单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 1321 - 1340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1321 | 2025-10-06 |
A spatiotemporal molecular atlas of mouse spinal cord injury identifies a distinct astrocyte subpopulation and therapeutic potential of IGFBP2
2024-10-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.06.016
PMID:39029468
|
研究论文 | 本研究构建了小鼠脊髓损伤的时空分子图谱，鉴定出表达Igfbp2的星形胶质细胞亚群并揭示其治疗潜力 | 首次在脊髓损伤中识别出从白质迁移至灰质的Astro-GMii星形胶质细胞亚群，并证明IGFBP2蛋白具有促进神经突生长和功能恢复的治疗潜力 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类临床中验证 | 解析脊髓损伤后的时空分子变化机制并探索治疗靶点 | 小鼠脊髓损伤模型 | 空间转录组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,空间转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1322 | 2025-10-06 |
scRNA-seq reveals transcriptional dynamics of Encephalitozoon intestinalis parasites in human macrophages
2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596468
PMID:38853846
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究人类巨噬细胞中Encephalitozoon intestinalis寄生虫感染的转录动态 | 首次在单细胞分辨率同时分析宿主和寄生虫在感染过程中的转录变化，揭示寄生虫通过避免宿主检测的潜行策略 | 研究仅关注人类巨噬细胞，未涉及其他细胞类型或体内环境 | 探究微孢子虫感染过程中宿主反应和寄生虫发育的转录调控机制 | 人类巨噬细胞和Encephalitozoon intestinalis寄生虫 | 单细胞生物学 | 机会性感染疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1323 | 2025-10-06 |
Inferring B Cell Phylogenies from Paired H and L Chain BCR Sequences with Dowser
2024-May-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300851
PMID:38557795
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研究论文 | 本研究开发了利用配对重链和轻链BCR序列推断B细胞系统发育树的方法 | 首次系统研究如何整合配对重链和轻链序列构建B细胞系统发育树，发现轻链整合显著提高树准确性和可重复性 | 当部分轻链数据缺失时（如混合单细胞和批量测序数据），许多系统发育方法会估计有偏的枝长 | 研究使用配对重链和轻链BCR序列构建B细胞系统发育树的策略 | B细胞受体(BCR)序列 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序，系统发育分析 | 最大似然法 | 基因序列数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1324 | 2025-10-06 |
Accurate single-molecule spot detection for image-based spatial transcriptomics with weakly supervised deep learning
2024-May-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.04.006
PMID:38754367
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研究论文 | 提出Polaris分析流程，通过弱监督深度学习实现图像空间转录组学中的单分子点检测 | 结合深度学习细胞分割与点检测模型及概率基因解码器，为多种空间转录技术提供统一解决方案 | NA | 开发准确量化单细胞基因表达的空间转录组学分析流程 | 图像空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 弱监督深度学习 | 深度学习模型 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学,MERFISH,seqFISH,原位RNA测序 | NA | NA |
| 1325 | 2025-10-06 |
Targeting SCD triggers lipotoxicity of cancer cells and enhances anti-tumor immunity in breast cancer brain metastasis mouse models
2024-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.06.592766
PMID:38766019
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研究论文 | 本研究探讨SCD抑制剂通过诱导癌细胞脂毒性并增强抗肿瘤免疫来治疗乳腺癌脑转移的机制 | 首次揭示SCD抑制剂通过重塑肿瘤脂质组、增强树突细胞抗原呈递和改善T细胞功能来协同抑制乳腺癌脑转移 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 开发针对乳腺癌脑转移的新型治疗策略 | 乳腺癌细胞和乳腺癌脑转移小鼠模型 | 癌症研究 | 乳腺癌脑转移 | 脂质组学分析，qPCR，western blot，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据，单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1326 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing comparison of the human metastatic prostate spine tumor microenvironment
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102805
PMID:38341849
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研究论文 | 本文开发了一种从前列腺癌患者临床样本中处理脊柱转移瘤单细胞RNA测序的实验室方案 | 建立了手术室到实验室的单细胞处理流程，专门针对脊柱转移瘤组织异质性高的挑战 | 仅基于单一前列腺癌患者样本，样本量有限 | 开发脊柱转移瘤单细胞测序分析方案，识别预后标志物和治疗靶点 | 前列腺癌脊柱转移患者的临床组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1例前列腺癌脊柱转移患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1327 | 2025-10-06 |
Protocol to study the inheritance and propagation of non-genetically encoded states using barcode decay lineage tracing
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102809
PMID:38180835
|
研究论文 | 提出一种结合条形码衰减谱系追踪和单细胞转录组分析的实验方案 | 开发BdLT-Seq技术，能够在保持同源性的同时定向评估克隆演化，比较同源细胞谱系间的非遗传分子特征 | NA | 研究非遗传编码状态的遗传和传播机制 | 细胞谱系 | 单细胞分析 | NA | 条形码衰减谱系追踪，单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1328 | 2025-10-06 |
Parallel labeled-line organization of sympathetic outflow for selective organ regulation in mice
2024-12-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54928-1
PMID:39658565
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和病毒遗传工具揭示了小鼠脊髓交感节前神经元的分子亚型及其对器官的选择性调控机制 | 首次在分子水平鉴定出脊髓交感节前神经元的两个亚型，并证明其通过平行标记线组织实现器官选择性调控 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在其它物种中验证 | 阐明交感神经系统输出特异性的神经环路组织机制 | 小鼠脊髓交感节前神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序，病毒遗传工具，化学遗传学操作 | NA | 基因表达数据，神经解剖数据，生理功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1329 | 2025-10-06 |
CDK9 recruits HUWE1 to degrade RARα and offers therapeutic opportunities for cutaneous T-cell lymphoma
2024-12-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54354-3
PMID:39632829
|
研究论文 | 本研究通过筛选小分子抑制剂库发现CDK9是皮肤T细胞淋巴瘤生长的关键驱动因子，并揭示了CDK9通过招募E3连接酶HUWE1降解RARα的机制 | 首次发现CDK9通过招募HUWE1降解RARα促进CTCL生长，并开发了CDK9-PROTAC与ATRA联合治疗的协同抗肿瘤策略 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未进行临床试验验证 | 探索皮肤T细胞淋巴瘤的靶向治疗新策略 | 皮肤T细胞淋巴瘤细胞和小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，PROTAC技术，小分子抑制剂筛选 | NA | 基因表达数据，细胞增殖数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1330 | 2025-10-06 |
Parallel measurement of transcriptomes and proteomes from same single cells using nanodroplet splitting
2024-12-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54099-z
PMID:39638780
|
研究论文 | 开发了一种名为nanoSPLITS的单细胞多组学平台，能够从同一单细胞并行测量转录组和蛋白质组 | 首次实现了从同一单细胞进行全局转录组和蛋白质组的并行测量，通过纳米液滴分裂技术整合RNA测序和质谱蛋白质组学 | NA | 开发单细胞多组学技术以更全面理解基因调控网络和细胞多样性 | 细胞周期蛋白依赖性激酶1抑制细胞和人类胰岛原代细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | nanoSPLITS | 纳米液滴分裂技术，整合RNA测序和质谱蛋白质组学的单细胞多组学平台 |
| 1331 | 2025-10-06 |
Synaptic connectome of the Drosophila circadian clock
2024-12-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54694-0
PMID:39638801
|
研究论文 | 本研究通过果蝇脑连接组数据构建了首个完整的动物昼夜节律时钟突触连接图谱 | 发现了额外的背侧时钟神经元，将果蝇昼夜节律网络神经元数量从150个修正为约240个；揭示了广泛的网络内对侧突触连接和新型间接光输入通路；整合单细胞转录组和受体定位解析了神经肽信号传导机制 | NA | 解析昼夜节律时钟如何协调多种节律性生理过程和行为 | 果蝇昼夜节律时钟神经元网络 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序, 受体定位, 连接组学分析 | NA | 连接组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间连接组学 | FlyWire脑连接组 | 果蝇全脑连接组数据集 |
| 1332 | 2025-10-06 |
NiCo identifies extrinsic drivers of cell state modulation by niche covariation analysis
2024-12-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54973-w
PMID:39639035
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研究论文 | 提出NiCo计算框架，通过整合单细胞空间转录组和单细胞RNA测序数据来推断空间生态位对细胞状态的影响 | 开发了能够捕获同一生态位内不同细胞类型间相互作用驱动的细胞状态变化的计算方法 | 方法依赖于单细胞分辨率空间转录组数据的可用性 | 理解细胞状态在组织发育、稳态和疾病中的调控机制 | 小鼠胚胎发生、成年小肠和肝脏组织 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 计算框架 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 多个小鼠组织样本（胚胎、小肠、肝脏） | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1333 | 2025-10-06 |
Decoding the molecular, cellular, and functional heterogeneity of zebrafish intracardiac nervous system
2024-12-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54830-w
PMID:39632839
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、解剖学研究和电生理技术对斑马鱼心内神经系统进行全面分类和功能表征 | 首次系统揭示心内神经系统的细胞类型多样性，发现具有起搏器/节律生成特征的神经元亚群 | 研究仅限于斑马鱼模型，人类心内神经系统的直接相关性需要进一步验证 | 解析心内神经系统的分子、细胞和功能异质性 | 斑马鱼心内神经系统 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 解剖学研究, 电生理技术 | NA | 单细胞转录组数据, 解剖学数据, 电生理记录 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1334 | 2025-10-06 |
Dual function of PHF16 in reinstating homeostasis of murine intestinal epithelium after crypt regeneration
2024-12-02, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.08.009
PMID:39232563
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研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调控因子PHF16通过双重机制恢复肠道上皮稳态 | 首次发现PHF16通过HBO1介导的H3K14乙酰化激活RAR/RXR靶基因，同时通过CDC73泛素化抑制YAP/TAZ活性的双重机制 | 研究主要基于小鼠模型和肠道类器官，人类临床相关性尚需验证 | 探究PHF16在肠道上皮稳态恢复中的分子机制 | 小鼠肠道干细胞、再生干细胞和肠道类器官 | 表观遗传学 | 肠道损伤修复 | 单细胞RNA测序, RNA测序, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | Phf16基因敲除小鼠模型和肠道类器官 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序, ATAC测序 | NA | NA |
| 1335 | 2025-10-06 |
Augmenting antitumor efficacy of Th17-derived Th1 cells through IFN-γ-induced type I interferon response network via IRF7
2024-Nov-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412120121
PMID:39541355
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研究论文 | 本研究揭示了Th17来源的Th1细胞通过IFN-γ诱导的IRF7介导的I型干扰素反应网络增强抗肿瘤效能的机制 | 首次发现Th1细胞通过ECM1依赖性方式在肿瘤中更快迁移和积累，并阐明IFN-γ通过上调IRF7促进I型干扰素反应网络和ECM1表达的分子机制 | Th1细胞表现出早期耗竭表型，其分化机制和抗肿瘤反应尚未完全阐明 | 探索Th17来源的Th1细胞的分化机制及其在癌症免疫治疗中的抗肿瘤效能 | CD4 T细胞亚群，特别是共表达Th1和Th17标志物的T细胞 | 免疫学 | 实体恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序，轨迹分析，转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1336 | 2025-10-06 |
DNA methylation memory of pancreatic acinar-ductal metaplasia transition state altering Kras-downstream PI3K and Rho GTPase signaling in the absence of Kras mutation
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.26.620414
PMID:39553977
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研究论文 | 本研究探讨胰腺腺泡-导管化生（ADM）过渡状态在无KRAS突变情况下通过DNA甲基化记忆影响下游信号通路的机制 | 首次发现在无致癌基因突变情况下，ADM过渡状态细胞能通过DNA甲基化记忆持续改变KRAS下游信号通路 | 研究主要关注DNA甲基化机制，未全面探讨其他表观遗传修饰的潜在作用 | 探究胰腺腺泡-导管化生过渡状态的表观遗传记忆机制及其在肿瘤发生中的作用 | 胰腺腺泡细胞、ADM过渡状态细胞、人类胰腺上皮内瘤变样本 | 表观遗传学 | 胰腺癌 | DNA甲基化分析、单细胞空间转录组学、基因表达分析 | NA | 表观遗传数据、基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 1337 | 2025-10-06 |
The small inhibitor WM-1119 effectively targets KAT6A-rearranged AML, but not KMT2A-rearranged AML, despite shared KAT6 genetic dependency
2024-10-08, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01610-0
PMID:39380002
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研究论文 | 评估KAT6A抑制剂WM-1119对KAT6A重排和KMT2A重排急性髓系白血病的治疗效果差异 | 首次发现KAT6A催化活性抑制剂对KAT6A重排AML有效，但对KMT2A重排AML需靶向降解整个KAT6A蛋白 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 评估不同KAT6A靶向治疗策略对KAT6A和KMT2A重排AML的治疗潜力 | KAT6A重排和KMT2A重排急性髓系白血病细胞 | 血液肿瘤研究 | 急性髓系白血病 | 流式细胞术,集落形成实验,shRNA敲低,CRISPR敲除,单细胞RNA-seq,ChIP-seq | 遗传修饰小鼠模型 | 基因表达数据,表观遗传数据,细胞功能数据 | 人类AML细胞系和原代患者AML样本 | NA | 单细胞RNA-seq,ChIP-seq | NA | NA |
| 1338 | 2025-10-06 |
c-Myc alone is enough to reprogram fibroblasts into functional macrophages
2024-09-12, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01605-x
PMID:39267119
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研究论文 | 本研究开发了一种通过c-Myc过表达将成纤维细胞重编程为功能性巨噬细胞的新方法 | 首次证明仅通过c-Myc单独过表达即可实现成纤维细胞向功能性巨噬细胞的重编程 | NA | 开发高效获取巨噬细胞的新方法以促进抗癌免疫治疗 | 成纤维细胞、巨噬细胞、白血病模型、乳腺癌模型、患者来源肿瘤异种移植模型 | 细胞重编程 | 白血病、乳腺癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、ChIP-qPCR、双荧光素酶报告基因检测 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、分子生物学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1339 | 2025-10-06 |
Spatial multi-omics: deciphering technological landscape of integration of multi-omics and its applications
2024-08-24, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01596-9
PMID:39182134
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综述 | 本文全面回顾了空间多组学技术的发展历程及其在生物医学研究中的应用 | 系统梳理了空间多组学技术在过去十年中的演进与完善，重点关注通量、分辨率、模态整合和准确性的提升 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据和研究方法的具体实施细节 | 探讨多组学整合的技术格局及其在生物医学领域的应用 | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和表观基因组的整合分析 | 空间生物学 | 癌症 | 空间多组学技术 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 空间多组学 | NA | NA |
| 1340 | 2025-10-06 |
Type I interferons induce an epigenetically distinct memory B cell subset in chronic viral infection
2024-05-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.03.016
PMID:38593796
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了慢性病毒感染中I型干扰素诱导形成表观遗传特征独特的记忆B细胞亚群 | 首次发现慢性病毒感染中存在富含干扰素刺激基因的独特记忆B细胞亚群，并证明早期干扰素受体阻断可改变其表观遗传特征 | 感染4周后记忆B细胞对干预措施产生抵抗，限制了治疗时间窗口 | 探究慢性病毒感染中记忆B细胞发育异常的机制及可逆性 | 急性和慢性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒感染模型中的记忆B细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |