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当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 1421 - 1440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1421 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing data analysis utilizing multi-type graph neural networks
2024-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108921
PMID:39059210
|
研究论文 | 提出一种利用多类型图神经网络和去噪自编码器的单细胞RNA测序数据分析模型 | 将零膨胀负二项模型与去噪自编码器结合，并集成多类型图神经网络处理单细胞数据 | NA | 解决单细胞RNA测序数据降维、去噪和聚类分析的技术难题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 去噪自编码器, 图神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1422 | 2025-10-06 |
Identification of miRNA signature in cancer-associated fibroblast to predict recurrent prostate cancer
2024-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108989
PMID:39142223
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，建立了癌症相关成纤维细胞miRNA特征模型来预测前列腺癌复发 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据构建CAFs相关miRNA预后模型，并鉴定出miR-106b-5p作为潜在治疗靶点 | 研究样本量相对有限，需要更大规模验证 | 建立CAFs相关miRNA模型以评估前列腺癌预后差异、肿瘤微环境和抗癌药物筛选 | 前列腺癌患者样本和成纤维细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时定量PCR, CCK8, 伤口愈合实验, 克隆形成实验, 细胞迁移实验 | Lasso, 随机森林, 支持向量机 | RNA测序数据 | 34例前列腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1423 | 2025-10-06 |
APOE Christchurch enhances a disease-associated microglial response to plaque but suppresses response to tau pathology
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.03.597211
PMID:38895362
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研究论文 | 本研究探讨APOE Christchurch突变在不同阿尔茨海默病小鼠模型中对小胶质细胞反应的调节作用 | 首次系统研究APOE Christchurch突变在淀粉样斑块和tau蛋白病变两种不同病理模型中的差异性调节作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证；样本量相对有限 | 阐明APOE Christchurch突变对阿尔茨海默病病理发展的保护机制 | 携带ApoeCh突变的5xFAD淀粉样病变小鼠模型和PS19 tau病变小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 免疫组织化学分析、生化分析、单细胞空间转录组学、蛋白质组学 | 小鼠疾病模型 | 图像数据、转录组数据、蛋白质组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 1424 | 2025-10-06 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2024-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579846
PMID:38370670
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了脂肪酸结合蛋白FABP4/5在肺动脉高压中调控内皮细胞糖酵解和动脉编程的作用机制 | 首次发现FABP4/5在肺动脉高压中调控内皮细胞代谢重编程和动脉分化的新功能 | 研究主要基于动物模型，在人类患者中的验证仍需进一步深入 | 探究肺动脉高压发病的细胞分子机制并寻找新的治疗靶点 | 肺动脉内皮细胞、肺动脉高压动物模型和IPAH患者样本 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 特发性PAH患者、肺动脉高压大鼠和基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1425 | 2025-10-06 |
scHD4E: Novel ensemble learning-based differential expression analysis method for single-cell RNA-sequencing data
2024-08, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108769
PMID:38897145
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研究论文 | 提出了一种基于集成学习的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法scHD4E | 仅使用四种性能最佳的差异表达分析方法进行集成学习，相比现有方法scDEA使用的12种方法更为精简高效 | 方法性能评估主要基于有限的六个真实数据集和一个模拟数据集 | 开发更准确稳定的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习 | 基因表达数据 | 六个真实数据集和一个模拟数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1426 | 2025-10-06 |
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-Jun-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202937
PMID:38912552
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综述 | 本文总结了2023年EMBO研讨会关于发育代谢领域的关键讨论，重点探讨了该领域面临的挑战与新兴机遇 | 强调了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算模型等技术革命为发育代谢研究带来的全新探索维度 | NA | 探讨发育代谢领域的历史障碍和新兴机遇 | 细胞特异性代谢网络、组织间代谢通讯、基因-代谢物时空相互作用 | 发育生物学 | NA | 代谢组学, 小分子传感器, 单细胞RNA测序, 计算建模 | 计算模型 | 代谢数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1427 | 2025-10-06 |
Functional profiling of murine glioma models highlights targetable immune evasion phenotypes
2024-11-27, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-024-02831-w
PMID:39592459
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研究论文 | 通过功能遗传筛选、单细胞转录组学和机器学习方法，系统性评估小鼠胶质瘤模型作为人类胶质母细胞瘤临床前模型的价值 | 首次通过CRISPR全基因组共培养杀伤筛选鉴定出胶质瘤三种关键免疫逃逸机制，并利用机器学习识别出与临床相关的免疫逃逸基因程序 | 研究基于小鼠模型，虽然部分重现了人类GBM特征，但仍存在物种差异 | 探索胶质瘤免疫逃逸机制并建立临床前模型与人类疾病的桥梁 | 小鼠胶质瘤模型（GL261和CT2A）及人类胶质母细胞瘤 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | CRISPR全基因组筛选、单细胞转录组学、机器学习 | 机器学习方法 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 两个小鼠胶质瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1428 | 2025-10-06 |
In vivo CRISPRi screen identified lncRNA portfolio crucial for cutaneous squamous cell carcinoma tumor growth
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.16.618774
PMID:39464078
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研究论文 | 通过CRISPRi筛选和单细胞测序分析鉴定出调控皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长的关键lncRNA组合 | 首次通过整合单细胞测序分析和体内外CRISPRi筛选系统鉴定lncRNA在cSCC中的功能，发现LINC00704和LINC01116等新型调控因子 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，需要在更多临床样本中验证 | 探索长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌发生发展中的作用机制 | 人类正常和cSCC皮肤组织、角质形成细胞亚群、cSCC癌细胞系 | 功能基因组学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞测序、CRISPR干扰筛选、假性批量分析、异种移植模型 | CRISPRi、xenograft | 单细胞测序数据、功能验证数据 | 正常和cSCC人类皮肤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1429 | 2025-10-06 |
Transcriptional profiling in microglia across physiological and pathological states identifies a transcriptional module associated with neurodegeneration
2024-09-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06684-7
PMID:39294270
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研究论文 | 通过整合分析人类小胶质细胞的转录组数据，识别出在神经退行性疾病中共享的转录特征 | 整合多个神经退行性疾病的单细胞RNA-seq数据集，发现跨疾病共享的小胶质细胞转录特征，并将遗传变异与转录特征相关联 | 基于公开数据集进行二次分析，可能受原始数据质量和样本来源限制 | 识别小胶质细胞在生理和病理状态下的转录特征，探索其在神经退行性疾病中的作用 | 人类小胶质细胞 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因组关联分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据, 基因组数据 | 多个公开数据集，涵盖阿尔茨海默病、多发性硬化症和帕金森病 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1430 | 2025-10-06 |
SPRR1B+ keratinocytes prime oral mucosa for rapid wound healing via STAT3 activation
2024-09-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06864-5
PMID:39300285
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研究论文 | 本研究通过整合分析口腔黏膜和皮肤伤口愈合过程中的单细胞测序数据，揭示了STAT3激活的SPRR1B+角质形成细胞在促进口腔黏膜快速愈合中的关键作用 | 首次发现STAT3激活的SPRR1B+角质形成细胞在正常口腔黏膜中固有存在，而在正常皮肤中缺失，这一细胞亚群通过促进角质形成细胞迁移来加速伤口愈合 | 研究主要基于小鼠模型验证，在人类临床样本中的验证仍需进一步深入 | 探究口腔黏膜快速伤口愈合的细胞机制 | 口腔黏膜和皮肤伤口愈合过程中的角质形成细胞 | 单细胞生物学 | 伤口愈合障碍 | bulk mRNA测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 小鼠模型和人类口腔/皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1431 | 2025-10-06 |
Vaccines combining slow delivery and follicle targeting of antigens increase germinal center B cell clonal diversity and clonal expansion
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.19.608655
PMID:39229011
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研究论文 | 本研究分析了结合磷酸丝氨酸标记抗原与铝佐剂及皂苷纳米颗粒佐剂的联合佐剂策略对生发中心B细胞反应的影响 | 首次证明两种作用机制互补的佐剂（缓释抗原递送和改变淋巴结摄取的佐剂）可协同增强生发中心B细胞克隆多样性和克隆扩增 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 探索联合佐剂策略增强体液免疫应答的机制 | 小鼠模型中的生发中心B细胞和HIV Env三聚体抗原 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | NA | 单细胞测序数据, 抗原分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | NA | NA |
| 1432 | 2025-10-06 |
Enhanced microglial dynamics and a paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contribute to cognitive resilience in Alzheimer's disease
2024-08-05, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-024-02775-1
PMID:39102080
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研究论文 | 本研究探讨无症状阿尔茨海默病患者大脑中淀粉样斑块微环境特征及其对认知韧性的保护机制 | 发现无症状AD患者斑块微环境中存在增强的小胶质细胞动态活动和减少的tau蛋白播种活性 | 基于死后脑组织研究，无法观察动态过程；样本量有限 | 揭示阿尔茨海默病病理条件下认知韧性的神经保护机制 | 无症状阿尔茨海默病患者和典型AD患者的死后脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 脑组织样本，转录组数据 | 一组无症状AD受试者队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1433 | 2025-10-06 |
Dominant dystrophic epidermolysis bullosa is associated with glycolytically active GATA3+ T helper 2 cells which may contribute to pruritus in lesional skin
2024-07-16, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae110
PMID:38477474
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示显性营养不良性大疱性表皮松解症瘙痒与糖酵解活性GATA3+ Th2细胞的关联 | 首次在DDEB病变皮肤中发现糖酵解活性增强的GATA3+ Th2细胞亚群，为理解疾病瘙痒机制提供新视角 | 样本量较小（6例患者），且仅针对瘙痒亚型患者进行研究 | 鉴定DDEB皮肤转录组特征以寻找减轻瘙痒的治疗靶点 | 显性营养不良性大疱性表皮松解症患者皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 定量PCR | NA | 转录组数据 | 6例DDEB患者（瘙痒亚型）和4例健康个体，共13个皮肤活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1434 | 2025-10-06 |
Somatic mutations associate with clonal expansion of CD8+ T cells
2024-06-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj0787
PMID:38848368
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研究论文 | 本研究通过分析90名血液和免疫疾病患者的CD4和CD8 T细胞，揭示了体细胞突变与CD8+T细胞克隆扩增的关联 | 首次在非恶性T细胞中系统研究体细胞突变谱，发现CD8+T细胞突变负荷更高且非同义突变具有非随机性特征 | 样本仅来自血液和免疫疾病患者，未包含健康对照组 | 探究体细胞突变在T细胞中的分布特征及其与克隆扩增的关系 | 90名血液和免疫疾病患者的CD4和CD8 T细胞 | 免疫基因组学 | 血液和免疫疾病 | T细胞受体测序, 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据, 单细胞测序数据 | 90名患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1435 | 2025-10-06 |
Gene regulatory landscape of cerebral cortex folding
2024-06-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn1640
PMID:38838158
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研究论文 | 本研究揭示了大脑皮层折叠的基因调控机制，通过表征雪貂大脑发育过程中的基因表达和表观遗传动态 | 首次揭示了H3K27ac表观遗传景观在定义大脑皮层折叠模式中的关键作用，并证明通过操纵转录因子表达可改变皮层折叠模式 | 研究仅限于雪貂模型，未在其他哺乳动物中进行验证 | 探索大脑皮层折叠模式的基因调控机制 | 雪貂大脑皮层发育过程中的基因表达和表观遗传变化 | 发育神经生物学 | 神经系统发育障碍 | 单细胞RNA测序，H3K27ac染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据，表观遗传数据 | 雪貂胚胎发育不同阶段的脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1436 | 2025-10-06 |
Gene representation bias in spatial transcriptomics
2024-06, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720024500070
PMID:39036848
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研究论文 | 本研究通过比较Visium空间转录组和bulk RNA-seq数据，识别在Visium中频繁低检测的基因并探索其潜在机制 | 首次系统性地发现空间转录组数据中存在基因表示偏倚，并揭示poly(T)基序可能通过形成发夹结构影响mRNA捕获效率 | 样本量相对有限（28个人类样本和19个小鼠样本），需要更多实验验证poly(T)基序形成发夹结构的假设 | 识别空间转录组数据中频繁低检测的基因并探究其潜在分子机制 | 人类和小鼠组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序，bulk RNA-seq，基序分析 | NA | 基因-点计数矩阵，序列数据 | 28个人类样本和19个小鼠样本，涵盖多种组织来源 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组技术 |
| 1437 | 2025-10-06 |
NDMNN: A novel deep residual network based MNN method to remove batch effects from scRNA-seq data
2024-06, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S021972002450015X
PMID:39036845
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研究论文 | 提出一种基于深度残差网络的NDMNN方法，用于消除单细胞RNA测序数据中的批次效应 | 将密集深度残差网络(NDnetwork)与MNN方法相结合，设计出新的批次效应校正方法 | NA | 开发更有效的单细胞RNA测序数据批次效应校正方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度残差网络 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1438 | 2025-10-06 |
Rejuvenation of peripheral immune cells attenuates Alzheimer's disease-like pathologies and behavioral deficits in a mouse model
2024-05-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl1123
PMID:38809977
|
研究论文 | 本研究通过年轻骨髓移植 rejuvenate 老年小鼠免疫系统，探索其对阿尔茨海默病病理和行为缺陷的改善作用 | 首次证明通过年轻骨髓移植 rejuvenate 外周免疫细胞可改善阿尔茨海默病样病理和行为缺陷 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探索免疫 rejuvenation 作为阿尔茨海默病治疗策略的潜力 | 老年小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，年轻骨髓移植 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据，行为数据，病理数据 | 老年小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1439 | 2025-10-06 |
Distinct Inflammatory Programs Underlie the Intramuscular Lipid Nanoparticle Response
2024-12-03, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c08490
PMID:39563529
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研究论文 | 本研究通过分析肌肉注射脂质纳米颗粒(LNP)后的免疫反应，揭示了两种不同的炎症基因表达程序 | 首次发现不同化学组成的LNP会诱导截然不同的炎症反应程序，并证明mRNA与LNP协同作用提供有效疫苗接种所需的先天免疫刺激 | 研究仅针对9种LNP进行评估，可能未涵盖所有可能的LNP类型 | 评估mRNA/LNP技术的免疫原性机制 | 脂质纳米颗粒(LNP)及其在肌肉组织中的免疫反应 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9种不同化学组成的LNP | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1440 | 2025-10-06 |
Unraveling the spatial organization and development of human thymocytes through integration of spatial transcriptomics and single-cell multi-omics profiling
2024-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51767-y
PMID:39237503
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞多组学数据解析人类胸腺细胞的空间组织和发育过程 | 开发了TSO-his工具整合多模态数据，首次在单细胞分辨率重建胸腺空间结构，发现CD8αα与记忆B细胞和单核细胞的新共定位关系 | NA | 解析人类胸腺的空间组织和T细胞发育机制 | 人类胸腺细胞 | 空间生物学 | 免疫系统疾病 | 空间转录组学,单细胞多组学测序,VDJ测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞多组学数据,VDJ序列数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞多组学,VDJ测序 | NA | NA |