单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202401-202412] [清除筛选条件]
当前共找到 7461 篇文献,本页显示第 1181 - 1200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1181 2025-10-05
Single-cell sequencing reveals the impact of endothelial cell PIEZO1 expression on thoracic aortic aneurysm
2024-06, Journal of molecular and cellular cardiology IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞测序揭示内皮细胞PIEZO1表达对胸主动脉瘤的影响 首次发现PIEZO1在胸主动脉瘤中表达降低,并证实其激动剂Yoda1可通过干预巨噬细胞浸润、细胞外基质降解和新血管形成抑制动脉瘤形成 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 探究PIEZO1在胸主动脉瘤发病机制中的作用 胸主动脉瘤患者样本和基因工程小鼠模型 单细胞生物学 胸主动脉瘤 单细胞测序,基因敲除模型,体内外药理学干预 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1182 2025-10-05
Syngeneic murine models with distinct immune microenvironments represent subsets of human intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-06, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究开发并表征了具有不同遗传驱动因素的免疫活性小鼠肝内胆管癌模型,揭示了肿瘤基因型与免疫微环境表型之间的相关性 首次开发了Fbxw7ΔF/Akt驱动的肝内胆管癌遗传小鼠模型,并系统比较了三种不同基因型模型的肿瘤免疫微环境特征和免疫治疗反应差异 研究基于小鼠模型,其临床转化价值需要进一步验证;样本规模相对有限 阐明胆管癌肿瘤免疫微环境特征,测试新型免疫治疗策略 肝内胆管癌小鼠模型和人类胆管癌患者队列 肿瘤免疫学 胆管癌 单细胞RNA测序,CITE-seq,全外显子测序,批量RNA测序 小鼠遗传模型 基因组数据,转录组数据,单细胞数据 三种不同基因型的小鼠胆管癌模型 NA 单细胞RNA测序,单细胞多组学 NA NA
1183 2024-08-07
Correction to 'Probabilistic cell/domain-type assignment of spatial transcriptomics data with SpatialAnno'
2024-Jan-25, Nucleic acids research IF:16.6Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1184 2025-10-05
Fate (or state) of CA2 neurons in a mineralocorticoid receptor knockout
2024-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间转录组学方法探究盐皮质激素受体敲除后海马CA2区神经元的命运变化 首次发现MR敲除导致CA2神经元获得CA1样分子表型,揭示了MR在控制CA2神经元发育状态中的关键作用 研究主要关注分子表型变化,对行为功能影响的直接证据不足 探究盐皮质激素受体敲除对海马CA2区神经元命运的影响 小鼠海马CA2区神经元 空间转录组学 NA 空间转录组学 条件性基因敲除模型 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1185 2025-10-05
Linking transcriptome and morphology in bone cells at cellular resolution with generative AI
2024-Dec-31, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research IF:5.1Q1
观点文章 探讨生成式AI在骨细胞转录组与形态学关联分析中的应用前景与挑战 首次系统提出将生成式AI应用于骨细胞多模态数据整合分析,实现细胞分辨率下的转录组与形态学关联研究 骨单细胞数据集存在技术偏差、重要骨细胞类型缺乏分析、空间信息不足等问题 推动生成式AI在骨细胞生物学研究中的应用,揭示细胞水平的复杂生物过程 骨细胞 计算机视觉,自然语言处理,机器学习 骨科疾病 单细胞测序,空间转录组学 生成式AI 组织学图像,单细胞分子数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1186 2025-10-05
Substrate Stiffness Dictates Unique Doxorubicin-induced Senescence-associated Secretory Phenotypes and Transcriptomic Signatures in Human Pulmonary Fibroblasts
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究机械张力通过基质刚度调控人肺成纤维细胞衰老相关分泌表型和转录组特征 首次揭示基质刚度特异性影响多柔比星诱导的细胞衰老和SASP表型,并发现高刚度驱动的胶原蛋白富集特征 研究主要基于体外细胞模型,体内验证相对有限 探究机械力刺激对细胞衰老和衰老相关分泌表型的影响机制 人原代肺成纤维细胞(IMR-90)和小鼠肺纤维化模型 细胞生物学 肺纤维化 质谱分析、转录组测序、单细胞RNA测序、计算元分析 NA 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 人原代肺成纤维细胞在不同刚度基质上的培养模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1187 2025-10-05
Spatial analysis reveals targetable macrophage-mediated mechanisms of immune evasion in hepatocellular carcinoma minimal residual disease
2024-Oct, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 通过空间分析揭示肝细胞癌微小残留病中巨噬细胞介导的免疫逃逸机制 首次通过单细胞高plex细胞成像和空间转录组学识别PD-L1+M2样巨噬细胞与干细胞样肿瘤细胞的空间互作机制 研究样本量相对有限(108例患者),且主要基于小鼠模型验证 探索肝细胞癌微小残留病的免疫逃逸机制及治疗靶点 肝细胞癌患者样本(108例,107万个细胞)和转基因小鼠模型 数字病理学 肝细胞癌 单细胞高plex细胞成像,空间转录组学 转基因小鼠模型,同源原位移植模型 空间成像数据,转录组数据 108例患者,107万个细胞 NA 单细胞成像,空间转录组学 NA NA
1188 2025-10-05
Spatial Transcriptomics Identifies Cellular and Molecular Characteristics of Scleroderma Skin Lesions: Pilot Study in Juvenile Scleroderma
2024-Aug-23, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究首次利用空间转录组学技术分析幼年硬皮病患者皮肤病变的细胞和分子特征 首次将Visium CytAssist空间转录组学平台应用于幼年硬皮病皮肤病变研究,并结合单细胞RNA测序数据进行验证 初步研究,样本量有限 探索幼年硬皮病皮肤病变的细胞和分子机制 幼年硬皮病患者的皮肤病变组织 数字病理学 硬皮病 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 幼年硬皮病患者皮肤病变组织(具体数量未明确) 10x Genomics 空间转录组学,单细胞RNA测序 Visium CytAssist Visium CytAssist空间转录组学平台
1189 2025-10-05
Optimizing cryopreservation of nasal polyp tissue for cellular functional studies and single-cell RNA sequencing
2024-May, International forum of allergy & rhinology IF:7.2Q1
研究论文 比较不同冷冻保存方法对鼻息肉组织细胞功能和单细胞RNA测序的影响 首次系统评估鼻息肉组织不同冷冻保存方法对特定细胞类型功能和单细胞测序的影响 仅针对鼻息肉组织,研究结果可能不适用于其他组织类型 优化鼻息肉组织的冷冻保存方法以支持细胞功能研究和单细胞RNA测序 鼻息肉组织样本 单细胞测序 鼻息肉 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1190 2025-10-05
An integrated single-nucleus and spatial transcriptomics atlas reveals the molecular landscape of the human hippocampus
2024-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过整合单核和空间转录组学数据构建人类海马体分子图谱 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术揭示人类海马体细胞类型的分子特征和空间分布 研究样本仅来自10名神经典型成年捐赠者,样本量相对有限 解析人类海马体细胞类型的分子特征和空间组织 人类前海马体组织 空间转录组学 NA 单核RNA测序, 空间转录组学 非负矩阵分解(NMF) 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 10名成年神经典型捐赠者的相邻组织切片 NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1191 2025-10-05
Shear stress is uncoupled from atheroprotective KLK10 in atherosclerotic plaques
2024-11, Atherosclerosis IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过比较健康和动脉粥样硬化条件下内皮细胞对生理剪切应力的转录组反应,揭示了动脉粥样硬化斑块中生理剪切应力与保护性因子KLK10的解耦现象 首次发现动脉粥样硬化斑块中生理剪切应力与保护性因子KLK10的解耦机制,揭示了疾病状态下内皮细胞对机械力刺激反应能力的改变 研究主要基于小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证;单细胞RNA测序样本量有限 探究动脉粥样硬化条件下内皮细胞对生理剪切应力保护性反应的改变机制 小鼠主动脉内皮细胞,包括健康C57BL/6小鼠、轻度病变Apoe-/-正常饮食小鼠和重度病变Apoe-/-高脂饮食小鼠 心血管生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序,3D光片成像,计算流体动力学 NA 单细胞转录组数据,成像数据 三组小鼠模型的内皮细胞(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1192 2025-10-05
Glutathione accelerates the cell cycle and cellular reprogramming in plant regeneration
2024-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了谷胱甘肽通过加速细胞周期和细胞重编程在植物再生中的关键作用 首次发现损伤附近细胞通过缩短G1期显著提高分裂速率,并鉴定出G1期存在短暂的谷胱甘肽核内峰值 研究主要基于拟南芥根系,在其他植物系统中的普适性有待验证 探究细胞重编程过程中的细胞周期动态 拟南芥根系细胞 植物生物学 NA 单细胞RNA测序, 活体成像 NA 基因表达数据, 图像数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
1193 2025-10-05
SpotSweeper: spatially-aware quality control for spatial transcriptomics
2024-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种名为SpotSweeper的空间转录组学质量控制方法 首次提出考虑空间位置信息的质量控制方法,能够识别局部异常值和区域伪影 仅使用公开数据进行验证,缺乏更广泛的数据集验证 开发专门针对空间转录组数据的质量控制方法 空间转录组数据中的低质量点和组织伪影 空间转录组学 NA 空间转录组学 多尺度方法 空间转录组数据 公开数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium平台
1194 2025-10-05
Learning antibody sequence constraints from allelic inclusion
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用等位基因包含现象学习抗体序列约束,通过单细胞测序数据识别异常序列并训练机器学习模型 首次大规模发现等位基因包含的幼稚B细胞,并利用这些细胞学习抗体序列约束,模型性能优于现有方法 研究主要关注轻链,对重链的研究仅限于小鼠模型 探索抗体序列的约束机制及其与抗体功能特性的关系 人类和小鼠的B细胞及其表达的抗体序列 机器学习 NA 单细胞测序 机器学习模型 序列数据 数千个幼稚B细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1195 2025-10-05
Characterisation of HBV and co-infection with HDV and HIV through spatial transcriptomics
2024-Aug, eGastroenterology
研究论文 本研究通过空间转录组学分析慢性乙型肝炎患者肝活检样本,揭示HBV与HDV/HIV共感染时的肝内转录景观和免疫特征 首次应用空间转录组学技术系统分析HBV与HDV/HIV共感染患者的肝内转录组特征和细胞组成 样本量较小(仅3例初治患者),属于原理验证性研究 评估空间转录组学在表征HBV与HDV/HIV共感染患者肝内转录景观、细胞组成和生物通路中的应用价值 慢性HBV感染患者的福尔马林固定石蜡包埋肝活检样本 空间转录组学 乙型肝炎 空间转录组学,数字空间分析 加权基因共表达网络分析 空间转录组数据 3例初治慢性HBV与HDV/HIV共感染患者 NanoString 空间转录组学 GeoMx数字空间分析平台 GeoMx Human Whole Transcriptome Atlas检测
1196 2025-10-05
Reproducible single cell annotation of programs underlying T-cell subsets, activation states, and functions
2024-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了T细胞注释工具TCAT,用于在单细胞水平量化T细胞的基因表达程序 提出了TCAT分析框架,能够同时量化预定义的基因表达程序,揭示了46个可重复的T细胞功能程序 NA 改进T细胞特征分析框架,解决传统分类与单细胞数据连续状态不匹配的问题 T细胞亚群、激活状态和功能 单细胞分析 COVID-19, 癌症 单细胞RNA测序 TCAT分析流程 单细胞RNA测序数据 170万个T细胞,来自700名个体的38种组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1197 2024-08-07
Identification of TIMPs signatures in Randall plaque from single-cell RNA sequencing (scRNA-Seq) analysis
2024-01-16, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1198 2024-11-22
Author Correction: Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2024-Dec, The EMBO journal
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1199 2025-10-05
Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation
2024-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞测序揭示了脂肪组织巨噬细胞在衰老过程中的多样性变化,发现神经相关巨噬细胞控制脂肪稳态并抑制年龄相关炎症 首次使用血管内标记排除循环髓系细胞,结合单细胞测序和正交验证,定义了寿命周期内驻留脂肪组织巨噬细胞的多样性变化,并发现CD169+神经相关巨噬细胞的新功能 研究主要基于小鼠模型,人类脂肪组织巨噬细胞的变化模式可能有所不同 探究脂肪组织巨噬细胞如何控制年龄相关炎症和脂肪稳态 小鼠内脏白色脂肪组织中的巨噬细胞亚群 单细胞生物学 年龄相关疾病 单细胞测序,血管内标记,正交验证 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1200 2025-10-05
Vascular heterogeneity of tight junction Claudins guides organotropic metastasis
2024-Sep, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 本研究揭示了器官特异性血管异质性通过调控紧密连接蛋白Claudins的表达决定乳腺癌器官倾向性转移的机制 首次阐明血管内皮细胞特异性Claudins蛋白表达差异是决定器官特异性转移的关键因素,独立于癌细胞内在机制 研究主要聚焦于肺和肾脏转移的对比,其他器官转移机制尚未完全探索 探究乳腺癌器官特异性转移的机制 转移性乳腺 carcinoma 模型 癌症生物学 乳腺癌 单细胞测序分析 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部