单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 1301 - 1320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal transcriptomic landscape of rice embryonic cells during seed germination
2024-09-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.016
PMID:38848718
|
研究论文 | 本研究利用空间增强分辨率组学测序和单细胞RNA测序技术，绘制了水稻种子萌发过程中胚胎细胞的时空转录组图谱 | 开发了基于深度学习的自动细胞分割模型，发现了两种先前未报道的盾片细胞类型，并提供了探索胚胎细胞在种子萌发中作用的新方法 | NA | 阐明不同胚胎细胞在调控种子活力和幼苗建成中的复杂生物学功能 | 水稻胚胎细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间增强分辨率组学测序(Stereo-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 原位杂交 | 深度学习 | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 吸水后6、24、36和48小时的水稻胚胎样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1302 | 2025-10-06 |
An integrated approach identifies the molecular underpinnings of murine anterior visceral endoderm migration
2024-09-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.014
PMID:38843837
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学和高分辨率活体成像技术，揭示了小鼠胚胎前内脏内胚层迁移的分子机制 | 首次结合单细胞转录组、磷酸化蛋白质组和活体成像技术系统研究AVE迁移，发现转录状态与细胞位置的紧密关联及信号素信号的关键作用 | 研究仅针对小鼠胚胎模型，结果在其他物种中的普适性有待验证 | 阐明前内脏内胚层独特迁移行为和功能的分子基础 | 小鼠胚胎前内脏内胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学, 活体成像, 晶格光片显微镜, 短期谱系标记 | NA | 基因表达数据, 蛋白质磷酸化数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1303 | 2025-10-06 |
Bacterial single-cell RNA sequencing captures biofilm transcriptional heterogeneity and differential responses to immune pressure
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601229
PMID:38979200
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研究论文 | 开发了一种优化的细菌单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，用于研究生物膜生长过程中的转录异质性及免疫细胞暴露后的转录适应性 | 首次开发了适用于细菌的单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，能够捕获生物膜内广泛的转录异质性并分析不同免疫细胞群的特异性反应 | 方法验证主要集中于生物膜与浮游生长的比较，尚未在其他细菌系统或更复杂环境中广泛测试 | 研究细菌生物膜的转录异质性及其对免疫压力的差异反应 | 细菌生物膜中的亚群细胞 | 单细胞测序技术 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | BaSSSh-seq | 优化的细菌单细胞RNA测序平台 |
| 1304 | 2025-10-06 |
Deep Transcriptomics Reveals Cell-Specific Isoforms of Pan-Neuronal Genes
2024-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.16.594572
PMID:38826410
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究神经元特异性剪接模式 | 开发新算法识别细胞特异性表达模式，发现神经元特异性异构体和调控RNA结合蛋白，并建立用户友好的空间转录组可视化平台 | 单细胞RNA-Seq方法的捕获效率和灵敏度限制 | 研究神经系统神经元特异性剪接模式和调控机制 | 神经元 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | CeNGEN联盟生成的深度细胞特异性转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1305 | 2025-10-06 |
Magnetic soft microrobots for erectile dysfunction therapy
2024-Dec-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2407809121
PMID:39556757
|
研究论文 | 开发了一种用于治疗勃起功能障碍的磁性软微机器人，可提高间充质基质细胞的保留率和存活率 | 设计了包含磁性纳米粒子链的超软水凝胶微球，具有活性氧清除功能，能够适应狭窄血管形状 | NA | 提高勃起功能障碍治疗的细胞治疗效果 | 大鼠和比格犬勃起功能障碍模型 | 生物医学工程 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1306 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals CD34 as a marker of human sinoatrial node pacemaker cardiomyocytes
2024-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54337-4
PMID:39604360
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现CD34可作为人类窦房结起搏心肌细胞的标志物 | 首次发现CD34可作为窦房结起搏细胞的表面标志物，并证明通过CD34分选可富集具有功能起搏表型的细胞 | 研究主要基于胎儿和干细胞来源的窦房结细胞，未涉及成人原代组织 | 鉴定人类窦房结起搏细胞的分子标志物 | 人类胎儿窦房结细胞和人多能干细胞分化的窦房结细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞/单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胎儿和干细胞来源的窦房结细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1307 | 2025-10-06 |
Spatially organized tumor-stroma boundary determines the efficacy of immunotherapy in colorectal cancer patients
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54710-3
PMID:39592630
|
研究论文 | 本研究通过整合空间增强分辨率组学测序等技术，揭示了结直肠癌中肿瘤-基质边界的空间组织与免疫治疗疗效的关联 | 首次通过空间多组学技术系统解析肿瘤-基质边界的空间组织结构及其在免疫检查点阻断治疗响应中的作用机制 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 探究结直肠癌患者对免疫治疗不同响应的肿瘤微环境机制 | 未经治疗和接受ICB治疗的结直肠癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间增强分辨率组学测序,单细胞RNA测序,多重成像分析 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,成像数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1308 | 2025-10-06 |
HLA-A+ tertiary lymphoid structures with reactivated tumor infiltrating lymphocytes are associated with a positive immunotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Jul, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02712-9
PMID:38762674
|
研究论文 | 本研究探索了食管鳞状细胞癌中HLA-A阳性三级淋巴结构与免疫检查点阻断治疗反应的关系 | 首次发现HLA-A阳性三级淋巴结构及其驻留的肿瘤浸润淋巴细胞与食管鳞癌免疫治疗反应相关 | 样本量相对有限（42例初治组织和60例患者），需要更大规模研究验证 | 识别食管鳞状细胞癌免疫检查点阻断治疗的生物标志物 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学,数字空间分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,单细胞测序数据 | 42例初治ESCC肿瘤组织和60例ESCC患者 | NanoString | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NanoString GeoMx数字空间分析仪 | NanoString GeoMx数字空间分析仪用于系统评估肿瘤微环境 |
| 1309 | 2025-10-06 |
Underrepresentation of activating KIR gene expression in single-cell RNA-seq data is due to KIR gene misassignment
2024-Jan, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350590
PMID:37944995
|
研究论文 | 本文揭示了单细胞RNA测序数据中激活型KIR基因表达被低估的原因是标准比对流程对KIR转录本的错误分配 | 首次系统性地识别并验证了单细胞RNA测序标准流程中KIR转录本错误分配的问题及其对激活型KIR表达量化的影响 | NA | 探究单细胞RNA测序数据中KIR基因表达量化的准确性问题 | 杀伤性免疫球蛋白样受体(KIR)转录本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1310 | 2025-10-06 |
Spatio-temporal transcriptomics of chromothriptic SHH-medulloblastoma identifies multiple genetic clones that resist treatment and drive relapse
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54709-w
PMID:39609432
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析染色体碎裂型SHH髓母细胞瘤，揭示了其空间异质性特征和治疗抵抗机制 | 首次应用空间转录组学技术系统分析染色体碎裂型髓母细胞瘤的空间异质性，识别出多个遗传克隆在治疗抵抗和复发中的作用 | 样本量相对有限（13例肿瘤和11个PDX样本），需要更大规模研究验证发现 | 探索染色体碎裂型髓母细胞瘤的分子特征和侵袭性决定因素 | 染色体碎裂型和非染色体碎裂型髓母细胞瘤患者样本及患者来源异种移植模型 | 空间转录组学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 13例髓母细胞瘤样本和11个患者来源异种移植样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1311 | 2025-10-06 |
C/EBPβ-dependent autophagy inhibition hinders NK cell function in cancer
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54355-2
PMID:39609420
|
研究论文 | 本研究揭示自噬是NK细胞抗肿瘤功能的核心调节因子，并发现C/EBPβ依赖的自噬抑制会阻碍NK细胞在癌症中的功能 | 首次发现自噬作为NK细胞内的检查点，并通过CXCL12-CXCR4-C/EBPβ信号轴阐明其调控机制 | 研究主要基于前列腺癌模型，在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探索癌症如何导致NK细胞功能失调及克服免疫治疗抵抗的机制 | 肿瘤浸润NK细胞、人类前列腺癌患者样本、多种小鼠癌症模型 | 免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据 | 晚期人类前列腺癌患者样本及多种小鼠癌症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1312 | 2025-10-06 |
Transcription factors ASCL1 and OLIG2 drive glioblastoma initiation and co-regulate tumor cell types and migration
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54750-9
PMID:39609428
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤发生发展中的协同调控作用 | 首次证明ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤形成中具有冗余功能，并共同调控肿瘤细胞类型和迁移能力 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究ASCL1和OLIG2转录因子在胶质母细胞瘤发生和异质性调控中的作用机制 | 小鼠脑室下区祖细胞和胶质母细胞瘤细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1313 | 2025-10-06 |
Spatial Pathomics Toolkit for Quantitative Analysis of Podocyte Nuclei with Histology and Spatial Transcriptomics Data in Renal Pathology
2024-Feb, Proceedings of SPIE--the International Society for Optical Engineering
DOI:10.1117/12.3006318
PMID:40375953
|
研究论文 | 开发并应用空间病理组学工具包(SPT)对肾病理中的足细胞核进行定量分析 | 提出首个整合组织学和空间转录组学数据的足细胞空间病理组学分析工具包 | 未提及具体样本量限制或验证范围 | 开发定量分析工具以促进肾病理中细胞空间病理组学研究 | 肾小球足细胞核 | 数字病理 | 肾脏疾病 | 空间转录组学, 病理图像分析 | 实例对象分割模型 | 全切片图像(WSI), 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1314 | 2025-10-06 |
Detecting global and local hierarchical structures in cell-cell communication using CrossChat
2024-12-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54821-x
PMID:39627184
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研究论文 | 开发CrossChat计算框架用于检测细胞间通讯的全局和局部层次结构 | 提出首个能够同时推断细胞间通讯全局和局部层次结构的计算方法，突破了现有方法仅能在预定义细胞群间分析通讯的局限 | 方法验证仅限于文中提到的四个数据集，需要更多数据验证通用性 | 开发计算框架以揭示细胞间通讯的层次结构 | 细胞间通讯系统 | 生物信息学 | COVID-19, 皮肤发育 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 多分辨率聚类, 树检测方法 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 两个非空间scRNA-seq数据集(COVID-19患者和小鼠胚胎皮肤), 两个空间转录组数据集(小鼠胚胎和小鼠创伤皮肤) | 10x Genomics, BGI | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium, Stereo-seq | 10x Visium空间转录组技术, BGI Stereo-seq空间转录组技术 |
| 1315 | 2025-10-06 |
Endothelial Pim3 kinase protects the vascular barrier during lung metastasis
2024-12-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54445-1
PMID:39627185
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现肺内皮细胞在黑色素瘤转移过程中的转录重编程，揭示了Pim3激酶在保护血管屏障功能中的关键作用 | 首次发现反应性毛细血管内皮细胞簇(rCap)及其标志物Pim3激酶在肺转移微环境中保护血管屏障功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证有限；观察时间点较早(6小时)，长期效应尚不明确 | 探究肺转移微环境中内皮细胞的分子调控机制及其在癌症转移中的作用 | 小鼠肺内皮细胞和黑色素瘤细胞 | 单细胞生物学 | 肺癌转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1316 | 2025-10-06 |
Granzyme K+CD8+ T cells interact with fibroblasts to promote neutrophilic inflammation in nasal polyps
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54685-1
PMID:39614076
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现GZMK+CD8+ T细胞通过与成纤维细胞相互作用促进鼻息肉中的中性粒细胞炎症 | 首次发现GZMK+CD8+ T细胞通过表达CXCR4与分泌CXCL12的成纤维细胞相互作用，独特地通过GZMK而非其他颗粒酶诱导中性粒细胞趋化因子产生 | NA | 阐明慢性鼻窦炎伴鼻息肉中中性粒细胞炎症的潜在机制 | 鼻息肉组织中的免疫细胞和基质细胞 | 单细胞生物学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞分析,空间转录组学,T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1317 | 2025-10-06 |
COVID-19 progression and convalescence in common variable immunodeficiency patients show dysregulated adaptive immune responses and persistent type I interferon and inflammasome activation
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54732-x
PMID:39609471
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析普通变异型免疫缺陷病（CVID）患者在COVID-19感染前后的免疫反应特征 | 首次揭示CVID患者在COVID-19康复期仍持续存在I型干扰素特征和炎症小体激活，并发现适应性免疫反应失调的详细机制 | 样本量有限，未明确完整体液免疫在这些过程中的具体调控机制 | 研究CVID患者对SARS-CoV-2感染的免疫反应特征和长期影响 | 普通变异型免疫缺陷病（CVID）患者 | 免疫学 | 免疫缺陷病 | 单细胞RNA测序，光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | CVID患者外周血样本（感染前、感染期间和康复期） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1318 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic census of mammalian olfactory epithelium aging
2024-11-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.020
PMID:39173624
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析年轻与年老小鼠嗅觉上皮，揭示衰老过程中的细胞和分子变化 | 首次在单细胞分辨率下系统绘制哺乳动物嗅觉上皮衰老的转录组图谱，识别了21种细胞类型中的衰老相关差异表达基因 | 研究仅限于小鼠模型，人类嗅觉上皮衰老可能存在物种特异性差异 | 探究哺乳动物嗅觉上皮衰老的细胞和分子机制 | 年轻和年老小鼠的嗅觉上皮组织 | 单细胞组学 | 衰老相关嗅觉功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老小鼠嗅觉上皮样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1319 | 2025-10-06 |
Long-Term Follow-up of Levonorgestrel Intrauterine Device for Atypical Hyperplasia and Early Endometrial Cancer Reveals Relapse Characterized by Immune Exhaustion
2024-Nov-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0362
PMID:38922360
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研究论文 | 评估左炔诺孕酮宫内节育器治疗子宫内膜非典型增生和早期子宫内膜癌的长期随访结果及复发机制 | 首次使用空间转录组学分析LIUD治疗过程中免疫微环境变化，揭示复发与免疫耗竭相关 | 样本量较小（仅5例患者的纵向活检），需更大规模研究验证 | 探索LIUD治疗AH/G1EEC的长期疗效及复发机制 | 子宫内膜非典型增生和早期子宫内膜癌患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 空间转录组学, 数字空间分析, 细胞类型反卷积分析 | MCP-counter分析 | 组织活检样本 | 43例初始响应患者（其中41例有随访数据），5例患者纵向活检 | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMX数字空间分析系统 | Nanostring GeoMX数字空间分析 |
| 1320 | 2025-10-06 |
Endoluminal Biopsy for Vein of Galen Malformation
2024-Nov-01, Neurosurgery
IF:3.9Q1
DOI:10.1227/neu.0000000000002986
PMID:38747605
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研究论文 | 本研究通过血管内组织采样技术对Galen静脉畸形病变进行原位分析，探索其遗传学和发病机制 | 首次在常规血管内治疗过程中通过线圈获取VOGM原位内皮细胞进行单细胞RNA测序分析 | 样本量较小（6名患者），需要更大规模研究验证发现 | 开发VOGM分子遗传学分类系统并探索个性化治疗策略 | Galen静脉畸形患者的内皮细胞 | 单细胞基因组学 | 脑血管畸形 | 单细胞RNA测序，遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据，DNA序列数据 | 6名患者（年龄12天至约6岁），10次ETS操作 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |