2，以增强抗肿瘤效果 | 首次揭示了IL-33/ST2信号在PD-L1免疫治疗中的免疫抑制机制，并开发了新的融合蛋白策略以增强抗肿瘤效果 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在临床试验中验证其效果 | 探讨IL-33/ST2信号在PD-L1免疫治疗中的作用，并开发新的治疗策略以增强抗肿瘤效果 | IL-33/ST2信号、PD-L1抗体、sST2-Fc融合蛋白、双功能融合蛋白anti-PD-L1-sST2 | NA | 肺癌、结肠癌 | RNA测序、ELISA、WB、免疫荧光 | NA | RNA、蛋白质 | 小鼠肿瘤模型 |
| 1455 | 2024-11-24 |
Bulk and single cells transcriptomes with experimental validation identify USP18 as a novel glioma prognosis and proliferation indicator
2024-May, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2024.12517
PMID:38596661
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析，结合实验验证，揭示了USP18作为胶质瘤预后和增殖的新指标 | 首次揭示了USP18在胶质瘤中的上调与不良预后相关，并影响患者对免疫治疗的反应 | 研究仅限于U251和U87MG ATCC细胞系，未涵盖所有胶质瘤细胞类型 | 探讨USP18在胶质瘤中的作用及其对预后和增殖的影响 | 胶质瘤细胞和患者的预后及增殖情况 | 数字病理学 | 脑癌 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | U251和U87MG ATCC细胞系 |
| 1456 | 2024-11-24 |
The neuroendocrine transition in prostate cancer is dynamic and dependent on ASCL1
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.09.588557
PMID:38645223
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研究论文 | 研究描述了前列腺癌中神经内分泌转变的动态过程及其依赖于ASCL1的分子机制 | 开发了一个多功能平台，用于识别和研究前列腺癌进展不同阶段神经内分泌谱系转化的分子决定因素 | 研究主要集中在小鼠模型和特定基因的缺失上，可能不完全适用于人类疾病 | 揭示前列腺癌中神经内分泌谱系转化的分子机制及其对治疗结果的影响 | 前列腺癌中的神经内分泌转变及其分子机制 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 多重免疫荧光、空间转录组学、PrismSpot | NA | 基因表达数据 | 小鼠前列腺器官样本 |
| 1457 | 2024-11-24 |
Nature and nurture in fruit fly hearing
2024, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2024.1503438
PMID:39568979
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review | 本文综述了果蝇听觉感知中的“先天与后天”现象，特别是歌曲偏好学习的神经机制 | 整合了单细胞转录组和脑连接组等组学数据库，结合传统分子遗传学，使果蝇成为研究听觉感知和行为中“先天与后天”神经基础的杰出模型 | NA | 探讨果蝇歌曲偏好学习的神经机制及其在听觉感知和行为中的作用 | 果蝇的歌曲偏好学习及其神经回路 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1458 | 2024-11-24 |
Single-cell sequencing reveals transcriptional dynamics regulated by ERα in mouse ovaries
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0313867
PMID:39570927
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序揭示ERα在小鼠卵巢中的转录调控动态 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了ERα缺失对卵巢细胞转录组的影响 | 研究仅限于αERKO小鼠模型，可能无法完全代表所有卵巢功能障碍的情况 | 阐明ERα调控卵巢细胞转录动力学的分子机制 | ERα敲除小鼠的卵巢细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 野生型和αERKO小鼠的卵巢细胞 |
| 1459 | 2024-11-24 |
BreCML: identifying breast cancer cell state in scRNA-seq via machine learning
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1482726
PMID:39574916
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研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的预测工具BreCML，用于准确分类乳腺癌细胞亚群及其相关标记基因 | BreCML在训练数据集上达到了98.92%的准确率，并在测试数据集上展示了卓越的准确性、精确度、召回率和F1分数 | NA | 开发一种能够准确分类乳腺癌细胞亚群及其相关标记基因的机器学习预测工具 | 乳腺癌细胞及其相关标记基因 | 机器学习 | 乳腺癌 | scRNA-seq | XGBoost | 基因数据 | NA |
| 1460 | 2024-11-24 |
Cellular Characterization and Interspecies Evolution of the Tree Shrew Retina across Postnatal Lifespan
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0536
PMID:39574940
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研究论文 | 研究了树鼩视网膜细胞在出生后生命周期中的细胞特征和跨物种进化 | 建立了树鼩视网膜细胞的年龄相关单细胞RNA测序图谱，并进行了跨物种分析 | NA | 探讨树鼩视网膜细胞在不同年龄阶段的细胞组成和基因表达模式 | 树鼩视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15只树鼩 |