单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7855 篇文献，本页显示第 1241 - 1260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2024-12-01 |
Integration of Machine Learning and Experimental Validation to Identify Anoikis-Related Prognostic Signature for Predicting the Breast Cancer Tumor Microenvironment and Treatment Response
2024-Nov-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15111458
PMID:39596658
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研究论文 | 本文通过整合机器学习方法和实验验证，生成了一个与细胞凋亡相关的预后标志物，用于预测乳腺癌的肿瘤微环境和治疗反应 | 首次生成了一个基于细胞凋亡相关基因的预后标志物，并验证了其在乳腺癌患者中的独立预后价值 | 样本量较小，需要进一步的大规模验证 | 研究细胞凋亡相关基因在乳腺癌预后中的作用，并开发新的预后标志物 | 乳腺癌患者的肿瘤微环境、药物敏感性和免疫治疗反应 | 机器学习 | 乳腺癌 | RT-PCR、Western blot分析、酶联免疫吸附测定 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1242 | 2024-12-01 |
PRMT5/WDR77 Enhances the Proliferation of Squamous Cell Carcinoma via the ΔNp63α-p21 Axis
2024-Nov-11, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16223789
PMID:39594744
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研究论文 | 研究探讨了PRMT5和WDR77在鳞状细胞癌（SCC）增殖中的作用及其机制 | 首次揭示了PRMT5和WDR77通过ΔNp63α-p21轴促进SCC增殖的机制 | NA | 探讨PRMT5和WDR77在鳞状细胞癌增殖中的作用及其分子机制 | PRMT5、WDR77、ΔNp63α和p21在鳞状细胞癌中的调控作用 | NA | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot分析 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和DepMap的鳞状细胞癌患者数据 |
| 1243 | 2024-12-01 |
Characterization and Experimental Use of Multiple Myeloma Bone Marrow Endothelial Cells and Progenitors
2024-Nov-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252212047
PMID:39596117
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研究论文 | 本研究分析了公开的单细胞RNA测序数据，以识别多发性骨髓瘤（MM）患者和健康供体中内皮细胞（ECs）的独特通路激活，并开发了一种从MM患者骨髓中分离和培养内皮祖细胞（EPCs）和ECs的新方法 | 本研究首次开发了一种从多发性骨髓瘤患者骨髓中分离和培养内皮祖细胞和内皮细胞的新方法，并验证了这些细胞在促进骨髓瘤细胞增殖中的作用 | NA | 研究多发性骨髓瘤骨髓微环境中内皮细胞的作用及其在肿瘤进展中的潜在治疗靶点 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓内皮细胞和内皮祖细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1244 | 2024-12-01 |
Spatiotemporal Cellular Dynamics of Germinal Center Reaction in Coronavirus Disease 2019 Lung-Draining Lymph Node Based on Imaging-Based Spatial Transcriptomics
2024-Nov-09, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.102180
PMID:39522760
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研究论文 | 本研究利用基于成像的空间转录组学技术，探讨了在COVID-19康复期和再感染期间，非人灵长类动物肺引流淋巴结中生发中心的时空细胞动力学及其对免疫记忆的影响 | 首次通过空间转录组学技术详细描述了COVID-19康复期和再感染期间肺引流淋巴结中生发中心的形成及其免疫细胞动力学 | 研究仅限于非人灵长类动物模型，结果的直接临床应用可能有限 | 阐明SARS-CoV-2感染后淋巴结构恢复的细微差别及其对免疫记忆的影响 | 非人灵长类动物肺引流淋巴结中的生发中心和免疫细胞 | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 非人灵长类动物样本 |
| 1245 | 2024-12-01 |
Interpretable machine learning uncovers epithelial transcriptional rewiring and a role for Gelsolin in COPD
2024-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.180239
PMID:39352744
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研究论文 | 本文利用无监督和有监督的可解释机器学习分析单细胞RNA测序数据，揭示了慢性阻塞性肺病（COPD）中上皮细胞转录重编程及Gelsolin的作用 | 本文首次通过机器学习方法识别出与COPD病理生理相关的潜在因素，并揭示了Gelsolin在疾病中的新作用 | 研究主要基于小鼠烟雾暴露模型和人类COPD样本，可能存在种属差异和样本量有限的问题 | 揭示COPD中未知的生物学机制 | COPD患者的肺部上皮细胞及Gelsolin蛋白 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序 | 无监督和有监督机器学习 | RNA测序数据 | 小鼠烟雾暴露模型及人类COPD患者样本 |
| 1246 | 2024-12-01 |
Inhibition of Bruton's tyrosine kinase with PD-1 blockade modulates T cell activation in solid tumors
2024-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169927
PMID:39513363
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研究论文 | 研究了使用ibrutinib抑制Bruton酪氨酸激酶与nivolumab联合治疗转移性实体瘤的效果 | 首次探讨了ibrutinib与nivolumab联合使用对MDSC和T细胞功能的影响 | 样本量较小，仅涉及16名患者 | 评估ibrutinib与nivolumab联合治疗对转移性实体瘤患者MDSC和T细胞功能的影响 | 转移性实体瘤患者 | NA | 实体瘤 | 单细胞RNA测序和T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据和细胞数据 | 16名患者 |
| 1247 | 2024-12-01 |
Thrombopoietin mimetic reduces mouse lung inflammation and fibrosis after radiation by attenuating activated endothelial phenotypes
2024-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181330
PMID:39513364
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研究论文 | 研究了血小板生成素模拟物（TPOm）在预防放射性肺损伤（RILI）中的机制和有效性 | 首次揭示了TPOm通过抑制内皮细胞激活来保护RILI | 研究仅在老鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探讨TPOm在预防放射性肺损伤中的作用机制 | 放射性肺损伤（RILI）及其对肺部炎症和纤维化的影响 | NA | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用全胸照射（WTI）小鼠模型进行研究 |
| 1248 | 2024-12-01 |
Addressing the mean-variance relationship in spatially resolved transcriptomics data with spoon
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.04.621867
PMID:39574747
|
研究论文 | 本文探讨了空间转录组学数据中基因表达的均值-方差关系，并提出了一种名为spoon的统计框架来消除这种偏差 | 提出了spoon统计框架，利用经验贝叶斯技术消除空间转录组学数据中的均值-方差关系偏差 | NA | 识别空间变异基因（SVGs）并消除技术偏差 | 空间转录组学数据中的基因表达 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 经验贝叶斯 | 转录组数据 | 模拟数据和真实空间转录组数据 |
| 1249 | 2024-12-01 |
FOXP Genes Regulate Purkinje Cell Diversity in Cerebellar Development and Evolution
2024-Nov-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.07.622485
PMID:39574602
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研究论文 | 研究探讨了FOXP基因在哺乳动物小脑发育中调节浦肯野细胞多样性的关键作用 | 通过单细胞RNA测序和一种新的无监督方法，识别了胚胎小鼠小脑中的11种浦肯野细胞亚型，并揭示了这些亚型与成年小脑组织结构的关系 | NA | 揭示FOXP基因在小脑发育和进化中调节浦肯野细胞多样性的机制 | 哺乳动物小脑中的浦肯野细胞及其亚型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胚胎小鼠小脑中的浦肯野细胞 |
| 1250 | 2024-12-01 |
Spatial Transcriptomics and Single-Nucleus Multi-Omics Analysis Revealing the Impact of High Maternal Folic Acid Supplementation on Offspring Brain Development
2024-Nov-07, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu16223820
PMID:39599606
|
研究论文 | 研究探讨了高剂量叶酸补充对母体怀孕期间后代大脑发育的影响 | 采用空间转录组学和单核多组学方法，揭示了高剂量叶酸补充对后代大脑发育的具体影响区域和基因通路 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 研究高剂量叶酸补充对后代大脑发育的影响 | 小鼠后代大脑发育 | 基因组学 | NA | 空间转录组学、单核多组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 1251 | 2024-12-01 |
The MRAP2 accessory protein directly interacts with melanocortin-3 receptor to enhance signaling
2024-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.06.622243
PMID:39574659
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研究论文 | 研究探讨了MRAP2辅助蛋白与黑皮质素-3受体（MC3R）的直接相互作用及其对信号传导的影响 | 首次使用单分子拉下技术（SiMPull）证实了MC3R和MRAP2在HEK293细胞中的相互作用，并揭示了MRAP2对MC3R信号传导的增强作用 | 研究主要在HEK293细胞中进行，未来需要在更多生理相关的细胞类型中验证结果 | 探究MRAP2辅助蛋白与MC3R的相互作用及其对能量稳态和食欲控制的影响 | MRAP2辅助蛋白和黑皮质素-3受体（MC3R） | NA | 肥胖 | 单分子拉下技术（SiMPull）、单核和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用HEK293细胞进行实验，具体样本数量未明确提及 |
| 1252 | 2024-12-01 |
Illumina SBS Sequencing and DNBSEQ Perform Similarly for Single-Cell Transcriptomics
2024-Nov-06, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15111436
PMID:39596636
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研究论文 | 比较了Illumina SBS和DNBSEQ在单细胞转录组测序中的性能 | 发现DNBSEQ在某些指标上略优于Illumina SBS，但两者在单细胞分析参数上表现相当 | 研究仅限于小鼠scRNA-seq库，未涵盖其他物种或数据类型 | 评估不同测序技术在单细胞转录组测序中的性能 | 小鼠单细胞转录组测序库 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠scRNA-seq库 |
| 1253 | 2024-12-01 |
Exploring Extracellular Vesicle Surface Protein Markers Produced by Glioblastoma Tumors: A Characterization Study Using In Vitro 3D Patient-Derived Cultures
2024-Nov-06, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16223748
PMID:39594703
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研究论文 | 研究使用体外3D患者来源的胶质母细胞瘤肿瘤培养物，探索外泌体表面蛋白标记物 | 创新点在于从忠实模拟肿瘤原始细胞结构的模型中分离外泌体，提供对参与外泌体释放的细胞的更深入理解 | NA | 研究目的是使用肿瘤来源的移植体调查外泌体的表面标记物，并探索其作为胶质母细胞瘤诊断生物标志物的角色 | 研究对象是胶质母细胞瘤肿瘤来源的外泌体表面蛋白标记物 | NA | 脑癌 | 外泌体分离、蛋白质分析、RNA测序 | NA | 蛋白质、RNA | 九名无IDH1/IDH2突变或1p-19q共缺失的胶质母细胞瘤患者 |
| 1254 | 2024-12-01 |
NF-ΚB Activation as a Key Driver in Chronic Lymphocytic Leukemia Evolution to Richter's Syndrome: Unraveling the Influence of Immune Microenvironment Dynamics
2024-Nov-05, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15111434
PMID:39596634
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研究论文 | 研究探讨了NF-κB通路在慢性淋巴细胞白血病（CLL）向Richter综合征（RS）进展中的作用及其机制 | 揭示了RS中NF-κB通路的活性状态及其在CLL向RS演变中的关键作用 | 研究样本量较小，仅涉及四名CLL-RS患者 | 阐明NF-κB激活的触发因素及其在CLL向RS进展中的动态变化 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）及其向Richter综合征（RS）的进展 | NA | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四名CLL-RS患者的外周血样本 |
| 1255 | 2024-12-01 |
Meta-atlas of Juvenile and Adult Enteric Neuron scRNA-seq for Dataset Comparisons and Consensus on Transcriptomic Definitions of Enteric Neuron Subtypes
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.31.621315
PMID:39574584
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综述 | 本文系统回顾了小鼠单细胞或单核RNA测序的肠神经系统数据集，并通过重新处理和计算整合这些独立的数据集，旨在识别新的细胞类型、共享标记基因以及达成肠神经元亚型转录组定义的共识 | 通过数据聚合生成肠神经元类型的共识视图，并提高稀有神经元类别的分辨率 | 未来研究面临将这些深度转录组数据与历史分类系统相连接的挑战 | 系统回顾和整合小鼠肠神经系统的单细胞RNA测序数据，以识别新的细胞类型和达成转录组定义的共识 | 小鼠肠神经系统的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 数百到数百万个单细胞 |
| 1256 | 2024-12-01 |
Molecular Signatures of Resilience to Alzheimer's Disease in Neocortical Layer 4 Neurons
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.03.621787
PMID:39574639
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研究论文 | 研究通过单细胞组学技术分析阿尔茨海默病中不同神经元的脆弱性和抗性特征 | 首次通过单核和空间转录组学技术，比较了阿尔茨海默病早期和晚期受影响的皮质区域，识别出在初级视觉皮质层4中表达特定基因的抗性兴奋性神经元群体 | 研究主要集中在初级视觉皮质层4的神经元，未涵盖其他脑区的神经元抗性机制 | 探讨阿尔茨海默病中神经元的抗性机制 | 阿尔茨海默病中不同皮质区域层4神经元的抗性特征 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞组学技术 | NA | 基因表达数据 | 涉及阿尔茨海默病早期和晚期受影响的皮质区域的神经元样本 |
| 1257 | 2024-12-01 |
Exercise Induced Endothelial Mesenchymal Transition (EndMT) Facilitates Meniscal Fibrocartilage Regeneration
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403788
PMID:39344749
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研究论文 | 研究展示了内皮间充质转化（EndMT）在膝关节半月板再生中的作用 | 开发了一种手持式生物打印系统，用于手术中制造多孔半月板支架，并结合术后定期运动刺激，促进了羊模型中半月板纤维软骨组织的再生 | 研究主要在羊模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 开发一种有效的转化策略，促进半月板再生，特别是在广泛损伤或退化的情况下 | 膝关节半月板及其再生 | 生物医学工程 | 关节疾病 | 内皮间充质转化（EndMT）、单细胞RNA测序、免疫荧光共染色 | NA | 组织 | 羊模型 |
| 1258 | 2024-11-19 |
General-purpose pre-trained large cellular models for single-cell transcriptomics
2024-Nov, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae340
PMID:39555105
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1259 | 2024-12-01 |
Population-Level Cell Trajectory Inference Based on Gaussian Distributions
2024-Nov-01, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111396
PMID:39595573
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研究论文 | 本文介绍了一种基于高斯分布的细胞轨迹推断方法CPvGTI，通过高斯混合模型和期望最大化算法优化细胞群体，并结合RNA速度进行高斯过程回归分析 | 提出了一种新的基于高斯分布的细胞轨迹推断方法CPvGTI，该方法在处理高维、高噪声的单细胞数据时表现优异 | NA | 解决现有细胞轨迹推断方法在处理高维、高噪声单细胞数据时的不足 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高斯混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | 四个结构多样的模拟数据集和四个真实数据集 |
| 1260 | 2024-12-01 |
Glycoengineered extracellular vesicles released from antibacterial hydrogel facilitate diabetic wound healing by promoting angiogenesis
2024-Nov, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70013
PMID:39600241
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研究论文 | 研究了一种新型水凝胶敷料，通过糖基化工程化的细胞外囊泡促进糖尿病伤口愈合 | 开发了一种包含糖基化工程化细胞外囊泡和抗菌水凝胶的新型敷料，显著提高了糖尿病伤口的愈合效果 | 研究主要在体外和小鼠实验中进行，尚未在临床上验证 | 探索新型水凝胶敷料在治疗感染性糖尿病伤口中的潜力 | 糖尿病伤口、细胞外囊泡、水凝胶敷料 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | RNA | 小鼠实验 |