单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 1201 - 1220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1201 | 2025-10-05 |
A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.10.588953
PMID:38645099
|
研究论文 | 本研究通过基因组编辑技术揭示了人类特异性增强子HAR对大脑皮层发育的调控机制 | 首次证明人类特异性增强子HAR通过调控WNT信号通路精细调节神经前体细胞的增殖和神经发生能力 | 研究主要依赖动物模型和类器官，与真实人类大脑发育环境存在差异 | 探索人类特异性基因组区域HAR在皮层发育中的功能作用 | 基因组编辑小鼠、灵长类模型、人类和黑猩猩神经前体细胞及皮层类器官 | 发育神经生物学 | NA | 基因组编辑、单细胞RNA测序、活体成像、谱系分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、成像数据 | 多种基因编辑动物模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1202 | 2025-10-05 |
Intestinal epithelial adaptations to vertical sleeve gastrectomy defined at single-cell resolution
2024-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110805
PMID:38309446
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了垂直袖状胃切除术对小鼠小肠上皮细胞的特异性影响 | 首次在单细胞分辨率下系统定义VSG对肠道上皮不同细胞谱系的特异性分子适应机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 阐明垂直袖状胃切除术诱导肠道适应性的细胞分子机制 | 小鼠小肠上皮细胞 | 单细胞组学 | 肥胖和糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 验证的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1203 | 2025-10-05 |
Multi-condition and multi-modal temporal profile inference during mouse embryonic development
2024-Sep-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.03.583179
PMID:38496477
|
研究论文 | 提出Sunbear联合建模框架，用于整合多条件和多模态的单细胞时间序列数据 | 开发能够整合多条件和多模态单细胞时间序列数据的联合建模框架，实现单细胞时间谱变化插补、多数据集多模态谱对齐以及缺失模态的外推预测 | 基于破坏性单细胞测量技术，无法捕获特定细胞的完整时间轨迹 | 开发单细胞多条件多模态时间序列数据的整合分析方法 | 小鼠胚胎发育过程中的单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 联合建模框架 | 单细胞时间序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1204 | 2025-10-05 |
Cellular and transcriptional profiles of peripheral blood mononuclear cells pre-vaccination predict immune response to preventative MUC1 vaccine
2024-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.598031
PMID:38948837
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析疫苗接种前外周血单核细胞，预测MUC1预防性疫苗的免疫反应 | 首次在癌前病变人群中研究非病毒癌症疫苗，并通过单细胞分析发现免疫应答者的特定细胞类型和基因特征 | 样本量较小（16名应答者和16名无应答者），需要在更大规模研究中验证 | 评估MUC1肿瘤抗原疫苗的安全性和免疫原性，并寻找预测疫苗反应的生物标志物 | 有晚期结肠腺瘤病史的个体 | 单细胞测序分析 | 结肠腺瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 贝叶斯网络分析，差异基因表达分析 | 单细胞转录组数据 | 32名参与者（16名免疫应答者和16名无应答者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1205 | 2025-10-05 |
A human stomach cell type transcriptome atlas
2024-02-14, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01812-5
PMID:38355543
|
研究论文 | 通过整合相关性分析方法构建人类胃部细胞类型转录组图谱 | 首次利用未分级的胃部RNAseq数据预测胃部细胞类型转录组特征，填补了主要单细胞测序图谱中胃部细胞类型基因富集谱的空白 | 基于相关性分析的预测方法而非直接单细胞测序，可能无法完全捕获细胞异质性 | 建立人类胃部细胞类型特异性基因表达图谱 | 人类胃部细胞（壁细胞、主细胞、胃黏液细胞、胃肠内分泌细胞等11种细胞类型） | 单细胞生物学 | 胃癌 | RNA-seq，整合相关性分析 | 相关性分析模型 | RNA测序数据 | 359名个体的未分级胃部RNAseq数据 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1206 | 2025-10-05 |
A single-cell and spatial RNA-seq database for Alzheimer's disease (ssREAD)
2024-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49133-z
PMID:38844475
|
研究论文 | 介绍了一个专门用于阿尔茨海默病的单细胞和空间RNA-seq数据库ssREAD | 提供了更广泛的AD相关数据集、优化的分析流程和改善的可用性，整合了大量单细胞和空间转录组数据 | NA | 解决阿尔茨海默病研究中单细胞和空间转录组数据缺乏综合性用户友好存储库的问题 | 阿尔茨海默病患者和模型动物的脑组织样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | RNA测序数据,空间转录组数据 | 1,053个样本（277个整合数据集）包含7,332,202个细胞，以及381个空间转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1207 | 2025-10-05 |
Construction of thyroid cancer classification and iodine metabolism related diagnostic model using thyroid differentiation score and bioinformation
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039464
PMID:39252309
|
研究论文 | 构建基于甲状腺分化评分和生物信息学的甲状腺癌分类及碘代谢相关诊断模型 | 首次结合甲状腺分化评分与碘代谢特征构建甲状腺癌诊断模型，识别出5个独立预测基因 | 模型验证主要依赖公共数据库数据，需要进一步临床前瞻性研究验证 | 开发甲状腺癌亚型分类诊断模型以提高诊疗准确性 | 甲状腺癌患者基因表达数据和临床病理信息 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 机器学习 | 逻辑回归模型, 机器学习模型 | 基因表达谱, 临床数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的甲状腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1208 | 2025-10-05 |
From womb to wellness: early environmental exposures, cord blood DNA methylation and disease origins
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2390823
PMID:39263926
|
综述 | 探讨胎儿环境暴露通过脐带血DNA甲基化影响疾病起源的机制与研究方向 | 系统阐述脐带血DNA甲基化作为胎儿表观遗传窗口的重要性，并提出单细胞测序等新技术应用前景 | 存在组织特异性问题、现有甲基化芯片覆盖度有限、细胞组成变异等混杂因素 | 阐明早期环境暴露与表观基因组相互作用机制，开发预防策略 | 脐带血DNA甲基化与胎儿环境暴露 | 表观遗传学 | 发育源性疾病 | DNA甲基化分析，单细胞测序 | NA | 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1209 | 2025-10-05 |
Epitranscriptomic regulation of cardiac fibrosis via YTHDF1-dependent PIEZO2 mRNA m6A modification
2024-12-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae239
PMID:39498803
|
研究论文 | 本研究揭示了YTHDF1通过m6A修饰调控PIEZO2表达的转录后机制在心脏纤维化中的作用 | 首次发现YTHDF1通过识别PIEZO2 mRNA的m6A修饰位点peak_26355调控其翻译，并影响心脏成纤维细胞自噬和纤维化的新表观转录组机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究机械敏感性离子通道Piezo家族在心脏纤维化中的分子机制 | 小鼠心脏成纤维细胞和实验性心脏纤维化模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | RNA-seq，单细胞测序，组织学分析，生化分析 | NA | 基因表达数据，组织学图像，生化数据 | 实验小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1210 | 2025-10-05 |
Fibroblast-specific TGF-β signaling mediates cardiac dysfunction, fibrosis, and hypertrophy in obese diabetic mice
2024-12-14, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae210
PMID:39373248
|
研究论文 | 本研究探讨了成纤维细胞特异性TGF-β信号在肥胖糖尿病小鼠心脏功能障碍、纤维化和肥厚中的关键作用 | 首次在肥胖糖尿病模型中证明成纤维细胞特异性TGF-β/Smad3信号通路是心脏病理变化的核心机制 | 体外实验显示血栓反应蛋白-4对心脏成纤维细胞无显著激活作用，与预期结果存在矛盾 | 研究TGF-β诱导的成纤维细胞活化在糖尿病心肌病发病机制中的作用 | 肥胖db/db糖尿病小鼠模型，特别是成纤维细胞特异性TbR2缺失和Smad3破坏的小鼠 | 心血管疾病研究 | 糖尿病心肌病 | 转录组学研究，单细胞RNA测序，体外实验，Ingenuity通路分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，功能评估数据 | db/db小鼠模型及相关基因修饰小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1211 | 2025-10-05 |
Restoring Mitochondrial Quantity and Quality to Reverse Warburg Effect and Drive Tumor Differentiation
2024-Dec-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5494402/v1
PMID:39711563
|
研究论文 | 本研究通过联合使用视黄酸和线粒体解偶联剂恢复肿瘤线粒体功能，诱导神经母细胞瘤分化并抑制增殖 | 首次提出通过协同增强线粒体生物合成和呼吸作用来恢复肿瘤线粒体数量和质量，从而逆转Warburg效应并驱动肿瘤分化 | 研究主要聚焦于神经母细胞瘤模型，在其他肿瘤类型中的适用性需要进一步验证 | 探索通过恢复线粒体功能诱导肿瘤分化的治疗策略 | 神经母细胞瘤细胞和原位异种移植模型 | 癌症生物学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，U-C-葡萄糖/谷氨酰胺同位素示踪，线粒体功能分析 | NA | 基因表达数据，代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1212 | 2025-10-05 |
Cross-species single-cell RNA sequencing reveals divergent phenotypes and activation states of adaptive immunity in human carotid and experimental murine atherosclerosis
2024-11-25, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae154
PMID:39041203
|
研究论文 | 通过跨物种单细胞RNA测序比较人类颈动脉和实验性小鼠动脉粥样硬化的免疫细胞组成和激活状态 | 首次通过整合人类和小鼠单细胞RNA测序数据揭示物种间免疫细胞组成的显著差异，挑战标准小鼠模型的转化价值 | 研究主要关注颈动脉粥样硬化，结果可能不适用于其他血管部位；样本数量相对有限 | 比较人类和小鼠动脉粥样硬化中适应性免疫细胞的表型和激活状态差异 | 人类颈动脉粥样硬化斑块和小鼠动脉粥样硬化血管组织中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，多色流式细胞术 | 生物信息学整合分析 | 单细胞转录组数据 | 人类颈动脉斑块样本（验证队列43例患者）+7个小鼠单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1213 | 2025-10-05 |
Regulation of Ptbp1-controlled alternative splicing of pyruvate kinase muscle by liver kinase B1 governs vascular smooth muscle cell plasticity in vivo
2024-11-25, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae187
PMID:39189621
|
研究论文 | 本研究揭示了肝激酶B1通过调控Ptbp1依赖的丙酮酸激酶肌肉亚型选择性剪接来控制血管平滑肌细胞可塑性的机制 | 首次发现Lkb1通过调控Ptbp1-PKM选择性剪接轴控制血管平滑肌细胞命运决定，并证明PKM2激活剂可逆转血管病变 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究控制血管平滑肌细胞可塑性的关键分子机制 | 血管平滑肌细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据，影像数据 | Lkb1flox/flox;Myh11-Cre/ERT2基因工程小鼠和人类主动脉瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1214 | 2025-10-05 |
Proximity-dependent labeling identifies dendritic cells that drive the tumor-specific CD4+ T cell response
2024-10-04, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adq8843
PMID:39365874
|
研究论文 | 本研究通过邻近标记技术识别了驱动肿瘤特异性CD4+ T细胞反应的树突状细胞 | 首次使用LIPSTIC单细胞转录组学技术追踪树突状细胞与T细胞的相互作用，揭示了肿瘤引流淋巴结和肿瘤微环境中少数超活化树突状细胞的关键作用 | 未明确说明样本规模和研究模型的具体限制 | 探究树突状细胞在肿瘤免疫应答中的具体作用机制 | 树突状细胞、CD4+ T细胞、CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 肿瘤免疫 | LIPSTIC邻近标记、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1215 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies interferon-inducible monocytes/macrophages as a cellular target for mitigating the progression of abdominal aortic aneurysm and rupture risk
2024-09-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae117
PMID:38836630
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定干扰素诱导性单核细胞/巨噬细胞是减轻腹主动脉瘤进展和破裂风险的细胞靶点 | 首次通过单细胞RNA测序在腹主动脉瘤中发现独特的干扰素诱导性单核细胞/巨噬细胞亚群，并揭示其在疾病进展中的关键作用 | 研究基于AngII灌注的ApoE-/-小鼠模型，人类样本验证尚需进一步研究 | 探索腹主动脉瘤发展和进展中涉及的细胞类型和信号通路 | AngII灌注的ApoE-/-小鼠腹主动脉标本 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同病理特征的腹主动脉标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1216 | 2025-10-05 |
Description of Bacterial RNA Transcripts Detected in Mycobacterium tuberculosis - Infected Cells from Peripheral Human Granulomas using Single Cell RNA Sequencing
2024-Aug-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.20.608852
PMID:39229107
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序检测人类结核肉芽肿中结核分枝杆菌的RNA转录本 | 在针对真核mRNA设计的单细胞RNA测序文库中成功捕获并分析了结核分枝杆菌的转录本，揭示了细菌转录本的序列变异模式 | 仅包含经医院病理实验室确认的结核感染患者的细菌序列数据，样本来源有限 | 探索结核分枝杆菌在感染宿主细胞中的转录特征和序列变异 | 来自巴布亚新几内亚莫尔兹比港总医院结核病诊所患者的细针穿刺样本 | 数字病理 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 经抗酸显微镜和/或GeneXpert分析确认的结核感染患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序转录组学流程，使用poly-T引物在约30微米珠上启动mRNA扩增 |
| 1217 | 2025-10-05 |
Immune disease dialogue of chemokine-based cell communications as revealed by single-cell RNA sequencing meta-analysis
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.17.603936
PMID:39071425
|
荟萃分析 | 通过单细胞RNA测序荟萃分析揭示免疫疾病中基于趋化因子的细胞通讯机制 | 首次通过跨疾病跨组织的单细胞RNA测序荟萃分析系统揭示免疫细胞趋化与外渗模式 | 基于公开数据库的二次分析，受原始数据质量和覆盖范围限制 | 解析免疫疾病中细胞间通讯与免疫细胞迁移机制 | 多种免疫疾病患者组织样本（皮肤、肺、结肠、肾脏） | 生物信息学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 配体-受体相互作用分析 | 单细胞转录组数据 | 多种免疫疾病公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1218 | 2025-10-05 |
NAD + activates renal metabolism and protects from chronic kidney disease in a model of Alport syndrome
2024-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.580911
PMID:38464264
|
研究论文 | 本研究通过Alport综合征小鼠模型揭示了NAD+补充通过激活肾代谢途径特别是近端小管细胞的脂肪酸氧化来保护慢性肾脏病的机制 | 首次在Alport小鼠模型中应用单核RNA测序和空间转录组学技术，首次报道该模型中转录水平的性别差异，明确了NAD+补充通过近端小管细胞发挥肾脏保护作用的具体机制 | 研究仅限于Alport综合征小鼠模型，尚未在人类或其他慢性肾脏病模型中验证 | 探究NAD+补充保护慢性肾脏病的分子机制和涉及的细胞类型 | Alport综合征小鼠模型 | 代谢研究 | 慢性肾脏病 | bulk RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 正交成像技术, 生化检测 | NA | RNA测序数据, 影像数据, 生化数据 | Alport综合征小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1219 | 2025-10-05 |
Modeling Glioma Intratumoral Heterogeneity with Primary Human Neural Stem and Progenitor Cells
2024-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.20.619254
PMID:39484434
|
研究论文 | 利用人类神经干细胞和祖细胞建立胶质瘤模型研究肿瘤内异质性 | 首次使用从胎儿脑组织纯化的同源神经干细胞和祖细胞建立胶质瘤模型，系统研究细胞起源对肿瘤异质性的影响 | 使用免疫缺陷小鼠模型可能无法完全模拟人类肿瘤微环境 | 探究细胞起源如何塑造胶质瘤的肿瘤内异质性 | 人类神经干细胞、胶质祖细胞和少突胶质前体细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种同源神经细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1220 | 2025-10-05 |
Chronic social defeat stress induces meningeal neutrophilia via type I interferon signaling
2024-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.30.610447
PMID:39257811
|
研究论文 | 本研究揭示了慢性社交挫败应激通过I型干扰素信号通路诱导脑膜中性粒细胞增多的机制 | 首次发现慢性应激通过I型干扰素信号通路驱动颅骨骨髓来源的中性粒细胞向脑膜迁移 | 研究仅使用小鼠模型，人类相关性尚需验证 | 探究应激相关障碍中脑膜免疫反应的分子机制 | 小鼠脑膜免疫细胞 | 神经免疫学 | 应激相关障碍 | 流式细胞术,免疫组织化学,组织透明化,单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |