单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 1241 - 1260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal modulation of growth factors directs the generation of multilineage mouse embryonic stem cell-derived mammary organoids
2024-01-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.003
PMID:38159568
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研究论文 | 通过时空调控生长因子实现了小鼠胚胎干细胞向多谱系乳腺类器官的定向分化 | 首次通过BMP4和PTHrP的顺序激活及hedgehog信号抑制，将皮肤类器官模型中的间充质转化为乳腺特异性间充质 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞模型，尚未在人类细胞中验证 | 开发能够模拟乳腺发育的多谱系类器官模型 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1242 | 2025-10-06 |
In-depth transcriptomic analysis of Anopheles gambiae hemocytes uncovers novel genes and the oenocytoid developmental lineage
2024-Jan-19, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-09986-6
PMID:38243165
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研究论文 | 通过深度转录组分析揭示了冈比亚按蚊血细胞的基因表达特征和细胞发育谱系 | 发现了4020个新基因和20008个新转录本异构体，鉴定了一个新的前血细胞前体细胞类型，明确了卵血细胞来源于前血细胞的发育路径 | 血细胞仅占昆虫总细胞的极小部分，研究主要基于成年雌蚊样本 | 构建冈比亚按蚊血细胞的全面转录组图谱，研究血细胞分化和免疫功能 | 冈比亚按蚊成年雌蚊的血细胞 | 转录组学 | NA | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 伪时序分析 | Monocle 3, 单细胞分析工具 | RNA测序数据 | 基于约24亿条Illumina短读长和940万条PacBio长读长高质量序列 | Illumina, PacBio | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina测序平台, PacBio测序平台 | 短读长Illumina测序和长读长PacBio测序技术 |
| 1243 | 2025-10-06 |
PancrESS - a meta-analysis resource for understanding cell-type specific expression in the human pancreas
2024-Jan-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-09964-y
PMID:38238687
|
研究论文 | 开发了一个用于理解人类胰腺细胞类型特异性表达的元分析资源和工具 | 整合了多个胰腺单细胞RNA测序数据集，提供了参考转录组丰度和细胞类型特异性指标的数据库，并开发了可直接处理原始计数数据的通用工具 | NA | 理解人类胰腺细胞类型特异性转录程序，促进胰腺疾病治疗方法的开发 | 人类胰腺单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序 | 元分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1244 | 2025-10-06 |
Expansion of highly interferon-responsive T cells in early-onset Alzheimer's disease
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559634
PMID:37823036
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现早发性阿尔茨海默病患者外周血中干扰素信号相关基因高表达的T细胞显著扩增 | 首次在早发性阿尔茨海默病患者中发现干扰素信号相关基因高表达的抗病毒样T细胞群显著扩增 | 样本量有限，需要进一步研究确认这些细胞在神经退行性疾病中的具体作用机制 | 探究早发性阿尔茨海默病的免疫反应特征 | 早发性阿尔茨海默病患者和临床正常对照者的外周血单核细胞及CD4 T细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 微滴数字PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 约182,000个外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1245 | 2025-10-06 |
Deciphering maternal-fetal cross-talk in the human placenta during parturition using single-cell RNA sequencing
2024-01-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adh8335
PMID:38198568
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析人类胎盘在分娩过程中母胎交流的细胞机制 | 首次建立人类胎盘单细胞图谱，揭示分娩过程中母胎细胞类型的转录组变化及细胞间通讯网络 | 研究主要关注足月分娩，对早产机制的分析仍需进一步验证 | 阐明分娩过程中母胎交流的细胞和分子机制 | 人类胎盘组织中的母体和胎儿细胞 | 单细胞组学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胎盘组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1246 | 2025-10-06 |
Dynamics of Endothelial Cell Generation and Turnover in Arteries During Homeostasis and Diseases
2024-01-09, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种遗传增殖追踪系统，用于定量分析动脉内皮细胞在稳态和疾病状态下的生成动态和细胞分裂方向 | 开发了基于Cre-loxP和Dre-rox的双重组系统，实现了体内内皮细胞增殖的无缝时间记录 | 研究主要针对小鼠大血管，对人类血管的适用性需要进一步验证 | 揭示动脉内皮细胞在稳态和疾病状态下的生成动态和调控机制 | 小鼠动脉内皮细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，基因敲除，遗传增殖追踪 | NA | 基因表达数据，细胞增殖数据 | 成年小鼠主动脉内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1247 | 2025-10-06 |
BACH1 promotes tissue necrosis and Mycobacterium tuberculosis susceptibility
2024-Jan, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01523-7
PMID:38066332
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研究论文 | 研究发现转录因子BACH1通过调控铁死亡促进结核分枝杆菌感染的组织坏死和宿主易感性 | 首次揭示BACH1通过抑制抗氧化基因表达调控铁死亡过程，从而影响结核分枝杆菌感染的宿主抵抗机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究BACH1在结核分枝杆菌感染中对宿主抵抗力的调控机制 | 小鼠模型、巨噬细胞、肺组织 | 分子生物学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 多个小鼠模型组（包括Bach1敲除和B6.Sst1小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1248 | 2025-10-06 |
Dandelion uses the single-cell adaptive immune receptor repertoire to explore lymphocyte developmental origins
2024-Jan, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01734-7
PMID:37055623
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研究论文 | 介绍用于单细胞V(D)J测序数据分析的计算流程Dandelion | 开发了能够改进V(D)J重叠群注释并识别非生产和部分剪接重叠群的单细胞分析流程，创建了可用于差异V(D)J使用分析和伪时间轨迹推断的AIR特征空间 | NA | 探索淋巴细胞发育起源 | 淋巴细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞V(D)J测序(scVDJ-seq), 单细胞RNA测序 | 计算流程 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞V(D)J测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1249 | 2025-10-06 |
MICA: a multi-omics method to predict gene regulatory networks in early human embryos
2024-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302415
PMID:37879938
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研究论文 | 开发了一种名为MICA的多组学方法，用于预测早期人类胚胎中的基因调控网络 | 首次将基于互信息的非线性方法应用于结合染色质可及性的单细胞多组学数据，能够捕获复杂的非单调依赖关系和反馈回路 | 在单细胞样本有限的情况下进行GRN推断存在困难 | 开发适用于单细胞多组学数据的基因调控网络预测方法 | 早期人类胚胎 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序,染色质可及性分析 | 基于互信息的非线性方法 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1250 | 2025-10-06 |
Integrative spatial and genomic analysis of tumor heterogeneity with Tumoroscope
2024-10-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53374-3
PMID:39472583
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研究论文 | 提出首个概率模型Tumoroscope，通过整合病理图像、全外显子组测序和空间转录组数据，在接近单细胞分辨率下推断癌症克隆及其定位 | 首个能够基于体细胞点突变直接定位肿瘤组织中克隆的概率模型，解决了空间转录组位点中克隆比例反卷积的问题 | NA | 研究肿瘤的空间和基因组异质性对癌症进展、治疗和生存的影响 | 前列腺癌和乳腺癌数据集 | 数字病理学 | 前列腺癌,乳腺癌 | 全外显子组测序,空间转录组学 | 概率模型 | 病理图像,基因组测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,全外显子组测序 | NA | NA |
| 1251 | 2025-10-06 |
HiDDEN: a machine learning method for detection of disease-relevant populations in case-control single-cell transcriptomics data
2024-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53666-8
PMID:39487129
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研究论文 | 提出一种名为HiDDEN的机器学习方法，用于在病例对照单细胞转录组数据中检测疾病相关细胞群体 | 开发了能够细化病例对照标签以准确反映每个细胞扰动状态的计算方法，解决了标准分析方法在受影响细胞比例小或扰动强度弱时的局限性 | 方法验证主要基于模拟数据集和有限的实际应用案例，需要更多真实世界数据的进一步验证 | 检测病例对照单细胞转录组数据中细微的转录变化和疾病相关细胞群体 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤，脱髓鞘疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习方法 | 单细胞转录组数据 | 模拟数据集、人类多发性骨髓瘤前体条件数据集、小鼠脱髓鞘模型数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1252 | 2025-10-06 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces immunosuppression in human cancer by impairing bioenergetics and ribosome biogenesis in immune cells
2024-11-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53706-3
PMID:39487111
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前列腺素E2通过EP2/EP4受体信号通路损害肿瘤浸润免疫细胞的生物能量和核糖体生物合成，导致免疫抑制的机制 | 首次在人类癌症中系统阐明PGE2-EP2/EP4信号通路通过下调c-Myc和PGC-1，损害免疫细胞的氧化磷酸化、糖酵解和核糖体蛋白合成，从而抑制抗肿瘤免疫的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要在更多人类癌症类型中验证；机制研究尚未完全揭示所有下游信号通路 | 探究前列腺素E2在肿瘤微环境中诱导免疫抑制的具体分子机制 | 人类癌症和雌性小鼠同系肿瘤中浸润的免疫细胞，包括CD8 T细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类癌症和雌性小鼠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1253 | 2025-10-06 |
Disrupting CENP-N mediated SEPT9 methylation as a strategy to inhibit aerobic glycolysis and liver metastasis in colorectal cancer
2024-Dec, Clinical & experimental metastasis
IF:4.2Q2
DOI:10.1007/s10585-024-10316-z
PMID:39424682
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研究论文 | 本研究揭示了CENP-N通过介导SEPT9甲基化促进结直肠癌有氧糖酵解和肝转移的新机制 | 首次发现CENP-N与SEPT9直接相互作用并增强其特定赖氨酸残基的甲基化，从而驱动代谢重编程和转移的新通路 | NA | 探索CENP-N介导SEPT9甲基化在结直肠癌有氧糖酵解和肝转移中的作用机制 | 结直肠癌细胞系及动物模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,甲基化特异性PCR,染色质免疫沉淀,功能分析实验 | NA | 基因表达数据,甲基化数据,功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1254 | 2025-10-06 |
Controlling human stem cell-derived islet composition using magnetic sorting
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.19.624394
PMID:39605713
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研究论文 | 本研究开发了一种通过磁性分选控制干细胞来源胰岛细胞组成的方法 | 首次使用基于CD49a标记的磁性激活细胞分选技术来富集功能性β细胞 | 未提及研究的局限性 | 改善干细胞来源胰岛的细胞组成和功能，用于1型糖尿病治疗 | 人类多能干细胞来源的胰岛细胞 | 细胞生物学 | 1型糖尿病 | 磁性激活细胞分选, 单细胞RNA测序, 免疫染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1255 | 2025-10-06 |
scAI-SNP: a method for inferring ancestry from single-cell data
2024-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.14.594208
PMID:38798590
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研究论文 | 开发了一种直接从单细胞基因组数据推断祖先来源的工具scAI-SNP | 首次实现了直接从稀疏的单细胞数据中准确推断个体祖先来源的方法 | 依赖于1000 Genomes Project数据集中的祖先信息SNP，可能不覆盖所有人群 | 开发从单细胞数据推断祖先来源的计算方法 | 单细胞基因组数据中的祖先信息单核苷酸多态性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 1000 Genomes Project中的3201个个体，来自26个人群群体 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1256 | 2025-10-06 |
Huntington's disease cellular phenotypes are rescued non-cell autonomously by healthy cells in mosaic telencephalic organoids
2024-Aug-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50877-x
PMID:39095390
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研究论文 | 本研究通过构建亨廷顿病镶嵌型端脑类器官，揭示了健康细胞通过非细胞自主机制挽救疾病细胞表型的能力 | 首次在镶嵌型端脑类器官中证明健康细胞可通过细胞间接触恢复亨廷顿病细胞的神经元特性、发育轨迹和突触功能 | 研究主要关注发育阶段，对成熟神经元退行性病变的长期影响仍需进一步验证 | 探究亨廷顿病中不同基因型细胞间的非细胞自主相互作用机制 | 健康与亨廷顿病基因型的端脑类器官 | 神经科学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1257 | 2025-10-06 |
SPI1+CD68+ macrophages as a biomarker for gastric cancer metastasis: a rationale for combined antiangiogenic and immunotherapy strategies
2024-Oct-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009983
PMID:39455096
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研究论文 | 本研究揭示了SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞作为胃癌转移生物标志物的重要作用 | 首次发现SPI1+CD68+巨噬细胞亚群在胃癌转移中的关键作用及其作为联合治疗策略的生物标志物 | 研究主要基于实验模型，需要进一步临床验证 | 评估SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌中的作用机制 | 胃癌组织和相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞转录组分析,免疫组织化学,免疫荧光,流式细胞术,染色质免疫沉淀 | 小鼠腹膜转移模型 | 基因表达数据,组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1258 | 2025-10-06 |
A phase 2 randomized trial with autologous polyclonal expanded regulatory T cells in children with new-onset type 1 diabetes
2024-05-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adn2404
PMID:38718135
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研究论文 | 评估自体多克隆扩增调节性T细胞在新发1型糖尿病儿童中的疗效和安全性的随机二期临床试验 | 首次在儿童新发1型糖尿病患者中开展自体多克隆扩增调节性T细胞的随机二期临床试验 | 单次剂量治疗未能阻止β细胞功能衰退，样本量有限（110例） | 评估自体多克隆扩增调节性T细胞在1型糖尿病儿童中的治疗效果 | 新发1型糖尿病的儿童和青少年患者 | 临床医学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术，bulk RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，基因表达数据 | 110例新发1型糖尿病儿童和青少年 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1259 | 2025-10-06 |
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591541
PMID:38746119
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析CAR信号传导，揭示驱动体内持久性的关键因素 | 首次使用单细胞测序系统性地将不同胞内信号域结构与转录输出关联，发现特定结构具有独特的强直信号特征 | 研究中发现的强直信号特征仅在液体肿瘤中驱动持久疗效，在实体瘤中无效 | 解码CAR信号传导设计原则，指导下一代胞内信号域结构的合理设计 | 表达嵌合抗原受体(CARs)的工程化T细胞 | 单细胞分析 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1260 | 2025-10-06 |
The IL-1β inhibitor canakinumab in previously treated lower-risk myelodysplastic syndromes: a phase 2 clinical trial
2024-11-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54290-2
PMID:39537648
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研究论文 | 评估IL-1β抑制剂canakinumab在既往治疗过的低危骨髓增生异常综合征患者中的安全性和疗效 | 首次在人体临床试验中证明IL-1β抑制剂canakinumab可通过抑制TNF介导的炎症信号通路影响造血分化 | 仅针对遗传复杂性较低的患者有效，样本量较小（25例患者） | 评估靶向IL-1β信号通路是否能挽救MDS患者的无效红细胞生成 | 25例既往治疗过的低危MDS患者（中位年龄74岁，60%男性） | 临床医学 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，基因表达数据 | 25例MDS患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |