单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 1401 - 1420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1401 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals distinct metabolic "microniches" and close host-symbiont interactions in deep-sea chemosynthetic tubeworm
2024-07-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3053
PMID:39047091
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示深海化能合成管虫体内代谢微环境及其与内共生菌的相互作用机制 | 首次在深海化能合成生态系统中应用原位单细胞固定技术，发现管虫通过控制化学合成气体和代谢物可用性在共生器官中维持两种不同的代谢微环境 | 研究仅针对一种冷泉管虫物种，尚未验证在其他化能合成生态系统中的普适性 | 阐明深海管虫与内共生菌之间的分子相互作用机制 | 冷泉管虫及其硫氧化γ-变形菌内共生体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 冷泉管虫共生器官组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 深海原位单细胞固定技术 |
| 1402 | 2025-10-06 |
Macrophage Dysfunction in Respiratory Disease
2024, Results and problems in cell differentiation
DOI:10.1007/978-3-031-65944-7_9
PMID:39406908
|
综述 | 本文探讨肺巨噬细胞在呼吸系统疾病中的功能障碍及其机制 | 整合谱系追踪和单细胞RNA测序技术揭示巨噬细胞在肺部疾病中的代谢特征和线粒体活性变化 | 未涉及具体实验验证和临床干预研究 | 解析巨噬细胞功能障碍在呼吸系统疾病发病机制中的作用 | 肺巨噬细胞（包括肺泡巨噬细胞和组织驻留细胞） | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1403 | 2025-10-06 |
The brain microvasculature is a primary mediator of interferon-α neurotoxicity in human cerebral interferonopathies
2024-07-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.05.017
PMID:38878770
|
研究论文 | 本研究揭示大脑微血管是干扰素-α神经毒性的主要介导者，为Aicardi-Goutières综合征提供了新的治疗靶点 | 首次证实大脑是神经毒性IFN-α的主要来源，并确定脑内皮细胞中的IFNAR信号通路是导致脑血管疾病的关键机制 | 动物模型与人类疾病存在差异，需要进一步验证治疗策略的临床适用性 | 探究Aicardi-Goutières综合征中神经毒性IFN-α的来源和作用机制 | Aicardi-Goutières综合征患者和小鼠模型 | 神经科学 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 磁共振成像, 单分子ELISA | NA | 基因表达数据, 影像数据, 蛋白质检测数据 | 人类患者和小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1404 | 2025-10-06 |
THBS2 + cancer-associated fibroblasts promote EMT leading to oxaliplatin resistance via COL8A1-mediated PI3K/AKT activation in colorectal cancer
2024-Dec-28, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02180-y
PMID:39732719
|
研究论文 | 本研究揭示THBS2+癌症相关成纤维细胞通过COL8A1介导的PI3K/AKT通路激活促进上皮间质转化，导致结直肠癌奥沙利铂耐药 | 首次发现THBS2+CAF亚群通过COL8A1-ITGB1相互作用激活PI3K/AKT通路促进EMT和奥沙利铂耐药的新机制 | NA | 探索特定CAF亚群促进结直肠癌奥沙利铂耐药的分子机制 | 结直肠癌细胞和癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1405 | 2025-10-06 |
Distinct tumor-TAM interactions in IDH-stratified glioma microenvironments unveiled by single-cell and spatial transcriptomics
2024-08-16, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01837-5
PMID:39148129
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示IDH分层胶质瘤微环境中肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞的独特相互作用 | 首次在IDH定义的胶质瘤类别中系统比较肿瘤-TAM相互作用，发现IDH-WT胶质母细胞瘤中两个间充质表型TAM亚群与患者预后不良相关，并鉴定SLAMF9受体作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于转录组学分析，需要进一步的功能实验验证发现的相互作用机制 | 阐明IDH分层胶质瘤微环境中肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞的相互作用特征 | 胶质瘤患者肿瘤样本中的肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq, RT-qPCR, 基因调控网络推断 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1406 | 2025-10-06 |
Spatial Proteomics towards cellular Resolution
2024-Dec-25, Expert review of proteomics
IF:3.8Q1
DOI:10.1080/14789450.2024.2445809
PMID:39710940
|
综述 | 本文概述了基于非靶向质谱的空间蛋白质组学工作流程及其向细胞分辨率发展的最新进展 | 强调空间蛋白质组学向细胞分辨率发展的技术突破，包括组织解剖、样品处理、生物信息学和液相色谱-质谱技术的进步 | 需要进一步发展数据分析和开发细胞或亚细胞水平的自动化智能组织解剖技术 | 推动空间蛋白质组学向细胞分辨率发展，深化对组织微环境空间组织的理解 | 组织微环境中的蛋白质空间分布 | 空间生物学 | NA | 非靶向质谱、液相色谱-质谱联用 | NA | 蛋白质组数据 | NA | NA | 空间蛋白质组学 | NA | 基于质谱的空间蛋白质组学工作流程 |
| 1407 | 2025-10-06 |
Prostate luminal cell plasticity and cancer
2024-Dec-25, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217430
PMID:39730086
|
综述 | 本文综述了前列腺管腔细胞可塑性在癌症中的作用及其对治疗耐药性的影响 | 整合了单细胞RNA测序和遗传谱系追踪技术揭示前列腺癌进展中的细胞可塑性和克隆动态变化 | 表观遗传改变如何影响肿瘤免疫原性仍是待研究领域 | 探讨前列腺细胞可塑性在癌症发展和治疗耐药中的作用机制 | 前列腺癌细胞、小鼠模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1408 | 2025-10-06 |
Pulmonary osteoclast-like cells in silica induced pulmonary fibrosis
2024-07-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4913
PMID:38985878
|
研究论文 | 本研究探讨了二氧化硅诱导肺纤维化的机制，发现肺内破骨样细胞分化是导致肺损伤的关键因素 | 首次发现二氧化硅暴露可诱导肺泡巨噬细胞和单核细胞分化为肺内破骨样细胞，并证实抗RANKL抗体治疗可抑制此过程并减轻肺纤维化 | 研究样本量有限，机制研究主要基于动物模型，人类样本验证仍需扩大 | 探索矽肺发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 职业性二氧化硅暴露患者的肺组织样本和矽肺小鼠模型 | 病理生理学 | 矽肺 | 单细胞RNA测序，组织学分析，生化检测，生理功能评估 | NA | 基因表达数据，组织图像，生化指标，生理参数 | 人类职业暴露患者肺样本和纵向小鼠矽肺模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 全肺单细胞RNA测序 |
| 1409 | 2025-10-06 |
Development of human pancreatic cancer avatars as a model for dynamic immune landscape profiling and personalized therapy
2024-07-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9071
PMID:38968363
|
研究论文 | 开发人胰腺癌avatar模型用于动态免疫景观分析和个性化治疗评估 | 创建个性化器官型avatar模型，能够对完整原位肿瘤微环境进行时空报告并反映临床反应 | 需要手术切除组织样本，模型维持时间有限（12天） | 建立胰腺癌临床前模型以促进治疗进展 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多重免疫荧光，空间转录组学 | 器官型avatar模型 | 图像，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1410 | 2025-10-06 |
Identification of intracellular bacteria from multiple single-cell RNA-seq platforms using CSI-Microbes
2024-07-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7402
PMID:38959321
|
研究论文 | 开发了CSI-Microbes计算流程，用于从单细胞RNA测序数据中识别微生物reads并分析类群差异丰度 | 首次系统评估多种单细胞RNA测序技术回收微生物UMI的效率，发现较新的10x化学方法最适合 | NA | 研究肿瘤微生物组及其与肿瘤微环境的相互作用 | 食管癌和结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 食管癌,结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 计算流程(CSI-Microbes) | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 3' v3和5'化学方法 |
| 1411 | 2025-10-06 |
Tumor suppressor FRMD3 controls mammary epithelial cell fate determination via notch signaling pathway
2024-07-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk8958
PMID:38959315
|
研究论文 | 本研究揭示肿瘤抑制因子FRMD3通过调控Notch信号通路决定乳腺上皮细胞命运 | 首次发现FRMD3通过破坏Dvl2与去泛素化酶USP9x的相互作用促进其降解，并中断Dvl2与CK1、FOXK1/2和NICD的相互作用 | NA | 探究乳腺上皮细胞管腔-基底转化机制及FRMD3的肿瘤抑制功能 | 乳腺上皮细胞(MECs)和三阴性乳腺癌 | 分子生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1412 | 2025-10-06 |
Development of a nanoparticle-based tendon-targeting drug delivery system to pharmacologically modulate tendon healing
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn2332
PMID:38896625
|
研究论文 | 开发了一种基于纳米颗粒的肌腱靶向药物递送系统，用于药理学调节肌腱愈合 | 首次发现肌腱愈合过程中的TRAP活性，并利用TRAP结合肽功能化纳米颗粒实现肌腱特异性药物递送 | 仅在小鼠模型中验证，尚未进行人体临床试验 | 开发改善肌腱愈合的药理学治疗方法 | 急性肌腱损伤的愈合过程 | 生物医学工程 | 肌腱损伤 | 空间转录组学、纳米颗粒药物递送系统 | NA | 基因表达数据、生物力学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1413 | 2025-10-06 |
Structure and dynamics of enterovirus genotype networks
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1693
PMID:38896609
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示肠道病毒种群通过突变网络维持与多个适应性基因型连接的进化动态 | 开发SEARCHLIGHT方法实现单细胞水平同时获取病毒单倍型和宿主转录组信息，首次在单细胞分辨率揭示病毒种群结构复杂性 | NA | 解析肠道病毒基因型网络的结构和动态，理解病毒种群如何适应选择性环境变化 | 肠道病毒种群 | 基因组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、病毒单倍型数据 | 数百个受感染的单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | SEARCHLIGHT（scRNA-seq-enabled acquisition of mRNA and consensus haplotypes linking individual genotypes and host transcriptomes） |
| 1414 | 2025-10-06 |
Expansion of learning capacity elicited by interspecific hybridization
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3409
PMID:38896617
|
研究论文 | 本研究通过种间杂交培育F1杂交鸣禽，探索了物种特异性学习能力的神经遗传机制 | 首次发现杂交鸣禽具有扩展的学习能力，能模仿双亲物种及其他异种鸣叫，并揭示这与发声运动投射神经元的特异性转录特征相关 | 尽管发现神经回路大小和神经元数量保守，但具体分子机制仍需进一步验证 | 探索物种特异性鸣叫学习的神经遗传机制 | F1杂交鸣禽及其亲本物种 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | F1杂交鸣禽个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1415 | 2025-10-06 |
MOXD1 is a lineage-specific gene and a tumor suppressor in neuroblastoma
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1583
PMID:38905335
|
研究论文 | 本研究通过分析神经母细胞瘤样本的RNA测序数据，发现MOXD1基因是神经母细胞瘤中的谱系特异性肿瘤抑制基因 | 首次将MOXD1鉴定为神经母细胞瘤中的谱系限制性肿瘤抑制基因，并揭示了其在肿瘤发展中的决定性作用 | 缺乏适当的早期肿瘤驱动事件研究模型 | 探索神经母细胞瘤的胚胎起源和早期肿瘤驱动事件 | 人类神经母细胞瘤样本、人类神经母细胞瘤细胞、胎儿肾上腺、斑马鱼、小鸡和小鼠模型 | 癌症生物学 | 神经母细胞瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 人类神经母细胞瘤样本和多种动物模型 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1416 | 2025-10-06 |
Noninvasive assessment of the lung inflammation-fibrosis axis by targeted imaging of CMKLR1
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9817
PMID:38896611
|
研究论文 | 本研究验证了CMKLR1作为肺部炎症-纤维化轴成像生物标志物的潜力 | 首次将CMKLR1确定为单核细胞源性巨噬细胞的瞬时标志物，并开发了CMKLR1靶向PET成像技术用于肺部炎症和纤维化的无创评估 | 研究主要基于小鼠模型，临床验证仍需进一步开展 | 开发用于纤维化肺疾病风险分层和治疗监测的可靠生物标志物 | 特发性肺纤维化患者和小鼠肺纤维化模型 | 数字病理 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，正电子发射断层扫描 | NA | 基因表达数据，影像数据 | 特发性肺纤维化患者队列和博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1417 | 2025-10-06 |
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj9173
PMID:38905344
|
研究论文 | 构建了跨物种三叉神经节和背根神经节的统一细胞图谱，促进不同物种和研究间的细胞类型比较 | 创建了首个涵盖6个物种、31个数据集的统一感觉神经节细胞图谱，改进了稀疏神经元亚型的注释 | 研究主要基于转录组数据，可能未完全捕捉蛋白质水平和功能特性的差异 | 比较不同物种感觉神经节的细胞类型多样性并建立统一注释标准 | 三叉神经节和背根神经节的感觉神经元和非神经元细胞 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 6个物种、31个数据集 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 1418 | 2025-10-06 |
Integration mapping of cardiac fibroblast single-cell transcriptomes elucidates cellular principles of fibrosis in diverse pathologies
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk8501
PMID:38905342
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据构建心脏纤维化的综合参考图谱 | 建立了首个全面的心脏纤维化单细胞转录组整合图谱，揭示了不同病理模型中成纤维细胞的相似性动态变化 | NA | 阐明不同病理条件下心脏纤维化的细胞学原理 | 心脏成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类健康及患病心脏样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1419 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals segregation of tumor cell states in glioblastoma and marked immunosuppression within the perinecrotic niche
2024-04-22, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01769-0
PMID:38650010
|
研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据，揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤细胞状态的空间分离模式以及坏死周围区域的免疫抑制特征 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术，系统揭示了胶质母细胞瘤中不同肿瘤细胞状态的空间分布规律及坏死周围区域的免疫抑制微环境 | 研究仅包含3例患者样本，样本量较小，可能限制结果的普适性 | 探究胶质母细胞瘤微环境中细胞类型和肿瘤细胞状态的空间分布特征 | 胶质母细胞瘤患者组织样本 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 3例胶质母细胞瘤患者 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序, 10x Visium空间转录组学平台 |
| 1420 | 2025-10-06 |
FABP5+ macrophages contribute to lipid metabolism dysregulation in type A aortic dissection
2024-Dec-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113438
PMID:39447410
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了FABP5+巨噬细胞在A型主动脉夹层脂质代谢失调中的关键作用 | 首次系统评估主动脉夹层中非免疫细胞与免疫细胞间的相互作用及其对代谢的影响，并发现FABP5+巨噬细胞的新亚群 | 研究结果仍需在更大样本中进一步验证，机制研究尚待深入 | 阐明A型主动脉夹层的脂质代谢景观及其病理机制 | A型主动脉夹层患者和模型小鼠 | 多组学分析 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 脂质代谢组学 | NA | RNA序列数据, 代谢组学数据 | TAAD模型小鼠和TAAD患者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 脂质代谢组学 | NA | NA |