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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-03-06 |
Quantum Dots-caused Retinal Degeneration in Zebrafish Regulated by Ferroptosis and Mitophagy in Retinal Pigment Epithelial Cells through Inhibiting Spliceosome
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406343
PMID:39420512
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研究论文 | 本研究揭示了InP/ZnS量子点通过诱导视网膜色素上皮细胞铁死亡和线粒体自噬,导致斑马鱼视网膜变性的机制 | 首次发现量子点通过抑制剪接因子prpf8,导致gpx4b mRNA未剪接,进而引发铁死亡和线粒体自噬,最终造成视网膜损伤 | 研究仅在斑马鱼模型中进行,尚未在哺乳动物或人体中验证 | 阐明典型金属量子点对视网膜的影响及其分子机制 | 斑马鱼视网膜 | 单细胞组学 | 视网膜变性 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | RNA测序数据,组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2026-03-06 |
Pericytes Modulate Third-Generation Tyrosine Kinase Inhibitor Sensitivity in EGFR-Mutated Lung Cancer Cells Through IL32-β5-Integrin Paracrine Signaling
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405130
PMID:39435643
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研究论文 | 本研究揭示了周细胞通过IL32-β5-整合素旁分泌信号通路调节EGFR突变肺癌细胞对第三代酪氨酸激酶抑制剂敏感性的机制 | 首次发现周细胞通过分泌IL32激活β5-整合素-Src-Akt通路,从而影响EGFR突变肺癌细胞的TKI敏感性,并揭示了YY1信号在此过程中的调控作用 | 动物模型中周细胞对TKI疗效的影响独立于血管功能,但人体内血管功能的潜在影响仍需进一步研究 | 探究EGFR突变肺癌患者对第三代TKI反应受限的机制,特别是周细胞在其中的作用 | EGFR突变肺癌细胞、患者来源的周细胞、肿瘤组织样本、动物模型 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫染色、共培养实验、条件培养基实验、动物模型 | NA | RNA测序数据、免疫染色图像、细胞实验数据、动物实验数据 | EGFR突变患者来源的周细胞和肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2026-03-06 |
Hepatocyte-Targeted Lipid Nanoparticle Delivery of HERC2 Plasmid Controls Drug-Induced Hepatotoxicity by Limiting β-Catenin-Regulated CYP2E1 Expression
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401633
PMID:39440550
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研究论文 | 本研究揭示了HERC2通过调控β-catenin介导的CYP2E1表达,在药物性肝损伤中发挥保护作用,并开发了靶向肝细胞的脂质纳米颗粒递送HERC2质粒的治疗策略 | 首次阐明了HERC2在药物性肝损伤中的保护性作用机制,即通过促进β-catenin泛素化来负调控CYP2E1表达,并创新性地采用肝细胞靶向脂质纳米颗粒递送HERC2质粒进行干预 | 研究主要基于APAP诱导的肝损伤模型,在其他类型DILI中的普适性有待验证;脂质纳米颗粒递送系统的长期安全性和体内稳定性需进一步评估 | 探究HERC2在药物性肝损伤中的作用机制并开发靶向治疗策略 | 肝细胞、HERC2基因、β-catenin蛋白、CYP2E1酶 | 分子生物学与药理学 | 药物性肝损伤 | 单细胞RNA测序、脂质纳米颗粒递送、质粒转染 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 肝细胞特异性HERC2缺陷小鼠模型及对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2026-03-06 |
Exercise Induced Endothelial Mesenchymal Transition (EndMT) Facilitates Meniscal Fibrocartilage Regeneration
2024-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403788
PMID:39344749
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研究论文 | 本研究探讨了运动诱导的内皮间质转化(EndMT)在促进半月板纤维软骨再生中的作用,并开发了一种手持式生物打印系统用于术中制造多孔半月板支架 | 首次证明EndMT在半月板再生中的贡献,并开发了结合术后规律运动刺激的多孔支架移植策略,简化了支架制造过程 | 研究基于绵羊模型,临床转化效果需进一步验证,且未详细探讨长期安全性和潜在副作用 | 开发一种有效的半月板再生转化策略,以改善半月板切除后的治疗 | 半月板纤维软骨组织,绵羊模型中的半月板再生过程 | 组织工程与再生医学 | 骨科疾病(半月板损伤) | 单细胞RNA测序,免疫荧光共染色分析 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 绵羊模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-03-01 |
Single-cell RNA sequencing data identify a conserved population of metallothionein-expressing macrophages that may be ubiquitous in vital human organs
2024-Oct, Clinical and translational discovery
DOI:10.1002/ctd2.348
PMID:40018369
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2026-03-06 |
Spatial multi-omics reveal intratumoral humoral immunity niches associated with tertiary lymphoid structures in pancreatic cancer immunotherapy pathologic responders
2024-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.22.613714
PMID:39386736
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研究论文 | 本研究通过空间多组学分析揭示了胰腺癌免疫治疗病理应答者中三级淋巴结构相关的瘤内体液免疫微环境 | 首次结合机器学习H&E图像分类模型和无监督基因表达矩阵分解方法,系统表征了三级淋巴结构微环境中的细胞状态,并发现了与PDAC患者生存改善显著相关的TLS特异性空间基因表达特征 | 样本量相对较小(仅26个PDAC肿瘤),且研究局限于接受联合免疫治疗的患者群体 | 探究胰腺癌中三级淋巴结构在肿瘤微环境中的空间关系及其在免疫治疗中的作用机制 | 接受联合免疫治疗的胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、BCR测序 | 机器学习图像分类模型、无监督基因表达矩阵分解方法 | H&E图像、空间转录组数据、空间蛋白质组数据 | 26个PDAC肿瘤样本 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, BCR测序 | NA | NA |
| 127 | 2026-03-06 |
Machine Learning Uncovers Vascular Endothelial Cell Identity Genes by Expression Regulation Features in Single Cells
2024-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.27.609808
PMID:39253493
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SCIG的机器学习方法,用于在单细胞水平上识别细胞身份基因 | SCIG方法无需与其他细胞进行比较,仅利用基因序列特征和单细胞RNA-seq表达信息即可识别细胞身份基因,并发现组织微环境对细胞身份精细化至关重要 | NA | 开发一种识别细胞身份基因的计算方法,以促进对细胞分化、发育和再生医学的理解 | 血管内皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据、遗传序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2026-03-06 |
Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates
2024-Jun, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01831-y
PMID:38698087
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了抗原特异性浆细胞前体的发育动态和基因组编程,特别是长寿命骨髓浆细胞的生成机制 | 发现了浆细胞前体的双相生成模式,并识别出一个新的浆细胞过渡状态,该状态依赖于TIGIT的可诱导表达进行克隆扩增 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证,且样本规模可能有限 | 阐明浆细胞前体的发育动力学和基因组编程,特别是长寿命浆细胞的生成机制 | 小鼠模型中的抗原特异性浆细胞前体,包括脾脏和骨髓中的B细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,B细胞抗原受体测序 | NA | 单细胞转录组数据,B细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2026-03-06 |
6-Formylindolo[3,2-b]carbazole, a potent ligand for the aryl hydrocarbon receptor, attenuates concanavalin-induced hepatitis by limiting T-cell activation and infiltration of proinflammatory CD11b+ Kupffer cells
2024-05-29, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae018
PMID:38366630
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研究论文 | 本研究探讨了强效芳烃受体激动剂FICZ在刀豆蛋白A诱导的小鼠自身免疫性肝炎模型中的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测序技术,系统揭示了FICZ通过限制CD3+ T细胞活化和CD11b+ Kupffer细胞浸润减轻肝炎的分子机制 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人体中验证;机制研究主要聚焦于免疫细胞亚群,对肝实质细胞的直接作用未充分探讨 | 阐明芳烃受体激活在自身免疫性肝炎中的保护作用机制 | 刀豆蛋白A诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序, 转座酶可及染色质测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未明确说明样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 130 | 2026-03-06 |
Integrating spatial transcriptomics and bulk RNA-seq: predicting gene expression with enhanced resolution through graph attention networks
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae316
PMID:38960406
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研究论文 | 本研究提出了一种名为STGAT的新方法,利用图注意力网络从全切片图像和批量RNA-seq数据中预测基因表达,以提高空间分辨率 | STGAT首次结合图注意力网络来推断空间转录组学中的点级基因表达,并在乳腺癌数据中展示了优于现有方法的性能 | 方法依赖于可用的空间转录组学数据进行训练,在数据有限的情况下可能影响泛化能力 | 开发从WSI和批量RNA-seq数据中预测点级基因表达的方法,以重新分析大规模队列研究并发现新的生物标志物 | 乳腺癌组织样本,包括空间转录组学数据和TCGA数据集 | 计算机视觉 | 乳腺癌 | 空间转录组学,批量RNA-seq | 图注意力网络 | 图像,文本 | 两个乳腺癌空间转录组学数据集和TCGA乳腺癌数据集 | NA | 空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2026-03-06 |
Human IL-6 fosters long-term engraftment of patient-derived disease-driving myeloma cells in immunodeficient mice
2024-May-07, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177300
PMID:38713510
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研究论文 | 本文介绍了一种基于人IL-6转基因NSG小鼠的异种移植模型,用于支持患者来源的多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病的长期植入和研究 | 开发了人IL-6转基因NSG小鼠模型,首次可靠地支持恶性及癌前人类浆细胞的植入,包括从多种浆细胞疾病患者中获取的细胞 | 模型依赖于免疫缺陷小鼠,可能无法完全模拟人类免疫系统与骨髓瘤的相互作用,且样本来源和规模可能有限 | 建立一种有效的患者来源异种移植模型,用于多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病的研究和临床前药物开发 | 患者来源的恶性及癌前人类浆细胞,包括来自未确定意义的单克隆丙种球蛋白病、复发前后多发性骨髓瘤、浆细胞白血病和淀粉样轻链淀粉样变性患者的细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 异种移植模型 | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2026-03-06 |
Technical optimization of spatially resolved single-cell transcriptomic datasets to study clinical liver disease
2024-02-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53993-2
PMID:38351241
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单核RNA测序技术,优化了临床肝病样本的处理和分析流程,生成了空间分辨的单细胞数据集 | 首次结合空间转录组学和单核RNA测序,在肝纤维化样本中建立了组织处理、数据分析和细胞互作评估的优化框架 | 样本量有限,空间转录组学尚未达到单细胞分辨率,且组织保存技术对数据有影响 | 优化空间分辨单细胞转录组数据集的技术流程,以研究临床肝病 | 来自组织学正常或晚期纤维化患者的匹配肝样本 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 匹配的肝样本(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2026-03-06 |
TFAP2 paralogs regulate midfacial development in part through a conserved ALX genetic pathway
2024-01-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202095
PMID:38063857
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研究论文 | 本文探讨了TFAP2同源基因通过调控ALX基因表达在小鼠和斑马鱼中面部发育中的作用 | 揭示了TFAP2家族成员通过直接激活ALX转录因子基因表达来调控脊椎动物中面部发育的保守遗传通路 | 研究主要基于小鼠和斑马鱼模型,人类中面部发育的保守性需进一步验证 | 探究中面部发育中基因调控网络的连接与激活机制 | 小鼠和斑马鱼的颅神经嵴细胞 | 发育生物学 | 面部发育异常 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2026-03-05 |
snRNA-seq of long-preserved FFPE samples from colorectal liver metastasis lesions with diverse prognoses
2024-12-26, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-04323-8
PMID:39725704
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研究论文 | 本研究利用snRandom-seq技术对长期保存的FFPE结直肠癌肝转移样本进行单核RNA测序,以探索预后差异的潜在影响因素 | 首次在保存至少三年(多数超过五年)的FFPE样本中成功应用单核RNA测序技术,克服了长期保存导致的RNA降解挑战 | 样本量相对有限(18例),且仅针对结直肠癌肝转移,可能限制了结果的普适性 | 探究结直肠癌肝转移患者预后差异的细胞异质性基础 | 结直肠癌肝转移患者的长期保存FFPE组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例结直肠癌肝转移病例的多个病灶样本,共82,285个细胞 | NA | 单核RNA-seq | snRandom-seq | 专门针对FFPE样本的单核RNA测序技术 |
| 135 | 2026-03-05 |
Molecular Lineages and Spatial Distributions of Subplate Neurons in the Human Fetal Cerebral Cortex
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407137
PMID:39495628
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序,揭示了人类胎儿大脑皮层中底板神经元的分子起源、谱系特化和空间分布特征 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,系统描绘了人类胎儿大脑皮层底板神经元的分子轨迹和空间景观,并识别了人类特异性基因和细胞外基质基因在其中的稳定表达模式 | 研究仅覆盖妊娠10至25周的胎儿样本,未涉及更早期或更晚期的发育阶段,且样本量有限 | 探究人类胎儿大脑皮层中底板神经元的起源、发育谱系及其在皮层神经发生和早期结构折叠中的作用 | 人类胎儿大脑皮层中的底板神经元 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 妊娠10至25周的人类胎儿大脑皮层样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 136 | 2026-03-05 |
Isolation and Comprehensive Analysis of Cochlear Tissue-Derived Small Extracellular Vesicles
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408964
PMID:39497619
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研究论文 | 本研究评估了三种耳蜗组织消化和耳蜗组织来源的小细胞外囊泡(CDsEV)分离方法,首次提出使用胶原酶D和DNase I结合蔗糖密度梯度离心作为最佳分离策略,并全面分析了CDsEV的内容物和细胞来源 | 首次提出并验证了使用胶原酶D和DNase I结合蔗糖密度梯度离心作为耳蜗组织来源小细胞外囊泡(CDsEV)的最佳分离方法,并首次通过单CDsEV测序与单细胞RNA测序数据的联合分析来追踪CDsEV的细胞来源 | NA | 评估耳蜗组织来源小细胞外囊泡(CDsEV)的分离方法,并全面分析其内容物(miRNA和蛋白质)及细胞来源,以增强对耳蜗内CDsEV功能的理解 | 耳蜗组织来源的小细胞外囊泡(CDsEV) | NA | NA | 小RNA测序, 蛋白质组学, 单CDsEV测序, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2026-03-05 |
Sirtuin1 Suppresses Calcium Oxalate Nephropathy via Inhibition of Renal Proximal Tubular Cell Ferroptosis Through PGC-1α-mediated Transcriptional Coactivation
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408945
PMID:39498889
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了Sirtuin1通过PGC-1α介导的转录共激活抑制肾近端小管细胞铁死亡,从而减轻草酸钙晶体诱导的肾损伤的机制 | 首次在草酸钙肾病模型中应用单细胞转录组测序技术,并揭示了Sirt1/PGC-1α/NRF2/GPX4信号轴在调控肾小管细胞铁死亡中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体样本或临床试验中得到验证 | 探究草酸钙晶体诱导肾损伤的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 草酸钙肾病小鼠模型的肾脏样本 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 草酸钙肾病小鼠的肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2026-03-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Pathological Processes and Crucial Targets for Vascular Endothelial Injury in Diabetic Hearts
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405543
PMID:39475009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了糖尿病心脏中血管内皮损伤的病理过程和关键调控靶点 | 首次在糖尿病小鼠心脏组织中构建单细胞转录图谱,识别了内皮细胞异质性并发现关键转录因子Ets1的保护作用 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且病理阶段覆盖可能有限 | 探究糖尿病心脏血管内皮损伤的机制和细胞异质性 | 瘦素受体敲除(db/db)糖尿病小鼠的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个病理阶段的db/db糖尿病小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 139 | 2026-03-05 |
AIP1 Regulates Ocular Angiogenesis Via NLRP12-ASC-Caspase-8 Inflammasome-Mediated Endothelial Pyroptosis
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405834
PMID:39527457
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序,在氧诱导视网膜病变模型中,鉴定出血管内皮细胞特异性抗血管生成因子AIP1,并揭示其通过抑制NLRP12-ASC-caspase-8炎症小体介导的内皮细胞焦亡来调控病理性眼内血管生成 | 首次鉴定出AIP1作为血管内皮细胞特异性抗血管生成因子,并揭示了一个新的非经典炎症小体NLRP12-ASC-caspase-8在介导内皮细胞焦亡和促进视网膜新生血管形成中的作用机制 | NA | 探究炎症调控病理性眼内血管生成的分子机制 | 血管内皮细胞、氧诱导视网膜病变模型 | NA | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 140 | 2026-03-05 |
Spatiotemporal Molecular Architecture of Lineage Allocation and Cellular Organization in Tooth Morphogenesis
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403627
PMID:39535354
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组和单细胞RNA测序,描述了牙齿形态发生中谱系分配和细胞组织的高分辨率全基因组分子模式 | 发现牙齿形态发生中88%的谱系物种在初始牙蕾中已出现,而非传统认为的顺序出现;揭示了牙乳头的一种先前未被识别的萌芽样模式,以及釉质结在时空中的连续分化层次;建立了指导牙齿形态发生的调控网络,涉及机械转导信号 | NA | 研究牙齿形态发生中的时空分子架构,包括谱系分配和细胞组织 | 牙齿形态发生过程中的细胞和组织 | 数字病理学 | 牙齿发育异常 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |