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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the process of CA19-9 production and dynamics of the immune microenvironment between CA19-9 (+) and CA19-9 (-) PDAC
2024-Oct-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003130
PMID:38816396
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胰腺导管腺癌中CA19-9的产生过程及CA19-9阳性与阴性患者免疫微环境的动态差异 | 首次在单细胞分辨率下识别出三种高产生CA19-9的癌细胞亚型,发现CA19-9通过抗原呈递癌症相关成纤维细胞的旁路产生机制,并证实CA19-9促进巨噬细胞M2极化的新功能 | 样本量较小(仅6个PDAC样本和2个癌旁样本),需更大规模研究验证 | 阐明CA19-9在胰腺导管腺癌中的产生机制及其在肿瘤微环境中的作用 | 胰腺导管腺癌患者组织样本(CA19-9阳性和阴性)及体外共培养细胞模型 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,体外共培养 | NA | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像 | 6个PDAC样本(3个CA19-9阳性,3个阴性)+2个癌旁样本+在线数据库补充样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1182 | 2025-10-06 |
The integrated molecular and histological analysis defines subtypes of esophageal squamous cell carcinoma
2024-10-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53164-x
PMID:39419971
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研究论文 | 通过整合分子和病理学分析定义食管鳞状细胞癌的亚型 | 首次结合基因组-转录组特征和AI辅助病理图像分析对ESCC进行综合分型,发现具有特定分子和病理特征的四种亚型 | 样本量相对有限(120例),仅针对中国人群 | 阐明食管鳞状细胞癌的分子和免疫特征,推动个性化治疗策略发展 | 120例中国食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 食管癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 基因组学, 转录组学, 免疫组织化学 | 深度学习模型 | 基因组数据, 转录组数据, 病理图像 | 120例 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1183 | 2025-10-06 |
Multimodal Spatial Profiling Reveals Immune Suppression and Microenvironment Remodeling in Fallopian Tube Precursors to High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2024-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.615007
PMID:39386723
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研究论文 | 通过整合高plex成像和空间转录组学分析输卵管前体病变向高级别浆液性卵巢癌发展的分子变化和肿瘤微环境重塑 | 首次通过多模态空间分析揭示输卵管前体病变中染色体不稳定性、持续性干扰素信号传导及免疫失调等分子变化 | 研究样本数量未明确说明,且仅关注输卵管前体病变向HGSOC的转变过程 | 阐明输卵管前体病变向高级别浆液性卵巢癌发展的分子机制和肿瘤微环境变化 | 人类输卵管组织样本,包括p53特征、浆液性输卵管上皮内癌和侵袭性HGSOC | 数字病理学 | 卵巢癌 | 高plex成像, 空间转录组学 | NA | 图像, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1184 | 2025-10-06 |
Bronchopulmonary Dysplasia with Pulmonary Hypertension Associates with Loss of Semaphorin Signaling and Functional Decrease in FOXF1 Expression
2024-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.27.609955
PMID:39253423
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析早产儿肺组织,揭示了支气管肺发育不良伴肺动脉高压与信号素信号通路缺失及FOXF1表达功能下降的关联 | 首次在人类早产儿肺组织中通过单细胞RNA测序识别出BPD+PH特有的异常毛细血管细胞状态,并发现信号素引导信号通路缺陷 | 样本量相对有限,需要在更大队列中验证发现 | 探究驱动人类支气管肺发育不良发展的细胞和分子动态机制 | 早产儿肺组织(BPD和BPD+PH阶段)与足月婴儿肺组织的对比 | 单细胞基因组学 | 支气管肺发育不良,肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 早产儿和足月婴儿肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1185 | 2025-10-06 |
Advancing cell-based therapy in sepsis: An anesthesia outlook
2024-Jul-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003097
PMID:38708689
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综述 | 本文从麻醉学角度综述细胞疗法在脓毒症治疗中的研究进展、现状及围手术期管理策略 | 整合单细胞测序与基因编辑技术探讨脓毒症特异性免疫反应,提出CAR-免疫细胞疗法新方向 | 未涉及具体临床试验数据验证,主要基于理论机制探讨 | 探索细胞疗法在脓毒症围手术期管理中的应用潜力 | 脓毒症患者及免疫细胞治疗机制 | 医学研究 | 脓毒症 | 单细胞测序, 基因编辑 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1186 | 2025-10-06 |
Identification of potential immune-related mechanisms related to the development of multiple myeloma
2024-Jul-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003116
PMID:38844445
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析初治多发性骨髓瘤患者的免疫微环境,特别关注单核/巨噬细胞的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序系统揭示初治多发性骨髓瘤患者骨髓免疫细胞特征,发现干扰素应答细胞群和免疫抑制性单核/巨噬细胞的富集 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究多发性骨髓瘤免疫微环境特征,特别关注单核/巨噬细胞的作用机制 | 多发性骨髓瘤患者和健康捐赠者的骨髓免疫细胞 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 流式细胞数据 | 多发性骨髓瘤患者和健康捐赠者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1187 | 2025-10-06 |
6-Formylindolo[3,2-b]carbazole, a potent ligand for the aryl hydrocarbon receptor, attenuates concanavalin-induced hepatitis by limiting T-cell activation and infiltration of proinflammatory CD11b+ Kupffer cells
2024-05-29, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae018
PMID:38366630
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研究论文 | 本研究探讨FICZ通过激活芳烃受体在刀豆蛋白A诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型中的保护作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测序技术,揭示FICZ通过调控CD3+ T细胞活化和CD11b+ Kupffer细胞浸润减轻肝炎的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;机制研究仍待深入 | 探究FICZ通过芳烃受体在自身免疫性肝炎中的保护作用及机制 | 刀豆蛋白A诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序, 转座酶可及染色质测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 1188 | 2025-10-06 |
Recent advances in cancer-associated fibroblast: Biomarkers, signaling pathways, and therapeutic opportunities
2024-Mar-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003031
PMID:38420743
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综述 | 本文总结了癌症相关成纤维细胞(CAFs)的研究进展,重点关注其表型和功能异质性、特定信号通路及靶向治疗策略 | 系统梳理了CAFs的异质性特征及其在肿瘤微环境中的多重功能,并总结了靶向CAFs的临床试验现状 | CAFs在肿瘤微环境中的复杂性尚未完全阐明,现有靶向CAFs的临床试验结果大多不理想 | 探讨癌症相关成纤维细胞在肿瘤发生发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 基因工程小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1189 | 2025-10-06 |
Binding profiles for 961 Drosophila and C. elegans transcription factors reveal tissue-specific regulatory relationships
2024-Dec-23, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279037.124
PMID:39438113
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研究论文 | 本研究通过系统分析果蝇和线虫的转录因子结合位点,揭示了组织特异性调控关系 | 首次在两个主要模式生物中系统性地构建了转录因子结合位点图谱,提出了'元峰'概念并建立了机器学习模型识别细胞类型特异性调控因子 | 研究主要基于模式生物,结果向其他物种的普适性需要进一步验证 | 构建转录因子结合位点图谱并解析调控网络 | 果蝇和线虫的转录因子 | 基因组学 | NA | ChIP-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 基因组测序数据,转录组数据 | 961个转录因子(果蝇605个,线虫356个),识别460万个结合位点 | NA | 染色质免疫沉淀测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1190 | 2025-10-06 |
Epigenetic Alteration of Smooth Muscle Cells Regulates Endothelin-Dependent Blood Pressure and Hypertensive Arterial Remodeling
2024-Jul-10, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.07.09.24310178
PMID:39040193
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研究论文 | 本研究揭示了表观遗传酶JMJD3通过调控平滑肌细胞可塑性影响血压和高血压动脉重塑的机制 | 首次将高血压相关人类DNA变异与平滑肌细胞表观遗传调控联系起来,并建立了新型平滑肌细胞特异性Jmjd3缺陷小鼠模型 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索表观遗传机制在高血压发病和动脉重塑中的作用 | 平滑肌细胞、人类遗传变异、小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | GWAS、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、基因表达数据 | 三个独立的人类GWAS研究数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1191 | 2025-10-06 |
Deciphering the heterogeneity of differentiating hPSC-derived corneal limbal stem cells through single-cell RNA sequencing
2024-07-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.06.001
PMID:38942029
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析人源多能干细胞分化为角膜缘干细胞过程中的异质性 | 首次在hPSC-LSC分化过程中发现并描述了四种先前未知的细胞状态(中胚层样或未分化亚群) | 研究仅涉及三种hPSC细胞系,样本规模有限 | 解析hPSC分化为角膜缘干细胞过程中的细胞异质性 | 人源多能干细胞分化的角膜缘干细胞 | 单细胞组学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种hPSC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1192 | 2025-10-06 |
Human pluripotent stem cell-derived kidney organoids reveal tubular epithelial pathobiology of heterozygous HNF1B-associated dysplastic kidney malformations
2024-06-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.04.011
PMID:38788724
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研究论文 | 本研究通过人类多能干细胞衍生的肾脏类器官揭示HNF1B杂合突变导致肾发育不良的肾小管上皮病理机制 | 首次利用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建HNF1B杂合突变肾脏类器官模型,发现谷氨酸能信号通路在肾脏发育中的新作用 | 类器官模型可能无法完全模拟体内肾脏发育的复杂性 | 研究HNF1B杂合突变导致肾发育不良的病理机制 | 人类胚胎干细胞和诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 发育生物学 | 肾发育不良 | CRISPR-Cas9基因编辑, RNA测序 | 肾脏类器官模型 | 基因表达数据 | 来自HNF1B相关肾发育不良家族的iPSCs和基因编辑的ESCs | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1193 | 2025-10-06 |
The Contribution of Meckel's Cartilage-Derived Type II Collagen-Positive Cells to the Jawbone Development and Repair
2024-Jun-05, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
DOI:10.1369/00221554241259059
PMID:38836522
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研究论文 | 本研究揭示了源自米克尔软骨的II型胶原阳性细胞在下颌骨发育和修复中的关键作用 | 首次发现II型胶原阳性细胞来源于原始米克尔软骨,并在胚胎期和出生后阶段均参与下颌骨成骨过程 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究II型胶原阳性细胞在下颌骨发育和修复中的具体作用机制 | 小鼠下颌骨组织 | 发育生物学 | 骨骼发育异常 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,他莫昔芬诱导CreER系统 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 胚胎期10.5天小鼠下颌骨 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1194 | 2025-10-06 |
Multi-omic profiling reveals potential biomarkers of hepatocellular carcinoma prognosis and therapy response among mitochondria-associated cell death genes in the context of 3P medicine
2024-Jun, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-024-00362-8
PMID:38841626
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研究论文 | 本研究通过多组学分析构建了基于线粒体相关细胞死亡基因的肝细胞癌预后预测模型 | 开发了整合10种机器学习算法和67种组合的共识线粒体细胞死亡指数(MCDI),首次在3P医学框架下系统评估线粒体细胞死亡基因在肝细胞癌中的预后和治疗反应预测价值 | 需要进一步的大规模临床验证来确认模型的普适性 | 构建肝细胞癌预后和治疗反应预测模型以支持预测性、预防性和个性化医学策略 | 肝细胞癌患者及其相关基因表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 多组学分析、RT-qPCR、western blotting、免疫组织化学染色 | 集成机器学习算法 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 训练队列、验证队列和内部临床队列 | NA | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 1195 | 2025-10-06 |
The diversification of methods for studying cell-cell interactions and communication
2024-Jun, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-023-00685-8
PMID:38238518
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综述 | 本文探讨细胞间相互作用研究方法的最新进展和工具多样化 | 重点关注下一代计算工具的演变,能够处理细胞异质性、空间组织和复杂数据集 | NA | 推动细胞间相互作用和通讯研究的发展 | 细胞间分子相互作用和通讯机制 | 生物信息学 | NA | 转录组学,单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据,单细胞数据,空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1196 | 2025-10-06 |
Acquisition of Drug Resistance in Basal Cell Nevus Syndrome Tumors through Basal to Squamous Cell Carcinoma Transition
2024-Jun, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.10.040
PMID:38157930
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研究论文 | 本研究通过多组学和空间转录组学分析,揭示了基底细胞痣综合征肿瘤通过基底细胞向鳞状细胞癌转化获得SMO抑制剂耐药性的机制 | 首次发现Gorlin综合征肿瘤可通过基底细胞向鳞状细胞癌转化获得SMO抑制剂耐药性,并鉴定出PCYT2、ETNK1和磷脂酰乙醇胺生物合成途径作为该耐药性的遗传抑制因子 | 基于单个病例研究,样本量有限,需要更多病例验证 | 探究Gorlin综合征患者长期SMO抑制剂治疗后产生耐药性的分子机制 | 基底细胞痣综合征(Gorlin综合征)患者的SMO抑制剂耐药性肿瘤 | 数字病理学 | 基底细胞癌 | 多组学分析, 空间转录组学, 空间全外显子组基因组分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 1例Gorlin综合征患者的耐药性肿瘤 | NA | 空间转录组学, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 1197 | 2025-10-06 |
Unique challenges and best practices for single cell transcriptomic analysis in toxicology
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100475
PMID:38645720
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综述 | 探讨毒理学中单细胞转录组学应用的独特挑战及最佳分析实践 | 系统阐述毒理学领域单细胞转录组分析的特有挑战并提出针对性解决方案 | NA | 提升单细胞转录组学在毒理学研究中的应用效果 | 毒理学研究中的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1198 | 2025-10-06 |
Endothelial Cell Flow-Mediated Quiescence Is Temporally Regulated and Utilizes the Cell Cycle Inhibitor p27
2024-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320671
PMID:38602102
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研究论文 | 本研究揭示了血流介导的内皮细胞静息状态具有时间调节特性,并发现细胞周期抑制剂p27在此过程中起关键作用 | 首次发现内皮细胞静息深度具有时间动态调节特性,并阐明p27通过HES1和ID3转录调控介导不同静息状态转换的机制 | 研究主要基于体外流动模型和模式生物,在人类生理环境中的验证仍需进一步研究 | 探究血流介导的内皮细胞静息状态的建立和维持机制 | 人原代内皮细胞、小鼠和斑马鱼内皮细胞 | 细胞生物学 | 血管功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因表达调控、体内细胞行为分析 | NA | 基因表达数据、细胞行为数据 | 原代内皮细胞、小鼠和斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1199 | 2025-10-06 |
Performing Suction Blister Skin Biopsies
2024-Jun, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.1073
PMID:38924322
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研究论文 | 介绍一种替代传统皮肤活检的微创无疤痕皮肤采样方法——吸疱皮肤活检技术 | 提出使用负压和温和加热诱导吸疱的微创皮肤采样方法,无需麻醉且不留永久疤痕 | NA | 开发改进的皮肤组织采样技术 | 人体皮肤组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞培养 | NA | 细胞,蛋白质,代谢物 | 每个活检部位最多产生5个直径10mm的水疱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1200 | 2025-10-06 |
IL-1β Inhibition Partially Negates the Beneficial Effects of Diet-Induced Atherosclerosis Regression in Mice
2024-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320800
PMID:38695167
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研究论文 | 本研究探讨IL-1β抑制对饮食诱导动脉粥样硬化消退的负面影响 | 首次揭示IL-1β在维持动脉粥样硬化斑块稳定性中的关键保护作用 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类中进行验证 | 探究降脂治疗中IL-1β对晚期动脉粥样硬化斑块组成和稳定性的调控机制 | Apoe-/-基因敲除小鼠的动脉粥样硬化病变 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,飞行时间细胞术,免疫染色,共聚焦显微镜 | 小鼠动脉粥样硬化模型 | 基因表达数据,图像数据 | Apoe-/-小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |