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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1421 | 2025-10-06 |
Synaptic connectome of the Drosophila circadian clock
2024-12-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54694-0
PMID:39638801
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研究论文 | 本研究通过果蝇脑连接组数据构建了首个完整的动物昼夜节律时钟突触连接图谱 | 发现了额外的背侧时钟神经元,将果蝇昼夜节律网络神经元数量从150个修正为约240个;揭示了广泛的网络内对侧突触连接和新型间接光输入通路;整合单细胞转录组和受体定位解析了神经肽信号传导机制 | NA | 解析昼夜节律时钟如何协调多种节律性生理过程和行为 | 果蝇昼夜节律时钟神经元网络 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序, 受体定位, 连接组学分析 | NA | 连接组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间连接组学 | FlyWire脑连接组 | 果蝇全脑连接组数据集 |
| 1422 | 2025-10-06 |
NiCo identifies extrinsic drivers of cell state modulation by niche covariation analysis
2024-12-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54973-w
PMID:39639035
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研究论文 | 提出NiCo计算框架,通过整合单细胞空间转录组和单细胞RNA测序数据来推断空间生态位对细胞状态的影响 | 开发了能够捕获同一生态位内不同细胞类型间相互作用驱动的细胞状态变化的计算方法 | 方法依赖于单细胞分辨率空间转录组数据的可用性 | 理解细胞状态在组织发育、稳态和疾病中的调控机制 | 小鼠胚胎发生、成年小肠和肝脏组织 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 计算框架 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 多个小鼠组织样本(胚胎、小肠、肝脏) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1423 | 2025-10-06 |
Decoding the molecular, cellular, and functional heterogeneity of zebrafish intracardiac nervous system
2024-12-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54830-w
PMID:39632839
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、解剖学研究和电生理技术对斑马鱼心内神经系统进行全面分类和功能表征 | 首次系统揭示心内神经系统的细胞类型多样性,发现具有起搏器/节律生成特征的神经元亚群 | 研究仅限于斑马鱼模型,人类心内神经系统的直接相关性需要进一步验证 | 解析心内神经系统的分子、细胞和功能异质性 | 斑马鱼心内神经系统 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 解剖学研究, 电生理技术 | NA | 单细胞转录组数据, 解剖学数据, 电生理记录 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1424 | 2025-10-06 |
Dual function of PHF16 in reinstating homeostasis of murine intestinal epithelium after crypt regeneration
2024-12-02, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.08.009
PMID:39232563
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研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调控因子PHF16通过双重机制恢复肠道上皮稳态 | 首次发现PHF16通过HBO1介导的H3K14乙酰化激活RAR/RXR靶基因,同时通过CDC73泛素化抑制YAP/TAZ活性的双重机制 | 研究主要基于小鼠模型和肠道类器官,人类临床相关性尚需验证 | 探究PHF16在肠道上皮稳态恢复中的分子机制 | 小鼠肠道干细胞、再生干细胞和肠道类器官 | 表观遗传学 | 肠道损伤修复 | 单细胞RNA测序, RNA测序, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | Phf16基因敲除小鼠模型和肠道类器官 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序, ATAC测序 | NA | NA |
| 1425 | 2025-10-06 |
Augmenting antitumor efficacy of Th17-derived Th1 cells through IFN-γ-induced type I interferon response network via IRF7
2024-Nov-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412120121
PMID:39541355
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研究论文 | 本研究揭示了Th17来源的Th1细胞通过IFN-γ诱导的IRF7介导的I型干扰素反应网络增强抗肿瘤效能的机制 | 首次发现Th1细胞通过ECM1依赖性方式在肿瘤中更快迁移和积累,并阐明IFN-γ通过上调IRF7促进I型干扰素反应网络和ECM1表达的分子机制 | Th1细胞表现出早期耗竭表型,其分化机制和抗肿瘤反应尚未完全阐明 | 探索Th17来源的Th1细胞的分化机制及其在癌症免疫治疗中的抗肿瘤效能 | CD4 T细胞亚群,特别是共表达Th1和Th17标志物的T细胞 | 免疫学 | 实体恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序,轨迹分析,转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1426 | 2025-10-06 |
DNA methylation memory of pancreatic acinar-ductal metaplasia transition state altering Kras-downstream PI3K and Rho GTPase signaling in the absence of Kras mutation
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.26.620414
PMID:39553977
|
研究论文 | 本研究探讨胰腺腺泡-导管化生(ADM)过渡状态在无KRAS突变情况下通过DNA甲基化记忆影响下游信号通路的机制 | 首次发现在无致癌基因突变情况下,ADM过渡状态细胞能通过DNA甲基化记忆持续改变KRAS下游信号通路 | 研究主要关注DNA甲基化机制,未全面探讨其他表观遗传修饰的潜在作用 | 探究胰腺腺泡-导管化生过渡状态的表观遗传记忆机制及其在肿瘤发生中的作用 | 胰腺腺泡细胞、ADM过渡状态细胞、人类胰腺上皮内瘤变样本 | 表观遗传学 | 胰腺癌 | DNA甲基化分析、单细胞空间转录组学、基因表达分析 | NA | 表观遗传数据、基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 1427 | 2025-10-06 |
The small inhibitor WM-1119 effectively targets KAT6A-rearranged AML, but not KMT2A-rearranged AML, despite shared KAT6 genetic dependency
2024-10-08, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01610-0
PMID:39380002
|
研究论文 | 评估KAT6A抑制剂WM-1119对KAT6A重排和KMT2A重排急性髓系白血病的治疗效果差异 | 首次发现KAT6A催化活性抑制剂对KAT6A重排AML有效,但对KMT2A重排AML需靶向降解整个KAT6A蛋白 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 评估不同KAT6A靶向治疗策略对KAT6A和KMT2A重排AML的治疗潜力 | KAT6A重排和KMT2A重排急性髓系白血病细胞 | 血液肿瘤研究 | 急性髓系白血病 | 流式细胞术,集落形成实验,shRNA敲低,CRISPR敲除,单细胞RNA-seq,ChIP-seq | 遗传修饰小鼠模型 | 基因表达数据,表观遗传数据,细胞功能数据 | 人类AML细胞系和原代患者AML样本 | NA | 单细胞RNA-seq,ChIP-seq | NA | NA |
| 1428 | 2025-10-06 |
c-Myc alone is enough to reprogram fibroblasts into functional macrophages
2024-09-12, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01605-x
PMID:39267119
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过c-Myc过表达将成纤维细胞重编程为功能性巨噬细胞的新方法 | 首次证明仅通过c-Myc单独过表达即可实现成纤维细胞向功能性巨噬细胞的重编程 | NA | 开发高效获取巨噬细胞的新方法以促进抗癌免疫治疗 | 成纤维细胞、巨噬细胞、白血病模型、乳腺癌模型、患者来源肿瘤异种移植模型 | 细胞重编程 | 白血病、乳腺癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、ChIP-qPCR、双荧光素酶报告基因检测 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、分子生物学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1429 | 2025-10-06 |
Spatial multi-omics: deciphering technological landscape of integration of multi-omics and its applications
2024-08-24, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01596-9
PMID:39182134
|
综述 | 本文全面回顾了空间多组学技术的发展历程及其在生物医学研究中的应用 | 系统梳理了空间多组学技术在过去十年中的演进与完善,重点关注通量、分辨率、模态整合和准确性的提升 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据和研究方法的具体实施细节 | 探讨多组学整合的技术格局及其在生物医学领域的应用 | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和表观基因组的整合分析 | 空间生物学 | 癌症 | 空间多组学技术 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 空间多组学 | NA | NA |
| 1430 | 2025-10-06 |
Type I interferons induce an epigenetically distinct memory B cell subset in chronic viral infection
2024-05-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.03.016
PMID:38593796
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了慢性病毒感染中I型干扰素诱导形成表观遗传特征独特的记忆B细胞亚群 | 首次发现慢性病毒感染中存在富含干扰素刺激基因的独特记忆B细胞亚群,并证明早期干扰素受体阻断可改变其表观遗传特征 | 感染4周后记忆B细胞对干预措施产生抵抗,限制了治疗时间窗口 | 探究慢性病毒感染中记忆B细胞发育异常的机制及可逆性 | 急性和慢性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒感染模型中的记忆B细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1431 | 2025-10-06 |
Protocol to analyze immune cells in the tumor microenvironment by transcriptome using machine learning
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102684
PMID:38219153
|
研究论文 | 提出一种基于机器学习的肿瘤微环境免疫细胞转录组分析方案 | 整合单细胞RNA测序与机器学习方法,系统分析肿瘤微环境中免疫细胞的表型变化、分化轨迹和浸润过程 | NA | 开发肿瘤微环境免疫细胞分析流程,识别潜在药物靶点 | 肿瘤微环境中的免疫细胞,特别是单核吞噬细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 批量RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1432 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of the holothurian regenerating intestine reveals the pluripotency of the coelomic epithelium
2024-Dec-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.01.601561
PMID:39005414
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究海参肠道再生过程中体腔上皮细胞的多能性 | 首次在棘皮动物再生研究中应用单细胞RNA测序技术,识别出再生原基中的13个不同细胞群,并发现至少4种新的前体细胞群 | 研究局限于海参这一特定物种,分子机制仍需进一步验证 | 探究海参肠道再生过程中再生原基细胞的分子特征和分化潜能 | 海参再生肠道组织中的细胞群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, HCR-FISH分析 | NA | 单细胞转录组数据, 荧光原位杂交图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1433 | 2025-10-06 |
Cancer-specific innate and adaptive immune rewiring drives resistance to PD-1 blockade in classic Hodgkin lymphoma
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54512-7
PMID:39737927
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间分析揭示了经典霍奇金淋巴瘤对PD-1阻断治疗的免疫应答机制 | 首次发现循环和肿瘤浸润的IL1β单核细胞/巨噬细胞群在cHL患者中的特异性存在及其与PD-1阻断耐药性的关联 | 样本来源和数量未明确说明,需要进一步验证外周血检测的临床实用性 | 阐明经典霍奇金淋巴瘤对PD-1阻断治疗的免疫应答机制和耐药性原因 | 经典霍奇金淋巴瘤患者和健康供体的免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,空间分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1434 | 2025-10-06 |
Immune checkpoint inhibitor-induced severe epidermal necrolysis mediated by macrophage-derived CXCL10 and abated by TNF blockade
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54180-7
PMID:39737932
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了免疫检查点抑制剂诱导的严重表皮坏死松解症的发病机制 | 首次发现巨噬细胞来源的CXCL10在ICI-SJS/TEN发病机制中的关键作用,并证实TNF阻断可有效治疗该病症 | 样本量较小(仅25例患者),需要更大规模研究验证 | 探究免疫检查点抑制剂诱导严重皮肤不良反应的分子机制和治疗方法 | 免疫检查点抑制剂诱导的Stevens-Johnson综合征/中毒性表皮坏死松解症患者 | 单细胞测序分析 | 皮肤不良反应 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个队列共25例ICI诱导SJS/TEN患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1435 | 2025-10-06 |
Monocyte Invasion into the Retina Restricts the Regeneration of Neurons from Müller Glia
2024-Nov-13, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0938-24.2024
PMID:39353729
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研究论文 | 本研究揭示外周免疫系统中的单核细胞通过浸润受损视网膜并分泌骨桥蛋白抑制Müller胶质细胞的神经再生能力 | 首次发现外周免疫系统(单核细胞)是中枢神经系统再生的屏障,并鉴定出骨桥蛋白是抑制神经再生的关键细胞因子 | 研究主要基于小鼠模型,在人类视网膜中的适用性需要进一步验证 | 探索限制哺乳动物视网膜神经元再生的机制 | 成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞和浸润的单核细胞 | 神经再生 | 视网膜疾病 | scRNA-seq(单细胞RNA测序) | CCR2基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 不同性别的CCR2敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1436 | 2025-10-06 |
Identification and Analysis of Biomarkers Associated with Lipophagy and Therapeutic Agents for COVID-19
2024-06-07, Viruses
DOI:10.3390/v16060923
PMID:38932215
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定与脂噬相关的COVID-19生物标志物和潜在治疗药物 | 首次系统研究脂噬相关基因在COVID-19中的作用,并发现7个脂噬相关基因作为生物标志物和药物靶点 | 基于生物信息学分析的预测结果需要实验验证 | 研究脂噬相关生物标志物和基于脂噬的COVID-19治疗药物 | COVID-19患者基因表达数据 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习 | 随机森林,支持向量机,广义线性模型,极限梯度提升 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE145926,GSE183533,GSE190496) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1437 | 2025-10-06 |
Identification of a myofibroblast differentiation program during neonatal lung development
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202659
PMID:38602479
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了新生儿肺发育过程中肺泡肌成纤维细胞的分化程序 | 发现了新生儿肺间充质细胞的新亚型,包括能够分化为成熟肺泡肌成纤维细胞的未成熟祖细胞 | NA | 研究新生儿肺发育过程中肺泡肌成纤维细胞的分化机制 | 新生小鼠肺组织中的间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,细胞分选,原代细胞培养,谱系追踪 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1438 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis drives PET imaging of tight junction protein expression in pancreatic cancer theranostics
2024-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.07.574209
PMID:38249519
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学筛选胰腺癌表面受体靶点,开发靶向紧密连接蛋白claudin-4的分子成像诊疗剂 | 首次通过空间转录组学数据驱动筛选发现claudin-4作为胰腺癌诊疗靶点,开发了特异性肽类分子成像剂 | NA | 开发胰腺癌分子成像和诊疗新方法 | 胰腺癌组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 分子成像 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1439 | 2025-10-06 |
Aging-induced immune microenvironment remodeling fosters melanoma in male mice via γδ17-Neutrophil-CD8 axis
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55164-3
PMID:39738047
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了雄性小鼠衰老过程中肺免疫微环境重塑促进黑色素瘤转移的机制 | 首次发现衰老通过γδ17-中性粒细胞-CD8轴促进肿瘤转移的免疫机制,并证明senolytic药物procyanidin C1可逆转此过程 | 研究仅限于雄性小鼠模型,未涉及雌性动物或人类样本 | 探究衰老免疫系统如何促进肿瘤转移的分子机制 | 雄性小鼠的肺免疫微环境和黑色素瘤转移模型 | 单细胞测序分析 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤转移模型 | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老雄性小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1440 | 2025-10-06 |
Early transcriptional similarities between two distinct neural lineages during ascidian embryogenesis
2024-10, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.06.005
PMID:38878991
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了海鞘胚胎中两种不同神经谱系在发育早期的转录组动态 | 首次以高时间分辨率比较两种不同发育起源神经前体细胞的转录组特征,发现神经板阶段存在早期转录相似性 | 转录因子结合位点富集分析显示两种神经谱系间共享转录调控的证据有限 | 探究不同神经谱系在谱系限制过程中的转录状态相似性程度 | 海鞘胚胎中两种不同发育起源的神经前体细胞及其姐妹细胞谱系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | PCA分析, 层次聚类 | 单细胞转录组数据 | 从16细胞期到神经板阶段连续五个细胞周期的手工分离神经前体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |