单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 1361 - 1380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1361 | 2026-03-02 |
Single-cell signatures identify microenvironment factors in tumors associated with patient outcomes
2024-Jun-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100799
PMID:38889686
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scBeacon的工具，用于通过整合和聚类多个单细胞RNA测序数据集来推导细胞类型特征，以解卷积批量肿瘤样本中的细胞组成，并在TCGA队列中识别与患者预后相关的肿瘤微环境因素 | 开发了scBeacon工具，通过整合多个scRNA-seq数据集来提取细胞类型特征，用于解卷积无关的批量肿瘤数据集，从而揭示传统癌症分型方法无法识别的内在肿瘤细胞特性 | NA | 识别肿瘤微环境中的细胞和分子特征，以关联患者预后 | 肿瘤及其微环境中的细胞组分 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，批量肿瘤样本数据 | TCGA队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1362 | 2026-03-02 |
Status of single-cell RNA sequencing for reproductive toxicology in zebrafish and the transcriptomic trade-off
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100463
PMID:38846809
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在斑马鱼生殖毒理学中的应用现状及其与传统方法的权衡 | 将单细胞RNA测序这一创新技术引入斑马鱼生殖毒理学领域，提供细胞水平的转录组视角 | 单细胞RNA测序在生殖毒理学中仍属未充分利用的技术，且与传统方法存在权衡需考虑 | 探索单细胞RNA测序在生殖毒理学，特别是斑马鱼模型中的应用潜力 | 斑马鱼性腺组织 | 生殖毒理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1363 | 2026-03-02 |
Effects of SPI1-mediated transcriptome remodeling on Alzheimer's disease-related phenotypes in mouse models of Aβ amyloidosis
2024-May-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48484-x
PMID:38734693
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研究论文 | 本研究通过在小鼠模型中调控SPI1表达，探讨其对阿尔茨海默病相关表型的影响 | 首次在Aβ淀粉样变性小鼠模型中系统评估SPI1表达水平变化对AD病理的调控作用，并揭示其通过免疫反应和补体系统等通路发挥作用的机制 | 研究基于小鼠模型，结果向人类AD治疗的转化仍需进一步验证 | 探究SPI1表达调控对阿尔茨海默病发病机制的影响 | Spi1敲低和过表达的小鼠模型 | NA | 阿尔茨海默病 | 靶向转录组学、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1364 | 2026-03-02 |
Peripheral HMGB1 is linked to O3 pathology of disease-associated astrocytes and amyloid
2024-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.13825
PMID:38624088
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研究论文 | 本研究探讨了臭氧暴露如何通过肺-脑轴影响阿尔茨海默病病理，特别是疾病相关星形胶质细胞和淀粉样斑块的作用 | 首次揭示了外周髓系细胞HMGB1在调节臭氧诱导的疾病相关星形胶质细胞表型中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需进一步验证 | 阐明空气污染物臭氧通过肺-脑轴影响阿尔茨海默病病理的机制 | 5xFAD转基因小鼠和Hmgb1fl/fl LysM-Cre+基因敲除小鼠 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学、蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 未明确说明样本数量，使用转基因小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1365 | 2026-03-02 |
Bento: a toolkit for subcellular analysis of spatial transcriptomics data
2024-04-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03217-7
PMID:38566187
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研究论文 | 本文介绍了Bento，一个用于亚细胞尺度空间转录组数据分析的Python工具包 | Bento利用单分子信息，首次实现了亚细胞尺度的空间分析，突破了现有方法仅限于多细胞尺度的限制 | NA | 开发一个工具包，用于在亚细胞尺度分析空间转录组数据 | 空间转录组数据，包括MERFISH、seqFISH+、Molecular Cartography和Xenium数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 分子坐标和分割边界数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1366 | 2026-03-02 |
Negative binomial mixture model for identification of noise in antibody-antigen specificity predictions from single-cell data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae170
PMID:39659592
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研究论文 | 本文提出了一种使用负二项混合模型对LIBRA-seq单细胞数据进行去噪的方法，以改进抗体-抗原特异性预测 | 通过负二项混合模型将抗原计数聚类为信号和噪声成分，为LIBRA-seq数据提供了一种数据驱动的去噪方法 | NA | 提高单细胞B细胞受体测序数据中抗原结合预测的准确性，以支持抗体发现和机器学习应用 | LIBRA-seq单细胞B细胞受体测序数据 | 机器学习 | NA | LIBRA-seq | 负二项混合模型 | 单细胞测序数据 | 来自九个供体的LIBRA-seq实验数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1367 | 2026-03-01 |
Elevated Shear Stress Modulates Heterogenous Cellular Subpopulations to Induce Vascular Remodeling
2024-12, Tissue engineering. Part A
DOI:10.1089/ten.TEA.2023.0362
PMID:38753711
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研究论文 | 本研究通过动物模型、单细胞RNA测序和组织病理学方法，探究了高剪切应力如何通过调控异质性细胞亚群诱导血管重塑 | 首次在单细胞分辨率下全面研究了高剪切应力诱导血管重塑的分子机制，并精确操控血流以表征所有重要的细胞亚群 | 研究基于大鼠动物模型，结果向人类临床转化的有效性有待进一步验证 | 探究高剪切应力诱导血管重塑的分子机制，以寻找预防动静脉瘘失败的新疗法 | 大鼠隐静脉中的细胞亚群，特别是内皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，组织病理学 | NA | 单细胞转录组数据，组织病理学图像 | 大鼠隐静脉样本（高剪切应力组与无高剪切应力对照组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1368 | 2026-03-01 |
Loss of NLRP6 increases the severity of kidney fibrosis
2024-09, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31347
PMID:38934623
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研究论文 | 本研究探讨了NLRP6在慢性肾病纤维化中的作用，发现其缺失会加剧肾脏炎症和纤维化 | 首次揭示了NLRP6在肾脏纤维化中的保护作用，并阐明了其通过p38 MAPK通路调节TGF-β1和Klotho表达的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞培养，人类临床样本验证有限，且未深入探讨NLRP6在其他肾脏细胞类型中的功能 | 探究NLRP6在慢性肾病纤维化中的功能和分子机制 | 野生型和Nlrp6缺陷小鼠、肾小管细胞培养物、人类肾脏转录组数据库 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组测序、基因表达分析、细胞培养 | NA | 转录组数据、基因表达数据 | 小鼠模型和细胞培养样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1369 | 2026-02-28 |
Single-cell profiling of the amphioxus digestive tract reveals conservation of endocrine cells in chordates
2024-12-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adq0702
PMID:39705360
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了文昌鱼消化道的细胞特征，包括其分段结构和细胞簇多样性，并强调了内分泌样细胞的保守性 | 首次在文昌鱼消化道中发现并描述了三种分泌胰岛素样、胰高血糖素样和生长抑素样肽的内分泌样细胞，揭示了脊椎动物消化系统进化的关键线索 | 研究基于模型生物文昌鱼，可能不完全代表所有脊椎动物的进化过程，且功能验证仅限于特定基因敲除线 | 探索脊椎动物消化系统的进化起源，通过分析原始脊索动物文昌鱼的消化道细胞特征 | 文昌鱼（amphioxus）的消化道组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，批量组织测序，基因敲除 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1370 | 2026-02-28 |
Chemokine expression profile of an innate granuloma
2024-Nov-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96425
PMID:39541153
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析先天免疫系统在肝脏中形成肉芽肿过程中的趋化因子表达谱 | 首次在先天免疫肉芽肿模型中系统研究CC和CXC趋化因子及其受体的时空动态表达模式 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；仅关注CCR2在单核细胞来源巨噬细胞中的作用，未全面探讨其他趋化因子受体 | 阐明先天免疫肉芽肿形成过程中趋化因子如何指导免疫细胞分层聚集 | 小鼠肝脏中的先天免疫肉芽肿 | 空间转录组学 | 感染性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1371 | 2026-02-28 |
A cell atlas of the adult female Aedes aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing
2024-06-05, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03432-8
PMID:38839790
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，构建了成年雌性埃及伊蚊中肠的细胞图谱 | 首次建立了埃及伊蚊中肠单细胞分离与RNA测序的方案，并系统注释了其细胞类型，为在单细胞水平研究虫媒病毒与中肠的相互作用提供了基础 | 研究未直接应用于病毒-中肠相互作用的实验验证，且为新建立的方法，其广泛适用性有待进一步验证 | 构建埃及伊蚊中肠的单细胞转录组图谱，以支持后续在单细胞水平研究虫媒病毒感染机制 | 成年雌性埃及伊蚊的中肠组织 | 单细胞组学 | 虫媒病毒感染（如登革热、寨卡病毒等） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，研究对象为成年雌性埃及伊蚊中肠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1372 | 2026-02-28 |
Airway injury induces alveolar epithelial and mesenchymal responses mediated by macrophages
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.02.587596
PMID:38617297
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探索了气道特异性上皮损伤如何引发远端肺泡、免疫和间质细胞的广泛反应 | 揭示了气道损伤通过肺泡巨噬细胞介导的Osteopontin上调，诱导远端肺泡II型细胞增殖和新型间质细胞群MANC2的动态变化 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证，且未深入探讨长期疾病发展机制 | 探究气道损伤对远端肺组织细胞反应的影响机制 | 小鼠模型中的气道和肺泡组织细胞 | 单细胞转录组学 | 肺损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1373 | 2026-02-28 |
Single-cell transcriptome analysis reveals tumoral microenvironment heterogenicity and hypervascularization in human carotid body tumor
2024-04, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31175
PMID:38214142
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人颈动脉体肿瘤，揭示了其微环境异质性和高血管化特征 | 首次对颈动脉体肿瘤进行单细胞转录组分析，识别了16种细胞群并阐明了内皮细胞、巨噬细胞和神经元细胞在肿瘤形成中的新机制 | NA | 定义导致颈动脉体肿瘤高血管化和慢性增生的细胞类型 | 人颈动脉体肿瘤样本 | 数字病理学 | 颈动脉体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1374 | 2026-02-28 |
Sirtuin 6 ameliorates bleomycin-induced pulmonary fibrosis via activation of lipid catabolism
2024-03, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31027
PMID:37099691
|
研究论文 | 本文探讨了Sirtuin 6通过激活脂质分解代谢改善博来霉素诱导的肺纤维化的机制 | 揭示了SIRT6通过PPARα介导的脂质分解代谢在肺纤维化中的保护作用，为治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类临床相关性需进一步验证 | 探究SIRT6在肺纤维化中的作用机制及潜在治疗策略 | 人类肺组织、小鼠模型、肺泡上皮细胞 | 分子生物学 | 肺纤维化 | 单细胞测序、高通量测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1375 | 2026-02-27 |
Single cell and TCR analysis of immune cells from AAV gene therapy-dosed Duchenne muscular dystrophy patients
2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101349
PMID:39524974
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和T细胞受体测序，分析了接受AAV基因治疗的杜氏肌营养不良症患者治疗前后的外周血单个核细胞，以探究免疫反应机制 | 首次在AAV基因治疗临床试验中结合单细胞转录组和TCR测序，揭示了治疗后T细胞干扰素反应基因的诱导以及特定TCR克隆的扩增，并发现部分扩增克隆与既往疱疹病毒感染相关 | 样本量较小（仅5名参与者），且仅有一例发生血栓性微血管病，限制了统计效力与普遍性结论的得出 | 探究高剂量AAV基因治疗在杜氏肌营养不良症患者中引发的免疫反应机制，特别是血栓性微血管病发生的潜在原因 | 接受AAV基因治疗的杜氏肌营养不良症患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据，TCR序列数据 | 5名患者治疗前后的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1376 | 2026-02-27 |
The IL-1β inhibitor canakinumab in previously treated lower-risk myelodysplastic syndromes: a phase 2 clinical trial
2024-11-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54290-2
PMID:39537648
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研究论文 | 本研究是一项II期非随机单臂临床试验，评估IL-1β抑制剂卡那单抗在先前治疗过的低风险骨髓增生异常综合征患者中的安全性和疗效 | 首次在低风险MDS患者中评估IL-1β抑制剂卡那单抗的临床活性，并利用单细胞RNA测序分析揭示其作用机制与遗传复杂性的关联 | 样本量较小（25例患者），且为非随机单臂设计，可能限制结果的普遍性和因果推断 | 评估靶向IL-1β信号通路是否能挽救MDS患者的无效红细胞生成 | 先前治疗过的低风险骨髓增生异常综合征患者 | 数字病理学 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 25例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1377 | 2026-02-27 |
MerTK+ macrophages promote melanoma progression and immunotherapy resistance through AhR-ALKAL1 activation
2024-10-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado8366
PMID:39365866
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序识别了表达高水平MerTK的巨噬细胞亚群，揭示了其在黑色素瘤进展和免疫治疗耐药中的作用机制 | 首次发现AhR-ALKAL1通路激活驱动MerTK+巨噬细胞的免疫抑制表型极化，并开发了靶向递送AhR拮抗剂的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；靶向递送系统的临床转化潜力需进一步评估 | 探究巨噬细胞异质性在黑色素瘤微环境中的调控机制及免疫治疗耐药成因 | 黑色素瘤微环境中的MerTK+巨噬细胞亚群 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量（基于小鼠模型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1378 | 2026-02-27 |
SpaTopic: A statistical learning framework for exploring tumor spatial architecture from spatially resolved transcriptomic data
2024-09-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp4942
PMID:39331720
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaTopic的统计学习框架，用于从空间分辨转录组数据中探索肿瘤的空间结构 | SpaTopic通过整合单细胞转录组学和空间分辨转录组数据，协调spot聚类和细胞类型反卷积，利用主题建模将肿瘤微环境分层为具有一致细胞组织的空间域，提高了空间架构注释的性能 | NA | 开发一个统计学习框架，以探索和解释肿瘤空间分辨转录组数据中的空间架构 | 肿瘤组织及其微环境 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间分辨转录组学，单细胞转录组学 | 主题建模 | 空间分辨转录组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间分辨转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1379 | 2026-02-27 |
Chemically programmed metabolism drives a superior cell fitness for cartilage regeneration
2024-09-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp4408
PMID:39259800
|
研究论文 | 本研究通过药物筛选发现化合物FPH2能增强人软骨细胞的适应性，促进关节软骨再生，并揭示其通过抑制肉碱棕榈酰转移酶I和优化代谢稳态的机制 | 首次发现FPH2能诱导软骨细胞进入“超级适应”状态，并通过代谢编程提升细胞适应性，为软骨再生提供新策略 | 研究主要基于动物模型，人类临床应用效果需进一步验证；单细胞转录组学分析可能未覆盖所有细胞亚群 | 探索增强软骨细胞适应性和促进关节软骨再生的化学方法 | 人软骨细胞和关节软骨组织 | 细胞治疗与再生医学 | 骨关节炎 | 药物筛选、单细胞转录组学、动物模型实验 | NA | 转录组数据、组织图像 | 大鼠动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1380 | 2026-02-27 |
High-Lactate-Metabolizing Photosynthetic Bacteria Reprogram Tumor Immune Microenvironment
2024-09, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405930
PMID:38924191
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研究论文 | 本研究筛选出一种高乳酸代谢光合细菌（LAB-1），用于重编程肿瘤免疫微环境，以增强免疫治疗效果 | 首次通过正交实验模拟肿瘤微环境并利用乳酸作为唯一有机碳源筛选高乳酸代谢光合细菌，并证明其能选择性定植于肿瘤组织、降低乳酸水平、提高pH值，从而有效重编程肿瘤免疫微环境 | 研究仅在鼠源4T1模型中进行验证，尚未在人类肿瘤或更广泛的肿瘤模型中测试其普适性与安全性 | 通过降低肿瘤组织中的乳酸水平来重编程肿瘤免疫微环境，以增强肿瘤免疫治疗的效果 | 高乳酸代谢光合细菌（LAB-1）及其在鼠源4T1肿瘤模型中的作用 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 鼠源4T1肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |