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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-03-13 |
Modulating inflammation with interleukin 37 treatment ameliorates murine Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
2024-04, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.12.006
PMID:38158181
|
研究论文 | 本研究探讨了抗炎细胞因子IL37b在治疗常染色体显性多囊肾病(ADPKD)中的潜力,通过基因小鼠模型证明其能减少囊肿负担并促进干扰素信号通路 | 首次揭示IL37b通过促进肾脏驻留巨噬细胞中的干扰素信号通路来抑制ADPKD囊肿形成,为其作为潜在疗法提供了新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化效果尚需验证,且未详细探讨IL37b在其他细胞类型中的作用 | 评估IL37b作为ADPKD治疗策略的有效性及其作用机制 | ADPKD基因小鼠模型(包括早期和成年发病型)及肾脏组织 | 数字病理学 | 常染色体显性多囊肾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 基因工程小鼠模型 | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-03-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals transdifferentiation of parathyroid chief cells into oxyphil cells in patients with uremic secondary hyperparathyroidism
2024-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.11.027
PMID:38142040
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者中甲状旁腺主细胞向嗜酸性细胞转分化的过程 | 首次建立了人类甲状旁腺的单细胞转录组图谱,并发现了主细胞向嗜酸性细胞的转分化过程,该过程与尿毒症环境中线粒体逐渐富集相关 | 研究样本量较小(仅3名患者),且动物模型(裸鼠移植)可能无法完全模拟人体内的复杂生理环境 | 探究尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者中甲状旁腺嗜酸性细胞的起源和增殖机制 | 从尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者切除的甲状旁腺结节(主细胞结节、嗜酸性细胞结节和混合结节) | 单细胞组学 | 继发性甲状旁腺功能亢进 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者的甲状旁腺混合结节 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-03-13 |
Advancing parathyroid anatomy understanding through single-cell RNA sequencing in uremic secondary hyperparathyroidism
2024-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.12.005
PMID:38388141
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评论 | 本文探讨了单细胞RNA测序在尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症研究中的最新应用,揭示了甲状旁腺内的细胞动态 | 通过单细胞RNA测序技术,对主细胞和嗜酸性细胞的分化过程提供了新见解,挑战了传统观点 | NA | 利用单细胞RNA测序技术增进对甲状旁腺解剖结构的理解 | 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症中的甲状旁腺细胞 | 数字病理学 | 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-03-13 |
A Cell Cycle-aware Network for Data Integration and Label Transferring of Single-cell RNA-seq and ATAC-seq
2024-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.31.578213
PMID:38352302
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研究论文 | 本文开发了一种细胞周期感知网络(CCAN),用于在整合单细胞多组学数据时去除细胞周期效应,同时保留细胞类型特异性变异 | 这是首个研究单细胞多组学数据整合中细胞周期效应的计算模型 | NA | 研究单细胞多组学数据整合中的细胞周期效应,并开发去除该效应的方法 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞ATAC测序(scATAC-seq)数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 细胞周期感知网络(CCAN) | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-03-13 |
Tracking early mammalian organogenesis - prediction and validation of differentiation trajectories at whole organism scale
2024-02-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201867
PMID:37982461
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序追踪小鼠早期器官发生过程,结合计算预测和实验验证,揭示了细胞分化轨迹 | 整合了高密度时间点单细胞数据(从E6.5到E9.5),首次在整体生物尺度上预测并验证了分化轨迹,发现了新的体节来源内皮程序 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于其他物种;时间范围限于早期器官发生阶段 | 追踪早期哺乳动物器官发生过程,建立细胞状态与命运关系的高分辨率图谱 | 小鼠胚胎(E6.5至E9.5阶段) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 计算谱系重建模型 | 单细胞转录组数据 | 超过400,000个细胞(包括300,000个新采样细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-03-13 |
Loss of p73 Expression Contributes to Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-01-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0503OC
PMID:37931077
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研究论文 | 本研究探讨了p73表达缺失在慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的作用,通过小鼠模型和人类样本分析揭示了p73缺失导致多纤毛细胞损失并促进COPD样病理 | 首次在小鼠模型中证明p73功能缺失导致多纤毛细胞缺失并自发发展出COPD样病理,同时发现吸烟和COPD患者中p73表达降低 | 样本量相对有限(人类样本n=82/69/11/12),机制研究仍需深入,动物模型与人类疾病的直接对应性有待验证 | 确定p73缺失是否导致小鼠出现COPD样表型,并探索吸烟或COPD是否影响p73表达 | 小鼠模型(p73缺陷小鼠)、人类气道上皮细胞、吸烟者和COPD患者的气道样本 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、电子显微镜、流式细胞术、形态计量学、强迫振荡技术 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、形态学图像数据、生理功能数据 | 小鼠模型未指定具体数量,人类样本包括当前吸烟者82例、既往吸烟者69例、COPD患者11例、非COPD对照12例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2026-03-10 |
PRMT5/WDR77 Enhances the Proliferation of Squamous Cell Carcinoma via the ΔNp63α-p21 Axis
2024-Nov-11, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16223789
PMID:39594744
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研究论文 | 本研究揭示了PRMT5及其结合伴侣WDR77通过稳定ΔNp63α蛋白并抑制p21,从而促进鳞状细胞癌增殖的新机制 | 首次发现PRMT5与WDR77协同通过ΔNp63α-p21轴促进鳞状细胞癌增殖,为该类癌症提供了新的治疗靶点 | NA | 探究PRMT5在鳞状细胞癌增殖中的作用及其分子机制 | 鳞状细胞癌患者数据、癌细胞系、小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, Western blot, 流式细胞术, MTT法 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞增殖数据 | 来自TCGA和DepMap的鳞状细胞癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-03-10 |
Addressing the mean-variance relationship in spatially resolved transcriptomics data with spoon
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.04.621867
PMID:39574747
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研究论文 | 本文提出了一种名为spoon的统计框架,用于解决空间转录组学数据中的均值-方差关系偏差,以更准确地识别空间可变基因 | 首次在空间转录组学数据中证明并处理均值-方差关系偏差,采用经验贝叶斯技术进行校正 | 未在摘要中明确说明,可能涉及方法在特定数据类型或条件下的适用性限制 | 改进空间转录组学数据分析中空间可变基因的识别准确性 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 经验贝叶斯统计模型 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2026-03-10 |
Distinct Patterns of Smooth Muscle Phenotypic Modulation in Thoracic and Abdominal Aortic Aneurysms
2024-Nov-01, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd11110349
PMID:39590192
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞表型调制的独特模式 | 首次在单细胞水平上比较了胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞的转录组差异,并识别出独特的SMCmod细胞群 | 研究主要基于小鼠模型数据,人类样本验证有限,未来需要更多研究来揭示具体的致病通路 | 探究胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞表型调制的差异及其在疾病发病机制中的作用 | 小鼠和人类的胸主动脉瘤及腹主动脉瘤组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫染色 | NA | RNA测序数据,图像数据 | 来自GEO数据库的小鼠TAA数据集(GSE153534)和AAA数据集(GSE164678, GSE152583)及对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-03-10 |
A LDH-Derived Metal Sulfide Nanosheet-Functionalized Bioactive Glass Scaffold for Vascularized Osteogenesis and Periprosthetic Infection Prevention/Treatment
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403009
PMID:39159063
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研究论文 | 本研究开发了一种功能化生物活性玻璃支架,用于促进血管化骨生成并预防/治疗假体周围感染 | 首次将MgCuFe-LDH衍生的硫化物纳米片功能化到生物活性玻璃支架上,结合抗菌阳离子和NIR-II光热性能,同步解决假体周围感染和骨整合问题 | 研究主要基于动物模型,临床转化效果尚需验证 | 开发一种多功能骨科植入材料,同步促进血管化骨生成和预防/治疗假体周围感染 | 生物活性玻璃支架功能化材料及其在骨再生和抗感染中的应用 | 生物材料与组织工程 | 骨科植入并发症 | 转录组测序、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 111 | 2026-03-10 |
From Cell to Gene: Deciphering the Mechanism of Heart Failure With Single-Cell Sequencing
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308900
PMID:39159065
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示心力衰竭(HF)机制中的应用,重点关注心肌细胞异质性和细胞间通讯网络 | 利用单细胞测序技术克服传统高通量测序的局限性,在单个细胞水平上解析基因表达,从而揭示HF中细胞组成和基因表达的变化,以及微环境中不同细胞群体的独特作用 | 当前心血管研究中单细胞测序技术仍面临挑战,如技术复杂性、数据分析难度以及样本获取限制等 | 深入探究心力衰竭的发病机制,特别是细胞异质性和细胞间相互作用 | 心力衰竭相关的心肌细胞及其他心脏细胞类型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组/转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-03-10 |
GJB2 Promotes HCC Progression by Activating Glycolysis Through Cytoplasmic Translocation and Generating a Suppressive Tumor Microenvironment Based on Single Cell RNA Sequencing
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402115
PMID:39162005
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序发现GJB2在肝细胞癌恶性细胞中高表达,并通过细胞质易位激活糖酵解及抑制性肿瘤微环境促进HCC进展 | 首次揭示了GJB2在HCC中的细胞定位改变(从细胞膜转向细胞质/核),并阐明了其通过激活NF-κB和HIF-1α/GLUT-1/PD-L1通路促进糖酵解及免疫抑制微环境的新机制 | 未明确说明样本数量及具体实验模型细节,机制研究主要在细胞层面进行 | 寻找肝细胞癌的有效治疗靶点 | 肝细胞癌(HCC)细胞及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-03-10 |
DrugFormer: Graph-Enhanced Language Model to Predict Drug Sensitivity
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405861
PMID:39206872
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研究论文 | 本文提出了一种名为DrugFormer的新型图增强大语言模型,用于在单细胞水平预测药物敏感性 | 提出首个结合序列化基因标记和基于基因的知识图谱的图增强大语言模型,用于单细胞水平的药物反应预测 | 模型训练依赖于带药物反应信息的单细胞数据,数据质量和覆盖范围可能影响预测性能 | 预测药物耐药性并揭示耐药细胞的分子机制 | 难治性多发性骨髓瘤和急性髓系白血病患者的单细胞 | 自然语言处理 | 多发性骨髓瘤, 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 图增强大语言模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-03-10 |
Loss of Smek1 Induces Tauopathy and Triggers Neurodegeneration by Regulating Microtubule Stability
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400584
PMID:39206808
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研究论文 | 本研究探讨了Smek1在tau蛋白病中防止神经退行性变的作用 | 首次揭示Smek1缺乏通过加剧tau病理和线粒体功能障碍,以年龄依赖性方式诱导神经退行性变 | NA | 研究Smek1在阿尔茨海默病和其他tau蛋白病中的生理和病理作用 | 小鼠模型和人类大脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-03-10 |
Myeloid Cells and Sensory Nerves Mediate Peritendinous Adhesion Formation via Prostaglandin E2
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405367
PMID:39207041
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结合条件性基因敲除小鼠模型,揭示了髓系细胞和感觉神经通过前列腺素E2介导肌腱周围粘连形成的机制 | 首次阐明髓系细胞中的COX2和感觉神经中的EP4受体在肌腱粘连形成中的关键作用,并发现PGE2局部治疗可改善修复肌腱的生物力学性能 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本分析有限;PGE2治疗的长期效果和安全性尚未评估 | 探究肌腱周围粘连形成的分子机制和潜在治疗靶点 | 人类和小鼠的肌腱组织样本、八种条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞组学 | 肌腱损伤/粘连 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 人类和小鼠标本(具体数量未明确),八种基因敲除小鼠品系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-03-10 |
Hypoxic Upregulation of IER2 Increases Paracrine GMFG Signaling of Endoplasmic Reticulum Stress-CAF to Promote Chordoma Progression via Targeting ITGB1
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405421
PMID:39207055
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研究论文 | 本研究揭示了内质网应激相关癌症相关成纤维细胞亚群通过IER2/GMFG/ITGB1轴促进脊索瘤进展的分子机制 | 首次系统阐明了缺氧微环境如何通过上调IER2将CAFs重编程为ERS-CAF亚群,并发现该亚群通过旁分泌GMFG信号靶向肿瘤细胞ITGB1驱动脊索瘤进展 | 研究主要基于体外和动物模型,临床转化潜力需进一步验证;ERS抑制剂的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究内质网应激相关癌症相关成纤维细胞亚群在脊索瘤中的致癌机制 | 脊索瘤肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞亚群、肿瘤细胞和SPP1巨噬细胞 | 单细胞组学与空间转录组学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、GeoMx数字空间分析、数据非依赖性采集蛋白质组学、bulk RNA-seq、多重定量免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、RNA-seq数据、免疫荧光图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学, bulk RNA-seq | GeoMx Digital Spatial Profiler | NA |
| 117 | 2026-03-10 |
Comprehensive Integration of Multiple Single-Cell Transcriptomic Data Sets Defines Distinct Cell Populations and Their Phenotypic Changes in Murine Atherosclerosis
2024-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320030
PMID:38152886
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研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞转录组数据集,定义了小鼠动脉粥样硬化中不同的细胞群体及其表型变化 | 开发了基于报告基因表达的算法来量化平滑肌细胞向巨噬细胞表型的转分化,并整合多个数据集进行元分析以解决现有研究中的不一致发现 | 研究受限于现有数据集的实验条件,且转分化事件在检测范围内极为罕见 | 解决动脉粥样硬化单细胞RNA测序研究中的不一致结果,并深入理解驻留血管细胞在疾病中的作用 | 小鼠动脉粥样硬化模型中的血管细胞,包括平滑肌细胞、内皮细胞和主动脉瓣细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,原位杂交 | 分类算法 | 单细胞转录组数据,图像数据 | 多个已发表数据集的整合,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-03-06 |
Spatially Informed Graph Structure Learning Extracts Insights from Spatial Transcriptomics
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403572
PMID:39382177
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研究论文 | 本文提出了一种名为STAGUE的创新框架,通过图结构学习从空间转录组数据中同时学习细胞图结构和低维嵌入,以提升空间聚类精度并发现新的细胞间相互作用 | STAGUE框架首次结合图结构学习和对比学习,参数化并优化细胞图邻接矩阵,克服了传统方法仅依赖空间邻近性定义图结构的局限性 | 未明确提及具体的数据集规模限制或计算复杂度问题,可能依赖于模拟和真实数据的泛化能力 | 旨在从空间转录组数据中提取更准确的细胞图结构和嵌入,以改善空间聚类和细胞间相互作用的发现 | 空间转录组数据集中的细胞,特别是人类乳腺癌组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 图结构学习,对比学习 | 空间转录组数据 | 86个真实和模拟的空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 119 | 2026-03-06 |
Gastric Cancer Actively Remodels Mechanical Microenvironment to Promote Chemotherapy Resistance via MSCs-Mediated Mitochondrial Transfer
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404994
PMID:39392399
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研究论文 | 本研究揭示了胃癌通过间充质基质细胞介导的线粒体转移主动重塑机械微环境以促进化疗耐药性的机制 | 首次发现胃癌细胞通过分泌细胞外基质增加肿瘤组织硬度,从而促进间充质基质细胞通过微囊泡向胃癌细胞转移线粒体,导致奥沙利铂耐药 | 研究主要基于单细胞测序和体外实验,缺乏大规模临床验证,且具体机械信号通路细节需进一步探索 | 探究胃癌奥沙利铂耐药的机制,特别是细胞外机械信号在其中的作用 | 胃癌患者肿瘤组织、胃癌细胞、间充质基质细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据、组织样本 | 奥沙利铂耐药的胃癌患者肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2026-03-06 |
Insufficient Mechanical Loading Downregulates Piezo1 in Chondrocytes and Impairs Fracture Healing Through ApoE-Induced Senescence
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400502
PMID:39418070
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研究论文 | 本研究探讨了机械负荷不足如何通过下调软骨细胞中的Piezo1表达,并经由ApoE诱导的衰老机制,影响骨折愈合过程 | 首次揭示了机械负荷不足通过Piezo1-ApoE轴调控软骨细胞衰老,从而影响骨折愈合的新机制,并开发了一种可注射热敏水凝胶用于局部治疗 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体中进行验证;水凝胶的长期安全性和疗效需进一步评估 | 探究机械负荷不足影响骨折愈合的分子机制,并开发新的治疗策略 | 骨折愈合过程中的软骨细胞,特别是肥厚性软骨细胞 | 骨生物学与再生医学 | 骨折愈合障碍 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |