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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1201 | 2025-10-06 |
Cellular-resolution gene expression mapping reveals organization in the head ganglia of the gastropod, Berghia stephanieae
2024-06, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25628
PMID:38852042
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和原位杂交链式反应技术,揭示了裸鳃类动物Berghia stephanieae头部神经节的细胞类型分子标记和空间组织 | 首次在裸鳃类动物中结合高通量单细胞RNA测序和原位杂交技术,识别并可视化神经元和胶质细胞的分子标记,揭示了神经节内和神经节间新的离散区域 | 研究仅针对特定物种Berghia stephanieae,结果可能无法直接推广到其他腹足类动物 | 建立腹足类动物神经系统的基本细胞组织结构与功能关系 | 裸鳃类动物Berghia stephanieae的头部神经节细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交链式反应 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1202 | 2025-10-06 |
Knocking down of Xkr8 enhances chemotherapy efficacy through modulating tumor immune microenvironment
2024-Jun, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.04.041
PMID:38685385
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研究论文 | 本研究通过敲低Xkr8基因增强化疗效果并调节肿瘤免疫微环境 | 首次在临床相关原位模型中评估Xkr8敲低联合化疗策略,并通过单细胞RNA测序阐明其作用机制 | 研究仅使用胰腺肿瘤模型,尚未在其他癌症类型中验证 | 评估Xkr8敲低联合化疗的抗肿瘤免疫反应增强效果 | 胰腺肿瘤模型中的肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低技术 | 原位肿瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1203 | 2025-10-06 |
Neutrophil-derived PAD4 induces citrullination of CKMT1 exacerbates mucosal inflammation in inflammatory bowel disease
2024-Jun, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01158-6
PMID:38720063
|
研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞来源的PAD4通过瓜氨酸化CKMT1加剧炎症性肠病黏膜炎症的分子机制 | 首次发现PAD4通过细胞外囊泡进入肠上皮细胞并瓜氨酸化CKMT1,破坏线粒体稳态和肠道屏障功能 | 研究主要基于DSS诱导的小鼠结肠炎模型,临床样本验证有限 | 阐明PAD4在炎症性肠病中的具体作用机制 | 小鼠结肠炎模型和IBD患者样本 | 分子生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,底物瓜氨酸化定位分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | DSS诱导结肠炎小鼠模型和IBD患者临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1204 | 2025-10-06 |
Esm-1 mediates transcriptional polarization associated with diabetic kidney disease
2024-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00419.2023
PMID:38601985
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了Esm-1在糖尿病肾病中作为肾小球转录极化的标志物 | 首次在单细胞水平系统表征Esm-1在糖尿病肾病中的表达模式及其与肾小球转录极化的关联 | 主要依赖公共数据库数据,样本量有限,需要进一步实验验证机制 | 探究Esm-1在糖尿病肾病发病机制中的作用 | 小鼠和人类肾脏内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,RNAscope,批量转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,批量转录组数据 | 27,786个肾脏内皮细胞(来自3个小鼠和4个人类数据库),20名健康受试者和41名糖尿病肾病患者 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1205 | 2025-10-06 |
Inter- and trans-generational impacts of environmental exposures on the germline resolved at the single-cell level
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100465
PMID:38586548
|
综述 | 探讨单细胞技术如何促进生殖毒理学研究,解析环境暴露对生殖细胞的跨代影响 | 整合单细胞多组学技术研究环境暴露对生殖细胞的跨代影响,提供细胞类型特异性响应分析 | 主要基于模式生物研究,人类生殖细胞研究存在技术挑战 | 推进生殖毒理学研究,解析环境因素对生殖细胞功能的影响机制 | 生殖细胞、模式生物(斑马鱼和小鼠) | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序、ATAC测序、多组学分析 | NA | 单细胞转录组、表观基因组 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1206 | 2025-10-06 |
TCL1A-expressing B cells are critical for tertiary lymphoid structure formation and the prognosis of oral squamous cell carcinoma
2024-05-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05292-7
PMID:38764038
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现TCL1A在B细胞中高表达,并揭示其通过促进三级淋巴结构形成改善口腔鳞癌预后的机制 | 首次揭示TCL1A在B细胞中的表达与三级淋巴结构形成的关系,及其通过调控CR2表达促进B细胞对树突状细胞的胞啃作用 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探究B细胞在口腔鳞癌免疫治疗中的作用机制 | 口腔鳞癌患者组织样本和B淋巴母细胞系 | 癌症免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 慢病毒转导 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织芯片数据, RNA测序数据 | 13例癌组织+8例癌旁组织(单细胞测序), 146例临床样本(组织芯片), 359例TCGA样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1207 | 2025-10-06 |
Single-cell approaches define two groups of mammalian oligodendrocyte precursor cells and their evolution over developmental time
2024-05-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.03.002
PMID:38579710
|
研究论文 | 通过单细胞多组学技术揭示哺乳动物少突胶质前体细胞在发育过程中的两个亚群及其演化特征 | 首次在发育过程中鉴定出两个具有不同定位、转录和表观遗传特征的少突胶质前体细胞亚群,并发现成年期髓鞘再生过程与发育期存在本质差异 | 研究仅聚焦于小鼠皮层组织,未验证其他脑区或物种的普适性 | 解析哺乳动物少突胶质前体细胞在发育过程中的异质性和演化规律 | 小鼠皮层少突胶质前体细胞(OPCs) | 单细胞组学 | 神经系统发育 | scRNA-seq, scATAC-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组、表观基因组、空间转录组数据 | 小鼠皮层发育不同时间点的OPC细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1208 | 2025-10-06 |
Direct programming of human pluripotent stem cells into endothelial progenitors with SOX17 and FGF2
2024-04-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.006
PMID:38518781
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现SOX17因子可将人多能干细胞直接编程为内皮祖细胞 | 首次发现SOX17过表达单独即可诱导内皮祖细胞分化,并与FGF2联合实现90%以上分化效率 | 未探讨SOX17调控下游靶基因的具体分子机制 | 探索转录因子在人多能干细胞向内皮祖细胞分化过程中的调控作用 | 人多能干细胞(hPSCs)和内皮祖细胞(EPs) | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas13d基因编辑 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1209 | 2025-10-06 |
MSX1+PDGFRAlow limb mesenchyme-like cells as an efficient stem cell source for human cartilage regeneration
2024-03-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.001
PMID:38428414
|
研究论文 | 本研究鉴定并表征了具有显著骨软骨再生能力的MSX1间充质祖细胞,并开发了从人多能干细胞生成MSX1+PDGFRAlow肢体间充质样细胞的方法 | 首次发现MSX1间充质祖细胞中PDGFRA亚群具有最强的骨软骨再生能力,并成功从人多能干细胞生成功能相似的肢体间充质样细胞 | 研究主要基于小鼠模型,人类细胞在人体内的长期安全性和有效性仍需验证 | 寻找用于人类软骨再生的高效干细胞来源 | MSX1间充质祖细胞及其PDGFRA亚群,人多能干细胞衍生的肢体间充质样细胞 | 再生医学 | 骨关节疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1210 | 2025-10-06 |
Activated mesenchymal stem/stromal cells promote myeloid cell differentiation via CCL2/CCR2 signaling
2024-03-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.002
PMID:38428413
|
研究论文 | 本研究揭示了间充质干细胞通过CCL2/CCR2信号通路促进髓系细胞分化的机制 | 首次发现PDGFRαSca-1阳性MSCs在LPS刺激下分泌CCL2,并通过该信号通路调控髓系细胞分化命运 | 主要基于小鼠模型研究,人类骨髓细胞的验证数据相对有限 | 探究间充质干细胞对造血干细胞/祖细胞分化的影响机制 | 小鼠间充质干细胞、造血干细胞/祖细胞、人类骨髓细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1211 | 2025-10-06 |
ER stress and lipid imbalance drive diabetic embryonic cardiomyopathy in an organoid model of human heart development
2024-03-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.01.003
PMID:38335962
|
研究论文 | 利用人类心脏类器官模型研究糖尿病胚胎心肌病的发病机制 | 首次使用先进的人类心脏类器官系统模拟胚胎心脏发育过程,揭示内质网应激和脂质代谢失衡在糖尿病胚胎心肌病中的关键作用 | 基于类器官模型的研究结果仍需在真实人类胚胎组织中验证 | 探究糖尿病对胚胎心脏发育的影响机制 | 人类心脏类器官 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序, 脂质组学, 成像技术 | 类器官模型 | 基因表达数据, 脂质组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1212 | 2025-10-06 |
SinCMat: A single-cell-based method for predicting functional maturation transcription factors
2024-02-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.12.006
PMID:38215756
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序的计算方法SinCMat,用于预测功能成熟转录因子 | 首个专门考虑功能细胞成熟过程的计算方法,通过识别身份转录因子和信号依赖转录因子的配对来驱动功能成熟 | NA | 预测驱动细胞功能成熟的转录因子 | 小鼠细胞图谱和Tabula Sapiens数据库中的细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大规模数据集(Mouse Cell Atlas和Tabula Sapiens) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1213 | 2025-10-06 |
Multifactoral immune modulation potentiates durable remission in multiple models of aggressive malignancy
2024-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302675R
PMID:38738472
|
研究论文 | 本研究开发了一种联合免疫调节和细胞抑制疗法,可在多种侵袭性恶性肿瘤模型中诱导持久缓解 | 发现独特的多因子免疫调节组合疗法,能重塑肿瘤微环境并消除多种难治性肿瘤模型 | 研究仅限于临床前动物模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索多通路靶向治疗在侵袭性恶性肿瘤中的协同抗肿瘤效应 | 三阴性乳腺癌(4T-1)、头颈鳞癌(MOC-2)和MYCN扩增型神经母细胞瘤的动物模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌,头颈癌,神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 过继性细胞转移 | NA | 基因表达数据, 治疗反应数据 | 多种肿瘤模型的实验动物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1214 | 2025-10-06 |
Dominant immune tolerance in the intestinal tract imposed by RelB-dependent migratory dendritic cells regulates protective type 2 immunity
2024-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53112-9
PMID:39443450
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研究论文 | 本研究揭示了肠道树突状细胞中RelB表达通过调控DC-Treg细胞相互作用建立免疫耐受机制 | 首次发现RelB在肠道隐窝斑和孤立淋巴滤泡相关树突状细胞分化中的关键作用,并阐明其通过CCL22调控DC-Treg细胞相互作用的机制 | 研究主要关注肠道特定区域的树突状细胞,其他免疫细胞类型和组织部位的作用尚未完全探索 | 探究RelB在肠道树突状细胞介导的免疫耐受和2型免疫应答调控中的作用机制 | 小鼠肠道树突状细胞、调节性T细胞和Heligmosomoides polygyrus bakeri寄生虫感染模型 | 免疫学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1215 | 2025-10-06 |
Overloading And unpacKing (OAK) - droplet-based combinatorial indexing for ultra-high throughput single-cell multiomic profiling
2024-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53227-z
PMID:39443484
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研究论文 | 介绍了一种名为OAK的超高通量单细胞多组学分析方法 | 结合液滴微流控和组合索引技术,通过过载和拆包策略提高条形码和试剂利用率 | 未明确说明技术局限,但暗示现有方法存在效率问题 | 开发超高通量单细胞多组学分析技术 | 支气管上皮细胞、视网膜组织、黑色素瘤细胞 | 单细胞测序技术 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、染色质可及性分析 | NA | 单细胞多组学数据 | 超过40万个黑色素瘤细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | 液滴条形码系统结合组合索引 |
| 1216 | 2025-10-06 |
IL-1β-induced epithelial cell and fibroblast transdifferentiation promotes neutrophil recruitment in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53307-0
PMID:39438439
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现IL-1β诱导的LY6D俱乐部细胞和IDO1成纤维细胞转分化促进慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的中性粒细胞募集 | 首次鉴定出IL-1信号诱导的LY6D俱乐部细胞和IDO1成纤维细胞两个细胞亚群,并阐明它们通过释放不同趋化因子促进中性粒细胞募集的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证需要进一步扩展 | 探究慢性鼻窦炎伴鼻息肉中中性粒细胞炎症的细胞机制和干预策略 | 人类鼻黏膜组织(下鼻甲、中鼻甲和鼻息肉)和LPS诱导的小鼠CRSwNP模型 | 单细胞生物学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自CRSwNP患者的人类鼻黏膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1217 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals immune features of treatment response to neoadjuvant immunochemotherapy in esophageal squamous cell carcinoma
2024-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52977-0
PMID:39438438
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示食管鳞癌新辅助免疫化疗治疗反应的免疫特征 | 首次通过单细胞RNA测序结合T细胞受体测序,系统解析了食管鳞癌新辅助免疫化疗响应者与非响应者的肿瘤微环境差异,发现CXCL13+CD8+ Tex细胞可作为治疗响应的预测标志物 | 样本量有限,需要更大规模的研究验证发现 | 探究食管鳞癌新辅助免疫化疗治疗反应的免疫学机制 | 接受新辅助免疫化疗的食管鳞癌患者组织样本 | 数字病理 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 食管鳞癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1218 | 2025-10-06 |
Activation-Induced Marker Assay to Identify and Isolate HCV-Specific T Cells for Single-Cell RNA-Seq Analysis
2024-10-17, Viruses
DOI:10.3390/v16101623
PMID:39459954
|
研究论文 | 开发了一种用于检测、分选和单细胞RNA测序分析丙型肝炎病毒特异性T细胞的激活诱导标记检测方法 | 建立了不依赖MHC多聚体的高灵敏度抗原特异性T细胞检测方法,并首次应用于HCV特异性T细胞的单细胞RNA测序分析 | 仅在一个研究对象中进行了验证,需要更大规模的队列研究来确认方法的普适性 | 开发能够识别和分离HCV特异性T细胞用于单细胞转录组分析的新方法 | 丙型肝炎病毒特异性CD4和CD8 T细胞 | 免疫学 | 丙型肝炎 | 单细胞RNA测序,T细胞受体分析,流式细胞分选 | NA | 单细胞基因表达数据,TCR序列数据 | 一个研究对象(包含1023个AIM CD4 T细胞克隆型和160个AIM CD8 T细胞克隆型) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1219 | 2025-10-06 |
Putting proteins in context
2024-Oct-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.009
PMID:39418999
|
研究论文 | 介绍了一种名为PINNACLE的几何深度学习方法,通过整合分析蛋白质相互作用和多器官单细胞转录组数据生成蛋白质的上下文表征 | 首次将蛋白质相互作用与多器官单细胞转录组数据结合,利用几何深度学习方法生成具有生物环境背景的蛋白质表征 | NA | 解决蛋白质表征缺乏生物环境背景的问题 | 蛋白质及其相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 几何深度学习 | 蛋白质相互作用数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1220 | 2025-10-06 |
Unraveling the Prefrontal Cortex-Basolateral Amygdala Pathway's Role on Schizophrenia's Cognitive Impairments: A Multimodal Study in Patients and Mouse Models
2024-07-27, Schizophrenia bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/schbul/sbae063
PMID:38811350
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研究论文 | 通过多模态方法研究前额叶皮层-基底外侧杏仁核通路在精神分裂症认知障碍中的作用 | 首次结合临床患者和动物模型,综合运用光遗传学、单细胞RNA测序和神经影像学技术揭示mPFC-BLA通路在精神分裂症认知障碍中的关键作用,并发现血液外泌体mRNA作为非侵入性生物标志物的潜力 | 研究样本量未明确说明,动物模型可能无法完全模拟人类精神分裂症的复杂性 | 探究前额叶皮层-基底外侧杏仁核通路在精神分裂症相关认知障碍中的作用机制 | 精神分裂症患者和甲基氧化甲醇乙酸酯诱导的小鼠模型 | 神经科学 | 精神分裂症 | 临床量表、磁共振成像、单细胞RNA测序、光遗传学、立体定位注射 | 小鼠疾病模型 | 影像数据、基因表达数据、行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |