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当前共找到 7466 篇文献,本页显示第 121 - 140 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
121 2026-09-08
G0 arrest gene patterns to predict the prognosis and drug sensitivity of patients with lung adenocarcinoma
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究基于G0期停滞相关基因构建了肺腺癌患者的预后和药物敏感性预测模型,并验证了其与肿瘤微环境和治疗反应的关系 首次开发了基于G0A相关基因的六基因特征,用于预测肺腺癌患者的生存预后和药物敏感性,并通过多种数据集和实验验证了其可靠性 未提及具体局限性,但可能受限于回顾性数据分析和外部验证数据集的异质性 开发并验证一种基于G0A相关基因的预后信号,以改善肺腺癌患者的预后预测和个性化治疗策略 肺腺癌患者,涉及TCGA-LUAD队列及多个公共转录组数据集(GSE50081, GSE72094, GSE127465, GSE131907, EMTAB6149)中的肿瘤样本和细胞系 基因组学、生物信息学 肺腺癌 批量RNA测序、单细胞RNA测序、实时定量PCR Cox回归模型、Lasso回归模型、列线图 基因表达数据、临床数据、单细胞转录组数据 TCGA-LUAD队列及多个外部数据集,涉及数百至上千例患者样本,具体数量未提及 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
122 2026-09-07
Proteomic Heterogeneity of the Extracellular Matrix Identifies Histologic Subtype-Specific Fibroblast in Gastric Cancer
2024-10, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1
研究论文 该研究通过定量蛋白质组学分析胃癌组织中的脱细胞细胞外基质,揭示了ECM成分的蛋白质组异质性,并识别了与组织学亚型相关的特异性成纤维细胞。 该研究首次将ECM蛋白质组学与单细胞RNA测序结合,识别出PCC-NOS亚型特异性脂肪生成型癌症相关成纤维细胞,并发现ABCA8作为其表面标志物 研究样本量可能有限,且未详细说明其局限性。 探讨胃癌中ECM的蛋白质组异质性及其与组织学亚型和预后的关联,以识别亚型特异性生物标志物。 胃癌组织的ECM蛋白质组分及PCC-NOS亚型特异性成纤维细胞。 蛋白质组学 胃癌 定量蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、肿瘤微阵列分析 NA 蛋白质组学数据、单细胞转录组数据、组织学图像 未提供具体样本数量。 NA 蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA NA
123 2026-09-07
PoweREST: Statistical Power Estimation for Spatial Transcriptomics Experiments to Detect Differentially Expressed Genes Between Two Conditions
2024-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍PoweREST,一个用于空间转录组实验统计功效估计的工具,以检测两种条件下的差异表达基因 首次为空间转录组数据中的差异表达基因检测提供功效计算工具,并支持实验前和初步数据后的功效估计 未提及具体局限性 支持空间转录组实验设计中的功效分析,优化资源利用 空间转录组数据中两种条件下的差异表达基因 生物信息学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Genomics Visium数据
124 2026-09-06
Single-Cell Meta-Analysis Uncovers the Pancreatic Endothelial Cell Transcriptomic Signature and Reveals a Key Role for NKX2-3 in PLVAP Expression
2024-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 该研究通过单细胞元分析揭示了胰腺内皮细胞的转录组特征,并发现NKX2-3在PLVAP表达中的关键作用。 首次定义了跨物种和发育阶段保守的胰腺内皮细胞富集基因签名,并鉴定了一个特化的胰岛毛细血管亚群,同时发现NKX2-3转录因子作为上游调控因子促进PLVAP表达。 由于胰腺消化酶的干扰,难以分离和表征原代胰腺内皮细胞,可能影响验证的全面性;且未提供NKX2-3在体内的功能验证。 阐明胰腺内皮细胞的转录组特征和细胞异质性,并探索关键转录因子NKX2-3在调节内皮屏障基因表达中的作用。 人类和小鼠的胰腺内皮细胞(包括胰岛毛细血管亚群),以及HUVECs(人脐静脉内皮细胞)作为过表达模型。 数字病理学和单细胞转录组学 不适用 单核/单细胞RNA测序,批量RNA测序,空间转录组学,免疫荧光,RNAscope,RT-qPCR 细胞模型(HUVECs过表达)和生物信息学分析 基因表达数据和图像数据 多个公开单细胞数据集(具体样本数量未在题目和摘要中说明) 不适用 单细胞RNA测序,空间转录组学 不适用 不适用
125 2026-09-06
Cross-tissue organization of myeloid cells in scleroderma and related fibrotic diseases
2024-Nov-01, Current opinion in rheumatology IF:5.2Q1
综述 本文通过单细胞RNA测序数据分析,提出跨组织统一髓系细胞命名法,并揭示DC3和SPP1巨噬细胞在不同纤维化疾病中的器官特异性富集模式 提出基于细胞类型定义基因特征的统一髓系细胞命名法,以解决scRNA-Seq研究在树突状细胞、单核细胞和巨噬细胞命名上的不一致性;发现DC3亚群在纤维化皮肤、肺和肝脏中富集,而SPP1巨噬细胞在肺、心和肾纤维化中富集 主要基于公开数据集的分析,缺乏实验验证;跨组织比较受限于不同研究的批次效应和样本异质性 建立跨组织的髓系细胞统一命名法,并阐明其在硬皮病及相关纤维化疾病中的富集模式 硬皮病及相关纤维化疾病(包括特发性肺纤维化、COVID-19肺纤维化、骨髓纤维化、肝、肾和心脏纤维化)中的髓系细胞 生物信息学 硬皮病, 纤维化疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多个公开scRNA-Seq数据集,涵盖多种组织(皮肤、肺、肝、肾、心脏等) NA 单细胞RNA测序 NA NA
126 2026-09-06
A Prime-Boost Vaccination Approach Induces Lung Resident Memory CD8+ T Cells Derived from Central Memory T Cells That Prevent Tumor Lung Metastasis
2024-10-01, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究采用初免-加强疫苗接种策略,通过肌肉注射DNA疫苗初免和鼻内接种减毒流感病毒载体疫苗加强,诱导产生肺组织驻留记忆CD8+ T细胞,并发现其源于中枢记忆T细胞,可有效预防肿瘤肺转移 首次揭示中枢记忆T细胞是疫苗诱导的肺组织驻留记忆CD8+ T细胞的主要前体细胞,并阐明了鼻内加强免疫通过CXCR3依赖性趋化重塑黏膜微环境促进TCM细胞分化为TRM细胞的机制 未明确提及 识别疫苗诱导的肺组织驻留记忆T细胞的来源,以优化预防肿瘤肺转移的疫苗策略 肺CD8+ TRM细胞、中枢记忆T细胞、转移性黑色素瘤和间皮瘤模型 免疫学 肿瘤转移 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确提及 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
127 2026-09-06
Trem2 Agonist Reprograms Foamy Macrophages to Promote Atherosclerotic Plaque Stability-Brief Report
2024-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究探讨Trem2激动剂抗体(AL002a)对动脉粥样硬化小鼠模型中泡沫巨噬细胞的重编程作用及其对斑块稳定性的影响 首次评估Trem2激动剂抗体对动脉粥样硬化斑块稳定性的治疗潜力,并揭示其通过重编程泡沫巨噬细胞转录组(上调氧化磷酸化和胶原基因表达)促进胆固醇外流和胶原沉积的新机制 研究仅在动脉粥样硬化小鼠模型中进行,未涉及人类样本验证;且斑块面积增加可能带来潜在风险,需进一步评估长期安全性 验证Trem2激动剂抗体能否通过增强巨噬细胞存活和减少坏死核心形成来改善动脉粥样硬化斑块稳定性 Ldlr-/-动脉粥样硬化小鼠及其主动脉斑块中的泡沫巨噬细胞 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序,体外细胞实验 NA 单细胞转录组数据,病理图像数据 未明确样本数量,涉及小鼠模型和多组比较 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于全主动脉悬液样本
128 2026-09-06
KRT17high/CXCL8+ Tumor Cells Display Both Classical and Basal Features and Regulate Myeloid Infiltration in the Pancreatic Cancer Microenvironment
2024-Jun-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序等多模态方法,鉴定出胰腺导管腺癌中KRT17高表达/CXCL8+的中间态肿瘤细胞亚型,并揭示其调控骨髓细胞浸润的作用。 首次在单细胞水平上鉴定出兼具经典和基底特征的KRT17high/CXCL8+中间态癌细胞亚型,并证明其通过CXCL8依赖性方式影响局部和系统性免疫微环境。 研究主要基于有限的样本和体外模型,患者来源类器官可能无法完全重现体内复杂的微环境,且纵向血液样本的追踪时间有限。 表征胰腺导管腺癌中中间态癌细胞亚型的特征及其在肿瘤微环境和系统免疫中的作用。 包含18个人类PDAC样本的单细胞RNA测序数据、患者来源的PDAC类器官、匹配的血液和肿瘤样本以及纵向血液样本。 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、血液和肿瘤样本的配对单细胞数据、血浆蛋白质组数据 18个人类PDAC样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
129 2026-09-06
Programmed Death Ligand 1-Expressing Macrophages and Their Protective Role in the Joint During Arthritis
2024-04, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究探讨了程序性死亡配体1(PD-L1)阳性巨噬细胞在关节炎中对关节的保护作用 首次阐明PD-L1+巨噬细胞在关节炎中的保护作用,并发现其兼具促吞噬和抗炎特性,且在人体滑膜中也存在类似细胞 研究主要基于胶原诱导性关节炎小鼠模型,结论是否完全适用于人类关节炎仍需更多验证 探究PD-L1在滑膜中的表达及PD-L1+巨噬细胞在关节炎中的作用机制 胶原诱导性关节炎小鼠模型和人类滑膜组织中的PD-L1+巨噬细胞 免疫学 关节炎 基因敲除小鼠、单细胞RNA测序 NA 基因表达和细胞表型数据 小鼠和人类滑膜样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
130 2026-09-05
Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus
2024-Dec-11, Research square
研究论文 DBiTplus是一种在同一组织切片上整合基于成像和基于测序的空间组学方法,结合空间转录组学和蛋白质成像实现单细胞分辨率细胞分型和基因组规模通路研究 创新点在于DBiTplus将测序为基础的空间转录组学与成像为基础的蛋白质空间图谱相结合,并通过RNaseH保留组织完整性实现高复用蛋白成像,以及开发了用于两种模态数据注册的计算流程 未明确提及局限性 开发一种整合多模态空间组学方法,以同时获取转录组和蛋白质信息,实现单细胞分辨率的细胞分型和基因组规模的生物学通路探索 小鼠胚胎、正常人淋巴结和人淋巴瘤FFPE组织 空间组学 淋巴瘤 空间转录组学、成像蛋白质组学、微流控、CODEX NA 空间转录组数据、蛋白质成像数据、图像 三种组织类型(具体数量未知) NA 空间转录组学、空间蛋白质组学 NA NA
131 2026-09-05
Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus
2024-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍DBiTplus,一种在同一组织切片上整合基于成像和基于测序的空间组学方法,实现单细胞分辨率的细胞分型和全基因组通路分析 将空间转录组学与高多重蛋白成像(CODEX)结合在同一组织切片上,通过RNaseH保留组织完整性,并开发计算流程整合两种模态数据 未提供明确局限性信息,可能需在文中探讨的技术挑战或样本适用性限制 开发一种整合多模态空间组学方法,以同时实现单细胞分辨率的转录组和蛋白组分析,促进细胞异质性理解 小鼠胚胎、正常人类淋巴结、人类淋巴瘤FFPE组织 空间组学 淋巴瘤 空间转录组测序, CODEX蛋白成像, 微流控空间条形码 NA 图像, 测序数据 小鼠胚胎、正常人类淋巴结、人类淋巴瘤FFPE组织(具体数量未提供) NA 空间转录组学, 空间蛋白组学 NA DBiTplus结合DBiT-seq和CODEX技术
132 2026-09-05
SOX10 mediates glioblastoma cell-state plasticity
2024-11, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究分析SOX10介导的胶质母细胞瘤细胞状态可塑性,并基于此设计联合治疗策略 首次证明SOX10低表达驱动胶质母细胞瘤向神经干细胞样侵袭性状态转变,并识别出可靶向的静止期神经干细胞群体,据此提出基于单细胞表型可塑性分析的联合治疗策略 研究主要基于动物模型和细胞系,需进一步验证在人类患者中的适用性 阐明SOX10在胶质母细胞瘤细胞状态可塑性中的作用,并利用该机制设计新型治疗策略 胶质母细胞瘤细胞系、小鼠模型及SOX10敲低肿瘤 基因组学、转录组学 胶质母细胞瘤 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 动物模型和细胞系样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
133 2026-09-05
Deconvolving organogenesis in space and time via spatial transcriptomics in thick tissues
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了3DEEP技术,一种用于厚组织(可达400微米)的空间转录组学方法,并在12小时龄小鼠皮肤中捕获了371个不同发育阶段的毛囊,从而通过分子伪时间序列构建了器官发生的四维图谱 创新点在于3DEEP技术能够分析更厚的组织块,并结合空间转录组学从单一时间点反向解析不同发育阶段的毛囊,从而实现三维和四维的器官发育分析 局限性可能包括对厚组织处理的技术复杂性,以及基因覆盖范围有限(本研究仅分析81个基因) 本研究旨在通过空间转录组学分析厚组织中的毛囊发育,以理解器官发生的时空动态 研究对象为小鼠皮肤中的毛囊,具体包括371个处于不同发育阶段的毛囊 空间转录组学 不适用 空间转录组学、组织透明化 不适用 空间转录组数据(基因表达) 371个毛囊,1毫米皮肤样本来自一只12小时龄小鼠 不适用 空间转录组学 不适用 不适用
134 2026-09-05
Directly selecting cell-type marker genes for single-cell clustering analyses
2024-07-15, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 提出一种名为Festem的统计方法,直接从单细胞RNA测序数据中筛选具有异质性分布、对聚类有信息价值的细胞类型标记基因,以改进下游聚类分析 直接依据异质性分布选择标记基因,而非使用方差或偏差等替代标准,避免了传统方法遗漏重要基因或选择无关基因的问题,并规避了DEG分析的选样偏差 未在摘要中明确提及局限性 开发一种直接从单细胞RNA测序数据中选择细胞类型标记基因的方法,以提高聚类分析的准确性和细胞类型识别能力 单细胞RNA测序数据中的细胞类型标记基因 机器学习 肝内胆管癌 单细胞RNA测序 统计模型 单细胞转录组数据 一个大规模肝内胆管癌数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
135 2026-09-05
Emerging trends in the study of spiralian larvae
2024-07, Evolution & development IF:2.6Q2
综述 本文综述了螺旋幼虫的研究进展,重点关注其前神经系统、纤毛带和后半球等形态特征,并探讨了如何利用现代高通量技术理解其发育与进化 结合比较基因组学、单细胞转录组学和表观基因组学等现代方法,提出新的可测试假说,以揭示螺旋幼虫和生活史进化的机制 文章未提及具体研究中的局限性 总结螺旋幼虫的发育和进化研究,并预测未来利用基因组和单细胞技术将促进对新兴螺旋类群的研究 螺旋动物门(Spiralia)的幼虫,特别是担轮幼虫 进化发育生物学 NA 比较基因组学、单细胞转录组学、表观基因组学 NA 基因组数据、单细胞转录组数据、表观基因组数据 NA NA 单细胞转录组学 NA NA
136 2026-09-05
Heat Inactivation of Nipah Virus for Downstream Single-Cell RNA Sequencing Does Not Interfere with Sample Quality
2024-01-09, Pathogens (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究评估了在单细胞RNA测序流程中加入热处理步骤对灭活尼帕病毒的效果,并确认该步骤不影响样本质量 首次验证在商用微流控单细胞RNA测序平台中,通过在cDNA合成后加入85°C热处理5分钟,可有效灭活BSL-4级别的尼帕病毒,同时保持样本质量和测序结果不受影响 研究仅限于尼帕病毒和特定商用平台,可能不适用于其他BSL-4病原体或不同测序平台 确保在处理BSL-4病原体样本时,单细胞RNA测序流程包含有效的病毒灭活步骤,同时不影响下游分析质量 尼帕病毒(NiV)感染的细胞样本,用于单细胞RNA测序分析 单细胞测序,病毒学 尼帕病毒感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 未明确说明具体样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 商用微流控分区单细胞RNA测序平台,具体配置未明确,但涉及cDNA合成后的热处理步骤
137 2026-09-05
Identification of ligand and receptor interactions in CKD and MASH through the integration of single cell and spatial transcriptomics
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过整合单细胞和空间转录组学数据,识别慢性肾脏病和代谢功能障碍相关脂肪性肝炎中的配体-受体相互作用 建立了整合单细胞和空间转录组数据的分析框架,以揭示细胞特异性配体-受体相互作用,并发现新的潜在治疗靶点 信息不足,未提供具体限制 深入理解CKD和MASH的分子机制,通过整合单细胞和空间转录组学数据识别细胞间的配体-受体相互作用 慢性肾脏病和代谢功能障碍相关脂肪性肝炎患者的人体样本 转录组学 慢性肾脏病,代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 两个人类队列 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
138 2026-09-04
Basic Fibroblast Growth Factor Supports the Function of Limbal Niche Cells via the Wnt/β-Catenin Pathway
2024-11, Journal of ocular pharmacology and therapeutics : the official journal of the Association for Ocular Pharmacology and Therapeutics IF:1.9Q3
研究论文 本文研究了碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)通过Wnt/β-catenin通路对角膜缘微环境细胞(LNC)功能的支持作用及其机制 首次利用单细胞RNA测序分析FGFR亚型及Wnt/β-catenin通路在LNC培养中的作用,并构建三维共培养模型验证bFGF通过该通路促进LNC干性 未提及 探究bFGF对LNC功能的影响及其分子机制 角膜缘微环境细胞(LNC)和成熟角膜上皮细胞(MCEC) 分子生物学 眼表疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
139 2026-09-04
Intestinal newborn regulatory B cell antibodies modulate microbiota communities
2024-10-09, Cell host & microbe IF:20.6Q1
研究论文 研究发现新生儿调节性B细胞通过自分泌IL-10抑制IgM产生,其分泌的抗体可影响早期肠道微生物群落的多样性和成员间的合作,从而促进生命早期微生物组的建立 首次揭示IL-10产生的调节性B细胞通过自分泌IL-10调节IgM产生,并鉴定出肠道nBreg衍生的抗体可靶向早期微生物群落的多种细菌门,为调节性B细胞在新生儿期的功能提供了新见解 尚未明确nBreg抗体影响微生物群落的具体分子机制,且研究仅限于小鼠模型,可能无法完全反映人类情况 探讨新生儿调节性B细胞及其抗体在早期肠道微生物组建立中的作用和机制 新生儿调节性B细胞(nBreg)及其产生的单克隆抗体,以及它们对肠道微生物群落的影响 免疫学,微生物组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单克隆抗体克隆与表征 NA 单细胞转录组数据,抗体序列数据,微生物组组成数据 205个来自肠道nBreg的单克隆抗体,以及来自胎儿和新生儿肠道组织的细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
140 2026-09-04
BCAA-producing Clostridium symbiosum promotes colorectal tumorigenesis through the modulation of host cholesterol metabolism
2024-09-11, Cell host & microbe IF:20.6Q1
研究论文 本文发现共生梭菌在结直肠癌肿瘤组织中富集,并通过产生支链氨基酸激活刺猬信号通路,促进宿主胆固醇合成,从而推动结直肠肿瘤发生。 首次揭示共生梭菌通过支链氨基酸调控胆固醇代谢,激活Sonic hedgehog信号,促进结肠干细胞增殖和肿瘤干性,为结直肠癌的预测和防治提供新靶点。 主要基于小鼠模型和体外实验,人体中的机制验证尚不充分;饮食干预和他汀类药物的效果需进一步临床验证。 揭示共生梭菌在结直肠肿瘤发生中的作用及其分子机制,并探索潜在的治疗靶点。 结直肠癌患者肿瘤组织、结直肠腺瘤复发患者、多种小鼠模型、结肠干细胞。 微生物组学 结直肠癌 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 涉及结直肠癌患者肿瘤组织样本、结直肠腺瘤复发患者样本,以及多种小鼠模型(具体数量未在摘要中提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'试剂盒用于单细胞转录组分析
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