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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1421 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome atlas of peripheral immune features to Omicron breakthrough infection under booster vaccination strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460442
PMID:39835127
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析加强疫苗接种策略下奥密克戎突破性感染的免疫特征 | 首次在加强疫苗接种背景下对奥密克戎突破性感染进行单细胞转录组与TCR/BCR联合测序分析,揭示了第四剂雾化Ad5-nCoV可能诱导的'训练免疫'现象 | 样本量有限(15例PBMC样本),需更大规模研究验证 | 探究加强疫苗接种策略下奥密克戎突破性感染的免疫特征 | 外周血单个核细胞(PBMC)样本,包括奥密克戎感染者和未感染疫苗接种者 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序,T细胞/B细胞受体(TCR/BCR)测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫受体序列数据 | 15例PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1422 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and immune microenvironment analysis reveal PLOD2-driven malignant transformation in cervical cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522655
PMID:39840054
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫微环境分析揭示PLOD2驱动宫颈癌恶性转化的机制 | 识别了宫颈癌中8种细胞类型和5个恶性上皮细胞亚群,建立了NNMT CAEPCs风险评分模型,并验证了PLOD2基因的预后价值 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索宫颈癌肿瘤微环境特征并识别潜在治疗靶点 | 宫颈癌恶性上皮细胞及其微环境 | 数字病理 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 生物信息学分析 | Cox回归模型, 风险评分模型 | 基因表达数据 | 来自UCSC和ArrayExpress数据库的测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1423 | 2025-10-07 |
Targeting immune cellular populations and transcription factors: unraveling the therapeutic potential of JQF for NAFLD
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1445924
PMID:39840059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了降糖清热方(JQF)通过调节免疫细胞亚群和转录因子治疗非酒精性脂肪肝病(NAFLD)的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统解析JQF治疗NAFLD的免疫调节机制,识别出关键免疫细胞亚群和调控转录因子 | 研究基于小鼠模型,需要进一步临床试验验证 | 探究降糖清热方治疗非酒精性脂肪肝病的作用机制 | 高脂饮食诱导的NAFLD小鼠模型 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, SCENIC分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 高脂饮食诱导的NAFLD小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1424 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the heterogeneity and function of mast cells in human ccRCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494025
PMID:39840068
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示人类透明细胞肾癌中肥大细胞的异质性和功能 | 首次在ccRCC中系统研究肥大细胞的异质性,发现VEGFA+肥大细胞亚群与IL1B+巨噬细胞共定位的新现象 | 样本量较小(仅4例患者),需要更大规模研究验证 | 探究肥大细胞在透明细胞肾癌中的异质性和功能作用 | 透明细胞肾癌患者组织样本中的肥大细胞 | 单细胞转录组学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 组织图像数据 | 4例ccRCC患者样本,整合TCGA数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量组织测序 | NA | NA |
| 1425 | 2025-10-07 |
Comprehensive bioinformatics analysis identifies metabolic and immune-related diagnostic biomarkers shared between diabetes and COPD using multi-omics and machine learning
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1475958
PMID:39845878
|
研究论文 | 通过多组学和机器学习方法识别糖尿病与COPD共享的代谢和免疫相关诊断生物标志物 | 首次通过跨疾病交叉分析识别糖尿病与COPD共享的分子机制和诊断标志物 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证分子机制 | 探索糖尿病与慢性阻塞性肺疾病之间的共同分子机制 | 糖尿病和COPD患者的多中心队列数据 | 生物信息学 | 糖尿病,慢性阻塞性肺疾病 | 多组学分析,机器学习,单细胞测序 | WGCNA,多种机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 多中心患者队列 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1426 | 2025-10-07 |
Deciphering hub genes and immune landscapes related to neutrophil extracellular traps in rheumatoid arthritis: insights from integrated bioinformatics analyses and experiments
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1521634
PMID:39845946
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和实验验证,揭示了类风湿关节炎中中性粒细胞胞外诱捕网相关的关键基因和免疫景观 | 首次阐明RA滑膜微环境中中性粒细胞的异质性及其与成纤维细胞的通讯机制,识别并验证了4个NET相关关键基因 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床验证 | 探索中性粒细胞胞外诱捕网在类风湿关节炎发病机制中的分子机制和关键基因 | 类风湿关节炎患者滑膜组织、佐剂诱导关节炎大鼠模型、临床队列样本 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, 免疫组织化学, 实时定量PCR, 机器学习 | 列线图诊断模型, 多种机器学习技术 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 微阵列数据 | 多个GEO数据集, 临床队列, 动物模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 1427 | 2025-10-07 |
Impact of glioma metabolism-related gene ALPK1 on tumor immune heterogeneity and the regulation of the TGF-β pathway
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1512491
PMID:39845963
|
研究论文 | 本研究通过整合多源胶质瘤数据集,开发了一种创新的预后风险评估框架,并探讨了代谢相关基因ALPK1对肿瘤免疫异质性和TGF-β通路的调控作用 | 采用101种机器学习技术组合确定最优一致性指数构建预测模型,首次系统阐明ALPK1在胶质瘤免疫调控中的作用 | 研究基于回顾性数据集,需要进一步实验验证 | 探索胶质瘤分子分型、识别新的预后生物标志物并理解其免疫微环境特征 | 胶质瘤患者 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 非负矩阵分解(NMF), 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 单细胞测序, 机器学习 | LASSO+GBM | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 多源胶质瘤数据集 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1428 | 2025-10-07 |
Exploring the shared mechanism of fatigue between systemic lupus erythematosus and myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome: monocytic dysregulation and drug repurposing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1440922
PMID:39845969
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研究论文 | 本研究探索系统性红斑狼疮和肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征之间疲劳症状的共同机制,聚焦于单核细胞失调和药物重定位 | 首次通过生物信息学分析和实验验证揭示SLE和ME/CFS疲劳症状的共享免疫机制,识别关键靶点并预测潜在治疗药物 | 研究主要基于体外细胞模型,需要进一步体内实验验证;药物预测需要临床前和临床试验确认 | 探索SLE和ME/CFS疲劳症状的共同机制并预测潜在治疗药物 | 系统性红斑狼疮和肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征患者相关基因和单核细胞 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 生物信息学分析,RT-qPCR,单细胞测序,分子对接 | PPI网络,ROC曲线,TF-mRNA-miNA共调控网络 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 58个重叠基因,THP-1细胞炎症模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1429 | 2025-10-07 |
Exploring the role of metabolic pathways in TNBC immunotherapy: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1528248
PMID:39850483
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综述 | 探讨代谢通路在三阴性乳腺癌免疫治疗中的作用,重点关注单细胞和空间转录组学技术的应用 | 整合单细胞和空间转录组学技术揭示TNBC肿瘤异质性和免疫微环境中代谢重编程与免疫功能的相互作用机制 | NA | 阐明代谢通路如何调节三阴性乳腺癌免疫微环境并影响免疫检查点抑制剂疗效 | 三阴性乳腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞群体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1430 | 2025-10-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing reveals the tumor heterogeneity and microenvironment landscape during liver metastasis in adenocarcinoma of esophagogastric junction
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1484234
PMID:39850884
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示食管胃结合部腺癌肝转移过程中的肿瘤异质性和微环境景观 | 首次在单细胞水平揭示AEGJ肝转移中成纤维细胞和周细胞的特定作用,并发现SFRP2基因在周细胞中的高表达及其通过Wnt通路影响血管稳定性和血管生成的新机制 | 样本量有限,需要更大规模的研究验证发现 | 探索食管胃结合部腺癌肝转移的细胞和分子机制 | 食管胃结合部腺癌肝转移患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管胃结合部腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1431 | 2025-10-07 |
Combining single-cell analysis and molecular docking techniques to construct a prognostic model for colon adenocarcinoma and uncovering inhibin subunit βb as a novel therapeutic target
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1524560
PMID:39850875
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞分析和分子对接技术构建结肠腺癌预后模型,并发现抑制素亚基βb作为新型治疗靶点 | 首次将失巢凋亡相关基因与结肠腺癌预后关联,通过单细胞RNA测序分析肿瘤微环境,并验证INHBB作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床样本确认 | 构建结肠腺癌预后模型并探索新的治疗靶点 | 结肠腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 基因敲除, Cox比例风险模型, Lasso回归 | 预后特征模型 | 转录组数据, 临床信息 | TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1432 | 2025-10-07 |
Macrophage heterogeneity and oncogenic mechanisms in lung adenocarcinoma: insights from scRNA-seq analysis and predictive modeling
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491872
PMID:39850883
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺腺癌中巨噬细胞异质性并建立基于巨噬细胞相关基因的预后预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序揭示肺腺癌巨噬细胞亚群复杂性,并构建基于巨噬细胞标志基因的预后模型 | NA | 探索肺腺癌中巨噬细胞特征及其对预后的影响 | 肺腺癌患者和巨噬细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,RT-PCR,细胞实验 | Lasso回归,多元Cox回归 | 单细胞RNA测序数据,临床数据 | TCGA数据集和多个外部验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1433 | 2025-10-07 |
The emergence of DNAM-1 as the facilitator of NK cell-mediated killing in ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1477781
PMID:39835114
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析卵巢癌患者NK细胞的表型和功能特征 | 首次系统揭示卵巢癌中DNAM-1作为NK细胞杀伤功能关键调节因子的作用机制 | 样本量有限(80例患者),主要基于观察性研究 | 探索卵巢癌中NK细胞的表型特征及其与临床预后的关系 | 卵巢癌患者的血液、原发肿瘤和转移组织中的NK细胞 | 免疫肿瘤学 | 卵巢癌 | 流式细胞术, scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 80名卵巢癌女性患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1434 | 2025-10-07 |
Integrating single cell analysis and machine learning methods reveals stem cell-related gene S100A10 as an important target for prediction of liver cancer diagnosis and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1534723
PMID:39840058
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研究论文 | 本研究结合单细胞分析和机器学习方法,发现干细胞相关基因S100A10可作为肝癌诊断和免疫治疗的重要预测靶点 | 首次整合单细胞RNA测序与机器学习算法识别肝癌干细胞相关关键基因,并验证S100A10的诊断和预后价值 | NA | 提高肝细胞癌诊断精度并推进有效免疫治疗方法 | 肝细胞癌干细胞相关基因 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | XGBoost | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1435 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals S100A8/A9hi neutrophils-induced endothelial cell death and lymphocyte infiltration after ischemic stroke
2024-12-31, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151023
PMID:39579533
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示缺血性中风后S100A8/A9高中性粒细胞诱导的内皮细胞死亡和淋巴细胞浸润机制 | 首次发现S100A8/A9hi中性粒细胞亚群在缺血性中风中的关键作用,并证实S100A8/A9抑制剂paquinimod的神经保护作用 | 未明确说明样本来源和具体数量,机制研究仍需进一步验证 | 探究缺血性中风后免疫细胞与血脑屏障相互作用的分子机制 | 中性粒细胞、内皮细胞和T细胞 | 单细胞基因组学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1436 | 2025-10-07 |
Revealing the roles of IL-7R in abdominal aortic aneurysm through integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq
2024-12-31, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151042
PMID:39586133
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研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示IL-7R在腹主动脉瘤发病机制中的关键作用 | 首次通过整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据系统分析IL-7R在AAA中的作用机制,发现IL-7R通过JAK/STAT通路促进IFN-γ分泌并诱导平滑肌细胞表型转换 | 数据来源于公共数据库GEO,缺乏独立验证队列;样本数量未明确说明 | 探索腹主动脉瘤的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 腹主动脉瘤组织样本和CD4记忆T细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1437 | 2025-10-07 |
Explainable deep neural networks for predicting sample phenotypes from single-cell transcriptomics
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae673
PMID:39814561
|
研究论文 | 开发了一个名为singleDeep的端到端流程,利用深度神经网络分析单细胞转录组数据以预测样本表型 | 提出了首个专门针对单细胞RNA测序数据的端到端深度神经网络分析流程,能够同时提供表型预测和基因重要性解释 | 未明确说明模型在更大规模数据集上的可扩展性以及计算资源需求 | 开发能够有效分析单细胞转录组数据并预测样本表型的深度学习方法 | 系统性红斑狼疮、阿尔茨海默病和COVID-19患者的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 自身免疫疾病,神经退行性疾病,传染病 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1438 | 2025-10-07 |
scGO: interpretable deep neural network for cell status annotation and disease diagnosis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf018
PMID:39820437
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研究论文 | 提出一种基于基因本体的可解释深度学习框架scGO,用于单细胞RNA测序数据的细胞状态注释和疾病诊断 | 利用稀疏神经网络整合基因、转录因子和GO术语之间的内在生物学关系,显著增强模型可解释性并降低计算成本 | 未在论文摘要中明确说明 | 开发可解释的深度学习模型用于细胞状态注释和疾病诊断 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习、稀疏神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1439 | 2025-10-07 |
Small Molecule Hydrogels Loading Small Molecule Drugs from Chinese Medicine for the Enhanced Treatment of Traumatic Brain Injury
2024-10-22, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c09097
PMID:39383335
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研究论文 | 开发了一种负载中药小分子药物的自组装水凝胶用于创伤性脑损伤的增强治疗 | 无需额外载药或添加非活性成分,仅利用源自中药的小分子药物在生理条件下自组装形成水凝胶 | 未提及临床转化面临的具体挑战和长期安全性数据 | 开发一种新型创伤性脑损伤治疗策略 | 创伤性脑损伤模型 | 生物医学工程 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1440 | 2025-10-07 |
Role of macrophages in regression of myocardial fibrosis following alleviation of left ventricular pressure overload
2024-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00240.2023
PMID:38363214
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研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞在左心室压力超负荷缓解后心肌纤维化消退中的作用 | 首次揭示巨噬细胞在压力超负荷缓解后对胶原降解和间质纤维化部分消退的潜在益处 | 纤维化消退不完全,具体机制仍需进一步研究 | 确定巨噬细胞表型在压力超负荷和负荷缓解过程中的时间变化及其对胶原降解的影响 | 小鼠心肌组织 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 免疫组织化学,流式细胞术,RT-PCR,免疫印迹,单细胞测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞表型数据 | 对照组,2周和4周TAC组,2周,4周和6周unTAC组小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |