单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 1281 - 1300 篇。

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	平台公司	平台技术	具体产品	平台详情
1281	2025-10-06	Multi-omics with dynamic network biomarker algorithm prefigures organ-specific metastasis of lung adenocarcinoma 2024-11-14, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53849-3 PMID:39543109	研究论文	本研究通过动态网络生物标志物算法和多组学数据预测肺腺癌器官特异性转移	首次结合动态网络生物标志物算法、单细胞RNA测序和血清蛋白质组学数据定位肺腺癌转移前状态	研究仅基于两个临床队列，需要更大样本验证	早期检测肺腺癌器官特异性转移	肺腺癌患者原发性病灶和血清样本	生物信息学	肺癌	单细胞RNA测序, 液相色谱-质谱联用	神经网络	单细胞RNA测序数据, 质谱数据	两个临床队列，包含四种主要肺腺癌远处转移类型	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
1282	2025-10-06	Dyna-vivo-seq unveils cellular RNA dynamics during acute kidney injury via in vivo metabolic RNA labeling-based scRNA-seq 2024-11-14, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54202-4 PMID:39543112	研究论文	本研究开发了一种名为Dyna-vivo-seq的新策略，通过体内代谢RNA标记的单细胞RNA测序技术揭示急性肾损伤过程中的细胞RNA动态变化	首次实现了在活体动物中进行基于代谢RNA标记的时间分辨动态转录分析，突破了该技术仅限于体外模型的限制	研究仅在雌性小鼠中进行，未涉及其他性别或物种	开发能够在活体生物单细胞水平表征动态转录组的方法	雌性小鼠急性肾损伤模型中的近端肾小管细胞	单细胞基因组学	急性肾损伤	代谢RNA标记，单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
1283	2025-10-06	Identification of signaling pathways that specify a subset of migrating enteric neural crest cells at the wavefront in mouse embryos 2024-07-08, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.034 PMID:38636517	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了小鼠胚胎中前沿迁移肠神经嵴细胞的分子机制和信号通路	首次系统描绘了前沿ENCCs在迁移过程中的时空动态变化，并鉴定了调控其特化的关键信号通路	研究主要基于小鼠胚胎模型，人类组织验证相对有限	探索肠神经系统发育过程中前沿迁移神经嵴细胞的分子调控机制	小鼠胚胎中的前沿迁移肠神经嵴细胞及其周围肠道组织	发育生物学	先天性巨结肠症	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	基因表达数据, 空间定位数据	小鼠胚胎样本	NA	单细胞RNA-seq, 空间转录组学	NA	NA
1284	2025-10-06	Single-cell transcriptomics across 2,534 microbial species reveals functional heterogeneity in the rumen microbiome 2024-Jul, Nature microbiology IF:20.5Q1 DOI:10.1038/s41564-024-01723-9 PMID:38866938	研究论文	通过单细胞转录组学技术揭示了瘤胃微生物组中2,534种微生物物种的功能异质性	开发了微生物组单细胞转录组学方法，结合液滴单细胞RNA测序和泛基因组计算分析，首次在单细胞水平解析复杂微生物群落功能	研究聚焦于瘤胃微生物组，方法在其他微生物生态系统中的适用性有待验证	解析复杂微生物群落中单个微生物的功能异质性和生态位适应性	瘤胃微生物组中的微生物细胞和物种	单细胞生物学	NA	单细胞RNA测序，泛基因组分析	NA	单细胞转录组数据	174,531个微生物细胞，2,534个物种	NA	单细胞RNA-seq	NA	液滴单细胞RNA测序
1285	2025-10-06	Villus myofibroblasts are developmental and adult progenitors of mammalian gut lymphatic musculature 2024-05-06, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.005 PMID:38537630	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和定量谱系追踪揭示了小鼠肠道绒毛平滑肌的发育起源和维持机制	首次发现绒毛肌成纤维细胞作为肠道淋巴管肌层在发育期和成年期的祖细胞，并揭示了NOTCH3-DLL4信号轴在平滑肌纤维组装和脂肪吸收中的关键作用	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类肠道中验证	探究肠道绒毛平滑肌的形成、组装和维持机制	小鼠肠道绒毛平滑肌细胞和淋巴管乳糜管	发育生物学	消化系统疾病	单细胞RNA测序，定量谱系追踪	NA	基因表达数据，谱系追踪数据	小鼠肠道组织样本	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
1286	2025-10-06	Metaplastic regeneration in the mouse stomach requires a reactive oxygen species pathway 2024-05-06, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.002 PMID:38521055	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠胃部损伤后胃主细胞通过活性氧途径进行化生再生的机制	首次在单细胞分辨率下阐明了活性氧和线粒体调控在胃部化生再生中的关键作用，并发现该机制同样适用于胰腺腺泡细胞	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证	探究胃部损伤后化生再生的分子机制	小鼠胃部细胞和胰腺腺泡细胞	单细胞生物学	胃部疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
1287	2025-10-06	Single-cell assessment of primary and stem cell-derived human trophoblast organoids as placenta-modeling platforms 2024-03-25, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.023 PMID:38359834	研究论文	通过单细胞转录组学评估源自原代滋养层细胞和滋养层干细胞的类器官作为胎盘建模平台的准确性	首次系统比较原代滋养层细胞和干细胞来源的滋养层类器官在重现体内发育轨迹方面的差异，发现干细胞来源类器官中存在体内几乎不存在的扩展祖细胞状态	发现当前滋养层类器官平台在细胞组成、分化和转录调控方面存在一定程度的不匹配	评估不同来源的滋养层类器官作为胎盘研究模型的准确性	人类滋养层干细胞和原代滋养层细胞来源的类器官	单细胞生物学	胎盘发育相关疾病	单细胞转录组学	类器官模型	单细胞RNA测序数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
1288	2025-10-06	Construction of single-cell cross-species chromatin accessibility landscapes with combinatorial-hybridization-based ATAC-seq 2024-03-25, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.015 PMID:38330939	研究论文	开发了一种基于组合杂交的单细胞ATAC测序方法，构建了跨物种染色质可及性图谱	开发了名为CH-ATAC-seq的新型单细胞ATAC测序方法，首次实现了斑马鱼、果蝇和蚯蚓等非哺乳动物物种的单细胞染色质可及性图谱构建	NA	探索脊椎动物和无脊椎动物间保守的调控程序	斑马鱼、果蝇、蚯蚓、人类、猴子和小鼠的细胞	表观基因组学	NA	单细胞ATAC测序, 单细胞RNA测序	NA	基因组测序数据	约80万个细胞类型特异性cCREs，152种主要细胞类型	NA	单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq	NA	组合杂交单细胞ATAC测序(CH-ATAC-seq)
1289	2025-10-06	Wnt dose escalation during the exit from pluripotency identifies tranilast as a regulator of cardiac mesoderm 2024-03-25, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.019 PMID:38354738	研究论文	本研究通过Wnt信号剂量梯度实验结合单细胞RNA测序，发现曲尼司特可协同激活Wnt信号促进心脏谱系分化	建立整合实验数据集、预测模型和小分子数据库的工作流程，首次发现曲尼司特对心脏中胚层分化的调控作用	仅使用hiPSC和鹌鹑胚胎验证，尚未在更复杂的哺乳动物模型中进行测试	探索Wnt信号在干细胞分化过程中的分子调控机制	人诱导多能干细胞(hiPSC)和鹌鹑胚胎	单细胞组学	心血管疾病	单细胞RNA测序, 多元回归模型, 体外分化分析, 体内胚胎分析	多元回归模型	单细胞RNA测序数据	未明确样本数量	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
1290	2025-10-06	Characterization of the human fetal gonad and reproductive tract by single-cell transcriptomics 2024-02-26, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.006 PMID:38295793	研究论文	通过单细胞转录组学分析人类胎儿性腺及生殖道的细胞组成和分子特征	首次对妊娠早期和中期人类胎儿性腺及相邻生殖道进行单细胞转录组分析，揭示了性别分化过程中的形态和分子变化	NA	研究人类胎儿性别特异性性腺发生和生殖道发育过程	人类胎儿性腺及相邻发育中的生殖道组织	单细胞组学	NA	单细胞转录组测序	NA	单细胞RNA测序数据	妊娠早期和中期男女性胎儿样本	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
1291	2025-10-06	The soil emergence-related transcription factor PIF3 controls root penetration by interacting with the receptor kinase FER 2024-02-26, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.001 PMID:38295794	研究论文	本研究揭示了转录因子PIF3通过与受体激酶FER相互作用调控植物根系穿透土壤的机制	首次发现FER-PIF3信号通路在根系土壤穿透中的关键作用，并阐明其通过调控机械敏感离子通道PIEZO和外根冠细胞脱落的分子机制	研究主要基于拟南芥和少量大豆突变体，在其他作物中的普适性需要进一步验证	探究植物根系穿透土壤的分子调控机制	拟南芥和大豆的根系组织	植物分子生物学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 生化实验, 成像技术, 遗传学实验	NA	基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 细胞成像数据	拟南芥和大豆突变体根系样本	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
1292	2025-10-06	Digital profiling of cancer transcriptomes from histology images with grouped vision attention 2024-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.09.28.560068 PMID:37808782	研究论文	开发了一种基于分组视觉注意力的Transformer模型，从组织学图像预测癌症转录组	首次将Transformer架构应用于组织学图像进行全转录组预测，并展示了在空间基因表达预测和临床预后中的应用	模型在组织水平训练，空间基因表达预测能力仍需进一步验证	从组织学图像中预测癌症转录组特征	9种癌症类型的肿瘤样本	数字病理学	癌症	深度学习，转录组分析	Transformer	组织学图像，基因表达数据	预训练：1,802个正常组织样本；训练评估：4,331个肿瘤样本；验证：1,305个肿瘤样本	NA	空间转录组学	NA	NA
1293	2025-10-06	Origin and adult renewal of the gut lacteal musculature from villus myofibroblasts 2024-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.01.19.523242 PMID:36712064	研究论文	本研究揭示了肠道绒毛平滑肌细胞的起源和成年更新机制	发现绒毛上皮下成纤维细胞前体通过中间收缩性肌成纤维细胞样表型成熟为平滑肌纤维的连续谱系，并鉴定NOTCH3-DLL4信号轴调控绒毛平滑肌与乳糜管组装	研究主要基于小鼠模型，人类肠道中的适用性需进一步验证	探究肠道绒毛平滑肌细胞的形成、分化和修复机制	小鼠肠道组织	发育生物学	消化系统疾病	单细胞RNA测序，定量谱系追踪	NA	基因表达数据，谱系追踪数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
1294	2025-10-06	Spatial transcriptomics reveals substantial heterogeneity in triple-negative breast cancer with potential clinical implications 2024-11-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54145-w PMID:39592577	研究论文	本研究通过空间转录组学技术揭示三阴性乳腺癌的肿瘤异质性及其临床意义	首次系统性地描绘TNBC的空间组织结构，识别出9种空间原型，并发现与免疫治疗反应相关的基因特征	样本量相对有限（92例患者），需要在更大队列中进一步验证	探索三阴性乳腺癌的肿瘤空间结构和微环境特征	92例三阴性乳腺癌患者样本	数字病理学	乳腺癌	空间转录组学	逐步聚类分析	空间转录组数据、组织形态学数据	92例TNBC患者	NA	空间转录组学	NA	NA
1295	2025-10-06	Bacterial single-cell RNA sequencing captures biofilm transcriptional heterogeneity and differential responses to immune pressure 2024-11-24, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54581-8 PMID:39580490	研究论文	本研究开发了一种优化的细菌单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，用于分析金黄色葡萄球菌生物膜生长过程中的转录异质性及免疫细胞暴露后的转录适应	开发了首个针对细菌的单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，能够在单细胞分辨率下探索生物膜动态和免疫压力响应	方法目前主要应用于金黄色葡萄球菌，在其他细菌物种中的适用性有待验证	研究细菌生物膜的转录异质性及其对免疫压力的差异响应	金黄色葡萄球菌生物膜	单细胞测序技术	细菌感染	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	BaSSSh-seq（细菌单细胞RNA测序方法）
1296	2025-10-06	Single-cell transcriptomics unveils molecular signatures of neuronal vulnerability in a mouse model of prion disease that overlap with Alzheimer's disease 2024-11-23, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54579-2 PMID:39580485	研究论文	本研究利用单细胞转录组学揭示了朊病毒病小鼠模型中神经元易损性的分子特征及其与阿尔茨海默病的重叠	首次通过单细胞转录组学系统识别朊病毒易损神经元亚群，并发现与阿尔茨海默病共享的易损性相关转录本	研究仅使用雌性小鼠模型，未涉及其他性别或更广泛的神经退行性疾病模型	探究特定神经元对错误折叠蛋白所致功能障碍和死亡更敏感的分子机制	朊病毒感染雌性小鼠的活体神经元	单细胞组学	神经退行性疾病	单细胞转录组测序	NA	单细胞RNA测序数据	朊病毒感染雌性小鼠的神经元样本	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
1297	2025-10-06	Immunotherapy that improves response to chemotherapy in high-grade serous ovarian cancer 2024-11-22, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54295-x PMID:39578450	研究论文	通过单细胞RNA测序分析高级别浆液性卵巢癌中肿瘤浸润免疫细胞，发现可增强新辅助化疗反应的潜在靶点	首次在高级别浆液性卵巢癌中通过单细胞RNA测序鉴定出STAB1和FOXP3作为化疗增敏的免疫治疗靶点，并开发了相应的靶向治疗策略	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	探索提高高级别浆液性卵巢癌对新辅助化疗反应的免疫治疗策略	高级别浆液性卵巢癌患者和小鼠模型的肿瘤浸润免疫细胞	单细胞测序分析	卵巢癌	单细胞RNA测序, 体外抑制实验, 反义寡核苷酸技术	NA	单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据	患者样本64,097个细胞，小鼠模型69,781个细胞，使用三种不同的HGSOC同系小鼠模型	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
1298	2025-10-06	Lenalidomide-induced pure red cell aplasia is associated with elevated expression of MHC-I molecules on erythrocytes 2024-11-22, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54571-w PMID:39578482	研究论文	本研究揭示了来那度胺治疗多发性骨髓瘤时诱发纯红细胞再生障碍的机制	首次发现来那度胺通过上调红细胞MHC-I分子表达，激活CD8 T细胞导致红细胞生成障碍	研究基于单个病例，样本量有限，需要更大规模研究验证	探究来那度胺治疗诱发纯红细胞再生障碍的分子机制	多发性骨髓瘤患者骨髓样本	血液肿瘤学	多发性骨髓瘤	单细胞转录组分析，体外功能实验	NA	单细胞RNA测序数据，体外实验数据	1例多发性骨髓瘤患者	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
1299	2025-10-06	A developmental biliary lineage program cooperates with Wnt activation to promote cell proliferation in hepatoblastoma 2024-11-20, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53802-4 PMID:39567523	研究论文	本研究通过组织学引导和空间转录组学分析肝母细胞瘤，揭示了胚胎胆道谱系程序与Wnt激活协同促进肿瘤细胞增殖的机制	发现胚胎胆道转录因子SOX4和生长因子FGF19在肝母细胞瘤增殖异质性中的关键作用，揭示了非遗传性表观遗传机制在肿瘤进化中的功能	研究主要基于患者来源的肿瘤类器官模型，需要进一步在体内验证这些发现	探究肝母细胞瘤中组织学和增殖异质性的分子机制	肝母细胞瘤患者肿瘤样本和患者来源的肿瘤类器官	空间转录组学	肝母细胞瘤	组织学引导的空间转录组学	NA	空间转录组数据、组织学图像	肝母细胞瘤患者样本和肿瘤类器官	NA	空间转录组学	NA	NA
1300	2025-10-06	Subcellular Level Spatial Transcriptomics with PHOTON 2024-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.09.10.612328 PMID:39314454	研究论文	介绍PHOTON方法实现亚细胞分辨率空间转录组分析	结合高分辨率成像与高通量测序，实现亚细胞水平空间转录组分析	NA	开发亚细胞分辨率空间转录组分析方法	卵巢颗粒细胞、核仁、应激颗粒中的RNA	空间转录组学	NA	高分辨率成像、高通量测序	NA	空间转录组数据	NA	NA	空间转录组学	PHOTON	PHOTON（纳米尺度转录组光选法）