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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1261 | 2025-10-06 |
Reconstructing the regulatory programs underlying the phenotypic plasticity of neural cancers
2024-11-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53954-3
PMID:39516198
|
研究论文 | 开发了一种名为scregclust的计算方法,用于从单细胞RNA测序数据重建细胞调控程序 | 提出单细胞调控驱动聚类方法,能高效划分基因模块并预测关键转录因子和激酶 | 对细胞状态调控机制的理解仍有限 | 研究神经系统癌症的表型可塑性调控程序 | 成人和儿童脑癌肿瘤样本及发育组织 | 生物信息学 | 神经系统癌症 | 单细胞RNA测序 | scregclust算法 | 单细胞RNA测序数据 | 15种肿瘤类型的数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1262 | 2025-10-06 |
Uncovering functional lncRNAs by scRNA-seq with ELATUS
2024-11-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54005-7
PMID:39521797
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研究论文 | 开发名为ELATUS的计算框架,通过单细胞RNA测序数据增强功能性长链非编码RNA的检测能力 | 结合伪比对工具Kallisto和选择性功能过滤,创建专门针对lncRNAs的单细胞RNA测序分析流程,在参考注释不准确的情况下表现更优 | 未提及具体样本数量和研究规模,主要关注方法学比较 | 开发优化单细胞RNA测序数据分析方法,提高功能性长链非编码RNA的检测准确性 | 长链非编码RNA(lncRNAs)在单细胞水平的表达分析 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞多组学测序(single-cell multiome),ATAC-seq | 计算框架ELATUS,基于Kallisto伪比对工具 | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学测序 | NA | NA |
| 1263 | 2025-10-06 |
Bioengineered vascular grafts with a pathogenic TGFBR1 variant model aneurysm formation in vivo and reveal underlying collagen defects
2024-05-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg6298
PMID:38718134
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研究论文 | 本研究通过结合hiPSC、生物工程血管移植物和基因编辑技术,在动物体内建立了功能性人类胸主动脉瘤模型 | 首次将hiPSC来源的血管平滑肌细胞与基因编辑技术结合,在动物体内构建了模拟人类胸主动脉瘤形成的生物工程血管移植物模型 | 研究样本量有限,仅针对特定TGFBR1变异,需要在更大多样性样本中验证 | 建立更好的人类胸主动脉瘤疾病模型并研究其发病机制 | 人类诱导多能干细胞来源的血管平滑肌细胞和生物工程血管移植物 | 组织工程 | 胸主动脉瘤 | 基因编辑,空间转录组学,组织学分析,蛋白质测定 | 生物工程血管移植物模型 | 转录组数据,组织学图像,蛋白质数据 | 使用isogenic对照hiPSC、基因编辑突变细胞和LDS患者来源细胞构建的多种生物工程血管移植物 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1264 | 2025-10-06 |
Synovial fibroblast gene expression is associated with sensory nerve growth and pain in rheumatoid arthritis
2024-04-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adk3506
PMID:38598614
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别与类风湿关节炎疼痛相关的滑膜成纤维细胞基因表达模块,并验证其促进疼痛感觉神经生长的机制 | 开发了基于图的基因表达模块识别方法,首次发现滑膜衬里层成纤维细胞基因表达与疼痛感觉神经生长的直接关联 | 研究样本主要来自炎症程度较低的类风湿关节炎患者,结果在高度炎症情况下的适用性需进一步验证 | 探究类风湿关节炎疼痛机制与滑膜成纤维细胞基因表达的关系 | 类风湿关节炎患者的滑膜活检样本、滑膜成纤维细胞、背根神经节神经元 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、机器学习、受体-配体相互作用分析 | GbGMI(基于图的基因表达模块识别) | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 两个独立队列的类风湿关节炎患者滑膜活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1265 | 2025-10-06 |
Multimodal Analytical Tools to Enhance Mechanistic Understanding of Aortic Valve Calcification
2024-04, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2023.06.017
PMID:37517686
|
综述 | 本文综述了用于增强主动脉瓣钙化机制理解的多模态分析工具 | 整合转录组学、蛋白质组学和分子成像技术,构建研究钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)的整体方法,具有识别新调控通路的潜力 | NA | 推进钙化性主动脉瓣疾病和药物靶点研究 | 钙化性主动脉瓣疾病(CAVD) | 生物医学研究 | 心血管疾病 | 转录组学, 蛋白质组学, 分子成像, 正电子发射断层扫描/计算机断层扫描 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1266 | 2025-10-06 |
Endothelial cells drive organ fibrosis in mice by inducing expression of the transcription factor SOX9
2024-02-28, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abq4581
PMID:38416842
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研究论文 | 本研究揭示内皮细胞通过转录因子SOX9驱动多器官纤维化的机制 | 首次证实内皮细胞(而非仅成纤维细胞)通过SOX9表达直接促进器官纤维化,并发现CCN2是介导此过程的关键因子 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚不充分 | 探究内皮细胞在器官纤维化中的作用机制 | 小鼠模型及人类心力衰竭患者心脏组织 | 分子生物学 | 器官纤维化/心力衰竭 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因编辑 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 组织病理数据 | 多种小鼠纤维化模型(心脏、肺、肝)及人类心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1267 | 2025-10-06 |
Lipocalin-2 expression identifies an intestinal regulatory neutrophil population during acute graft-versus-host disease
2024-02-21, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi1501
PMID:38381845
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现表达脂质运载蛋白-2的肠道中性粒细胞群体,可减轻急性移植物抗宿主病的严重程度 | 首次发现LCN2表达的中性粒细胞群体通过调控巨噬细胞功能缓解aGVHD,并揭示LCN2/IGF-1R信号通路机制 | 未明确LCN2治疗对移植物抗白血病效应的影响,人类样本验证仍需扩大 | 探索急性移植物抗宿主病的肠道组织耐受机制和潜在治疗策略 | 小鼠模型和人类aGVHD患者肠道活检样本 | 单细胞生物学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个患者队列的肠道活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1268 | 2025-10-06 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize the molecular and cellular architecture of the ischemic mouse brain
2024-02-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg1323
PMID:38324639
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞转录组学技术,系统描绘了缺血性小鼠大脑的分子和细胞结构特征 | 首次整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了缺血大脑中LGALS9-CD44信号通路的关键作用,并发现细胞外囊泡介导的Lgals9递送可改善功能恢复 | 研究仅基于小鼠模型,需要在其他物种中进一步验证;Lgals9的具体作用机制仍需深入探索 | 表征缺血性大脑的分子和细胞结构特征,探索神经炎症在脑缺血后的病理机制 | 缺血性中风小鼠模型中的脑组织细胞 | 空间转录组学 | 脑血管疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 19,777个转录组位点 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1269 | 2025-10-06 |
CD23+IgG1+ memory B cells are poised to switch to pathogenic IgE production in food allergy
2024-02-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi0673
PMID:38324641
|
研究论文 | 本研究在儿童花生过敏中发现了一类CD23+IgG1+记忆B细胞,这些细胞在2型免疫反应中产生,含有高亲和力花生特异性克隆,并能被激活分化为产生IgE的细胞 | 首次描述了CD23+IgG1+记忆B细胞作为致病性IgE产生细胞前体在食物过敏中的关键作用,揭示了长期过敏持续性的潜在机制 | 研究主要聚焦于儿童花生过敏,样本来源相对局限,需要进一步验证在其他食物过敏中的普适性 | 探究食物过敏中持续性IgE反应的B细胞记忆机制 | 人类儿童花生过敏患者 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞RNA测序,B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据,血清学数据 | 儿童花生过敏患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1270 | 2025-10-06 |
Understanding the cell fate and behavior of progenitors at the origin of the mouse cardiac mitral valve
2024-02-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.006
PMID:38198889
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和克隆分析揭示了小鼠心脏二尖瓣发育过程中内皮祖细胞的命运决定机制 | 首次定义了二尖瓣祖细胞的代谢过程特征,并揭示了内皮细胞衍生克隆在瓣叶形成中的特异性生长模式 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类或其他物种中验证 | 探究心脏二尖瓣发育过程中内皮祖细胞的命运决定和行为机制 | 小鼠胚胎和出生后二尖瓣的内皮细胞和瓣膜细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 回顾性多色克隆分析 | NA | 基因表达数据, 细胞谱系数据 | 基因标记的内皮细胞和显微解剖的小鼠胚胎及出生后二尖瓣样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1271 | 2025-10-06 |
YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulation in murine bone development
2024-01-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.11.029
PMID:38141609
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研究论文 | 本研究揭示了YAP和TAZ在小鼠骨骼发育过程中协调成骨前体细胞动员与血管生成及力学调控的机制 | 首次发现YAP和TAZ在胚胎骨骼发育中空间耦合成骨前体细胞动员与血管生成,并调控血管形态发生和力学响应 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究胚胎骨骼发育过程中成骨前体细胞动员与血管生成协调作用的分子机制 | 小鼠胚胎骨骼发育过程中的成骨前体细胞和血管系统 | 发育生物学 | 骨骼发育疾病 | 单细胞RNA测序,3D细胞共培养 | NA | 基因表达数据,细胞成像数据 | 小鼠胚胎样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1272 | 2025-10-06 |
Insights into midgut cell types and their crucial role in antiviral immunity in the lepidopteran model Bombyx mori
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1349428
PMID:38420120
|
综述 | 本文综述了鳞翅目模型家蚕中肠细胞类型及其在抗病毒免疫中的关键作用 | 利用前沿单细胞转录组学揭示昆虫中肠细胞中先前未被识别的亚群,并阐明昆虫与高等哺乳动物胃肠道之间的显著相似性 | NA | 探讨昆虫中肠细胞类型在免疫防御中的复杂作用机制 | 家蚕中肠细胞类型(柱状细胞、肠内分泌细胞、杯状细胞和再生细胞) | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1273 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from pregnant women with Systemic lupus erythematosus
2024, International reviews of immunology
IF:4.3Q2
DOI:10.1080/08830185.2024.2376649
PMID:39066603
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析妊娠期系统性红斑狼疮患者外周血单个核细胞的免疫细胞组成和基因表达特征 | 首次在单细胞水平比较妊娠期活动性与非活动性SLE患者的免疫细胞比例和转录模式差异 | 样本量较小(仅12例患者),且未包含健康孕妇对照组 | 阐明妊娠期SLE患者的免疫细胞特征和分子机制 | 系统性红斑狼疮孕妇的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12例SLE患者(包含活动性/非活动性、妊娠/非妊娠分组) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序技术 |
| 1274 | 2025-10-06 |
Immune cell profiling of preeclamptic pregnant and postpartum women by single-cell RNA sequencing
2024, International reviews of immunology
IF:4.3Q2
DOI:10.1080/08830185.2022.2144291
PMID:36369864
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析先兆子痫孕妇和产后妇女的免疫细胞特征 | 首次在单细胞水平系统描绘先兆子痫患者孕期和产后免疫细胞图谱,揭示免疫细胞亚群的异质性和动态变化 | 样本量较小(3例患者和2例对照),仅使用外周血单个核细胞进行研究 | 探究先兆子痫患者免疫系统在单细胞水平的特征和异质性 | 先兆子痫孕妇和健康对照的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例早发性先兆子痫孕妇和2例健康对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 1275 | 2025-10-06 |
Chemokine receptors in primary and secondary lymphoid tissues
2024, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2023.11.003
PMID:39260934
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综述 | 本文综述了趋化因子受体在初级和次级淋巴组织免疫细胞中的存在与功能 | 系统梳理了不同趋化因子受体在淋巴器官中的特异性功能,如CXCR4在骨髓中的作用和CCR7在胸腺及次级淋巴组织中的调控机制 | 主要关注常规趋化因子受体,对非典型受体覆盖有限,且为综述性内容缺乏原始实验数据 | 探讨趋化因子受体在淋巴组织免疫细胞中的分布和功能 | 骨髓、胸腺、脾脏、淋巴结和派尔集合淋巴结等淋巴组织中的免疫细胞 | 免疫学 | NA | 高维光谱流式细胞术、单细胞测序 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1276 | 2025-10-06 |
Divergent WNT signaling and drug sensitivity profiles within hepatoblastoma tumors and organoids
2024-11-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52757-w
PMID:39567475
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肝母细胞瘤的分子异质性和药物敏感性特征 | 首次在肝母细胞瘤中识别出两种具有不同WNT信号模式的肿瘤上皮亚型,并发现它们对特定靶向药物的敏感性差异 | 研究样本量有限,需要更大规模的验证研究 | 表征肝母细胞瘤的分子异质性并识别新的靶向治疗策略 | 肝母细胞瘤组织和肿瘤来源的类器官 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 高通量药物筛选 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据, 药物反应数据 | 肝母细胞瘤组织和肿瘤类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1277 | 2025-10-06 |
Molecular profiles, sources and lineage restrictions of stem cells in an annelid regeneration model
2024-11-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54041-3
PMID:39557833
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和嵌合转基因技术研究海洋环节动物后部再生过程中的细胞谱系和分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序和新型嵌合转基因技术揭示环节动物再生过程中多种细胞群重新出现干细胞特征 | 研究仅限于海洋环节动物模型,结论在其他动物门类的普适性仍需验证 | 探索动物再生能力的分子和细胞机制 | 海洋环节动物Platynereis dumerilii的后部再生过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 嵌合转基因技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1278 | 2025-10-06 |
Single cell and spatial transcriptomics highlight the interaction of club-like cells with immunosuppressive myeloid cells in prostate cancer
2024-11-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54364-1
PMID:39550375
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了前列腺癌中club-like细胞与免疫抑制性髓系细胞的相互作用机制 | 首次在前列腺癌中发现club-like细胞作为上皮细胞亚型在肿瘤微环境中的关键作用,并揭示其与髓源性抑制细胞的关联 | 研究样本量相对有限,机制研究仍需进一步功能验证 | 探索前列腺癌治疗抵抗的肿瘤微环境机制 | 前列腺癌患者肿瘤微环境中的细胞亚群 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据,空间定位数据 | 120名患者 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1279 | 2025-10-06 |
GPRC5A promotes lung colonization of esophageal squamous cell carcinoma
2024-11-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54251-9
PMID:39550386
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现GPRC5A通过调控YAP1信号通路促进食管鳞癌肺转移 | 首次揭示早期播散癌细胞具有滋养层样'肿瘤植入'表型,并发现GPRC5A/WWP1/LATS1/YAP1这一新的转移调控通路 | 机制研究仍需进一步验证,临床样本量有限 | 探索食管鳞癌肺转移的分子机制 | 食管鳞癌细胞和148例ESCC患者 | 癌症生物学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 148例ESCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1280 | 2025-10-06 |
Defective germinal center selection results in persistence of self-reactive B cells from the primary to the secondary repertoire in Primary Antiphospholipid Syndrome
2024-11-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54228-8
PMID:39548093
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术解析原发性抗磷脂综合征中自身反应性B细胞的起源和存活机制 | 首次在人类PAPS中系统追踪自身反应性B细胞从初始到记忆和长寿命浆细胞阶段的全过程,揭示其通过缺陷的生发中心选择而持续存在 | 样本来源仅限于外周血和骨髓,未涉及其他淋巴器官;研究人群为三重阳性PAPS患者,结果可能不适用于所有PAPS亚型 | 阐明原发性抗磷脂综合征中自身反应性B细胞的起源和存活机制 | 原发性抗磷脂综合征患者的B细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, B细胞受体谱分析, CITEseq, 单细胞永生化 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, BCR序列数据 | 三重阳性PAPS患者的外周血和骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |