单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7855 篇文献，本页显示第 1401 - 1420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1401 | 2024-11-26 |
RETRACTION: Prognostic Value and Potential Mechanism of Cellular Senescence and Tumor Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma: Insights From Bulk Transcriptomics and Single-Cell Sequencing Analysis
2024-Nov-25, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24453
PMID:39584580
|
correction | 该文章因同行评审过程被破坏而被撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1402 | 2024-11-26 |
CRISPR-based genetic screens in human pluripotent stem cells derived neurons and brain organoids
2024-Nov-25, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-024-03934-2
PMID:39585363
|
综述 | 本文总结了基于CRISPR的基因筛选技术在人多能干细胞衍生的神经元和脑类器官中的应用 | 结合CRISPR基因筛选和单细胞RNA测序，揭示了人类神经细胞中受遗传变异影响的下游基因和细胞通路，为神经发育障碍的病理机制提供了新见解 | 尽管CRISPR基因筛选技术具有巨大潜力，但仍面临挑战，如技术复杂性和数据解释的困难 | 探讨CRISPR基因筛选技术在神经系统疾病研究和潜在治疗策略开发中的应用 | 人多能干细胞衍生的神经元和脑类器官 | 基因组学 | 神经发育障碍 | CRISPR基因筛选技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 1403 | 2024-11-26 |
High CD44 expression and enhanced E-selectin binding identified as biomarkers of chemoresistant leukemic cells in human T-ALL
2024-Nov-24, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02473-7
PMID:39580584
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研究论文 | 研究识别了CD44高表达和E-选择素增强结合作为化疗耐药白血病细胞的生物标志物 | 通过单细胞RNA测序揭示了化疗耐药白血病细胞的特征，并发现了CD44表达与E-选择素结合的关联 | NA | 研究T-ALL中化疗耐药机制，并寻找新的治疗选项 | T-ALL中的化疗耐药白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 39个T-ALL样本 |
| 1404 | 2024-11-26 |
Upregulation of CD244 promotes CD8+ T cell exhaustion in patients with alveolar echinococcosis and a murine model
2024-Nov-23, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-024-06573-2
PMID:39578914
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研究论文 | 研究CD244在肺吸虫病患者和鼠模型中促进CD8+ T细胞耗竭的作用 | 首次揭示了CD244在介导CD8+ T细胞耗竭中的作用，并探讨了其在肺吸虫病恶性进展中的机制 | 研究主要基于体外和体内模型，缺乏对人类患者的长期随访数据 | 探讨CD244在肺吸虫病患者中促进CD8+ T细胞耗竭的作用及其机制 | 肺吸虫病患者的CD8+ T细胞和鼠模型 | 免疫学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、流式细胞术 | NA | RNA序列、图像 | 肺吸虫病患者的肝组织样本和CD244缺陷小鼠 |
| 1405 | 2024-11-26 |
Single-cell sequencing reveals PTX3 involvement in ovarian cancer metastasis
2024-Nov-23, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01558-2
PMID:39580424
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化技术，揭示了PTX3在卵巢癌腹膜转移中的作用及其机制 | 首次证实PTX3在卵巢癌转移病灶中的表达高于原发病灶，并发现PTX3通过激活EMT和NF-κB信号通路促进卵巢癌细胞的转移能力 | NA | 探讨PTX3在卵巢癌腹膜转移中的作用及其分子机制 | 卵巢癌细胞、PTX3表达及其功能 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、共免疫沉淀 | NA | RNA | NA |
| 1406 | 2024-11-26 |
Single-cell analysis uncovers liver susceptibility to pancreatic cancer metastasis via myeloid cell characterization
2024-Nov-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01566-0
PMID:39578286
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析胰腺癌肝转移的肿瘤免疫微环境特征 | 发现了与胰腺癌肝转移相关的特定巨噬细胞亚群Mph_SPP1，并揭示了其在调节血管生成和肿瘤侵袭中的作用 | 研究仅限于单细胞RNA测序数据，未涉及其他类型的实验验证 | 探究胰腺癌肝转移的肿瘤免疫微环境特征 | 胰腺癌和结直肠癌的肝转移样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括胰腺癌肝转移、结直肠癌肝转移、原发性胰腺癌、原发性结直肠癌以及外周血单核细胞和邻近正常胰腺组织样本 |
| 1407 | 2024-11-26 |
Immunotherapy that improves response to chemotherapy in high-grade serous ovarian cancer
2024-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54295-x
PMID:39578450
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了高级别浆液性卵巢癌中的肿瘤浸润免疫细胞，发现了一些可以增强新辅助化疗反应的潜在靶点 | 本文首次在高级别浆液性卵巢癌中发现新辅助化疗诱导的stabilin-1和FOXP3表达上调，并通过体外实验和动物模型验证了这些靶点的有效性 | 本文主要基于体外实验和动物模型，尚未在临床试验中验证这些靶点的效果 | 研究如何通过免疫疗法增强高级别浆液性卵巢癌患者对化疗的反应 | 高级别浆液性卵巢癌中的肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 64,097个细胞样本和69,781个细胞样本分别来自患者和同基因小鼠模型 |
| 1408 | 2024-11-26 |
Lenalidomide-induced pure red cell aplasia is associated with elevated expression of MHC-I molecules on erythrocytes
2024-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54571-w
PMID:39578482
|
研究论文 | 研究揭示了来那度胺诱导的纯红细胞再生障碍与红细胞上MHC-I分子高表达的关联 | 首次揭示了来那度胺治疗后红细胞上MHC-I分子异常高表达与纯红细胞再生障碍的关系 | 研究仅基于单一病例，需要更多病例验证 | 探讨来那度胺治疗后纯红细胞再生障碍的机制 | 多发性骨髓瘤患者及其红细胞和T细胞 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 单一病例 |
| 1409 | 2024-11-26 |
VGAE-CCI: variational graph autoencoder-based construction of 3D spatial cell-cell communication network
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae619
PMID:39581873
|
研究论文 | 提出了一种基于变分图自编码器的深度学习框架VGAE-CCI，用于构建三维空间细胞间通信网络 | 该方法能够识别跨多层组织的细胞间通信，并适用于具有缺失或部分不完整数据的空间转录组数据 | 未提及 | 解决空间转录组数据中的不完整性和系统偏差问题，以及跨多层组织的细胞间通信分析 | 细胞间通信网络 | 生物信息学 | NA | 空间转录组测序 (ST-seq) | 变分图自编码器 (VGAE) | 空间转录组数据 | 六个数据集 |
| 1410 | 2024-11-26 |
BioDSNN: a dual-stream neural network with hybrid biological knowledge integration for multi-gene perturbation response prediction
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae617
PMID:39584702
|
研究论文 | 本文提出了一种双流神经网络架构BioDSNN，用于预测多基因扰动响应 | 结合生成模型和生物知识网络，实现了对单细胞RNA-seq数据的双模态深度理解 | NA | 研究基因扰动对细胞的影响，并提出一种新的计算模型来预测未见过的基因扰动组合 | 单细胞RNA-seq数据和基因扰动响应 | 机器学习 | NA | 生成模型、图网络、掩码变换器 | 双流神经网络 | 基因数据 | NA |
| 1411 | 2024-11-26 |
ETV2 transcriptionally activates Rig1 gene expression and promotes reprogramming of the endothelial lineage
2024-11-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78115-w
PMID:39562637
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研究论文 | 研究探讨了ETV2转录因子通过激活Rig1基因表达促进成纤维细胞向内皮细胞重编程的分子机制 | 首次揭示了ETV2通过直接激活Rig1基因表达来促进成纤维细胞向内皮细胞的重编程 | 研究主要集中在体外实验，缺乏体内验证 | 揭示ETV2介导的成纤维细胞向内皮细胞重编程的分子机制 | ETV2转录因子和Rig1基因在成纤维细胞重编程中的作用 | NA | 心血管疾病 | ChIP-seq、电泳迁移率变动分析、转录分析 | NA | RNA-seq | 使用了携带可诱导ETV2表达系统的鼠胚胎成纤维细胞（MEFs） |
| 1412 | 2024-11-26 |
Tissue factor pathway inhibitor 2 (TFPI2) is a potential serum biomarker for clear cell renal carcinoma
2024-11-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80248-x
PMID:39562727
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研究论文 | 研究评估了组织因子途径抑制剂2（TFPI2）作为透明细胞肾细胞癌（RCC）的潜在血清生物标志物的有效性 | TFPI2作为透明细胞肾细胞癌的潜在血清生物标志物，提供了改进检测和预后评估的途径 | NA | 评估TFPI2作为透明细胞肾细胞癌的生物标志物的有效性 | 透明细胞肾细胞癌患者的血清样本和健康志愿者的血清样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血清 | 肾细胞癌患者和健康志愿者的血清样本 |
| 1413 | 2024-11-26 |
Sample multiplexing for retinal single-cell RNA sequencing
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111250
PMID:39569377
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研究论文 | 本文介绍了一种用于视网膜单细胞RNA测序的样本多重化方法 | 本文提出了一种样本多重化方法，通过使用胆固醇修饰的寡核苷酸对每个样本进行唯一序列条形码标记，从而在生物信息学上解析样本来源 | 本文未详细讨论该方法在其他细胞类型或物种中的适用性 | 研究目的是开发一种能够在单细胞RNA测序中解析样本来源的方法 | 研究对象是视网膜神经节细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 小鼠视网膜样本 |
| 1414 | 2024-11-26 |
Cryptotanshinone alleviates immunosuppression in endometriosis by targeting MDSCs through JAK2/STAT3 pathway
2024-Nov-14, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156227
PMID:39580997
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研究论文 | 研究了Cryptotanshinone通过JAK2/STAT3信号通路减轻子宫内膜异位症中的免疫抑制作用 | 首次证明了Cryptotanshinone通过抑制MDSC的积累和调节MDSC介导的免疫反应，成为治疗子宫内膜异位症的有前途的天然化合物 | NA | 探讨Cryptotanshinone通过JAK2/STAT3信号通路调节MDSC的治疗潜力及其对免疫微环境和子宫内膜异位症病变生长的影响 | 子宫内膜异位症患者及其免疫细胞 | NA | 子宫内膜异位症 | 转录组数据分析、单细胞RNA测序、表面等离子体共振、细胞热位移分析、流式细胞术、免疫荧光、Western blot | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | C57BL/6J子宫内膜异位症小鼠模型、体外骨髓来源的MDSC |
| 1415 | 2024-11-26 |
Actin Dysregulation Induces Neuroendocrine Plasticity and Immune Evasion: A Vulnerability of Small Cell Lung Cancer
2024-Nov-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.15.528365
PMID:36824957
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研究论文 | 研究了CRACD在小细胞肺癌中的作用及其对肿瘤细胞可塑性和免疫逃逸的影响 | 首次揭示了CRACD通过调节肌动蛋白聚合和EZH2介导的H3K27甲基化，影响小细胞肺癌的肿瘤细胞可塑性和免疫逃逸 | 研究主要集中在CRACD和EZH2的作用，未全面探讨其他潜在的调控机制 | 探讨小细胞肺癌中肿瘤细胞可塑性和免疫逃逸的机制 | 小细胞肺癌细胞及其相关基因和蛋白质 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及小细胞肺癌患者肿瘤样本 |
| 1416 | 2024-11-26 |
Cross-tissue organization of myeloid cells in scleroderma and related fibrotic diseases
2024-Nov-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001047
PMID:39171604
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综述 | 本文综述了硬皮病及相关纤维化疾病中髓系细胞在不同组织中的分布情况 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析，提出了一种统一的髓系细胞命名法，并发现了一种新的树突状细胞亚群DC3 | scRNA-Seq研究在髓系细胞类型的命名上存在不一致性 | 探讨硬皮病及相关纤维化疾病中髓系细胞的组织分布和命名统一 | 硬皮病、特发性肺纤维化、COVID-19肺纤维化、骨髓纤维化及肝、肾、心脏纤维化中的髓系细胞 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及多种纤维化疾病的多个组织样本 |
| 1417 | 2024-11-26 |
Single-cell RNA-seq in diabetic foot ulcer wound healing
2024 Nov-Dec, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.13218
PMID:39264020
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究糖尿病足溃疡伤口愈合过程中的细胞亚群、基因和分子 | 首次利用单细胞RNA测序技术深入研究糖尿病足溃疡伤口愈合的分子机制 | NA | 探索糖尿病足溃疡伤口愈合的机制并寻找潜在的治疗靶点 | 糖尿病足溃疡伤口愈合过程中的细胞亚群、基因和分子 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1418 | 2024-11-26 |
The neuroendocrine transition in prostate cancer is dynamic and dependent on ASCL1
2024-Nov, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00838-6
PMID:39394434
|
研究论文 | 本文介绍了一种多功能体内平台，用于研究前列腺癌进展中的神经内分泌谱系转化 | 本文引入了一种新的体内平台，用于研究前列腺癌中的神经内分泌转化，并揭示了ASCL1在其中的关键作用 | 该研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类患者中验证其结果 | 研究前列腺癌中的神经内分泌转化机制及其对治疗结果的影响 | 前列腺癌中的神经内分泌转化过程及其依赖的ASCL1基因 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 多重免疫荧光和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 涉及小鼠前列腺器官样本和人类相关驱动突变样本 |
| 1419 | 2024-11-26 |
Differential chromatin accessibility and transcriptional dynamics define breast cancer subtypes and their lineages
2024-Nov, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00773-6
PMID:39478117
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研究论文 | 研究通过多组学技术和空间转录组学分析，揭示了乳腺癌亚型及其潜在起源细胞的基因表达和染色质可及性的特征联系 | 首次在单细胞水平上分析了乳腺癌亚型及其潜在起源细胞的转录和染色质可及性，并识别了定义基底型和腔型乳腺癌谱系的关键基因 | 研究样本量较小，仅涉及37名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨乳腺癌亚型及其潜在起源细胞的转录网络特征 | 乳腺癌亚型及其潜在起源细胞的基因表达和染色质可及性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学技术、空间转录组学、多重成像 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 61个样本，来自37名乳腺癌患者 |
| 1420 | 2024-11-26 |
Mapping intratumoral myeloid-T cell interactomes at single-cell resolution reveals targets for overcoming checkpoint inhibitor resistance
2024-Oct-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620093
PMID:39554094
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研究论文 | 本文开发了一种计算方法，用于分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）衍生的单细胞分辨率细胞间相互作用图谱，并应用于研究CD40激动剂（CD40ag）如何改变免疫细胞间的对话，特别是在肿瘤模型中与免疫检查点阻断（ICB）联合使用时 | 本文创新性地开发了一种计算方法，能够有效分析单细胞RNA测序数据中的细胞间相互作用，并揭示了CD40ag在改善ICB反应中的作用 | 本文未详细讨论该计算方法在其他类型肿瘤或不同数据集上的适用性和泛化能力 | 研究如何通过分析单细胞RNA测序数据中的细胞间相互作用，揭示CD40ag在克服免疫检查点抑制剂耐药性中的作用 | 研究对象包括肿瘤微环境中的髓系细胞和T细胞，以及它们在CD40ag和ICB治疗下的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |