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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1241 2026-03-21
Cross-talk of pyroptosis-based subtypes, the development of a risk classifier and immune responses in cervical cancer
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究基于焦亡相关基因对宫颈癌进行分型,开发了一个风险分类器,并探讨了其与免疫应答的关系 首次基于焦亡相关基因对宫颈癌进行分子分型,并构建了一个包含四个基因(PEG3、FSCN1、CDH3和SLC2A1)的风险分类器,同时揭示了不同风险组间的免疫微环境差异 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列验证;单细胞测序分析可能受限于样本量和细胞类型覆盖 探索焦亡在宫颈癌中的预后价值及其对免疫代谢的调控作用 宫颈癌患者样本和细胞系 生物信息学与计算生物学 宫颈癌 单细胞测序、PCR、CIBERSORT算法、无监督聚类分析、逐步Cox回归 风险分类器(基于Cox回归) 基因表达数据、单细胞测序数据、临床生存数据 两个独立队列共501例宫颈癌样本(C1组259例,C2组242例) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1242 2026-03-21
Single-cell RNA sequencing reveals the mechanism of PI3K/AKT/mTOR signaling pathway activation in lung adenocarcinoma by KRAS mutation
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了KRAS突变在肺腺癌中激活PI3K/AKT/mTOR信号通路的机制 首次在单细胞水平上结合KRAS突变状态分析PI3K/AKT/mTOR通路活性,并识别出GRB2+上皮细胞亚群作为关键靶点 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明 探究KRAS突变对肺腺癌中PI3K/AKT/mTOR信号通路活性的影响机制 肺腺癌患者单细胞RNA测序数据及TCGA数据集中的基因表达和突变谱 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 Seurat包、主成分分析、AUCell评分、基因集富集分析、inferCNV包 单细胞RNA测序数据、基因表达谱、突变谱 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1243 2026-03-21
COL3A1-positive endothelial cells influence LUAD prognosis and regulate LUAD carcinogenesis by NCL-PI3K-AKT axis
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了COL3A1阳性内皮细胞在肺腺癌发生发展及免疫微环境形成中的关键作用,并鉴定出关键靶基因NCL通过PI3K-AKT通路调控癌细胞凋亡与增殖 首次在单细胞水平系统解析了COL3A1阳性内皮细胞亚群在肺腺癌中的独特功能,发现其通过NCL-PI3K-AKT轴调控肿瘤发生的新机制 研究样本量较小(16例),功能验证主要在细胞系水平进行,缺乏体内实验验证 探究肺腺癌中内皮细胞异质性及其在肿瘤发生和微环境形成中的作用机制 肺腺癌患者样本(16例)及A549、NCI-H1299肺腺癌细胞系 数字病理 肺癌 单细胞RNA测序,伪时间分析,细胞通讯分析,基因调控网络分析,流式细胞术,Western blot,EdU染色,Ki-67染色 NA 单细胞RNA测序数据,转录组数据,蛋白质印迹数据 16例肺腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1244 2026-03-21
Cytotoxic T-lymphocytes in acute myeloid leukemia: Monitoring prognosis and guiding treatment choice
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究探讨了细胞毒性T淋巴细胞(CTLs)在急性髓系白血病(AML)中的作用,并基于其细胞遗传学标志物构建了一个随机森林模型,用于预后分层和治疗选择指导 通过单细胞RNA测序数据识别了CTLs在AML细胞通讯中的核心作用,并利用随机森林模型基于CTLs标志基因进行预后评估和免疫治疗响应预测 研究基于公开数据集GSE116256,样本来源和数量可能有限,且模型需进一步验证 理解CTLs在AML预后监测和临床治疗响应中的作用,并开发预测模型 急性髓系白血病(AML)患者 数字病理学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 随机森林 单细胞RNA测序数据 基于GSE116256数据集,具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1245 2026-03-21
Machine learning reveals PANoptosis as a potential reporter and prognostic revealer of tumour microenvironment in lung adenocarcinoma
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合多种细胞死亡模式构建PANoptosis基因集,利用单细胞RNA-seq数据分析肺腺癌样本,建立风险模型并验证其预后价值及与肿瘤微环境的关联 首次将铁死亡、铜死亡、焦亡、坏死性凋亡和双硫死亡整合为PANoptosis基因集,并应用于肺腺癌的单细胞分析,揭示了其与肿瘤免疫微环境的潜在联系 研究仅基于11个肺腺癌样本的单细胞数据,样本量较小,且细胞验证仅限于两种肺腺癌细胞系 探究PANoptosis在肺腺癌中的表达模式及其作为预后生物标志物和肿瘤微环境调节因子的潜力 肺腺癌患者样本及两种肺腺癌细胞系 机器学习 肺腺癌 单细胞RNA测序 LASSO回归、COX回归 单细胞RNA-seq数据 11个肺腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1246 2026-03-21
Immune infiltration and clinical significance analyses of the cancer-associated fibroblast-related signature in skin cutaneous melanoma
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究构建了一个与癌症相关成纤维细胞(CAF)相关的10基因特征模型,用于预测皮肤黑色素瘤(SKCM)患者的预后、免疫景观及对化疗/免疫疗法的反应 基于单细胞转录组分析和加权基因共表达分析,首次构建了针对皮肤黑色素瘤的CAF相关预后特征模型,并揭示了其与免疫抑制及治疗反应的关系 研究主要基于TCGA和GEO的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证;模型在外部独立队列中的验证尚不充分 建立CAF相关特征模型,为皮肤黑色素瘤患者的预后评估和治疗方案选择提供新视角 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者 生物信息学 皮肤黑色素瘤 单细胞转录组分析,加权基因共表达分析(WGCNA) 预后特征模型(10基因模型) 基因表达数据 TCGA-SKCM队列中的样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1247 2026-03-21
Exploring the mechanism underlying the therapeutic effects of butein in colorectal cancer using network pharmacology and single-cell RNA sequencing data
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究结合网络药理学和单细胞RNA测序数据,探索了紫铆因在结直肠癌中的治疗机制,并识别出UBE2C作为潜在的生物标志物 首次将网络药理学与单细胞RNA测序分析相结合,系统性地揭示紫铆因在结直肠癌中的作用机制,并利用机器学习筛选出关键生物标志物UBE2C 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏体内或体外实验的直接验证,且单细胞数据样本来源和数量有限 阐明紫铆因在结直肠癌中的治疗作用机制,并寻找潜在的生物标志物 结直肠癌相关的基因、信号通路和细胞类型 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序、网络药理学、机器学习、差异表达分析、WGCNA 机器学习(未指定具体模型)、MCODE、ROC曲线分析 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 使用了GSE38026、GSE222300(单细胞数据集)和GSE40967(外部验证数据集)等多个公共数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1248 2026-03-21
Prognosis and therapy in thyroid cancer by gene signatures related to natural killer cells
2024-01, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,开发了与自然杀伤细胞相关的基因风险特征,用于预测甲状腺癌的预后 首次利用自然杀伤细胞相关基因KLF2、OSTF1和TAPBP构建甲状腺癌预后风险特征,为甲状腺癌的预后评估和治疗提供了新视角 研究样本量有限,仅基于TCGA-THCA队列和少量单细胞数据,需要进一步的外部验证 开发与自然杀伤细胞相关的可靠风险特征,以预测甲状腺癌的预后和指导免疫治疗 甲状腺癌患者,包括7个单细胞RNA测序样本和502个批量RNA测序患者数据 生物信息学 甲状腺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 LASSO Cox回归模型 RNA测序数据 7个单细胞样本和502个批量RNA测序患者 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
1249 2026-03-20
The astrocyte-enriched gene deathstar plays a crucial role in the development, locomotion, and lifespan of D. melanogaster
2024-12, Fly IF:2.4Q3
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,在果蝇大脑中鉴定出一个星形胶质细胞富集表达的新基因deathstar,并揭示了其在个体发育、运动能力和寿命中的关键作用 首次在果蝇中鉴定出星形胶质细胞特异性表达的新基因deathstar,并系统阐明了其在发育、运动行为和寿命调控中的生理功能 研究主要基于果蝇模型,其发现向哺乳动物系统的直接推广性有待验证;RNA干扰技术可能存在脱靶效应 探究果蝇大脑星形胶质细胞特异性表达基因的功能及其在生理和行为调控中的作用 黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)的大脑组织,特别是星形胶质细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,RNA干扰,免疫染色 NA 单细胞基因表达数据,图像数据 果蝇视叶和全脑的单细胞RNA测序数据,转基因成年果蝇脑组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1250 2026-03-20
Optimization of hybridization chain reaction for imaging single RNA molecules in Drosophila larvae
2024-12, Fly IF:2.4Q3
研究论文 本文提出了一种优化的杂交链式反应(HCR)流程,用于在果蝇幼虫中实现单RNA分子的成像 开发了优化的HCR探针设计开源代码,仅需五对探针即可实现高特异性、高灵敏度且可多重检测的RNA可视化,显著降低了实验成本和时间 未明确说明该方法在其他生物体系或更复杂组织中的适用性,也未提供与其他现有成像方法的定量比较数据 优化单RNA分子成像技术,以支持基于单细胞RNA测序数据的筛选项目 果蝇幼虫中的特定RNA分子 分子成像 NA 杂交链式反应(HCR) NA 图像 NA NA NA NA NA
1251 2026-03-20
FAT1 as a tumor mutation burden specific gene affects the immunotherapy effect in head and neck squamous cell cancer
2024-09, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了FAT1基因突变作为头颈部鳞状细胞癌中肿瘤突变负荷的特异性标志物,及其对免疫治疗效果的影响 首次在头颈部鳞状细胞癌中揭示FAT1基因突变与高肿瘤突变负荷及免疫治疗耐药性的特异性关联,并利用单细胞RNA测序技术解析了高TMB样本中免疫微环境的特征细胞群 样本量较小(仅33例患者),且为单中心研究,需要更大规模的多中心队列进行验证 探究头颈部鳞状细胞癌中肿瘤突变负荷的特异性遗传突变及其对免疫治疗反应的影响机制 头颈部鳞状细胞癌患者 肿瘤免疫学 头颈部鳞状细胞癌 二代测序,单细胞RNA测序,转录组分析 NA 基因组测序数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 33例头颈部鳞状细胞癌患者 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1252 2026-03-20
A distinct subset of urothelial cells with enhanced EMT features promotes chemotherapy resistance and cancer recurrence by increasing COL4A1-ITGB1 mediated angiogenesis
2024-09, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序在尿路上皮癌中发现了一个具有上皮-间质转化特征的细胞亚群,该亚群通过介导COL4A1-ITGB1相互作用促进血管生成,从而导致化疗耐药和癌症复发 首次在尿路上皮癌中通过单细胞RNA测序鉴定出具有EMT特征的特定尿路上皮细胞亚群,并揭示了其通过COL4A1-ITGB1相互作用介导血管生成和化疗耐药的新机制 研究未明确说明单细胞测序样本的具体数量,且EMT-UC样细胞是通过过表达ZEB1和DES构建的,可能与体内天然存在的EMT-UC存在差异 探究尿路上皮癌化疗耐药和肿瘤复发的潜在机制 尿路上皮癌患者组织样本、构建的EMT-UC样细胞 单细胞组学 尿路上皮癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1253 2026-03-20
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2024-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为PreTSA的计算方法,用于高效建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时空基因表达模式 PreTSA在保持与最先进方法结果一致的同时,显著减少了计算时间,为研究极大数据集中的基因表达模式提供了独特解决方案 NA 开发一种计算高效的方法来建模时空基因表达模式 大规模单细胞和空间转录组数据 数字病理学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 基因表达数据 数百万个细胞 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1254 2026-03-20
Single-cell RNA-seq revealed heterogeneous responses and functional differentiation of hemocytes against white spot syndrome virus infection in Litopenaeus vannamei
2024-03-19, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了南美白对虾血细胞在感染白斑综合征病毒后的异质性反应和功能分化 首次应用单细胞RNA测序技术绘制对虾血细胞在病毒感染下的转录组图谱,并识别出16个转录不同的细胞簇,揭示了血细胞在抗病毒免疫反应中的功能分化 研究仅关注白斑综合征病毒感染,未涉及其他病原体或环境因素对血细胞反应的影响 探究对虾血细胞在病毒感染下的免疫反应机制和功能分化 南美白对虾的血细胞 单细胞转录组学 病毒感染 单细胞RNA测序 无监督伪时间分析 转录组数据 健康与感染白斑综合征病毒的对虾血细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1255 2026-03-20
Drug resistance mechanisms in dopamine agonist-resistant prolactin pituitary neuroendocrine tumors and exploration for new drugs
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了多巴胺激动剂耐药性催乳素垂体神经内分泌肿瘤的耐药机制,并通过类器官模型筛选出潜在有效药物金雀异黄素 首次结合转录组测序和单细胞测序分析催乳素瘤的DA耐药机制,并成功建立DA耐药催乳素瘤类器官模型进行药物筛选 样本量相对较小(27例耐药和10例敏感肿瘤),类器官模型仅使用8个进行药物筛选 探究多巴胺激动剂耐药性催乳素瘤的耐药机制并寻找新的潜在治疗药物 多巴胺激动剂耐药性和敏感性的催乳素垂体神经内分泌肿瘤 数字病理学 垂体肿瘤 转录组测序,单细胞测序,类器官培养,药物筛选 类器官模型 RNA测序数据,单细胞测序数据,体外实验数据 27例DA耐药催乳素瘤,10例敏感催乳素瘤,3例耐药和3例敏感肿瘤进行单细胞测序,8个类器官用于药物筛选 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
1256 2026-03-20
MAFF confers vulnerability to cisplatin-based and ionizing radiation treatments by modulating ferroptosis and cell cycle progression in lung adenocarcinoma
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过CRISPR筛选和单细胞RNA测序,发现MAFF在肺腺癌中通过调控铁死亡和细胞周期进程,影响肿瘤生长和对顺铂及电离辐射治疗的敏感性 首次将MAFF识别为肺腺癌中调控铁死亡和细胞周期进程的关键因子,并揭示其通过cAMP/PKA/CREB1通路上调,增强肿瘤对顺铂和电离辐射治疗的脆弱性 研究主要基于细胞和异种移植模型,临床样本验证有限,且MAFF的药理学激动剂开发尚未在人体试验中验证 探索肺腺癌中肿瘤生长和治疗抵抗的机制,以改善顺铂和电离辐射治疗的效果 肺腺癌细胞系、小鼠模型和患者样本 癌症生物学 肺癌 CRISPR筛选、单细胞RNA测序、RNA测序、ChIP测序 细胞模型、异种移植模型 基因表达数据、转录组数据 未明确指定样本数量,涉及细胞和动物模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1257 2026-03-20
The role of histone H1.2 in pancreatic cancer metastasis and chemoresistance
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了组蛋白H1.2在胰腺癌转移和化疗耐药中的作用,并开发了一个基于基因表达的评分系统来预测患者生存 开发了一个新颖的转移和化疗耐药特征评分系统,并首次将组蛋白H1.2与c-MYC信号通路在胰腺癌中的调控联系起来 研究主要基于基因表达数据和实验模型,临床验证和机制细节有待进一步探索 探索胰腺癌化疗耐药与肿瘤转移之间的关联及其分子细胞机制 胰腺癌患者基因表达数据、单细胞RNA测序数据以及体外和体内实验模型 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、基因表达分析、体外增殖、侵袭、迁移、药物敏感性实验、免疫组织化学 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1258 2026-03-20
Single-cell transcriptome analysis reveals the association between histone lactylation and cisplatin resistance in bladder cancer
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了膀胱癌中组蛋白乳酸化与顺铂耐药之间的关联 首次在单细胞层面揭示了H3K18乳酸化通过富集于靶基因启动子区域激活转录,从而驱动膀胱癌顺铂耐药的新机制,并鉴定出YBX1和YY1为关键转录因子 未在文中明确说明,可能包括样本量有限、机制验证主要在细胞层面进行、临床转化潜力需进一步验证等 探究膀胱癌顺铂耐药的分子机制,特别是组蛋白乳酸化在其中的作用 膀胱癌细胞 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1259 2026-03-19
Integrating Bulk RNA and Single-Cell RNA Sequencing Identifies and Validates Lactylation-Related Signatures for Intervertebral Disc Degeneration
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过整合Bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,揭示了乳酸化修饰与椎间盘退变(IVDD)的正相关性,建立了乳酸化相关基因(LRGs)特征,并验证了CBX3作为关键靶点及其抑制剂醋酸阿托西班的治疗潜力 首次系统性地整合Bulk和单细胞RNA-seq数据解析IVDD中的乳酸化修饰机制,鉴定出6个核心LRGs并发现CBX3的关键作用,首次提出醋酸阿托西班作为CBX3特异性抑制剂可通过调控乳酸化缓解IVDD进展 研究主要基于生物信息学分析和体外/体内实验验证,缺乏大规模临床队列验证;醋酸阿托西班的具体作用机制和长期疗效仍需进一步研究 探究乳酸化修饰在椎间盘退变(IVDD)中的作用机制,并寻找潜在的治疗靶点和生物标志物 椎间盘退变(IVDD)相关的基因表达数据和细胞/动物模型 生物信息学 椎间盘退变 Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接, 体外实验, 体内实验 NA 基因表达数据 多个Bulk RNA-seq数据集(未明确样本数量),包含体内和体外实验样本 NA 单细胞RNA-seq, Bulk RNA-seq NA NA
1260 2026-03-19
Robust identification of perturbed cell types in single-cell RNA-seq data
2024-09-01, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为scDist的计算工具,用于在单细胞RNA-seq数据中稳健地识别受扰动的细胞类型 基于混合效应模型,提供统计严谨且计算高效的方法,以克服个体和队列变异导致的假阳性问题 未在摘要中明确提及 检测单细胞转录组数据中因疾病或条件变化而改变的细胞类型 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型,特别是免疫细胞如树突状细胞、浆细胞样树突状细胞和FCER1G+NK细胞 单细胞转录组学 COVID-19 单细胞RNA-seq 混合效应模型 单细胞转录组数据 未在摘要中明确提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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