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当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-12-13 |
Targeting SHCBP1 Inhibits Tumor Progression by Restoring Ciliogenesis in Ductal Carcinoma
2024-Dec-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1095
PMID:39312205
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研究论文 | 本研究揭示了SHCBP1通过调控Rab8 GTPase活性影响中体残余物与中心体的接近，从而抑制导管癌中纤毛发生，并证明靶向SHCBP1可恢复纤毛发生并抑制肿瘤进展 | 首次发现SHCBP1通过调控Rab8 GTPase活性介导中体残余物与中心体接近，从而控制导管癌纤毛发生的新机制 | 研究主要基于动物模型和患者来源异种移植模型，尚未在人体临床试验中验证 | 阐明导管癌中纤毛缺失的机制及其临床意义，开发新的治疗策略 | 导管癌 | 肿瘤生物学 | 导管癌 | 单细胞转录组分析、基因敲除、患者来源异种移植模型 | 转基因小鼠模型、PDX模型 | 转录组数据、临床预后数据 | 大型患者队列及转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2025-12-13 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals the Pseudo-temporal Dynamic Evolution Characteristics of ADSCs to Neuronal Differentiation
2024-Dec-11, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-024-01524-y
PMID:39661257
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了脂肪来源基质细胞向神经元分化的伪时间动态演化特征 | 首次在单细胞分辨率下描绘了ADSCs向神经元分化的连续动态基因表达图谱，并识别出两个不同的细胞状态机制 | 研究仅基于体外诱导模型，未验证体内分化潜力；样本时间点覆盖有限，可能遗漏关键过渡状态 | 解析ADSCs向神经元分化的遗传特征与动态演化过程 | 脂肪来源基质细胞及其在不同诱导时间点（0、1、3、5、6、8小时）的衍生细胞 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病（帕金森病相关） | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析（Monocle2） | 单细胞转录组数据 | 38,453个细胞，涵盖8个时间点组别 | BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析平台 |
| 123 | 2025-12-13 |
Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.10.574997
PMID:38260455
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研究论文 | 本研究通过整合全基因组表观基因组分析、表观基因组编辑及单细胞RNA-seq CRISPR筛选，鉴定了一类响应机械微环境的新型基因组增强子——机械增强子 | 首次系统鉴定并命名了响应细胞外基质硬度的“机械增强子”，并通过表观基因组编辑实现在刚性材料上模拟软材料环境的基因表达模式 | 未明确机械增强子在具体疾病模型中的完整调控网络及其临床转化路径 | 探究机械微环境如何通过表观遗传机制精确调控细胞转录与表型 | 基因组增强子、细胞机械响应通路 | 表观遗传学、细胞力学 | NA | 全基因组表观基因组分析、表观基因组编辑、单细胞RNA-seq CRISPR筛选 | CRISPR筛选模型 | 表观基因组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2025-12-12 |
Scalable spatial single-cell transcriptomics and translatomics in 3D thick tissue blocks
2024-Aug-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.05.606553
PMID:39149316
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研究论文 | 本文开发了Deep-STARmap和Deep-RIBOmap技术，用于在200微米厚的组织块中进行三维空间单细胞转录组和翻译组量化 | 首次实现了在厚组织块（200微米）中进行三维空间单细胞转录组和翻译组分析，突破了现有技术仅限于薄切片（5-20微米）的限制 | NA | 揭示基因在三维组织环境中如何塑造组织结构和功能，以理解健康与疾病状态 | 小鼠大脑组织、人类皮肤癌组织 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间单细胞转录组学、空间单细胞翻译组学、多色荧光蛋白成像 | NA | 图像、转录组数据、翻译组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 125 | 2025-12-11 |
A deep neural network to de-noise single-cell RNA sequencing data
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.20.624552
PMID:39605470
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ZiPo的深度人工神经网络，用于估计单细胞RNA测序数据中的零膨胀率和预测文库大小，以解决测量丢失问题 | ZiPo引入了可调节的零膨胀分布来捕获丢失事件，并采用尺度不变损失项使权重稀疏，从而提高模型的生物可解释性 | 处理时间与细胞数量成正比，可能在大规模数据集上存在计算效率限制 | 开发一种深度神经网络来去噪单细胞RNA测序数据，改善数据分析和细胞类型发现 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度人工神经网络，深度自编码器 | 基因表达数据 | 三个数据集（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 126 | 2025-12-11 |
Longitudinal Multi-omic Immune Profiling Reveals Age-Related Immune Cell Dynamics in Healthy Adults
2024-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.10.612119
PMID:39314416
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研究论文 | 本研究通过纵向多组学免疫分析，揭示了健康成年人中与年龄相关的免疫细胞动态变化 | 结合单细胞RNA测序、蛋白质组学和流式细胞术，对300多名健康成年人进行长期跟踪，构建了包含超过1600万个PBMCs的免疫健康图谱，首次系统揭示了T细胞在衰老过程中独特的转录变化积累 | 研究主要关注外周免疫细胞，未涉及组织特异性免疫变化；样本量虽大但可能无法完全代表所有人群；纵向跟踪时间仅为两年，可能不足以捕捉更长期的衰老效应 | 探究健康免疫系统在生命周期中的基本变化，为年龄相关感染和疾病易感性的干预措施开发提供依据 | 300多名健康成年人，包括96名年轻和老年参与者进行为期两年的年度疫苗接种跟踪 | 免疫学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质组学、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 | 超过300名健康成年人，其中96名进行纵向跟踪，产生超过1600万个外周血单个核细胞（PBMCs）数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2025-12-09 |
Correct stimulation of CD28H arms NK cells against tumor cells
2024-Nov, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350901
PMID:39101623
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研究论文 | 本研究探讨了通过靶向CD28H特异性表位来激活NK细胞，增强其对肿瘤细胞的杀伤活性，并克服HHLA2和HLA-E的抑制信号 | 揭示了靶向CD28H特定表位的单克隆抗体能强烈激活NK细胞的钙流和细胞活性，并首次在透明细胞肾癌中通过scRNA-seq分析发现CD28H NK细胞浸润HHLA2阳性肿瘤 | 研究主要基于体外实验和细胞系模型，缺乏体内动物模型验证；样本量有限，仅涉及透明细胞肾癌的scRNA-seq分析 | 探索CD28H作为NK细胞新型激活靶点在抗肿瘤免疫治疗中的潜力 | NK细胞、造血细胞系、透明细胞肾癌细胞 | 免疫学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量，但涉及透明细胞肾癌细胞的scRNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2025-12-04 |
Clustering single-cell RNA sequencing data via iterative smoothing and self-supervised discriminative embedding
2024-07, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03074-5
PMID:38834657
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研究论文 | 本文提出了一种名为scRISE的深度聚类方法，用于单细胞RNA测序数据，通过迭代平滑和自监督判别嵌入来改善数据表示和聚类质量 | scRISE模型结合了基于图自编码器的迭代平滑模块和具有自适应相似性阈值的自监督判别嵌入模块，以去噪数据并优化聚类 | NA | 解决单细胞RNA测序数据聚类中相似性度量的鲁棒性挑战，以识别细胞类型和细胞间相互作用 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 图自编码器 | 基因表达数据 | 十七个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2025-12-03 |
Transcriptomic Evaluation of a Stress Vulnerability Network Using Single-Cell RNA Sequencing in Mouse Prefrontal Cortex
2024-Dec-01, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2024.05.023
PMID:38866174
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序评估小鼠前额叶皮层中的应激脆弱性网络，揭示了与应激脆弱性相关的细胞类型和基因表达差异 | 首次结合多点在体神经生理学和单细胞RNA测序技术，识别出大脑中潜在应激脆弱性状态涉及的细胞类型和基因 | 研究仅基于小鼠模型，样本量较小（n=12），且性别仅限于C57BL/6品系，可能限制对人类应激脆弱性的直接推广 | 探究应激脆弱性的分子机制，以理解情绪障碍如重度抑郁症的风险因素 | 雄性及雌性C57BL/6小鼠的前额叶皮层细胞 | 神经科学 | 情绪障碍 | 单细胞RNA测序，多点在体神经生理学 | NA | 转录组数据，电生理数据 | 12只C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2025-12-03 |
Nonepithelial Gene Expression Correlates With Symptom Severity in Adults With Eosinophilic Esophagitis
2024-Dec, The journal of allergy and clinical immunology. In practice
DOI:10.1016/j.jaip.2024.05.015
PMID:38768900
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研究论文 | 本研究探讨了嗜酸性粒细胞性食管炎（EoE）患者症状严重程度与非上皮细胞基因表达之间的相关性 | 首次将患者报告的症状指标（EEsAI）与食管非上皮细胞基因表达关联，揭示了成纤维细胞等非上皮细胞在EoE症状严重性中的潜在作用 | 样本量相对有限（146名成人），且仅基于回顾性数据分析，未进行实验验证 | 揭示EoE症状变异的分子机制，探索症状严重程度与食管基因表达的关系 | 146名成人EoE患者，根据食管扩张史分组 | 生物信息学 | 嗜酸性粒细胞性食管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 146名成人EoE患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2025-12-03 |
Spatial Transcriptomics Unravel the Tissue Complexity of Oral Pathogenesis
2024-Dec, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241271934
PMID:39382116
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综述 | 本文综述了空间转录组学在口腔疾病组织复杂性研究中的应用，包括其工作流程、数据分析方法以及在颅面发育和疾病中的具体案例 | 空间转录组学作为一种前沿方法，首次在口腔疾病领域系统性地整合了基因表达与空间信息，揭示了传统方法无法观察到的细胞区域间复杂相互作用 | 本文为综述性文章，未涉及原始实验数据，且空间转录组学技术本身可能存在分辨率限制和数据分析复杂性等挑战 | 探讨空间转录组学在理解口腔疾病组织复杂性和发病机制中的应用潜力 | 颅面区域组织（如颅骨、腭部、唾液腺、舌头、口腔底部、口咽部和牙周组织）以及相关疾病状态（如Sjögren病、口腔鳞状细胞癌、HPV感染、牙周病） | 数字病理学 | 口腔疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2025-12-03 |
Targeting GSDME-mediated macrophage polarization for enhanced antitumor immunity in hepatocellular carcinoma
2024-Dec, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01231-0
PMID:39496854
|
研究论文 | 本研究通过分析肝癌患者样本，发现GSDME通过调控巨噬细胞极化影响抗PD1治疗耐药性，并探索了Eliprodil与抗PD1联合治疗的潜力 | 首次揭示GSDME在肿瘤相关巨噬细胞中通过PDPK1/PI3K-AKT通路促进M2样极化，并发现小分子Eliprodil可阻断该通路，为联合免疫治疗提供新靶点 | 样本量较小（仅9例患者），临床前模型结果需在更大规模临床试验中验证 | 探索肝细胞癌抗PD1治疗耐药机制并开发联合免疫治疗新策略 | 肝细胞癌患者肿瘤组织、肿瘤相关巨噬细胞、CD8+T细胞及小鼠肝癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | RNA测序、单细胞测序、流式细胞术 | NA | 转录组数据、单细胞数据 | 9例接受抗PD1单药治疗的肝细胞癌患者肿瘤组织 | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 133 | 2025-12-03 |
Splicing the Difference: Harnessing the Complexity of the Transcriptome in Hematopoiesis
2024-Dec, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2024.104655
PMID:39393608
|
综述 | 本文综述了转录组复杂性在造血过程中的作用，重点关注可变剪接、相关调控因子及其在血液系统恶性肿瘤中的意义 | 整合了多色流式细胞分选与批量及单细胞测序等前沿技术，系统阐述了可变剪接在造血及血液疾病中的调控机制 | 作为一篇综述文章，未提供原始实验数据，主要基于现有文献进行总结和展望 | 更新关于可变剪接在造血过程中作用的研究进展，阐明剪接因子突变如何导致血液恶性肿瘤 | 造血系统，包括造血干细胞、祖细胞、成熟血细胞及相关血液疾病（如骨髓增生异常综合征） | 自然语言处理 | 血液系统恶性肿瘤 | 多色流式细胞分选，批量测序，单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2025-12-03 |
Nanomaterial-Mediated Reprogramming of Macrophages to Inhibit Refractory Muscle Fibrosis
2024-Dec, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202410368
PMID:39548911
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研究论文 | 本研究开发了一种功能化纳米材料，通过调控巨噬细胞极化来抑制难治性肌肉纤维化 | 利用聚乙烯亚胺功能化的纳米材料捕获细胞游离核酸，通过TLR7/9-NF-κB信号通路调控巨噬细胞表型，从而改变纤维-脂肪生成祖细胞的亚群平衡 | 研究主要关注口面部肌肉纤维化，在其他肌肉类型或组织中的适用性需进一步验证 | 开发治疗难治性肌肉纤维化的新策略 | 巨噬细胞和纤维-脂肪生成祖细胞 | NA | 肌肉纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2025-12-03 |
Age-Related ECM Stiffness Mediates TRAIL Activation in Muscle Stem Cell Differentiation
2024-Dec, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400334
PMID:39601528
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研究论文 | 本研究探讨了年龄相关的细胞外基质（ECM）硬化如何通过TRAIL通路影响肌肉干细胞（MuSC）的分化，揭示了其在肌肉再生障碍中的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和体外基质工程，系统分析了年龄和ECM硬度对MuSC分化的协同影响，并识别出TRAIL通路在年龄相关纤维化群体中的关键作用 | 研究主要基于体外模型和动物实验，人类样本的验证不足；BAPN的长期治疗效果和副作用未充分评估 | 探究年龄相关ECM硬化如何通过分子机制影响肌肉干细胞的分化和功能，以阐明肌肉再生障碍的成因 | 年轻和年老小鼠的肌肉干细胞（MuSCs） | 单细胞组学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 年轻和年老MuSCs在软硬不同基质条件下的四组实验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2025-12-03 |
GSK3β and UCHL3 govern RIPK4 homeostasis via deubiquitination to enhance tumor metastasis in ovarian cancer
2024-06, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03040-1
PMID:38664501
|
研究论文 | 本研究揭示了GSK3β和UCHL3通过去泛素化调控RIPK4稳定性，从而促进卵巢癌转移的新机制 | 首次发现UCHL3作为关键去泛素酶调控RIPK4稳定性，并阐明GSK3β介导的磷酸化增强RIPK4与UCHL3互作，形成促进卵巢癌转移的新通路 | NA | 探究卵巢癌中RIPK4稳定性的调控机制及其在肿瘤转移中的作用 | 卵巢癌组织、细胞系及动物模型 | 肿瘤生物学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、去泛素化分析、磷酸化修饰研究 | NA | 测序数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2025-12-03 |
ScRNA-seq of gastric cancer tissues reveals differences in the immune microenvironment of primary tumors and metastases
2024-05, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03012-5
PMID:38555278
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胃癌组织，揭示了原发肿瘤与转移灶之间免疫微环境的差异 | 首次在单细胞分辨率上系统比较了胃癌原发灶与转移灶的免疫微环境差异，并发现ApoE表达巨噬细胞与不良预后的关联 | 样本量相对有限（46例组织），且未进行长期临床随访验证功能机制 | 探究胃癌原发肿瘤与转移灶之间免疫微环境的差异及其对疾病进展的影响 | 胃癌患者的原发肿瘤组织、癌旁非肿瘤组织及转移灶组织 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 46例胃癌组织（包括原发灶、癌旁组织和转移灶） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2025-12-03 |
ZEB1 controls a lineage-specific transcriptional program essential for melanoma cell state transitions
2024-05, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03010-7
PMID:38519642
|
研究论文 | 本研究通过全基因组分析揭示了转录因子ZEB1在黑色素瘤细胞状态转换中的关键调控作用 | 首次在全基因组层面鉴定ZEB1在黑色素瘤中的转录靶点，并设计了黑色素瘤特异的ZEB1调控网络，结合单细胞空间多组学分析验证其在肿瘤异质性中的作用 | 研究主要基于黑色素瘤模型，在乳腺癌细胞中的比较分析显示谱系特异性，可能限制了结论在其他癌症类型的普适性 | 阐明黑色素瘤细胞可塑性和肿瘤异质性的转录调控机制 | 黑色素瘤细胞模型和人类黑色素瘤样本 | 计算生物学 | 黑色素瘤 | ChIP测序，RNA测序，单细胞RNA测序，空间多组学分析 | NA | 基因组测序数据，转录组数据，单细胞数据 | 未明确具体样本数量，包括黑色素瘤模型和人类黑色素瘤样本 | NA | ChIP-seq，RNA-seq，scRNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 139 | 2025-12-03 |
LPCAT2 inhibits colorectal cancer progression via the PRMT1/SLC7A11 axis
2024-05, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-02996-4
PMID:38605214
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现LPCAT2+肿瘤细胞群恶性程度较低，并阐明LPCAT2通过PRMT1/SLC7A11轴诱导铁死亡抑制结直肠癌进展的分子机制 | 首次在结直肠癌中鉴定出LPCAT2+低恶性细胞群，并揭示LPCAT2通过调控PRMT1乙酰化抑制其核转位，进而下调SLC7A11表达诱导铁死亡的新通路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床样本验证相对有限，且未深入探讨LPCAT2表达异质性的调控机制 | 探究LPCAT2在结直肠癌进展中的功能及分子机制，寻找潜在治疗靶点 | 人类和小鼠结直肠癌组织、结直肠癌细胞系、LPCAT2基因敲除小鼠 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类和小鼠结直肠癌组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 140 | 2025-12-03 |
scATAnno: Automated Cell Type Annotation for single-cell ATAC Sequencing Data
2024-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543296
PMID:37333088
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研究论文 | 本文介绍了scATAnno，一个用于自动注释单细胞ATAC测序数据的Python软件包 | 开发了基于大规模scATAC-seq参考图谱的自动注释工具，无需使用scRNA-seq数据，并整合了KNN和加权距离不确定性评分以提高准确性 | NA | 开发一种自动化工具，用于单细胞ATAC测序数据的细胞类型注释 | 单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌、基底细胞癌 | 单细胞ATAC测序 | KNN | 表观遗传数据 | 多个数据集，包括外周血单核细胞、三阴性乳腺癌和基底细胞癌样本 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |