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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1401 | 2025-10-07 |
Genetic variation in IL-4 activated tissue resident macrophages alters the epigenetic state to determine strain specific synergistic responses to LPS
2024-Jan-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3759654/v1
PMID:38712032
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研究论文 | 本研究探讨了C57BL/6和BALB/c小鼠品系中组织驻留巨噬细胞对IL-4激活的差异表观遗传反应及其对LPS协同响应的影响 | 首次揭示遗传背景通过改变IL-4诱导的表观遗传重编程决定巨噬细胞对LPS的品系特异性协同反应 | 研究仅限于腹膜腔组织驻留巨噬细胞,未涉及其他组织来源的巨噬细胞 | 解析遗传变异如何影响巨噬细胞整合多重刺激的表观遗传机制 | C57BL/6和BALB/c小鼠品系的腹膜腔组织驻留巨噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 表观基因组分析 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 两个小鼠品系的组织驻留巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1402 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics and chromatin accessibility profiling elucidate the kidney-protective mechanism of mineralocorticoid receptor antagonists
2024-01-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157165
PMID:37906287
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和染色质可及性分析揭示盐皮质激素受体拮抗剂的肾脏保护机制 | 首次结合单细胞表达和染色质可及性工具系统阐明盐皮质激素在肾脏中的靶基因和细胞类型,并比较不同降压药物的肾脏保护效果 | 研究基于大鼠模型,人类样本验证尚不充分 | 探究盐皮质激素受体拮抗剂在高血压相关肾脏疾病中的保护机制 | 大鼠肾脏细胞及人类肾脏样本 | 单细胞多组学 | 肾脏疾病 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 染色质可及性数据 | 大鼠模型及人类肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 1403 | 2025-10-07 |
Tuberculous meningitis diagnosis and treatment: classic approaches and high-throughput pathways
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1543009
PMID:39867878
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综述 | 本文综述结核性脑膜炎的经典诊断治疗方法及高通量技术新途径 | 系统评估核酸检测、宏基因组测序和单细胞测序等新兴技术,探索代谢组学和蛋白质组学生物标志物的诊断潜力 | NA | 优化结核性脑膜炎诊断策略并推动多组学技术的临床转化 | 结核性脑膜炎的诊断和治疗技术 | NA | 结核性脑膜炎 | 核酸检测、宏基因组下一代测序、单细胞测序、代谢组学、蛋白质组学 | NA | 基因组数据、代谢组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 宏基因组下一代测序, 单细胞测序 | Xpert Ultra | NA |
| 1404 | 2025-10-07 |
Infiltrating lipid-rich macrophage subpopulations identified as a regulator of increasing prostate size in human benign prostatic hyperplasia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494476
PMID:39867899
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了良性前列腺增生中富含脂质的巨噬细胞亚群,并探讨其与前列腺体积增大的关系 | 首次在良性前列腺增生中鉴定出TREM2高表达和MARCO高表达两种新型巨噬细胞亚群,揭示了脂质代谢重编程在巨噬细胞表型转变中的关键作用 | 样本量相对有限,需要进一步研究验证这些巨噬细胞亚群作为治疗靶点的潜力 | 探究巨噬细胞表型变化与良性前列腺增生发展的关系 | 人类良性前列腺增生组织中的CD45+过渡区白细胞 | 单细胞生物学 | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 20例人类前列腺组织(10例大于90克,10例小于40克) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1405 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis of medaka lymphocytes reveals absence of fully mature T cells in the thymus and the T-lineage commitment in the kidney
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517467
PMID:39867910
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较野生型和突变型青鳉淋巴细胞,揭示其T细胞发育的独特特征 | 首次在青鳉中发现胸腺中缺乏完全成熟的T细胞,并在肾脏中鉴定出已定向T系发育的淋巴祖细胞 | 研究仅聚焦于青鳉和斑马鱼的比较,未涵盖其他硬骨鱼物种 | 探究硬骨鱼类淋巴细胞发育的分子和细胞机制差异 | 青鳉(野生型和V(D)J重组缺陷突变型)的胸腺和肾脏淋巴细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和突变型青鳉的胸腺和肾脏淋巴细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1406 | 2025-10-07 |
Identification of a pancreatic stellate cell gene signature and lncRNA interactions associated with type 2 diabetes progression
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1532609
PMID:39872314
|
研究论文 | 本研究通过识别胰腺星状细胞基因特征和lncRNA相互作用,揭示了2型糖尿病进展的新机制 | 首次发现COL1A2hi/VCANhi/SULF1hi胰腺星状细胞特异性特征及其在2型糖尿病中的独特作用,并构建了相关的lncRNA-mRNA调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证 | 探索2型糖尿病中胰腺星状细胞的基因表达特征及其通过lncRNA-mRNA相互作用在疾病进展中的调控机制 | 2型糖尿病患者的胰岛细胞、胰腺星状细胞和外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个2型糖尿病和1型糖尿病数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1407 | 2025-10-07 |
Identification and validation of BATF as a prognostic biomarker and regulator of immune cell infiltration in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1429855
PMID:39872530
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,发现BATF是急性髓系白血病中免疫细胞浸润的调节因子和预后生物标志物 | 首次系统揭示BATF在AML中的预后价值及其通过调节CD8+T细胞和NK细胞比例影响免疫细胞浸润的新机制 | 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,需要更多临床样本验证BATF的临床应用价值 | 探索BATF在急性髓系白血病中的预后价值和免疫调节作用 | 急性髓系白血病患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, 流式细胞术, 单细胞测序 | C1498小鼠AML模型 | 基因组数据, 临床数据, 实验数据 | TCGA-LAML和GEO(GSE37642)数据库样本 | NA | 单细胞测序, RNA-seq | NA | NA |
| 1408 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq reveals immune cell heterogeneity and increased Th17 cells in human fibrotic skin diseases
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522076
PMID:39872534
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示纤维化皮肤疾病中免疫细胞的异质性及Th17细胞增加现象 | 首次通过CD45+免疫细胞富集构建纤维化皮肤疾病的单细胞图谱,发现Th17细胞通过IL-17A促进瘢痕疙瘩成纤维细胞功能 | 研究样本量有限,仅针对瘢痕疙瘩等特定纤维化皮肤疾病 | 探究纤维化皮肤疾病中免疫细胞的细胞景观和Th17细胞的作用机制 | 瘢痕疙瘩和正常瘢痕组织中的CD45+免疫细胞及成纤维细胞 | 单细胞测序分析 | 纤维化皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 荧光激活细胞分选, Ki-67染色, 划痕实验, 实时PCR, Western blotting | NA | 单细胞基因表达数据 | 瘢痕疙瘩和正常瘢痕组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1409 | 2025-10-07 |
Upregulation of interferon-γ response genes in monocytes and T cells identified by single-cell transcriptomics in patients with anti-citrullinated peptide antibody-positive early rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1439082
PMID:39877346
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析比较了ACPA阳性和阴性早期类风湿关节炎患者的免疫系统差异 | 首次在单细胞水平揭示了ACPA+早期RA患者中干扰素-γ反应基因在单核细胞和T细胞中的普遍上调 | 样本量相对有限,仅分析了37,318个细胞 | 探究ACPA阳性和阴性早期类风湿关节炎患者的免疫系统差异 | 抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性的早期类风湿关节炎患者 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序,多重细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,血清细胞因子数据 | 37,318个CD45+细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1410 | 2025-10-07 |
Immunometabolic alterations in type 2 diabetes mellitus revealed by single-cell RNA sequencing: insights into subtypes and therapeutic targets
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1537909
PMID:39877357
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示2型糖尿病中的免疫代谢改变,识别疾病亚型和潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平系统分析T2DM患者PBMCs的免疫代谢特征,基于代谢异质性定义三种疾病亚型,并识别关键转录因子和潜在治疗药物 | 样本量相对有限(37例患者和11例对照),仅分析外周血单个核细胞,未涉及组织特异性免疫代谢改变 | 阐明2型糖尿病的免疫代谢机制并识别治疗靶点 | 2型糖尿病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,基因集变异分析,机器学习 | 机器学习分类模型 | 单细胞转录组数据 | 37例2型糖尿病患者和11例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1411 | 2025-10-07 |
Characterization of NOD-like receptor-based molecular heterogeneity in glioma and its association with immune micro-environment and metabolism reprogramming
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1498583
PMID:39882240
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研究论文 | 本研究通过分析胶质母细胞瘤患者的转录组数据,揭示了NOD样受体信号通路在肿瘤免疫微环境和代谢重编程中的关键作用 | 首次基于NLR基因表达谱将GBM患者分为具有不同临床预后的亚型,并鉴定TRIP6基因为NLR通路中的关键枢纽基因 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索NOD样受体信号通路在胶质母细胞瘤临床异质性中的作用机制 | 496例具有完整预后信息的胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序,单细胞测序,LASSO回归,COX回归,随机森林算法 | NMF聚类,LASSO,COX,随机森林 | 基因表达数据 | 496例GBM患者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1412 | 2025-10-07 |
TCR transgenic clone selection guided by immune receptor analysis and single-cell RNA expression of polyclonal responders
2024-Dec-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98344
PMID:39854619
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞测序和TCR谱分析快速筛选抗原特异性TCR序列并生成TCR转基因小鼠的新方法 | 利用单细胞测序和TCR谱分析技术替代传统的杂交瘤筛选方法,快速选择最佳TCR克隆 | NA | 开发快速生成抗原特异性TCR转基因小鼠的方法 | SARS-CoV-2刺突蛋白特异性CD8 T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, TCR谱分析, PCR克隆 | NA | 单细胞RNA表达数据, TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1413 | 2025-10-07 |
NK cell exhaustion in Wilson's disease revealed by single-cell RNA sequencing predicts the prognosis of cholecystitis
2024-Dec-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98867
PMID:39854622
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示威尔逊病中NK细胞耗竭及其与胆囊炎预后的关联 | 首次在威尔逊病模型中揭示代谢异常导致NK细胞耗竭,并证实其与胆囊炎预后的直接关联 | 回顾性临床研究,样本来源单一,机制验证不够充分 | 探究肝脏疾病代谢异常影响胆囊炎风险的免疫机制 | 威尔逊病患者及胆囊炎患者 | 单细胞组学 | 肝胆疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据,临床数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1414 | 2025-10-07 |
scMMAE: masked cross-attention network for single-cell multimodal omics fusion to enhance unimodal omics
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf010
PMID:39851073
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研究论文 | 提出一种基于掩码自编码器和交叉注意力机制的单细胞多组学融合框架scMMAE,用于增强单组学分析 | 首次将掩码自编码器与交叉注意力机制结合用于单细胞多组学融合,同时捕获共享特征和独特信息,并能将知识迁移到单组学分析 | NA | 开发单细胞多组学融合方法以增强单组学数据分析 | 单细胞转录组学和蛋白质组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 掩码自编码器, 交叉注意力网络 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1415 | 2025-10-07 |
Complex hierarchical structures analysis in single-cell data with Poincaré deep manifold transformation
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae687
PMID:39851075
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研究论文 | 提出一种名为PoincaréDMT的新方法,用于分析单细胞RNA测序数据中的复杂层次结构 | 通过双曲庞加莱圆盘映射保留全局结构,结合数据增强实现局部结构校正,并整合批次图减轻批次效应 | NA | 解决单细胞数据分析中结构保留不完整和嵌入高失真问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度流形变换 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1416 | 2025-10-07 |
Immunotherapy drives mesenchymal tumor cell state shift and TME immune response in glioblastoma patients
2024-08-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae085
PMID:38695342
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了免疫检查点抑制剂治疗胶质母细胞瘤时肿瘤细胞向间充质状态转变的耐药机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示了免疫治疗驱动的胶质母细胞瘤肿瘤细胞向间充质干细胞样状态转变的耐药机制 | 样本量相对有限,需要在更大队列中验证研究结果 | 探索胶质母细胞瘤对免疫检查点抑制剂治疗的耐药机制 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 76个肿瘤样本(主要研究)+ 298个外部验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1417 | 2025-10-07 |
Integrated cancer cell-specific single-cell RNA-seq datasets of immune checkpoint blockade-treated patients
2024-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.17.576110
PMID:38328153
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研究论文 | 整合了免疫检查点阻断治疗患者的癌细胞特异性单细胞RNA-seq数据集 | 整合了来自9种癌症类型、174名患者的8个scRNA-seq数据集,创建了专门用于研究癌细胞对ICB治疗反应的独特资源 | 样本量相对有限,数据来源于已有的研究数据集 | 研究不同癌症类型中癌细胞对免疫检查点阻断治疗的反应机制 | 癌细胞 | 单细胞组学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 174名患者,90,270个癌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1418 | 2025-10-07 |
Heterogeneity and synaptic plasticity analysis of hippocampus based on db-/- mice induced diabetic encephalopathy
2024-01, Psychoneuroendocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.psyneuen.2023.106412
PMID:37898037
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析db/db糖尿病小鼠海马体细胞异质性和突触可塑性,探索糖尿病脑病的发病机制 | 首次在糖尿病认知障碍模型中构建海马体单细胞转录组图谱,发现少突胶质前体细胞的五个新亚群及其与神经可塑性调控的关联 | 研究仅限于db/db小鼠模型,样本量相对有限,需要进一步验证Sstr2基因在神经可塑性中的具体作用机制 | 探索长期高血糖状态下海马体细胞异质性及其对突触可塑性的影响 | db/db糖尿病小鼠海马体细胞 | 数字病理学 | 糖尿病脑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | CI组21,379个细胞,对照组20,045个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1419 | 2025-10-07 |
Single-cell mitophagy patterns within the tumor microenvironment modulate intercellular communication, impacting the progression and prognosis of hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1448878
PMID:39835122
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝细胞癌肿瘤微环境中的线粒体自噬模式及其对细胞间通讯和疾病预后的影响 | 首次在肝细胞癌肿瘤微环境中系统鉴定不同细胞类型的线粒体自噬模式,并揭示其通过调控细胞间通讯影响肿瘤进展的机制 | 线粒体自噬似乎不影响免疫治疗效果,研究样本量相对有限 | 探究肝细胞癌肿瘤微环境中线粒体自噬模式对细胞通讯和疾病进展的影响 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境细胞,包括癌症相关成纤维细胞、T细胞、B细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NMF聚类,CellChat,Monocle,SCENIC | 单细胞RNA测序数据 | 25,189个细胞,来自两个肝细胞癌患者数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1420 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing analysis reveals cancer-associated pericyte subgroup in esophageal squamous cell carcinoma to predict prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1474673
PMID:39835116
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研究论文 | 通过单细胞测序分析发现食管鳞状细胞癌中与预后相关的癌症相关周细胞亚群 | 首次在食管鳞状细胞癌中鉴定出6个周细胞亚型,并发现其中c4_SOD2与预后负相关、c5_TYMS与预后正相关 | 未明确说明样本量的具体数值,周细胞异质性机制仍需进一步验证 | 探究食管鳞状细胞癌中癌症相关周细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 食管鳞状细胞癌患者组织样本中的周细胞 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序, 多重免疫荧光, 分子对接 | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA-seq数据, 免疫荧光图像 | 大样本单细胞测序数据(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间分布分析 | NA | NA |