单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1281	2025-02-27	Adult Human, but Not Rodent, Spermatogonial Stem Cells Retain States with a Foetal-like Signature 2024-04-24, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13090742 PMID:38727278	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了人类和啮齿动物精原干细胞（SSCs）的转录状态，揭示了人类成年精原干细胞保留胎儿样特征的状态	研究发现人类成年精原干细胞中存在一种胎儿样特征的状态0B，这种状态在啮齿动物中不会持续到成年，表明不同物种在确保生育力和基因组完整性方面采取了不同的进化策略	研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要进一步的实验验证来确认这些转录状态的功能意义	研究旨在揭示人类和啮齿动物精原干细胞在发育和物种间的转录异质性	人类和啮齿动物的精原干细胞	生殖生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	34个青春期后人类睾丸样本，28个胎儿和青春期前样本，以及来自绵羊、猪、水牛、猕猴、大鼠和小鼠的数据
1282	2025-02-27	The rise of single-cell transcriptomics in yeast 2024-04, Yeast (Chichester, England) DOI:10.1002/yea.3934 PMID:38403881	review	本文回顾了酵母单细胞转录组学（scRNA-seq）的当前技术，探讨了其优缺点，并展望了新技术的发展潜力	本文首次系统性地总结了酵母单细胞转录组学技术的现状，并提出了未来技术发展的方向	由于酵母细胞壁、细胞体积小和RNA含量少等固有特性，scRNA-seq在酵母中的应用受到技术限制	探讨酵母单细胞转录组学技术的现状及其在基础和应用研究中的潜力	酵母	单细胞组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
1283	2025-02-27	A single-cell atlas enables mapping of homeostatic cellular shifts in the adult human breast 2024-Apr, Nature genetics IF:31.7Q1 DOI:10.1038/s41588-024-01688-9 PMID:38548988	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，构建了一个包含55名接受乳房缩小术或风险降低乳房切除术的捐赠者的人类乳腺细胞图谱	首次通过单细胞RNA测序技术构建了人类乳腺细胞图谱，并揭示了年龄、生育史和基因突变对乳腺细胞稳态的影响	研究样本主要来自接受手术的捐赠者，可能无法完全代表普通人群	研究人类乳腺细胞的稳态变化及其与乳腺癌风险的关系	55名接受乳房缩小术或风险降低乳房切除术的捐赠者的乳腺细胞	单细胞测序	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	55名捐赠者，超过800,000个细胞
1284	2025-02-26	Nanomaterial-Mediated Reprogramming of Macrophages to Inhibit Refractory Muscle Fibrosis 2024-Dec, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202410368 PMID:39548911	研究论文	本研究探讨了纳米材料介导的巨噬细胞重编程在抑制难治性肌肉纤维化中的作用	通过工程化纳米材料调控巨噬细胞表型，利用单细胞RNA测序揭示其通过cfNA介导的TLR7/9-NF-κB信号通路减少促纤维化Gal3巨噬细胞比例，从而改变纤维脂肪生成祖细胞的亚群分布	研究主要针对口面部肌肉纤维化，其他类型肌肉纤维化的适用性尚需验证	开发新的治疗策略以调控先天炎症反应-纤维化稳态，治疗难治性肌肉纤维化	口面部肌肉纤维化	生物医学工程	肌肉纤维化	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
1285	2025-02-26	scMGATGRN: a multiview graph attention network-based method for inferring gene regulatory networks from single-cell transcriptomic data 2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae526 PMID:39417321	研究论文	本文提出了一种基于多视图图注意力网络的新方法scMGATGRN，用于从单细胞转录组数据中推断基因调控网络	scMGATGRN结合了图注意力网络（GAT）、多视图模型和视图级注意力机制，能够同时利用基因调控网络中节点的局部特征信息和高阶邻居特征信息，动态调整节点嵌入表示的相对重要性，并高效聚合来自两个视图的节点嵌入表示	NA	推断基因调控网络（GRN）以理解细胞系统的结构和动态，揭示复杂的调控关系，并探索疾病机制	单细胞转录组数据	机器学习	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	多视图图注意力网络（scMGATGRN）	单细胞转录组数据	七个基准单细胞RNA测序数据集，来自五种细胞系（两种人类和三种小鼠），包含四种不同类型的真实网络
1286	2025-02-26	Identification of microenvironment features associated with primary resistance to anti-PD-1/PD-L1 + antiangiogenesis in gastric cancer through spatial transcriptomics and plasma proteomics 2024-Sep-13, Molecular cancer IF:27.7Q1 DOI:10.1186/s12943-024-02092-x PMID:39272096	研究论文	本研究通过空间转录组学和血浆蛋白质组学，识别了与胃癌抗PD-1/PD-L1和抗血管生成联合治疗原发性耐药相关的微环境特征	首次在Caucasian患者中评估regorafenib与avelumab联合治疗的效果，并揭示了M2巨噬细胞和S100A10蛋白在耐药机制中的关键作用	研究样本量较小，且主要针对Caucasian患者，可能限制了结果的普遍适用性	探讨胃癌患者对联合治疗的耐药机制，特别是肿瘤微环境中的免疫调节作用	晚期胃癌患者	数字病理学	胃癌	空间转录组学, 血浆蛋白质组学	NA	转录组数据, 蛋白质组数据	REGOMUNE II期研究中的Caucasian患者
1287	2025-02-26	CD8+ T-cell differentiation and dysfunction inform treatment response in acute myeloid leukemia 2024-09-12, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2023021680 PMID:38776511	研究论文	本文探讨了急性髓性白血病（AML）中CD8+ T细胞分化、功能障碍与治疗反应之间的关系	利用高维流式细胞术和单细胞转录组学，发现早期记忆CD8+ T细胞与治疗反应相关，并分化为两种不同的终末状态	研究结果需要进一步在更大样本中验证	研究AML中CD8+ T细胞分化与功能障碍对治疗反应的影响	急性髓性白血病（AML）患者	生物医学	急性髓性白血病	高维流式细胞术、单细胞转录组学	NA	流式细胞数据、单细胞转录组数据	AML患者样本
1288	2025-02-26	Single-cell atlas of the human brain vasculature across development, adulthood and disease 2024-Aug, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-07493-y PMID:38987604	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析，构建了人类大脑血管系统的分子图谱，涵盖了发育期、成年期及疾病状态	首次大规模单细胞RNA测序分析人类大脑血管系统，揭示了健康与疾病状态下血管的分子异质性及细胞间相互作用	样本来源主要为胎儿和成年患者，可能无法完全代表所有年龄段或疾病类型	研究人类大脑血管系统的细胞和分子结构，特别是在发育、成年及疾病状态下的变化	606,380个新鲜分离的内皮细胞、血管周围细胞及其他组织来源细胞，来自68名人类胎儿和成年患者的117个样本	单细胞测序	脑肿瘤、脑血管畸形	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	606,380个细胞，来自68名人类胎儿和成年患者的117个样本
1289	2025-02-26	Pulmonary osteoclast-like cells in silica induced pulmonary fibrosis 2024-Jul-12, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adl4913 PMID:38985878	研究论文	本文探讨了硅尘诱导的肺纤维化的机制，通过人类肺样本和硅肺病小鼠模型进行研究	发现了硅尘诱导肺泡巨噬细胞和单核细胞向破骨细胞样分化的新机制，并提出了抗RANKL单克隆抗体治疗的新策略	研究主要依赖于动物模型和有限的临床样本，需要进一步验证在更大规模的人类研究中的效果	研究硅尘诱导的肺纤维化的病理生理机制，并探索潜在的治疗方法	人类肺样本和硅肺病小鼠模型	病理生理学	硅肺病	全肺单细胞RNA测序、组织学、生化和生理评估	小鼠模型	RNA测序数据、组织学数据、生化数据、生理数据	人类肺样本和硅肺病小鼠模型
1290	2025-02-26	SFXN1-mediated immune cell infiltration and tumorigenesis in lung adenocarcinoma: A potential therapeutic target 2024-May-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.111918 PMID:38537539	研究论文	本研究探讨了SFXN1在肺腺癌（LUAD）中的功能意义及其作为治疗靶点的潜力	首次揭示了SFXN1在LUAD中的上调及其与不良预后的关联，并发现SFXN1通过抑制NK和细胞毒性T细胞的浸润促进肿瘤进展	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在临床患者中进行验证	探讨SFXN1在LUAD中的功能及其作为治疗靶点的潜力	肺腺癌（LUAD）	肿瘤学	肺癌	RNA测序、单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot、免疫组化	NA	RNA-seq数据、scRNA-seq数据	TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本
1291	2025-02-26	Integrated scRNAseq analyses of mouse cochlear supporting cells reveal the involvement of Ezh2 in hair cell regeneration 2024-Jan-28, Molecular biology reports IF:2.6Q3 DOI:10.1007/s11033-023-09173-y PMID:38281217	研究论文	本文通过整合小鼠耳蜗支持细胞的单细胞RNA测序数据，揭示了Ezh2在毛细胞再生中的潜在作用	首次通过整合多个公共单细胞RNA测序数据集，揭示了Ezh2在小鼠耳蜗毛细胞再生中的关键调控作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探索小鼠耳蜗毛细胞再生的分子基础	小鼠耳蜗支持细胞	生物信息学	听力损失	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	RNA测序数据	多个公共数据集，涵盖E14到P33阶段的小鼠耳蜗样本
1292	2025-02-25	Ectopic expression of NKG7 enhances CAR-T function and improves the therapeutic efficacy in liquid and solid tumors 2024-Dec, Pharmacological research IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.phrs.2024.107506 PMID:39551173	研究论文	本文通过单细胞RNA测序数据探索了肿瘤浸润T细胞的特征，发现NKG7的异位表达能显著增强CAR-T细胞的功能，并提高其在液体和实体肿瘤中的治疗效果	利用临床肿瘤样本的单细胞测序数据寻找增强CAR-T细胞功能的策略，并首次发现NKG7的异位表达能显著提高CAR-T细胞的治疗效果	缺乏治疗后的活检数据，尤其是在实体肿瘤中，限制了CAR-T细胞体内特性的理解	探索增强CAR-T细胞功能的策略，并提高其在液体和实体肿瘤中的治疗效果	消化系统癌症的肿瘤浸润T细胞（TILs）	生物医学	消化系统癌症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	CAR-T细胞模型	RNA测序数据	19个临床样本
1293	2025-02-25	Gas6-Axl signal promotes indoor VOCs exposure-induced pulmonary fibrosis via pulmonary microvascular endothelial cells-fibroblasts cross-talk 2024-08-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.134786 PMID:38824778	研究论文	本研究探讨了室内挥发性有机化合物（VOCs）暴露通过肺微血管内皮细胞与成纤维细胞的相互作用促进肺纤维化的机制	揭示了VOCs暴露通过Gas6-Axl信号通路激活成纤维细胞的新机制，并发现Atf3基因在调控PANoptosis表型中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，人体内的机制仍需进一步验证	阐明VOCs暴露诱导肺纤维化的潜在分子机制	小鼠模型及肺微血管内皮细胞与成纤维细胞	生物医学	肺纤维化	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠模型	基因表达数据	未明确提及具体样本数量
1294	2025-02-23	Failure of metabolic checkpoint control during late-stage granulopoiesis drives neutropenia in reticular dysgenesis 2024-Dec-26, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024024123 PMID:39378586	研究论文	本文研究了由于线粒体腺苷酸激酶2（AK2）功能丧失导致的严重免疫缺陷综合征——网状发育不全，探讨了代谢检查点在造血过程中的作用	通过结合单细胞转录组学分析和CRISPR模型，揭示了AK2缺陷在造血系统中的影响，特别是在晚期粒细胞生成过程中代谢检查点的失效机制	研究主要基于患者样本和体外模型，可能无法完全反映体内复杂环境	探讨AK2缺陷对造血系统的影响及代谢检查点在维持代谢稳态中的作用	网状发育不全患者样本和原代人类造血干细胞	细胞生物学	免疫缺陷综合征	单细胞转录组学、CRISPR	CRISPR模型	基因表达数据	网状发育不全患者样本和原代人类造血干细胞
1295	2025-02-23	Genetic inference and single cell expression analysis of potential targets in heart failure and breast cancer 2024-Oct-26, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-024-06010-y PMID:39460820	研究论文	本研究通过结合遗传推断和单细胞表达分析，探索心力衰竭和乳腺癌的潜在遗传靶点，并利用孟德尔随机化方法评估这些靶点的因果关系	结合遗传推断和单细胞表达分析，揭示心力衰竭和乳腺癌的潜在遗传靶点，并通过实验验证ITM2B基因在乳腺癌中的作用	研究主要依赖于GWAS数据和单细胞RNA测序技术，可能存在样本选择偏差和技术局限性	探索心力衰竭和乳腺癌的潜在遗传靶点，并评估这些靶点的因果关系	心力衰竭和乳腺癌的遗传变异及其表达模式	基因组学	心力衰竭, 乳腺癌	GWAS, 单细胞RNA测序, 免疫荧光	NA	基因组数据, 单细胞RNA测序数据	NA
1296	2025-02-23	Hydrogel biomaterials that stiffen and soften on demand reveal that skeletal muscle stem cells harbor a mechanical memory 2024-Aug-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2406787121 PMID:39163337	研究论文	本文研究了骨骼肌干细胞（MuSCs）对微环境硬度的记忆效应及其对细胞功能的影响	使用动态水凝胶生物材料，能够在光照下软化和硬化，揭示了MuSCs对基质硬度的持久记忆效应及其分子机制	研究主要基于体外实验，未完全验证在体内环境中的适用性	探讨MuSCs是否具有对过去微环境的记忆，以及这种记忆是否可以被克服	骨骼肌干细胞（MuSCs）	生物材料	杜氏肌营养不良	单细胞RNA测序	NA	细胞数据	NA
1297	2025-02-23	Astrocytes Modulate a Specific Paraventricular Thalamus→Prefrontal Cortex Projection to Enhance Consciousness Recovery from Anesthesia 2024-Aug-21, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience DOI:10.1523/JNEUROSCI.1808-23.2024 PMID:38926088	研究论文	本研究通过动物模型和电生理记录，揭示了星形胶质细胞在促进从七氟醚麻醉中恢复意识中的作用	发现了特定的PVT→前额叶皮层投射在意识恢复中的作用，并揭示了七氟醚通过抑制PVT星形胶质细胞Kir4.1电导来调节这一过程	研究主要基于雄性小鼠模型，未涉及其他性别或物种	探索星形胶质细胞在麻醉恢复中的具体调节机制	雄性小鼠的星形胶质细胞和谷氨酸能神经元	神经科学	麻醉恢复	单细胞RNA测序、电生理记录	NA	电生理数据、RNA测序数据	雄性小鼠
1298	2025-02-23	Trem2 Agonist Reprograms Foamy Macrophages to Promote Atherosclerotic Plaque Stability-Brief Report 2024-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320797 PMID:38695172	研究论文	本文研究了Trem2激动剂AL002a对动脉粥样硬化斑块稳定性的影响，发现其通过促进泡沫巨噬细胞的存活和增殖，改善斑块稳定性	首次展示了Trem2激动剂AL002a通过重编程泡沫巨噬细胞功能，增强胆固醇外流和胶原沉积，从而改善动脉粥样硬化斑块稳定性	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证其效果	探讨Trem2激动剂对动脉粥样硬化斑块稳定性的影响	动脉粥样硬化易感小鼠（Ldlr-/-）	心血管疾病	动脉粥样硬化	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	动脉粥样硬化易感小鼠
1299	2025-02-23	Pharmacological suppression of the OTUD4/CD73 proteolytic axis revives antitumor immunity against immune-suppressive breast cancers 2024-Mar-26, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI176390 PMID:38530357	研究论文	本文探讨了通过药理学手段抑制OTUD4/CD73蛋白水解轴，以恢复对免疫抑制性乳腺癌的抗肿瘤免疫反应	发现了OTUD4/CD73蛋白水解轴作为治疗免疫抑制性三阴性乳腺癌的新靶点，并开发了特异性抑制剂ST80	研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证	探索针对免疫抑制性乳腺癌的新治疗策略	三阴性乳腺癌（TNBC）	肿瘤免疫学	乳腺癌	多组学分析、空间转录组学分析	NA	基因表达数据、蛋白质相互作用数据	临床前TNBC模型
1300	2025-02-22	[Microglia differential genes and their functions in paraquat-induced Parkinson's disease-like in mice's brains based on single-cell RNA sequencing] 2024-Apr-20, Zhonghua lao dong wei sheng zhi ye bing za zhi = Zhonghua laodong weisheng zhiyebing zazhi = Chinese journal of industrial hygiene and occupational diseases DOI:10.3760/cma.j.cn121094-20230524-00184 PMID:38677987	研究论文	本文基于单细胞RNA测序技术，分析了百草枯诱导的帕金森病样小鼠脑中小胶质细胞亚群的差异基因及相关信号通路，为阐明百草枯诱导的帕金森病样变化的机制提供线索	首次利用单细胞RNA测序技术研究百草枯诱导的帕金森病样小鼠脑中小胶质细胞亚群的差异基因及其功能	样本量较小，仅使用了6只小鼠，且仅验证了部分差异基因的表达	阐明百草枯诱导的帕金森病样变化的机制	百草枯诱导的帕金森病样小鼠脑中的小胶质细胞亚群	生物信息学	帕金森病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	6只6周龄的C57BL/6雄性小鼠