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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 1201 - 1220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1201 | 2026-04-03 |
Multi-omics in exploring the pathophysiology of diabetic retinopathy
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1500474
PMID:39723239
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）及其他多组学技术在探索糖尿病视网膜病变（DR）病理生理机制中的重要作用 | 系统性地整合并强调了scRNA-seq与其他多组学技术（如转录组学、遗传关联研究、代谢组学）的协同作用，为揭示DR的复杂分子机制、发现新生物标志物和治疗靶点提供了革命性的视角 | 作为一篇综述文章，未报告原始实验数据，其结论基于对现有研究的总结和展望 | 探讨多组学技术，特别是scRNA-seq，在阐明糖尿病视网膜病变（DR）病理生理机制中的应用与贡献 | 糖尿病视网膜病变（DR）的分子机制、细胞类型、信号通路、生物标志物及潜在治疗靶点 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多组学分析（包括转录组学、遗传关联研究、代谢组学） | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序，多组学分析 | NA | NA |
| 1202 | 2026-04-03 |
Breast pericytes: a newly identified driver of tumor cell proliferation
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1455484
PMID:39741968
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和细胞培养实验，揭示了乳腺周细胞作为肿瘤微环境中的关键因子，能显著促进乳腺癌细胞增殖 | 首次成功分离并纯化乳腺周细胞，利用单细胞RNA测序定义了其异质性，并发现周细胞在部分乳腺肿瘤中脱离血管成为主要间充质细胞类型，且能诱导肿瘤细胞快速生长 | 周细胞在肿瘤中的具体刺激机制尚未完全阐明，且样本量可能有限，需要进一步研究验证 | 探究乳腺周细胞在乳腺癌微环境中的作用及其对肿瘤细胞增殖的影响 | 乳腺组织中的周细胞和乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | FACS, 单细胞RNA测序, 转录组深度测序 | NA | RNA序列数据, 细胞培养数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1203 | 2026-04-02 |
Single-cell multi-omics map of human fetal blood in Down syndrome
2024-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07946-4
PMID:39322663
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据，构建了人类唐氏综合征胎儿血液的高分辨率多组学图谱 | 首次结合单细胞多组学与空间转录组学，揭示了唐氏综合征中造血干细胞被“启动”分化的分子机制，并发现了非编码元件与基因调控网络的重构 | 样本量相对较小（仅18个胎儿），且仅关注胎儿期，未涉及出生后或成人阶段的造血异常 | 理解唐氏综合征中失调的造血过程及其分子基础 | 人类胎儿肝脏和骨髓样本，包括3个二倍体和15个三倍体（唐氏综合征）胎儿 | 数字病理学 | 唐氏综合征 | 单细胞转录组学，染色质可及性分析，空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据，ATAC-seq数据，空间转录组数据 | 18个胎儿样本（3个二倍体，15个三倍体），超过110万个细胞 | 10x Genomics | 单细胞多组学，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression，10x Visium空间转录组技术 |
| 1204 | 2026-04-02 |
Cholinergic Neuronal Activity Promotes Diffuse Midline Glioma Growth through Muscarinic Signaling
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.21.614235
PMID:39386427
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研究论文 | 本研究揭示了胆碱能神经元活动通过毒蕈碱信号通路促进弥漫性中线胶质瘤生长的机制 | 首次发现中脑胆碱能神经元的长程投射通过M1和M3毒蕈碱受体促进DMG生长，并揭示了其与健康少突胶质前体细胞增殖的平行效应 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养，人类患者样本验证有限，且胆碱能神经元亚群的具体作用机制仍需进一步探索 | 探究胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其分子机制 | 弥漫性中线胶质瘤细胞、健康少突胶质前体细胞、胆碱能神经元 | 神经科学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 光遗传学刺激、单细胞RNA测序、体外共培养、药理学阻断 | 小鼠模型、hiPSC衍生神经元模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据 | 原发性患者DMG样本、DMG荷瘤小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1205 | 2026-04-01 |
Tppp3 is a novel molecule for retinal ganglion cell identification and optic nerve regeneration
2024-12-29, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01917-6
PMID:39734233
|
研究论文 | 本研究探索了Tppp3分子在视网膜神经节细胞神经保护和轴突再生中的作用 | 首次揭示了Tppp3在哺乳动物视网膜神经节细胞轴突再生中的促进作用，并发现其通过上调Bmp4等基因和神经炎症通路发挥作用 | 研究主要基于啮齿类动物模型，尚未在更高等的哺乳动物中进行验证 | 寻找促进中枢神经系统轴突再生的分子调控因子 | 视网膜神经节细胞（RGCs） | 神经科学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠、猕猴和人类的视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1206 | 2026-04-01 |
Evaluating the Utilities of Foundation Models in Single-cell Data Analysis
2024-Dec-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.08.555192
PMID:38464157
|
研究论文 | 本文通过综合实验评估了基础模型在单细胞测序数据分析中的性能，并比较了其与任务特定方法的优劣 | 首次对十种单细胞基础模型在八个下游任务中的性能进行全面评估，并提出了一个用于评估训练稳定性、超参数影响的框架 | 研究发现单细胞基础模型并非在所有任务中都优于任务特定方法，这挑战了开发单细胞分析基础模型的必要性 | 评估基础模型在单细胞数据分析中的效用，并为模型预训练和微调提供指导 | 单细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型（如scGPT、Geneformer、CellPLM） | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1207 | 2026-04-01 |
Methods to Enable Spatial Transcriptomics of Bone Tissues
2024-05-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66850
PMID:38767376
|
研究论文 | 本文描述了一种处理新鲜骨组织样本以生成高质量空间转录组数据的方法，并提供了针对先前石蜡包埋样本的详细指南 | 开发了一种针对硬组织（如骨）的空间转录组学方法，解决了在切片处理过程中保持RNA质量和组织形态的挑战 | NA | 开发适用于骨组织的空间转录组学方法，以分析细胞基因表达与组织学背景的关系 | 骨组织样本，包括新鲜样本和先前石蜡包埋的样本，如骨肉瘤原发肿瘤和肺转移样本 | 空间转录组学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1208 | 2026-04-01 |
Single-cell analyses reveal transient retinal progenitor cells in the ciliary margin of developing human retina
2024-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47933-x
PMID:38670973
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了人类视网膜发育过程中睫状缘区存在短暂性视网膜祖细胞 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学，首次在人类视网膜发育中鉴定出睫状缘区的短暂性早期视网膜祖细胞，并揭示了其转录和染色质可及性变化 | 研究仅涵盖人类视网膜发育至妊娠中期的阶段，未涉及后期发育或成熟视网膜 | 探究人类视网膜发育过程中视网膜祖细胞的起源、分化和时空分布 | 人类视网膜发育过程中的细胞，特别是睫状缘区的视网膜祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 人类早期眼样本，涵盖至妊娠中期 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1209 | 2026-04-01 |
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-01-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010554
PMID:37782774
|
研究论文 | 本研究探讨了套细胞淋巴瘤对PRMT5靶向治疗产生耐药性的机制，并发现mTOR信号通路上调是耐药的关键因素，通过mTORC1抑制剂temsirolimus可克服耐药性 | 首次在套细胞淋巴瘤中系统研究PRMT5抑制剂耐药机制，结合患者来源异种移植模型和细胞系模型，通过单细胞RNA测序揭示mTOR信号通路在耐药中的核心作用，并验证了联合靶向治疗的协同效应 | 研究主要基于体外细胞系和PDX模型，缺乏大规模临床样本验证；耐药机制可能涉及其他未被发现的通路；长期联合治疗的安全性和有效性需进一步评估 | 探究套细胞淋巴瘤对PRMT5靶向治疗产生耐药性的分子机制，并寻找克服耐药性的治疗策略 | 套细胞淋巴瘤细胞系、患者来源异种移植模型 | 肿瘤生物学 | 套细胞淋巴瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8个细胞系（4个敏感，4个原发耐药），4个耐药细胞系，PDX模型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1210 | 2026-03-31 |
Interpreting single-cell and spatial omics data using deep neural network training dynamics
2024-12, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00721-5
PMID:39633094
|
研究论文 | 本研究开发了Annotatability框架，通过监测深度神经网络在单细胞和空间组学数据上的训练动态，来识别注释不匹配并表征生物数据结构 | 提出了一种基于深度神经网络训练动态的新方法，用于评估细胞注释的可靠性并揭示生物信号结构，结合信号感知图嵌入技术进行下游分析 | 未明确说明方法在更大规模或更复杂数据集上的可扩展性，且依赖于预定义的细胞注释，可能受注释主观性影响 | 解决单细胞和空间组学数据注释中的模糊性和错误问题，以更好地解释细胞类型、状态和异质性 | 单细胞和空间组学数据中的细胞注释和生物信号结构 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，空间组学 | 深度神经网络 | 单细胞RNA测序数据，空间组学数据 | 八个单细胞RNA测序和空间组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1211 | 2026-03-31 |
Mapping the gene space at single-cell resolution with gene signal pattern analysis
2024-12, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00734-0
PMID:39706866
|
研究论文 | 本文提出了一种名为基因信号模式分析（GSPA）的图信号处理方法，用于从单细胞数据中学习丰富的基因表示，以映射基因空间 | 首次系统性地提出基因嵌入问题，并开发了基于细胞-细胞图的扩散小波字典的GSPA方法，实现了基因在细胞流形上的模式化和定位表征 | 未明确提及方法在特定疾病或大规模数据集上的验证限制 | 开发计算方法来映射单细胞测序分析中的基因空间，并评估基因表示的有效性 | 单细胞测序数据中的基因 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 图信号处理（GSPA） | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1212 | 2026-03-30 |
Population-level comparisons of gene regulatory networks modeled on high-throughput single-cell transcriptomics data
2024-03, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00597-5
PMID:38438786
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SCORPION的工具，用于从单细胞/核RNA测序数据重建可比较的基因调控网络，以支持群体水平的比较 | SCORPION利用消息传递算法和相同基线先验，克服了数据稀疏性和细胞异质性，在合成数据上优于12种现有基因调控网络重建技术，并能准确识别野生型和转录因子扰动细胞间的调控网络差异 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种工具，用于从单细胞转录组学数据重建可比较的基因调控网络，以进行群体水平的比较 | 单细胞/核RNA测序数据，特别是来自结直肠癌和相邻健康组织的200,436个细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 消息传递算法 | 单细胞转录组学数据 | 200,436个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1213 | 2026-03-30 |
Extracting, filtering and simulating cellular barcodes using CellBarcode tools
2024-02, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00595-7
PMID:38374363
|
研究论文 | 本文介绍了CellBarcode工具包及其条形码模拟套件CellBarcodeSim，用于从批量或单细胞测序数据中高效、灵活地提取和过滤多种条形码类型 | 开发了支持多种条形码类型和分析策略的通用工具，并提供了条形码模拟功能以优化识别过程 | 未明确提及具体的技术限制或性能边界 | 提高DNA细胞条形码识别的准确性和可重复性 | DNA细胞条形码 | 生物信息学 | NA | PCR和测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞测序, 批量测序 | NA | NA |
| 1214 | 2026-03-29 |
Generation and Downstream Analysis of Single-Cell and Single-Nuclei Transcriptomes in Brain Organoids
2024-03-29, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66225
PMID:38619271
|
研究论文 | 本文提供了一个关于在脑类器官中生成和分析单细胞及单核转录组的逐步实验指南 | 通过结合单细胞和单核转录组学方法，克服了难以分离细胞类型的限制，使单个细胞的转录组分析在脑类器官研究中普遍适用 | NA | 为脑类器官研究提供单细胞和单核转录组学的实验流程，以促进对大脑发育的细胞过程和分子机制的全面研究 | 脑类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，单核转录组学，RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单核RNA-seq | NA | NA |
| 1215 | 2026-03-29 |
Spatial High-resolution Analysis of Gene Expression Levels in Tendons
2024-03-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65852
PMID:38526117
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方法论文 | 本文综述了肌腱组织中空间高分辨率基因表达水平的分析方法，重点关注新型原位杂交技术 | 针对富含基质的肌腱组织，提出了单细胞水平的空间转录组学分析方法，解决了低细胞数、低RNA含量和高基质背景的挑战 | NA | 开发并优化肌腱组织中空间基因表达水平的分析方法 | 肌腱组织，特别是年轻和老年动物模型及人类肌腱样本 | 数字病理学 | NA | 原位杂交，空间转录组学 | NA | 图像，RNA空间表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1216 | 2026-03-28 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Links DNMT3B and PFKFB4 Transcriptional Profiles with Metastatic Traits in Hepatoblastoma
2024-10-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111394
PMID:39595571
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-Seq分析，将DNMT3B和PFKFB4的转录谱与肝母细胞瘤的转移特性联系起来 | 利用弹性网络机器学习方法识别了DNMT3B和PFKFB4作为肝母细胞瘤转移的关键预测因子，并构建了一个基于这两个酶表达的代谢评分，该评分在预测转移方面比现有分类器更敏感 | 研究基于GSE131329转录组数据集，样本来源可能有限，且未涉及实验验证或机制探讨 | 探究肝母细胞瘤中代谢酶的过表达与转移风险之间的关联，并开发预测转移的临床-生物学模型 | 肝母细胞瘤肿瘤组织与非癌性肝组织，重点关注代谢酶的表达差异 | 单细胞组学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA-Seq，转录组分析 | ElasticNet机器学习，逻辑回归模型 | 转录组数据 | 基于GSE131329转录组数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1217 | 2024-08-07 |
A New Immunological Index for the Elderly: High Proportion of Multiple TCR T Cells Based on scRNA-Seq
2024-05-07, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0509-1
PMID:38722790
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1218 | 2026-03-25 |
Single-Cell Gene-Regulatory Networks of Advanced Symptomatic Atherosclerosis
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323184
PMID:38639096
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了晚期症状性动脉粥样硬化中的关键平滑肌细胞和巨噬细胞亚型，并整合基因调控网络分析，揭示了GRN39在疾病进展中的核心作用 | 首次将最基因丰富的单细胞亚簇与冠状动脉疾病的基因调控网络框架整合，识别并独立验证了GRN39在促进晚期症状性动脉粥样硬化中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，可能无法完全反映人类疾病的复杂性；单细胞测序技术（SmartSeq2）的基因覆盖范围（约8000基因/细胞）相对有限 | 探究动脉粥样硬化进展中血管细胞类型转化的单细胞基因表达模式及其临床和病理生理学相关性 | Ldlr-/-Apob100/100小鼠（具有人类样血浆脂蛋白）以及人类无症状和症状性颈动脉斑块中的单细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（SmartSeq2），基因调控网络分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 16,588个单细胞（来自小鼠和人类），600名冠状动脉疾病患者（STARNET研究） | NA | 单细胞RNA-seq | SmartSeq2 | SmartSeq2（约8000基因/细胞） |
| 1219 | 2026-03-25 |
Identification of cells of leukemic stem cell origin with non-canonical regenerative properties
2024-Apr-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101485
PMID:38582086
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，识别了急性髓系白血病中具有非典型再生特性的细胞群——再生富集细胞，并探讨了其在白血病复发中的作用 | 首次揭示了AML中RECs这一新细胞群，它们源自白血病干细胞但缺乏干细胞能力，并通过空间转录组学证实了其与CD34+细胞的邻近关系及对再生的调控作用 | 未明确RECs的具体分子机制，且样本量可能有限，需要进一步验证 | 探究急性髓系白血病化疗后复发细胞的特性及其再生机制 | 急性髓系白血病患者样本中的细胞群体 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据，空间数据 | AML患者队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1220 | 2026-03-25 |
Multicellular ecotypes shape progression of lung adenocarcinoma from ground-glass opacity toward advanced stages
2024-Apr-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101489
PMID:38554705
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研究论文 | 本研究通过机器学习、单细胞RNA测序和全外显子组测序，分析了58例肺腺癌患者，揭示了与不同影像学模式和癌细胞状态相关的六种肺多细胞生态型 | 首次系统性地将肺腺癌的影像学表现（磨玻璃影与实性结节）与肿瘤微环境中的多细胞生态型、免疫状态及特定驱动基因（如EGFR L858R）联系起来，并发现了CTHCR1成纤维细胞在免疫抑制环境中的关键作用 | 样本量相对有限（58例患者），且研究主要基于特定队列，需要在更大人群和不同种族中进行验证 | 探究肺腺癌从磨玻璃影向晚期进展过程中的肿瘤异质性及微环境演变机制 | 58例肺腺癌患者及其肿瘤组织 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据, 基因组数据, 影像数据 | 58例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |